data_7Z0O # _entry.id 7Z0O # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.358 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 7Z0O pdb_00007z0o 10.2210/pdb7z0o/pdb WWPDB D_1292118132 ? ? EMDB EMD-14428 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Structure of transcription factor UAF in complex with TBP and 35S rRNA promoter DNA' _pdbx_database_related.db_id EMD-14428 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7Z0O _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2022-02-23 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Baudin, F.' 1 0000-0003-0816-0861 'Murciano, B.' 2 0000-0001-8886-2972 'Fung, H.K.H.' 3 0000-0001-9568-1782 'Fromm, S.A.' 4 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_citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Baudin, F.' 1 0000-0003-0816-0861 primary 'Murciano, B.' 2 0000-0001-8886-2972 primary 'Fung, H.K.H.' 3 0000-0001-9568-1782 primary 'Fromm, S.A.' 4 0000-0002-2094-1911 primary 'Mattei, S.' 5 0000-0002-2005-8977 primary 'Mahamid, J.' 6 0000-0001-6968-041X primary 'Muller, C.W.' 7 0000-0003-2176-8337 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Histone H3' 15391.007 2 ? ? ? ? 2 polymer man 'Histone H4' 11395.390 1 ? ? ? ? 3 polymer man 'RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN5' 41873.906 1 ? ? ? ? 4 polymer man 'RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN9' 42964.336 1 ? ? ? ? 5 polymer man 'RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN10' 16525.703 1 ? ? ? ? 6 polymer man 'Upstream 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TDLRFQSSAIGALQESVEAYLVSLFEDTNLAAIHAKRVTIQKKDIKLARRLRGERS ; A,C ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKILRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEEVRAVLKSFLESVIRDSVTYTEHAKRK TVTSLDVVYALKRQGRTLYGFGG ; ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKILRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEEVRAVLKSFLESVIRDSVTYTEHAKRK TVTSLDVVYALKRQGRTLYGFGG ; B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;SMEHQQLRKYVELYNKEVEEFYNGAASGRPAEFHPSKVHVKSIHEKAGTANAGVEISSVGVDWDSEEKNTFFWCLSRYSI HRVDEWRSLLPRKSAMEILGYYRLLRRASASARSRKAGDDGAPIAYEMSAEWVALETKLSETVMAITEGAAEVADEEGHC EGLIDYESWKRRWVAIYSHSRIAEIRPLPRHALPLSRSATQTLERCVSRYTRTLLWCTALAGMASRSVSARAAESRGHKS LPTVVTRRQVERALCTEARSRDLHVLPRRIVLTLRKWELDYPREGKLFRTKEMAHLFLQSQLSRRDAPPVHQDENQENQE NQENQEQDNTASEGESEAERDEIDEADLFRSALHENQLLKWLSK ; ;SMEHQQLRKYVELYNKEVEEFYNGAASGRPAEFHPSKVHVKSIHEKAGTANAGVEISSVGVDWDSEEKNTFFWCLSRYSI HRVDEWRSLLPRKSAMEILGYYRLLRRASASARSRKAGDDGAPIAYEMSAEWVALETKLSETVMAITEGAAEVADEEGHC EGLIDYESWKRRWVAIYSHSRIAEIRPLPRHALPLSRSATQTLERCVSRYTRTLLWCTALAGMASRSVSARAAESRGHKS LPTVVTRRQVERALCTEARSRDLHVLPRRIVLTLRKWELDYPREGKLFRTKEMAHLFLQSQLSRRDAPPVHQDENQENQE NQENQEQDNTASEGESEAERDEIDEADLFRSALHENQLLKWLSK ; D ? 4 'polypeptide(L)' no no ;SMSDLDEESQIETQIDAPIEDIIRGSELTTTTADKETLKSANELLDSLEHSHRVDLSLHLYSAYLLKRLLYKANEKKHFY EVNQFVKTQIKDNWTSWPNPNTIIDPSVDKLYEDIPEGIANVSVQPGEISNRALMHASDMMRVELDAQWQKFLSKSALDH DVTLDVDELNIPNEISRNILVKLDSLFEGLHDKIAKENEFDVRQDKHSNNIRANQIDDEPMQANRRIKYTYHDLVSRGCE MNEDMTDIYMKSLELYNDIPEKYKKRKFRLPKQILKKYHQPKKTSSYLKELLSKTREDFIPVEKLLKDKRLTSKDKSKLQ RLNREETEDALNKRTFFQVKGYLEDENEISDYELDDCLIELPNGNI ; ;SMSDLDEESQIETQIDAPIEDIIRGSELTTTTADKETLKSANELLDSLEHSHRVDLSLHLYSAYLLKRLLYKANEKKHFY EVNQFVKTQIKDNWTSWPNPNTIIDPSVDKLYEDIPEGIANVSVQPGEISNRALMHASDMMRVELDAQWQKFLSKSALDH DVTLDVDELNIPNEISRNILVKLDSLFEGLHDKIAKENEFDVRQDKHSNNIRANQIDDEPMQANRRIKYTYHDLVSRGCE MNEDMTDIYMKSLELYNDIPEKYKKRKFRLPKQILKKYHQPKKTSSYLKELLSKTREDFIPVEKLLKDKRLTSKDKSKLQ RLNREETEDALNKRTFFQVKGYLEDENEISDYELDDCLIELPNGNI ; E ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MDRNVYEACSNIIKEFGTHVVSADEVLAEKIDNAVPIPFKTREEIDADVEKDRNEGVFEGNIIPDIDLRVVHYYATQLCL NKYPHLINAFDETSLITLGLLIEKWVKDYLTSIQTEQGRQSKVIGKGPCEFISKHIDYRHAPGNI ; ;MDRNVYEACSNIIKEFGTHVVSADEVLAEKIDNAVPIPFKTREEIDADVEKDRNEGVFEGNIIPDIDLRVVHYYATQLCL NKYPHLINAFDETSLITLGLLIEKWVKDYLTSIQTEQGRQSKVIGKGPCEFISKHIDYRHAPGNI ; F ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MAELNDYSTMIDILLSDMDLETVTTKKVRMALKEVYAIDVESQGKAINKLIRKHLDLVKERPRFERSLEDLLKENATLAI ELTKEITVSKRSSGEEKNDSETKGTHVEKKKGTVSKSPISTRKVTLSKSLASLLGEHELTRTEVVRRLWAYIKAHNLQNP NNKKEILCDEKLELILGKSTNMFEMHKILASHMTEPKKISDCPPLIQEVRRKEKPIVSDSEQSDTKGI ; ;MAELNDYSTMIDILLSDMDLETVTTKKVRMALKEVYAIDVESQGKAINKLIRKHLDLVKERPRFERSLEDLLKENATLAI ELTKEITVSKRSSGEEKNDSETKGTHVEKKKGTVSKSPISTRKVTLSKSLASLLGEHELTRTEVVRRLWAYIKAHNLQNP NNKKEILCDEKLELILGKSTNMFEMHKILASHMTEPKKISDCPPLIQEVRRKEKPIVSDSEQSDTKGI ; G ? 7 'polypeptide(L)' no no ;GHMADEERLKEFKEANKIVFDPNTRQVWENQNRDGTKPATTFQSEEDIKRAAPESEKDTSATSGIVPTLQNIVATVTLGC RLDLKTVALHARNAEYNPKRFAAVIMRIREPKTTALIFASGKMVVTGAKSEDDSKLASRKYARIIQKIGFAAKFTDFKIQ 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;GAAAAAAAAAATATACGCTAAGATTTTTGGAGAATAGCTTAAATTGAAGTTTTTCTCGGCGAGAAATACGTAGTTAAGGC AGAGCGACAGAGAGGGCAAAAGAAAATAAAAGTAAGATTTTAGTTTGTAATGGGAGGGGGGGTTTAGTCAT ; N ? 9 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DT)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC) (DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DA)(DA)(DA)(DC)(DT)(DA)(DA)(DA)(DA)(DT)(DC)(DT)(DT)(DA)(DC) (DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DT)(DT)(DT)(DT)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DC)(DC)(DC)(DT)(DC) (DT)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DT) (DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DT)(DT)(DT)(DC)(DT)(DC)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DA) (DA)(DA)(DC)(DT)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DT)(DA)(DT)(DT)(DC) (DT)(DC)(DC)(DA)(DA)(DA)(DA)(DA)(DT)(DC)(DT)(DT)(DA)(DG)(DC)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA) (DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DC) ; ;ATGACTAAACCCCCCCTCCCATTACAAACTAAAATCTTACTTTTATTTTCTTTTGCCCTCTCTGTCGCTCTGCCTTAACT ACGTATTTCTCGCCGAGAAAAACTTCAATTTAAGCTATTCTCCAAAAATCTTAGCGTATATTTTTTTTTTC ; T ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 ARG n 1 4 THR n 1 5 LYS n 1 6 GLN n 1 7 THR n 1 8 ALA n 1 9 ARG n 1 10 LYS n 1 11 SER n 1 12 THR n 1 13 GLY n 1 14 GLY n 1 15 LYS n 1 16 ALA n 1 17 PRO n 1 18 ARG n 1 19 LYS n 1 20 GLN n 1 21 LEU n 1 22 ALA n 1 23 SER n 1 24 LYS n 1 25 ALA n 1 26 ALA n 1 27 ARG n 1 28 LYS n 1 29 SER n 1 30 ALA n 1 31 PRO n 1 32 SER n 1 33 THR n 1 34 GLY n 1 35 GLY n 1 36 VAL n 1 37 LYS n 1 38 LYS n 1 39 PRO n 1 40 HIS n 1 41 ARG n 1 42 TYR n 1 43 LYS n 1 44 PRO n 1 45 GLY n 1 46 THR n 1 47 VAL n 1 48 ALA n 1 49 LEU n 1 50 ARG n 1 51 GLU n 1 52 ILE n 1 53 ARG n 1 54 ARG n 1 55 PHE n 1 56 GLN n 1 57 LYS n 1 58 SER n 1 59 THR n 1 60 GLU n 1 61 LEU n 1 62 LEU n 1 63 ILE n 1 64 ARG n 1 65 LYS n 1 66 LEU n 1 67 PRO n 1 68 PHE n 1 69 GLN n 1 70 ARG n 1 71 LEU n 1 72 VAL n 1 73 ARG n 1 74 GLU n 1 75 ILE n 1 76 ALA n 1 77 GLN n 1 78 ASP n 1 79 PHE n 1 80 LYS n 1 81 THR n 1 82 ASP n 1 83 LEU n 1 84 ARG n 1 85 PHE n 1 86 GLN n 1 87 SER n 1 88 SER n 1 89 ALA n 1 90 ILE n 1 91 GLY n 1 92 ALA n 1 93 LEU n 1 94 GLN n 1 95 GLU n 1 96 SER n 1 97 VAL n 1 98 GLU n 1 99 ALA n 1 100 TYR n 1 101 LEU n 1 102 VAL n 1 103 SER n 1 104 LEU n 1 105 PHE n 1 106 GLU n 1 107 ASP n 1 108 THR n 1 109 ASN n 1 110 LEU n 1 111 ALA n 1 112 ALA n 1 113 ILE n 1 114 HIS n 1 115 ALA n 1 116 LYS n 1 117 ARG n 1 118 VAL n 1 119 THR n 1 120 ILE n 1 121 GLN n 1 122 LYS n 1 123 LYS n 1 124 ASP n 1 125 ILE n 1 126 LYS n 1 127 LEU n 1 128 ALA n 1 129 ARG n 1 130 ARG n 1 131 LEU n 1 132 ARG n 1 133 GLY n 1 134 GLU n 1 135 ARG n 1 136 SER n 2 1 MET n 2 2 SER n 2 3 GLY n 2 4 ARG n 2 5 GLY n 2 6 LYS n 2 7 GLY n 2 8 GLY n 2 9 LYS n 2 10 GLY n 2 11 LEU n 2 12 GLY n 2 13 LYS n 2 14 GLY n 2 15 GLY n 2 16 ALA n 2 17 LYS n 2 18 ARG n 2 19 HIS n 2 20 ARG n 2 21 LYS n 2 22 ILE n 2 23 LEU n 2 24 ARG n 2 25 ASP n 2 26 ASN n 2 27 ILE n 2 28 GLN n 2 29 GLY n 2 30 ILE n 2 31 THR n 2 32 LYS n 2 33 PRO n 2 34 ALA n 2 35 ILE n 2 36 ARG n 2 37 ARG n 2 38 LEU n 2 39 ALA n 2 40 ARG n 2 41 ARG n 2 42 GLY n 2 43 GLY n 2 44 VAL n 2 45 LYS n 2 46 ARG n 2 47 ILE n 2 48 SER n 2 49 GLY n 2 50 LEU n 2 51 ILE n 2 52 TYR n 2 53 GLU n 2 54 GLU n 2 55 VAL n 2 56 ARG n 2 57 ALA n 2 58 VAL n 2 59 LEU n 2 60 LYS n 2 61 SER n 2 62 PHE n 2 63 LEU n 2 64 GLU n 2 65 SER n 2 66 VAL n 2 67 ILE n 2 68 ARG n 2 69 ASP n 2 70 SER n 2 71 VAL n 2 72 THR n 2 73 TYR n 2 74 THR n 2 75 GLU n 2 76 HIS n 2 77 ALA n 2 78 LYS n 2 79 ARG n 2 80 LYS n 2 81 THR n 2 82 VAL n 2 83 THR n 2 84 SER n 2 85 LEU n 2 86 ASP n 2 87 VAL n 2 88 VAL n 2 89 TYR n 2 90 ALA n 2 91 LEU n 2 92 LYS n 2 93 ARG n 2 94 GLN n 2 95 GLY n 2 96 ARG n 2 97 THR n 2 98 LEU n 2 99 TYR n 2 100 GLY n 2 101 PHE n 2 102 GLY n 2 103 GLY n 3 1 SER n 3 2 MET n 3 3 GLU n 3 4 HIS n 3 5 GLN n 3 6 GLN n 3 7 LEU n 3 8 ARG n 3 9 LYS n 3 10 TYR n 3 11 VAL n 3 12 GLU n 3 13 LEU n 3 14 TYR n 3 15 ASN n 3 16 LYS n 3 17 GLU n 3 18 VAL n 3 19 GLU n 3 20 GLU n 3 21 PHE n 3 22 TYR n 3 23 ASN n 3 24 GLY 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'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 'Biological sequence' 1 145 ;baker's yeast ; ? 'RRN10, YBL025W, YBL0426' ? 'ATCC 204508 / S288c' ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae' 4932 ? ? '204508 / S288c' ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample 'Biological sequence' 1 228 ;baker's yeast ; ? 'UAF30, YOR295W' ? 'ATCC 204508 / S288c' ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae' 4932 ? ? '204508 / S288c' ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample 'Biological sequence' 1 242 ;baker's yeast ; ? 'SPT15, BTF1, TBP1, YER148W' ? 'ATCC 204508 / S288c' ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae' 4932 ? ? '204508 / S288c' ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 8 1 sample 1 151 'Saccharomyces cerevisiae' ;baker's yeast ; 4932 ? 9 1 sample 1 151 'Saccharomyces cerevisiae' ;baker's yeast ; 4932 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP H3_YEAST P61830 ? 1 ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLASKAARKSAPSTGGVKKPHRYKPGTVALREIRRFQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAIGALQESVEAYLVSLFEDTNLAAIHAKRVTIQKKDIKLARRLRGERS ; 1 2 UNP H4_YEAST P02309 ? 2 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKILRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEEVRAVLKSFLESVIRDSVTYTEHAKRK TVTSLDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 3 UNP RRN5_YEAST Q02983 ? 3 ;MEHQQLRKYVELYNKEVEEFYNGAASGRPAEFHPSKVHVKSIHEKAGTANAGVEISSVGVDWDSEEKNTFFWCLSRYSIH RVDEWRSLLPRKSAMEILGYYRLLRRASASARSRKAGDDGAPIAYEMSAEWVALETKLSETVMAITEGAAEVADEEGHCE GLIDYESWKRRWVAIYSHSRIAEIRPLPRHALPLSRSATQTLERCVSRYTRTLLWCTALAGMASRSVSARAAESRGHKSL PTVVTRRQVERALCTEARSRDLHVLPRRIVLTLRKWELDYPREGKLFRTKEMAHLFLQSQLSRRDAPPVHQDENQENQEN QENQEQDNTASEGESEAERDEIDEADLFRSALHENQLLKWLSK ; 1 4 UNP RRN9_YEAST P53437 ? 4 ;MSDLDEESQIETQIDAPIEDIIRGSELTTTTADKETLKSANELLDSLEHSHRVDLSLHLYSAYLLKRLLYKANEKKHFYE VNQFVKTQIKDNWTSWPNPNTIIDPSVDKLYEDIPEGIANVSVQPGEISNRALMHASDMMRVELDAQWQKFLSKSALDHD VTLDVDELNIPNEISRNILVKLDSLFEGLHDKIAKENEFDVRQDKHSNNIRANQIDDEPMQANRRIKYTYHDLVSRGCEM NEDMTDIYMKSLELYNDIPEKYKKRKFRLPKQILKKYHQPKKTSSYLKELLSKTREDFIPVEKLLKDKRLTSKDKSKLQR LNREETEDALNKRTFFQVKGYLEDENEISDYELDDCLIELPNGNI ; 1 5 UNP RRN10_YEAST P38204 ? 5 ;MDRNVYEACSNIIKEFGTHVVSADEVLAEKIDNAVPIPFKTREEIDADVEKDRNEGVFEGNIIPDIDLRVVHYYATQLCL NKYPHLINAFDETSLITLGLLIEKWVKDYLTSIQTEQGRQSKVIGKGPCEFISKHIDYRHAPGNI ; 1 6 UNP UAF30_YEAST Q08747 ? 6 ;MAELNDYSTMIDILLSDMDLETVTTKKVRMALKEVYAIDVESQGKAINKLIRKHLDLVKERPRFERSLEDLLKENATLAI ELTKEITVSKRSSGEEKNDSETKGTHVEKKKGTVSKSPISTRKVTLSKSLASLLGEHELTRTEVVRRLWAYIKAHNLQNP NNKKEILCDEKLELILGKSTNMFEMHKILASHMTEPKKISDCPPLIQEVRRKEKPIVSDSEQSDTKGI ; 1 7 UNP TBP_YEAST P13393 ? 7 ;MADEERLKEFKEANKIVFDPNTRQVWENQNRDGTKPATTFQSEEDIKRAAPESEKDTSATSGIVPTLQNIVATVTLGCRL DLKTVALHARNAEYNPKRFAAVIMRIREPKTTALIFASGKMVVTGAKSEDDSKLASRKYARIIQKIGFAAKFTDFKIQNI VGSCDVKFPIRLEGLAFSHGTFSSYEPELFPGLIYRMVKPKIVLLIFVSGKIVLTGAKQREEIYQAFEAIYPVLSEFRKM ; 1 8 GB X87401.1 854429 ? 8 ;GAAAAAAAAAATATACGCTAAGATTTTTGGAGAATAGCTTAAATTGAAGTTTTTCTCGGCGAGAAATACGTAGTTAAGGC AGAGCGACAGAGAGGGCAAAAGAAAATAAAAGTAAGATTTTAGTTTGTAATGGGAGGGGGGGTTTAGTCAT ; 2 9 GB X87401.1 854429 ? 9 ;ATGACTAAACCCCCCCTCCCATTACAAACTAAAATCTTACTTTTATTTTCTTTTGCCCTCTCTGTCGCTCTGCCTTAACT ACGTATTTCTCGCCGAGAAAAACTTCAATTTAAGCTATTCTCCAAAAATCTTAGCGTATATTTTTTTTTTC ; 152 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7Z0O A 1 ? 136 ? P61830 1 ? 136 ? 1 136 2 2 7Z0O B 1 ? 103 ? P02309 1 ? 103 ? 1 103 3 1 7Z0O C 1 ? 136 ? P61830 1 ? 136 ? 1 136 4 3 7Z0O D 2 ? 364 ? Q02983 1 ? 363 ? 1 363 5 4 7Z0O E 2 ? 366 ? P53437 1 ? 365 ? 1 365 6 5 7Z0O F 1 ? 145 ? P38204 1 ? 145 ? 1 145 7 6 7Z0O G 1 ? 228 ? Q08747 1 ? 228 ? 1 228 8 7 7Z0O H 3 ? 242 ? P13393 1 ? 240 ? 1 240 9 8 7Z0O N 1 ? 151 ? 854429 2 ? 152 ? -190 -40 10 9 7Z0O T 1 ? 151 ? 854429 152 ? 2 ? 40 190 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 4 7Z0O SER D 1 ? UNP Q02983 ? ? 'expression tag' 0 1 5 7Z0O SER E 1 ? UNP P53437 ? ? 'expression tag' 0 2 8 7Z0O GLY H 1 ? UNP P13393 ? ? 'expression tag' -1 3 8 7Z0O HIS H 2 ? UNP P13393 ? ? 'expression tag' 0 4 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7Z0O _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7Z0O _struct.title 'Structure of transcription factor UAF in complex with TBP and 35S rRNA promoter DNA' _struct.pdbx_structure_determination_methodology ? _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7Z0O _struct_keywords.text 'Transcription Factor, Nucleolus, Histone Fold, TRANSCRIPTION' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 3 ? E N N 4 ? F N N 5 ? G N N 6 ? H N N 7 ? I N N 8 ? J N N 9 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ALA A 48 ? GLU A 60 ? ALA A 48 GLU A 60 1 ? 13 HELX_P HELX_P2 AA2 ARG A 64 ? PHE A 79 ? ARG A 64 PHE A 79 1 ? 16 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN A 86 ? ALA A 115 ? GLN A 86 ALA A 115 1 ? 30 HELX_P HELX_P4 AA4 GLN A 121 ? GLY A 133 ? GLN A 121 GLY A 133 1 ? 13 HELX_P HELX_P5 AA5 ASN B 26 ? ILE B 30 ? ASN B 26 ILE B 30 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 THR B 31 ? GLY B 42 ? THR B 31 GLY B 42 1 ? 12 HELX_P HELX_P7 AA7 ILE B 51 ? ALA B 77 ? ILE B 51 ALA B 77 1 ? 27 HELX_P HELX_P8 AA8 THR B 83 ? ARG B 93 ? THR B 83 ARG B 93 1 ? 11 HELX_P HELX_P9 AA9 ALA C 48 ? PHE C 55 ? ALA C 48 PHE C 55 1 ? 8 HELX_P HELX_P10 AB1 ARG C 64 ? PHE C 79 ? ARG C 64 PHE C 79 1 ? 16 HELX_P HELX_P11 AB2 GLN C 86 ? ALA C 115 ? GLN C 86 ALA C 115 1 ? 30 HELX_P HELX_P12 AB3 GLN C 121 ? ARG C 132 ? GLN C 121 ARG C 132 1 ? 12 HELX_P HELX_P13 AB4 GLN D 5 ? ASN D 23 ? GLN D 4 ASN D 22 1 ? 19 HELX_P HELX_P14 AB5 ASP D 64 ? TYR D 78 ? ASP D 63 TYR D 77 1 ? 15 HELX_P HELX_P15 AB6 SER D 79 ? HIS D 81 ? SER D 78 HIS D 80 5 ? 3 HELX_P HELX_P16 AB7 ARG D 82 ? ARG D 87 ? ARG D 81 ARG D 86 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 AB8 SER D 88 ? LEU D 90 ? SER D 87 LEU D 89 5 ? 3 HELX_P HELX_P18 AB9 SER D 94 ? SER D 111 ? SER D 93 SER D 110 1 ? 18 HELX_P HELX_P19 AC1 SER D 129 ? GLU D 148 ? SER D 128 GLU D 147 1 ? 20 HELX_P HELX_P20 AC2 GLY D 149 ? ALA D 151 ? GLY D 148 ALA D 150 5 ? 3 HELX_P HELX_P21 AC3 ASP D 165 ? ILE D 176 ? ASP D 164 ILE D 175 1 ? 12 HELX_P HELX_P22 AC4 TYR D 177 ? SER D 180 ? TYR D 176 SER D 179 5 ? 4 HELX_P HELX_P23 AC5 ILE D 182 ? ARG D 186 ? ILE D 181 ARG D 185 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 AC6 SER D 196 ? ALA D 219 ? SER D 195 ALA D 218 1 ? 24 HELX_P HELX_P25 AC7 LEU D 220 ? SER D 225 ? LEU D 219 SER D 224 5 ? 6 HELX_P HELX_P26 AC8 THR D 246 ? GLU D 257 ? THR D 245 GLU D 256 1 ? 12 HELX_P HELX_P27 AC9 ALA D 258 ? ASP D 262 ? ALA D 257 ASP D 261 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 AD1 VAL D 265 ? TRP D 277 ? VAL D 264 TRP D 276 1 ? 13 HELX_P HELX_P29 AD2 THR D 290 ? SER D 303 ? THR D 289 SER D 302 1 ? 14 HELX_P HELX_P30 AD3 ASP D 341 ? LYS D 364 ? ASP D 340 LYS D 363 1 ? 24 HELX_P HELX_P31 AD4 THR E 37 ? ASP E 55 ? THR E 36 ASP E 54 1 ? 19 HELX_P HELX_P32 AD5 LEU E 56 ? ASN E 74 ? LEU E 55 ASN E 73 1 ? 19 HELX_P HELX_P33 AD6 HIS E 78 ? ILE E 90 ? HIS E 77 ILE E 89 1 ? 13 HELX_P HELX_P34 AD7 LYS E 91 ? THR E 95 ? 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GLN H 219 GLU H 236 1 ? 18 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? 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PRO 200 H 1 -4.24 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? 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THR H 66 THR H 75 AA9 5 THR H 155 ? ASP H 167 ? THR H 153 ASP H 165 AA9 6 LYS H 213 ? ALA H 219 ? LYS H 211 ALA H 217 AA9 7 ILE H 204 ? ILE H 208 ? ILE H 202 ILE H 206 AA9 8 LEU H 195 ? MET H 199 ? LEU H 193 MET H 197 AA9 9 SER H 185 ? SER H 186 ? SER H 183 SER H 184 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N LYS A 43 ? N LYS A 43 O SER D 57 ? O SER D 56 AA2 1 2 N ARG A 84 ? N ARG A 84 O VAL B 82 ? O VAL B 82 AA3 1 2 N ILE A 120 ? N ILE A 120 O ARG B 46 ? O ARG B 46 AA3 2 3 N ILE B 47 ? N ILE B 47 O TYR D 126 ? O TYR D 125 AA4 1 2 N ARG C 41 ? N ARG C 41 O LEU D 188 ? O LEU D 187 AA5 1 2 N ARG C 84 ? N ARG C 84 O THR D 243 ? O THR D 242 AA6 1 2 N VAL D 38 ? N VAL D 37 O VAL D 61 ? O VAL D 60 AA7 1 2 N VAL D 228 ? N VAL D 227 O ILE E 300 ? O ILE E 299 AA8 1 2 N GLN F 114 ? N GLN F 114 O SER F 121 ? O SER F 121 AA9 1 2 N VAL H 104 ? N VAL H 102 O ILE H 117 ? O ILE H 115 AA9 2 3 N THR H 114 ? N THR H 112 O THR H 126 ? O THR H 124 AA9 3 4 O MET H 123 ? O MET H 121 N VAL H 76 ? N VAL H 74 AA9 4 5 N THR H 75 ? N THR H 73 O LYS H 158 ? O LYS H 156 AA9 5 6 N GLY H 164 ? N GLY H 162 O LEU H 216 ? O LEU H 214 AA9 6 7 O THR H 217 ? O THR H 215 N VAL H 205 ? N VAL H 203 AA9 7 8 O ILE H 208 ? O ILE H 206 N LEU H 195 ? N LEU H 193 AA9 8 9 O ILE H 196 ? O ILE H 194 N SER H 186 ? 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J DT 149 687 1 Y 1 T DT 189 ? J DT 150 688 1 Y 1 T DC 190 ? J DC 151 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 30 mM ? HEPES 1 2 30 mM ? 'Sodium Citrate' 1 3 250 mM ? 'Potassium Chloride' 1 4 2 mM ? DTT 1 5 0.1 % ? 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