data_7LY9 # _entry.id 7LY9 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.352 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 7LY9 pdb_00007ly9 10.2210/pdb7ly9/pdb WWPDB D_1000254909 ? ? EMDB EMD-23589 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Cryo-EM structure of 2909 Fab in complex with 3BNC117 Fab and CAP256.wk34.c80 SOSIP.RnS2 N160K HIV-1 Env trimer' _pdbx_database_related.db_id EMD-23589 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7LY9 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-03-06 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Gorman, J.' 1 0000-0002-3775-6560 'Kwong, P.D.' 2 0000-0003-3560-232X # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Commun' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2041-1723 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 12 _citation.language ? _citation.page_first 6470 _citation.page_last 6470 _citation.title ;Extended antibody-framework-to-antigen distance observed exclusively with broad HIV-1-neutralizing antibodies recognizing glycan-dense surfaces. ; _citation.year 2021 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41467-021-26579-z _citation.pdbx_database_id_PubMed 34753907 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Lee, M.' 1 0000-0002-4972-3811 primary 'Changela, A.' 2 ? primary 'Gorman, J.' 3 0000-0002-3775-6560 primary 'Rawi, R.' 4 0000-0002-0445-2325 primary 'Bylund, T.' 5 ? primary 'Chao, C.W.' 6 ? primary 'Lin, B.C.' 7 ? primary 'Louder, M.K.' 8 0000-0001-7540-9263 primary 'Olia, A.S.' 9 ? primary 'Zhang, B.' 10 ? primary 'Doria-Rose, N.A.' 11 ? primary 'Zolla-Pazner, S.' 12 0000-0002-0750-2666 primary 'Shapiro, L.' 13 0000-0001-9943-8819 primary 'Chuang, G.Y.' 14 ? primary 'Kwong, P.D.' 15 0000-0003-3560-232X # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7LY9 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 7LY9 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man '2909 Light Chain' 22582.885 1 ? ? ? ? 2 polymer man '2909 Heavy Chain' 25067.795 1 ? ? ? ? 3 polymer man 'Envelope glycoprotein gp120' 53337.512 3 ? ? 'UNP residues 29-486' ? 4 polymer man '3BNC117 Heavy Chain' 24656.484 3 ? ? ? ? 5 polymer man '3BNC117 Light Chain' 23022.658 3 ? ? ? ? 6 polymer man 'Envelope glycoprotein gp41' 17355.703 3 ? ? 'UNP residues 498-651' ? 7 branched man '2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 424.401 7 ? ? ? ? 8 branched man ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]alpha-D-mannopyranose-(1-6)-[alpha-D-mannopyranose-(1-3)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 1235.105 3 ? ? ? ? 9 branched man ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 748.682 1 ? ? ? ? 10 branched man 'beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 586.542 1 ? ? ? ? 11 non-polymer syn 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 54 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;SYVLTQPPSVSVAPGKTARITCGGNNIANKNVHWYQQKPGQAPVLVIYYDDDRPSGIPDRFSGSNSGNTATLTISRVEAG DEADYYCQVWDSNSDHVVFGGGTQLTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAG VETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPT ; ;SYVLTQPPSVSVAPGKTARITCGGNNIANKNVHWYQQKPGQAPVLVIYYDDDRPSGIPDRFSGSNSGNTATLTISRVEAG DEADYYCQVWDSNSDHVVFGGGTQLTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVKAG VETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPT ; L ? 2 'polypeptide(L)' no yes ;EVQLVESGGNVVQPGGSLRLSCTASGFSFDDSTMHWVRQAPGKGLQWVSLISWNGGRTYYADSVKGRFTISRDNSKNSLY LQMNSLKTEDTAFYFCAKDKGDSD(TYS)D(TYS)NLGYSYFYYMDGWGKGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGT AALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPK ; ;EVQLVESGGNVVQPGGSLRLSCTASGFSFDDSTMHWVRQAPGKGLQWVSLISWNGGRTYYADSVKGRFTISRDNSKNSLY LQMNSLKTEDTAFYFCAKDKGDSDYDYNLGYSYFYYMDGWGKGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVK DYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPK ; H ? 3 'polypeptide(L)' no no ;GLWVTVYYGVPVWREAKTTLFCASDAKSYEKEVHNVWATHACVPTDPNPQELVLENVTENFNMWKNDMVDQMHEDIISLW DQSLKPCVKLTPLCVTLNCSDAKVNATYKGTREEIKNCSFKATTELRDKKRREYALFYRLDIVPLSGEGNNNSEYRLINC NTSVITQICPKVTFDPIPIHYCAPAGYAILKCNNKTFNGTGPCNNVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEIIIRSEN LTDNVKTIIVHLNESVEITCTRPNNMTRKSVRIGPGQTFYALGDIIGDIRQPHCNISEIKWEKTLQRVSEKLREHFNKTI IFNQSSGGDLEITTHSFNCGGEFFYCNTSDLFFNKTFNETYSTGSNSTNSTITLPCRIKQIINMWQEVGRAMYAPPIAGN ITCKSNITGLLLTRDGGGNNSTKETFRPGGGNMRDNWRSELYKYKVVEVKPLGIAPTECNRTVVQRRRRRR ; ;GLWVTVYYGVPVWREAKTTLFCASDAKSYEKEVHNVWATHACVPTDPNPQELVLENVTENFNMWKNDMVDQMHEDIISLW DQSLKPCVKLTPLCVTLNCSDAKVNATYKGTREEIKNCSFKATTELRDKKRREYALFYRLDIVPLSGEGNNNSEYRLINC NTSVITQICPKVTFDPIPIHYCAPAGYAILKCNNKTFNGTGPCNNVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEIIIRSEN LTDNVKTIIVHLNESVEITCTRPNNMTRKSVRIGPGQTFYALGDIIGDIRQPHCNISEIKWEKTLQRVSEKLREHFNKTI IFNQSSGGDLEITTHSFNCGGEFFYCNTSDLFFNKTFNETYSTGSNSTNSTITLPCRIKQIINMWQEVGRAMYAPPIAGN ITCKSNITGLLLTRDGGGNNSTKETFRPGGGNMRDNWRSELYKYKVVEVKPLGIAPTECNRTVVQRRRRRR ; G,D,K ? 4 'polypeptide(L)' no no ;QVQLLQSGAAVTKPGASVRVSCEASGYNIRDYFIHWWRQAPGQGLQWVGWINPKTGQPNNPRQFQGRVSLTRHASWDFDT YSFYMDLKALRSDDTAVYFCARQRSDYWDFDVWGSGTQVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPV TVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSC ; ;QVQLLQSGAAVTKPGASVRVSCEASGYNIRDYFIHWWRQAPGQGLQWVGWINPKTGQPNNPRQFQGRVSLTRHASWDFDT YSFYMDLKALRSDDTAVYFCARQRSDYWDFDVWGSGTQVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPV TVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSC ; B,E,A ? 5 'polypeptide(L)' no no ;DIQMTQSPSSLSASVGDTVTITCQANGYLNWYQQRRGKAPKLLIYDGSKLERGVPSRFSGRRWGQEYNLTINNLQPEDIA TYFCQVYEFVVPGTRLDLKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDS KDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; ;DIQMTQSPSSLSASVGDTVTITCQANGYLNWYQQRRGKAPKLLIYDGSKLERGVPSRFSGRRWGQEYNLTINNLQPEDIA TYFCQVYEFVVPGTRLDLKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDS KDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; C,I,M ? 6 'polypeptide(L)' no no ;AVVGLGAVFLGFLGAAGSTMGAASNTLTVQARQLLSGIVQQQSNLLRAPEAQQHMLQLGVWGFKQLQARVLAIERYLEVQ QLLGMWGCSGKLICCTNVPWNSSWSNKTYNEIWDNMTWMQWDREIGNYTDTIYKLLEVSQFQQEINEKDNLTLD ; ;AVVGLGAVFLGFLGAAGSTMGAASNTLTVQARQLLSGIVQQQSNLLRAPEAQQHMLQLGVWGFKQLQARVLAIERYLEVQ QLLGMWGCSGKLICCTNVPWNSSWSNKTYNEIWDNMTWMQWDREIGNYTDTIYKLLEVSQFQQEINEKDNLTLD ; F,J,N ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 SER n 1 2 TYR n 1 3 VAL n 1 4 LEU n 1 5 THR n 1 6 GLN n 1 7 PRO n 1 8 PRO n 1 9 SER n 1 10 VAL n 1 11 SER n 1 12 VAL n 1 13 ALA n 1 14 PRO n 1 15 GLY n 1 16 LYS n 1 17 THR n 1 18 ALA n 1 19 ARG n 1 20 ILE n 1 21 THR n 1 22 CYS n 1 23 GLY n 1 24 GLY n 1 25 ASN n 1 26 ASN n 1 27 ILE n 1 28 ALA n 1 29 ASN n 1 30 LYS n 1 31 ASN n 1 32 VAL n 1 33 HIS n 1 34 TRP n 1 35 TYR n 1 36 GLN n 1 37 GLN n 1 38 LYS 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PRO n 1 211 THR n 2 1 GLU n 2 2 VAL n 2 3 GLN n 2 4 LEU n 2 5 VAL n 2 6 GLU n 2 7 SER n 2 8 GLY n 2 9 GLY n 2 10 ASN n 2 11 VAL n 2 12 VAL n 2 13 GLN n 2 14 PRO n 2 15 GLY n 2 16 GLY n 2 17 SER n 2 18 LEU n 2 19 ARG n 2 20 LEU n 2 21 SER n 2 22 CYS n 2 23 THR n 2 24 ALA n 2 25 SER n 2 26 GLY n 2 27 PHE n 2 28 SER n 2 29 PHE n 2 30 ASP n 2 31 ASP n 2 32 SER n 2 33 THR n 2 34 MET n 2 35 HIS n 2 36 TRP n 2 37 VAL n 2 38 ARG n 2 39 GLN n 2 40 ALA n 2 41 PRO n 2 42 GLY n 2 43 LYS n 2 44 GLY n 2 45 LEU n 2 46 GLN n 2 47 TRP n 2 48 VAL n 2 49 SER n 2 50 LEU n 2 51 ILE n 2 52 SER n 2 53 TRP n 2 54 ASN n 2 55 GLY n 2 56 GLY n 2 57 ARG n 2 58 THR n 2 59 TYR n 2 60 TYR n 2 61 ALA n 2 62 ASP n 2 63 SER n 2 64 VAL n 2 65 LYS n 2 66 GLY n 2 67 ARG n 2 68 PHE n 2 69 THR n 2 70 ILE n 2 71 SER n 2 72 ARG n 2 73 ASP n 2 74 ASN n 2 75 SER n 2 76 LYS n 2 77 ASN n 2 78 SER n 2 79 LEU n 2 80 TYR n 2 81 LEU n 2 82 GLN n 2 83 MET n 2 84 ASN n 2 85 SER n 2 86 LEU n 2 87 LYS n 2 88 THR n 2 89 GLU n 2 90 ASP n 2 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C CYS 346 SG ? ? ? 1_555 C CYS 376 SG ? ? G CYS 385 G CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf11 disulf ? ? C CYS 459 SG ? ? ? 1_555 F CYS 95 SG ? ? G CYS 501 F CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf12 disulf ? ? D CYS 22 SG ? ? ? 1_555 D CYS 100 SG ? ? B CYS 22 B CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf13 disulf ? ? E CYS 23 SG ? ? ? 1_555 E CYS 84 SG ? ? C CYS 23 C CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf14 disulf ? ? F CYS 88 SG ? ? ? 1_555 F CYS 94 SG ? ? F CYS 598 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf15 disulf ? ? G CYS 22 SG ? ? ? 1_555 G CYS 42 SG ? ? D CYS 54 D CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf16 disulf ? ? G CYS 87 SG ? ? ? 1_555 G CYS 169 SG ? ? D CYS 119 D CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf17 disulf ? ? G CYS 94 SG ? ? ? 1_555 G CYS 160 SG ? ? D CYS 126 D CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf18 disulf ? ? G CYS 99 SG ? ? ? 1_555 G CYS 118 SG ? ? D CYS 131 D CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf19 disulf ? ? G CYS 182 SG ? ? ? 1_555 G CYS 211 SG ? ? D CYS 218 D CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf20 disulf ? ? G CYS 192 SG ? ? ? 1_555 G CYS 203 SG ? ? D CYS 228 D CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf21 disulf ? ? G CYS 260 SG ? ? ? 1_555 G CYS 294 SG ? ? D CYS 296 D CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf22 disulf ? ? G CYS 339 SG ? ? ? 1_555 G CYS 403 SG ? ? D CYS 378 D CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf23 disulf ? ? G CYS 346 SG ? ? ? 1_555 G CYS 376 SG ? ? D CYS 385 D CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf24 disulf ? ? G CYS 459 SG ? ? ? 1_555 J CYS 95 SG ? ? D CYS 501 J CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf25 disulf ? ? H CYS 22 SG ? ? ? 1_555 H CYS 100 SG ? ? E CYS 22 E CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf26 disulf ? ? I CYS 23 SG ? ? ? 1_555 I CYS 84 SG ? ? I CYS 23 I CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf27 disulf ? ? J CYS 88 SG ? ? ? 1_555 J CYS 94 SG ? ? J CYS 598 J CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf28 disulf ? ? 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K CYS 385 K CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf37 disulf ? ? K CYS 459 SG ? ? ? 1_555 N CYS 95 SG ? ? K CYS 501 N CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf38 disulf ? ? L CYS 22 SG ? ? ? 1_555 L CYS 100 SG ? ? A CYS 22 A CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf39 disulf ? ? M CYS 23 SG ? ? ? 1_555 M CYS 84 SG ? ? M CYS 23 M CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf40 disulf ? ? N CYS 88 SG ? ? ? 1_555 N CYS 94 SG ? ? N CYS 598 N CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? covale1 covale both ? B ASP 104 C ? ? ? 1_555 B TYS 105 N ? A H ASP 100 H TYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.336 ? ? covale2 covale both ? B TYS 105 C ? A ? 1_555 B ASP 106 N ? B H TYS 100 H ASP 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? ? covale3 covale both ? B ASP 106 C ? B ? 1_555 B TYS 107 N ? C H ASP 100 H TYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.355 ? ? covale4 covale both ? B TYS 107 C ? C ? 1_555 B ASN 108 N ? D H TYS 100 H ASN 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.351 ? ? covale5 covale one ? C ASN 56 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? 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C ASN 240 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? G ASN 276 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? C ASN 253 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? G ASN 289 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? C ASN 265 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? G ASN 301 G NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? C ASN 295 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? G ASN 332 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? C ASN 317 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? G ASN 356 G NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? C ASN 323 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? G ASN 362 G NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? C ASN 347 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? G ASN 386 G NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? C ASN 354 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? G ASN 393 G NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? C ASN 400 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? G ASN 442 G NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? C ASN 406 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? G ASN 448 G NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? C ASN 460 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? G ASN 502 G NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? E ASN 68 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? C ASN 72 C NAG 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? F ASN 101 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? F ASN 611 F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? F ASN 127 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? F ASN 637 F NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? G ASN 56 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? D ASN 88 D NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? G ASN 98 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? D ASN 130 D NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? G ASN 117 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? D ASN 156 D NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? G ASN 161 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? D ASN 197 D NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? G ASN 194 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? D ASN 230 D NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? G ASN 198 ND2 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? D ASN 234 D NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? G ASN 205 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? D ASN 241 D NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? G ASN 226 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? D ASN 262 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.502 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? G ASN 240 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? D ASN 276 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? 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# loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 7 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 8 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 8 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 4 8 4 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 5 8 5 MAN C1 O1 4 MAN O3 HO3 sing ? 6 8 6 MAN C1 O1 4 MAN O6 HO6 sing ? 7 8 7 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 8 9 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 9 9 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 10 9 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 11 10 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 12 10 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 7 NAG 1 n 7 NAG 2 n 8 NAG 1 n 8 NAG 2 n 8 BMA 3 n 8 MAN 4 n 8 MAN 5 n 8 MAN 6 n 8 MAN 7 n 9 NAG 1 n 9 NAG 2 n 9 BMA 3 n 9 MAN 4 n 10 NAG 1 n 10 NAG 2 n 10 BMA 3 n # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 11 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? 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