data_7P5Z # _entry.id 7P5Z # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.354 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 7P5Z pdb_00007p5z 10.2210/pdb7p5z/pdb WWPDB D_1292116881 ? ? EMDB EMD-13211 ? ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type PDB '7P30 contains the DNA-bound MCM double hexamer without DDK.' 7P30 unspecified EMDB 'EMD-13176 represents the DNA-bound MCM double hexamer without DDK.' EMD-13176 'other EM volume' EMDB 'Structure of a DNA-loaded MCM double hexamer engaged with the Dbf4-dependent kinase' EMD-13211 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7P5Z _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-07-15 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Greiwe, J.F.' 1 0000-0002-5708-7923 'Miller, T.C.R.' 2 0000-0002-9749-1656 'Martino, F.' 3 ? 'Costa, A.' 4 0000-0003-1126-2498 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Nat.Struct.Mol.Biol. _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1545-9985 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 29 _citation.language ? _citation.page_first 10 _citation.page_last 20 _citation.title 'Structural mechanism for the selective phosphorylation of DNA-loaded MCM double hexamers by the Dbf4-dependent kinase.' _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41594-021-00698-z _citation.pdbx_database_id_PubMed 34963704 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Greiwe, J.F.' 1 0000-0002-5708-7923 primary 'Miller, T.C.R.' 2 0000-0002-9749-1656 primary 'Locke, J.' 3 0000-0002-0641-3389 primary 'Martino, F.' 4 ? primary 'Howell, S.' 5 ? primary 'Schreiber, A.' 6 ? primary 'Nans, A.' 7 0000-0002-3791-2447 primary 'Diffley, J.F.X.' 8 0000-0001-5184-7680 primary 'Costa, A.' 9 0000-0003-1126-2498 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7P5Z _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? 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_entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MSDNRRRRREEDDSDSENELPPSSPQQHFRGGMNPVSSPIGSPDMINPEGDDNEVDDVPDIDEVEEQMNEVDLMDDNMYE DYAADHNRDRYDPDQVDDREQQELSLSERRRIDAQLNERDRLLRNVAYIDDEDEEQEGAAQLDEMGLPVQRRRRRRQYED LENSDDDLLSDMDIDPLREELTLESLSNVKANSYSEWITQPNVSRTIARELKSFLLEYTDETGRSVYGARIRTLGEMNSE SLEVNYRHLAESKAILALFLAKCPEEMLKIFDLVAMEATELHYPDYARIHSEIHVRISDFPTIYSLRELRESNLSSLVRV TGVVTRRTGVFPQLKYVKFNCLKCGSILGPFFQDSNEEIRISFCTNCKSKGPFRVNGEKTVYRNYQRVTLQEAPGTVPPG RLPRHREVILLADLVDVSKPGEEVEVTGIYKNNYDGNLNAKNGFPVFATIIEANSIKRREGNTANEGEEGLDVFSWTEEE EREFRKISRDRGIIDKIISSMAPSIYGHRDIKTAVACSLFGGVPKNVNGKHSIRGDINVLLLGDPGTAKSQILKYVEKTA HRAVFATGQGASAVGLTASVRKDPITKEWTLEGGALVLADKGVCLIDEFDKMNDQDRTSIHEAMEQQSISISKAGIVTTL QARCSIIAAANPNGGRYNSTLPLAQNVSLTEPILSRFDILCVVRDLVDEEADERLATFVVDSHVRSHPENDEDREGEELK 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GSFPITVRHLESILRIAESFAKMRLSEFVSSYDLDRAIKVVVDSFVDAQKVSVRRQLRRSFAIYTLGH ; 2,A ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MKRRWKKNFIAVSAANRFKKISSSGALENLYFQGEMEGSTGFDGDATTFFAPDAVFGDRVRRFQEFLDTFTSYRDSVRSI QVYNSNNAANYNDDQDDADERDLLGDDDGDDLEKEKKAASSTSLNILPHRIIISLDDLREFDRSFWSGILVEPAYFIPPA EKALTDLADSMDDVPHPNASAVSSRHPWKLSFKGSFGAHALSPRTLTAQHLNKLVSVEGIVTKTSLVRPKLIRSVHYAAK TGRFHYRDYTDATTTLTTRIPTPAIYPTEDTEGNKLTTEYGYSTFIDHQRITVQEMPEMAPAGQLPRSIDVILDDDLVDK TKPGDRVNVVGVFKSLGAGGMNQSNSNTLIGFKTLILGNTVYPLHARSTGVAARQMLTDFDIRNINKLSKKKDIFDILSQ SLAPSIYGHDHIKKAILLMLMGGVEKNLENGSHLRGDINILMVGDPSTAKSQLLRFVLNTASLAIATTGRGSSGVGLTAA VTTDRETGERRLEAGAMVLADRGVVCIDEFDKMTDVDRVAIHEVMEQQTVTIAKAGIHTTLNARCSVIAAANPVFGQYDV NRDPHQNIALPDSLLSRFDLLFVVTDDINEIRDRSISEHVLRTHRYLPPGYLEGEPVRERLNLSLAVGEDADINPEEHSN SGAGVENEGEDDEDHVFEKFNPLLQAGAKLAKNKGNYNGTEIPKLVTIPFLRKYVQYAKERVIPQLTQEAINVIVKNYTD LRNDDNTKKSPITARTLETLIRLATAHAKVRLSKTVNKVDAKVAANLLRFALLGEDIGNDIDEEESEYEEALSKRSPQKS PKKRQRVRQPASNSGSPIKSTPRRSTASSVNATPSSARRILRFQDDEQNAGEDDNDIMSPLPADEEAELQRRLQLGLRVS 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AKHLTNLYLEDKPEHISQDDVLPVEFLTMYISYAKEHIHPIITEAAKTELVRAYVGMRKMGDDSRSDEKRITATTRQLES MIRLAEAHAKMKLKNVVELEDVQEAVRLIRSAIKDYATDPKTGKIDMNLVQTGKSVIQRKLQEDLSREIMNVLKDQASDS MSFNELIKQINEHSQDRVESSDIQEALSRLQQEDKVIVLGEGVRRSVRLNNRV ; 4,C ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSFDRPEIYSAPVLQGESPNDDDNTEIIKSFKNFILEFRLDSQFIYRDQLRNNILVKNYSLTVNMEHLIGYNEDIYKKLS DEPSDIIPLFETAITQVAKRISILSRAQSANNNDKDPENTSMDTDSLLLNSLPTFQLILNSNANQIPLRDLDSEHVSKIV RLSGIIISTSVLSSRATYLSIMCRNCRHTTSITINNFNSITGNTVSLPRSCLSTIESESSMANESNIGDESTKKNCGPDP YIIIHESSKFIDQQFLKLQEIPELVPVGEMPRNLTMTCDRYLTNKVIPGTRVTIVGIYSIYNSKNGAGSGRSGGGNGGSG VAIRTPYIKILGIQSDVETSSIWNSVTMFTEEEEEEFLQLSRNPKLYEILTNSIAPSIFGNEDIKKAIVCLLMGGSKKIL PDGMRLRGDINVLLLGDPGTAKSQLLKFVEKVSPIAVYTSGKGSSAAGLTASVQRDPMTREFYLEGGAMVLADGGVVCID EFDKMRDEDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITTVLNSRTSVLAAANPIYGRYDDLKSPGDNIDFQTTILSRFDMIFIVKDDH NEERDISIANHVINIHTGNANAMQNQQEENGSEISIEKMKRYITYCRLKCAPRLSPQAAEKLSSNFVTIRKQLLINELES TERSSIPITIRQLEAIIRITESLAKLELSPIAQERHVDEAIRLFQASTMDAASQDPIGGLNQASGTSLSEIRRFEQELKR 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;MSSPFPADTPSSNRPSNSSPPPSSIGAGFGSSSGLDSQIGSRLHFPSSSQPHVSNSQTGPFVNDSTQFSSQRLQTDGSAT NDMEGNEPARSFKSRALNHVKKVDDVTGEKVREAFEQFLEDFSVQSTDTGEVEKVYRAQIEFMKIYDLNTIYIDYQHLSM RENGALAMAISEQYYRFLPFLQKGLRRVVRKYAPELLNTSDSLKRSEGDEGQADEDEQQDDDMNGSSLPRDSGSSAAPGN GTSAMATRSITTSTSPEQTERVFQISFFNLPTVHRIRDIRSEKIGSLLSISGTVTRTSEVRPELYKASFTCDMCRAIVDN VEQSFKYTEPTFCPNPSCENRAFWTLNVTRSRFLDWQKVRIQENANEIPTGSMPRTLDVILRGDSVERAKPGDRCKFTGV EIVVPDVTQLGLPGVKPSSTLDTRGISKTTEGLNSGVTGLRSLGVRDLTYKISFLACHVISIGSNIGASSPDANSNNRET ELQMAANLQANNVYQDNERDQEVFLNSLSSDEINELKEMVKDEHIYDKLVRSIAPAVFGHEAVKKGILLQMLGGVHKSTV EGIKLRGDINICVVGDPSTSKSQFLKYVVGFAPRSVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEEGGDYTIEAGALMLADNGICCIDE FDKMDISDQVAIHEAMEQQTISIAKAGIHATLNARTSILAAANPVGGRYNRKLSLRGNLNMTAPIMSRFDLFFVILDDCN EKIDTELASHIVDLHMKRDEAIEPPFSAEQLRRYIKYARTFKPILTKEARSYLVEKYKELRKDDAQGFSRSSYRITVRQL ESMIRLSEAIARANCVDEITPSFIAEAYDLLRQSIIRVDVDDVEMDEEFDNIESQSHAASGNNDDNDDGTGSGVITSEPP ADIEEGQSEATARPGTSEKKKTTVTYDKYVSMMNMIVRKIAEVDREGAEELTAVDIVDWYLLQKENDLGSLAEYWEERRL 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;MSAALPSIQLPVDYNNLFNEITDFLVTFKQDTLSSDATRNENEDENLDAENIEQHLLEKGPKYMAMLQKVANRELNSVII DLDDILQYQNEKFLQGTQADDLVSAIQQNANHFTELFCRAIDNNMPLPTKEIDYKDDVLDVILNQRRLRNERMLSDRTNE IRSENLMDTTMDPPSSMNDALREVVEDETELFPPNLTRRYFLYFKPLSQNCARRYRKKAISSKPLSVRQIKGDFLGQLIT VRGIITRVSDVKPAVEVIAYTCDQCGYEVFQEVNSRTFTPLSECTSEECSQNQTKGQLFMSTRASKFSAFQECKIQELSQ QVPVGHIPRSLNIHVNGTLVRSLSPGDIVDVTGIFLPAPYTGFKALKAGLLTETYLEAQFVRQHKKKFASFSLTSDVEER VMELITSGDVYNRLAKSIAPEIYGNLDVKKALLLLLVGGVDKRVGDGMKIRGDINVCLMGDPGVAKSQLLKAICKISPRG VYTTGKGSSGVGLTAAVMKDPVTDEMILEGGALVLADNGICCIDEFDKMDESDRTAIHEVMEQQTISISKAGINTTLNAR TSILAAANPLYGRYNPRLSPLDNINLPAALLSRFDILFLMLDIPSRDDDEKLAEHVTYVHMHNKQPDLDFTPVEPSKMRE YIAYAKTKRPVMSEAVNDYVVQAYIRLRQDSKREMDSKFSFGQATPRTLLGIIRLSQALAKLRLADMVDIDDVEEALRLV RVSKESLYQETNKSKEDESPTTKIFTIIKKMLQETGKNTLSYENIVKTVRLRGFTMLQLSNCIQEYSYLNVWHLINEGNT LKFVDDGTMDTDQEDSLVSTPKLAPQTTASANVSAQDSDIDLQDA ; 7,F ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MTSKTKNIDDIPPEIKEEMIQLYHDLPGIENEYKLIDKIGEGTFSSVYKAKDITGKITKKFASHFWNYGSNYVALKKIYV 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'DBF4, DNA52, YDR052C, D4205, YD9609.07C' ? 'ATCC 204508 / S288c' ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae S288C' 559292 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 9 1 sample 1 53 'Saccharomyces cerevisiae S288C' ? 559292 ? 10 1 sample 1 53 'Saccharomyces cerevisiae S288C' ? 559292 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP MCM2_YEAST P29469 ? 1 ;MSDNRRRRREEDDSDSENELPPSSPQQHFRGGMNPVSSPIGSPDMINPEGDDNEVDDVPDIDEVEEQMNEVDLMDDNMYE DYAADHNRDRYDPDQVDDREQQELSLSERRRIDAQLNERDRLLRNVAYIDDEDEEQEGAAQLDEMGLPVQRRRRRRQYED LENSDDDLLSDMDIDPLREELTLESLSNVKANSYSEWITQPNVSRTIARELKSFLLEYTDETGRSVYGARIRTLGEMNSE SLEVNYRHLAESKAILALFLAKCPEEMLKIFDLVAMEATELHYPDYARIHSEIHVRISDFPTIYSLRELRESNLSSLVRV TGVVTRRTGVFPQLKYVKFNCLKCGSILGPFFQDSNEEIRISFCTNCKSKGPFRVNGEKTVYRNYQRVTLQEAPGTVPPG RLPRHREVILLADLVDVSKPGEEVEVTGIYKNNYDGNLNAKNGFPVFATIIEANSIKRREGNTANEGEEGLDVFSWTEEE EREFRKISRDRGIIDKIISSMAPSIYGHRDIKTAVACSLFGGVPKNVNGKHSIRGDINVLLLGDPGTAKSQILKYVEKTA HRAVFATGQGASAVGLTASVRKDPITKEWTLEGGALVLADKGVCLIDEFDKMNDQDRTSIHEAMEQQSISISKAGIVTTL QARCSIIAAANPNGGRYNSTLPLAQNVSLTEPILSRFDILCVVRDLVDEEADERLATFVVDSHVRSHPENDEDREGEELK NNGESAIEQGEDEINEQLNARQRRLQRQRKKEEEISPIPQELLMKYIHYARTKIYPKLHQMDMDKVSRVYADLRRESIST GSFPITVRHLESILRIAESFAKMRLSEFVSSYDLDRAIKVVVDSFVDAQKVSVRRQLRRSFAIYTLGH ; 1 2 UNP MCM3_YEAST P24279 ? 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3 ;MSQQSSSPTKEDNNSSSPVVPNPDSVPPQLSSPALFYSSSSSQGDIYGRNNSQNLSQGEGNIRAAIGSSPLNFPSSSQRQ NSDVFQSQGRQGRIRSSASASGRSRYHSDLRSDRALPTSSSSLGRNGQNRVHMRRNDIHTSDLSSPRRIVDFDTRSGVNT LDTSSSSAPPSEASEPLRIIWGTNVSIQECTTNFRNFLMSFKYKFRKILDEREEFINNTTDEELYYIKQLNEMRELGTSN LNLDARNLLAYKQTEDLYHQLLNYPQEVISIMDQTIKDCMVSLIVDNNLDYDLDEIETKFYKVRPYNVGSCKGMRELNPN DIDKLINLKGLVLRSTPVIPDMKVAFFKCNVCDHTMAVEIDRGVIQEPARCERIDCNEPNSMSLIHNRCSFADKQVIKLQ ETPDFVPDGQTPHSISLCVYDELVDSCRAGDRIEVTGTFRSIPIRANSRQRVLKSLYKTYVDVVHVKKVSDKRLDVDTST IEQELMQNKVDHNEVEEVRQITDQDLAKIREVAAREDLYSLLARSIAPSIYELEDVKKGILLQLFGGTNKTFTKGGRYRG DINILLCGDPSTSKSQILQYVHKITPRGVYTSGKGSSAVGLTAYITRDVDTKQLVLESGALVLSDGGVCCIDEFDKMSDS TRSVLHEVMEQQTISIAKAGIITTLNARSSILASANPIGSRYNPNLPVTENIDLPPPLLSRFDLVYLVLDKVDEKNDREL AKHLTNLYLEDKPEHISQDDVLPVEFLTMYISYAKEHIHPIITEAAKTELVRAYVGMRKMGDDSRSDEKRITATTRQLES MIRLAEAHAKMKLKNVVELEDVQEAVRLIRSAIKDYATDPKTGKIDMNLVQTGKSVIQRKLQEDLSREIMNVLKDQASDS MSFNELIKQINEHSQDRVESSDIQEALSRLQQEDKVIVLGEGVRRSVRLNNRV ; 1 4 UNP MCM5_YEAST P29496 ? 4 ;MSFDRPEIYSAPVLQGESPNDDDNTEIIKSFKNFILEFRLDSQFIYRDQLRNNILVKNYSLTVNMEHLIGYNEDIYKKLS DEPSDIIPLFETAITQVAKRISILSRAQSANNNDKDPENTSMDTDSLLLNSLPTFQLILNSNANQIPLRDLDSEHVSKIV RLSGIIISTSVLSSRATYLSIMCRNCRHTTSITINNFNSITGNTVSLPRSCLSTIESESSMANESNIGDESTKKNCGPDP YIIIHESSKFIDQQFLKLQEIPELVPVGEMPRNLTMTCDRYLTNKVIPGTRVTIVGIYSIYNSKNGAGSGRSGGGNGGSG VAIRTPYIKILGIQSDVETSSIWNSVTMFTEEEEEEFLQLSRNPKLYEILTNSIAPSIFGNEDIKKAIVCLLMGGSKKIL PDGMRLRGDINVLLLGDPGTAKSQLLKFVEKVSPIAVYTSGKGSSAAGLTASVQRDPMTREFYLEGGAMVLADGGVVCID EFDKMRDEDRVAIHEAMEQQTISIAKAGITTVLNSRTSVLAAANPIYGRYDDLKSPGDNIDFQTTILSRFDMIFIVKDDH NEERDISIANHVINIHTGNANAMQNQQEENGSEISIEKMKRYITYCRLKCAPRLSPQAAEKLSSNFVTIRKQLLINELES TERSSIPITIRQLEAIIRITESLAKLELSPIAQERHVDEAIRLFQASTMDAASQDPIGGLNQASGTSLSEIRRFEQELKR RLPIGWSTSYQTLRREFVDTHRFSQLALDKALYALEKHETIQLRHQGQNIYRSGV ; 1 5 UNP MCM6_YEAST P53091 ? 5 ;MSSPFPADTPSSNRPSNSSPPPSSIGAGFGSSSGLDSQIGSRLHFPSSSQPHVSNSQTGPFVNDSTQFSSQRLQTDGSAT NDMEGNEPARSFKSRALNHVKKVDDVTGEKVREAFEQFLEDFSVQSTDTGEVEKVYRAQIEFMKIYDLNTIYIDYQHLSM RENGALAMAISEQYYRFLPFLQKGLRRVVRKYAPELLNTSDSLKRSEGDEGQADEDEQQDDDMNGSSLPRDSGSSAAPGN GTSAMATRSITTSTSPEQTERVFQISFFNLPTVHRIRDIRSEKIGSLLSISGTVTRTSEVRPELYKASFTCDMCRAIVDN VEQSFKYTEPTFCPNPSCENRAFWTLNVTRSRFLDWQKVRIQENANEIPTGSMPRTLDVILRGDSVERAKPGDRCKFTGV EIVVPDVTQLGLPGVKPSSTLDTRGISKTTEGLNSGVTGLRSLGVRDLTYKISFLACHVISIGSNIGASSPDANSNNRET ELQMAANLQANNVYQDNERDQEVFLNSLSSDEINELKEMVKDEHIYDKLVRSIAPAVFGHEAVKKGILLQMLGGVHKSTV EGIKLRGDINICVVGDPSTSKSQFLKYVVGFAPRSVYTSGKASSAAGLTAAVVRDEEGGDYTIEAGALMLADNGICCIDE FDKMDISDQVAIHEAMEQQTISIAKAGIHATLNARTSILAAANPVGGRYNRKLSLRGNLNMTAPIMSRFDLFFVILDDCN EKIDTELASHIVDLHMKRDEAIEPPFSAEQLRRYIKYARTFKPILTKEARSYLVEKYKELRKDDAQGFSRSSYRITVRQL ESMIRLSEAIARANCVDEITPSFIAEAYDLLRQSIIRVDVDDVEMDEEFDNIESQSHAASGNNDDNDDGTGSGVITSEPP ADIEEGQSEATARPGTSEKKKTTVTYDKYVSMMNMIVRKIAEVDREGAEELTAVDIVDWYLLQKENDLGSLAEYWEERRL AFKVIKRLVKDRILMEIHGTRHNLRDLENEENENNKTVYVIHPNCEVLDQLEPQDSS ; 1 6 UNP MCM7_YEAST P38132 ? 6 ;MSAALPSIQLPVDYNNLFNEITDFLVTFKQDTLSSDATRNENEDENLDAENIEQHLLEKGPKYMAMLQKVANRELNSVII DLDDILQYQNEKFLQGTQADDLVSAIQQNANHFTELFCRAIDNNMPLPTKEIDYKDDVLDVILNQRRLRNERMLSDRTNE IRSENLMDTTMDPPSSMNDALREVVEDETELFPPNLTRRYFLYFKPLSQNCARRYRKKAISSKPLSVRQIKGDFLGQLIT VRGIITRVSDVKPAVEVIAYTCDQCGYEVFQEVNSRTFTPLSECTSEECSQNQTKGQLFMSTRASKFSAFQECKIQELSQ QVPVGHIPRSLNIHVNGTLVRSLSPGDIVDVTGIFLPAPYTGFKALKAGLLTETYLEAQFVRQHKKKFASFSLTSDVEER VMELITSGDVYNRLAKSIAPEIYGNLDVKKALLLLLVGGVDKRVGDGMKIRGDINVCLMGDPGVAKSQLLKAICKISPRG VYTTGKGSSGVGLTAAVMKDPVTDEMILEGGALVLADNGICCIDEFDKMDESDRTAIHEVMEQQTISISKAGINTTLNAR TSILAAANPLYGRYNPRLSPLDNINLPAALLSRFDILFLMLDIPSRDDDEKLAEHVTYVHMHNKQPDLDFTPVEPSKMRE YIAYAKTKRPVMSEAVNDYVVQAYIRLRQDSKREMDSKFSFGQATPRTLLGIIRLSQALAKLRLADMVDIDDVEEALRLV RVSKESLYQETNKSKEDESPTTKIFTIIKKMLQETGKNTLSYENIVKTVRLRGFTMLQLSNCIQEYSYLNVWHLINEGNT LKFVDDGTMDTDQEDSLVSTPKLAPQTTASANVSAQDSDIDLQDA ; 1 7 UNP CDC7_YEAST P06243 ? 7 ;MTSKTKNIDDIPPEIKEEMIQLYHDLPGIENEYKLIDKIGEGTFSSVYKAKDITGKITKKFASHFWNYGSNYVALKKIYV TSSPQRIYNELNLLYIMTGSSRVAPLCDAKRVRDQVIAVLPYYPHEEFRTFYRDLPIKGIKKYIWELLRALKFVHSKGII HRDIKPTNFLFNLELGRGVLVDFGLAEAQMDYKSMISSQNDYDNYANTNHDGGYSMRNHEQFCPCIMRNQYSPNSHNQTP PMVTIQNGKVVHLNNVNGVDLTKGYPKNETRRIKRANRAGTRGFRAPEVLMKCGAQSTKIDIWSVGVILLSLLGRRFPMF QSLDDADSLLELCTIFGWKELRKCAALHGLGFEASGLIWDKPNGYSNGLKEFVYDLLNKECTIGTFPEYSVAFETFGFLQ QELHDRMSIEPQLPDPKTNMDAVDAYELKKYQEEIWSDHYWCFQVLEQCFEMDPQKRSSAEDLLKTPFFNELNENTYLLD GESTDEDDVVSSSEADLLDKDVLLISE ; 1 8 UNP DBF4_YEAST P32325 ? 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A CYS 341 SG ? ? ? 1_555 S ZN . ZN ? ? 2 CYS 341 2 ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? ? metalc2 metalc ? ? A CYS 344 SG ? ? ? 1_555 S ZN . ZN ? ? 2 CYS 344 2 ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.219 ? ? metalc3 metalc ? ? A CYS 364 SG ? ? ? 1_555 S ZN . ZN ? ? 2 CYS 364 2 ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.390 ? ? metalc4 metalc ? ? A CYS 367 SG ? ? ? 1_555 S ZN . ZN ? ? 2 CYS 367 2 ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.240 ? ? metalc5 metalc ? ? A SER 550 OG ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? 2 SER 550 2 MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? ? metalc6 metalc ? ? Q ATP . O1G ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? 2 ATP 901 2 MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? ? metalc7 metalc ? ? Q ATP . O2A ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? 2 ATP 901 2 MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? ? metalc8 metalc ? ? B SER 451 OG ? ? ? 1_555 U MG . MG ? ? 3 SER 416 3 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.118 ? ? metalc9 metalc ? ? T ADP . O1B ? ? ? 1_555 U MG . MG ? ? 3 ADP 1001 3 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? ? metalc10 metalc ? ? T ADP . O3B ? ? ? 1_555 U MG . MG ? ? 3 ADP 1001 3 MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.912 ? ? metalc11 metalc ? ? C CYS 349 SG ? ? ? 1_555 W ZN . ZN ? ? 4 CYS 349 4 ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? ? metalc12 metalc ? ? C CYS 352 SG ? ? ? 1_555 W ZN . ZN ? ? 4 CYS 352 4 ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? ? metalc13 metalc ? ? C CYS 371 SG ? ? ? 1_555 W ZN . ZN ? ? 4 CYS 371 4 ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.260 ? ? metalc14 metalc ? ? C CYS 376 SG ? ? ? 1_555 W ZN . ZN ? ? 4 CYS 376 4 ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? ? metalc15 metalc ? ? C SER 575 OG ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? 4 SER 575 7 MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? ? metalc16 metalc ? ? V ADP . O1B ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? 4 ADP 1001 7 MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.312 ? ? metalc17 metalc ? ? V ADP . O2B ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? 4 ADP 1001 7 MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.728 ? ? metalc18 metalc ? ? V ADP . O1A ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? 4 ADP 1001 7 MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? ? metalc19 metalc ? ? V ADP . O3A ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? 4 ADP 1001 7 MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.579 ? ? metalc20 metalc ? ? D CYS 183 SG ? ? ? 1_555 Z ZN . ZN ? ? 5 CYS 183 5 ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.255 ? ? metalc21 metalc ? ? D CYS 186 SG ? ? ? 1_555 Z ZN . ZN ? ? 5 CYS 186 5 ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.168 ? ? metalc22 metalc ? ? D CYS 211 SG ? ? ? 1_555 Z ZN . ZN ? ? 5 CYS 211 5 ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.250 ? ? metalc23 metalc ? ? D CYS 236 SG ? ? ? 1_555 Z ZN . ZN ? ? 5 CYS 236 5 ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.270 ? ? metalc24 metalc ? ? D SER 423 OG ? ? ? 1_555 Y MG . MG ? ? 5 SER 423 5 MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? ? metalc25 metalc ? ? X ADP . O2B ? ? ? 1_555 Y MG . MG ? ? 5 ADP 801 5 MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.206 ? ? metalc26 metalc ? ? E CYS 311 SG ? ? ? 1_555 AA ZN . ZN ? ? 6 CYS 311 6 ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? ? metalc27 metalc ? ? E CYS 314 SG ? ? ? 1_555 AA ZN . ZN ? ? 6 CYS 314 6 ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.140 ? ? metalc28 metalc ? ? E CYS 333 SG ? ? ? 1_555 AA ZN . ZN ? ? 6 CYS 333 6 ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? ? metalc29 metalc ? ? E CYS 338 SG ? ? ? 1_555 AA ZN . ZN ? ? 6 CYS 338 6 ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? ? metalc30 metalc ? ? F CYS 262 SG ? ? ? 1_555 EA ZN . ZN ? ? 7 CYS 262 7 ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? ? metalc31 metalc ? ? F CYS 265 SG ? ? ? 1_555 EA ZN . ZN ? ? 7 CYS 265 7 ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? ? metalc32 metalc ? ? F CYS 284 SG ? ? ? 1_555 EA ZN . ZN ? ? 7 CYS 284 7 ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.282 ? ? metalc33 metalc ? ? F CYS 289 SG ? ? ? 1_555 EA ZN . ZN ? ? 7 CYS 289 7 ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? ? metalc34 metalc ? ? F SER 467 OG ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? 7 SER 467 7 MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.082 ? ? metalc35 metalc ? ? F GLU 542 OE1 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? 7 GLU 542 7 MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.700 ? ? metalc36 metalc ? ? CA ADP . O3B ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? 7 ADP 902 7 MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? ? metalc37 metalc ? ? G CYS 341 SG ? ? ? 1_555 HA ZN . ZN ? ? A CYS 341 A ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? ? metalc38 metalc ? ? G CYS 344 SG ? ? ? 1_555 HA ZN . ZN ? ? A CYS 344 A ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? ? metalc39 metalc ? ? G CYS 364 SG ? ? ? 1_555 HA ZN . ZN ? ? A CYS 364 A ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? ? metalc40 metalc ? ? G CYS 367 SG ? ? ? 1_555 HA ZN . ZN ? ? A CYS 367 A ZN 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? ? metalc41 metalc ? ? G SER 550 OG ? ? ? 1_555 GA MG . MG ? ? A SER 550 A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.060 ? ? metalc42 metalc ? ? FA ATP . O1G ? ? ? 1_555 GA MG . MG ? ? A ATP 901 A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? ? metalc43 metalc ? ? FA ATP . O1B ? ? ? 1_555 GA MG . MG ? ? A ATP 901 A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.874 ? ? metalc44 metalc ? ? FA ATP . O2A ? ? ? 1_555 GA MG . MG ? ? A ATP 901 A MG 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.320 ? ? metalc45 metalc ? ? H SER 451 OG ? ? ? 1_555 JA MG . MG ? ? B SER 416 B MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.103 ? ? metalc46 metalc ? ? IA ADP . O1B ? ? ? 1_555 JA MG . MG ? ? B ADP 1001 B MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.275 ? ? metalc47 metalc ? ? IA ADP . O3B ? ? ? 1_555 JA MG . MG ? ? B ADP 1001 B MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? ? metalc48 metalc ? ? I CYS 349 SG ? ? ? 1_555 LA ZN . ZN ? ? C CYS 349 C ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.283 ? ? metalc49 metalc ? ? I CYS 352 SG ? ? ? 1_555 LA ZN . ZN ? ? C CYS 352 C ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? ? metalc50 metalc ? ? I CYS 371 SG ? ? ? 1_555 LA ZN . ZN ? ? C CYS 371 C ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? ? metalc51 metalc ? ? I CYS 376 SG ? ? ? 1_555 LA ZN . ZN ? ? C CYS 376 C ZN 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? ? metalc52 metalc ? ? I SER 575 OG ? ? ? 1_555 QA MG . MG ? ? C SER 575 F MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.136 ? ? metalc53 metalc ? ? KA ADP . O1B ? ? ? 1_555 QA MG . MG ? ? C ADP 1001 F MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? ? metalc54 metalc ? ? KA ADP . O2B ? ? ? 1_555 QA MG . MG ? ? C ADP 1001 F MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? ? metalc55 metalc ? ? KA ADP . O1A ? ? ? 1_555 QA MG . MG ? ? C ADP 1001 F MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.151 ? ? metalc56 metalc ? ? KA ADP . O3A ? ? ? 1_555 QA MG . MG ? ? C ADP 1001 F MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? ? metalc57 metalc ? ? J CYS 183 SG ? ? ? 1_555 OA ZN . ZN ? ? D CYS 183 D ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.273 ? ? metalc58 metalc ? ? J CYS 186 SG ? ? ? 1_555 OA ZN . ZN ? ? D CYS 186 D ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.171 ? ? metalc59 metalc ? ? J CYS 211 SG ? ? ? 1_555 OA ZN . ZN ? ? D CYS 211 D ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? ? metalc60 metalc ? ? J CYS 236 SG ? ? ? 1_555 OA ZN . ZN ? ? D CYS 236 D ZN 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.247 ? ? metalc61 metalc ? ? J SER 423 OG ? ? ? 1_555 NA MG . MG ? ? D SER 423 D MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.086 ? ? metalc62 metalc ? ? MA ADP . O2B ? ? ? 1_555 NA MG . MG ? ? D ADP 801 D MG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? ? metalc63 metalc ? ? K CYS 311 SG ? ? ? 1_555 PA ZN . ZN ? ? E CYS 311 E ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? ? metalc64 metalc ? ? K CYS 314 SG ? ? ? 1_555 PA ZN . ZN ? ? E CYS 314 E ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? ? metalc65 metalc ? ? K CYS 333 SG ? ? ? 1_555 PA ZN . ZN ? ? E CYS 333 E ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? ? metalc66 metalc ? ? K CYS 338 SG ? ? ? 1_555 PA ZN . ZN ? ? E CYS 338 E ZN 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.260 ? ? metalc67 metalc ? ? L CYS 262 SG ? ? ? 1_555 TA ZN . ZN ? ? F CYS 262 F ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.240 ? ? metalc68 metalc ? ? L CYS 265 SG ? ? ? 1_555 TA ZN . ZN ? ? F CYS 265 F ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? ? metalc69 metalc ? ? L CYS 284 SG ? ? ? 1_555 TA ZN . ZN ? ? F CYS 284 F ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.272 ? ? metalc70 metalc ? ? L CYS 289 SG ? ? ? 1_555 TA ZN . ZN ? ? F CYS 289 F ZN 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.281 ? ? metalc71 metalc ? ? L SER 467 OG ? ? ? 1_555 SA MG . MG ? ? F SER 467 F MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? ? metalc72 metalc ? ? RA ADP . O3B ? ? ? 1_555 SA MG . MG ? ? F ADP 902 F MG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.146 ? ? metalc73 metalc ? ? N CYS 695 SG ? ? ? 1_555 UA ZN . ZN ? ? G CYS 661 G ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? ? metalc74 metalc ? ? N CYS 698 SG ? ? ? 1_555 UA ZN . ZN ? ? G CYS 664 G ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? ? metalc75 metalc ? ? N HIS 708 NE2 ? ? ? 1_555 UA ZN . ZN ? ? G HIS 674 G ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.007 ? ? metalc76 metalc ? ? N HIS 714 ND1 ? ? ? 1_555 UA ZN . ZN ? ? G HIS 680 G ZN 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? hydrog1 hydrog ? ? O DG 1 N1 ? ? ? 1_555 P DC 53 N3 ? ? X DG 1 Y DC -1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? O DG 1 N2 ? ? ? 1_555 P DC 53 O2 ? ? X DG 1 Y DC -1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? O DG 1 O6 ? ? ? 1_555 P DC 53 N4 ? ? X DG 1 Y DC -1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? O DC 2 N3 ? ? ? 1_555 P DG 52 N1 ? ? X DC 2 Y DG -2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? O DC 2 N4 ? ? ? 1_555 P DG 52 O6 ? ? X DC 2 Y DG -2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? O DC 2 O2 ? ? ? 1_555 P DG 52 N2 ? ? X DC 2 Y DG -2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? O DA 3 N1 ? ? ? 1_555 P DT 51 N3 ? ? X DA 3 Y DT -3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? O DA 3 N6 ? ? ? 1_555 P DT 51 O4 ? ? X DA 3 Y DT -3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? O DT 4 N3 ? ? ? 1_555 P DA 50 N1 ? ? X DT 4 Y DA -4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? O DT 4 O4 ? ? ? 1_555 P DA 50 N6 ? ? X DT 4 Y DA -4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? O DG 5 N1 ? ? ? 1_555 P DC 49 N3 ? ? X DG 5 Y DC -5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? O DG 5 N2 ? ? ? 1_555 P DC 49 O2 ? ? X DG 5 Y DC -5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? O DG 5 O6 ? ? ? 1_555 P DC 49 N4 ? ? X DG 5 Y DC -5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? O DC 6 N3 ? ? ? 1_555 P DG 48 N1 ? ? X DC 6 Y DG -6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? O DC 6 N4 ? ? ? 1_555 P DG 48 O6 ? ? X DC 6 Y DG -6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? O DC 6 O2 ? ? ? 1_555 P DG 48 N2 ? ? X DC 6 Y DG -6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? O DA 7 N1 ? ? ? 1_555 P DT 47 N3 ? ? X DA 7 Y DT -7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? O DA 7 N6 ? ? ? 1_555 P DT 47 O4 ? ? X DA 7 Y DT -7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? O DT 8 N3 ? ? ? 1_555 P DA 46 N1 ? ? X DT 8 Y DA -8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? O DT 8 O4 ? ? ? 1_555 P DA 46 N6 ? ? X DT 8 Y DA -8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? O DG 9 N1 ? ? ? 1_555 P DC 45 N3 ? ? X DG 9 Y DC -9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? O DG 9 N2 ? ? ? 1_555 P DC 45 O2 ? ? X DG 9 Y DC -9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? O DG 9 O6 ? ? ? 1_555 P DC 45 N4 ? ? X DG 9 Y DC -9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? O DC 10 N3 ? ? ? 1_555 P DG 44 N1 ? ? X DC 10 Y DG -10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? O DC 10 N4 ? ? ? 1_555 P DG 44 O6 ? ? X DC 10 Y DG -10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? O DC 10 O2 ? ? ? 1_555 P DG 44 N2 ? ? X DC 10 Y DG -10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? O DG 11 N1 ? ? ? 1_555 P DC 43 N3 ? ? X DG 11 Y DC -11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? O DG 11 N2 ? ? ? 1_555 P DC 43 O2 ? ? X DG 11 Y DC -11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? O DG 11 O6 ? ? ? 1_555 P DC 43 N4 ? ? X DG 11 Y DC -11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? O DC 12 N3 ? ? ? 1_555 P DG 42 N1 ? ? X DC 12 Y DG -12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? O DC 12 N4 ? ? ? 1_555 P DG 42 O6 ? ? X DC 12 Y DG -12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? O DC 12 O2 ? ? ? 1_555 P DG 42 N2 ? ? X DC 12 Y DG -12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? O DC 16 O2 ? ? ? 1_555 P DG 38 N2 ? ? X DC 16 Y DG -16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? O DA 17 N1 ? ? ? 1_555 P DT 37 N3 ? ? X DA 17 Y DT -17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? O DA 17 N6 ? ? ? 1_555 P DT 37 O4 ? ? X DA 17 Y DT -17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? O DT 18 N3 ? ? ? 1_555 P DA 36 N1 ? ? X DT 18 Y DA -18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? O DT 18 O4 ? ? ? 1_555 P DA 36 N6 ? ? X DT 18 Y DA -18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? O DG 19 N1 ? ? ? 1_555 P DC 35 N3 ? ? X DG 19 Y DC -19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? O DG 19 N2 ? ? ? 1_555 P DC 35 O2 ? ? X DG 19 Y DC -19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? O DG 19 O6 ? ? ? 1_555 P DC 35 N4 ? ? X DG 19 Y DC -19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? O DC 20 N3 ? ? ? 1_555 P DG 34 N1 ? ? 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C CYS 376 ? 4 CYS 376 ? 1_555 110.8 ? 19 OG ? C SER 575 ? 4 SER 575 ? 1_555 MG ? BA MG . ? 7 MG 901 ? 1_555 O1B ? V ADP . ? 4 ADP 1001 ? 1_555 131.9 ? 20 OG ? C SER 575 ? 4 SER 575 ? 1_555 MG ? BA MG . ? 7 MG 901 ? 1_555 O2B ? V ADP . ? 4 ADP 1001 ? 1_555 79.2 ? 21 O1B ? V ADP . ? 4 ADP 1001 ? 1_555 MG ? BA MG . ? 7 MG 901 ? 1_555 O2B ? V ADP . ? 4 ADP 1001 ? 1_555 59.7 ? 22 OG ? C SER 575 ? 4 SER 575 ? 1_555 MG ? BA MG . ? 7 MG 901 ? 1_555 O1A ? V ADP . ? 4 ADP 1001 ? 1_555 86.7 ? 23 O1B ? V ADP . ? 4 ADP 1001 ? 1_555 MG ? BA MG . ? 7 MG 901 ? 1_555 O1A ? V ADP . ? 4 ADP 1001 ? 1_555 123.2 ? 24 O2B ? V ADP . ? 4 ADP 1001 ? 1_555 MG ? BA MG . ? 7 MG 901 ? 1_555 O1A ? V ADP . ? 4 ADP 1001 ? 1_555 101.8 ? 25 OG ? C SER 575 ? 4 SER 575 ? 1_555 MG ? BA MG . ? 7 MG 901 ? 1_555 O3A ? V ADP . ? 4 ADP 1001 ? 1_555 117.0 ? 26 O1B ? V ADP . ? 4 ADP 1001 ? 1_555 MG ? BA MG . ? 7 MG 901 ? 1_555 O3A ? V ADP . ? 4 ADP 1001 ? 1_555 60.0 ? 27 O2B ? V ADP . ? 4 ADP 1001 ? 1_555 MG ? 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D CYS 186 ? 5 CYS 186 ? 1_555 ZN ? Z ZN . ? 5 ZN 803 ? 1_555 SG ? D CYS 211 ? 5 CYS 211 ? 1_555 106.1 ? 37 SG ? D CYS 183 ? 5 CYS 183 ? 1_555 ZN ? Z ZN . ? 5 ZN 803 ? 1_555 SG ? D CYS 236 ? 5 CYS 236 ? 1_555 109.6 ? 38 SG ? D CYS 186 ? 5 CYS 186 ? 1_555 ZN ? Z ZN . ? 5 ZN 803 ? 1_555 SG ? D CYS 236 ? 5 CYS 236 ? 1_555 109.5 ? 39 SG ? D CYS 211 ? 5 CYS 211 ? 1_555 ZN ? Z ZN . ? 5 ZN 803 ? 1_555 SG ? D CYS 236 ? 5 CYS 236 ? 1_555 111.6 ? 40 OG ? D SER 423 ? 5 SER 423 ? 1_555 MG ? Y MG . ? 5 MG 802 ? 1_555 O2B ? X ADP . ? 5 ADP 801 ? 1_555 82.2 ? 41 SG ? E CYS 311 ? 6 CYS 311 ? 1_555 ZN ? AA ZN . ? 6 ZN 1101 ? 1_555 SG ? E CYS 314 ? 6 CYS 314 ? 1_555 106.2 ? 42 SG ? E CYS 311 ? 6 CYS 311 ? 1_555 ZN ? AA ZN . ? 6 ZN 1101 ? 1_555 SG ? E CYS 333 ? 6 CYS 333 ? 1_555 115.9 ? 43 SG ? E CYS 314 ? 6 CYS 314 ? 1_555 ZN ? AA ZN . ? 6 ZN 1101 ? 1_555 SG ? E CYS 333 ? 6 CYS 333 ? 1_555 108.1 ? 44 SG ? E CYS 311 ? 6 CYS 311 ? 1_555 ZN ? AA ZN . ? 6 ZN 1101 ? 1_555 SG ? E CYS 338 ? 6 CYS 338 ? 1_555 110.4 ? 45 SG ? E CYS 314 ? 6 CYS 314 ? 1_555 ZN ? AA ZN . ? 6 ZN 1101 ? 1_555 SG ? E CYS 338 ? 6 CYS 338 ? 1_555 105.1 ? 46 SG ? E CYS 333 ? 6 CYS 333 ? 1_555 ZN ? AA ZN . ? 6 ZN 1101 ? 1_555 SG ? E CYS 338 ? 6 CYS 338 ? 1_555 110.5 ? 47 SG ? F CYS 262 ? 7 CYS 262 ? 1_555 ZN ? EA ZN . ? 7 ZN 904 ? 1_555 SG ? F CYS 265 ? 7 CYS 265 ? 1_555 107.8 ? 48 SG ? F CYS 262 ? 7 CYS 262 ? 1_555 ZN ? EA ZN . ? 7 ZN 904 ? 1_555 SG ? F CYS 284 ? 7 CYS 284 ? 1_555 107.1 ? 49 SG ? F CYS 265 ? 7 CYS 265 ? 1_555 ZN ? EA ZN . ? 7 ZN 904 ? 1_555 SG ? F CYS 284 ? 7 CYS 284 ? 1_555 112.7 ? 50 SG ? F CYS 262 ? 7 CYS 262 ? 1_555 ZN ? EA ZN . ? 7 ZN 904 ? 1_555 SG ? F CYS 289 ? 7 CYS 289 ? 1_555 111.7 ? 51 SG ? F CYS 265 ? 7 CYS 265 ? 1_555 ZN ? EA ZN . ? 7 ZN 904 ? 1_555 SG ? F CYS 289 ? 7 CYS 289 ? 1_555 107.2 ? 52 SG ? F CYS 284 ? 7 CYS 284 ? 1_555 ZN ? EA ZN . ? 7 ZN 904 ? 1_555 SG ? F CYS 289 ? 7 CYS 289 ? 1_555 110.4 ? 53 OG ? F SER 467 ? 7 SER 467 ? 1_555 MG ? 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A ATP 901 ? 1_555 MG ? GA MG . ? A MG 902 ? 1_555 O1B ? FA ATP . ? A ATP 901 ? 1_555 69.0 ? 63 OG ? G SER 550 ? A SER 550 ? 1_555 MG ? GA MG . ? A MG 902 ? 1_555 O2A ? FA ATP . ? A ATP 901 ? 1_555 98.4 ? 64 O1G ? FA ATP . ? A ATP 901 ? 1_555 MG ? GA MG . ? A MG 902 ? 1_555 O2A ? FA ATP . ? A ATP 901 ? 1_555 108.3 ? 65 O1B ? FA ATP . ? A ATP 901 ? 1_555 MG ? GA MG . ? A MG 902 ? 1_555 O2A ? FA ATP . ? A ATP 901 ? 1_555 71.7 ? 66 OG ? H SER 451 ? B SER 416 ? 1_555 MG ? JA MG . ? B MG 1002 ? 1_555 O1B ? IA ADP . ? B ADP 1001 ? 1_555 120.0 ? 67 OG ? H SER 451 ? B SER 416 ? 1_555 MG ? JA MG . ? B MG 1002 ? 1_555 O3B ? IA ADP . ? B ADP 1001 ? 1_555 169.2 ? 68 O1B ? IA ADP . ? B ADP 1001 ? 1_555 MG ? JA MG . ? B MG 1002 ? 1_555 O3B ? IA ADP . ? B ADP 1001 ? 1_555 70.1 ? 69 SG ? I CYS 349 ? C CYS 349 ? 1_555 ZN ? LA ZN . ? C ZN 1002 ? 1_555 SG ? I CYS 352 ? C CYS 352 ? 1_555 109.2 ? 70 SG ? I CYS 349 ? C CYS 349 ? 1_555 ZN ? LA ZN . ? C ZN 1002 ? 1_555 SG ? I CYS 371 ? C CYS 371 ? 1_555 107.6 ? 71 SG ? I CYS 352 ? C CYS 352 ? 1_555 ZN ? LA ZN . ? C ZN 1002 ? 1_555 SG ? I CYS 371 ? C CYS 371 ? 1_555 108.4 ? 72 SG ? I CYS 349 ? C CYS 349 ? 1_555 ZN ? LA ZN . ? C ZN 1002 ? 1_555 SG ? I CYS 376 ? C CYS 376 ? 1_555 112.5 ? 73 SG ? I CYS 352 ? C CYS 352 ? 1_555 ZN ? LA ZN . ? C ZN 1002 ? 1_555 SG ? I CYS 376 ? C CYS 376 ? 1_555 108.7 ? 74 SG ? I CYS 371 ? C CYS 371 ? 1_555 ZN ? LA ZN . ? C ZN 1002 ? 1_555 SG ? I CYS 376 ? C CYS 376 ? 1_555 110.4 ? 75 OG ? I SER 575 ? C SER 575 ? 1_555 MG ? QA MG . ? F MG 901 ? 1_555 O1B ? KA ADP . ? C ADP 1001 ? 1_555 133.1 ? 76 OG ? I SER 575 ? C SER 575 ? 1_555 MG ? QA MG . ? F MG 901 ? 1_555 O2B ? KA ADP . ? C ADP 1001 ? 1_555 77.4 ? 77 O1B ? KA ADP . ? C ADP 1001 ? 1_555 MG ? QA MG . ? F MG 901 ? 1_555 O2B ? KA ADP . ? C ADP 1001 ? 1_555 64.1 ? 78 OG ? I SER 575 ? C SER 575 ? 1_555 MG ? QA MG . ? F MG 901 ? 1_555 O1A ? KA ADP . ? C ADP 1001 ? 1_555 89.3 ? 79 O1B ? KA ADP . ? C ADP 1001 ? 1_555 MG ? QA MG . ? 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RELION 3.1 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details 'The entire MCM loading and phosphorylation reaction was applied to the EM grid.' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 7P5Z 'double helix' 7P5Z 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 O DG 1 1_555 P DC 53 1_555 -0.467 -1.107 1.856 9.223 8.281 3.393 1 X_DG1:DC-1_Y X 1 ? 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