data_7JG2 # _entry.id 7JG2 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.397 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 7JG2 pdb_00007jg2 10.2210/pdb7jg2/pdb WWPDB D_1000247439 ? ? EMDB EMD-22310 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2020-11-11 2 'Structure model' 1 1 2024-10-30 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Data collection' 2 2 'Structure model' 'Database references' 3 2 'Structure model' 'Structure summary' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' chem_comp_atom 2 2 'Structure model' chem_comp_bond 3 2 'Structure model' database_2 4 2 'Structure model' em_admin 5 2 'Structure model' pdbx_entry_details 6 2 'Structure model' pdbx_modification_feature # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 2 2 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 3 2 'Structure model' '_em_admin.last_update' 4 2 'Structure model' '_pdbx_entry_details.has_protein_modification' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7JG2 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2020-07-18 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type EMDB 'dimeric Immunoglobin A, SIgA without Secretory component' EMD-22309 'other EM volume' PDB 'dimeric Immunoglobin A, SIgA without Secretory Component' 7JG1 unspecified EMDB 'Secretory Immunoglobin A (SIgA)' EMD-22310 'associated EM volume' # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Kumar Bharathkar, S.' 1 0000-0002-3637-4990 'Parker, B.P.' 2 0000-0002-1464-1189 'Malyutin, A.G.' 3 0000-0003-1716-5437 'Stadtmueller, B.M.' 4 0000-0003-0637-3206 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Elife _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2050-084X _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 9 _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'The structures of Secretory and dimeric Immunoglobulin A.' _citation.year 2020 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.7554/eLife.56098 _citation.pdbx_database_id_PubMed 33107820 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Kumar Bharathkar, S.' 1 ? primary 'Parker, B.W.' 2 ? primary 'Malyutin, A.G.' 3 ? primary 'Haloi, N.' 4 ? primary 'Huey-Tubman, K.E.' 5 ? primary 'Tajkhorshid, E.' 6 0000-0001-8434-1010 primary 'Stadtmueller, B.' 7 0000-0003-0637-3206 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Igh protein' 37976.891 4 ? ? ? ;Genes encoding the mus musculus IgA HC constant region and the lambda LC constant region were fused with HC and LC variable region sequences to create complete HC and LC sequences. The HC and LC variable region is not modeled in this structure. Since authors have chosen not to provide complete sample sequence of the HC and LC variable region the UNKs were not included in the sequence. ; 2 polymer man 'Polymeric immunoglobulin receptor' 61257.211 1 ? ? ? ? 3 polymer man 'Immunoglobulin J chain' 15637.499 1 ? ? ? ? 4 branched man ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 910.823 1 ? ? ? ? 5 branched man 'beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 586.542 1 ? ? ? ? 6 branched man '2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 424.401 2 ? ? ? ? 7 non-polymer syn 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 4 ? ? ? ? # _entity_name_com.entity_id 2 _entity_name_com.name 'Poly-Ig receptor' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;WGQGTLVTVSAESARNPTIYPLTLPPALSSDPVIIGCLIHDYFPSGTMNVTWGKSGKDITTVNFPPALASGGRYTMSSQL TLPAVECPEGESVKCSVQHDSNPVQELDVNCSGPTPPPPITIPSCQPSLSLQRPALEDLLLGSDASITCTLNGLRNPEGA VFTWEPSTGKDAVQKKAVQNSCGCYSVSSVLPGCAERWNSGASFKCTVTHPESGTLTGTIAKVTVNTFPPQVHLLPPPSE ELALNELLSLTCLVRAFNPKEVLVRWLHGNEELSPESYLVFEPLKEPGEGATTYLVTSVLRVSAETWKQGDQYSCMVGHE ALPMNFTQKTIDRLSGKPTNVSVSVIMSEGDGICY ; ;WGQGTLVTVSAESARNPTIYPLTLPPALSSDPVIIGCLIHDYFPSGTMNVTWGKSGKDITTVNFPPALASGGRYTMSSQL TLPAVECPEGESVKCSVQHDSNPVQELDVNCSGPTPPPPITIPSCQPSLSLQRPALEDLLLGSDASITCTLNGLRNPEGA VFTWEPSTGKDAVQKKAVQNSCGCYSVSSVLPGCAERWNSGASFKCTVTHPESGTLTGTIAKVTVNTFPPQVHLLPPPSE ELALNELLSLTCLVRAFNPKEVLVRWLHGNEELSPESYLVFEPLKEPGEGATTYLVTSVLRVSAETWKQGDQYSCMVGHE ALPMNFTQKTIDRLSGKPTNVSVSVIMSEGDGICY ; A,B,C,D ? 2 'polypeptide(L)' no no ;KSPIFGPQEVSSIEGDSVSITCYYPDTSVNRHTRKYWCRQGASGMCTTLISSNGYLSKEYSGRANLINFPENNTFVINIE QLTQDDTGSYKCGLGTSNRGLSFDVSLEVSQVPELPSDTHVYTKDIGRNVTIECPFKRENAPSKKSLCKKTNQSCELVID STEKVNPSYIGRAKLFMKGTDLTVFYVNISHLTHNDAGLYICQAGEGPSADKKNVDLQVLAPEPELLYKDLRSSVTFECD LGREVANEAKYLCRMNKETCDVIINTLGKRDPDFEGRILITPKDDNGRFSVLITGLRKEDAGHYQCGAHSSGLPQEGWPI QTWQLFVNEESTIPNRRSVVKGVTGGSVAIACPYNPKESSSLKYWCRWEGDGNGHCPVLVGTQAQVQEEYEGRLALFDQP GNGTYTVILNQLTTEDAGFYWCLTNGDSRWRTTIELQVAEATREPNLEVTPQNATAVLGETFTVSCHYPCKFYSQEKYWC KWSNKGCHILPSHDEGARQSSVSCDQSSQLVSMTLNPVSKEDEGWYWCGVKQGQTYGETTAIYIAVEER ; ;KSPIFGPQEVSSIEGDSVSITCYYPDTSVNRHTRKYWCRQGASGMCTTLISSNGYLSKEYSGRANLINFPENNTFVINIE QLTQDDTGSYKCGLGTSNRGLSFDVSLEVSQVPELPSDTHVYTKDIGRNVTIECPFKRENAPSKKSLCKKTNQSCELVID STEKVNPSYIGRAKLFMKGTDLTVFYVNISHLTHNDAGLYICQAGEGPSADKKNVDLQVLAPEPELLYKDLRSSVTFECD LGREVANEAKYLCRMNKETCDVIINTLGKRDPDFEGRILITPKDDNGRFSVLITGLRKEDAGHYQCGAHSSGLPQEGWPI QTWQLFVNEESTIPNRRSVVKGVTGGSVAIACPYNPKESSSLKYWCRWEGDGNGHCPVLVGTQAQVQEEYEGRLALFDQP GNGTYTVILNQLTTEDAGFYWCLTNGDSRWRTTIELQVAEATREPNLEVTPQNATAVLGETFTVSCHYPCKFYSQEKYWC KWSNKGCHILPSHDEGARQSSVSCDQSSQLVSMTLNPVSKEDEGWYWCGVKQGQTYGETTAIYIAVEER ; E ? 3 'polypeptide(L)' no no ;DDEATILADNKCMCTRVTSRIIPSTEDPNEDIVERNIRIVVPLNNRENISDPTSPLRRNFVYHLSDVCKKCDPVEVELED QVVTATQSNICNEDDGVPETCYMYDRNKCYTTMVPLRYHGETKMVQAALTPDSCYPD ; ;DDEATILADNKCMCTRVTSRIIPSTEDPNEDIVERNIRIVVPLNNRENISDPTSPLRRNFVYHLSDVCKKCDPVEVELED QVVTATQSNICNEDDGVPETCYMYDRNKCYTTMVPLRYHGETKMVQAALTPDSCYPD ; J ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 7 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 TRP n 1 2 GLY n 1 3 GLN n 1 4 GLY n 1 5 THR n 1 6 LEU n 1 7 VAL n 1 8 THR n 1 9 VAL n 1 10 SER n 1 11 ALA n 1 12 GLU n 1 13 SER n 1 14 ALA n 1 15 ARG n 1 16 ASN n 1 17 PRO n 1 18 THR n 1 19 ILE n 1 20 TYR n 1 21 PRO n 1 22 LEU n 1 23 THR n 1 24 LEU n 1 25 PRO n 1 26 PRO n 1 27 ALA n 1 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PRO n 1 118 PRO n 1 119 PRO n 1 120 ILE n 1 121 THR n 1 122 ILE n 1 123 PRO n 1 124 SER n 1 125 CYS n 1 126 GLN n 1 127 PRO n 1 128 SER n 1 129 LEU n 1 130 SER n 1 131 LEU n 1 132 GLN n 1 133 ARG n 1 134 PRO n 1 135 ALA n 1 136 LEU n 1 137 GLU n 1 138 ASP n 1 139 LEU n 1 140 LEU n 1 141 LEU n 1 142 GLY n 1 143 SER n 1 144 ASP n 1 145 ALA n 1 146 SER n 1 147 ILE n 1 148 THR n 1 149 CYS n 1 150 THR n 1 151 LEU n 1 152 ASN n 1 153 GLY n 1 154 LEU n 1 155 ARG n 1 156 ASN n 1 157 PRO n 1 158 GLU n 1 159 GLY n 1 160 ALA n 1 161 VAL n 1 162 PHE n 1 163 THR n 1 164 TRP n 1 165 GLU n 1 166 PRO n 1 167 SER n 1 168 THR n 1 169 GLY n 1 170 LYS n 1 171 ASP n 1 172 ALA n 1 173 VAL n 1 174 GLN n 1 175 LYS n 1 176 LYS n 1 177 ALA n 1 178 VAL n 1 179 GLN n 1 180 ASN n 1 181 SER n 1 182 CYS n 1 183 GLY n 1 184 CYS n 1 185 TYR n 1 186 SER n 1 187 VAL n 1 188 SER n 1 189 SER n 1 190 VAL n 1 191 LEU n 1 192 PRO n 1 193 GLY n 1 194 CYS n 1 195 ALA n 1 196 GLU n 1 197 ARG n 1 198 TRP n 1 199 ASN n 1 200 SER n 1 201 GLY n 1 202 ALA n 1 203 SER n 1 204 PHE n 1 205 LYS n 1 206 CYS n 1 207 THR n 1 208 VAL n 1 209 THR n 1 210 HIS n 1 211 PRO n 1 212 GLU n 1 213 SER n 1 214 GLY n 1 215 THR n 1 216 LEU n 1 217 THR n 1 218 GLY n 1 219 THR n 1 220 ILE n 1 221 ALA n 1 222 LYS n 1 223 VAL n 1 224 THR n 1 225 VAL n 1 226 ASN n 1 227 THR n 1 228 PHE n 1 229 PRO n 1 230 PRO n 1 231 GLN n 1 232 VAL n 1 233 HIS n 1 234 LEU n 1 235 LEU n 1 236 PRO n 1 237 PRO n 1 238 PRO n 1 239 SER n 1 240 GLU n 1 241 GLU n 1 242 LEU n 1 243 ALA n 1 244 LEU n 1 245 ASN n 1 246 GLU n 1 247 LEU n 1 248 LEU n 1 249 SER n 1 250 LEU n 1 251 THR n 1 252 CYS n 1 253 LEU n 1 254 VAL n 1 255 ARG n 1 256 ALA n 1 257 PHE n 1 258 ASN n 1 259 PRO n 1 260 LYS n 1 261 GLU n 1 262 VAL n 1 263 LEU n 1 264 VAL n 1 265 ARG n 1 266 TRP n 1 267 LEU n 1 268 HIS n 1 269 GLY n 1 270 ASN n 1 271 GLU n 1 272 GLU n 1 273 LEU n 1 274 SER n 1 275 PRO n 1 276 GLU n 1 277 SER n 1 278 TYR n 1 279 LEU n 1 280 VAL n 1 281 PHE n 1 282 GLU n 1 283 PRO n 1 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P01592 23 ? 159 ? 1 137 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 CYS A 194 ? GLY A 201 ? CYS A 306 GLY A 313 1 ? 8 HELX_P HELX_P2 AA2 SER A 239 ? ASN A 245 ? SER A 351 ASN A 357 1 ? 7 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 274 ? GLU A 276 ? SER A 386 GLU A 388 5 ? 3 HELX_P HELX_P4 AA4 ALA A 304 ? GLN A 309 ? ALA A 416 GLN A 421 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 ALA B 135 ? LEU B 139 ? ALA B 247 LEU B 251 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 CYS B 194 ? SER B 200 ? CYS B 306 SER B 312 1 ? 7 HELX_P HELX_P7 AA7 PRO B 211 ? SER B 213 ? PRO B 323 SER B 325 5 ? 3 HELX_P HELX_P8 AA8 PRO B 238 ? ALA B 243 ? PRO B 350 ALA B 355 1 ? 6 HELX_P HELX_P9 AA9 ALA B 304 ? GLY B 310 ? ALA B 416 GLY B 422 1 ? 7 HELX_P HELX_P10 AB1 LEU B 322 ? PHE B 326 ? LEU B 434 PHE B 438 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 SER C 181 ? GLY C 183 ? SER C 293 GLY C 295 5 ? 3 HELX_P HELX_P12 AB3 GLY C 193 ? SER C 200 ? GLY C 305 SER C 312 1 ? 8 HELX_P HELX_P13 AB4 PRO C 238 ? ALA C 243 ? PRO C 350 ALA C 355 1 ? 6 HELX_P HELX_P14 AB5 SER C 274 ? GLU C 276 ? SER C 386 GLU C 388 5 ? 3 HELX_P HELX_P15 AB6 ALA C 304 ? GLY C 310 ? ALA C 416 GLY C 422 1 ? 7 HELX_P HELX_P16 AB7 ASP C 332 ? GLY C 336 ? ASP C 444 GLY C 448 5 ? 5 HELX_P HELX_P17 AB8 ALA D 135 ? LEU D 140 ? ALA D 247 LEU D 252 1 ? 6 HELX_P HELX_P18 AB9 CYS D 194 ? GLY D 201 ? CYS D 306 GLY D 313 1 ? 8 HELX_P HELX_P19 AC1 PRO D 238 ? ASN D 245 ? PRO D 350 ASN D 357 1 ? 8 HELX_P HELX_P20 AC2 SER D 274 ? TYR D 278 ? SER D 386 TYR D 390 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 AC3 ALA D 304 ? GLY D 310 ? ALA D 416 GLY D 422 1 ? 7 HELX_P HELX_P22 AC4 LEU D 322 ? PHE D 326 ? LEU D 434 PHE D 438 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 THR E 27 ? THR E 33 ? THR E 27 THR E 33 1 ? 7 HELX_P HELX_P24 AC6 LYS E 137 ? ALA E 141 ? LYS E 137 ALA E 141 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 AC7 ASN E 166 ? ILE E 170 ? ASN E 166 ILE E 170 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 AC8 THR E 193 ? ALA E 197 ? THR E 193 ALA E 197 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 GLY E 242 ? ALA E 246 ? GLY E 242 ALA E 246 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 AD1 ASP E 271 ? GLU E 275 ? ASP E 271 GLU E 275 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 AD2 ARG E 297 ? ALA E 301 ? ARG E 297 ALA E 301 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 AD3 ASN E 355 ? SER E 359 ? ASN E 355 SER E 359 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 AD4 THR E 413 ? ALA E 417 ? THR E 413 ALA E 417 5 ? 5 HELX_P HELX_P32 AD5 PRO E 469 ? TYR E 473 ? PRO E 469 TYR E 473 5 ? 5 HELX_P HELX_P33 AD6 SER E 519 ? GLU E 523 ? SER E 519 GLU E 523 5 ? 5 HELX_P HELX_P34 AD7 LEU F 64 ? CYS F 68 ? LEU J 64 CYS J 68 1 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 125 SG ? ? ? 1_555 A CYS 184 SG ? ? A CYS 237 A CYS 296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 149 SG ? ? ? 1_555 A CYS 206 SG ? ? A CYS 261 A CYS 318 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 182 SG ? ? ? 1_555 B CYS 182 SG ? ? A CYS 294 B CYS 294 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf4 disulf ? ? A CYS 252 SG ? ? ? 1_555 A CYS 315 SG ? ? A CYS 364 A CYS 427 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf5 disulf ? ? A CYS 354 SG ? ? ? 1_555 F CYS 68 SG ? ? A CYS 466 J CYS 68 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf6 disulf ? ? B CYS 125 SG ? ? ? 1_555 B CYS 184 SG ? ? B CYS 237 B CYS 296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf7 disulf ? ? B CYS 149 SG ? ? ? 1_555 B CYS 206 SG ? ? B CYS 261 B CYS 318 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.617 ? ? disulf8 disulf ? ? B CYS 252 SG ? ? ? 1_555 B CYS 315 SG ? ? B CYS 364 B CYS 427 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf9 disulf ? ? C CYS 125 SG ? ? ? 1_555 C CYS 184 SG ? ? C CYS 237 C CYS 296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf10 disulf ? ? C CYS 149 SG ? ? ? 1_555 C CYS 206 SG ? ? C CYS 261 C CYS 318 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf11 disulf ? ? C CYS 182 SG ? ? ? 1_555 D CYS 182 SG ? ? C CYS 294 D CYS 294 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf12 disulf ? ? C CYS 252 SG ? ? ? 1_555 C CYS 315 SG ? ? C CYS 364 C CYS 427 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? ? disulf13 disulf ? ? C CYS 354 SG ? ? ? 1_555 F CYS 14 SG ? ? C CYS 466 J CYS 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf14 disulf ? ? D CYS 125 SG ? ? ? 1_555 D CYS 184 SG ? ? D CYS 237 D CYS 296 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf15 disulf ? ? D CYS 149 SG ? ? ? 1_555 D CYS 206 SG ? ? D CYS 261 D CYS 318 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf16 disulf ? ? D CYS 252 SG ? ? ? 1_555 D CYS 315 SG ? ? D CYS 364 D CYS 427 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf17 disulf ? ? E CYS 22 SG ? ? ? 1_555 E CYS 92 SG ? ? E CYS 22 E CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf18 disulf ? ? E CYS 38 SG ? ? ? 1_555 E CYS 46 SG ? ? E CYS 38 E CYS 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf19 disulf ? ? E CYS 134 SG ? ? ? 1_555 E CYS 202 SG ? ? E CYS 134 E CYS 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.212 ? ? disulf20 disulf ? ? E CYS 239 SG ? ? ? 1_555 E CYS 306 SG ? ? E CYS 239 E CYS 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf21 disulf ? ? E CYS 253 SG ? ? ? 1_555 E CYS 260 SG ? ? E CYS 253 E CYS 260 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf22 disulf ? ? E CYS 352 SG ? ? ? 1_555 E CYS 422 SG ? ? E CYS 352 E CYS 422 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf23 disulf ? ? E CYS 366 SG ? ? ? 1_555 E CYS 376 SG ? ? E CYS 366 E CYS 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf24 disulf ? ? E CYS 466 SG ? ? ? 1_555 E CYS 528 SG ? ? E CYS 466 E CYS 528 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf25 disulf ? ? F CYS 12 SG ? ? ? 1_555 F CYS 101 SG ? ? J CYS 12 J CYS 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf26 disulf ? ? F CYS 71 SG ? ? ? 1_555 F CYS 91 SG ? ? J CYS 71 J CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf27 disulf ? ? F CYS 109 SG ? ? ? 1_555 F CYS 134 SG ? ? J CYS 109 J CYS 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? covale1 covale one ? A ASN 325 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? A ASN 437 A NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? C ASN 325 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? C ASN 437 C NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? C ASN 340 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? C ASN 452 C NAG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? D ASN 340 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? D ASN 452 D NAG 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? E ASN 72 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? E ASN 72 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? E ASN 129 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? E ASN 129 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? E ASN 188 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? E ASN 188 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? F ASN 48 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? J ASN 48 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale9 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale10 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G BMA . C1 ? ? F NAG 2 F BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale11 covale both ? G BMA . O6 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? F BMA 3 F MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale12 covale both ? G MAN . O3 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? F MAN 4 F MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale13 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale14 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H BMA . C1 ? ? G NAG 2 G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale15 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale16 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? I NAG 1 I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _pdbx_modification_feature.ordinal _pdbx_modification_feature.label_comp_id _pdbx_modification_feature.label_asym_id _pdbx_modification_feature.label_seq_id _pdbx_modification_feature.label_alt_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_label_alt_id _pdbx_modification_feature.auth_comp_id _pdbx_modification_feature.auth_asym_id _pdbx_modification_feature.auth_seq_id _pdbx_modification_feature.PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.symmetry _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_comp_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_asym_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_auth_seq_id _pdbx_modification_feature.modified_residue_PDB_ins_code _pdbx_modification_feature.modified_residue_symmetry _pdbx_modification_feature.comp_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id_linking_atom _pdbx_modification_feature.modified_residue_id _pdbx_modification_feature.ref_pcm_id _pdbx_modification_feature.ref_comp_id _pdbx_modification_feature.type _pdbx_modification_feature.category 1 NAG G . ? ASN E 72 ? NAG F 1 ? 1_555 ASN E 72 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 2 NAG H . ? ASN E 129 ? NAG G 1 ? 1_555 ASN E 129 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 3 NAG I . ? ASN E 188 ? NAG H 1 ? 1_555 ASN E 188 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 4 NAG J . ? ASN F 48 ? NAG I 1 ? 1_555 ASN J 48 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 5 NAG K . ? ASN A 325 ? NAG A 501 ? 1_555 ASN A 437 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 6 NAG L . ? ASN C 325 ? NAG C 501 ? 1_555 ASN C 437 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 7 NAG M . ? ASN C 340 ? NAG C 502 ? 1_555 ASN C 452 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 8 NAG N . ? ASN D 340 ? NAG D 501 ? 1_555 ASN D 452 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 9 CYS A 125 ? CYS A 184 ? CYS A 237 ? 1_555 CYS A 296 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 10 CYS A 149 ? CYS A 206 ? CYS A 261 ? 1_555 CYS A 318 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 11 CYS A 182 ? CYS B 182 ? CYS A 294 ? 1_555 CYS B 294 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 12 CYS A 252 ? CYS A 315 ? CYS A 364 ? 1_555 CYS A 427 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 13 CYS A 354 ? CYS F 68 ? CYS A 466 ? 1_555 CYS J 68 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 14 CYS B 125 ? CYS B 184 ? CYS B 237 ? 1_555 CYS B 296 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 15 CYS B 149 ? CYS B 206 ? CYS B 261 ? 1_555 CYS B 318 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 16 CYS B 252 ? CYS B 315 ? CYS B 364 ? 1_555 CYS B 427 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 17 CYS C 125 ? CYS C 184 ? CYS C 237 ? 1_555 CYS C 296 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 18 CYS C 149 ? CYS C 206 ? CYS C 261 ? 1_555 CYS C 318 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 19 CYS C 182 ? CYS D 182 ? CYS C 294 ? 1_555 CYS D 294 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 20 CYS C 252 ? CYS C 315 ? CYS C 364 ? 1_555 CYS C 427 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 21 CYS C 354 ? CYS F 14 ? CYS C 466 ? 1_555 CYS J 14 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 22 CYS D 125 ? CYS D 184 ? CYS D 237 ? 1_555 CYS D 296 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 23 CYS D 149 ? CYS D 206 ? CYS D 261 ? 1_555 CYS D 318 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 24 CYS D 252 ? CYS D 315 ? CYS D 364 ? 1_555 CYS D 427 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 25 CYS E 22 ? CYS E 92 ? CYS E 22 ? 1_555 CYS E 92 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 26 CYS E 38 ? CYS E 46 ? CYS E 38 ? 1_555 CYS E 46 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 27 CYS E 134 ? CYS E 202 ? CYS E 134 ? 1_555 CYS E 202 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 28 CYS E 239 ? CYS E 306 ? CYS E 239 ? 1_555 CYS E 306 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 29 CYS E 253 ? CYS E 260 ? CYS E 253 ? 1_555 CYS E 260 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 30 CYS E 352 ? CYS E 422 ? CYS E 352 ? 1_555 CYS E 422 ? 1_555 SG SG . . . 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AE3 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD1 4 5 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD3 1 2 ? parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD3 4 5 ? anti-parallel AD4 1 2 ? parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD6 1 2 ? parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD8 1 2 ? parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD8 4 5 ? anti-parallel AD9 1 2 ? parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 SER A 128 ? 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