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'Structural atlas of the most abundant human gut virus' 2023 ? 10.21203/rs.3.rs-1898492/v1 ? ? ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Bayfield, O.W.' 1 ? primary 'Shkoporov, A.N.' 2 ? primary 'Yutin, N.' 3 ? primary 'Khokhlova, E.V.' 4 ? primary 'Smith, J.L.R.' 5 ? primary 'Hawkins, D.E.D.P.' 6 ? primary 'Koonin, E.V.' 7 ? primary 'Hill, C.' 8 ? primary 'Antson, A.A.' 9 ? 1 'Antson, A.' 10 ? 1 'Bayfield, O.' 11 ? 1 'Shkoporov, A.' 12 ? 1 'Yutin, N.' 13 ? 1 'Khokhlova, E.' 14 ? 1 'Smith, J.' 15 ? 1 'Hawkins, D.' 16 ? 1 'Koonin, E.' 17 ? 1 'Hill, C.' 18 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7QOJ _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? 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;MTYNELIYMVLDELKLSSDDSYYTPDHVIFLLVKYRSFLLKQRYSDIKKQIPDSDYQSICLDLIEVPAISGEPCEGSSYL RSKNKVPTTMMIGNPRVYPMDFYQGEITYISRDRMRYVGYNKFLRNIIYCSKAPDGYLYFKSWNPQFLHLEKVSFNAIFE DAKEASEMACPEENGTICKLEDKEFPIEDALVPPLIELVVKELRGPEYSPKDEDNNAKDDLPDAR ; ;MTYNELIYMVLDELKLSSDDSYYTPDHVIFLLVKYRSFLLKQRYSDIKKQIPDSDYQSICLDLIEVPAISGEPCEGSSYL RSKNKVPTTMMIGNPRVYPMDFYQGEITYISRDRMRYVGYNKFLRNIIYCSKAPDGYLYFKSWNPQFLHLEKVSFNAIFE DAKEASEMACPEENGTICKLEDKEFPIEDALVPPLIELVVKELRGPEYSPKDEDNNAKDDLPDAR ; C ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MTNKEFSDGFSTLLNSFGITPNITLDEYEKSTFLTNAQEQLIIDIYSGRNIIYGKSFEQTEEIRRYLSNLVETYETSTKV TGKLGLSKDSVFFEIPQDTWFITYEVAFLKDSRLGCLDGIEASVVPLPQDDLYRAKDNPFRGPSKDRVLRLDIKSDLAEL ISKYNVDKYLMRYISQPTPIILVDLPDGLSINGVSTESECELNPVVHRAILERAVQLAIISKTQLTGNKE ; ;MTNKEFSDGFSTLLNSFGITPNITLDEYEKSTFLTNAQEQLIIDIYSGRNIIYGKSFEQTEEIRRYLSNLVETYETSTKV TGKLGLSKDSVFFEIPQDTWFITYEVAFLKDSRLGCLDGIEASVVPLPQDDLYRAKDNPFRGPSKDRVLRLDIKSDLAEL ISKYNVDKYLMRYISQPTPIILVDLPDGLSINGVSTESECELNPVVHRAILERAVQLAIISKTQLTGNKE ; D ? 5 'polypeptide(L)' no no 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;MDKMLEISEEAITRYFTTLSQFGYKKYSDVDKIIVLFFMEEMLAGEMSYYVTQDDYRNIVNALYCLAGSTCMIDFPMFES YDTLVHSNNRTFVPRITEDSILRSTEDDNFRVEA ; ;MDKMLEISEEAITRYFTTLSQFGYKKYSDVDKIIVLFFMEEMLAGEMSYYVTQDDYRNIVNALYCLAGSTCMIDFPMFES YDTLVHSNNRTFVPRITEDSILRSTEDDNFRVEA ; I ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MFFTQEDYRKIEKWLLANSRKDTDFAGAATPLKGNETVVLVQNGKNVKASVKDVVEQLFLLGVSDFVNITDKYGESYISL SQAIELIPYRSRKIGQVVTFLDDTGKWAMFQFQGTRKNQWGTLSLWVDLIDLMTGLTITDSEDIVTETNSANQVALKFAD KTYNEADYSGLGRVYLRKNIVNVEDPVTGNIVKMNYLTQSMISKENTIYIVQYSYNLNGQTITIPSGCVLKFEGGSISNG SIKGTDTNIIAPQIRIFNTILLSGTWKVRDIFDDWFDFNATTNFDNINNFYNISILQSDDLENNVILKGNYYSSLKDGIV LSLSSNTNLVLNGSISLLPNNLSSYSIIKGVDKENIKISGGGRLIGDLQNHLGDTGEWGFGISFTGCKTVSITNIDSSYM WGDGLYIGASDDTKEETLSQNIQVNNCKFEYNRRQGISITGAVDVFVNNCYFFNTGKINGTSPKAGLDIEPSGLYNSNVT ISNCIADSNVSTGFLVYGDNRNIVIDNCASKNQLISITIAQRSATTDNDDVFIRHGNIGGSLQITRGNIRVEDCEVDSVY FTADTSGIGANVTISNSVIGAKRWEGSTYFNSVFLIDSNSQINNLYIFDSKIDYDPSILTQGLFNIGGNSIRDNILFENC DISQKNTVNSLNTKVGSYRNCRFYNMTRIYLANEPNKTVEFTDNYCAMTRESSSTNIFSFLNSSSTQDVILFVVRNNTFS 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;MAKKKIKRRGKMPPNIFDTGGQSWGQQSSGQFSNAFKGENLGNSIGSIGGAVGGIAQAGISNAQIADTSGIEAQNKAQKN MVVGASSNDDLMSEWGSWNKVKDDYSWKDVRGGSTGQRVTNTIGAAGQGAAAGASVGGPIGAIVGGVVGLGSAIGGWLGG NRKAKRKAKKLNKEAKEANERALTSFETRADNIDTQNDFNMLANFSAYGGPLEFGSGAIGYEFDNRYLNNQEMSAVAKQR LTSLPNSFQALPEMNTYNAFAEGGGLSREKNYGSKKKPYPSVPSGDFAGPHRSYPIPTKADARDALRLAGLHGNESVRRK VLAKYPSLKAFGGSLFDSVVGNNFNQSFTQGIQGMFQQEPEQTVQAANIAKDGGDIKIKEKNKGKFTAYCGGKVTEACIR KGKNSSNPTTRKRATFAQNARNWNAFGGWLNTQGGDFTNGVTFINEGGSHEENPYQGIQIGVDPEGAPNLVEQGEVVYDD YVFSDRMEIPDDIRKEYKLRGKTFAKAAKSAQRESEERPNDPLSTKGLQAAMERIATAQEEARQRKEAHREGNEYPSMFA YGGDTNPYGLALEDPMSVEELEALMVQSGETGEIAPEGNNGNRQTWTRYAPIIGSGLASLSDLFSKPDYDSADLISGVDL GAEAVGYAPIGNYLSYRPLDRDFYINKMNQQAAATRRGLMNTSGGNRLNAQAGILAADYNYGQNMGNLARQAEEYNQQLR ERVEAFNRGTNMFNTETGLKASMFNAESRNAAKRARLGQATTVAQLRQGIKDQDAARRSANITNFLQGLGDMGWENEQAN WLDTLAKSGVLKMNTKGEYTGGTKKAKGGKVRTKKKKGLTYG ; ;MAKKKIKRRGKMPPNIFDTGGQSWGQQSSGQFSNAFKGENLGNSIGSIGGAVGGIAQAGISNAQIADTSGIEAQNKAQKN 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9 ;MAKKKIKRRGKMPPNIFDTGGQSWGQQSSGQFSNAFKGENLGNSIGSIGGAVGGIAQAGISNAQIADTSGIEAQNKAQKN MVVGASSNDDLMSEWGSWNKVKDDYSWKDVRGGSTGQRVTNTIGAAGQGAAAGASVGGPIGAIVGGVVGLGSAIGGWLGG NRKAKRKAKKLNKEAKEANERALTSFETRADNIDTQNDFNMLANFSAYGGPLEFGSGAIGYEFDNRYLNNQEMSAVAKQR LTSLPNSFQALPEMNTYNAFAEGGGLSREKNYGSKKKPYPSVPSGDFAGPHRSYPIPTKADARDALRLAGLHGNESVRRK VLAKYPSLKAFGGSLFDSVVGNNFNQSFTQGIQGMFQQEPEQTVQAANIAKDGGDIKIKEKNKGKFTAYCGGKVTEACIR KGKNSSNPTTRKRATFAQNARNWNAFGGWLNTQGGDFTNGVTFINEGGSHEENPYQGIQIGVDPEGAPNLVEQGEVVYDD YVFSDRMEIPDDIRKEYKLRGKTFAKAAKSAQRESEERPNDPLSTKGLQAAMERIATAQEEARQRKEAHREGNEYPSMFA YGGDTNPYGLALEDPMSVEELEALMVQSGETGEIAPEGNNGNRQTWTRYAPIIGSGLASLSDLFSKPDYDSADLISGVDL GAEAVGYAPIGNYLSYRPLDRDFYINKMNQQAAATRRGLMNTSGGNRLNAQAGILAADYNYGQNMGNLARQAEEYNQQLR ERVEAFNRGTNMFNTETGLKASMFNAESRNAAKRARLGQATTVAQLRQGIKDQDAARRSANITNFLQGLGDMGWENEQAN WLDTLAKSGVLKMNTKGEYTGGTKKAKGGKVRTKKKKGLTYG ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7QOJ A 1 ? 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'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 7QOJ _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 7QOJ _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 20659 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.755 ? 27934 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.799 ? 7823 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.048 ? 3095 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 3616 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 7QOJ _struct.title 'Tail barrel assembly of the phicrAss001 virion with C12 symmetry imposed' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 7QOJ _struct_keywords.text 'crAssphage, bacteriophage, virus, DNA virus, portal, vertex, capsid, connector, tail' _struct_keywords.pdbx_keywords VIRUS # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 5 ? G N N 6 ? H N N 6 ? I N N 7 ? J N N 8 ? K N N 8 ? L N N 8 ? M N N 9 ? N N N 9 ? O N N 10 ? P N N 11 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 PRO A 13 ? LYS A 17 ? PRO A 13 LYS A 17 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 18 ? LYS A 32 ? THR A 18 LYS A 32 1 ? 15 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 43 ? ASN A 55 ? SER A 43 ASN A 55 1 ? 13 HELX_P HELX_P4 AA4 HIS A 59 ? LEU A 63 ? HIS A 59 LEU A 63 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 MET A 87 ? ARG A 101 ? MET A 87 ARG A 101 1 ? 15 HELX_P HELX_P6 AA6 SER A 116 ? SER A 138 ? SER A 116 SER A 138 1 ? 23 HELX_P HELX_P7 AA7 GLU A 143 ? ASP A 153 ? GLU A 143 ASP A 153 1 ? 11 HELX_P HELX_P8 AA8 GLU A 158 ? ASP A 179 ? GLU A 158 ASP A 179 1 ? 22 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP A 179 ? GLY A 195 ? ASP A 179 GLY A 195 1 ? 17 HELX_P HELX_P10 AB1 ASN A 214 ? LEU A 216 ? ASN A 214 LEU A 216 5 ? 3 HELX_P HELX_P11 AB2 SER A 242 ? TYR A 250 ? SER A 242 TYR A 250 1 ? 9 HELX_P HELX_P12 AB3 SER A 255 ? MET A 265 ? SER A 255 MET A 265 1 ? 11 HELX_P HELX_P13 AB4 SER A 429 ? ASN A 455 ? SER A 429 ASN A 455 1 ? 27 HELX_P HELX_P14 AB5 ASP A 472 ? HIS A 484 ? ASP A 472 HIS A 484 1 ? 13 HELX_P HELX_P15 AB6 LYS A 492 ? GLY A 494 ? LYS A 492 GLY A 494 5 ? 3 HELX_P HELX_P16 AB7 THR A 495 ? THR A 500 ? THR A 495 THR A 500 1 ? 6 HELX_P HELX_P17 AB8 ALA A 504 ? ASN A 509 ? ALA A 504 ASN A 509 5 ? 6 HELX_P HELX_P18 AB9 ASN A 518 ? ALA A 541 ? ASN A 518 ALA A 541 1 ? 24 HELX_P HELX_P19 AC1 LEU A 565 ? LYS A 598 ? LEU A 565 LYS A 598 1 ? 34 HELX_P HELX_P20 AC2 GLY A 599 ? ARG A 600 ? GLY A 599 ARG A 600 5 ? 2 HELX_P HELX_P21 AC3 ASN A 601 ? LYS A 602 ? ASN A 601 LYS A 602 5 ? 2 HELX_P HELX_P22 AC4 LYS A 603 ? LEU A 608 ? LYS A 603 LEU A 608 1 ? 6 HELX_P HELX_P23 AC5 SER A 609 ? VAL A 615 ? SER A 609 VAL A 615 1 ? 7 HELX_P HELX_P24 AC6 MET A 616 ? ILE A 618 ? MET A 616 ILE A 618 5 ? 3 HELX_P HELX_P25 AC7 ALA A 624 ? TYR A 628 ? ALA A 624 TYR A 628 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 AC8 SER A 635 ? GLN A 654 ? SER A 635 GLN A 654 1 ? 20 HELX_P HELX_P27 AC9 SER A 659 ? THR A 668 ? SER A 659 THR A 668 1 ? 10 HELX_P HELX_P28 AD1 SER A 671 ? GLU A 739 ? SER A 671 GLU A 739 1 ? 69 HELX_P HELX_P29 AD2 LEU B 10 ? LEU B 18 ? LEU B 10 LEU B 18 1 ? 9 HELX_P HELX_P30 AD3 ARG B 19 ? THR B 24 ? ARG B 19 THR B 24 5 ? 6 HELX_P HELX_P31 AD4 ASN B 27 ? GLY B 43 ? ASN B 27 GLY B 43 1 ? 17 HELX_P HELX_P32 AD5 LEU B 44 ? TYR B 48 ? LEU B 44 TYR B 48 5 ? 5 HELX_P HELX_P33 AD6 ASN B 147 ? GLY B 170 ? ASN B 147 GLY B 170 1 ? 24 HELX_P HELX_P34 AD7 SER B 173 ? ILE B 197 ? 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THR D 60 SER D 68 1 ? 9 HELX_P HELX_P49 AF4 LEU D 132 ? ASP D 137 ? LEU D 132 ASP D 137 1 ? 6 HELX_P HELX_P50 AF5 ASN D 203 ? THR D 223 ? ASN D 203 THR D 223 1 ? 21 HELX_P HELX_P51 AF6 ASN E 2 ? ASN E 15 ? ASN E 2 ASN E 15 1 ? 14 HELX_P HELX_P52 AF7 ASN E 26 ? GLU E 47 ? ASN E 26 GLU E 47 1 ? 22 HELX_P HELX_P53 AF8 PRO E 48 ? ASN E 51 ? PRO E 48 ASN E 51 5 ? 4 HELX_P HELX_P54 AF9 SER E 60 ? SER E 68 ? SER E 60 SER E 68 1 ? 9 HELX_P HELX_P55 AG1 SER E 121 ? SER E 130 ? SER E 121 SER E 130 1 ? 10 HELX_P HELX_P56 AG2 ASN E 204 ? ILE E 206 ? ASN E 204 ILE E 206 5 ? 3 HELX_P HELX_P57 AG3 ILE E 207 ? GLY E 225 ? ILE E 207 GLY E 225 1 ? 19 HELX_P HELX_P58 AG4 ASP E 226 ? GLY E 234 ? ASP E 226 GLY E 234 1 ? 9 HELX_P HELX_P59 AG5 ASN F 2 ? ASN F 15 ? ASN F 2 ASN F 15 1 ? 14 HELX_P HELX_P60 AG6 ASN F 26 ? GLU F 47 ? ASN F 26 GLU F 47 1 ? 22 HELX_P HELX_P61 AG7 PRO F 48 ? ASN F 51 ? PRO F 48 ASN F 51 5 ? 4 HELX_P HELX_P62 AG8 SER F 60 ? PHE F 67 ? SER F 60 PHE F 67 1 ? 8 HELX_P HELX_P63 AG9 SER F 121 ? MET F 129 ? SER F 121 MET F 129 1 ? 9 HELX_P HELX_P64 AH1 ASN F 204 ? ILE F 206 ? ASN F 204 ILE F 206 5 ? 3 HELX_P HELX_P65 AH2 ILE F 207 ? GLY F 225 ? ILE F 207 GLY F 225 1 ? 19 HELX_P HELX_P66 AH3 ASP F 226 ? GLY F 234 ? ASP F 226 GLY F 234 1 ? 9 HELX_P HELX_P67 AH4 GLN F 235 ? GLU F 238 ? GLN F 235 GLU F 238 5 ? 4 HELX_P HELX_P68 AH5 VAL G 58 ? TYR G 62 ? VAL G 58 TYR G 62 1 ? 5 HELX_P HELX_P69 AH6 THR G 91 ? MET G 94 ? THR G 91 MET G 94 5 ? 4 HELX_P HELX_P70 AH7 GLN G 104 ? LYS G 107 ? GLN G 104 LYS G 107 5 ? 4 HELX_P HELX_P71 AH8 LEU G 145 ? CYS G 161 ? LEU G 145 CYS G 161 1 ? 17 HELX_P HELX_P72 AH9 PRO G 166 ? THR G 185 ? PRO G 166 THR G 185 1 ? 20 HELX_P HELX_P73 AI1 ASN G 187 ? PHE G 199 ? ASN G 187 PHE G 199 1 ? 13 HELX_P HELX_P74 AI2 ASP H 41 ? PHE H 43 ? ASP H 41 PHE H 43 5 ? 3 HELX_P HELX_P75 AI3 GLN H 92 ? LYS H 95 ? GLN H 92 LYS H 95 1 ? 4 HELX_P HELX_P76 AI4 ILE H 103 ? LYS H 107 ? 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THR M 503 GLN M 512 1 ? 10 HELX_P HELX_P91 AK1 GLN M 512 ? GLU M 517 ? GLN M 512 GLU M 517 1 ? 6 HELX_P HELX_P92 AK2 ASP M 521 ? GLY M 552 ? ASP M 521 GLY M 552 1 ? 32 HELX_P HELX_P93 AK3 GLY N 217 ? LYS N 238 ? GLY N 217 LYS N 238 1 ? 22 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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A GLN 160 OE1 ? ? ? 1_555 O MG . MG ? ? A GLN 160 A MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.803 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 8 ? AB1 ? 7 ? AB2 ? 8 ? AB3 ? 8 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AA9 4 5 ? parallel AA9 5 6 ? anti-parallel AA9 6 7 ? anti-parallel AA9 7 8 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? parallel AB1 5 6 ? anti-parallel AB1 6 7 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? parallel AB2 5 6 ? anti-parallel AB2 6 7 ? anti-parallel AB2 7 8 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? parallel AB3 5 6 ? anti-parallel AB3 6 7 ? anti-parallel AB3 7 8 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LYS A 106 ? 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SER B 70 LEU B 76 AA8 1 GLY B 62 ? GLU B 63 ? GLY B 62 GLU B 63 AA8 2 VAL B 117 ? THR B 120 ? VAL B 117 THR B 120 AA8 3 SER B 110 ? THR B 113 ? SER B 110 THR B 113 AA8 4 ARG B 84 ? ALA B 85 ? ARG B 84 ALA B 85 AA9 1 GLN C 57 ? VAL C 66 ? GLN C 57 VAL C 66 AA9 2 TYR C 79 ? SER C 82 ? TYR C 79 SER C 82 AA9 3 LEU C 138 ? LYS C 141 ? LEU C 138 LYS C 141 AA9 4 ILE C 128 ? LYS C 132 ? ILE C 128 LYS C 132 AA9 5 ILE C 107 ? TYR C 109 ? ILE C 107 TYR C 109 AA9 6 ARG C 96 ? TYR C 98 ? ARG C 96 TYR C 98 AA9 7 LYS C 152 ? ALA C 157 ? LYS C 152 ALA C 157 AA9 8 GLN C 57 ? VAL C 66 ? GLN C 57 VAL C 66 AB1 1 VAL D 71 ? THR D 76 ? VAL D 71 THR D 76 AB1 2 VAL D 166 ? SER D 175 ? VAL D 166 SER D 175 AB1 3 THR D 99 ? LEU D 109 ? THR D 99 LEU D 109 AB1 4 GLU D 121 ? PRO D 126 ? GLU D 121 PRO D 126 AB1 5 ARG D 147 ? ILE D 153 ? ARG D 147 ILE D 153 AB1 6 LEU D 157 ? ILE D 161 ? LEU D 157 ILE D 161 AB1 7 SER D 90 ? GLU D 94 ? SER D 90 GLU D 94 AB2 1 ILE E 71 ? GLU E 75 ? ILE E 71 GLU E 75 AB2 2 ILE E 164 ? ARG E 173 ? ILE E 164 ARG E 173 AB2 3 LEU E 100 ? THR E 110 ? LEU E 100 THR E 110 AB2 4 GLY E 113 ? PRO E 119 ? GLY E 113 PRO E 119 AB2 5 GLN E 140 ? ILE E 145 ? GLN E 140 ILE E 145 AB2 6 SER E 153 ? ILE E 157 ? SER E 153 ILE E 157 AB2 7 LYS E 92 ? ASP E 95 ? LYS E 92 ASP E 95 AB2 8 VAL E 77 ? LEU E 78 ? VAL E 77 LEU E 78 AB3 1 ILE F 71 ? GLU F 75 ? ILE F 71 GLU F 75 AB3 2 ILE F 164 ? ARG F 173 ? ILE F 164 ARG F 173 AB3 3 LEU F 100 ? THR F 110 ? LEU F 100 THR F 110 AB3 4 THR F 114 ? PRO F 119 ? THR F 114 PRO F 119 AB3 5 GLN F 140 ? ILE F 145 ? GLN F 140 ILE F 145 AB3 6 SER F 153 ? ILE F 157 ? SER F 153 ILE F 157 AB3 7 ALA F 91 ? ASP F 95 ? ALA F 91 ASP F 95 AB3 8 VAL F 77 ? LEU F 78 ? VAL F 77 LEU F 78 AB4 1 HIS G 2 ? ILE G 8 ? HIS G 2 ILE G 8 AB4 2 PHE G 14 ? SER G 20 ? PHE G 14 SER G 20 AB4 3 ASN G 96 ? ASN G 102 ? ASN G 96 ASN G 102 AB5 1 TYR G 54 ? ASN G 57 ? TYR G 54 ASN G 57 AB5 2 SER G 34 ? ASP G 38 ? SER G 34 ASP G 38 AB5 3 PHE G 115 ? LYS G 120 ? 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