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_citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Poll, G.' 1 ? primary 'Pilsl, M.' 2 ? primary 'Griesenbeck, J.' 3 0000-0002-7817-6095 primary 'Tschochner, H.' 4 ? primary 'Milkereit, P.' 5 0000-0001-8850-9140 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat '25S rRNA' 1097493.875 1 ? ? ? ? 2 polymer nat '5.8S rRNA' 50682.922 1 ? ? ? ? 3 polymer nat ITS2 74308.391 1 ? ? ? ? 4 polymer nat '60S ribosomal protein L3' 43850.793 1 ? ? ? ? 5 polymer nat '60S ribosomal protein L4-A' 39159.125 1 ? ? ? ? 6 polymer nat 'ATP-dependent RNA helicase HAS1' 56798.348 1 3.6.4.13 ? ? ? 7 polymer nat '60S ribosomal protein L6-A' 20000.564 1 ? ? ? ? 8 polymer nat '60S ribosomal protein L7-A' 27686.281 1 ? ? ? ? 9 polymer nat '60S ribosomal protein L8-A' 28175.820 1 ? ? ? ? 10 polymer nat '60S 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;CCUUCUCAAACAUUCUGUUUGGUAGUGAGUGAUACUCUUUGGAGUUAACUUGAAAUUGCUGGCCUUUUCAUUGGAUGUUU UUUUUCCAAAGAGAGGUUUCUCUGCGUGCUUGAGGUAUAAUGCAAGUACGGUCGUUUUAGGUUUUACCAACUGCGGCUAA UCUUUUUUUAUACUGAGCGUAUUGGAACGUUAUCGAUAAGAAGAGAGCGUCUAGGCGAACAAUGUUCUUAAA ; ;CCUUCUCAAACAUUCUGUUUGGUAGUGAGUGAUACUCUUUGGAGUUAACUUGAAAUUGCUGGCCUUUUCAUUGGAUGUUU UUUUUCCAAAGAGAGGUUUCUCUGCGUGCUUGAGGUAUAAUGCAAGUACGGUCGUUUUAGGUUUUACCAACUGCGGCUAA UCUUUUUUUAUACUGAGCGUAUUGGAACGUUAUCGAUAAGAAGAGAGCGUCUAGGCGAACAAUGUUCUUAAA ; 6 ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSHRKYEAPRHGHLGFLPRKRAASIRARVKAFPKDDRSKPVALTSFLGYKAGMTTIVRDLDRPGSKFHKREVVEAVTVVD TPPVVVVGVVGYVETPRGLRSLTTVWAEHLSDEVKRRFYKNWYKSKKKAFTKYSAKYAQDGAGIERELARIKKYASVVRV LVHTQIRKTPLAQKKAHLAEIQLNGGSISEKVDWAREHFEKTVAVDSVFEQNEMIDAIAVTKGHGFEGVTHRWGTKKLPR KTHRGLRKVACIGAWHPAHVMWSVARAGQRGYHSRTSINHKIYRVGKGDDEANGATSFDRTKKTITPMGGFVHYGEIKND FIMVKGCIPGNRKRIVTLRKSLYTNTSRKALEEVSLKWIDTASKFGKGRFQTPAEKHAFMGTLKKDL ; ;MSHRKYEAPRHGHLGFLPRKRAASIRARVKAFPKDDRSKPVALTSFLGYKAGMTTIVRDLDRPGSKFHKREVVEAVTVVD 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GAHLGRFVIWTEAAFTKLDQVWGSETVASSKVGYTLPSHIISTSDVTRIINSSEIQSAIRPAGQATQKRTHVLKKNPLKN KQVLLRLNPYAKVFAAEKLGSKKAEKTGTKPAAVFTETLKHD ; C ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MATPSNKRSRDSESTEEPVVDEKSTSKQNNAAPEGEQTTCVEKFEELKLSQPTLKAIEKMGFTTMTSVQARTIPPLLAGR DVLGAAKTGSGKTLAFLIPAIELLHSLKFKPRNGTGIIVITPTRELALQIFGVARELMEFHSQTFGIVIGGANRRQEAEK LMKGVNMLIATPGRLLDHLQNTKGFVFKNLKALIIDEADRILEIGFEDEMRQIIKILPNEDRQSMLFSATQTTKVEDLAR ISLRPGPLFINVVPETDNSTADGLEQGYVVCDSDKRFLLLFSFLKRNQKKKIIVFLSSCNSVKYYAELLNYIDLPVLELH GKQKQQKRTNTFFEFCNAERGILICTDVAARGLDIPAVDWIIQFDPPDDPRDYIHRVGRTARGTKGKGKSLMFLTPNELG FLRYLKASKVPLNEYEFPENKIANVQSQLEKLIKSNYYLHQTAKDGYRSYLQAYASHSLKTVYQIDKLDLAKVAKSYGFP VPPKVNITIGASGKTPNTKRRKTHK ; ;MATPSNKRSRDSESTEEPVVDEKSTSKQNNAAPEGEQTTCVEKFEELKLSQPTLKAIEKMGFTTMTSVQARTIPPLLAGR DVLGAAKTGSGKTLAFLIPAIELLHSLKFKPRNGTGIIVITPTRELALQIFGVARELMEFHSQTFGIVIGGANRRQEAEK LMKGVNMLIATPGRLLDHLQNTKGFVFKNLKALIIDEADRILEIGFEDEMRQIIKILPNEDRQSMLFSATQTTKVEDLAR ISLRPGPLFINVVPETDNSTADGLEQGYVVCDSDKRFLLLFSFLKRNQKKKIIVFLSSCNSVKYYAELLNYIDLPVLELH 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12 'polypeptide(L)' no no ;MAISKNLPILKNHFRKHWQERVKVHFDQAGKKVSRRNARATRAAKIAPRPLDLLRPVVRAPTVKYNRKVRAGRGFTLAEV KAAGLTAAYARTIGIAVDHRRQNRNQEIFDANVQRLKEYQSKIIVFPRNGKAPEAEQVLSAAATFPIAQPATDVEARAVQ DNGESAFRTLRLARSEKKFRGIREKRAREKAEAEAEKKK ; ;MAISKNLPILKNHFRKHWQERVKVHFDQAGKKVSRRNARATRAAKIAPRPLDLLRPVVRAPTVKYNRKVRAGRGFTLAEV KAAGLTAAYARTIGIAVDHRRQNRNQEIFDANVQRLKEYQSKIIVFPRNGKAPEAEQVLSAAATFPIAQPATDVEARAVQ DNGESAFRTLRLARSEKKFRGIREKRAREKAEAEAEKKK ; L ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MSTDSIVKASNWRLVEVGRVVLIKKGQSAGKLAAIVEIIDQKKVLIDGPKAGVPRQAINLGQVVLTPLTFALPRGARTAT VSKKWAAAAVCEKWAASSWAKKIAQRERRAALTDFERFQVMVLRKQKRYTVKKALAKA ; ;MSTDSIVKASNWRLVEVGRVVLIKKGQSAGKLAAIVEIIDQKKVLIDGPKAGVPRQAINLGQVVLTPLTFALPRGARTAT VSKKWAAAAVCEKWAASSWAKKIAQRERRAALTDFERFQVMVLRKQKRYTVKKALAKA ; M ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MGAYKYLEELQRKKQSDVLRFLQRVRVWEYRQKNVIHRAARPTRPDKARRLGYKAKQGFVIYRVRVRRGNRKRPVPKGAT YGKPTNQGVNELKYQRSLRATAEERVGRRAANLRVLNSYWVNQDSTYKYFEVILVDPQHKAIRRDARYNWICDPVHKHRE ARGLTATGKKSRGINKGHKFNNTKAGRRKTWKRQNTLSLWRYRK ; 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'ATCC 204508 / S288c' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 33 1 sample 1 231 ;Baker's yeast ; 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? 'ATCC 204508 / S288c' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 34 1 sample 1 245 ;Baker's yeast ; 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? 'ATCC 204508 / S288c' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 7OHP 7OHP ? 1 ? 1 2 GB KT175188.1 940534893 ? 2 ;AAACUUUCAACAACGGAUCUCUUGGUUCUCGCAUCGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUGAAUUGCAGAA UUCCGUGAAUCAUCGAAUCUUUGAACGCACAUUGCGCCCCUUGGUAUUCCAGGGGGCAUGCCUGUUUGAGCGUCAUUU ; 392 3 PDB 7OHP 7OHP ? 3 ? 1 4 UNP RL3_YEAST P14126 ? 4 ;MSHRKYEAPRHGHLGFLPRKRAASIRARVKAFPKDDRSKPVALTSFLGYKAGMTTIVRDLDRPGSKFHKREVVEAVTVVD TPPVVVVGVVGYVETPRGLRSLTTVWAEHLSDEVKRRFYKNWYKSKKKAFTKYSAKYAQDGAGIERELARIKKYASVVRV LVHTQIRKTPLAQKKAHLAEIQLNGGSISEKVDWAREHFEKTVAVDSVFEQNEMIDAIAVTKGHGFEGVTHRWGTKKLPR KTHRGLRKVACIGAWHPAHVMWSVARAGQRGYHSRTSINHKIYRVGKGDDEANGATSFDRTKKTITPMGGFVHYGEIKND FIMVKGCIPGNRKRIVTLRKSLYTNTSRKALEEVSLKWIDTASKFGKGRFQTPAEKHAFMGTLKKDL ; 1 5 UNP RL4A_YEAST P10664 ? 5 ;MSRPQVTVHSLTGEATANALPLPAVFSAPIRPDIVHTVFTSVNKNKRQAYAVSEKAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVGGG GTGRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRKWNVKVNHNEKRYATASAIAATAVASLVLARGHRVEKIPEIPLVVSTDLESIQ KTKEAVAALKAVGAHSDLLKVLKSKKLRAGKGKYRNRRWTQRRGPLVVYAEDNGIVKALRNVPGVETANVASLNLLQLAP GAHLGRFVIWTEAAFTKLDQVWGSETVASSKVGYTLPSHIISTSDVTRIINSSEIQSAIRPAGQATQKRTHVLKKNPLKN KQVLLRLNPYAKVFAAEKLGSKKAEKTGTKPAAVFTETLKHD ; 1 6 UNP HAS1_YEAST Q03532 ? 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A A 13 N6 ? ? ? 1_555 B U 145 O4 ? ? 1 A 13 2 U 145 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A U 14 N3 ? ? ? 1_555 B C 117 O2 ? ? 1 U 14 2 C 117 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-C MISPAIR' ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A U 14 O2 ? ? ? 1_555 B G 136 N2 ? ? 1 U 14 2 G 136 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A C 15 N3 ? ? ? 1_555 B G 144 N1 ? ? 1 C 15 2 G 144 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A C 15 N4 ? ? ? 1_555 B G 144 O6 ? ? 1 C 15 2 G 144 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? A C 15 O2 ? ? ? 1_555 B G 144 N2 ? ? 1 C 15 2 G 144 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? A A 16 N1 ? ? ? 1_555 B U 143 N3 ? ? 1 A 16 2 U 143 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? A A 16 N6 ? ? ? 1_555 B U 143 O4 ? ? 1 A 16 2 U 143 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? A G 17 N1 ? ? ? 1_555 B C 142 N3 ? ? 1 G 17 2 C 142 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog217 hydrog ? ? A U 181 N3 ? ? ? 1_555 A A 235 N1 ? ? 1 U 181 1 A 235 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog218 hydrog ? ? A U 181 O4 ? ? ? 1_555 A A 235 N6 ? ? 1 U 181 1 A 235 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog219 hydrog ? ? A U 182 N3 ? ? ? 1_555 A G 234 O6 ? ? 1 U 182 1 G 234 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog220 hydrog ? ? A U 182 O2 ? ? ? 1_555 A G 234 N1 ? ? 1 U 182 1 G 234 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog221 hydrog ? ? A G 183 N1 ? ? ? 1_555 A C 233 N3 ? ? 1 G 183 1 C 233 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog222 hydrog ? ? A G 183 N2 ? ? ? 1_555 A C 233 O2 ? ? 1 G 183 1 C 233 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog223 hydrog ? ? A G 183 O6 ? ? ? 1_555 A C 233 N4 ? ? 1 G 183 1 C 233 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog224 hydrog ? ? A U 184 N3 ? ? ? 1_555 A G 232 O6 ? ? 1 U 184 1 G 232 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? ? hydrog225 hydrog ? ? 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'A-G MISPAIR' ? ? ? hydrog234 hydrog ? ? A G 189 N1 ? ? ? 1_555 A C 205 N3 ? ? 1 G 189 1 C 205 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog235 hydrog ? ? A G 189 N2 ? ? ? 1_555 A C 205 O2 ? ? 1 G 189 1 C 205 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog236 hydrog ? ? A G 189 O6 ? ? ? 1_555 A C 205 N4 ? ? 1 G 189 1 C 205 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog237 hydrog ? ? A U 190 N3 ? ? ? 1_555 A A 221 N1 ? ? 1 U 190 1 A 221 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog238 hydrog ? ? A U 190 O4 ? ? ? 1_555 A A 221 N6 ? ? 1 U 190 1 A 221 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog239 hydrog ? ? A U 191 N3 ? ? ? 1_555 A A 204 N1 ? ? 1 U 191 1 A 204 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog240 hydrog ? ? A U 191 O4 ? ? ? 1_555 A A 204 N6 ? ? 1 U 191 1 A 204 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog241 hydrog ? ? A C 192 N3 ? ? ? 1_555 A G 203 N1 ? ? 1 C 192 1 G 203 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog242 hydrog ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1497 hydrog ? ? C A 10 N1 ? ? ? 1_555 C U 19 N3 ? ? 6 A 10 6 U 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1498 hydrog ? ? C A 10 N6 ? ? ? 1_555 C U 19 O4 ? ? 6 A 10 6 U 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1499 hydrog ? ? C C 11 N3 ? ? ? 1_555 C G 17 N1 ? ? 6 C 11 6 G 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1500 hydrog ? ? C C 11 N4 ? ? ? 1_555 C G 17 O6 ? ? 6 C 11 6 G 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1501 hydrog ? ? C C 11 O2 ? ? ? 1_555 C G 17 N2 ? ? 6 C 11 6 G 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog1502 hydrog ? ? C C 11 N3 ? ? ? 1_555 C U 18 N3 ? ? 6 C 11 6 U 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_18_PAIR ? ? ? hydrog1503 hydrog ? ? C C 11 N4 ? ? ? 1_555 C U 18 O4 ? ? 6 C 11 6 U 18 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_18_PAIR ? ? ? hydrog1504 hydrog ? ? C A 12 N3 ? ? ? 1_555 C G 17 N1 ? ? 6 A 12 6 G 17 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-G MISPAIR' ? ? ? hydrog1505 hydrog ? ? C G 27 N1 ? ? ? 1_555 C U 51 O2 ? ? 6 G 27 6 U 51 1_555 ? ? ? ? ? ? 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TYPE_28_PAIR ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 LEU 17 D . ? LEU 17 B PRO 18 D ? PRO 18 B 1 -1.61 2 ILE 148 E . ? ILE 148 C PRO 149 E ? PRO 149 C 1 -2.25 3 GLY 67 G . ? GLY 67 E PRO 68 G ? PRO 68 E 1 1.78 4 PRO 110 O . ? 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