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14 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DG)(DC)(DT)(DC)(DC)(DT)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DA)(DT) (DC)(DC)(DT)(DC)(DT)(DC)(DG)(DA)(DT)(DG)(DG)(DC)(DT)(DA)(DT)(DG)(DA)(DG)(DA)(DT) (DC)(DA)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG) ; CGCTCTGCTCCTTCTCCCATCCTCTCGATGGCTATGAGATCAACTAG T ? 15 polyribonucleotide no no AUCGAGAGGA AUCGAGAGGA P ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MLGFLSARQTGLEDPLRLRRAESTRRVLGLELNKDRDVERIHGGGINTLDIEPVEGRYMLSGGSDGVIVLYDLENSSRQS YYTCKAVCSIGRDHPDVHRYSVETVQWYPHDTGMFTSSSFDKTLKVWDTNTLQTADVFNFEETVYSHHMSPVSTKHCLVA VGTRGPKVQLCDLKSGSCSHILQGHRQEILAVSWSPRYDYILATASADSRVKLWDVRRASGCLITLDQHNGKKSQAVESA NTAHNGKVNGLCFTSDGLHLLTVGTDNRMRLWNSSNGENTLVNYGKVCNNSKKGLKFTVSCGCSSEFVFVPYGSTIAVYT VYSGEQITMLKGHYKTVDCCVFQSNFQELYSGSRDCNILAWVPSLYEPVPDDDETTTKSQLNPAFEDAWSSSDEEG ; ;MLGFLSARQTGLEDPLRLRRAESTRRVLGLELNKDRDVERIHGGGINTLDIEPVEGRYMLSGGSDGVIVLYDLENSSRQS YYTCKAVCSIGRDHPDVHRYSVETVQWYPHDTGMFTSSSFDKTLKVWDTNTLQTADVFNFEETVYSHHMSPVSTKHCLVA 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ILE T 1103 ? PHE d 1097 ILE d 1100 5 ? 4 HELX_P HELX_P186 AU6 SER T 1104 ? VAL T 1112 ? SER d 1101 VAL d 1109 1 ? 9 HELX_P HELX_P187 AU7 THR T 1128 ? ARG T 1141 ? 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I CYS 119 I ZN 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? ? metalc29 metalc ? ? J CYS 7 SG ? ? ? 1_555 BA ZN . ZN ? ? J CYS 7 J ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? ? metalc30 metalc ? ? J CYS 10 SG ? ? ? 1_555 BA ZN . ZN ? ? J CYS 10 J ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.191 ? ? metalc31 metalc ? ? J CYS 44 SG ? ? ? 1_555 BA ZN . ZN ? ? J CYS 44 J ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? ? metalc32 metalc ? ? J CYS 45 SG ? ? ? 1_555 BA ZN . ZN ? ? J CYS 45 J ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? ? metalc33 metalc ? ? L CYS 19 SG ? ? ? 1_555 CA ZN . ZN ? ? L CYS 19 L ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.300 ? ? metalc34 metalc ? ? L CYS 22 SG ? ? ? 1_555 CA ZN . ZN ? ? L CYS 22 L ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? ? metalc35 metalc ? ? L CYS 36 SG ? ? ? 1_555 CA ZN . ZN ? ? L CYS 36 L ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.235 ? ? metalc36 metalc ? ? L CYS 39 SG ? ? ? 1_555 CA ZN . ZN ? ? L CYS 39 L ZN 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? ? hydrog1 hydrog ? ? M DC 1 N3 ? ? ? 1_555 N DG 47 N1 ? ? N DC 1 T DG 47 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? M DC 1 N4 ? ? ? 1_555 N DG 47 O6 ? ? N DC 1 T DG 47 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? M DC 1 O2 ? ? ? 1_555 N DG 47 N2 ? ? N DC 1 T DG 47 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? M DT 2 N3 ? ? ? 1_555 N DA 46 N1 ? ? N DT 2 T DA 46 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? M DT 2 O4 ? ? ? 1_555 N DA 46 N6 ? ? N DT 2 T DA 46 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? M DA 3 N1 ? ? ? 1_555 N DT 45 N3 ? ? N DA 3 T DT 45 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? M DA 3 N6 ? ? ? 1_555 N DT 45 O4 ? ? N DA 3 T DT 45 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? M DG 4 N1 ? ? ? 1_555 N DC 44 N3 ? ? N DG 4 T DC 44 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? M DG 4 N2 ? ? ? 1_555 N DC 44 O2 ? ? N DG 4 T DC 44 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? M DG 4 O6 ? ? ? 1_555 N DC 44 N4 ? ? N DG 4 T DC 44 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? M DT 5 N3 ? ? ? 1_555 N DA 43 N1 ? ? N DT 5 T DA 43 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? M DT 5 O4 ? ? ? 1_555 N DA 43 N6 ? ? N DT 5 T DA 43 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? M DT 6 N3 ? ? ? 1_555 N DA 42 N1 ? ? N DT 6 T DA 42 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? M DT 6 O4 ? ? ? 1_555 N DA 42 N6 ? ? N DT 6 T DA 42 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? M DG 7 N1 ? ? ? 1_555 N DC 41 N3 ? ? N DG 7 T DC 41 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? M DG 7 N2 ? ? ? 1_555 N DC 41 O2 ? ? N DG 7 T DC 41 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? M DG 7 O6 ? ? ? 1_555 N DC 41 N4 ? ? N DG 7 T DC 41 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? M DA 8 N1 ? ? ? 1_555 N DT 40 N3 ? ? N DA 8 T DT 40 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? M DA 8 N6 ? ? ? 1_555 N DT 40 O4 ? ? N DA 8 T DT 40 1_555 ? ? ? ? ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? M DC 12 O2 ? ? ? 1_555 N DG 36 N2 ? ? N DC 12 T DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? M DA 13 N1 ? ? ? 1_555 N DT 35 N3 ? ? N DA 13 T DT 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? M DA 13 N6 ? ? ? 1_555 N DT 35 O4 ? ? N DA 13 T DT 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? M DG 31 N1 ? ? ? 1_555 N DC 17 N3 ? ? N DG 31 T DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? M DG 31 N2 ? ? ? 1_555 N DC 17 O2 ? ? N DG 31 T DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? M DG 31 O6 ? ? ? 1_555 N DC 17 N4 ? ? N DG 31 T DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? M DG 32 N1 ? ? ? 1_555 N DC 16 N3 ? ? N DG 32 T DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? M DG 32 N2 ? ? ? 1_555 N DC 16 O2 ? ? N DG 32 T DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? M DG 32 O6 ? ? ? 1_555 N DC 16 N4 ? ? N DG 32 T DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? M DA 33 N1 ? ? ? 1_555 N DT 15 N3 ? ? N DA 33 T DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? M DA 33 N6 ? ? ? 1_555 N DT 15 O4 ? ? N DA 33 T DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? M DG 34 N1 ? ? ? 1_555 N DC 14 N3 ? ? N DG 34 T DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? M DG 34 N2 ? ? ? 1_555 N DC 14 O2 ? ? N DG 34 T DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? M DG 34 O6 ? ? ? 1_555 N DC 14 N4 ? ? N DG 34 T DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? M DA 35 N1 ? ? ? 1_555 N DT 13 N3 ? ? N DA 35 T DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? M DA 35 N6 ? ? ? 1_555 N DT 13 O4 ? ? N DA 35 T DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? M DA 36 N1 ? ? ? 1_555 N DT 12 N3 ? ? N DA 36 T DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? M DA 36 N6 ? ? ? 1_555 N DT 12 O4 ? ? N DA 36 T DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? M DG 37 N1 ? ? ? 1_555 N DC 11 N3 ? ? N DG 37 T DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? M DG 37 N2 ? ? ? 1_555 N DC 11 O2 ? ? N DG 37 T DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? M DG 37 O6 ? ? ? 1_555 N DC 11 N4 ? ? N DG 37 T DC 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? M DG 38 N1 ? ? ? 1_555 N DC 10 N3 ? ? N DG 38 T DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? M DG 38 N2 ? ? ? 1_555 N DC 10 O2 ? ? N DG 38 T DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? M DG 38 O6 ? ? ? 1_555 N DC 10 N4 ? ? N DG 38 T DC 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog53 hydrog ? ? M DA 39 N1 ? ? ? 1_555 N DT 9 N3 ? ? N DA 39 T DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog54 hydrog ? ? M DA 39 N6 ? ? ? 1_555 N DT 9 O4 ? ? N DA 39 T DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog55 hydrog ? ? M DG 40 N1 ? ? ? 1_555 N DC 8 N3 ? ? N DG 40 T DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? 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RELION ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.3 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 7OO3 'double helix' 7OO3 'a-form double helix' 7OO3 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 M DC 1 1_555 N DG 47 1_555 0.182 -0.194 0.713 1.108 -1.326 1.088 1 N_DC1:DG47_T N 1 ? 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