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EMD-25102 'other EM volume' EMDB 'CryoEM structure of Venezuelan Equine Encephalitis virus (VEEV) TC-83 strain VLP in complex with Fab hVEEV-63' EMD-25103 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7SFV _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-10-04 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Binshtein, E.' 1 0000-0003-2745-104X 'Crowe, J.E.' 2 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? 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;STEELFNEYKLTRPYMARCIRCAVGSCHSPIAIEAVKSDGHDGYVRLQTSSQYGLDSSGNLKGRTMRYDMHGTIKEIPLH QVSLYTSRPCHIVDGHGYFLLARCPAGDSITMEFKKDSVRHSCSVPYEVKFNPVGRELYTHPPEHGVEQACQVYAHDAQN RGAYVEMHLPGSEVDSSLVSLSGSSVTVTPPDGTSALVECECGGTKISETINKTKQFSQCTKKEQCRAYRLQNDKWVYNS DKLPKAAGATLKGKLHVPFLLADGKCTVPLAPEPMITFGFRSVSLKLHPKNPTYLITRQLADEPHYTHELISEPAVRNFT VTEKGWEFVWGNHPPKRFWAQETAPGNPHGLPHEVITHYYHRYPMSTILGLSICAAIATVSVAASTWLFCRSRVACLTPY RLTPNARIPFCLAVLCCA ; B,E,H,K ? 3 'polypeptide(L)' no no ;RMVMKLESDKTFPIMLEGKINGYACVVGGKLFRPMHVEGKIDNDVLAALKTKKASKYDLEYADVPQNMRADTFKYTHEKP QGYYSWHHGAVQYENGRFTVPKGVGAKGDSGRPILDNQGRVVAIVLGGVNEGSRTALSVVMWNEKGVTVKYTPENCEQW ; ;RMVMKLESDKTFPIMLEGKINGYACVVGGKLFRPMHVEGKIDNDVLAALKTKKASKYDLEYADVPQNMRADTFKYTHEKP QGYYSWHHGAVQYENGRFTVPKGVGAKGDSGRPILDNQGRVVAIVLGGVNEGSRTALSVVMWNEKGVTVKYTPENCEQW ; C,F,I,L ? 4 'polypeptide(L)' no no ;QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKSSGYTFTNYIIHWVRQAPGQRLEWMGWINAGNGNTKYSQKFQGRISVTRDTSASAAY MELSSLKSEDTALYYCATLQMDYGGNGDLDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVT 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_entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 440 VEEV ? ? ? 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'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP POLS_EEVV8 P05674 ? 1 ;YEHATTMPSQAGISYNTIVNRAGYAPLPISITPTKIKLIPTVNLEYVTCHYKTGMDSPAIKCCGSQECTPTYRPDEQCKV FTGVYPFMWGGAYCFCDTENTQVSKAYVMKSDDCLADHAEAYKAHTASVQAFLNITVGEHSIVTTVYVNGETPVNFNGVK ITAGPLSTAWTPFDRKIVQYAGEIYNYDFPEYGAGQPGAFGDIQSRTVSSSDLYANTNLVLQRPKAGAIHVPYTQAPSGF EQWKKDKAPSLKFTAPFGCEIYTNPIRAENCAVGSIPLAFDIPDALFTRVSETPTLSAAECTLNECVYSSDFGGIATVKY SASKSGKCAVHVPSGTATLKEAAVELTEQGSATIHFSTANIHPEFRLQICTSYVTCKGDCHPPKDHIVTHPQYHAQTFTA AVSKTAWTWLTSLLGGSAVIIIIGLVLATIVAMYVLTNQK ; 813 2 UNP POLS_EEVV8 P05674 ? 2 ;STEELFNEYKLTRPYMARCIRCAVGSCHSPIAIEAVKSDGHDGYVRLQTSSQYGLDSSGNLKGRTMRYDMHGTIKEIPLH QVSLYTSRPCHIVDGHGYFLLARCPAGDSITMEFKKDSVRHSCSVPYEVKFNPVGRELYTHPPEHGVEQACQVYAHDAQN RGAYVEMHLPGSEVDSSLVSLSGSSVTVTPPDGTSALVECECGGTKISETINKTKQFSQCTKKEQCRAYRLQNDKWVYNS DKLPKAAGATLKGKLHVPFLLADGKCTVPLAPEPMITFGFRSVSLKLHPKNPTYLITRQLADEPHYTHELISEPAVRNFT VTEKGWEFVWGNHPPKRFWAQETAPGNPHGLPHEVITHYYHRYPMSTILGLSICAAIATVSVAASTWLFCRSRVACLTPY RLTPNARIPFCLAVLCCA ; 335 3 UNP POLS_EEVV8 P05674 ? 3 ;RMVMKLESDKTFPIMLEGKINGYACVVGGKLFRPMHVEGKIDNDVLAALKTKKASKYDLEYADVPQNMRADTFKYTHEKP QGYYSWHHGAVQYENGRFTVPKGVGAKGDSGRPILDNQGRVVAIVLGGVNEGSRTALSVVMWNEKGVTVKYTPENCEQW ; 117 4 PDB 7SFV 7SFV ? 4 ? 1 5 PDB 7SFV 7SFV ? 5 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7SFV A 1 ? 440 ? 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'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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O CYS 22 SG ? ? ? 1_555 O CYS 96 SG ? ? O CYS 22 O CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf56 disulf ? ? P CYS 21 SG ? ? ? 1_555 P CYS 86 SG ? ? P CYS 22 P CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf57 disulf ? ? Q CYS 22 SG ? ? ? 1_555 Q CYS 96 SG ? ? Q CYS 22 Q CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf58 disulf ? ? R CYS 21 SG ? ? ? 1_555 R CYS 86 SG ? ? R CYS 22 R CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf59 disulf ? ? S CYS 22 SG ? ? ? 1_555 S CYS 96 SG ? ? S CYS 22 S CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf60 disulf ? ? T CYS 21 SG ? ? ? 1_555 T CYS 86 SG ? ? T CYS 22 T CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? covale1 covale one ? A ASN 134 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? A ASN 134 A NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? B ASN 318 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? B ASN 318 B NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? D ASN 134 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? D ASN 134 D NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? G ASN 134 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? G ASN 134 G NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? H ASN 318 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? H ASN 318 H NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? J ASN 134 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? J ASN 134 J NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? K ASN 318 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? K ASN 318 K NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLY 164 A . ? GLY 164 A PRO 165 A ? PRO 165 A 1 1.37 2 ASN 264 A . ? ASN 264 A PRO 265 A ? PRO 265 A 1 -2.03 3 ALA 344 B . ? ALA 344 B PRO 345 B ? PRO 345 B 1 -8.79 4 GLY 164 D . ? GLY 164 D PRO 165 D ? PRO 165 D 1 0.17 5 ASN 264 D . ? ASN 264 D PRO 265 D ? PRO 265 D 1 -2.06 6 ALA 344 E . ? ALA 344 E PRO 345 E ? PRO 345 E 1 -10.44 7 GLY 164 G . ? GLY 164 G PRO 165 G ? PRO 165 G 1 0.91 8 ASN 264 G . ? ASN 264 G PRO 265 G ? PRO 265 G 1 -3.66 9 ALA 344 H . ? ALA 344 H PRO 345 H ? PRO 345 H 1 -10.16 10 GLY 164 J . ? GLY 164 J PRO 165 J ? PRO 165 J 1 0.60 11 ASN 264 J . ? ASN 264 J PRO 265 J ? PRO 265 J 1 -2.10 12 ALA 344 K . ? ALA 344 K PRO 345 K ? PRO 345 K 1 -8.61 13 SER 122 Q . ? SER 122 Q ALA 123 Q ? ALA 123 Q 1 -2.57 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 5 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 5 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 3 ? AC1 ? 3 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 5 ? AC4 ? 6 ? AC5 ? 5 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 5 ? AC8 ? 5 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 3 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 2 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 5 ? 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AO5 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC4 5 6 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC7 4 5 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC8 4 5 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD8 4 5 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE6 3 4 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AE9 3 4 ? anti-parallel AE9 4 5 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? anti-parallel AF1 4 5 ? anti-parallel AF1 5 6 ? anti-parallel AF1 6 7 ? anti-parallel AF1 7 8 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 3 4 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF4 3 4 ? anti-parallel AF4 4 5 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF5 3 4 ? anti-parallel AF5 4 5 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF7 2 3 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG1 2 3 ? anti-parallel AG1 3 4 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG4 2 3 ? anti-parallel AG4 3 4 ? anti-parallel AG4 4 5 ? anti-parallel AG5 1 2 ? anti-parallel AG6 1 2 ? anti-parallel AG6 2 3 ? anti-parallel AG6 3 4 ? anti-parallel AG7 1 2 ? anti-parallel AG7 2 3 ? anti-parallel AG8 1 2 ? anti-parallel AG8 2 3 ? anti-parallel AG9 1 2 ? anti-parallel AH1 1 2 ? anti-parallel AH1 2 3 ? anti-parallel AH2 1 2 ? anti-parallel AH2 2 3 ? anti-parallel AH2 3 4 ? anti-parallel AH3 1 2 ? anti-parallel AH3 2 3 ? anti-parallel AH4 1 2 ? anti-parallel AH4 2 3 ? anti-parallel AH5 1 2 ? anti-parallel AH5 2 3 ? anti-parallel AH5 3 4 ? anti-parallel AH5 4 5 ? 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anti-parallel AJ5 2 3 ? anti-parallel AJ6 1 2 ? anti-parallel AJ7 1 2 ? anti-parallel AJ7 2 3 ? anti-parallel AJ8 1 2 ? anti-parallel AJ8 2 3 ? anti-parallel AJ8 3 4 ? anti-parallel AJ9 1 2 ? anti-parallel AJ9 2 3 ? anti-parallel AK1 1 2 ? anti-parallel AK1 2 3 ? anti-parallel AK2 1 2 ? anti-parallel AK2 2 3 ? anti-parallel AK2 3 4 ? anti-parallel AK2 4 5 ? anti-parallel AK3 1 2 ? anti-parallel AK3 2 3 ? anti-parallel AK3 3 4 ? anti-parallel AK3 4 5 ? anti-parallel AK4 1 2 ? anti-parallel AK4 2 3 ? anti-parallel AK5 1 2 ? anti-parallel AK5 2 3 ? anti-parallel AK5 3 4 ? anti-parallel AK6 1 2 ? parallel AK6 2 3 ? anti-parallel AK6 3 4 ? anti-parallel AK6 4 5 ? anti-parallel AK6 5 6 ? anti-parallel AK7 1 2 ? parallel AK7 2 3 ? anti-parallel AK7 3 4 ? anti-parallel AK8 1 2 ? anti-parallel AK9 1 2 ? parallel AK9 2 3 ? anti-parallel AK9 3 4 ? anti-parallel AK9 4 5 ? anti-parallel AL1 1 2 ? parallel AL1 2 3 ? anti-parallel AL1 3 4 ? anti-parallel AL2 1 2 ? anti-parallel AL2 2 3 ? anti-parallel AL3 1 2 ? anti-parallel AL3 2 3 ? anti-parallel AL4 1 2 ? anti-parallel AL4 2 3 ? anti-parallel AL5 1 2 ? anti-parallel AL5 2 3 ? anti-parallel AL5 3 4 ? anti-parallel AL6 1 2 ? anti-parallel AL6 2 3 ? anti-parallel AL6 3 4 ? anti-parallel AL7 1 2 ? parallel AL7 2 3 ? anti-parallel AL7 3 4 ? anti-parallel AL7 4 5 ? anti-parallel AL7 5 6 ? anti-parallel AL8 1 2 ? anti-parallel AL9 1 2 ? parallel AL9 2 3 ? anti-parallel AL9 3 4 ? anti-parallel AL9 4 5 ? anti-parallel AM1 1 2 ? parallel AM1 2 3 ? anti-parallel AM1 3 4 ? anti-parallel AM2 1 2 ? anti-parallel AM2 2 3 ? anti-parallel AM3 1 2 ? anti-parallel AM3 2 3 ? anti-parallel AM4 1 2 ? anti-parallel AM4 2 3 ? anti-parallel AM5 1 2 ? anti-parallel AM5 2 3 ? anti-parallel AM5 3 4 ? anti-parallel AM6 1 2 ? anti-parallel AM6 2 3 ? anti-parallel AM6 3 4 ? anti-parallel AM7 1 2 ? anti-parallel AM7 2 3 ? anti-parallel AM7 3 4 ? anti-parallel AM7 4 5 ? anti-parallel AM8 1 2 ? anti-parallel AM9 1 2 ? parallel AN1 1 2 ? anti-parallel AN1 2 3 ? anti-parallel AN2 1 2 ? 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FA 6 NAG 1 502 502 NAG NAG K . # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 'complete icosahedral assembly' ? 1200-meric 1200 2 'icosahedral asymmetric unit' ? eicosameric 20 3 'icosahedral pentamer' ? 100-meric 100 4 'icosahedral 23 hexamer' ? 120-meric 120 5 'icosahedral asymmetric unit, std point frame' ? eicosameric 20 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 '(1-60)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA 2 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA 3 '(1-5)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA 4 '(1,2,6,10,23,24)' A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA 5 P A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] P 'transform to point frame' ? ? -0.58778525 -0.80901699 -0.00000028 592.17202 0.68819071 -0.50000000 0.52573144 -302.66606 -0.42532581 0.30901700 0.85065061 -311.32293 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 1.00000000 0.00000 2 'point symmetry operation' ? ? 0.30901700 -0.95105652 -0.00000033 696.13996 0.95105652 0.30901699 0.00000045 -110.25791 -0.00000033 -0.00000045 1.00000000 0.00033 3 'point symmetry operation' ? ? -0.80901699 -0.58778525 -0.00000086 1016.12054 0.58778525 -0.80901700 0.00000028 517.73897 -0.00000087 -0.00000027 1.00000000 0.00048 4 'point symmetry operation' ? ? -0.80901700 0.58778525 -0.00000086 517.73946 -0.58778525 -0.80901699 -0.00000028 1016.12030 -0.00000086 0.00000029 1.00000000 0.00024 5 'point symmetry operation' ? ? 0.30901699 0.95105652 -0.00000033 -110.25757 -0.95105652 0.30901700 -0.00000045 696.14001 -0.00000032 0.00000046 1.00000000 -0.00006 6 'point symmetry operation' ? ? -0.63819591 -0.26286581 -0.72360731 1112.72391 -0.26286581 -0.80901699 0.52573099 655.48840 -0.72360731 0.52573099 0.44721291 318.24245 7 'point symmetry operation' ? ? -0.44721339 0.52573071 -0.72360722 697.43302 -0.85065106 0.00000000 0.52573071 561.69770 0.27639278 0.85065106 0.44721338 -243.45536 8 'point symmetry operation' ? ? 0.36180332 0.58778525 -0.72360684 328.14370 -0.26286581 0.80901700 0.52573099 -30.47432 0.89442715 0.00000027 0.44721367 -144.83816 9 'point symmetry operation' ? ? 0.67082061 -0.16245945 -0.72360669 515.20124 0.68819071 0.50000000 0.52573144 -302.66606 0.27639331 -0.85065088 0.44721338 477.80844 10 'point symmetry operation' ? ? 0.05278710 -0.68819072 -0.72360699 1000.09847 0.68819071 -0.50000000 0.52573144 121.28222 -0.72360698 -0.52573143 0.44721290 764.00800 11 'point symmetry operation' ? ? -0.05278709 -0.68819071 0.72360698 431.31261 -0.68819071 -0.50000000 -0.52573144 1150.56261 0.72360699 -0.52573144 -0.44721291 529.65440 12 'point symmetry operation' ? ? -0.67082061 -0.16245943 0.72360669 470.44411 -0.68819071 0.50000000 -0.52573144 726.61433 -0.27639330 -0.85065088 -0.44721338 1091.35204 13 'point symmetry operation' ? ? -0.36180332 0.58778526 0.72360684 21.37176 0.26286581 0.80901699 -0.52573099 192.40815 -0.89442715 0.00000028 -0.44721367 992.73446 14 'point symmetry operation' ? ? 0.44721338 0.52573071 0.72360722 -295.30172 0.85065106 0.00000000 -0.52573071 286.19885 -0.27639278 0.85065105 -0.44721338 370.08780 15 'point symmetry operation' ? ? 0.63819591 -0.26286581 0.72360731 -41.94434 0.26286581 -0.80901700 -0.52573099 878.37087 0.72360731 0.52573098 -0.44721290 83.88858 16 'point symmetry operation' ? ? -0.30901699 0.95105652 0.00000033 151.75659 0.95105652 0.30901699 0.00000045 -110.25791 0.00000032 0.00000045 -1.00000000 847.89620 17 'point symmetry operation' ? ? 0.80901700 0.58778524 0.00000086 -168.22399 0.58778526 -0.80901700 0.00000028 517.73897 0.00000086 0.00000028 -1.00000000 847.89605 18 'point symmetry operation' ? ? 0.80901699 -0.58778526 0.00000086 330.15710 -0.58778525 -0.80901699 -0.00000028 1016.12030 0.00000087 -0.00000028 -1.00000000 847.89628 19 'point symmetry operation' ? ? -0.30901700 -0.95105651 0.00000033 958.15413 -0.95105652 0.30901700 -0.00000045 696.14002 0.00000033 -0.00000046 -1.00000000 847.89658 20 'point symmetry operation' ? ? -1.00000000 0.00000000 0.00000000 847.89655 0.00000000 1.00000000 0.00000000 0.00000 0.00000000 0.00000000 -1.00000000 847.89653 21 'point symmetry operation' ? ? -0.44721338 -0.52573071 -0.72360723 1143.19827 0.85065106 0.00000000 -0.52573071 286.19885 0.27639277 -0.85065105 0.44721338 477.80873 22 'point symmetry operation' ? ? -0.63819591 0.26286580 -0.72360732 889.84090 0.26286581 -0.80901700 -0.52573099 878.37087 -0.72360731 -0.52573097 0.44721291 764.00794 23 'point symmetry operation' ? ? 0.05278709 0.68819070 -0.72360699 416.58395 -0.68819071 -0.50000000 -0.52573144 1150.56261 -0.72360698 0.52573145 0.44721291 318.24212 24 'point symmetry operation' ? ? 0.67082060 0.16245944 -0.72360670 377.45244 -0.68819071 0.50000000 -0.52573144 726.61434 0.27639331 0.85065088 0.44721339 -243.45551 25 'point symmetry operation' ? ? 0.36180332 -0.58778525 -0.72360684 826.52479 0.26286580 0.80901699 -0.52573099 192.40815 0.89442714 -0.00000029 0.44721368 -144.83792 26 'point symmetry operation' ? ? 0.94721386 0.16245944 -0.27639255 70.68034 -0.16245944 -0.50000000 -0.85065089 1065.42878 -0.27639254 0.85065088 -0.44721385 370.08797 27 'point symmetry operation' ? ? 0.44721338 -0.85065106 -0.27639278 712.16122 -0.52573071 0.00000000 -0.85065106 1007.46295 0.72360722 0.52573070 -0.44721338 83.88894 28 'point symmetry operation' ? ? -0.67082060 -0.68819071 -0.27639331 1117.27524 -0.16245945 0.50000000 -0.85065089 641.48051 0.72360669 -0.52573145 -0.44721338 529.65473 29 'point symmetry operation' ? ? -0.86180313 0.42532581 -0.27639340 726.16859 0.42532581 0.30901699 -0.85065061 473.25676 -0.27639340 -0.85065060 -0.44721386 1091.35216 30 'point symmetry operation' ? ? 0.13819716 0.95105651 -0.27639293 79.33737 0.42532581 -0.30901700 -0.85065061 735.27120 -0.89442691 0.00000046 -0.44721415 992.73448 31 'point symmetry operation' ? ? -0.13819716 0.95105652 0.27639293 -37.83835 -0.42532581 -0.30901699 0.85065061 374.63979 0.89442691 0.00000045 0.44721415 -144.83834 32 'point symmetry operation' ? ? 0.86180313 0.42532581 0.27639341 -238.90432 -0.42532581 0.30901700 0.85065061 112.62534 0.27639340 -0.85065060 0.44721385 477.80808 33 'point symmetry operation' ? ? 0.67082061 -0.68819071 0.27639331 314.13584 0.16245944 0.50000000 0.85065089 -217.53223 -0.72360669 -0.52573143 0.44721338 764.00767 34 'point symmetry operation' ? ? -0.44721338 -0.85065105 0.27639278 856.99942 0.52573071 0.00000000 0.85065106 -159.56639 -0.72360722 0.52573071 0.44721338 318.24234 35 'point symmetry operation' ? ? -0.94721386 0.16245945 0.27639255 639.46742 0.16245944 -0.50000000 0.85065089 206.41604 0.27639253 0.85065088 0.44721386 -243.45539 36 'point symmetry operation' ? ? -0.36180332 -0.58778524 0.72360684 519.75284 -0.26286581 0.80901700 0.52573099 -30.47432 -0.89442714 -0.00000028 -0.44721368 992.73469 37 'point symmetry operation' ? 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