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'Helicobacter phage KHP30' 1208236 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP PORTL_BPKHP I7HHN4 ? 1 ;MDFTTLQNDFTNDYQKALIANNEFLEAKKYYNGNQLPQDVLNIILERGQTPIIENMFKVIVNKILGYKIESISEIRLSPK QEEDRALSDLLNSLLQVFIQQENYDKSMIERDKNLLIGGLGVIQLWVSQDKDKNVEIEIKAIKPESFVIDYFSTDKNALD ARRFHKMLEVSEQEALLLFGDSVIVNYSNVNHERIASVIESWYKEYNEETQSYEWNRYLWNRNTGIYKSEKKPFKNGACP FIVSKLYTDELNNYYGLFRDIKPMQDFINYAENRMGNMMGSFKAMFEEDAVVDVAEFVETMSLDNAIAKVRPNALKDHKI QFMNNQADLSALSQKAEQKRQLLRLLAGLNDESLGMAVNRQSGVAIAQRKESGLMGLQTFLKATDDMDRLIFRLAVSFIC EYFTKEQVFKIVDKKLGDRYFKINSNDDNKIRPLKFDLILKSQLKTESRDEKWYNWNELLKILAPIRPDLVPSLVPLMLN DMDSPITNDVLEAIQNANALQQQNAEANAPYNQQIQALQIQKLQAEIMELQAKAHKYAEQGALSQTTNESEKINQAVAIT EMQQQNANNANNEESNNKPKKKLKTSDKTTWRKYPSAQNLDY ; 1 2 UNP I7HHN3_BPKHP I7HHN3 ? 2 ;MIEVSEVIAKVRERLNDNEVGNYEILDSVLVENINQALLKICLEFRLKKAITRSLITEEERFLTLNNLLGIESVKLDKKE IESRNTIEKDTGELELLILSDRISVTPFKIGELEVVYYTYEEIRNILETIKLPKICLDVLVYSVLCNLLEIPNNETNFSV LANYKQLLKLAKDNLTNYLSLMYSKNIHFSKVVRV ; 1 3 UNP I7HFX1_BPKHP I7HFX1 ? 3 ;MDTTRFIRNFILFKDALQKQNFNNKDLNTTSMQAALQSEQLALSEESQYLQSEQVRAKMQIDFLGMQANLQNAKAETLNK LIQCQAMLKSLKDNAMINRANALVSLLQVQANAANGITTSNFEAAFKIIAQIGSEYNQITLNNGNVSVQEKEQTNELKTI LNSLSKELEKLNQQSEVNSIQIFSDKLEVLKDAPARLWGFSTLSNAKEGFYNEANEQIASGSVCLFRSDKVRKHTITFKA INTKTSLSKNITISVIANKLKERMS ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7WMP a 1 ? 602 ? 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'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7WMP _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7WMP _struct.title 'Tail structure of Helicobacter pylori bacteriophage KHP30' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7WMP _struct_keywords.text 'PHAGE, PHAGE TAIL, CRYOEM, VIRUS, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 1 ? L N N 1 ? M N N 2 ? N N N 2 ? O N N 2 ? P N N 2 ? Q N N 2 ? R N N 2 ? S N N 2 ? T N N 2 ? U N N 2 ? V N N 2 ? W N N 2 ? X N N 2 ? Y N N 3 ? Z N N 3 ? AA N N 3 ? BA N N 3 ? CA N N 3 ? DA N N 3 ? EA N N 3 ? FA N N 3 ? GA N N 3 ? HA N N 3 ? IA N N 3 ? JA N N 3 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 2 ? LYS A 16 ? ASP a 2 LYS a 16 1 ? 15 HELX_P HELX_P2 AA2 ALA A 17 ? ASN A 32 ? ALA a 17 ASN a 32 1 ? 16 HELX_P HELX_P3 AA3 PRO A 37 ? 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SER b 171 PHE b 179 1 ? 9 HELX_P HELX_P32 AD5 LEU B 257 ? MET B 279 ? LEU b 257 MET b 279 1 ? 23 HELX_P HELX_P33 AD6 ASP B 293 ? SER B 302 ? ASP b 293 SER b 302 1 ? 10 HELX_P HELX_P34 AD7 ASP B 328 ? ALA B 347 ? ASP b 328 ALA b 347 1 ? 20 HELX_P HELX_P35 AD8 SER B 353 ? ARG B 360 ? SER b 353 ARG b 360 1 ? 8 HELX_P HELX_P36 AD9 LEU B 377 ? PHE B 403 ? LEU b 377 PHE b 403 1 ? 27 HELX_P HELX_P37 AE1 THR B 404 ? LYS B 410 ? THR b 404 LYS b 410 1 ? 7 HELX_P HELX_P38 AE2 ASP B 413 ? PHE B 421 ? ASP b 413 PHE b 421 1 ? 9 HELX_P HELX_P39 AE3 GLU B 447 ? ARG B 467 ? GLU b 447 ARG b 467 1 ? 21 HELX_P HELX_P40 AE4 PRO B 468 ? VAL B 471 ? PRO b 468 VAL b 471 5 ? 4 HELX_P HELX_P41 AE5 LEU B 474 ? ASN B 480 ? LEU b 474 ASN b 480 1 ? 7 HELX_P HELX_P42 AE6 ILE B 486 ? GLN B 563 ? ILE b 486 GLN b 563 1 ? 78 HELX_P HELX_P43 AE7 ASP C 2 ? LYS C 16 ? ASP c 2 LYS c 16 1 ? 15 HELX_P HELX_P44 AE8 ALA C 17 ? ASN C 32 ? ALA c 17 ASN c 32 1 ? 16 HELX_P HELX_P45 AE9 PRO C 37 ? ARG C 47 ? PRO c 37 ARG c 47 1 ? 11 HELX_P HELX_P46 AF1 PHE C 57 ? SER C 71 ? PHE c 57 SER c 71 1 ? 15 HELX_P HELX_P47 AF2 ASP C 84 ? LEU C 95 ? ASP c 84 LEU c 95 1 ? 12 HELX_P HELX_P48 AF3 LEU C 95 ? GLN C 100 ? LEU c 95 GLN c 100 1 ? 6 HELX_P HELX_P49 AF4 GLU C 102 ? GLY C 118 ? GLU c 102 GLY c 118 1 ? 17 HELX_P HELX_P50 AF5 LYS C 143 ? PHE C 147 ? LYS c 143 PHE c 147 5 ? 5 HELX_P HELX_P51 AF6 ASP C 155 ? LEU C 159 ? ASP c 155 LEU c 159 5 ? 5 HELX_P HELX_P52 AF7 SER C 171 ? PHE C 179 ? SER c 171 PHE c 179 1 ? 9 HELX_P HELX_P53 AF8 LEU C 257 ? MET C 279 ? LEU c 257 MET c 279 1 ? 23 HELX_P HELX_P54 AF9 ASP C 293 ? SER C 302 ? ASP c 293 SER c 302 1 ? 10 HELX_P HELX_P55 AG1 ASP C 328 ? ALA C 347 ? ASP c 328 ALA c 347 1 ? 20 HELX_P HELX_P56 AG2 SER C 353 ? ARG C 360 ? SER c 353 ARG c 360 1 ? 8 HELX_P HELX_P57 AG3 LEU C 377 ? PHE C 403 ? LEU c 377 PHE c 403 1 ? 27 HELX_P HELX_P58 AG4 THR C 404 ? LYS C 410 ? THR c 404 LYS c 410 1 ? 7 HELX_P HELX_P59 AG5 ASP C 413 ? PHE C 421 ? 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