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EMDB EMD-25441 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Structure of Bfr2-Lcp5 Complex Observed in the Small Subunit Processome Isolated from R2TP-depleted Yeast Cells' _pdbx_database_related.db_id EMD-25441 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 7SUK _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2021-11-17 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Rai, J.' 1 0000-0002-4473-3850 'Zhao, Y.' 2 ? 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'Artificial intelligence-assisted cryoEM structure of Bfr2-Lcp5 complex observed in the yeast small subunit processome.' 2022 ? 10.1016/j.jsb.2015.11.003 35650250 ? ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Zhao, Y.' 1 0000-0003-0485-2780 primary 'Rai, J.' 2 ? primary 'Xu, C.' 3 ? primary 'He, H.' 4 ? primary 'Li, H.' 5 0000-0003-2046-9861 1 'Zhao, Y.' 6 0000-0003-0485-2780 1 'Rai, J.' 7 0000-0002-4473-3850 1 'Xu, C.' 8 ? 1 'He, H.' 9 ? 1 'Li, H.' 10 0000-0003-2046-9861 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'U3 small nucleolar RNA-associated protein MPP10' 28232.779 1 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Nucleolar protein 56' 45461.172 1 ? ? ? ? 3 polymer nat 'Something about silencing protein 10' 20009.535 1 ? ? ? ? 4 polymer nat 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snoRNA-associated protein 16' 57 'U3 snoRNA-associated protein 13,U three protein 13' 58 'Forty S assembly factor' 59 'Nucleolar protein 5' 61 'U3 snoRNA-associated protein 20,U three protein 20' 62 '18S rRNA cytosine acetyltransferase,Killer toxin-resistance protein 33,Ribosomal RNA cytidine acetyltransferase 1' 63 'RP9,S10,Small ribosomal subunit protein eS6-A,YS4' 64 'S27a,Small ribosomal subunit protein uS15,YS15' 65 'Brefeldin A resistance protein 2' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;KNLSSFEKQQIEIRKQIEQLENEAVAEKKWSLKGEVKAKDRPEDALLTEELEFDRTAKPVPVITSEVTESLEDMIRRRIQ DSNFDDLQRRTLLDITRKSQRPQFELSDVKSSKSLAEIYEDDYTRAEDESALSEELQKAHSEISELYANLVYKLDVLSSV HFVPKPASTSLEIRVETPTISMEDAQPLYMSNASSLAPQEIYNVGKAEKDGEIRLKNGVAMSKEELTREDKNRLRRALKR KRSKA ; ;KNLSSFEKQQIEIRKQIEQLENEAVAEKKWSLKGEVKAKDRPEDALLTEELEFDRTAKPVPVITSEVTESLEDMIRRRIQ DSNFDDLQRRTLLDITRKSQRPQFELSDVKSSKSLAEIYEDDYTRAEDESALSEELQKAHSEISELYANLVYKLDVLSSV HFVPKPASTSLEIRVETPTISMEDAQPLYMSNASSLAPQEIYNVGKAEKDGEIRLKNGVAMSKEELTREDKNRLRRALKR KRSKA ; NA ? 2 'polypeptide(L)' no no ;PIEYLLFEEPTGYAVFKVKLQQDDIGSRLKEVQEQINDFGAFTKLIELVSFAPFKGAAEALENANDISEGLVSESLKAIL DLNLPKASSKKKNITLAISDKNLGPSIKEEFPYVDCISNELAQDLIRGVRLHGEKLFKGLQSGDLERAQLGLGHAYSRAK VKFSVQKNDNHIIQAIALLDQLDKDINTFAMRVKEWYGWHFPELAKLVPDNYTFAKLVLFIKDKASLN(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)ALL(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)GQDISETDMENVCVFAQRVASLADYRRQLYDYLCE KMHTVAPNLSELIGEVIGARLISHAGSLTNLSKQAASTVQILGAEKALFRALKTKGNTPKYGLIYHSGFISKASAKNKGR ISRYLANKCSMASRIDNYSEEPSNVFGSVLKKQVEQRLEFY ; ;PIEYLLFEEPTGYAVFKVKLQQDDIGSRLKEVQEQINDFGAFTKLIELVSFAPFKGAAEALENANDISEGLVSESLKAIL DLNLPKASSKKKNITLAISDKNLGPSIKEEFPYVDCISNELAQDLIRGVRLHGEKLFKGLQSGDLERAQLGLGHAYSRAK 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UCAUCGUGGGCAUCUUGCGAUUCCAUUGGUGAGCAGCGAAGGAUUUGGUGGAUUACUAGCUAAUAGCAAUCUAUUUCAAA GAAUUCAAACUUGGGGGAAUGCCUUGUUGAAUAGCCGGUCGCAAGACUGUGAUUCUUCAAGUGUAACCUCCUCUCAAAUC AGCGAUAUCAAACGUACCAUUCCGUGAAACACCGGGGUAUCUGUUUGGUGGAACCUGAUUAGAGGAAACUCAAAGAGUGC UAUGGUAUGGUGACGGAGUGCGCUGGUCAAGAGUGUAAAAGCUUUUUGAACAGAGAGCAUUUCCGGCAGCAGAGAGACCU GAAAAAGCAAUUUUUCUGGAAUUUCAGCUGUUUCCAAACUCAAUAAGUAUCUUCUAGCAAGAGGGAAUAGGUGGGAAAAA AAAAAAGAGAUUUCGGUUUCUUUCUUUUUUACUGCUUGUUGCUUCUUCUUUUAAGAUAGU ; ;AUGCGAAAGCAGUUGAAGACAAGUUCGAAAAGAGUUUGGAAACGAAUUCGAGUAGGCUUGUCGUUCGUUAUGUUUUUGUA AAUGGCCUCGUCAAACGGUGGAGAGAGUCGCUAGGUGAUCGUCAGAUCUGCCUAGUCUCUAUACAGCGUGUUUAAUUGAC AUGGGUUGAUGCGUAUUGAGAGAUACAAUUUGGGAAGAAAUUCCCAGAGUGUGUUUCUUUUGCGUUUAACCUGAACAGUC UCAUCGUGGGCAUCUUGCGAUUCCAUUGGUGAGCAGCGAAGGAUUUGGUGGAUUACUAGCUAAUAGCAAUCUAUUUCAAA GAAUUCAAACUUGGGGGAAUGCCUUGUUGAAUAGCCGGUCGCAAGACUGUGAUUCUUCAAGUGUAACCUCCUCUCAAAUC AGCGAUAUCAAACGUACCAUUCCGUGAAACACCGGGGUAUCUGUUUGGUGGAACCUGAUUAGAGGAAACUCAAAGAGUGC 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Residues ASN NH 445 and PRO NH 453 are linked together in the model; however, there are residues between them in the deposited polymeric sequence. ; # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 LYS 1 295 295 LYS LYS NA . n A 1 2 ASN 2 296 296 ASN ASN NA . n A 1 3 LEU 3 297 297 LEU LEU NA . n A 1 4 SER 4 298 298 SER SER NA . n A 1 5 SER 5 299 299 SER SER NA . n A 1 6 PHE 6 300 300 PHE PHE NA . n A 1 7 GLU 7 301 301 GLU GLU NA . n A 1 8 LYS 8 302 302 LYS LYS NA . n A 1 9 GLN 9 303 303 GLN GLN NA . n A 1 10 GLN 10 304 304 GLN GLN NA . n A 1 11 ILE 11 305 305 ILE ILE NA . n A 1 12 GLU 12 306 306 GLU GLU NA . n A 1 13 ILE 13 307 307 ILE ILE NA . n A 1 14 ARG 14 308 308 ARG ARG NA . n A 1 15 LYS 15 309 309 LYS LYS NA . n A 1 16 GLN 16 310 310 GLN GLN NA . n A 1 17 ILE 17 311 311 ILE ILE NA . n A 1 18 GLU 18 312 312 GLU GLU NA . n A 1 19 GLN 19 313 313 GLN GLN NA . n A 1 20 LEU 20 314 314 LEU LEU NA . n A 1 21 GLU 21 315 315 GLU GLU NA . n A 1 22 ASN 22 316 316 ASN ASN NA . n A 1 23 GLU 23 317 317 GLU GLU NA . n A 1 24 ALA 24 318 318 ALA ALA NA . n A 1 25 VAL 25 319 319 VAL VAL NA . n A 1 26 ALA 26 320 320 ALA ALA NA . n A 1 27 GLU 27 321 321 GLU GLU NA . n A 1 28 LYS 28 322 322 LYS LYS NA . n A 1 29 LYS 29 323 323 LYS LYS NA . n A 1 30 TRP 30 324 324 TRP TRP NA . n A 1 31 SER 31 325 325 SER SER NA . n A 1 32 LEU 32 326 326 LEU LEU NA . n A 1 33 LYS 33 327 327 LYS LYS NA . n A 1 34 GLY 34 328 328 GLY GLY NA . n A 1 35 GLU 35 329 329 GLU GLU NA . n A 1 36 VAL 36 330 330 VAL VAL NA . n A 1 37 LYS 37 331 331 LYS LYS NA . n A 1 38 ALA 38 332 332 ALA ALA NA . n A 1 39 LYS 39 333 333 LYS LYS NA . n A 1 40 ASP 40 334 334 ASP ASP NA . n A 1 41 ARG 41 335 335 ARG ARG NA . n A 1 42 PRO 42 336 336 PRO PRO NA . n A 1 43 GLU 43 337 337 GLU GLU NA . n A 1 44 ASP 44 338 338 ASP ASP NA . n A 1 45 ALA 45 339 339 ALA ALA NA . n A 1 46 LEU 46 340 340 LEU LEU NA . n A 1 47 LEU 47 341 341 LEU LEU NA . n A 1 48 THR 48 342 342 THR THR NA . n A 1 49 GLU 49 343 343 GLU GLU NA . n A 1 50 GLU 50 344 344 GLU GLU NA . n A 1 51 LEU 51 345 345 LEU LEU NA . n A 1 52 GLU 52 346 346 GLU GLU NA . n A 1 53 PHE 53 347 347 PHE PHE NA . n A 1 54 ASP 54 348 348 ASP ASP NA . n A 1 55 ARG 55 349 349 ARG ARG NA . n A 1 56 THR 56 350 350 THR THR NA . n A 1 57 ALA 57 351 351 ALA ALA NA . n A 1 58 LYS 58 352 352 LYS LYS NA . n A 1 59 PRO 59 353 353 PRO PRO NA . n A 1 60 VAL 60 354 354 VAL VAL NA . n A 1 61 PRO 61 355 355 PRO PRO NA . n A 1 62 VAL 62 356 356 VAL VAL NA . n A 1 63 ILE 63 357 357 ILE ILE NA . n A 1 64 THR 64 358 358 THR THR NA . n A 1 65 SER 65 359 359 SER SER NA . n A 1 66 GLU 66 360 360 GLU GLU NA . n A 1 67 VAL 67 361 361 VAL VAL NA . n A 1 68 THR 68 362 362 THR THR NA . n A 1 69 GLU 69 363 363 GLU GLU NA . n A 1 70 SER 70 364 364 SER SER NA . n A 1 71 LEU 71 365 365 LEU LEU NA . n A 1 72 GLU 72 366 366 GLU GLU NA . n A 1 73 ASP 73 367 367 ASP ASP NA . n A 1 74 MET 74 368 368 MET MET NA . n A 1 75 ILE 75 369 369 ILE ILE NA . n A 1 76 ARG 76 370 370 ARG ARG NA . n A 1 77 ARG 77 371 371 ARG ARG NA . n A 1 78 ARG 78 372 372 ARG ARG NA . n A 1 79 ILE 79 373 373 ILE ILE NA . n A 1 80 GLN 80 374 374 GLN GLN NA . n A 1 81 ASP 81 375 375 ASP ASP NA . n A 1 82 SER 82 376 376 SER SER NA . n A 1 83 ASN 83 377 377 ASN ASN NA . n A 1 84 PHE 84 378 378 PHE PHE NA . n A 1 85 ASP 85 379 379 ASP ASP NA . n A 1 86 ASP 86 380 380 ASP ASP NA . n A 1 87 LEU 87 381 381 LEU LEU NA . n A 1 88 GLN 88 382 382 GLN GLN NA . n A 1 89 ARG 89 383 383 ARG ARG NA . n A 1 90 ARG 90 384 384 ARG ARG NA . n A 1 91 THR 91 385 385 THR THR NA . n A 1 92 LEU 92 386 386 LEU LEU NA . n A 1 93 LEU 93 387 ? ? ? 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. n BB 51 38 ILE 38 134 134 ILE ILE NH . n BB 51 39 LEU 39 135 135 LEU LEU NH . n BB 51 40 GLN 40 136 136 GLN GLN NH . n BB 51 41 GLU 41 137 137 GLU GLU NH . n BB 51 42 ILE 42 138 138 ILE ILE NH . n BB 51 43 PRO 43 139 139 PRO PRO NH . n BB 51 44 ASP 44 140 140 ASP ASP NH . n BB 51 45 TRP 45 141 141 TRP TRP NH . n BB 51 46 GLU 46 142 142 GLU GLU NH . n BB 51 47 GLU 47 143 143 GLU GLU NH . n BB 51 48 LYS 48 144 144 LYS LYS NH . n BB 51 49 SER 49 145 145 SER SER NH . n BB 51 50 LEU 50 146 146 LEU LEU NH . n BB 51 51 ALA 51 147 147 ALA ALA NH . n BB 51 52 GLU 52 148 148 GLU GLU NH . n BB 51 53 VAL 53 149 149 VAL VAL NH . n BB 51 54 ASP 54 150 150 ASP ASP NH . n BB 51 55 SER 55 151 151 SER SER NH . n BB 51 56 PHE 56 152 152 PHE PHE NH . n BB 51 57 PHE 57 153 153 PHE PHE NH . n BB 51 58 LYS 58 154 154 LYS LYS NH . n BB 51 59 ASN 59 155 155 ASN ASN NH . n BB 51 60 LYS 60 156 156 LYS LYS NH . n BB 51 61 ILE 61 157 157 ILE ILE NH . n BB 51 62 VAL 62 158 158 VAL VAL NH . n BB 51 63 SER 63 159 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;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB ; # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal 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2 2 'Structure model' chem_comp_bond # _pdbx_entry_details.entry_id 7SUK _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ;Residues for which the identity and register can not be assigned are listed as UNK. The actual sequences can be found under the following UniProt ids: chain L3 - P0CX55, LH - Q02931, LK - P38882, LM - P42945, LN - Q06679, LP - Q02354, LQ - Q12220, NB - Q12136, SA Q12460, SI - Q08965, SS - Q04500, ST - Q99207. ; _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? # _em_3d_fitting.entry_id 7SUK _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 7SUK _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 199534 _em_3d_reconstruction.resolution 3.99 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.7 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.name 'Structure of Bfr2-Lcp5 Complex Observed in the Small Subunit Processome Isolated from R2TP-depleted Yeast Cells' _em_entity_assembly.source NATURAL _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list ;1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31,32,33,34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45,46,47,48,49,50,51,52,53,54,55,56,57,58,59,60,61,62,63,64,65,66 ; _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 7SUK _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen ? _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs ? _em_imaging.nominal_defocus_max 2500 _em_imaging.nominal_defocus_min 1300 _em_imaging.nominal_magnification ? _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ? _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.instrument ? _em_vitrification.entry_id 7SUK _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 7SUK _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_bond.id _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_target_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.linker_flag 1 1 C4 8 A 140 ? ? 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CG LV GLU 286 ? ? 129.31 113.40 15.91 2.20 N 85 1 CA LZ LEU 88 ? ? CB LZ LEU 88 ? ? CG LZ LEU 88 ? ? 130.55 115.30 15.25 2.30 N 86 1 CA SC LEU 306 ? ? CB SC LEU 306 ? ? CG SC LEU 306 ? ? 131.66 115.30 16.36 2.30 N 87 1 CA SE LEU 65 ? ? CB SE LEU 65 ? ? CG SE LEU 65 ? ? 130.00 115.30 14.70 2.30 N 88 1 CB SG ASP 115 ? ? CG SG ASP 115 ? ? OD1 SG ASP 115 ? ? 125.62 118.30 7.32 0.90 N 89 1 CA SI LEU 263 ? ? CB SI LEU 263 ? ? CG SI LEU 263 ? ? 131.61 115.30 16.31 2.30 N 90 1 CA SI CYS 308 ? ? CB SI CYS 308 ? ? SG SI CYS 308 ? ? 122.02 114.20 7.82 1.10 N 91 1 CB SI ASP 348 ? ? CG SI ASP 348 ? ? OD1 SI ASP 348 ? ? 127.88 118.30 9.58 0.90 N 92 1 CA SI MET 1145 ? ? CB SI MET 1145 ? ? CG SI MET 1145 ? ? 123.70 113.30 10.40 1.70 N 93 1 CB SL ASP 68 ? ? CG SL ASP 68 ? ? OD2 SL ASP 68 ? ? 126.10 118.30 7.80 0.90 N 94 1 CA SL LEU 117 ? ? CB SL LEU 117 ? ? CG SL LEU 117 ? ? 129.41 115.30 14.11 2.30 N 95 1 CA SM PRO 41 ? ? N SM PRO 41 ? ? 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"C1'" 8 C 190 ? ? N1 8 C 190 ? ? 113.83 108.50 5.33 0.70 N 121 1 "C3'" 8 G 199 ? ? "O3'" 8 G 199 ? ? P 8 A 200 ? ? 126.93 119.70 7.23 1.20 Y 122 1 N1 8 U 241 ? ? C2 8 U 241 ? ? O2 8 U 241 ? ? 128.85 122.80 6.05 0.70 N 123 1 N3 8 U 241 ? ? C2 8 U 241 ? ? O2 8 U 241 ? ? 116.52 122.20 -5.68 0.70 N 124 1 C2 8 U 241 ? ? N1 8 U 241 ? ? "C1'" 8 U 241 ? ? 128.47 117.70 10.77 1.20 N 125 1 N1 8 C 258 ? ? C2 8 C 258 ? ? O2 8 C 258 ? ? 124.02 118.90 5.12 0.60 N 126 1 N3 8 C 258 ? ? C2 8 C 258 ? ? O2 8 C 258 ? ? 117.42 121.90 -4.48 0.70 N 127 1 C2 8 C 258 ? ? N1 8 C 258 ? ? "C1'" 8 C 258 ? ? 125.57 118.80 6.77 1.10 N 128 1 N1 8 C 282 ? ? C2 8 C 282 ? ? O2 8 C 282 ? ? 122.83 118.90 3.93 0.60 N 129 1 N1 8 C 343 ? ? C2 8 C 343 ? ? O2 8 C 343 ? ? 123.02 118.90 4.12 0.60 N 130 1 N3 8 C 343 ? ? C2 8 C 343 ? ? O2 8 C 343 ? ? 117.40 121.90 -4.50 0.70 N 131 1 C2 8 C 343 ? ? N1 8 C 343 ? ? "C1'" 8 C 343 ? ? 125.52 118.80 6.72 1.10 N 132 1 C6 8 C 354 ? ? N1 8 C 354 ? ? C2 8 C 354 ? ? 117.88 120.30 -2.42 0.40 N 133 1 C4 8 G 377 ? ? N9 8 G 377 ? ? "C1'" 8 G 377 ? ? 134.73 126.50 8.23 1.30 N 134 1 N1 8 U 482 ? ? C2 8 U 482 ? ? O2 8 U 482 ? ? 127.59 122.80 4.79 0.70 N 135 1 N3 8 U 482 ? ? C2 8 U 482 ? ? O2 8 U 482 ? ? 117.37 122.20 -4.83 0.70 N 136 1 C2 8 U 482 ? ? N1 8 U 482 ? ? "C1'" 8 U 482 ? ? 125.56 117.70 7.86 1.20 N 137 1 N1 8 U 517 ? ? C2 8 U 517 ? ? O2 8 U 517 ? ? 127.19 122.80 4.39 0.70 N 138 1 C2 8 U 517 ? ? N1 8 U 517 ? ? "C1'" 8 U 517 ? ? 125.79 117.70 8.09 1.20 N 139 1 N1 8 C 519 ? ? C2 8 C 519 ? ? O2 8 C 519 ? ? 123.87 118.90 4.97 0.60 N 140 1 N3 8 C 519 ? ? C2 8 C 519 ? ? O2 8 C 519 ? ? 117.64 121.90 -4.26 0.70 N 141 1 C6 8 C 519 ? ? N1 8 C 519 ? ? "C1'" 8 C 519 ? ? 112.87 120.80 -7.93 1.20 N 142 1 C2 8 C 519 ? ? N1 8 C 519 ? ? "C1'" 8 C 519 ? ? 128.96 118.80 10.16 1.10 N 143 1 "O5'" 8 U 532 ? ? P 8 U 532 ? ? OP1 8 U 532 ? ? 118.33 110.70 7.63 1.20 N 144 1 C2 8 C 536 ? ? N1 8 C 536 ? ? "C1'" 8 C 536 ? ? 126.15 118.80 7.35 1.10 N 145 1 C2 8 C 589 ? ? N1 8 C 589 ? ? "C1'" 8 C 589 ? ? 125.58 118.80 6.78 1.10 N 146 1 C6 8 C 880 ? ? N1 8 C 880 ? ? C2 8 C 880 ? ? 117.77 120.30 -2.53 0.40 N 147 1 N1 8 G 885 ? ? C6 8 G 885 ? ? O6 8 G 885 ? ? 116.09 119.90 -3.81 0.60 N 148 1 C2 8 U 917 ? ? N1 8 U 917 ? ? "C1'" 8 U 917 ? ? 125.27 117.70 7.57 1.20 N 149 1 N3 8 G 954 ? ? C4 8 G 954 ? ? C5 8 G 954 ? ? 125.52 128.60 -3.08 0.50 N 150 1 N3 8 G 954 ? ? C4 8 G 954 ? ? N9 8 G 954 ? ? 130.49 126.00 4.49 0.60 N 151 1 C8 8 G 954 ? ? N9 8 G 954 ? ? "C1'" 8 G 954 ? ? 117.43 127.00 -9.57 1.30 N 152 1 C4 8 G 954 ? ? N9 8 G 954 ? ? "C1'" 8 G 954 ? ? 137.36 126.50 10.86 1.30 N 153 1 C6 8 C 975 ? ? N1 8 C 975 ? ? C2 8 C 975 ? ? 117.46 120.30 -2.84 0.40 N 154 1 N1 8 C 975 ? ? C2 8 C 975 ? ? O2 8 C 975 ? ? 123.05 118.90 4.15 0.60 N 155 1 N3 8 C 975 ? ? C2 8 C 975 ? ? O2 8 C 975 ? ? 116.87 121.90 -5.03 0.70 N 156 1 C2 8 C 975 ? ? N1 8 C 975 ? ? 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? 54.89 -76.95 113 1 UNK LK 413 ? ? -78.48 -89.61 114 1 UNK LK 425 ? ? -152.58 -31.20 115 1 LYS LK 473 ? ? -93.98 -60.96 116 1 HIS LL 168 ? ? 54.80 14.56 117 1 SER LL 252 ? ? -176.63 -178.88 118 1 ASP LL 258 ? ? 52.85 74.66 119 1 PRO LL 323 ? ? -69.98 -177.16 120 1 ASN LL 360 ? ? -98.74 34.60 121 1 ASN LL 448 ? ? -94.76 58.68 122 1 ARG LL 471 ? ? -94.55 51.29 123 1 HIS LL 509 ? ? -96.71 31.04 124 1 LEU LL 523 ? ? -95.31 34.13 125 1 SER LM 78 ? ? -89.58 49.07 126 1 ILE LM 79 ? ? -124.77 -50.81 127 1 PHE LM 161 ? ? -95.69 53.08 128 1 LYS LM 341 ? ? 52.65 76.58 129 1 TYR LM 358 ? ? -93.43 -60.67 130 1 TRP LN 85 ? ? 60.88 65.54 131 1 GLU LN 88 ? ? -94.67 -62.01 132 1 ASN LN 140 ? ? -94.74 -63.95 133 1 ASP LN 180 ? ? -96.22 -63.04 134 1 LYS LN 197 ? ? -151.69 -158.31 135 1 PHE LN 269 ? ? 71.99 -8.63 136 1 GLN LN 309 ? ? -142.02 15.46 137 1 LEU LN 328 ? ? -131.40 -38.79 138 1 SER LN 341 ? ? -161.28 -167.63 139 1 SER LN 395 ? ? -118.79 -167.29 140 1 ARG LN 579 ? ? 67.22 -1.48 141 1 PRO LN 664 ? ? -68.29 -176.76 142 1 ASN LN 666 ? ? 56.25 95.38 143 1 UNK LN 718 ? ? -151.93 -95.32 144 1 UNK LN 719 ? ? -105.58 -158.22 145 1 UNK LN 720 ? ? 56.01 -78.61 146 1 UNK LN 724 ? ? -82.84 -132.01 147 1 UNK LN 725 ? ? -155.25 71.15 148 1 UNK LN 729 ? ? -155.15 -149.27 149 1 SER LN 748 ? ? -148.40 -158.40 150 1 GLU LN 756 ? ? -126.28 -169.67 151 1 ILE LO 43 ? ? -103.32 -61.64 152 1 TRP LO 248 ? ? 61.00 67.06 153 1 ASP LO 346 ? ? 68.59 -1.30 154 1 GLU LO 429 ? ? -140.33 10.19 155 1 ALA LO 547 ? ? -65.16 3.22 156 1 ASP LO 558 ? ? -95.56 57.81 157 1 LYS LO 578 ? ? -97.85 34.87 158 1 GLU LO 609 ? ? 72.36 -8.54 159 1 LEU LO 612 ? ? -92.21 -62.36 160 1 LYS LO 674 ? ? 68.69 -4.20 161 1 LEU LP 265 ? ? -99.89 35.71 162 1 UNK LP 327 ? ? 57.08 -71.87 163 1 UNK LP 328 ? ? -68.01 81.43 164 1 UNK LP 344 ? ? -103.33 47.62 165 1 UNK LP 347 ? ? -100.54 48.89 166 1 UNK LP 349 ? ? -72.94 -88.92 167 1 UNK LP 351 ? ? 54.69 -154.11 168 1 UNK LP 352 ? ? -146.56 44.93 169 1 UNK LP 353 ? ? -69.16 94.80 170 1 UNK LP 366 ? ? -105.36 44.11 171 1 UNK LP 368 ? ? -145.18 15.94 172 1 UNK LP 380 ? ? 56.53 -71.88 173 1 UNK LP 384 ? ? -84.86 -110.94 174 1 UNK LP 391 ? ? -152.26 -46.47 175 1 UNK LP 397 ? ? -119.87 -116.43 176 1 UNK LP 399 ? ? -98.49 41.71 177 1 UNK LP 401 ? ? -150.72 -10.24 178 1 UNK LP 415 ? ? -92.61 54.13 179 1 UNK LP 419 ? ? -151.63 -98.93 180 1 UNK LP 424 ? ? -114.44 60.49 181 1 UNK LP 425 ? ? -152.34 0.57 182 1 UNK LP 426 ? ? -147.77 -12.76 183 1 UNK LP 430 ? ? -148.69 -26.22 184 1 ASP LQ 164 ? ? -100.91 -61.70 185 1 GLU LQ 174 ? ? -142.50 46.30 186 1 MET LQ 238 ? ? -92.91 -61.37 187 1 GLU LQ 249 ? ? -125.24 -168.74 188 1 LYS LQ 250 ? ? 60.71 64.64 189 1 SER LQ 252 ? ? -163.31 -162.10 190 1 UNK LQ 288 ? ? -115.26 -146.54 191 1 UNK LQ 289 ? ? -72.04 -73.42 192 1 UNK LQ 309 ? ? -100.14 43.97 193 1 ARG LQ 372 ? ? -131.41 -35.41 194 1 THR LQ 375 ? ? 71.90 -8.62 195 1 ARG LQ 391 ? ? 73.06 -11.94 196 1 LYS LQ 423 ? ? -128.39 -169.39 197 1 ILE LQ 425 ? ? -104.09 -60.25 198 1 CYS LQ 430 ? ? -140.76 32.49 199 1 HIS LQ 614 ? ? 59.79 74.14 200 1 ASP LQ 616 ? ? -94.56 -66.62 201 1 SER LQ 617 ? ? -172.43 134.86 202 1 ASP LQ 636 ? ? -98.13 32.92 203 1 ASP LQ 678 ? ? -91.76 46.63 204 1 UNK LQ 776 ? ? -84.59 -80.23 205 1 UNK LQ 778 ? ? -158.26 -64.38 206 1 UNK LQ 779 ? ? -75.04 -84.08 207 1 UNK LQ 780 ? ? -101.18 -130.69 208 1 UNK LQ 781 ? ? -107.40 -65.88 209 1 UNK LQ 782 ? ? 57.48 101.12 210 1 UNK LQ 784 ? ? -74.47 -167.90 211 1 LYS LQ 787 ? ? 56.59 95.47 212 1 ASN LQ 864 ? ? -95.49 35.18 213 1 LYS LS 231 ? ? 72.31 -7.31 214 1 HIS LS 348 ? ? -160.41 117.94 215 1 SER LS 366 ? ? 68.02 -5.59 216 1 ASN LS 369 ? ? -92.69 51.80 217 1 SER LS 503 ? ? 67.68 -5.81 218 1 PHE LT 27 ? ? -100.72 -62.80 219 1 ARG LT 28 ? ? -170.75 -176.56 220 1 VAL LT 33 ? ? -122.99 -56.08 221 1 TYR LT 94 ? ? -101.86 -167.22 222 1 ASP LT 134 ? ? -92.38 47.74 223 1 ILE LT 284 ? ? -124.38 -57.81 224 1 LEU LT 343 ? ? -140.08 -157.13 225 1 GLN LT 391 ? ? -94.49 52.57 226 1 ASP LT 459 ? ? -140.99 20.61 227 1 ASP LT 460 ? ? 57.81 80.38 228 1 GLN LT 575 ? ? 68.98 -5.58 229 1 PHE LT 759 ? ? -95.60 52.59 230 1 SER LT 763 ? ? -91.67 51.25 231 1 LYS LT 901 ? ? 65.03 -0.34 232 1 SER LU 9 ? ? 71.83 -9.36 233 1 ALA LU 10 ? ? 55.97 15.85 234 1 GLU LU 36 ? ? -95.92 -62.01 235 1 GLU LU 169 ? ? 38.98 47.39 236 1 ASN LU 242 ? ? 33.76 54.62 237 1 THR LU 255 ? ? -92.89 -61.69 238 1 ALA LU 274 ? ? 68.32 -4.65 239 1 GLU LU 282 ? ? -67.78 10.54 240 1 HIS LU 284 ? ? -86.02 40.86 241 1 PHE LU 404 ? ? -94.42 34.87 242 1 LEU LV 41 ? ? 60.19 65.40 243 1 GLN LV 51 ? ? 49.95 15.62 244 1 ASP LV 110 ? ? 35.34 58.98 245 1 GLN LV 118 ? ? -125.05 -167.84 246 1 ARG LV 121 ? ? -89.95 30.03 247 1 THR LV 135 ? ? -115.14 -168.97 248 1 SER LV 158 ? ? 60.53 67.60 249 1 ASN LV 174 ? ? 57.93 71.60 250 1 ARG LV 258 ? ? -141.42 41.53 251 1 ASN LV 287 ? ? 73.32 31.41 252 1 ASN LV 318 ? ? -141.00 13.56 253 1 GLU LV 334 ? ? -96.56 54.91 254 1 CYS LV 353 ? ? -100.03 41.24 255 1 GLU LW 77 ? ? 68.08 -4.39 256 1 LYS LW 131 ? ? -91.46 -63.70 257 1 THR LW 327 ? ? -97.29 32.89 258 1 ALA LW 344 ? ? -99.08 31.17 259 1 THR LW 443 ? ? -128.71 -169.56 260 1 SER LW 448 ? ? -97.05 34.11 261 1 ASP LZ 17 ? ? -162.47 116.53 262 1 THR LZ 67 ? ? -92.87 52.45 263 1 PHE LZ 182 ? ? 36.53 46.84 264 1 SER NG 22 ? ? -126.60 -168.48 265 1 LYS NG 36 ? ? -79.85 -164.38 266 1 ILE NG 39 ? ? -95.80 -65.29 267 1 ASP NK 120 ? ? -92.57 51.95 268 1 ASN NK 130 ? ? -92.22 53.56 269 1 ASP SC 248 ? ? -93.78 58.58 270 1 ARG SC 322 ? ? 65.87 -3.37 271 1 TYR SD 118 ? ? -143.37 31.32 272 1 MET SD 236 ? ? 44.78 71.23 273 1 PRO SD 247 ? ? -68.39 1.07 274 1 ASP SD 248 ? ? -100.15 61.21 275 1 THR SD 279 ? ? -140.90 -0.37 276 1 LEU SD 306 ? ? -91.82 49.71 277 1 GLU SE 72 ? ? -85.63 46.10 278 1 GLN SF 32 ? ? -131.25 -30.19 279 1 LEU SG 211 ? ? -92.39 -60.43 280 1 LYS SG 225 ? ? 70.87 -6.78 281 1 GLU SG 238 ? ? 60.57 69.94 282 1 ASP SG 301 ? ? -92.92 33.74 283 1 ASN SG 419 ? ? -140.93 29.01 284 1 TRP SG 492 ? ? -95.52 31.05 285 1 ASN SH 16 ? ? 38.85 53.43 286 1 ASN SH 42 ? ? -113.04 74.92 287 1 VAL SH 82 ? ? -94.43 -62.85 288 1 ALA SH 288 ? ? 69.69 -9.66 289 1 LEU SI 139 ? ? -100.36 78.72 290 1 UNK SI 402 ? ? -99.39 32.12 291 1 UNK SI 408 ? ? -101.31 41.17 292 1 UNK SI 409 ? ? -154.42 -51.97 293 1 UNK SI 411 ? ? 55.55 -157.52 294 1 UNK SI 412 ? ? -137.24 -140.55 295 1 UNK SI 413 ? ? -93.28 49.11 296 1 UNK SI 415 ? ? -141.09 -120.30 297 1 UNK SI 416 ? ? -155.69 -7.96 298 1 ARG SI 779 ? ? -94.92 -60.16 299 1 PHE SI 783 ? ? 60.03 71.78 300 1 GLN SI 900 ? ? -80.85 -158.45 301 1 ASN SI 944 ? ? 69.01 -0.93 302 1 LYS SI 977 ? ? -121.76 -54.34 303 1 SER SI 981 ? ? -94.59 -61.25 304 1 LYS SI 1026 ? ? 66.33 -0.95 305 1 ASN SI 1043 ? ? 60.27 63.20 306 1 SER SJ 49 ? ? -91.32 50.70 307 1 LEU SJ 50 ? ? -93.66 51.13 308 1 LEU SJ 148 ? ? 59.73 18.71 309 1 LYS SJ 195 ? ? -97.61 35.33 310 1 LEU SK 148 ? ? 67.97 -5.17 311 1 PRO SK 166 ? ? -86.50 -159.39 312 1 ASP SK 214 ? ? -91.20 53.37 313 1 ALA SK 217 ? ? -143.54 34.52 314 1 PHE SL 52 ? ? -80.98 -158.32 315 1 ASN SL 56 ? ? 55.42 73.14 316 1 LEU SL 91 ? ? 70.12 -5.90 317 1 ALA SM 37 ? ? -95.78 -63.29 318 1 ASP SM 59 ? ? -68.83 4.49 319 1 THR SM 80 ? ? -99.96 33.00 320 1 SER SM 93 ? ? -66.49 -71.86 321 1 ARG SM 94 ? ? -170.66 129.22 322 1 ASP SM 95 ? ? 51.63 74.09 323 1 ASN SM 121 ? ? 58.25 19.31 324 1 HIS SM 159 ? ? 33.98 48.50 325 1 LYS SM 269 ? ? 45.23 26.41 326 1 ASP SM 270 ? ? -144.05 18.04 327 1 PHE SM 280 ? ? -93.01 49.70 328 1 SER SN 80 ? ? 59.04 18.43 329 1 TYR SN 144 ? ? -92.42 49.30 330 1 SER SN 208 ? ? -128.49 -166.72 331 1 ARG SO 105 ? ? -140.14 44.71 332 1 SER SO 112 ? ? -99.45 36.57 333 1 THR SO 146 ? ? -99.57 36.71 334 1 ARG SO 176 ? ? -93.91 59.36 335 1 LEU SO 177 ? ? -103.87 41.66 336 1 LYS SQ 203 ? ? -134.46 -30.14 337 1 ASN SR 65 ? ? 35.83 41.80 338 1 ASN SR 89 ? ? 46.52 78.42 339 1 ASP SR 90 ? ? -30.98 -25.51 340 1 ASP SR 97 ? ? -117.25 -71.53 341 1 GLU SR 98 ? ? -170.52 123.11 342 1 ASN SR 99 ? ? 49.85 72.62 343 1 GLU SR 138 ? ? 33.32 55.09 344 1 PRO SS 314 ? ? -68.34 79.67 345 1 UNK SS 351 ? ? -108.84 42.75 346 1 UNK SS 357 ? ? -149.63 -31.18 347 1 UNK SS 360 ? ? -152.77 -8.33 348 1 UNK SS 362 ? ? -155.38 -8.54 349 1 UNK SS 370 ? ? 55.31 -127.50 350 1 UNK SS 374 ? ? -105.34 48.63 351 1 UNK SS 375 ? ? -82.31 -120.13 352 1 UNK SS 377 ? ? -90.66 -144.32 353 1 UNK SS 407 ? ? -154.18 -59.87 354 1 ASN ST 56 ? ? -111.24 77.72 355 1 UNK ST 239 ? ? -100.14 62.68 356 1 UNK ST 240 ? ? -150.77 -131.55 357 1 UNK ST 275 ? ? -140.45 36.00 358 1 UNK ST 279 ? ? -83.59 -119.58 359 1 UNK ST 280 ? ? -100.47 73.95 360 1 UNK ST 282 ? ? -85.91 -139.17 361 1 UNK ST 287 ? ? -151.48 -115.10 362 1 UNK ST 289 ? ? -156.63 33.50 363 1 UNK ST 293 ? ? -152.32 9.86 364 1 UNK ST 305 ? ? -132.09 -60.51 365 1 UNK ST 385 ? ? 55.35 -114.52 366 1 UNK ST 393 ? ? -110.56 75.67 367 1 UNK ST 395 ? ? -132.20 -118.43 368 1 UNK ST 413 ? ? -71.83 -90.40 369 1 UNK ST 415 ? ? -97.24 33.61 370 1 LYS ST 419 ? ? 55.80 -60.63 371 1 ASP ST 587 ? ? -92.52 -60.38 372 1 PHE ST 606 ? ? 38.55 44.80 373 1 THR ST 612 ? ? -79.00 -162.31 374 1 ILE ST 614 ? ? 39.97 77.25 375 1 ALA ST 626 ? ? -100.86 74.56 376 1 ALA ST 656 ? ? -103.44 40.62 377 1 LYS SY 10 ? ? -99.88 37.53 378 1 LYS SY 11 ? ? -63.11 -73.60 379 1 GLN SY 12 ? ? 178.22 159.12 380 1 ASN SY 59 ? ? 60.22 82.66 381 1 ASP SY 88 ? ? -109.65 41.08 382 1 ASN SY 153 ? ? 33.68 57.77 383 1 MET SY 185 ? ? 33.95 66.72 384 1 LYS SY 226 ? ? -81.01 -70.96 385 1 LYS SY 246 ? ? -92.54 54.75 386 1 ASN SZ 241 ? ? -99.55 38.42 387 1 LYS SZ 313 ? ? -111.85 74.32 388 1 ASN NH 155 ? ? -92.75 54.01 389 1 PRO NH 165 ? ? -81.58 -159.84 390 1 ILE NH 241 ? ? -123.43 -62.23 391 1 LYS NH 244 ? ? -96.95 34.03 392 1 LYS NH 245 ? ? -96.34 34.04 393 1 SER NH 382 ? ? -98.72 32.61 394 1 CYS NH 435 ? ? -95.27 -61.80 395 1 ASN NH 445 ? ? -146.83 41.68 396 1 ASP NH 505 ? ? -91.25 54.19 397 1 VAL NH 690 ? ? -121.61 -63.94 398 1 PRO NH 947 ? ? -96.68 48.38 399 1 ASP NH 972 ? ? -95.01 -60.39 400 1 ASN NH 1203 ? ? -91.65 53.42 401 1 VAL NH 1207 ? ? -124.42 -53.00 402 1 ILE NH 1232 ? ? -123.33 -63.32 403 1 LEU NI 147 ? ? -98.92 31.47 404 1 ILE SU 163 ? ? -91.74 -62.40 405 1 SER SU 172 ? ? -160.15 116.28 406 1 GLU SU 173 ? 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