data_7JRP # _entry.id 7JRP # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.338 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 7JRP WWPDB D_1000251289 EMDB EMD-22448 # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type PDB 'related structure from same publication' 7JRG unspecified PDB 'related structure from same publication' 7JRO unspecified EMDB 'Plant Mitochondrial complex SC III2+IV from Vigna radiata' EMD-22448 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7JRP _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2020-08-12 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Maldonado, M.' 1 ? 'Letts, J.A.' 2 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Elife _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2050-084X _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 10 _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Atomic structures of respiratory complex III 2 , complex IV, and supercomplex III 2 -IV from vascular plants.' _citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.7554/eLife.62047 _citation.pdbx_database_id_PubMed 33463523 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Maldonado, M.' 1 0000-0002-3428-1053 primary 'Guo, F.' 2 ? primary 'Letts, J.A.' 3 0000-0002-9864-3586 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7JRP _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7JRP _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mitochondrial isoform X1' 58711.238 2 ? ? ? ? 2 polymer nat Alpha-MPP 54537.684 2 ? ? ? ? 3 polymer nat COB 44353.543 2 ? ? ? ? 4 polymer nat 'cytochrome c1-2, heme protein, mitochondrial' 33556.188 2 ? ? ? ? 5 polymer nat 'Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial' 30051.432 2 7.1.1.8 ? ? ? 6 polymer nat 'Cytochrome b-c1 complex subunit 7' 14392.698 2 ? ? ? ? 7 polymer nat 'cytochrome b-c1 complex subunit 8' 8349.831 2 ? ? ? ? 8 polymer nat 'Cytochrome b-c1 complex subunit 6' 8117.424 2 ? ? ? ? 9 polymer nat 'cytochrome b-c1 complex subunit 9' 8203.420 2 ? ? ? ? 10 polymer nat QCR10 8948.875 2 ? ? ? ? 11 polymer nat COX1 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(II) ION' 63.546 1 ? ? ? ? 29 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 1 ? ? ? ? 30 non-polymer syn 'DINUCLEAR COPPER ION' 127.092 1 ? ? ? ? 31 non-polymer syn LYSINE 147.195 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 MPP-beta 2 'Inactive zinc metalloprotease alpha,Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MSLNRLLSAARRSDRRASALSSFRSLSASPALAPSAASPPAPPPPTAMIYDRAAEAIKSKLRQLENPDPRFLKHGNPRPA LSDHTRILAAPETRVTTLPNGLRVATESSLAARTATVGVWIDAGSRFETEETNGTAHFLEHMIFKGTERRNARELEEEIE NMGGHLNAYTSREQTTYYAKVTDSDVPQALDILADILQNSRFEENRISRERDVILREMEEVEGQTEEVIFDHLHATAFQY TPLGRTILGPAQNIKTITKAHLQSYIQTHYTAPRMVIAASGAVKHEDIVEQVKKLFTKLSTDATTTAQLVAKEPAIFTGS EVRMLDDDIPLAQFAVAFEGASWKDPDSIALMVMQAMLGSWNKTAGGGKHMGSELAQRVGINEVAESIMAFNTNYKDTGL FGVYAVAKPDCLDDLSYAIMQETTKLVYRVSEDDVTRACNQLKSSLLLHIDGTSPVAEDIGRQLLTYGRRIPFAELFARI DAVDASTIKRVANRFIYDKDVAIAAMGPIQRLPDYNWFRRRTYWNRY ; ;MSLNRLLSAARRSDRRASALSSFRSLSASPALAPSAASPPAPPPPTAMIYDRAAEAIKSKLRQLENPDPRFLKHGNPRPA LSDHTRILAAPETRVTTLPNGLRVATESSLAARTATVGVWIDAGSRFETEETNGTAHFLEHMIFKGTERRNARELEEEIE NMGGHLNAYTSREQTTYYAKVTDSDVPQALDILADILQNSRFEENRISRERDVILREMEEVEGQTEEVIFDHLHATAFQY TPLGRTILGPAQNIKTITKAHLQSYIQTHYTAPRMVIAASGAVKHEDIVEQVKKLFTKLSTDATTTAQLVAKEPAIFTGS EVRMLDDDIPLAQFAVAFEGASWKDPDSIALMVMQAMLGSWNKTAGGGKHMGSELAQRVGINEVAESIMAFNTNYKDTGL FGVYAVAKPDCLDDLSYAIMQETTKLVYRVSEDDVTRACNQLKSSLLLHIDGTSPVAEDIGRQLLTYGRRIPFAELFARI DAVDASTIKRVANRFIYDKDVAIAAMGPIQRLPDYNWFRRRTYWNRY ; A,M ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MYRAAASSFRRHLKGHGSKLGSTRSSTSAAVAARTSKGGLFSWLTGERSSSLPSLDIPLGGVVLPDPLPDSVEQSKTKIT TLSNGLKIASETSPNPAASIGLYLDCGSIYETPFSSGASHLLERMAFKSTTNRSHFRIVREVEAIGGNIGASASREQMGY 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GWLLRYMHANGASMFFIVVYLHIFRGLYYASYSSPREFVWCLGVVIFLLMIVTAFTGYVLPWGQMSFWGATVITSLASAI PVVGDTIVTWLWGGFSVDNATLNRFFSLHYLLPFLLVGASLLHLAALHQYGSNNPLGVHSEMDQISFYPYFYVKDLVGWV AFAIFFSIWIFYAPNVLGHPDNYIPANPMSTPPHIVPEWYFLPIYAILRSIPDKSGGVAAIALVFICLLALPFFKSMYVR SSSFRPIYQGIFWLLLADCLLLGWIGCQPVEAPFVTIGQISSFVFFLFFAITPILGRVGRGIPNSYTTDETEM ; ;MTIRNQRFSLLKEPISSTLNQHLIDYPTPSNLSYWWGFGSLAGICLVIQIVTGVFLAMHYTPHVDLAFNSVEHVMRDVEG GWLLRYMHANGASMFFIVVYLHIFRGLYYASYSSPREFVWCLGVVIFLLMIVTAFTGYVLPWGQMSFWGATVITSLASAI PVVGDTIVTWLWGGFSVDNATLNRFFSLHYLLPFLLVGASLLHLAALHQYGSNNPLGVHSEMDQISFYPYFYVKDLVGWV AFAIFFSIWIFYAPNVLGHPDNYIPANPMSTPPHIVPEWYFLPIYAILRSIPDKSGGVAAIALVFICLLALPFFKSMYVR SSSFRPIYQGIFWLLLADCLLLGWIGCQPVEAPFVTIGQISSFVFFLFFAITPILGRVGRGIPNSYTTDETEM ; C,O ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MTGGVFQLLRRKLHPQFTNSSLLSPIIAKKDGAGSTGSRSLKVLALIGAGVSGFFSFSTVAVADEAEHGLACPSYPWPHK GILSSYDHASIRRGHQVYTEVCASCHSMSLISYRDLVGVAYTEEEVKAMAAEIEVVDGPNDEGEMFTRPGKLSDRFPQPY ANEAAARFANGGAYPPDLSLITKARHNGQNYVFSLLTGYRDPPAGVSIREGLHYNPYFPGGAIAMPKMLNDGAVEYEDGT PATEAQMGKDVVSFLSWAAEPEMEERKLMGFKWIFVLSLALLQAAYYRRLRWSVLKSRKLVLDVVN ; ;MTGGVFQLLRRKLHPQFTNSSLLSPIIAKKDGAGSTGSRSLKVLALIGAGVSGFFSFSTVAVADEAEHGLACPSYPWPHK GILSSYDHASIRRGHQVYTEVCASCHSMSLISYRDLVGVAYTEEEVKAMAAEIEVVDGPNDEGEMFTRPGKLSDRFPQPY ANEAAARFANGGAYPPDLSLITKARHNGQNYVFSLLTGYRDPPAGVSIREGLHYNPYFPGGAIAMPKMLNDGAVEYEDGT PATEAQMGKDVVSFLSWAAEPEMEERKLMGFKWIFVLSLALLQAAYYRRLRWSVLKSRKLVLDVVN ; D,P ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MLRVAAKRLSSLSSSAWRANHAASAVLSRNPVAPSLSTEEHRSDPFSLRPEFFLPIRGYATDSLFHPKENSLIPEIPATV AAVKNPSSKIIYDEHNHERFPPGDPSKRAFAYFVLTGGRFVYASLIRLLVLKFVLSMSASKDVLALASLEVDLSSIEPGT TVTVKWRGKPVFIRRRTEDDIKLANSVDVASLRDPQQDAERVKNPEWLIVIGVCTHLGCIPLPNAGDFGGWFCPCHGSHY DISGRIRKGPAPYNLEVPTYTFLEENKLMIG ; ;MLRVAAKRLSSLSSSAWRANHAASAVLSRNPVAPSLSTEEHRSDPFSLRPEFFLPIRGYATDSLFHPKENSLIPEIPATV AAVKNPSSKIIYDEHNHERFPPGDPSKRAFAYFVLTGGRFVYASLIRLLVLKFVLSMSASKDVLALASLEVDLSSIEPGT TVTVKWRGKPVFIRRRTEDDIKLANSVDVASLRDPQQDAERVKNPEWLIVIGVCTHLGCIPLPNAGDFGGWFCPCHGSHY DISGRIRKGPAPYNLEVPTYTFLEENKLMIG ; E,Q ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MASFLQSFLDPKKNWLAAQHMKSLVKRLSKYGLRYDDLYDPYYDLDVKEALNRLPKEVVDARHARLKRAIDLSMKHEYLP EDLQAMQTPFRGYLQDMLALVKRERAEREALGGLPLYQRSIP ; ;MASFLQSFLDPKKNWLAAQHMKSLVKRLSKYGLRYDDLYDPYYDLDVKEALNRLPKEVVDARHARLKRAIDLSMKHEYLP EDLQAMQTPFRGYLQDMLALVKRERAEREALGGLPLYQRSIP ; F,R ? 7 'polypeptide(L)' no no MGKQIVPVKSVIYALSPFQQKVMTGLWKDLPTKIHHKVSENWISATLLLGPLVGTYAYVQNYLEKEKLHHRY MGKQIVPVKSVIYALSPFQQKVMTGLWKDLPTKIHHKVSENWISATLLLGPLVGTYAYVQNYLEKEKLHHRY G,S ? 8 'polypeptide(L)' no no MADEEPVDQKRYLEESCKPKCVKPLLEYQACIKRIHGDDSGQKHCTGQYFDYWFCVDKCVAPKLFTKLK MADEEPVDQKRYLEESCKPKCVKPLLEYQACIKRIHGDDSGQKHCTGQYFDYWFCVDKCVAPKLFTKLK H,T ? 9 'polypeptide(L)' no no METVARRRGGGIFESLYKVVMRRNSVYVTFVIAGAFLGERAVDYGIHKLWEANNVGKRYEDIPVLGQKLSEE METVARRRGGGIFESLYKVVMRRNSVYVTFVIAGAFLGERAVDYGIHKLWEANNVGKRYEDIPVLGQKLSEE J,V ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MAGLPARLRIQPADVKAAAMWGVAAATGGLYLVQVSILVLPPVKVVFHFYLVSGFRICLDVKDLRTMPCSAPRIWRLYIL I ; ;MAGLPARLRIQPADVKAAAMWGVAAATGGLYLVQVSILVLPPVKVVFHFYLVSGFRICLDVKDLRTMPCSAPRIWRLYIL I ; K,W ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MTNPVRWLFSTNHKDIGTLYFIFGAIAGVMGTCFSVLIRMELARPGDQILGGNHQLYNVLITAHAFLMIFFMVMPAMIGG FGNWFVPILIGAPDMAFPRLNNISFWLLPPSLLLLLSSALVEVGSGTGWTVYPPLSGITSHSGGAVDLAIFSLHLSGVSS ILGSINFITTIFNMRGPGMTMHRSPLFVWSVLVTAFLLLLSLPVLAGAITMLLTDRNFNTTFFDPAGGGDPILYQHLFWF FGHPEVYILILPGFGIISHIVSTFSGKPVFGYLGMVYAMISIGVLGFLVWAHHMFTVGLDVDTRAYFTAATMIIAVPTGI KIFSWIATMWGGSIQYKTPMLFAVGFIFLFTIGGLTGIVLANSGLDIALHDTYYVVAHFHYVLSMGAVFALFAGFYYWVG KIFGRTYPETLGQIHFWITFFGVNLTFFPMHFLGLSGMPRRIPDYPDAYAGWNALSSFGSYISVVGICCFFVVVTITSTS GNNITRANIPWAVEQNSTTLEWLVQSPPAFHTFGELPAIKETKSYVK ; ;MTNPVRWLFSTNHKDIGTLYFIFGAIAGVMGTCFSVLIRMELARPGDQILGGNHQLYNVLITAHAFLMIFFMVMPAMIGG FGNWFVPILIGAPDMAFPRLNNISFWLLPPSLLLLLSSALVEVGSGTGWTVYPPLSGITSHSGGAVDLAIFSLHLSGVSS ILGSINFITTIFNMRGPGMTMHRSPLFVWSVLVTAFLLLLSLPVLAGAITMLLTDRNFNTTFFDPAGGGDPILYQHLFWF FGHPEVYILILPGFGIISHIVSTFSGKPVFGYLGMVYAMISIGVLGFLVWAHHMFTVGLDVDTRAYFTAATMIIAVPTGI KIFSWIATMWGGSIQYKTPMLFAVGFIFLFTIGGLTGIVLANSGLDIALHDTYYVVAHFHYVLSMGAVFALFAGFYYWVG KIFGRTYPETLGQIHFWITFFGVNLTFFPMHFLGLSGMPRRIPDYPDAYAGWNALSSFGSYISVVGICCFFVVVTITSTS GNNITRANIPWAVEQNSTTLEWLVQSPPAFHTFGELPAIKETKSYVK ; a ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MCGGFPAISFCDAPEPWQLGFQDAATPIMQGIMDLHHDIFFFLVQIAVFVLWVLSRALWCFRSKISPIPQRIVHGTTIEI LWTIFPSIILMFIAIPSFTLLYSMDDVVVDPAITIKAIGHQWYWSYEYSDYNNSDEQSLAFDSYMVPEDDLELGQLRLLE VDNRVVVPAKTHLRVLITSADVLHSWAVPSLGVKCDAVPGRLNQISTFIQREGVYYGQCSEICGTNHAFMPIVVEAVSTK DYGSWVSNQIQ ; ;MCGGFPAISFCDAPEPWQLGFQDAATPIMQGIMDLHHDIFFFLVQIAVFVLWVLSRALWCFRSKISPIPQRIVHGTTIEI LWTIFPSIILMFIAIPSFTLLYSMDDVVVDPAITIKAIGHQWYWSYEYSDYNNSDEQSLAFDSYMVPEDDLELGQLRLLE VDNRVVVPAKTHLRVLITSADVLHSWAVPSLGVKCDAVPGRLNQISTFIQREGVYYGQCSEICGTNHAFMPIVVEAVSTK DYGSWVSNQIQ ; b ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MIESQRHSYHLVDPSPWPISGSLGALATTVGGVMYMHSFQGGATLLSLGLIFILYTMFVWWRDVLRESTLEGHHTKVVQL GLRYGFILFIVSEVMFLFAFFWAFFHSSLAPTVEIGGIWPPLGIWVLDPWEIPFLNTLILLSSGAAVTWAHHAILAGKEK RAVYALVATVLLALVFTGFQGMEYYQAPFTISDSIYGSTFFLATGFHGFHVIIGTLFLIICGIRQYLGHLTKEHHVGFEA AAWYWHFVDVVWLFLFVSIYWWGGI ; ;MIESQRHSYHLVDPSPWPISGSLGALATTVGGVMYMHSFQGGATLLSLGLIFILYTMFVWWRDVLRESTLEGHHTKVVQL GLRYGFILFIVSEVMFLFAFFWAFFHSSLAPTVEIGGIWPPLGIWVLDPWEIPFLNTLILLSSGAAVTWAHHAILAGKEK RAVYALVATVLLALVFTGFQGMEYYQAPFTISDSIYGSTFFLATGFHGFHVIIGTLFLIICGIRQYLGHLTKEHHVGFEA AAWYWHFVDVVWLFLFVSIYWWGGI ; c ? 14 'polypeptide(L)' no no MSTKYIVSAILGSFGIAWVCDYYVSEKKIFGGSTPGTITNKEWGEETDKKFQAWPRTAGPPVVVNPITRQNFVVKSRSE MSTKYIVSAILGSFGIAWVCDYYVSEKKIFGGSTPGTITNKEWGEETDKKFQAWPRTAGPPVVVNPITRQNFVVKSRSE d ? 15 'polypeptide(L)' no no ;MLRRFLSHSNLRSLHTALSPSRPRFAAPLLTRHVTAQSGASSVRKRVEDVVPIATGHEREEIQASLEGRDILEINHPEGP FGTKEAPAIVKSYFDRRIVGCPGGEGEDEHDVVWFWLENGKPHECPVCSQYFELKVVGPGGDPYGHGDHH ; ;MLRRFLSHSNLRSLHTALSPSRPRFAAPLLTRHVTAQSGASSVRKRVEDVVPIATGHEREEIQASLEGRDILEINHPEGP FGTKEAPAIVKSYFDRRIVGCPGGEGEDEHDVVWFWLENGKPHECPVCSQYFELKVVGPGGDPYGHGDHH ; e ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MATSLVRSGFLRTALRGGARGSQVPKRNFSSAGHHDDAYETAKWEKITYLGIVSCTGLAIYNLSKGHPHTEEPPAYPYLH IRNKEFPWGPDGLFETKKHH ; ;MATSLVRSGFLRTALRGGARGSQVPKRNFSSAGHHDDAYETAKWEKITYLGIVSCTGLAIYNLSKGHPHTEEPPAYPYLH IRNKEFPWGPDGLFETKKHH ; f ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MAETAANKSQSLAEEYHVSDKQEKTAVVEKPVEVKEVENPQEAGSVEAVVEKIVEETTPVAPAVAQESSEVSPPPAEESA EESTEEQSSGNVEDNSGNEDAAEKTPEIKLETAPADFRFPTTNQTRHCFTRYIEYHRCVAAKGEGASECDKFAKYYRSLC PGEWIDRWNEQRENGTFPGPL ; ;MAETAANKSQSLAEEYHVSDKQEKTAVVEKPVEVKEVENPQEAGSVEAVVEKIVEETTPVAPAVAQESSEVSPPPAEESA EESTEEQSSGNVEDNSGNEDAAEKTPEIKLETAPADFRFPTTNQTRHCFTRYIEYHRCVAAKGEGASECDKFAKYYRSLC PGEWIDRWNEQRENGTFPGPL ; g ? 18 'polypeptide(L)' no no MAGPRIAHATLKGPSVVKEIIIGITLGLAAGSVWKMHHWNEQRKIRTFYDLLEKGEIGVVVDEQ MAGPRIAHATLKGPSVVKEIIIGITLGLAAGSVWKMHHWNEQRKIRTFYDLLEKGEIGVVVDEQ h ? 19 'polypeptide(L)' no no MSEPPFRPREKLIEKQKHFQSVHKHTYLKGPYDKITSVAIPLALAASSLYLIGRGIYNMSHGIGKKE MSEPPFRPREKLIEKQKHFQSVHKHTYLKGPYDKITSVAIPLALAASSLYLIGRGIYNMSHGIGKKE i ? 20 'polypeptide(L)' no no ;MAFNNALRSAAKLIASSESSISTSVSRGFHSTPMKRMGGGHGHDEPYYIHAKHMYNLDRMKHRGLKMSLAVFSAFSIGVA VPVYAVIFQQKKTASA ; ;MAFNNALRSAAKLIASSESSISTSVSRGFHSTPMKRMGGGHGHDEPYYIHAKHMYNLDRMKHRGLKMSLAVFSAFSIGVA VPVYAVIFQQKKTASA ; j ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 SER n 1 3 LEU n 1 4 ASN n 1 5 ARG n 1 6 LEU n 1 7 LEU n 1 8 SER n 1 9 ALA n 1 10 ALA n 1 11 ARG n 1 12 ARG n 1 13 SER n 1 14 ASP n 1 15 ARG n 1 16 ARG n 1 17 ALA n 1 18 SER n 1 19 ALA n 1 20 LEU n 1 21 SER n 1 22 SER n 1 23 PHE n 1 24 ARG n 1 25 SER n 1 26 LEU n 1 27 SER n 1 28 ALA n 1 29 SER n 1 30 PRO n 1 31 ALA n 1 32 LEU n 1 33 ALA n 1 34 PRO n 1 35 SER n 1 36 ALA n 1 37 ALA n 1 38 SER n 1 39 PRO n 1 40 PRO n 1 41 ALA n 1 42 PRO n 1 43 PRO n 1 44 PRO n 1 45 PRO n 1 46 THR n 1 47 ALA n 1 48 MET n 1 49 ILE n 1 50 TYR n 1 51 ASP n 1 52 ARG n 1 53 ALA n 1 54 ALA n 1 55 GLU n 1 56 ALA n 1 57 ILE n 1 58 LYS n 1 59 SER n 1 60 LYS n 1 61 LEU n 1 62 ARG n 1 63 GLN n 1 64 LEU n 1 65 GLU n 1 66 ASN n 1 67 PRO n 1 68 ASP n 1 69 PRO n 1 70 ARG n 1 71 PHE n 1 72 LEU n 1 73 LYS 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PRO n 17 121 THR n 17 122 THR n 17 123 ASN n 17 124 GLN n 17 125 THR n 17 126 ARG n 17 127 HIS n 17 128 CYS n 17 129 PHE n 17 130 THR n 17 131 ARG n 17 132 TYR n 17 133 ILE n 17 134 GLU n 17 135 TYR n 17 136 HIS n 17 137 ARG n 17 138 CYS n 17 139 VAL n 17 140 ALA n 17 141 ALA n 17 142 LYS n 17 143 GLY n 17 144 GLU n 17 145 GLY n 17 146 ALA n 17 147 SER n 17 148 GLU n 17 149 CYS n 17 150 ASP n 17 151 LYS n 17 152 PHE n 17 153 ALA n 17 154 LYS n 17 155 TYR n 17 156 TYR n 17 157 ARG n 17 158 SER n 17 159 LEU n 17 160 CYS n 17 161 PRO n 17 162 GLY n 17 163 GLU n 17 164 TRP n 17 165 ILE n 17 166 ASP n 17 167 ARG n 17 168 TRP n 17 169 ASN n 17 170 GLU n 17 171 GLN n 17 172 ARG n 17 173 GLU n 17 174 ASN n 17 175 GLY n 17 176 THR n 17 177 PHE n 17 178 PRO n 17 179 GLY n 17 180 PRO n 17 181 LEU n 18 1 MET n 18 2 ALA n 18 3 GLY n 18 4 PRO n 18 5 ARG n 18 6 ILE n 18 7 ALA n 18 8 HIS n 18 9 ALA n 18 10 THR n 18 11 LEU n 18 12 LYS n 18 13 GLY n 18 14 PRO n 18 15 SER n 18 16 VAL n 18 17 VAL n 18 18 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_entity_src_nat.pdbx_cell_line _entity_src_nat.pdbx_atcc _entity_src_nat.pdbx_cellular_location _entity_src_nat.pdbx_organ _entity_src_nat.pdbx_organelle _entity_src_nat.pdbx_cell _entity_src_nat.pdbx_plasmid_name _entity_src_nat.pdbx_plasmid_details _entity_src_nat.details 1 1 sample 1 527 'Mung bean' 'Vigna radiata var. radiata' 3916 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 1 506 'Mung bean' 'Vigna radiata var. radiata' 3916 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 1 393 ? 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'Vigna radiata' 157791 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 14 1 sample 1 79 'Mung bean' 'Vigna radiata var. radiata' 3916 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 15 1 sample 1 150 'Mung bean' 'Vigna radiata var. radiata' 3916 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 16 1 sample 1 100 'Mung bean' 'Vigna radiata var. radiata' 3916 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 17 1 sample 1 181 'Mung bean' 'Vigna radiata var. radiata' 3916 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 18 1 sample 1 64 'Mung bean' 'Vigna radiata var. radiata' 3916 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 19 1 sample 1 67 'Mung bean' 'Vigna radiata var. radiata' 3916 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 20 1 sample 1 96 'Mung bean' 'Vigna radiata var. radiata' 3916 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A1S3TWG4_VIGRR A0A1S3TWG4 ? 1 ;MSLNRLLSAARRSDRRASALSSFRSLSASPALAPSAASPPAPPPPTAMIYDRAAEAIKSKLRQLENPDPRFLKHGNPRPA LSDHTRILAAPETRVTTLPNGLRVATESSLAARTATVGVWIDAGSRFETEETNGTAHFLEHMIFKGTERRNARELEEEIE NMGGHLNAYTSREQTTYYAKVTDSDVPQALDILADILQNSRFEENRISRERDVILREMEEVEGQTEEVIFDHLHATAFQY TPLGRTILGPAQNIKTITKAHLQSYIQTHYTAPRMVIAASGAVKHEDIVEQVKKLFTKLSTDATTTAQLVAKEPAIFTGS EVRMLDDDIPLAQFAVAFEGASWKDPDSIALMVMQAMLGSWNKTAGGGKHMGSELAQRVGINEVAESIMAFNTNYKDTGL FGVYAVAKPDCLDDLSYAIMQETTKLVYRVSEDDVTRACNQLKSSLLLHIDGTSPVAEDIGRQLLTYGRRIPFAELFARI DAVDASTIKRVANRFIYDKDVAIAAMGPIQRLPDYNWFRRRTYWNRY ; 1 2 UNP A0A1S3VF71_VIGRR A0A1S3VF71 ? 2 ;MYRAAASSFRRHLKGHGSKLGSTRSSTSAAVAARTSKGGLFSWLTGERSSSLPSLDIPLGGVVLPDPLPDSVEQSKTKIT TLSNGLKIASETSPNPAASIGLYLDCGSIYETPFSSGASHLLERMAFKSTTNRSHFRIVREVEAIGGNIGASASREQMGY TFDALKTYVPQMVELLVDCVRNPAFLDWEVNEELRKVKAELGELSNNPQGLLLEAIHSAGYSGALAYPLLAPEAALNRLD GPSLEEFVAENYTAPRMVLAAAGVEHEELVSIAEPLLSDLPNVPRPDEPKSVYVGGDFRRHGESGGTHVALAFEVPGGWH KEKDAIVLTVLQMLMGGGGSFSAGGPGKGMHSRLYLRVLNEYQQIQSFSAFNSIFNNTGLFGIYASTSPDFAPKAVDIAA KELIAIASPGQVTQVQLDRAKKSTKSAVLMNLESRMIASEDIGRQILTYGERKPLEQFLKAVDEITLNDITKISQKIISS PLTMASYGDVLSVPSYESVNRKFHAK ; 1 3 PDB 7JRP 7JRP ? 3 ? 1 4 UNP A0A1S3W199_VIGRR A0A1S3W199 ? 4 ;MTGGVFQLLRRKLHPQFTNSSLLSPIIAKKDGAGSTGSRSLKVLALIGAGVSGFFSFSTVAVADEAEHGLACPSYPWPHK GILSSYDHASIRRGHQVYTEVCASCHSMSLISYRDLVGVAYTEEEVKAMAAEIEVVDGPNDEGEMFTRPGKLSDRFPQPY ANEAAARFANGGAYPPDLSLITKARHNGQNYVFSLLTGYRDPPAGVSIREGLHYNPYFPGGAIAMPKMLNDGAVEYEDGT PATEAQMGKDVVSFLSWAAEPEMEERKLMGFKWIFVLSLALLQAAYYRRLRWSVLKSRKLVLDVVN ; 1 5 UNP A0A1S3TB49_VIGRR A0A1S3TB49 ? 5 ;MLRVAAKRLSSLSSSAWRANHAASAVLSRNPVAPSLSTEEHRSDPFSLRPEFFLPIRGYATDSLFHPKENSLIPEIPATV AAVKNPSSKIIYDEHNHERFPPGDPSKRAFAYFVLTGGRFVYASLIRLLVLKFVLSMSASKDVLALASLEVDLSSIEPGT TVTVKWRGKPVFIRRRTEDDIKLANSVDVASLRDPQQDAERVKNPEWLIVIGVCTHLGCIPLPNAGDFGGWFCPCHGSHY DISGRIRKGPAPYNLEVPTYTFLEENKLMIG ; 1 6 UNP A0A1S3U9J1_VIGRR A0A1S3U9J1 ? 6 ;MASFLQSFLDPKKNWLAAQHMKSLVKRLSKYGLRYDDLYDPYYDLDVKEALNRLPKEVVDARHARLKRAIDLSMKHEYLP EDLQAMQTPFRGYLQDMLALVKRERAEREALGGLPLYQRSIP ; 1 7 UNP A0A1S3U9S5_VIGRR A0A1S3U9S5 ? 7 MGKQIVPVKSVIYALSPFQQKVMTGLWKDLPTKIHHKVSENWISATLLLGPLVGTYAYVQNYLEKEKLHHRY 1 8 UNP A0A1S3VHC0_VIGRR A0A1S3VHC0 ? 8 MADEEPVDQKRYLEESCKPKCVKPLLEYQACIKRIHGDDSGQKHCTGQYFDYWFCVDKCVAPKLFTKLK 1 9 UNP A0A1S3TQD2_VIGRR A0A1S3TQD2 ? 9 METVARRRGGGIFESLYKVVMRRNSVYVTFVIAGAFLGERAVDYGIHKLWEANNVGKRYEDIPVLGQKLSEE 1 10 PDB 7JRP 7JRP ? 10 ? 1 11 PDB 7JRP 7JRP ? 11 ? 1 12 UNP A0A1S3TZB2_VIGRR A0A1S3TZB2 ? 12 ;MCGGFPAISFCDAPEPWQLGFQDAATPIMQGIMDLHHDIFFFLVQIAVFVLWVLSRALWCFRSKISPIPQRIVHGTTIEI LWTIFPSIILMFIAIPSFTLLYSMDDVVVDPAITIKAIGHQWYWSYEYSDYNNSDEQSLAFDSYMVPEDDLELGQLRLLE VDNRVVVPAKTHLRVLITSADVLHSWAVPSLGVKCDAVPGRLNQISTFIQREGVYYGQCSEICGTNHAFMPIVVEAVSTK DYGSWVSNQIQ ; 133 13 PDB 7JRP 7JRP ? 13 ? 1 14 UNP A0A1S3TNX9_VIGRR A0A1S3TNX9 ? 14 MSTKYIVSAILGSFGIAWVCDYYVSEKKIFGGSTPGTITNKEWGEETDKKFQAWPRTAGPPVVVNPITRQNFVVKSRSE 46 15 UNP A0A1S3U1E4_VIGRR A0A1S3U1E4 ? 15 ;MLRRFLSHSNLRSLHTALSPSRPRFAAPLLTRHVTAQSGASSVRKRVEDVVPIATGHEREEIQASLEGRDILEINHPEGP FGTKEAPAIVKSYFDRRIVGCPGGEGEDEHDVVWFWLENGKPHECPVCSQYFELKVVGPGGDPYGHGDHH ; 1 16 UNP A0A1S3UMA0_VIGRR A0A1S3UMA0 ? 16 ;MATSLVRSGFLRTALRGGARGSQVPKRNFSSAGHHDDAYETAKWEKITYLGIVSCTGLAIYNLSKGHPHTEEPPAYPYLH IRNKEFPWGPDGLFETKKHH ; 1 17 UNP A0A1S3VV60_VIGRR A0A1S3VV60 ? 17 ;MAETAANKSQSLAEEYHVSDKQEKTAVVEKPVEVKEVENPQEAGSVEAVVEKIVEETTPVAPAVAQESSEVSPPPAEESA EESTEEQSSGNVEDNSGNEDAAEKTPEIKLETAPADFRFPTTNQTRHCFTRYIEYHRCVAAKGEGASECDKFAKYYRSLC PGEWIDRWNEQRENGTFPGPL ; 1 18 UNP A0A1S3V319_VIGRR A0A1S3V319 ? 18 MAGPRIAHATLKGPSVVKEIIIGITLGLAAGSVWKMHHWNEQRKIRTFYDLLEKGEIGVVVDEQ 1 19 UNP A0A1S3TUX2_VIGRR A0A1S3TUX2 ? 19 MSEPPFRPREKLIEKQKHFQSVHKHTYLKGPYDKITSVAIPLALAASSLYLIGRGIYNMSHGIGKKE 1 20 UNP A0A1S3V7C2_VIGRR A0A1S3V7C2 ? 20 ;MAFNNALRSAAKLIASSESSISTSVSRGFHSTPMKRMGGGHGHDEPYYIHAKHMYNLDRMKHRGLKMSLAVFSAFSIGVA VPVYAVIFQQKKTASA ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7JRP A 1 ? 527 ? 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CARDIOLIPIN ;DIPHOSPHATIDYL GLYCEROL; BIS-(1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHO)-1',3'-SN-GLYCEROL ; 'C81 H156 O17 P2 -2' 1464.043 CU non-polymer . 'COPPER (II) ION' ? 'Cu 2' 63.546 CUA non-polymer . 'DINUCLEAR COPPER ION' ? Cu2 127.092 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HEA non-polymer . HEME-A ? 'C49 H56 Fe N4 O6' 852.837 HEC non-polymer . 'HEME C' ? 'C34 H34 Fe N4 O4' 618.503 HEM non-polymer . 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE' HEME 'C34 H32 Fe N4 O4' 616.487 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PC1 non-polymer . 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE 3-SN-PHOSPHATIDYLCHOLINE 'C44 H88 N O8 P' 790.145 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7JRP _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 7JRP _struct.title 'Plant Mitochondrial complex SC III2+IV from Vigna radiata' _struct.pdbx_descriptor ;Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mitochondrial isoform X1, Alpha-MPP, COB, cytochrome c1-2, heme protein, mitochondrial, Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial (E.C.7.1.1.8), Cytochrome b-c1 complex subunit 7, cytochrome b-c1 complex subunit 8, Cytochrome b-c1 complex subunit 6, cytochrome b-c1 complex subunit 9, QCR10, COX1, Cytochrome c oxidase subunit 2, COX3, COX4, cytochrome c oxidase subunit 5b-2, mitochondrial, cytochrome c oxidase subunit 6a, mitochondrial, cytochrome c oxidase subunit 6b-1, Cytochrome c oxidase subunit 5C, COX7a, COX7c ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7JRP _struct_keywords.text 'mitochondria, respiration, bioenergetics, plants, OXIDOREDUCTASE' _struct_keywords.pdbx_keywords OXIDOREDUCTASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 1 ? L N N 2 ? M N N 3 ? N N N 4 ? O N N 5 ? P N N 6 ? Q N N 7 ? R N N 8 ? S N N 9 ? T N N 10 ? U N N 11 ? V N N 12 ? W N N 13 ? X N N 14 ? Y N N 15 ? Z N N 16 ? AA N N 17 ? BA N N 18 ? CA N N 19 ? DA N N 20 ? EA N N 21 ? FA N N 22 ? GA N N 23 ? HA N N 23 ? IA N N 24 ? JA N N 24 ? KA N N 25 ? LA N N 25 ? MA N N 25 ? NA N N 25 ? OA N N 25 ? PA N N 23 ? QA N N 26 ? RA N N 23 ? SA N N 25 ? TA N N 25 ? UA N N 21 ? VA N N 23 ? WA N N 22 ? XA N N 25 ? YA N N 23 ? ZA N N 24 ? AB N N 24 ? BB N N 25 ? CB N N 25 ? DB N N 25 ? EB N N 25 ? FB N N 26 ? GB N N 23 ? HB N N 22 ? IB N N 23 ? JB N N 27 ? KB N N 27 ? LB N N 28 ? MB N N 29 ? NB N N 22 ? OB N N 25 ? PB N N 25 ? QB N N 23 ? RB N N 25 ? SB N N 25 ? TB N N 25 ? UB N N 25 ? VB N N 30 ? WB N N 25 ? XB N N 25 ? YB N N 25 ? ZB N N 25 ? AC N N 25 ? BC N N 25 ? CC N N 25 ? DC N N 25 ? EC N N 25 ? FC N N 21 ? GC N N 25 ? HC N N 22 ? IC N N 31 ? 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GLU A 203 VAL A 221 1 ? 19 HELX_P HELX_P7 AA7 THR A 225 ? PHE A 238 ? THR A 225 PHE A 238 1 ? 14 HELX_P HELX_P8 AA8 THR A 241 ? ARG A 245 ? THR A 241 ARG A 245 5 ? 5 HELX_P HELX_P9 AA9 PRO A 250 ? LYS A 255 ? PRO A 250 LYS A 255 1 ? 6 HELX_P HELX_P10 AB1 THR A 258 ? TYR A 270 ? THR A 258 TYR A 270 1 ? 13 HELX_P HELX_P11 AB2 THR A 271 ? PRO A 273 ? THR A 271 PRO A 273 5 ? 3 HELX_P HELX_P12 AB3 LYS A 284 ? LYS A 294 ? LYS A 284 LYS A 294 1 ? 11 HELX_P HELX_P13 AB4 THR A 305 ? LYS A 312 ? THR A 305 LYS A 312 1 ? 8 HELX_P HELX_P14 AB5 ASP A 347 ? MET A 357 ? ASP A 347 MET A 357 1 ? 11 HELX_P HELX_P15 AB6 SER A 373 ? GLU A 383 ? SER A 373 GLU A 383 1 ? 11 HELX_P HELX_P16 AB7 LYS A 408 ? ASP A 410 ? LYS A 408 ASP A 410 5 ? 3 HELX_P HELX_P17 AB8 CYS A 411 ? ARG A 429 ? CYS A 411 ARG A 429 1 ? 19 HELX_P HELX_P18 AB9 SER A 431 ? ILE A 450 ? SER A 431 ILE A 450 1 ? 20 HELX_P HELX_P19 AC1 GLY A 452 ? TYR A 467 ? GLY A 452 TYR A 467 1 ? 16 HELX_P HELX_P20 AC2 PRO A 472 ? ALA A 482 ? 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SER B 352 ASN B 360 1 ? 9 HELX_P HELX_P35 AD8 PHE B 391 ? SER B 408 ? PHE B 391 SER B 408 1 ? 18 HELX_P HELX_P36 AD9 THR B 413 ? LEU B 432 ? THR B 413 LEU B 432 1 ? 20 HELX_P HELX_P37 AE1 SER B 434 ? GLY B 450 ? SER B 434 GLY B 450 1 ? 17 HELX_P HELX_P38 AE2 PRO B 454 ? ILE B 465 ? PRO B 454 ILE B 465 1 ? 12 HELX_P HELX_P39 AE3 THR B 466 ? ILE B 478 ? THR B 466 ILE B 478 1 ? 13 HELX_P HELX_P40 AE4 VAL B 490 ? VAL B 493 ? VAL B 490 VAL B 493 5 ? 4 HELX_P HELX_P41 AE5 SER B 495 ? LYS B 502 ? SER B 495 LYS B 502 1 ? 8 HELX_P HELX_P42 AE6 GLU C 13 ? ASP C 25 ? GLU C 13 ASP C 25 1 ? 13 HELX_P HELX_P43 AE7 TRP C 36 ? MET C 58 ? TRP C 36 MET C 58 1 ? 23 HELX_P HELX_P44 AE8 LEU C 66 ? ASP C 77 ? LEU C 66 ASP C 77 1 ? 12 HELX_P HELX_P45 AE9 GLY C 80 ? ALA C 110 ? GLY C 80 ALA C 110 1 ? 31 HELX_P HELX_P46 AF1 ARG C 116 ? VAL C 139 ? ARG C 116 VAL C 139 1 ? 24 HELX_P HELX_P47 AF2 GLY C 143 ? LEU C 156 ? GLY C 143 LEU C 156 1 ? 14 HELX_P HELX_P48 AF3 GLY C 164 ? GLY C 173 ? 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ALA j 80 LYS j 92 1 ? 13 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? H CYS 17 SG ? ? ? 1_555 H CYS 59 SG ? ? H CYS 17 H CYS 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf2 disulf ? ? H CYS 31 SG ? ? ? 1_555 H CYS 45 SG ? ? H CYS 31 H CYS 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? ? disulf3 disulf ? ? R CYS 17 SG ? ? ? 1_555 R CYS 59 SG ? ? T CYS 17 T CYS 59 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? ? disulf4 disulf ? ? R CYS 21 SG ? ? ? 1_555 R CYS 55 SG ? ? T CYS 21 T CYS 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf5 disulf ? ? R CYS 31 SG ? ? ? 1_555 R CYS 45 SG ? ? T CYS 31 T CYS 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf6 disulf ? ? AA CYS 128 SG ? ? ? 1_555 AA CYS 160 SG ? ? g CYS 128 g CYS 160 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? ? disulf7 disulf ? ? AA CYS 138 SG ? ? ? 1_555 AA CYS 149 SG ? ? g CYS 138 g CYS 149 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? covale1 covale none ? D CYS 102 SG ? ? ? 1_555 QA HEC . CAB ? ? D CYS 102 D HEC 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.646 ? ? covale2 covale none ? D CYS 105 SG ? ? ? 1_555 QA HEC . CAC ? ? D CYS 105 D HEC 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.803 ? ? covale3 covale none ? N CYS 102 SG ? ? ? 1_555 FB HEC . CAB ? ? P CYS 102 P HEC 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.677 ? ? covale4 covale none ? N CYS 105 SG ? ? ? 1_555 FB HEC . CAC ? ? P CYS 105 P HEC 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.772 ? ? metalc1 metalc ? ? A HIS 137 NE2 ? ? ? 1_555 EA ZN . ZN ? ? A HIS 137 A ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.937 ? ? metalc2 metalc ? ? A HIS 141 NE2 ? ? ? 1_555 EA ZN . ZN ? ? A HIS 141 A ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.948 ? ? metalc3 metalc ? ? A GLU 217 OE1 ? ? ? 1_555 EA ZN . ZN ? ? A GLU 217 A ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? ? metalc4 metalc ? ? A GLU 217 OE2 ? ? ? 1_555 EA ZN . ZN ? ? A GLU 217 A ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.179 ? ? metalc5 metalc ? ? C HIS 88 NE2 ? ? ? 1_555 IA HEM . FE ? ? C HIS 88 C HEM 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? ? metalc6 metalc ? ? C HIS 102 NE2 ? ? ? 1_555 JA HEM . FE ? ? C HIS 102 C HEM 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.015 ? ? metalc7 metalc ? ? C HIS 189 NE2 ? ? ? 1_555 IA HEM . FE ? ? C HIS 189 C HEM 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.976 ? ? metalc8 metalc ? ? C HIS 203 NE2 ? ? ? 1_555 JA HEM . FE ? ? C HIS 203 C HEM 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? ? metalc9 metalc ? ? D HIS 106 NE2 ? ? ? 1_555 QA HEC . FE ? ? D HIS 106 D HEC 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.924 ? ? metalc10 metalc ? ? D MET 225 SD ? ? ? 1_555 QA HEC . FE ? ? D MET 225 D HEC 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? ? metalc11 metalc ? ? K HIS 137 NE2 ? ? ? 1_555 UA ZN . ZN ? ? M HIS 137 M ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.950 ? ? metalc12 metalc ? ? K HIS 141 NE2 ? ? ? 1_555 UA ZN . ZN ? ? M HIS 141 M ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.993 ? ? metalc13 metalc ? ? K GLU 217 OE1 ? ? ? 1_555 UA ZN . ZN ? ? M GLU 217 M ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? ? metalc14 metalc ? ? K GLU 217 OE2 ? ? ? 1_555 UA ZN . ZN ? ? M GLU 217 M ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.199 ? ? metalc15 metalc ? ? M HIS 88 NE2 ? ? ? 1_555 ZA HEM . FE ? ? O HIS 88 O HEM 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? ? metalc16 metalc ? ? M HIS 102 NE2 ? ? ? 1_555 AB HEM . FE ? ? O HIS 102 O HEM 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? ? metalc17 metalc ? ? M HIS 189 NE2 ? ? ? 1_555 ZA HEM . FE ? ? O HIS 189 O HEM 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.016 ? ? metalc18 metalc ? ? M HIS 203 NE2 ? ? ? 1_555 AB HEM . FE ? ? O HIS 203 O HEM 404 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? ? metalc19 metalc ? ? N HIS 106 NE2 ? ? ? 1_555 FB HEC . FE ? ? P HIS 106 P HEC 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.884 ? ? metalc20 metalc ? ? N MET 225 SD ? ? ? 1_555 FB HEC . FE ? ? P MET 225 P HEC 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? ? metalc21 metalc ? ? U HIS 64 NE2 ? ? ? 1_555 KB HEA . FE ? ? a HIS 64 a HEA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? ? metalc22 metalc ? ? U HIS 243 ND1 ? ? ? 1_555 LB CU . CU ? ? a HIS 243 a CU 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.830 ? ? metalc23 metalc ? ? U HIS 292 NE2 ? ? ? 1_555 LB CU . CU ? ? a HIS 292 a CU 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.987 ? ? metalc24 metalc ? ? U HIS 293 NE2 ? ? ? 1_555 LB CU . CU ? ? a HIS 293 a CU 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.811 ? ? metalc25 metalc ? ? U ASP 371 OD2 ? ? ? 1_555 MB MG . MG ? ? a ASP 371 a MG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.300 ? ? metalc26 metalc ? ? U HIS 378 NE2 ? ? ? 1_555 JB HEA . FE ? ? a HIS 378 a HEA 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? ? metalc27 metalc ? ? U HIS 380 NE2 ? ? ? 1_555 KB HEA . FE ? ? a HIS 380 a HEA 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.116 ? ? metalc28 metalc ? ? MB MG . MG ? ? ? 1_555 V GLU 221 OE2 ? ? a MG 604 b GLU 221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? ? metalc29 metalc ? ? V HIS 184 ND1 ? ? ? 1_555 VB CUA . CU2 ? ? b HIS 184 b CUA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.215 ? ? metalc30 metalc ? ? V CYS 219 SG ? ? ? 1_555 VB CUA . CU1 ? ? b CYS 219 b CUA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? ? metalc31 metalc ? ? V CYS 219 SG ? ? ? 1_555 VB CUA . CU2 ? ? b CYS 219 b CUA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.512 ? ? metalc32 metalc ? ? V GLU 221 O ? ? ? 1_555 VB CUA . CU1 ? ? b GLU 221 b CUA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.341 ? ? metalc33 metalc ? ? V CYS 223 SG ? ? ? 1_555 VB CUA . CU1 ? ? b CYS 223 b CUA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? ? metalc34 metalc ? ? V CYS 223 SG ? ? ? 1_555 VB CUA . CU2 ? ? b CYS 223 b CUA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.467 ? ? metalc35 metalc ? ? V HIS 227 ND1 ? ? ? 1_555 VB CUA . CU1 ? ? b HIS 227 b CUA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.142 ? ? metalc36 metalc ? ? V MET 230 SD ? ? ? 1_555 VB CUA . CU2 ? ? b MET 230 b CUA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.627 ? ? metalc37 metalc ? ? Y CYS 101 SG ? ? ? 1_555 FC ZN . ZN ? ? e CYS 101 e ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? ? metalc38 metalc ? ? Y HIS 110 NE2 ? ? ? 1_555 FC ZN . ZN ? ? e HIS 110 e ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.805 ? ? metalc39 metalc ? ? Y CYS 125 SG ? ? ? 1_555 FC ZN . ZN ? ? e CYS 125 e ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.288 ? ? metalc40 metalc ? ? Y CYS 128 SG ? ? ? 1_555 FC ZN . ZN ? ? e CYS 128 e ZN 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.290 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 114 C . ? SER 114 C PRO 115 C ? PRO 115 C 1 3.57 2 TYR 228 C . ? TYR 228 C PRO 229 C ? PRO 229 C 1 -1.14 3 ALA 352 C . ? ALA 352 C PRO 353 C ? PRO 353 C 1 -1.54 4 ILE 121 F . ? ILE 121 F PRO 122 F ? PRO 122 F 1 -5.07 5 SER 114 M . ? SER 114 O PRO 115 M ? PRO 115 O 1 1.88 6 TYR 228 M . ? TYR 228 O PRO 229 M ? PRO 229 O 1 -1.31 7 ALA 352 M . ? ALA 352 O PRO 353 M ? PRO 353 O 1 3.22 8 TRP 119 W . ? TRP 119 c PRO 120 W ? PRO 120 c 1 0.11 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 8 ? AA4 ? 6 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 6 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 6 ? AB2 ? 6 ? AB3 ? 8 ? AB4 ? 6 ? AB5 ? 6 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 5 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA3 5 6 ? parallel AA3 6 7 ? anti-parallel AA3 7 8 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA6 5 6 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB1 5 6 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB2 5 6 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB3 5 6 ? parallel AB3 6 7 ? anti-parallel AB3 7 8 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB4 5 6 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB5 5 6 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 THR A 93 ? 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RELION ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 6 _em_specimen.details 'This sample was monodisperse on size exclusion chromatography but was a mixture of different mitochondrial respiratory complexes' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 21 'ZINC ION' ZN 22 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE PC1 23 CARDIOLIPIN CDL 24 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE' HEM 25 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOETHANOLAMINE 3PE 26 'HEME C' HEC 27 HEME-A HEA 28 'COPPER (II) ION' CU 29 'MAGNESIUM ION' MG 30 'DINUCLEAR COPPER ION' CUA 31 LYSINE LYS # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 'gel filtration' ? 2 1 'native gel electrophoresis' ? #