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'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose 'beta-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 FUC 'L-saccharide, alpha linking' . alpha-L-fucopyranose 'alpha-L-fucose; 6-deoxy-alpha-L-galactopyranose; L-fucose; fucose' 'C6 H12 O5' 164.156 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MAN 'D-saccharide, alpha linking' . alpha-D-mannopyranose 'alpha-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7WUH _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7WUH _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 36500 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.758 ? 49665 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 8.935 ? 5546 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.052 ? 5976 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 6218 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7WUH _struct.title 'SARS-CoV-2 Spike in complex with Fab of m31A7' _struct.pdbx_structure_determination_methodology ? _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7WUH _struct_keywords.text ;SARS-CoV-2, monoclonal antibody, broad neutralization, m31A7, mono-GlcNAc-decorated S vaccine, memory B cells, VIRAL PROTEIN, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex ; _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 2 ? 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ZA N N 14 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASP A 281 ? LYS A 291 ? ASP A 294 LYS A 304 1 ? 11 HELX_P HELX_P2 AA2 PRO A 324 ? ASN A 330 ? PRO A 337 ASN A 343 1 ? 7 HELX_P HELX_P3 AA3 ARG A 390 ? ARG A 395 ? ARG A 403 ARG A 408 5 ? 6 HELX_P HELX_P4 AA4 GLY A 403 ? ASN A 409 ? GLY A 416 ASN A 422 1 ? 7 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP A 724 ? CYS A 730 ? ASP A 737 CYS A 743 1 ? 7 HELX_P HELX_P6 AA6 SER A 733 ? GLY A 744 ? SER A 746 GLY A 757 1 ? 12 HELX_P HELX_P7 AA7 GLY A 744 ? ALA A 770 ? GLY A 757 ALA A 783 1 ? 27 HELX_P HELX_P8 AA8 SER A 803 ? VAL A 813 ? SER A 816 VAL A 826 1 ? 11 HELX_P HELX_P9 AA9 THR A 853 ? SER A 871 ? THR A 866 SER A 884 1 ? 19 HELX_P HELX_P10 AB1 GLY A 872 ? ALA A 877 ? GLY A 885 ALA A 890 1 ? 6 HELX_P HELX_P11 AB2 PRO A 884 ? MET A 889 ? PRO A 897 MET A 902 1 ? 6 HELX_P HELX_P12 AB3 MET A 889 ? GLY A 897 ? MET A 902 GLY A 910 1 ? 9 HELX_P HELX_P13 AB4 THR A 899 ? SER A 927 ? THR A 912 SER A 940 1 ? 29 HELX_P HELX_P14 AB5 LEU A 932 ? SER A 955 ? LEU A 945 SER A 968 1 ? 24 HELX_P HELX_P15 AB6 LEU A 964 ? LEU A 971 ? LEU A 977 LEU A 984 1 ? 8 HELX_P HELX_P16 AB7 ASP A 972 ? VAL A 1020 ? ASP A 985 VAL A 1033 1 ? 49 HELX_P HELX_P17 AB8 ASP B 281 ? LYS B 291 ? ASP C 294 LYS C 304 1 ? 11 HELX_P HELX_P18 AB9 TYR B 352 ? SER B 358 ? TYR C 365 SER C 371 1 ? 7 HELX_P HELX_P19 AC1 GLY B 391 ? ILE B 397 ? GLY C 404 ILE C 410 1 ? 7 HELX_P HELX_P20 AC2 GLY B 403 ? ASN B 409 ? 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SER L 188 GLU L 193 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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A CYS 725 SG ? ? ? 1_555 A CYS 747 SG ? ? A CYS 738 A CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf11 disulf ? ? A CYS 730 SG ? ? ? 1_555 A CYS 736 SG ? ? A CYS 743 A CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf12 disulf ? ? A CYS 1019 SG ? ? ? 1_555 A CYS 1030 SG ? ? A CYS 1032 A CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf13 disulf ? ? A CYS 1069 SG ? ? ? 1_555 A CYS 1113 SG ? ? A CYS 1082 A CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf14 disulf ? ? B CYS 278 SG ? ? ? 1_555 B CYS 288 SG ? ? C CYS 291 C CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf15 disulf ? ? B CYS 366 SG ? ? ? 1_555 B CYS 419 SG ? ? C CYS 379 C CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf16 disulf ? ? B CYS 378 SG ? ? ? 1_555 B CYS 512 SG ? ? C CYS 391 C CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf17 disulf ? ? B CYS 467 SG ? ? ? 1_555 B CYS 475 SG ? ? C CYS 480 C CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf18 disulf ? ? B CYS 604 SG ? ? ? 1_555 B CYS 636 SG ? ? C CYS 617 C CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf19 disulf ? ? B CYS 649 SG ? ? ? 1_555 B CYS 658 SG ? ? C CYS 662 C CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf20 disulf ? ? B CYS 725 SG ? ? ? 1_555 B CYS 747 SG ? ? C CYS 738 C CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf21 disulf ? ? B CYS 730 SG ? ? ? 1_555 B CYS 736 SG ? ? C CYS 743 C CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf22 disulf ? ? B CYS 1019 SG ? ? ? 1_555 B CYS 1030 SG ? ? C CYS 1032 C CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf23 disulf ? ? B CYS 1069 SG ? ? ? 1_555 B CYS 1113 SG ? ? C CYS 1082 C CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf24 disulf ? ? C CYS 118 SG ? ? ? 1_555 C CYS 153 SG ? ? E CYS 131 E CYS 166 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf25 disulf ? ? C CYS 278 SG ? ? ? 1_555 C CYS 288 SG ? ? E CYS 291 E CYS 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf26 disulf ? ? C CYS 323 SG ? ? ? 1_555 C CYS 348 SG ? ? E CYS 336 E CYS 361 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf27 disulf ? ? C CYS 366 SG ? ? ? 1_555 C CYS 419 SG ? ? E CYS 379 E CYS 432 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf28 disulf ? ? C CYS 378 SG ? ? ? 1_555 C CYS 512 SG ? ? E CYS 391 E CYS 525 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf29 disulf ? ? C CYS 467 SG ? ? ? 1_555 C CYS 475 SG ? ? E CYS 480 E CYS 488 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf30 disulf ? ? C CYS 525 SG ? ? ? 1_555 C CYS 577 SG ? ? E CYS 538 E CYS 590 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf31 disulf ? ? C CYS 604 SG ? ? ? 1_555 C CYS 636 SG ? ? E CYS 617 E CYS 649 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf32 disulf ? ? C CYS 649 SG ? ? ? 1_555 C CYS 658 SG ? ? E CYS 662 E CYS 671 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf33 disulf ? ? C CYS 725 SG ? ? ? 1_555 C CYS 747 SG ? ? E CYS 738 E CYS 760 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf34 disulf ? ? C CYS 730 SG ? ? ? 1_555 C CYS 736 SG ? ? E CYS 743 E CYS 749 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf35 disulf ? ? C CYS 1019 SG ? ? ? 1_555 C CYS 1030 SG ? ? E CYS 1032 E CYS 1043 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf36 disulf ? ? C CYS 1069 SG ? ? ? 1_555 C CYS 1113 SG ? ? E CYS 1082 E CYS 1126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf37 disulf ? ? D CYS 39 SG ? ? ? 1_555 D CYS 113 SG ? ? D CYS 22 D CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf38 disulf ? ? D CYS 163 SG ? ? ? 1_555 D CYS 219 SG ? ? D CYS 146 D CYS 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf39 disulf ? ? E CYS 43 SG ? ? ? 1_555 E CYS 114 SG ? ? F CYS 23 F CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf40 disulf ? ? E CYS 160 SG ? ? ? 1_555 E CYS 220 SG ? ? F CYS 140 F CYS 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf41 disulf ? ? F CYS 39 SG ? ? ? 1_555 F CYS 113 SG ? ? H CYS 22 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf42 disulf ? ? F CYS 163 SG ? ? ? 1_555 F CYS 219 SG ? ? H CYS 146 H CYS 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf43 disulf ? ? G CYS 43 SG ? ? ? 1_555 G CYS 114 SG ? ? I CYS 23 I CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf44 disulf ? ? G CYS 160 SG ? ? ? 1_555 G CYS 220 SG ? ? I CYS 140 I CYS 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf45 disulf ? ? H CYS 39 SG ? ? ? 1_555 H CYS 113 SG ? ? K CYS 22 K CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf46 disulf ? ? H CYS 163 SG ? ? ? 1_555 H CYS 219 SG ? ? K CYS 146 K CYS 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf47 disulf ? ? I CYS 43 SG ? ? ? 1_555 I CYS 114 SG ? ? L CYS 23 L CYS 94 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf48 disulf ? ? I CYS 160 SG ? ? ? 1_555 I CYS 220 SG ? ? L CYS 140 L CYS 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? covale1 covale one ? A ASN 48 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? A ASN 61 A NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.417 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 109 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? A ASN 122 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 152 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? A ASN 165 B NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 221 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? A ASN 234 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 269 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? A ASN 282 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 318 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? A ASN 331 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? A ASN 603 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? A ASN 616 A NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 644 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? A ASN 657 A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 696 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? A ASN 709 A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 704 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? A ASN 717 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? A ASN 788 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? A ASN 801 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? A ASN 1061 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? A ASN 1074 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? A ASN 1085 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? A ASN 1098 A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? B ASN 48 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? C ASN 61 C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? B ASN 61 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? C ASN 74 C NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? B ASN 109 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? C ASN 122 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? B ASN 136 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? C ASN 149 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? B ASN 152 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? C ASN 165 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? B ASN 221 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? C ASN 234 C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? B ASN 269 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? C ASN 282 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? B ASN 318 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? C ASN 331 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? B ASN 590 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? C ASN 603 C NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? B ASN 603 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? C ASN 616 C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? B ASN 644 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? C ASN 657 C NAG 1306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? B ASN 696 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? C ASN 709 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? B ASN 704 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? C ASN 717 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? B ASN 788 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? C ASN 801 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? B ASN 1061 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? C ASN 1074 C NAG 1307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? B ASN 1085 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? C ASN 1098 C NAG 1308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? C ASN 48 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? E ASN 61 E NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? C ASN 109 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? E ASN 122 E NAG 1304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? C ASN 136 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? E ASN 149 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? C ASN 152 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? E ASN 165 E NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? C ASN 221 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? E ASN 234 E NAG 1305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? C ASN 269 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? E ASN 282 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? C ASN 318 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? E ASN 331 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? C ASN 590 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? E ASN 603 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? C ASN 704 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? E ASN 717 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? C ASN 788 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? E ASN 801 e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale40 covale one ? C ASN 1061 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? E ASN 1074 f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? N-Glycosylation covale41 covale one ? C ASN 1085 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? E ASN 1098 E NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? F ASN 119 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? H ASN 102 g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale43 covale one ? H ASN 119 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? K ASN 102 K NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale44 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? B NAG 1 B NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale45 covale both ? J NAG . O6 ? ? ? 1_555 J FUC . C1 ? ? B NAG 1 B FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale46 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale47 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale48 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L BMA . C1 ? ? J NAG 2 J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale49 covale both ? L BMA . O6 ? ? ? 1_555 L MAN . C1 ? ? J BMA 3 J MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale50 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale51 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M BMA . C1 ? ? M NAG 2 M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale52 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale53 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? ? covale54 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? ? covale55 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale56 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q BMA . C1 ? ? Q NAG 2 Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale57 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale58 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale59 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S BMA . C1 ? ? S NAG 2 S BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? ? covale60 covale both ? S BMA . O3 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? S BMA 3 S MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale61 covale both ? S BMA . O6 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? S BMA 3 S MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale62 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale63 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale64 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U BMA . C1 ? ? U NAG 2 U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale65 covale both ? U BMA . O6 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U BMA 3 U MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? ? covale66 covale both ? U MAN . O6 ? ? ? 1_555 U MAN . C1 ? ? U MAN 4 U MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale67 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale68 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale69 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W BMA . C1 ? ? W NAG 2 W BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale70 covale both ? W BMA . O3 ? ? ? 1_555 W MAN . C1 ? ? W BMA 3 W MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale71 covale both ? W BMA . O6 ? ? ? 1_555 W MAN . C1 ? ? W BMA 3 W MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale72 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale73 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? Y NAG 1 Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale74 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y BMA . C1 ? ? Y NAG 2 Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? ? covale75 covale both ? Y BMA . O6 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y BMA 3 Y MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? ? covale76 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? ? covale77 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z BMA . C1 ? ? Z NAG 2 Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale78 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale79 covale both ? AA NAG . O6 ? ? ? 1_555 AA FUC . C1 ? ? a NAG 1 a FUC 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale80 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA BMA . C1 ? ? a NAG 2 a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale81 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? ? covale82 covale both ? BA NAG . O6 ? ? ? 1_555 BA FUC . C1 ? ? b NAG 1 b FUC 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale83 covale both ? CA NAG . O6 ? ? ? 1_555 CA FUC . C1 ? ? c NAG 1 c FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale84 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? d NAG 1 d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? ? covale85 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA BMA . C1 ? ? d NAG 2 d BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? ? covale86 covale both ? DA BMA . O3 ? ? ? 1_555 DA MAN . C1 ? ? d BMA 3 d MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale87 covale both ? DA MAN . O2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? d MAN 4 d NAG 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale88 covale both ? DA MAN . O6 ? ? ? 1_555 DA MAN . C1 ? ? d MAN 4 d MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale89 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? e NAG 1 e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale90 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA BMA . C1 ? ? e NAG 2 e BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale91 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? f NAG 1 f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale92 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA BMA . C1 ? ? f NAG 2 f BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale93 covale both ? FA BMA . O3 ? ? ? 1_555 FA MAN . C1 ? ? f BMA 3 f MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale94 covale both ? FA MAN . O3 ? ? ? 1_555 FA MAN . C1 ? ? f MAN 4 f MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale95 covale both ? FA MAN . O6 ? ? ? 1_555 FA MAN . C1 ? ? f MAN 4 f MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale96 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA NAG . 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C1 ? ? g NAG 2 g BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 169 D . ? PHE 152 D PRO 170 D ? PRO 153 D 1 -8.57 2 GLU 171 D . ? GLU 154 D PRO 172 D ? PRO 155 D 1 -7.87 3 SER 27 E . ? SER 7 F PRO 28 E ? 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loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 4 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 4 3 FUC C1 O1 1 NAG O6 HO6 sing ? 3 5 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 4 6 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 5 6 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 6 6 4 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 7 7 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 8 7 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 9 8 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 10 8 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 11 8 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 12 8 5 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 13 9 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 14 9 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 15 9 4 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 16 9 5 MAN C1 O1 4 MAN O6 HO6 sing ? 17 10 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 18 10 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 19 10 4 FUC C1 O1 1 NAG O6 HO6 sing ? 20 11 2 FUC C1 O1 1 NAG O6 HO6 sing ? 21 12 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 22 12 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 23 12 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 24 12 5 NAG C1 O1 4 MAN O2 HO2 sing ? 25 12 6 MAN C1 O1 4 MAN O6 HO6 sing ? 26 13 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 27 13 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 28 13 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 29 13 5 MAN C1 O1 4 MAN O3 HO3 sing ? 30 13 6 MAN C1 O1 4 MAN O6 HO6 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n 4 FUC 3 n 5 NAG 1 n 5 NAG 2 n 6 NAG 1 n 6 NAG 2 n 6 BMA 3 n 6 MAN 4 n 7 NAG 1 n 7 NAG 2 n 7 BMA 3 n 8 NAG 1 n 8 NAG 2 n 8 BMA 3 n 8 MAN 4 n 8 MAN 5 n 9 NAG 1 n 9 NAG 2 n 9 BMA 3 n 9 MAN 4 n 9 MAN 5 n 10 NAG 1 n 10 NAG 2 n 10 BMA 3 n 10 FUC 4 n 11 NAG 1 n 11 FUC 2 n 12 NAG 1 n 12 NAG 2 n 12 BMA 3 n 12 MAN 4 n 12 NAG 5 n 12 MAN 6 n 13 NAG 1 n 13 NAG 2 n 13 BMA 3 n 13 MAN 4 n 13 MAN 5 n 13 MAN 6 n # loop_ _pdbx_entity_instance_feature.ordinal _pdbx_entity_instance_feature.comp_id _pdbx_entity_instance_feature.asym_id _pdbx_entity_instance_feature.seq_num _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num _pdbx_entity_instance_feature.feature_type _pdbx_entity_instance_feature.details 1 BMA ? ? BMA ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? 2 FUC ? ? FUC ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? 3 MAN ? ? MAN ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? 4 NAG ? ? NAG ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 14 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'electron microscopy' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #