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Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 154 D . ? PHE 154 D PRO 155 D ? PRO 155 D 1 -6.16 2 GLU 156 D . ? GLU 156 D PRO 157 D ? PRO 157 D 1 -0.74 3 SER 7 E . ? SER 7 E PRO 8 E ? 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AC7 ? 5 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 4 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 3 ? AD6 ? 5 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 4 ? AD9 ? 2 ? AE1 ? 6 ? AE2 ? 3 ? AE3 ? 6 ? AE4 ? 2 ? AE5 ? 5 ? AE6 ? 4 ? AE7 ? 2 ? AE8 ? 4 ? AE9 ? 3 ? AF1 ? 4 ? AF2 ? 2 ? AF3 ? 4 ? AF4 ? 2 ? AF5 ? 5 ? AF6 ? 5 ? AF7 ? 2 ? AF8 ? 4 ? AF9 ? 3 ? AG1 ? 3 ? AG2 ? 4 ? AG3 ? 4 ? AG4 ? 4 ? AG5 ? 3 ? AG6 ? 2 ? AG7 ? 5 ? AG8 ? 5 ? AG9 ? 2 ? AH1 ? 4 ? AH2 ? 3 ? AH3 ? 3 ? AH4 ? 4 ? AH5 ? 4 ? AH6 ? 4 ? AH7 ? 3 ? AH8 ? 4 ? AH9 ? 6 ? AI1 ? 4 ? AI2 ? 4 ? AI3 ? 3 ? AI4 ? 2 ? AI5 ? 3 ? AI6 ? 4 ? AI7 ? 4 ? AI8 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA1 7 8 ? parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA2 6 7 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AA9 4 5 ? anti-parallel AA9 5 6 ? parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC7 4 5 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD4 1 2 ? parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD6 4 5 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE1 4 5 ? anti-parallel AE1 5 6 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE3 4 5 ? anti-parallel AE3 5 6 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE5 4 5 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE6 3 4 ? anti-parallel AE7 1 2 ? parallel AE8 1 2 ? parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE8 3 4 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 3 4 ? parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF5 3 4 ? anti-parallel AF5 4 5 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF6 3 4 ? anti-parallel AF6 4 5 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF8 2 3 ? anti-parallel AF8 3 4 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG1 2 3 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG2 2 3 ? anti-parallel AG2 3 4 ? anti-parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG3 2 3 ? anti-parallel AG3 3 4 ? anti-parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG4 2 3 ? anti-parallel AG4 3 4 ? anti-parallel AG5 1 2 ? anti-parallel AG5 2 3 ? anti-parallel AG6 1 2 ? anti-parallel AG7 1 2 ? anti-parallel AG7 2 3 ? anti-parallel AG7 3 4 ? anti-parallel AG7 4 5 ? anti-parallel AG8 1 2 ? anti-parallel AG8 2 3 ? anti-parallel AG8 3 4 ? anti-parallel AG8 4 5 ? anti-parallel AG9 1 2 ? anti-parallel AH1 1 2 ? anti-parallel AH1 2 3 ? anti-parallel AH1 3 4 ? anti-parallel AH2 1 2 ? anti-parallel AH2 2 3 ? anti-parallel AH3 1 2 ? anti-parallel AH3 2 3 ? anti-parallel AH4 1 2 ? anti-parallel AH4 2 3 ? anti-parallel AH4 3 4 ? anti-parallel AH5 1 2 ? anti-parallel AH5 2 3 ? anti-parallel AH5 3 4 ? anti-parallel AH6 1 2 ? anti-parallel AH6 2 3 ? anti-parallel AH6 3 4 ? anti-parallel AH7 1 2 ? anti-parallel AH7 2 3 ? anti-parallel AH8 1 2 ? anti-parallel AH8 2 3 ? anti-parallel AH8 3 4 ? anti-parallel AH9 1 2 ? parallel AH9 2 3 ? anti-parallel AH9 3 4 ? anti-parallel AH9 4 5 ? anti-parallel AH9 5 6 ? anti-parallel AI1 1 2 ? parallel AI1 2 3 ? anti-parallel AI1 3 4 ? anti-parallel AI2 1 2 ? anti-parallel AI2 2 3 ? anti-parallel AI2 3 4 ? anti-parallel AI3 1 2 ? anti-parallel AI3 2 3 ? anti-parallel AI4 1 2 ? parallel AI5 1 2 ? anti-parallel AI5 2 3 ? anti-parallel AI6 1 2 ? anti-parallel AI6 2 3 ? anti-parallel AI6 3 4 ? anti-parallel AI7 1 2 ? anti-parallel AI7 2 3 ? anti-parallel AI7 3 4 ? anti-parallel AI8 1 2 ? anti-parallel AI8 2 3 ? anti-parallel AI8 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 TYR A 2 ? 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ALA A 575 ARG A 577 AA9 5 PHE A 539 ? ARG A 541 ? PHE A 565 ARG A 567 AA9 6 PHE B 17 ? ARG B 18 ? PHE B 43 ARG B 44 AB1 1 GLU A 628 ? HIS A 629 ? GLU A 654 HIS A 655 AB1 2 ILE A 666 ? THR A 670 ? ILE A 692 THR A 696 AB1 3 ILE A 644 ? TYR A 648 ? ILE A 670 TYR A 674 AB1 4 ILE A 638 ? GLY A 641 ? ILE A 664 GLY A 667 AB2 1 GLU A 676 ? ASN A 677 ? GLU A 702 ASN A 703 AB2 2 ILE B 762 ? TYR B 763 ? ILE B 788 TYR B 789 AB3 1 SER A 685 ? PRO A 702 ? SER A 711 PRO A 728 AB3 2 GLY A 1033 ? ALA A 1052 ? GLY A 1059 ALA A 1078 AB3 3 TYR A 1021 ? SER A 1029 ? TYR A 1047 SER A 1055 AB4 1 SER A 685 ? PRO A 702 ? SER A 711 PRO A 728 AB4 2 GLY A 1033 ? ALA A 1052 ? GLY A 1059 ALA A 1078 AB4 3 VAL A 1068 ? SER A 1071 ? VAL A 1094 SER A 1097 AB4 4 TRP A 1076 ? THR A 1079 ? TRP A 1102 THR A 1105 AB5 1 LYS A 707 ? VAL A 710 ? LYS A 733 VAL A 736 AB5 2 LEU A 832 ? LEU A 835 ? LEU A 858 LEU A 861 AB6 1 ILE A 762 ? LYS A 764 ? ILE A 788 LYS A 790 AB6 2 GLU C 676 ? SER C 678 ? 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'Homo sapiens' ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain 2 1 ? 7111 'Trichoplusia ni' ? ? 3 2 ? 9606 'Homo sapiens' ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 50 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode ? _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? _em_image_recording.avg_electron_dose_per_subtomogram ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? ? ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _pdbx_audit_support.funding_organization 'Ministry of Science and Technology (MoST, China)' _pdbx_audit_support.country China _pdbx_audit_support.grant_number 2020YFC0845900 _pdbx_audit_support.ordinal 1 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero J 4 NAG 1 F NAG 1 A NAG 1414 n J 4 NAG 2 F NAG 2 A NAG 1415 n K 4 NAG 1 I NAG 1 A NAG 1416 n K 4 NAG 2 I NAG 2 A NAG 1417 n L 4 NAG 1 L NAG 1 A NAG 1418 n L 4 NAG 2 L NAG 2 A NAG 1419 n M 4 NAG 1 M NAG 1 A NAG 1420 n M 4 NAG 2 M NAG 2 A NAG 1421 n N 4 NAG 1 N NAG 1 A NAG 1422 n N 4 NAG 2 N NAG 2 A NAG 1423 n O 4 NAG 1 O NAG 1 B NAG 1413 n O 4 NAG 2 O NAG 2 B NAG 1414 n P 4 NAG 1 P NAG 1 B NAG 1415 n P 4 NAG 2 P NAG 2 B NAG 1416 n Q 4 NAG 1 Q NAG 1 B NAG 1417 n Q 4 NAG 2 Q NAG 2 B NAG 1418 n R 4 NAG 1 R NAG 1 B NAG 1419 n R 4 NAG 2 R NAG 2 B NAG 1420 n S 4 NAG 1 S NAG 1 B NAG 1421 n S 4 NAG 2 S NAG 2 B NAG 1422 n T 4 NAG 1 T NAG 1 B NAG 1423 n T 4 NAG 2 T NAG 2 B NAG 1424 n U 4 NAG 1 U NAG 1 C NAG 1413 n U 4 NAG 2 U NAG 2 C NAG 1414 n V 4 NAG 1 V NAG 1 C NAG 1415 n V 4 NAG 2 V NAG 2 C NAG 1416 n W 4 NAG 1 W NAG 1 C NAG 1417 n W 4 NAG 2 W NAG 2 C NAG 1418 n X 4 NAG 1 X NAG 1 C NAG 1419 n X 4 NAG 2 X NAG 2 C NAG 1420 n Y 4 NAG 1 Y NAG 1 C NAG 1421 n Y 4 NAG 2 Y NAG 2 C NAG 1422 n Z 4 NAG 1 Z NAG 1 C NAG 1423 n Z 4 NAG 2 Z NAG 2 C NAG 1424 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # _pdbx_entity_branch.entity_id 4 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 4 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 4 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 4 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}' LINUCS PDB-CARE ? # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.entity_id 4 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.value_order sing _pdbx_entity_branch_link.details ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 5 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? 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