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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP COQ9_HUMAN O75208 ? 1 ;MAAAAVSGALGRAGWRLLQLRCLPVARCRQALVPRAFHASAVGLRSSDEQKQQPPNSFSQQHSETQGAEKPDPESSHSPP RYTDQGGEEEEDYESEEQLQHRILTAALEFVPAHGWTAEAIAEGAQSLGLSSAAASMFGKDGSELILHFVTQCNTRLTRV LEEEQKLVQLGQAEKRKTDQFLRDAVETRLRMLIPYIEHWPRALSILMLPHNIPSSLSLLTSMVDDMWHYAGDQSTDFNW YTRRAMLAAIYNTTELVMMQDSSPDFEDTWRFLENRVNDAMNMGHTAKQVKSTGEALVQGLMGAAVTLKNLTGLNQRR ; 1 2 UNP COQ7_HUMAN Q99807 ? 2 ;MSCAGAAAAPRLWRLRPGARRSLSAYGRRTSVRFRSSGMTLDNISRAAVDRIIRVDHAGEYGANRIYAGQMAVLGRTSVG PVIQKMWDQEKDHLKKFNELMVTFRVRPTVLMPLWNVLGFALGAGTALLGKEGAMACTVAVEESIAHHYNNQIRTLMEED PEKYEELLQLIKKFRDEELEHHDIGLDHDAELAPAYAVLKSIIQAGCRVAIYLSERL ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7SSS A 1 ? 318 ? O75208 1 ? 318 ? 1 318 2 1 7SSS B 1 ? 318 ? O75208 1 ? 318 ? 1 318 3 1 7SSS C 1 ? 318 ? O75208 1 ? 318 ? 1 318 4 1 7SSS D 1 ? 318 ? O75208 1 ? 318 ? 1 318 5 2 7SSS E 1 ? 217 ? Q99807 1 ? 217 ? 1 217 6 2 7SSS F 1 ? 217 ? Q99807 1 ? 217 ? 1 217 7 2 7SSS G 1 ? 217 ? Q99807 1 ? 217 ? 1 217 8 2 7SSS H 1 ? 217 ? Q99807 1 ? 217 ? 1 217 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight 8PP non-polymer . '2-[(2E,6E,10E,14E,18E,22E,26E)-3,7,11,15,19,23,27,31-OCTAMETHYLDOTRIACONTA-2,6,10,14,18,22,26,30-OCTAENYL]PHENOL' ? 'C46 H70 O' 639.047 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAD non-polymer . NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE ? 'C21 H27 N7 O14 P2' 663.425 PEV non-polymer . '(1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE' 'PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE; 1-PALMITOYL-2-OLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOETHANOLAMINE' 'C39 H78 N O8 P' 720.012 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7SSS _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7SSS _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.008 ? 12225 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.092 ? 16442 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 14.596 ? 4561 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.043 ? 1778 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.019 ? 2066 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7SSS _struct.title 'Structure of the NADH-bound human COQ7:COQ9 complex by single-particle electron cryo-microscopy' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7SSS _struct_keywords.text 'hydroxylase, complex, lipid, enzyme, NADH, coenzymeQ, isoprene, OPP, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 3 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 3 ? M N N 3 ? N N N 4 ? 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THR D 117 SER D 127 1 ? 11 HELX_P HELX_P35 AD8 GLY D 142 ? LEU D 170 ? GLY D 142 LEU D 170 1 ? 29 HELX_P HELX_P36 AD9 LYS D 177 ? ARG D 191 ? LYS D 177 ARG D 191 1 ? 15 HELX_P HELX_P37 AE1 MET D 192 ? ILE D 197 ? MET D 192 ILE D 197 5 ? 6 HELX_P HELX_P38 AE2 HIS D 199 ? MET D 208 ? HIS D 199 MET D 208 1 ? 10 HELX_P HELX_P39 AE3 ASN D 212 ? ALA D 231 ? ASN D 212 ALA D 231 1 ? 20 HELX_P HELX_P40 AE4 PHE D 238 ? GLN D 260 ? PHE D 238 GLN D 260 1 ? 23 HELX_P HELX_P41 AE5 SER D 263 ? ASP D 265 ? SER D 263 ASP D 265 5 ? 3 HELX_P HELX_P42 AE6 PHE D 266 ? ASN D 282 ? PHE D 266 ASN D 282 1 ? 17 HELX_P HELX_P43 AE7 ARG E 46 ? GLY E 75 ? ARG E 46 GLY E 75 1 ? 30 HELX_P HELX_P44 AE8 VAL E 79 ? ARG E 105 ? VAL E 79 ARG E 105 1 ? 27 HELX_P HELX_P45 AE9 LEU E 111 ? THR E 126 ? LEU E 111 THR E 126 1 ? 16 HELX_P HELX_P46 AF1 GLY E 130 ? MET E 157 ? GLY E 130 MET E 157 1 ? 28 HELX_P HELX_P47 AF2 TYR E 164 ? GLU E 178 ? TYR E 164 GLU E 178 1 ? 15 HELX_P HELX_P48 AF3 ALA E 193 ? GLU E 215 ? 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