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_citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Nagao, R.' 1 ? primary 'Kato, K.' 2 ? primary 'Kumazawa, M.' 3 ? primary 'Ifuku, K.' 4 ? primary 'Yokono, M.' 5 ? primary 'Suzuki, T.' 6 ? primary 'Dohmae, N.' 7 ? primary 'Akita, F.' 8 ? primary 'Akimoto, S.' 9 ? primary 'Miyazaki, N.' 10 ? primary 'Shen, J.R.' 11 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 7VD6 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? 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'Chaetoceros gracilis' 184592 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A679BXP6_9STRA A0A679BXP6 ? 1 ;MKLAVAALLVASAAAFAPAPASKASTSLKVSEIELGVTEPLGVYDPLGWLESEPEAFERRRAVERKHGRVAMAAVVGTIV HNNHIVFDGYLSPSNNLKFSDIPTGVDGIRAIPTAGLAQILAFFALVELAWMPASKYDGDYGVGYFGTDIKDPEEKARKL NVELNNGRAAMMGIMGNMVAEVLTGQTMYEQYASGHISPFGDGQGVF ; 1 2 PDB 7VD6 7VD6 ? 2 ? 1 3 PDB 7VD6 7VD6 ? 3 ? 1 4 PDB 7VD6 7VD6 ? 4 ? 1 5 PDB 7VD6 7VD6 ? 5 ? 1 6 PDB 7VD6 7VD6 ? 6 ? 1 7 PDB 7VD6 7VD6 ? 7 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 7VD6 11 1 ? 207 ? 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'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CLA non-polymer . 'CHLOROPHYLL A' ? 'C55 H72 Mg N4 O5' 893.489 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DD6 non-polymer . "(3S,3'R,5R,6S,7cis)-7',8'-didehydro-5,6-dihydro-5,6-epoxy-beta,beta-carotene-3,3'-diol" Diadinoxanthin 'C40 H54 O3' 582.855 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 KC1 non-polymer . 'Chlorophyll c1' ? 'C35 H30 Mg N4 O5' 610.941 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LHG non-polymer . 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE ? 'C38 H75 O10 P' 722.970 LMG non-polymer . 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE ? 'C45 H86 O10' 787.158 LMU D-saccharide . DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE ? 'C24 H46 O11' 510.615 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 SQD non-polymer . '1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL' SULFOQUINOVOSYLDIACYLGLYCEROL 'C41 H78 O12 S' 795.116 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 UNL non-polymer . 'UNKNOWN LIGAND' ? ? ? VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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MG ? ? 16 GLN 121 16 KC1 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? ? metalc36 metalc ? ? F GLU 129 OE1 ? ? ? 1_555 DD KC1 . MG ? ? 16 GLU 130 16 KC1 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.191 ? ? metalc37 metalc ? ? F GLU 166 OE1 ? ? ? 1_555 ED CLA . MG ? ? 16 GLU 167 16 CLA 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? ? metalc38 metalc ? ? F ASN 169 OD1 ? ? ? 1_555 GD KC1 . MG ? ? 16 ASN 170 16 KC1 308 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.195 ? ? metalc39 metalc ? ? FD CLA . MG ? ? ? 1_555 EH HOH . O ? ? 16 CLA 307 16 HOH 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? ? metalc40 metalc ? ? G GLU 64 OE1 ? ? ? 1_555 RD CLA . MG ? ? 17 GLU 64 17 CLA 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.101 ? ? metalc41 metalc ? ? G GLN 119 OE1 ? ? ? 1_555 UD KC1 . MG ? ? 17 GLN 119 17 KC1 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.106 ? ? metalc42 metalc ? ? G GLU 128 OE1 ? ? ? 1_555 VD KC1 . MG ? ? 17 GLU 128 17 KC1 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? ? metalc43 metalc ? ? G GLU 128 OE2 ? ? ? 1_555 VD KC1 . MG ? ? 17 GLU 128 17 KC1 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.430 ? ? metalc44 metalc ? ? G GLU 163 OE1 ? ? ? 1_555 WD CLA . MG ? ? 17 GLU 163 17 CLA 307 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.144 ? ? metalc45 metalc ? ? G ASN 166 OD1 ? ? ? 1_555 YD KC1 . MG ? ? 17 ASN 166 17 KC1 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.137 ? ? metalc46 metalc ? ? XD CLA . MG ? ? ? 1_555 FH HOH . O ? ? 17 CLA 308 17 HOH 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? ? metalc47 metalc ? ? ZD CLA . MG ? ? ? 1_555 FH HOH . O ? ? 17 CLA 310 17 HOH 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.134 ? ? metalc48 metalc ? ? H GLU 64 OE1 ? ? ? 1_555 ME CLA . MG ? ? 18 GLU 64 18 CLA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.172 ? ? metalc49 metalc ? ? H GLN 119 OE1 ? ? ? 1_555 PE KC1 . MG ? ? 18 GLN 119 18 KC1 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.151 ? ? metalc50 metalc ? ? H GLU 128 OE1 ? ? ? 1_555 RE KC1 . MG ? ? 18 GLU 128 18 KC1 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.244 ? ? metalc51 metalc ? ? H ASN 166 OD1 ? ? ? 1_555 UE KC1 . MG ? ? 18 ASN 166 18 KC1 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? ? metalc52 metalc ? ? TE CLA . MG ? ? ? 1_555 GH HOH . O ? ? 18 CLA 308 18 HOH 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.190 ? ? metalc53 metalc ? ? I ALA 58 O ? ? ? 1_555 NF CLA . MG ? ? 19 ALA 58 19 CLA 310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.463 ? ? metalc54 metalc ? ? I GLU 112 OE1 ? ? ? 1_555 EF CLA . MG ? ? 19 GLU 112 19 CLA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.155 ? ? metalc55 metalc ? ? I GLN 165 OE1 ? ? ? 1_555 HF CLA . MG ? ? 19 GLN 165 19 CLA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.973 ? ? metalc56 metalc ? ? I GLU 174 OE1 ? ? ? 1_555 IF CLA . MG ? ? 19 GLU 174 19 CLA 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.184 ? ? metalc57 metalc ? ? I GLU 221 OE1 ? ? ? 1_555 JF CLA . MG ? ? 19 GLU 221 19 CLA 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? ? metalc58 metalc ? ? I GLN 238 OE1 ? ? ? 1_555 MF CLA . MG ? ? 19 GLN 238 19 CLA 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.160 ? ? metalc59 metalc ? ? GF CLA . MG ? ? ? 1_555 HH HOH . O ? ? 19 CLA 303 19 HOH 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? ? metalc60 metalc ? ? KF CLA . MG ? ? ? 1_555 RF LHG . O4 ? ? 19 CLA 307 19 LHG 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.983 ? ? metalc61 metalc ? ? 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MG ? ? 21 GLN 171 21 CLA 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.200 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id GLY _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 53 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id J _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id GLY _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 53 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id 20 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 TRP _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 54 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 J _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 TRP _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 54 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 20 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle -7.92 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? 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DD KC1 . ? 16 KC1 305 ? 1_555 NA ? DD KC1 . ? 16 KC1 305 ? 1_555 90.6 ? 356 ND ? DD KC1 . ? 16 KC1 305 ? 1_555 MG ? DD KC1 . ? 16 KC1 305 ? 1_555 NA ? DD KC1 . ? 16 KC1 305 ? 1_555 92.7 ? 357 OE1 ? F GLU 129 ? 16 GLU 130 ? 1_555 MG ? DD KC1 . ? 16 KC1 305 ? 1_555 NC ? DD KC1 . ? 16 KC1 305 ? 1_555 98.5 ? 358 NB ? DD KC1 . ? 16 KC1 305 ? 1_555 MG ? DD KC1 . ? 16 KC1 305 ? 1_555 NC ? DD KC1 . ? 16 KC1 305 ? 1_555 93.7 ? 359 ND ? DD KC1 . ? 16 KC1 305 ? 1_555 MG ? DD KC1 . ? 16 KC1 305 ? 1_555 NC ? DD KC1 . ? 16 KC1 305 ? 1_555 80.6 ? 360 NA ? DD KC1 . ? 16 KC1 305 ? 1_555 MG ? DD KC1 . ? 16 KC1 305 ? 1_555 NC ? DD KC1 . ? 16 KC1 305 ? 1_555 164.7 ? 361 OE1 ? F GLU 166 ? 16 GLU 167 ? 1_555 MG ? ED CLA . ? 16 CLA 306 ? 1_555 NA ? ED CLA . ? 16 CLA 306 ? 1_555 74.2 ? 362 OE1 ? F GLU 166 ? 16 GLU 167 ? 1_555 MG ? ED CLA . ? 16 CLA 306 ? 1_555 NB ? ED CLA . ? 16 CLA 306 ? 1_555 81.3 ? 363 NA ? ED CLA . ? 16 CLA 306 ? 1_555 MG ? ED CLA . ? 16 CLA 306 ? 1_555 NB ? 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