data_7T4R # _entry.id 7T4R # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.356 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 7T4R pdb_00007t4r 10.2210/pdb7t4r/pdb WWPDB D_1000259068 ? ? EMDB EMD-25686 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'CryoEM structure of the HCMV Pentamer gH/gL/UL128/UL130/UL131A in complex with THBD and neutralizing fabs MSL-109 and 13H11' _pdbx_database_related.db_id EMD-25686 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7T4R _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-12-10 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Kschonsak, M.' 1 0000-0002-4392-1614 'Johnson, M.C.' 2 0000-0002-1477-7801 'Schelling, R.' 3 0000-0001-6966-6626 'Green, E.M.' 4 0000-0002-9758-4799 'Rouge, L.' 5 0000-0002-7953-5803 'Ho, H.' 6 ? 'Patel, N.' 7 ? 'Kilic, C.' 8 ? 'Kraft, E.' 9 ? 'Arthur, C.P.' 10 0000-0001-9647-1509 'Rohou, A.L.' 11 0000-0002-3343-9621 'Comps-Agrar, L.' 12 0000-0002-5260-6536 'Martinez-Martin, N.' 13 ? 'Perez, L.' 14 0000-0002-8860-7928 'Payandeh, J.' 15 0000-0002-4015-9716 'Ciferri, C.' 16 0000-0002-0804-2411 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Sci Adv' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2375-2548 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 8 _citation.language ? _citation.page_first eabm2536 _citation.page_last eabm2536 _citation.title 'Structural basis for HCMV Pentamer receptor recognition and antibody neutralization.' _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1126/sciadv.abm2536 _citation.pdbx_database_id_PubMed 35275719 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Kschonsak, M.' 1 0000-0002-4392-1614 primary 'Johnson, M.C.' 2 0000-0002-1477-7801 primary 'Schelling, R.' 3 ? primary 'Green, E.M.' 4 ? primary 'Rouge, L.' 5 0000-0002-7953-5803 primary 'Ho, H.' 6 0000-0002-1964-0660 primary 'Patel, N.' 7 0000-0001-9327-6062 primary 'Kilic, C.' 8 ? primary 'Kraft, E.' 9 0000-0003-4483-8684 primary 'Arthur, C.P.' 10 0000-0001-9647-1509 primary 'Rohou, A.L.' 11 0000-0002-3343-9621 primary 'Comps-Agrar, L.' 12 ? primary 'Martinez-Martin, N.' 13 ? primary 'Perez, L.' 14 0000-0002-8860-7928 primary 'Payandeh, J.' 15 0000-0002-4015-9716 primary 'Ciferri, C.' 16 0000-0002-0804-2411 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7T4R _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 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H' 87311.273 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Envelope glycoprotein L' 30846.492 2 ? ? ? ? 4 polymer man 'Envelope protein UL128' 19746.023 2 ? ? ? ? 5 polymer man 'Envelope glycoprotein UL130' 28866.811 2 ? ? ? ? 6 polymer man 'Envelope protein UL131A' 15011.043 2 ? ? ? ? 7 polymer man 'Fab 13H11 heavy chain' 26600.086 2 ? ? ? ? 8 polymer man 'Fab 13H11 light chain' 25780.020 2 ? ? ? ? 9 polymer man 'Fab MSL-109 light chain' 28355.809 2 ? ? ? ? 10 polymer man 'Fab MSL-109 heavy chain' 27547.818 2 ? ? ? ? 11 non-polymer syn 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 14 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 TM,Fetomodulin 2 gH 3 gL 4 UL128 5 UL130 6 'Protein UL131A,UL131A' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no 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PHRCQMFCNQTACPADCDPNTQASCECPEGYILDDGFICTDIDECENGGFCSGVCHNLPGTFECICGPDSALARHIGTDC DSGKVDGGDSGSGEPPPSPTPGSTLTPPAVGLVHSGGNSDYKDDDDK ; A ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MRPGLPSYLIILAVCLFSHLLSSRYGAEAVSEPLDKAFHLLLNTYGRPIRFLRENTTQCTYNSSLRNSTVVRENAISFNF FQSYNQYYVFHMPRCLFAGPLAEQFLNQVDLTETLERYQQRLNTYALVSKDLASYRSFSQQLKAQDSLGEQPTTVPPPID LSIPHVWMPPQTTPHGWTESHTTSGLHRPHFNQTCILFDGHDLLFSTVTPCLHQGFYLIDELRYVKITLTEDFFVVTVSI DDDTPMLLIFGHLPRVLFKAPYQRDNFILRQTEKHELLVLVKKDQLNRHSYLKDPDFLDAALDFNYLDLSALLRNSFHRY AVDVLKSGRCQMLDRRTVEMAFAYALALFAAARQEEAGAQVSVPRALDRQAALLQIQEFMITCLSQTPPRTTLLLYPTAV DLAKRALWTPNQITDITSLVRLVYILSKQNQQHLIPQWALRQIADFALKLHKTHLASFLSAFARQELYLMGSLVHSMLVH TTERREIFIVETGLCSLAELSHFTQLLAHPHHEYLSDLYTPCSSSGRRDHSLERLTRLFPDATVPATVPAALSILSTMQP STLETFPDLFCLPLGESFSALTVSEHVSYIVTNQYLIKGISYPVSTTVVGQSLIITQTDSQTKCELTRNMHTTHSITVAL NISLENCAFCQSALLEYDDTQGVINIMYMHDSDDVLFALDPYNEVVVSSPRTHYLMLLKNGTVLEVTDVVVDATDGTKLG PEQKLISEEDLNSAVDGSGLNDIFEAQKIEWHENLYFQGHHHHHHHH ; ;MRPGLPSYLIILAVCLFSHLLSSRYGAEAVSEPLDKAFHLLLNTYGRPIRFLRENTTQCTYNSSLRNSTVVRENAISFNF FQSYNQYYVFHMPRCLFAGPLAEQFLNQVDLTETLERYQQRLNTYALVSKDLASYRSFSQQLKAQDSLGEQPTTVPPPID LSIPHVWMPPQTTPHGWTESHTTSGLHRPHFNQTCILFDGHDLLFSTVTPCLHQGFYLIDELRYVKITLTEDFFVVTVSI DDDTPMLLIFGHLPRVLFKAPYQRDNFILRQTEKHELLVLVKKDQLNRHSYLKDPDFLDAALDFNYLDLSALLRNSFHRY AVDVLKSGRCQMLDRRTVEMAFAYALALFAAARQEEAGAQVSVPRALDRQAALLQIQEFMITCLSQTPPRTTLLLYPTAV DLAKRALWTPNQITDITSLVRLVYILSKQNQQHLIPQWALRQIADFALKLHKTHLASFLSAFARQELYLMGSLVHSMLVH TTERREIFIVETGLCSLAELSHFTQLLAHPHHEYLSDLYTPCSSSGRRDHSLERLTRLFPDATVPATVPAALSILSTMQP STLETFPDLFCLPLGESFSALTVSEHVSYIVTNQYLIKGISYPVSTTVVGQSLIITQTDSQTKCELTRNMHTTHSITVAL NISLENCAFCQSALLEYDDTQGVINIMYMHDSDDVLFALDPYNEVVVSSPRTHYLMLLKNGTVLEVTDVVVDATDGTKLG PEQKLISEEDLNSAVDGSGLNDIFEAQKIEWHENLYFQGHHHHHHHH ; B,K ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MCRRPDCGFSFSPGPVILLWCCLLLPIVSSAAVSVAPTAAEKVPAECPELTRRCLLGEVFEGDKYESWLRPLVNVTGRDG PLSQLIRYRPVTPEAANSVLLDEAFLDTLALLYNNPDQLRALLTLLSSDTAPRWMTVMRGYSECGDGSPAVYTCVDDLCR GYDLTRLSYGRSIFTEHVLGFELVPPSLFNVVVAIRNEATRTNRAVRLPVSTAAAPEGITLFYGLYNAVKEFCLRHQLDP PLLRHLDKYYAGLPPELKQTRVNLPAHSRYGPQAVDAR ; ;MCRRPDCGFSFSPGPVILLWCCLLLPIVSSAAVSVAPTAAEKVPAECPELTRRCLLGEVFEGDKYESWLRPLVNVTGRDG PLSQLIRYRPVTPEAANSVLLDEAFLDTLALLYNNPDQLRALLTLLSSDTAPRWMTVMRGYSECGDGSPAVYTCVDDLCR GYDLTRLSYGRSIFTEHVLGFELVPPSLFNVVVAIRNEATRTNRAVRLPVSTAAAPEGITLFYGLYNAVKEFCLRHQLDP PLLRHLDKYYAGLPPELKQTRVNLPAHSRYGPQAVDAR ; C,L ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSPKNLTPFLTALWLLLGHSRVPRVRAEECCEFINVNHPPERCYDFKMCNRFTVALRCPDGEVCYSPEKTAEIRGIVTTM THSLTRQVVHNKLTSCNYNPLYLEADGRIRCGKVNDKAQYLLGAAGSVPYRWINLEYDKITRIVGLDQYLESVKKHKRLD VCRAKMGYMLQ ; ;MSPKNLTPFLTALWLLLGHSRVPRVRAEECCEFINVNHPPERCYDFKMCNRFTVALRCPDGEVCYSPEKTAEIRGIVTTM THSLTRQVVHNKLTSCNYNPLYLEADGRIRCGKVNDKAQYLLGAAGSVPYRWINLEYDKITRIVGLDQYLESVKKHKRLD VCRAKMGYMLQ ; D,M ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MLRLLLRHHFHCLLLCAVWATPCLASPWFTLTANQNPSPPWSKLTYPKPHDAATFYCPFLYPSPPRSPSQFSGFQRVSTG PECRNETLYLLYNREGQTLVERSSTWVKKVIWYLSGRNQTILQRMPRTASKPSDGNVQISVEDAKIFGAHMVPKQTKLLR FVVNDGTRYQMCVMKLESWAHVFRDYSVSFQVRLTFTEANNQTYTFCTHPNLIVGSENLYFQGSAWSHPQFEKGGGSGGG SGGGSAWSHPQFEK ; ;MLRLLLRHHFHCLLLCAVWATPCLASPWFTLTANQNPSPPWSKLTYPKPHDAATFYCPFLYPSPPRSPSQFSGFQRVSTG PECRNETLYLLYNREGQTLVERSSTWVKKVIWYLSGRNQTILQRMPRTASKPSDGNVQISVEDAKIFGAHMVPKQTKLLR FVVNDGTRYQMCVMKLESWAHVFRDYSVSFQVRLTFTEANNQTYTFCTHPNLIVGSENLYFQGSAWSHPQFEKGGGSGGG SGGGSAWSHPQFEK ; E,N ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MRLCRVWLSVCLCAVVLGQCQRETAEKNDYYRVPHYWDACSRALPDQTRYKYVEQLVDLTLNYHYDASHGLDNFDVLKRI NVTEVSLLISDFRRQNRRGGTNKRTTFNAAGSLAPHARSLEFSVRLFAN ; ;MRLCRVWLSVCLCAVVLGQCQRETAEKNDYYRVPHYWDACSRALPDQTRYKYVEQLVDLTLNYHYDASHGLDNFDVLKRI NVTEVSLLISDFRRQNRRGGTNKRTTFNAAGSLAPHARSLEFSVRLFAN ; F,O ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MKKNIAFLLASMFVFSIATNAYAQVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYYIHWVRQAPGQGLEWMGIIHPSSGG TSYAQKFQGRVTMTRDTSTSTVSMDLSSLRSEDTAVYYCGRAFRILGLSDVFVNDWGQGTVVTVSSASTKGPSVFPLAPS SKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKV DKKVEPKSCD ; ;MKKNIAFLLASMFVFSIATNAYAQVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTNYYIHWVRQAPGQGLEWMGIIHPSSGG TSYAQKFQGRVTMTRDTSTSTVSMDLSSLRSEDTAVYYCGRAFRILGLSDVFVNDWGQGTVVTVSSASTKGPSVFPLAPS SKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKV DKKVEPKSCD ; G,P ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MKKNIAFLLASMFVFSIATNAYADIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGINNYLAWYQQKPGKVPKLLIYAASTLQSG VPSRFSGSGSGTAFTLTILSLQPEDVATYYCQKYNSAPFTFGPGTKVDIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLN NFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; ;MKKNIAFLLASMFVFSIATNAYADIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGINNYLAWYQQKPGKVPKLLIYAASTLQSG VPSRFSGSGSGTAFTLTILSLQPEDVATYYCQKYNSAPFTFGPGTKVDIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLN NFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; H,Q ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MKKNIAFLLASMFVFSIATNAYADIVMTQSPLSLSVTPGEPASISCRSSQSLLHTNGYNYLDWYVQKPGQSPQLLIYLAS NRASGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVETEDVGVYYCMQALQIPRTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASV 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_entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 LEU n 1 3 GLY n 1 4 VAL n 1 5 LEU n 1 6 VAL n 1 7 LEU n 1 8 GLY n 1 9 ALA n 1 10 LEU n 1 11 ALA n 1 12 LEU n 1 13 ALA n 1 14 GLY n 1 15 LEU n 1 16 GLY n 1 17 PHE n 1 18 PRO n 1 19 ALA n 1 20 PRO n 1 21 ALA n 1 22 GLU n 1 23 PRO n 1 24 GLN n 1 25 PRO n 1 26 GLY n 1 27 GLY n 1 28 SER n 1 29 GLN n 1 30 CYS n 1 31 VAL n 1 32 GLU n 1 33 HIS n 1 34 ASP n 1 35 CYS n 1 36 PHE n 1 37 ALA n 1 38 LEU n 1 39 TYR n 1 40 PRO n 1 41 GLY n 1 42 PRO n 1 43 ALA n 1 44 THR n 1 45 PHE n 1 46 LEU n 1 47 ASN n 1 48 ALA n 1 49 SER n 1 50 GLN n 1 51 ILE n 1 52 CYS n 1 53 ASP n 1 54 GLY n 1 55 LEU n 1 56 ARG n 1 57 GLY n 1 58 HIS n 1 59 LEU n 1 60 MET n 1 61 THR n 1 62 VAL n 1 63 ARG n 1 64 SER n 1 65 SER n 1 66 VAL n 1 67 ALA n 1 68 ALA n 1 69 ASP n 1 70 VAL n 1 71 ILE n 1 72 SER n 1 73 LEU n 1 74 LEU n 1 75 LEU n 1 76 ASN n 1 77 GLY n 1 78 ASP n 1 79 GLY n 1 80 GLY n 1 81 VAL n 1 82 GLY n 1 83 ARG n 1 84 ARG n 1 85 ARG n 1 86 LEU n 1 87 TRP n 1 88 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP TRBM_HUMAN P07204 ? 1 ;MLGVLVLGALALAGLGFPAPAEPQPGGSQCVEHDCFALYPGPATFLNASQICDGLRGHLMTVRSSVAADVISLLLNGDGG VGRRRLWIGLQLPPGCGDPKRLGPLRGFQWVTGDNNTSYSRWARLDLNGAPLCGPLCVAVSAAEATVPSEPIWEEQQCEV KADGFLCEFHFPATCRPLAVEPGAAAAAVSITYGTPFAARGADFQALPVGSSAAVAPLGLQLMCTAPPGAVQGHWAREAP GAWDCSVENGGCEHACNAIPGAPRCQCPAGAALQADGRSCTASATQSCNDLCEHFCVPNPDQPGSYSCMCETGYRLAADQ HRCEDVDDCILEPSPCPQRCVNTQGGFECHCYPNYDLVDGECVEPVDPCFRANCEYQCQPLNQTSYLCVCAEGFAPIPHE PHRCQMFCNQTACPADCDPNTQASCECPEGYILDDGFICTDIDECENGGFCSGVCHNLPGTFECICGPDSALARHIGTDC DSGKVDGGDSGSGEPPPSPTPGSTLTPPAVGLVHSG ; 1 2 UNP F5H9T3_HCMV F5H9T3 ? 2 ;MRPGLPSYLIILAVCLFSHLLSSRYGAEAVSEPLDKAFHLLLNTYGRPIRFLRENTTQCTYNSSLRNSTVVRENAISFNF FQSYNQYYVFHMPRCLFAGPLAEQFLNQVDLTETLERYQQRLNTYALVSKDLASYRSFSQQLKAQDSLGEQPTTVPPPID LSIPHVWMPPQTTPHGWTESHTTSGLHRPHFNQTCILFDGHDLLFSTVTPCLHQGFYLIDELRYVKITLTEDFFVVTVSI DDDTPMLLIFGHLPRVLFKAPYQRDNFILRQTEKHELLVLVKKDQLNRHSYLKDPDFLDAALDFNYLDLSALLRNSFHRY AVDVLKSGRCQMLDRRTVEMAFAYALALFAAARQEEAGAQVSVPRALDRQAALLQIQEFMITCLSQTPPRTTLLLYPTAV DLAKRALWTPNQITDITSLVRLVYILSKQNQQHLIPQWALRQIADFALKLHKTHLASFLSAFARQELYLMGSLVHSMLVH TTERREIFIVETGLCSLAELSHFTQLLAHPHHEYLSDLYTPCSSSGRRDHSLERLTRLFPDATVPATVPAALSILSTMQP STLETFPDLFCLPLGESFSALTVSEHVSYIVTNQYLIKGISYPVSTTVVGQSLIITQTDSQTKCELTRNMHTTHSITVAL NISLENCAFCQSALLEYDDTQGVINIMYMHDSDDVLFALDPYNEVVVSSPRTHYLMLLKNGTVLEVTDVVVDATD ; 1 3 UNP Q71DN9_HCMV Q71DN9 ? 3 ;MCRRPDCGFSFSPGPVILLWCCLLLPIVSSAAVSVAPTAAEKVPAECPELTRRCLLGEVFEGDKYESWLRPLVNVTGRDG PLSQLIRYRPVTPEAANSVLLDEAFLDTLALLYNNPDQLRALLTLLSSDTAPRWMTVMRGYSECGDGSPAVYTCVDDLCR GYDLTRLSYGRSIFTEHVLGFELVPPSLFNVVVAIRNEATRTNRAVRLPVSTAAAPEGITLFYGLYNAVKEFCLRHQLDP PLLRHLDKYYAGLPPELKQTRVNLPAHSRYGPQAVDAR ; 1 4 UNP Q38LY2_HCMV Q38LY2 ? 4 ;MSPKNLTPFLTALWLLLGHSRVPRVRAEECCEFINVNHPPERCYDFKMCNRFTVALRCPDGEVCYSPEKTAEIRGIVTTM THSLTRQVVHNKLTSCNYNPLYLEADGRIRCGKVNDKAQYLLGAAGSVPYRWINLEYDKITRIVGLDQYLESVKKHKRLD VCRAKMGYMLQ ; 1 5 UNP Q38M07_HCMV Q38M07 ? 5 ;MLRLLLRHHFHCLLLCAVWATPCLASPWFTLTANQNPSPPWSKLTYPKPHDAATFYCPFLYPSPPRSPSQFSGFQRVSTG PECRNETLYLLYNREGQTLVERSSTWVKKVIWYLSGRNQTILQRMPRTASKPSDGNVQISVEDAKIFGAHMVPKQTKLLR FVVNDGTRYQMCVMKLESWAHVFRDYSVSFQVRLTFTEANNQTYTFCTHPNLIV ; 1 6 UNP Q8AZ45_HCMV Q8AZ45 ? 6 ;MRLCRVWLSVCLCAVVLGQCQRETAEKNDYYRVPHYWDACSRALPDQTRYKYVEQLVDLTLNYHYDASHGLDNFDVLKRI NVTEVSLLISDFRRQNRRGGTNKRTTFNAAGSLAPHARSLEFSVRLFAN ; 1 7 PDB 7T4R 7T4R ? 7 ? 1 8 PDB 7T4R 7T4R ? 8 ? 1 9 PDB 7T4R 7T4R ? 9 ? 1 10 PDB 7T4R 7T4R ? 10 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7T4R A 1 ? 516 ? 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GLN G 62 GLN G 65 5 ? 4 HELX_P HELX_P58 AG4 ARG G 110 ? THR G 114 ? ARG G 87 THR G 91 5 ? 5 HELX_P HELX_P59 AG5 GLN H 102 ? VAL H 106 ? GLN H 79 VAL H 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P60 AG6 GLU I 107 ? VAL I 111 ? GLU I 107 VAL I 111 5 ? 5 HELX_P HELX_P61 AG7 ARG J 110 ? THR J 114 ? ARG J 110 THR J 114 5 ? 5 HELX_P HELX_P62 AG8 PRO K 93 ? ALA K 98 ? PRO K 93 ALA K 98 5 ? 6 HELX_P HELX_P63 AG9 GLY K 99 ? VAL K 109 ? GLY K 99 VAL K 109 1 ? 11 HELX_P HELX_P64 AH1 THR K 114 ? LEU K 122 ? THR K 114 LEU K 122 1 ? 9 HELX_P HELX_P65 AH2 LEU K 127 ? LEU K 132 ? LEU K 127 LEU K 132 1 ? 6 HELX_P HELX_P66 AH3 ARG K 264 ? ASN K 266 ? ARG K 264 ASN K 266 5 ? 3 HELX_P HELX_P67 AH4 LYS K 282 ? LEU K 286 ? LYS K 282 LEU K 286 5 ? 5 HELX_P HELX_P68 AH5 HIS K 289 ? ASP K 294 ? HIS K 289 ASP K 294 5 ? 6 HELX_P HELX_P69 AH6 LEU K 298 ? ASP K 303 ? LEU K 298 ASP K 303 1 ? 6 HELX_P HELX_P70 AH7 ASP K 308 ? SER K 316 ? ASP K 308 SER K 316 1 ? 9 HELX_P HELX_P71 AH8 SER K 316 ? GLY K 328 ? 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ASN O 73 LYS O 78 1 ? 6 HELX_P HELX_P114 AM6 ASN O 81 ? GLN O 95 ? ASN O 81 GLN O 95 1 ? 15 HELX_P HELX_P115 AM7 THR P 51 ? TYR P 55 ? THR P 28 TYR P 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P116 AM8 GLN P 85 ? GLN P 88 ? GLN P 62 GLN P 65 5 ? 4 HELX_P HELX_P117 AM9 ARG P 110 ? THR P 114 ? ARG P 87 THR P 91 5 ? 5 HELX_P HELX_P118 AN1 GLN Q 102 ? VAL Q 106 ? GLN Q 79 VAL Q 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P119 AN2 GLU R 107 ? VAL R 111 ? GLU R 107 VAL R 111 5 ? 5 HELX_P HELX_P120 AN3 ARG S 110 ? THR S 114 ? ARG S 110 THR S 114 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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D CYS 96 SG ? ? ? 1_555 D CYS 111 SG ? ? D CYS 96 D CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf11 disulf ? ? E CYS 172 SG ? ? ? 1_555 E CYS 207 SG ? ? E CYS 172 E CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.010 ? ? disulf12 disulf ? ? G CYS 45 SG ? ? ? 1_555 G CYS 119 SG ? ? G CYS 22 G CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf13 disulf ? ? H CYS 46 SG ? ? ? 1_555 H CYS 111 SG ? ? H CYS 23 H CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf14 disulf ? ? I CYS 46 SG ? ? ? 1_555 I CYS 116 SG ? ? I CYS 46 I CYS 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf15 disulf ? ? J CYS 45 SG ? ? ? 1_555 J CYS 119 SG ? ? J CYS 45 J CYS 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf16 disulf ? ? K CYS 59 SG ? ? ? 1_555 L CYS 54 SG ? ? K CYS 59 L CYS 54 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf17 disulf ? ? K CYS 95 SG ? ? ? 1_555 L CYS 47 SG ? ? K CYS 95 L CYS 47 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf18 disulf ? ? K CYS 195 SG ? ? ? 1_555 K CYS 211 SG ? ? K CYS 195 K CYS 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf19 disulf ? ? K CYS 330 SG ? ? ? 1_555 K CYS 383 SG ? ? K CYS 330 K CYS 383 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf20 disulf ? ? K CYS 495 SG ? ? ? 1_555 K CYS 522 SG ? ? K CYS 495 K CYS 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf21 disulf ? ? K CYS 571 SG ? ? ? 1_555 K CYS 624 SG ? ? K CYS 571 K CYS 624 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf22 disulf ? ? L CYS 144 SG ? ? ? 1_555 M CYS 162 SG ? ? L CYS 144 M CYS 162 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf23 disulf ? ? M CYS 43 SG ? ? ? 1_555 M CYS 58 SG ? ? M CYS 43 M CYS 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf24 disulf ? ? M CYS 96 SG ? ? ? 1_555 M CYS 111 SG ? ? M CYS 96 M CYS 111 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf25 disulf ? ? N CYS 172 SG ? ? ? 1_555 N CYS 207 SG ? ? N CYS 172 N CYS 207 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? ? disulf26 disulf ? ? P CYS 45 SG ? ? ? 1_555 P CYS 119 SG ? ? P CYS 22 P CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf27 disulf ? ? Q CYS 46 SG ? ? ? 1_555 Q CYS 111 SG ? ? Q CYS 23 Q CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf28 disulf ? ? R CYS 46 SG ? ? ? 1_555 R CYS 116 SG ? ? R CYS 46 R CYS 116 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf29 disulf ? ? S CYS 45 SG ? ? ? 1_555 S CYS 119 SG ? ? S CYS 45 S CYS 119 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? covale1 covale one ? B ASN 62 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? B ASN 62 B NAG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? B ASN 67 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? B ASN 67 B NAG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? B ASN 192 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? B ASN 192 B NAG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? B ASN 700 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? B ASN 700 B NAG 805 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? C ASN 74 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? C ASN 74 C NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? E ASN 201 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? E ASN 201 E NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? K ASN 67 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? K ASN 67 K NAG 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? K ASN 192 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? K ASN 192 K NAG 803 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? K ASN 700 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? K ASN 700 K NAG 804 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? N ASN 201 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? N ASN 201 N NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? O ASN 81 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? O ASN 81 O NAG 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ALA 260 B . ? ALA 260 B PRO 261 B ? PRO 261 B 1 7.49 2 THR 387 B . ? THR 387 B PRO 388 B ? PRO 388 B 1 -1.81 3 PRO 185 C . ? PRO 185 C PRO 186 C ? PRO 186 C 1 15.36 4 CYS 57 E . ? CYS 57 E PRO 58 E ? PRO 58 E 1 -5.38 5 SER 30 H . ? SER 7 H PRO 31 H ? PRO 8 H 1 -25.14 6 ALA 117 H . ? ALA 94 H PRO 118 H ? PRO 95 H 1 -6.50 7 ALA 260 K . ? ALA 260 K PRO 261 K ? PRO 261 K 1 8.56 8 THR 387 K . ? THR 387 K PRO 388 K ? PRO 388 K 1 -11.33 9 PRO 185 L . ? PRO 185 L PRO 186 L ? PRO 186 L 1 17.73 10 CYS 57 N . ? CYS 57 N PRO 58 N ? PRO 58 N 1 20.56 11 SER 30 Q . ? SER 7 Q PRO 31 Q ? PRO 8 Q 1 -10.25 12 ALA 117 Q . ? ALA 94 Q PRO 118 Q ? PRO 95 Q 1 5.68 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 8 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 3 ? AB2 ? 7 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 6 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 6 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 6 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 6 ? AC6 ? 7 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 5 ? AC9 ? 5 ? AD1 ? 5 ? AD2 ? 3 ? AD3 ? 3 ? AD4 ? 7 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 6 ? AD7 ? 4 ? AD8 ? 4 ? AD9 ? 4 ? AE1 ? 4 ? AE2 ? 6 ? AE3 ? 4 ? AE4 ? 4 ? AE5 ? 6 ? AE6 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA5 6 7 ? anti-parallel AA5 7 8 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB2 5 6 ? anti-parallel AB2 6 7 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB4 5 6 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AB9 5 6 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC2 5 6 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC5 5 6 ? anti-parallel AC6 1 2 ? parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? anti-parallel AC6 5 6 ? anti-parallel AC6 6 7 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC8 4 5 ? parallel AC9 1 2 ? parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AC9 4 5 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD1 4 5 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD4 5 6 ? anti-parallel AD4 6 7 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD6 1 2 ? parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD6 4 5 ? anti-parallel AD6 5 6 ? anti-parallel AD7 1 2 ? parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE2 1 2 ? parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE2 4 5 ? anti-parallel AE2 5 6 ? anti-parallel AE3 1 2 ? parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE5 1 2 ? parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE5 4 5 ? anti-parallel AE5 5 6 ? anti-parallel AE6 1 2 ? parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE6 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLY A 27 ? 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GA 11 NAG 1 201 130 NAG NAG O . # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details nonadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 19 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _pdbx_audit_revision_history.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_history.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_history.major_revision 1 _pdbx_audit_revision_history.minor_revision 0 _pdbx_audit_revision_history.revision_date 2022-03-23 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # _pdbx_entry_details.entry_id 7T4R _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest N _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? # _em_3d_fitting.entry_id 7T4R _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 7T4R _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details 'A composite map was generated from the three individual focused 3D maps.' _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 504492 _em_3d_reconstruction.resolution 3.3 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.name ;Complex of 2x HCMV Pentamer gH, gL, UL128, UL130, UL131A bound to 1x THBD and 2x fabs of human neutralizing antibodies MSL-109 and 13H11 ; _em_entity_assembly.source 'MULTIPLE SOURCES' _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list '1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10' _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 7T4R _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_max 1500 _em_imaging.nominal_defocus_min 500 _em_imaging.nominal_magnification 105000 _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details ;The grid was incubated with a thiol reactive self-assembling reaction mixture of 4mM monothiolalkane(C11)PEG6-OH (11-mercaptoundecyl) hexaethyleneglycol, (SPT-0011P6, SensoPath Technologies, Inc., Bozeman, MT)[23]. Grids were incubated with this self-assembled, monolayer (SAM) solution for 24 hours. Prior to grid freezing, grids were removed from the SAM solution and rinsed with EtOH. ; _em_sample_support.grid_material GOLD _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type 'UltrAuFoil R0.6/1' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 277.15 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details 'blot for 3.5s before plunging' _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.instrument 'LEICA EM GP' _em_vitrification.entry_id 7T4R _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 7T4R _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 7T4R _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 GLU A 32 ? ? 49.37 -126.02 2 1 GLU A 144 ? ? -100.04 54.87 3 1 TYR B 61 ? ? -90.70 -69.60 4 1 ASP B 220 ? ? 59.59 -129.17 5 1 LEU B 253 ? ? -117.39 62.96 6 1 SER B 457 ? ? -126.41 -168.04 7 1 CYS B 495 ? ? -83.86 49.65 8 1 ASN C 114 ? ? 55.48 19.42 9 1 ASP C 117 ? ? -91.79 51.63 10 1 TYR D 44 ? ? -140.33 13.48 11 1 HIS D 82 ? ? -69.24 1.71 12 1 ARG E 84 ? ? 84.34 3.55 13 1 ASN E 200 ? ? -140.04 40.22 14 1 ASN E 201 ? ? 39.26 47.95 15 1 ALA H 50 ? ? -149.22 -158.56 16 1 SER H 52 ? ? -142.71 13.27 17 1 ALA I 79 ? ? 55.86 6.75 18 1 ASN J 100 ? ? 37.30 51.99 19 1 PHE K 191 ? ? -167.24 115.52 20 1 ASP K 220 ? ? 54.19 -123.51 21 1 LEU K 253 ? ? -118.23 60.66 22 1 MET K 332 ? ? 179.24 155.18 23 1 ASN K 411 ? ? -140.57 34.76 24 1 SER K 457 ? ? -128.53 -169.83 25 1 GLU K 564 ? ? -69.53 5.12 26 1 TRP L 68 ? ? -57.35 -9.71 27 1 ASN L 114 ? ? 57.13 17.97 28 1 ASP L 117 ? ? -92.61 52.35 29 1 PRO L 149 ? ? -66.94 60.60 30 1 ALA L 199 ? ? -90.97 -62.47 31 1 ASP L 239 ? ? -156.34 59.26 32 1 SER M 66 ? ? -151.89 89.03 33 1 ASP M 160 ? ? -92.70 56.28 34 1 ALA N 53 ? ? -142.73 14.16 35 1 ARG N 84 ? ? 81.34 33.49 36 1 ASP N 134 ? ? -141.05 30.69 37 1 ASN N 200 ? ? -142.67 42.75 38 1 LEU Q 47 ? ? -105.23 -61.64 39 1 PRO R 31 ? ? -48.66 155.92 40 1 ALA R 79 ? ? 56.21 7.07 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id 1 1 Y 1 J GLU 24 ? 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A VAL 4 5 1 Y 1 A LEU 5 ? A LEU 5 6 1 Y 1 A VAL 6 ? A VAL 6 7 1 Y 1 A LEU 7 ? A LEU 7 8 1 Y 1 A GLY 8 ? A GLY 8 9 1 Y 1 A ALA 9 ? A ALA 9 10 1 Y 1 A LEU 10 ? A LEU 10 11 1 Y 1 A ALA 11 ? A ALA 11 12 1 Y 1 A LEU 12 ? A LEU 12 13 1 Y 1 A ALA 13 ? A ALA 13 14 1 Y 1 A GLY 14 ? A GLY 14 15 1 Y 1 A LEU 15 ? A LEU 15 16 1 Y 1 A GLY 16 ? A GLY 16 17 1 Y 1 A PHE 17 ? A PHE 17 18 1 Y 1 A PRO 18 ? A PRO 18 19 1 Y 1 A ALA 19 ? A ALA 19 20 1 Y 1 A PRO 20 ? A PRO 20 21 1 Y 1 A ALA 21 ? A ALA 21 22 1 Y 1 A GLU 22 ? A GLU 22 23 1 Y 1 A PRO 23 ? A PRO 23 24 1 Y 1 A GLN 24 ? A GLN 24 25 1 Y 1 A GLY 97 ? A GLY 97 26 1 Y 1 A ASP 98 ? A ASP 98 27 1 Y 1 A PRO 99 ? A PRO 99 28 1 Y 1 A LYS 100 ? A LYS 100 29 1 Y 1 A ARG 101 ? A ARG 101 30 1 Y 1 A LEU 102 ? A LEU 102 31 1 Y 1 A GLY 103 ? A GLY 103 32 1 Y 1 A PRO 104 ? A PRO 104 33 1 Y 1 A LEU 105 ? A LEU 105 34 1 Y 1 A LEU 178 ? A LEU 178 35 1 Y 1 A ALA 179 ? A ALA 179 36 1 Y 1 A VAL 180 ? A VAL 180 37 1 Y 1 A GLU 181 ? A GLU 181 38 1 Y 1 A PRO 182 ? 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