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N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ILE 224 A . ? ILE 224 A PRO 225 A ? PRO 225 A 1 -19.54 2 PRO 1402 A . ? PRO 1402 A PRO 1403 A ? PRO 1403 A 1 6.64 3 GLN 1282 D . ? GLN 1381 D PRO 1283 D ? PRO 1382 D 1 -10.53 4 SER 1683 E . ? 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AA7 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 TYR A 205 ? VAL A 209 ? TYR A 205 VAL A 209 AA1 2 PHE A 243 ? ASP A 247 ? PHE A 243 ASP A 247 AA2 1 GLN A 349 ? MET A 350 ? GLN A 349 MET A 350 AA2 2 VAL A 362 ? ALA A 363 ? VAL A 362 ALA A 363 AA3 1 LYS A 1045 ? CYS A 1046 ? LYS A 1045 CYS A 1046 AA3 2 TRP A 1090 ? ALA A 1091 ? TRP A 1090 ALA A 1091 AA4 1 ILE A 1060 ? ASN A 1064 ? ILE A 1060 ASN A 1064 AA4 2 GLY A 1083 ? PRO A 1087 ? GLY A 1083 PRO A 1087 AA5 1 VAL A 1484 ? PRO A 1486 ? VAL A 1484 PRO A 1486 AA5 2 ASP A 1527 ? THR A 1529 ? ASP A 1527 THR A 1529 AA6 1 THR B 327 ? PRO B 329 ? THR B 327 PRO B 329 AA6 2 GLU B 375 ? CYS B 377 ? GLU B 375 CYS B 377 AA7 1 THR E 2010 ? PRO E 2013 ? THR E 2010 PRO E 2013 AA7 2 THR E 1997 ? HIS E 2001 ? THR E 1997 HIS E 2001 AA7 3 GLN E 2071 ? HIS E 2076 ? GLN E 2071 HIS E 2076 AA7 4 TYR E 2041 ? ASP E 2045 ? TYR E 2041 ASP E 2045 AA7 5 LEU E 2050 ? ILE E 2051 ? LEU E 2050 ILE E 2051 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N HIS A 206 ? N HIS A 206 O MET A 246 ? O MET A 246 AA2 1 2 N MET A 350 ? N MET A 350 O VAL A 362 ? O VAL A 362 AA3 1 2 N LYS A 1045 ? N LYS A 1045 O ALA A 1091 ? O ALA A 1091 AA4 1 2 N ILE A 1063 ? N ILE A 1063 O PHE A 1084 ? O PHE A 1084 AA5 1 2 N ILE A 1485 ? N ILE A 1485 O VAL A 1528 ? O VAL A 1528 AA6 1 2 N ILE B 328 ? N ILE B 328 O CYS B 376 ? O CYS B 376 AA7 1 2 O LEU E 2012 ? O LEU E 2012 N LEU E 1998 ? N LEU E 1998 AA7 2 3 N HIS E 2001 ? N HIS E 2001 O LEU E 2072 ? O LEU E 2072 AA7 3 4 O VAL E 2075 ? O VAL E 2075 N PHE E 2042 ? N PHE E 2042 AA7 4 5 N ASP E 2045 ? N ASP E 2045 O LEU E 2050 ? O LEU E 2050 # _atom_sites.entry_id 7SX3 _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C N O P S # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 MET 1 1 ? ? ? 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A . n A 1 33 ILE 33 33 33 ILE ILE A . n A 1 34 ASN 34 34 34 ASN ASN A . n A 1 35 LYS 35 35 35 LYS LYS A . n A 1 36 PRO 36 36 36 PRO PRO A . n A 1 37 TRP 37 37 37 TRP TRP A . n A 1 38 VAL 38 38 38 VAL VAL A . n A 1 39 HIS 39 39 39 HIS HIS A . n A 1 40 SER 40 40 40 SER SER A . n A 1 41 LEU 41 41 41 LEU LEU A . n A 1 42 LEU 42 42 42 LEU LEU A . n A 1 43 ARG 43 43 43 ARG ARG A . n A 1 44 ILE 44 44 44 ILE ILE A . n A 1 45 CYS 45 45 45 CYS CYS A . n A 1 46 ALA 46 46 46 ALA ALA A . n A 1 47 ILE 47 47 47 ILE ILE A . n A 1 48 ILE 48 48 48 ILE ILE A . n A 1 49 SER 49 49 49 SER SER A . n A 1 50 VAL 50 50 50 VAL VAL A . n A 1 51 ILE 51 51 51 ILE ILE A . n A 1 52 SER 52 52 52 SER SER A . n A 1 53 VAL 53 53 53 VAL VAL A . n A 1 54 CYS 54 54 54 CYS CYS A . n A 1 55 MET 55 55 55 MET MET A . n A 1 56 ASN 56 56 56 ASN ASN A . n A 1 57 THR 57 57 57 THR THR A . n A 1 58 PRO 58 58 58 PRO PRO A . n A 1 59 MET 59 59 59 MET MET A . n A 1 60 THR 60 60 60 THR THR A . n A 1 61 PHE 61 61 61 PHE PHE A . n A 1 62 GLU 62 62 62 GLU GLU A . n A 1 63 HIS 63 63 63 HIS HIS A . n A 1 64 TYR 64 64 64 TYR TYR A . n A 1 65 PRO 65 65 65 PRO PRO A . n A 1 66 PRO 66 66 66 PRO PRO A . n A 1 67 LEU 67 67 67 LEU LEU A . n A 1 68 GLN 68 68 68 GLN GLN A . n A 1 69 TYR 69 69 69 TYR TYR A . n A 1 70 VAL 70 70 70 VAL VAL A . n A 1 71 THR 71 71 71 THR THR A . n A 1 72 PHE 72 72 72 PHE PHE A . n A 1 73 THR 73 73 73 THR THR A . n A 1 74 LEU 74 74 74 LEU LEU A . n A 1 75 ASP 75 75 75 ASP ASP A . n A 1 76 THR 76 76 76 THR THR A . n A 1 77 LEU 77 77 77 LEU LEU A . n A 1 78 LEU 78 78 78 LEU LEU A . n A 1 79 MET 79 79 79 MET MET A . n A 1 80 PHE 80 80 80 PHE PHE A . n A 1 81 LEU 81 81 81 LEU LEU A . n A 1 82 TYR 82 82 82 TYR TYR A . n A 1 83 THR 83 83 83 THR THR A . n A 1 84 ALA 84 84 84 ALA ALA A . n A 1 85 GLU 85 85 85 GLU GLU A . n A 1 86 MET 86 86 86 MET MET A . n A 1 87 ILE 87 87 87 ILE ILE A . n A 1 88 ALA 88 88 88 ALA ALA A . n A 1 89 LYS 89 89 89 LYS LYS A . n A 1 90 MET 90 90 90 MET MET A . n A 1 91 HIS 91 91 91 HIS HIS A . n A 1 92 ILE 92 92 ? ? ? 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E ASP 3250 3804 1 Y 1 E ALA 3251 ? E ALA 3251 3805 1 Y 1 E VAL 3252 ? E VAL 3252 3806 1 Y 1 E LEU 3253 ? E LEU 3253 3807 1 Y 1 E ASP 3254 ? E ASP 3254 3808 1 Y 1 E GLU 3255 ? E GLU 3255 3809 1 Y 1 E SER 3256 ? E SER 3256 3810 1 Y 1 E HIS 3257 ? E HIS 3257 3811 1 Y 1 E VAL 3258 ? E VAL 3258 3812 1 Y 1 E GLY 3259 ? E GLY 3259 3813 1 Y 1 E GLY 3260 ? E GLY 3260 3814 1 Y 1 E SER 3261 ? E SER 3261 3815 1 Y 1 E GLY 3262 ? E GLY 3262 3816 1 Y 1 E GLY 3263 ? E GLY 3263 3817 1 Y 1 E SER 3264 ? E SER 3264 3818 1 Y 1 E ASP 3265 ? E ASP 3265 3819 1 Y 1 E TYR 3266 ? E TYR 3266 3820 1 Y 1 E LYS 3267 ? E LYS 3267 3821 1 Y 1 E ASP 3268 ? E ASP 3268 3822 1 Y 1 E ASP 3269 ? E ASP 3269 3823 1 Y 1 E ASP 3270 ? E ASP 3270 3824 1 Y 1 E ASP 3271 ? E ASP 3271 3825 1 Y 1 E LYS 3272 ? E LYS 3272 3826 1 Y 1 E GLY 3273 ? E GLY 3273 3827 1 Y 1 E ASN 3274 ? E ASN 3274 3828 1 Y 1 E SER 3275 ? E SER 3275 3829 1 Y 1 E ASP 3276 ? E ASP 3276 3830 1 Y 1 E TYR 3277 ? E TYR 3277 3831 1 Y 1 E LYS 3278 ? E LYS 3278 3832 1 Y 1 E ASP 3279 ? E ASP 3279 3833 1 Y 1 E ASP 3280 ? E ASP 3280 3834 1 Y 1 E ASP 3281 ? E ASP 3281 3835 1 Y 1 E ASP 3282 ? E ASP 3282 3836 1 Y 1 E LYS 3283 ? E LYS 3283 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 200 mM NaCl 'sodium chloride' 1 2 25 mM HEPES ? # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details 'selected micrographs with a CTF fit of 10.0 A or better' # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units ? _em_entity_assembly_molwt.value ? # _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 9606 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Homo sapiens' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 2 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 9606 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Homo sapiens' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain Expi293 # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 64.009 _em_image_recording.average_exposure_time 3 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode ? _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 2 _em_image_recording.num_real_images 26550 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? # _em_imaging_optics.id 1 _em_imaging_optics.imaging_id 1 _em_imaging_optics.chr_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.energyfilter_lower ? _em_imaging_optics.energyfilter_name 'GIF Bioquantum' _em_imaging_optics.energyfilter_upper ? _em_imaging_optics.energyfilter_slit_width 20 _em_imaging_optics.phase_plate ? _em_imaging_optics.sph_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.details ? # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ? _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 3048401 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? Gautomatch ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? SerialEM 3.7.11 ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? CTFFIND 4.1.13 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? cisTEM 1.02 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? cisTEM 1.02 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? RELION 3.1 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? cisTEM 1.02 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 1.65 _em_specimen.details ;NALCN was reconstituted into lipid nanodiscs and mildly crosslinkned with 0.05% EM grade glutaraldehyde for 10 min at room temperature. Cross-linking was quenched with 9 mM Tris pH 7.5 ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _pdbx_audit_support.funding_organization 'Not funded' _pdbx_audit_support.country ? _pdbx_audit_support.grant_number ? _pdbx_audit_support.ordinal 1 # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 6 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose NAG 7 '(1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE' PEV 8 '(1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE' PGV 9 'CHOLESTEROL HEMISUCCINATE' Y01 # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 'mass spectrometry' 'identification of CaM' 2 1 'gel filtration' 'elutes as single peak on SEC' #