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K FRU 5 K FRU 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.355 ? ? covale36 covale both ? O FRU . O6 ? ? ? 1_555 O FRU . C2 ? ? L FRU 1 L FRU 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.355 ? ? covale37 covale both ? O FRU . O6 ? ? ? 1_555 O FRU . C2 ? ? L FRU 2 L FRU 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.357 ? ? covale38 covale both ? O FRU . O6 ? ? ? 1_555 O FRU . C2 ? ? L FRU 3 L FRU 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.355 ? ? metalc1 metalc ? ? E GLU 280 OE1 ? ? ? 1_555 P MG . MG ? ? B GLU 262 B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? ? metalc2 metalc ? ? E GLU 280 OE2 ? ? ? 1_555 P MG . MG ? ? B GLU 262 B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? ? metalc3 metalc ? ? E TYR 291 O ? ? ? 1_555 P MG . MG ? ? B TYR 273 B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? ? metalc4 metalc ? ? E SER 417 O ? ? ? 1_555 P MG . MG ? ? B SER 399 B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.686 ? ? metalc5 metalc ? ? E ASN 419 OD1 ? ? ? 1_555 P MG . MG ? ? B ASN 401 B MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? ? metalc6 metalc ? ? P MG . MG ? ? ? 1_555 F ASN 689 OD1 ? ? B MG 601 A ASN 664 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.998 ? ? metalc7 metalc ? ? F ASP 862 OD1 ? ? ? 1_555 Q MG . MG ? ? A ASP 837 A MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.803 ? ? metalc8 metalc ? ? F ASP 864 OD1 ? ? ? 1_555 Q MG . MG ? ? A ASP 839 A MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? ? metalc9 metalc ? ? F ASN 866 OD1 ? ? ? 1_555 Q MG . MG ? ? A ASN 841 A MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.958 ? ? metalc10 metalc ? ? F VAL 868 O ? ? ? 1_555 Q MG . MG ? ? A VAL 843 A MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? ? metalc11 metalc ? ? F ASP 873 OD1 ? ? ? 1_555 Q MG . MG ? ? A ASP 848 A MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.492 ? ? metalc12 metalc ? ? F ASP 873 OD2 ? ? ? 1_555 Q MG . MG ? ? A ASP 848 A MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.972 ? ? metalc13 metalc ? ? G GLU 280 OE1 ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? J GLU 262 J MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? ? metalc14 metalc ? ? G GLU 280 OE2 ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? J GLU 262 J MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? ? metalc15 metalc ? ? G TYR 291 O ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? J TYR 273 J MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? ? metalc16 metalc ? ? G SER 417 O ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? J SER 399 J MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.685 ? ? metalc17 metalc ? ? G ASN 419 OD1 ? ? ? 1_555 R MG . MG ? ? J ASN 401 J MG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? ? metalc18 metalc ? ? R MG . MG ? ? ? 1_555 H ASN 689 OD1 ? ? J MG 601 I ASN 664 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.013 ? ? metalc19 metalc ? ? H ASP 862 OD1 ? ? ? 1_555 S MG . MG ? ? I ASP 837 I MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.804 ? ? metalc20 metalc ? ? H ASP 864 OD1 ? ? ? 1_555 S MG . MG ? ? I ASP 839 I MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? ? metalc21 metalc ? ? H ASN 866 OD1 ? ? ? 1_555 S MG . MG ? ? I ASN 841 I MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.959 ? ? metalc22 metalc ? ? H VAL 868 O ? ? ? 1_555 S MG . MG ? ? I VAL 843 I MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.545 ? ? metalc23 metalc ? ? H ASP 873 OD1 ? ? ? 1_555 S MG . MG ? ? I ASP 848 I MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.492 ? ? metalc24 metalc ? ? H ASP 873 OD2 ? ? ? 1_555 S MG . MG ? ? I ASP 848 I MG 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.972 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 4 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 6 ? AB1 ? 7 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 5 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 8 ? AB6 ? 5 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 5 ? AB9 ? 7 ? AC1 ? 7 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 3 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 4 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 4 ? AD3 ? 6 ? AD4 ? 7 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 2 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 2 ? AD9 ? 5 ? AE1 ? 2 ? AE2 ? 24 ? AE3 ? 2 ? AE4 ? 2 ? AE5 ? 2 ? AE6 ? 2 ? AE7 ? 2 ? AE8 ? 2 ? AE9 ? 2 ? AF1 ? 2 ? AF2 ? 2 ? AF3 ? 2 ? AF4 ? 5 ? AF5 ? 2 ? AF6 ? 24 ? AF7 ? 2 ? AF8 ? 2 ? AF9 ? 2 ? AG1 ? 2 ? AG2 ? 2 ? 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anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD3 4 5 ? anti-parallel AD3 5 6 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD4 5 6 ? anti-parallel AD4 6 7 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? parallel AD9 4 5 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE2 4 5 ? anti-parallel AE2 5 6 ? anti-parallel AE2 6 7 ? anti-parallel AE2 7 8 ? anti-parallel AE2 8 9 ? anti-parallel AE2 9 10 ? 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anti-parallel AF6 13 14 ? anti-parallel AF6 14 15 ? anti-parallel AF6 15 16 ? anti-parallel AF6 16 17 ? anti-parallel AF6 17 18 ? anti-parallel AF6 18 19 ? anti-parallel AF6 19 20 ? anti-parallel AF6 20 21 ? anti-parallel AF6 21 22 ? anti-parallel AF6 22 23 ? anti-parallel AF6 23 24 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG3 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 PHE A 59 ? 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RELION 3.1 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 3 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'Wellcome Trust' 'United Kingdom' 215064/Z/18/Z 1 'Wellcome Trust' 'United Kingdom' 214222/Z/18/Z 2 'Wellcome Trust' 'United Kingdom' 108466/Z/15/Z 3 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero I 5 FRU 1 H FRU 1 H FRU 12 n I 5 FRU 2 H FRU 2 H FRU 11 n I 5 FRU 3 H FRU 3 H FRU 10 n I 5 FRU 4 H FRU 4 H FRU 9 n I 5 FRU 5 H FRU 5 H FRU 8 n I 5 FRU 6 H FRU 6 H FRU 7 n I 5 FRU 7 H FRU 7 H FRU 6 n I 5 FRU 8 H FRU 8 H FRU 5 n I 5 FRU 9 H FRU 9 H FRU 4 n I 5 FRU 10 H FRU 10 H FRU 3 n I 5 FRU 11 H FRU 11 H FRU 2 n I 5 FRU 12 H FRU 12 H FRU 1 n I 5 FRU 13 H FRU 13 H FRU 13 n J 6 FRU 1 F FRU 1 F FRU 5 n J 6 FRU 2 F FRU 2 F FRU 4 n J 6 FRU 3 F FRU 3 F FRU 3 n J 6 FRU 4 F FRU 4 F FRU 2 n J 6 FRU 5 F FRU 5 F FRU 1 n K 6 FRU 1 N FRU 1 N FRU 5 n K 6 FRU 2 N FRU 2 N FRU 4 n K 6 FRU 3 N FRU 3 N FRU 3 n K 6 FRU 4 N FRU 4 N FRU 2 n K 6 FRU 5 N FRU 5 N FRU 1 n L 7 FRU 1 C FRU 1 C FRU 6 n L 7 FRU 2 C FRU 2 C FRU 5 n L 7 FRU 3 C FRU 3 C FRU 4 n L 7 FRU 4 C FRU 4 C FRU 3 n L 7 FRU 5 C FRU 5 C FRU 2 n L 7 FRU 6 C FRU 6 C FRU 1 n L 7 FRU 7 C FRU 7 C FRU 7 n M 8 FRU 1 D FRU 1 D FRU 4 n M 8 FRU 2 D FRU 2 D FRU 3 n M 8 FRU 3 D FRU 3 D FRU 2 n M 8 FRU 4 D FRU 4 D FRU 1 n N 7 FRU 1 K FRU 1 K FRU 6 n N 7 FRU 2 K FRU 2 K FRU 5 n N 7 FRU 3 K FRU 3 K FRU 4 n N 7 FRU 4 K FRU 4 K FRU 3 n N 7 FRU 5 K FRU 5 K FRU 2 n N 7 FRU 6 K FRU 6 K FRU 1 n N 7 FRU 7 K FRU 7 K FRU 7 n O 8 FRU 1 L FRU 1 L FRU 4 n O 8 FRU 2 L FRU 2 L FRU 3 n O 8 FRU 3 L FRU 3 L FRU 2 n O 8 FRU 4 L FRU 4 L FRU 1 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier FRU 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DFrufb FRU 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-fructofuranose FRU 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Fruf FRU 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Fru # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 5 'DFrufb2-6DFrufb2-6DFrufb2-6DFrufb2-6DFrufb2-6DFrufb2-6[DFrufb2-1]DFrufb2-6DFrufb2-6DFrufb2-6DFrufb2-6DFrufb2-6DFrufb2-' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 5 'WURCS=2.0/1,13,12/[ha122h-2b_2-5]/1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1-1/a6-b2_b6-c2_c6-d2_d6-e2_e6-f2_f1-g2_f6-h2_h6-i2_i6-j2_j6-k2_k6-l2_l6-m2' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 5 ;[][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{}}}}}}}}}}}} ; LINUCS PDB-CARE ? 4 6 DFrufb2-6DFrufb2-6DFrufb2-6DFrufb2-6DFrufb2- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 6 'WURCS=2.0/1,5,4/[ha122h-2b_2-5]/1-1-1-1-1/a6-b2_b6-c2_c6-d2_d6-e2' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 6 '[][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{}}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 7 7 'DFrufb2-6DFrufb2-6DFrufb2-6DFrufb2-6[DFrufb2-1]DFrufb2-6DFrufb2-' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 8 7 'WURCS=2.0/1,7,6/[ha122h-2b_2-5]/1-1-1-1-1-1-1/a6-b2_b1-c2_b6-d2_d6-e2_e6-f2_f6-g2' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 9 7 '[][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{}}}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 10 8 DFrufb2-6DFrufb2-6DFrufb2-6DFrufb2- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 11 8 'WURCS=2.0/1,4,3/[ha122h-2b_2-5]/1-1-1-1/a6-b2_b6-c2_c6-d2' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 12 8 '[][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{[(6+2)][b-D-Fruf]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 5 2 FRU C2 O2 1 FRU O6 HO6 sing ? 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_pdbx_entity_instance_feature.seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id FRU _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.feature_type 'SUBJECT OF INVESTIGATION' _pdbx_entity_instance_feature.details ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 9 _pdbx_entity_nonpoly.name 'MAGNESIUM ION' _pdbx_entity_nonpoly.comp_id MG # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 'electron microscopy' ? 2 1 'gel filtration' ? #