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'High Five' ? ? ? ? ? ? ? ? ? pACEBAC1 ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A024LB08_ECOLX A0A024LB08 ? 1 ;MSDVAETLDPLRLPLQGERLIEASAGTGKTFTIAALYLRLLLGLGGSAAFPRPLTVEELLVVTFTEAATAELRGRIRSNI HELRIACLRETTDNPLYERLLEEIDDKAQAAQWLLLAERQMDEAAVFTIHGFCQRMLNLNAFESGMLFEQQLIEDESLLR YQACADFWRRHCYPLPREIAQVVFETWKGPQALLRDINRYLQGEAPVIKAPPPDDETLASRHAQIVARIDTVKQQWRDAV GELDALIESSGIDRRKFNRSNQAKWIDKISAWAEEETNSYQLPESLEKFSQRFLEDRTKAGGETPRHPLFEAIDQLLAEP LSIRDLVITRALAEIRETVAREKRRRGELGFDDMLSRLDSALRSESGEVLAAAIRTRFPVAMIDEFQDTDPQQYRIFRRI WHHQPETALLLIGDPKQAIYAFRGADIFTYMKARSEVHAHYTLDTNWRSAPGMVNSVNKLFSQTDDAFMFREIPFIPVKS AGKNQALRFVFKGETQPAMKMWLMEGESCGVGDYQSTMAQVCAAQIRDWLQAGQRGEALLMNGDDARPVRASDISVLVRS RQEAAQVRDALTLLEIPSVYLSNRDSVFETLEAQEMLWLLQAVMTPERENTLRSALATSMMGLNALDIETLNNDEHAWDV VVEEFDGYRQIWRKRGVMPMLRALMSARNIAENLLATAGGERRLTDILHISELLQEAGTQLESEHALVRWLSQHILEPDS NASSQQMRLESDKHLVQIVTIHKSKGLEYPLVWLPFITNFRVQEQAFYHDRHSFEAVLDLNAAPESVDLAEAERLAEDLR LLYVALTRSVWHCSLGVAPLVRRRGDKKGDTDVHQSALGRLLQKGEPQDAAGLRTCIEALCDDDIAWQTAQTGDNQPWQV NDVSTAELNAKTLQRLPGDNWRVTSYSGLQQRGHGIAQDLMPRLDVDAAGVASVVEEPTLTPHQFPRGASPGTFLHSLFE DLDFTQPVDPNWVREKLELGGFESQWEPVLTEWITAVLQAPLNETGVSLSQLSARNKQVEMEFYLPISEPLIASQLDTLI RQFDPLSAGCPPLEFMQVRGMLKGFIDLVFRHEGRYYLLDYKSNWLGEDSSAYTQQAMAAAMQAHRYDLQYQLYTLALHR YLRHRIADYDYEHHFGGVIYLFLRGVDKEHPQQGIYTTRPNAGLIALMDEMFAGMTLEEA ; 1 2 UNP RECC_ECOLI P07648 ? 2 ;MLRVYHSNRLDVLEALMEFIVERERLDDPFEPEMILVQSTGMAQWLQMTLSQKFGIAANIDFPLPASFIWDMFVRVLPEI PKESAFNKQSMSWKLMTLLPQLLEREDFTLLRHYLTDDSDKRKLFQLSSKAADLFDQYLVYRPDWLAQWETGHLVEGLGE AQAWQAPLWKALVEYTHQLGQPRWHRANLYQRFIETLESATTCPPGLPSRVFICGISALPPVYLQALQALGKHIEIHLLF TNPCRYYWGDIKDPAYLAKLLTRQRRHSFEDRELPLFRDSENAGQLFNSDGEQDVGNPLLASWGKLGRDYIYLLSDLESS QELDAFVDVTPDNLLHNIQSDILELENRAVAGVNIEEFSRSDNKRPLDPLDSSITFHVCHSPQREVEVLHDRLLAMLEED PTLTPRDIIVMVADIDSYSPFIQAVFGSAPADRYLPYAISDRRARQSHPVLEAFISLLSLPDSRFVSEDVLALLDVPVLA ARFDITEEGLRYLRQWVNESGIRWGIDDDNVRELELPATGQHTWRFGLTRMLLGYAMESAQGEWQSVLPYDESSGLIAEL VGHLASLLMQLNIWRRGLAQERPLEEWLPVCRDMLNAFFLPDAETEAAMTLIEQQWQAIIAEGLGAQYGDAVPLSLLRDE LAQRLDQERISQRFLAGPVNICTLMPMRSIPFKVVCLLGMNDGVYPRQLAPLGFDLMSQKPKRGDRSRRDDDRYLFLEAL ISAQQKLYISYIGRSIQDNSERFPSVLVQELIDYIGQSHYLPGDEALNCDESEARVKAHLTCLHTRMPFDPQNYQPGERQ SYAREWLPAASQAGKAHSEFVQPLPFTLPETVPLETLQRFWAHPVRAFFQMRLQVNFRTEDSEIPDTEPFILEGLSRYQI NQQLLNALVEQDDAERLFRRFRAAGDLPYGAFGEIFWETQCQEMQQLADRVIACRQPGQSMEIDLACNGVQITGWLPQVQ PDGLLRWRPSLLSVAQGMQLWLEHLVYCASGGNGESRLFLRKDGEWRFPPLAAEQALHYLSQLIEGYREGMSAPLLVLPE SGGAWLKTCYDAQNDAMLDDDSTLQKARTKFLQAYEGNMMVRGEGDDIWYQRLWRQLTPETMEAIVEQSQRFLLPLFRFN QS ; 1 3 UNP RECD_ECOLI P04993 ? 3 ;MKLQKQLLEAVEHKQLRPLDVQFALTVAGDEHPAVTLAAALLSHDAGEGHVCLPLSRLENNEASHPLLATCVSEIGELQN WEECLLASQAVSRGDEPTPMILCGDRLYLNRMWCNERTVARFFNEVNHAIEVDEALLAQTLDKLFPVSDEINWQKVAAAV ALTRRISVISGGPGTGKTTTVAKLLAALIQMADGERCRIRLAAPTGKAAARLTESLGKALRQLPLTDEQKKRIPEDASTL HRLLGAQPGSQRLRHHAGNPLHLDVLVVDEASMIDLPMMSRLIDALPDHARVIFLGDRDQLASVEAGAVLGDICAYANAG FTAERARQLSRLTGTHVPAGTGTEAASLRDSLCLLQKSYRFGSDSGIGQLAAAINRGDKTAVKTVFQQDFTDIEKRLLQS GEDYIAMLEEALAGYGRYLDLLQARAEPDLIIQAFNEYQLLCALREGPFGVAGLNERIEQFMQQKRKIHRHPHSRWYEGR PVMIARNDSALGLFNGDIGIALDRGQGTRVWFAMPDGNIKSVQPSRLPEHETTWAMTVHKSQGSEFDHAALILPSQRTPV VTRELVYTAVTRARRRLSLYADERILSAAIATRTERRSGLAALFSSRE ; 1 4 UNP GP59_BPT7 P20406 ? 4 MSRDLVTIPRDVWNDIQGYIDSLERENDSLKNQLMEADEYVAELEEKLNGTS 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8B1R B 1 ? 1180 ? A0A024LB08 1 ? 1180 ? 1 1180 2 2 8B1R C 1 ? 1122 ? P07648 1 ? 1122 ? 1 1122 3 3 8B1R D 1 ? 608 ? P04993 1 ? 608 ? 1 608 4 4 8B1R P 1 ? 52 ? P20406 1 ? 52 ? 1 52 5 4 8B1R Q 1 ? 52 ? P20406 1 ? 52 ? 1 52 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 8B1R _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 8B1R _struct.title 'RecBCD in complex with the phage protein gp5.9' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8B1R _struct_keywords.text 'Homologous recombination, DNA repair, phage, Helicase, Nuclease, Inhibitor, Protein complex, Enzyme, DNA mimic, DNA BINDING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA BINDING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 4 ? F N N 5 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 28 ? GLY A 43 ? GLY B 28 GLY B 43 1 ? 16 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 65 ? GLU A 90 ? THR B 65 GLU B 90 1 ? 26 HELX_P HELX_P3 AA3 ASN A 94 ? ILE A 104 ? ASN B 94 ILE B 104 1 ? 11 HELX_P HELX_P4 AA4 ASP A 106 ? GLN A 120 ? ASP B 106 GLN B 120 1 ? 15 HELX_P HELX_P5 AA5 ILE A 129 ? ASN A 140 ? ILE B 129 ASN B 140 1 ? 12 HELX_P HELX_P6 AA6 ASN A 140 ? GLY A 145 ? ASN B 140 GLY B 145 1 ? 6 HELX_P HELX_P7 AA7 GLU A 156 ? TYR A 173 ? GLU B 156 TYR B 173 1 ? 18 HELX_P HELX_P8 AA8 PRO A 176 ? TRP A 187 ? PRO B 176 TRP B 187 1 ? 12 HELX_P HELX_P9 AA9 GLY A 189 ? GLN A 202 ? GLY B 189 GLN B 202 1 ? 14 HELX_P HELX_P10 AB1 THR A 217 ? ALA A 239 ? THR B 217 ALA B 239 1 ? 23 HELX_P HELX_P11 AB2 GLY A 241 ? SER A 250 ? GLY B 241 SER B 250 1 ? 10 HELX_P HELX_P12 AB3 ASN A 258 ? GLU A 275 ? ASN B 258 GLU B 275 1 ? 18 HELX_P HELX_P13 AB4 GLU A 284 ? PHE A 289 ? GLU B 284 PHE B 289 1 ? 6 HELX_P HELX_P14 AB5 SER A 290 ? THR A 298 ? SER B 290 THR B 298 1 ? 9 HELX_P HELX_P15 AB6 HIS A 307 ? ALA A 318 ? HIS B 307 ALA B 318 1 ? 12 HELX_P HELX_P16 AB7 ILE A 323 ? GLY A 347 ? ILE B 323 GLY B 347 1 ? 25 HELX_P HELX_P17 AB8 GLY A 350 ? SER A 364 ? GLY B 350 SER B 364 1 ? 15 HELX_P HELX_P18 AB9 SER A 366 ? PHE A 378 ? SER B 366 PHE B 378 1 ? 13 HELX_P HELX_P19 AC1 ASP A 390 ? HIS A 402 ? ASP B 390 HIS B 402 1 ? 13 HELX_P HELX_P20 AC2 ASP A 414 ? ALA A 418 ? ASP B 414 ALA B 418 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 AC3 ASP A 426 ? VAL A 437 ? ASP B 426 VAL B 437 1 ? 12 HELX_P HELX_P22 AC4 ALA A 450 ? PHE A 461 ? ALA B 450 PHE B 461 1 ? 12 HELX_P HELX_P23 AC5 GLY A 482 ? LEU A 487 ? GLY B 482 LEU B 487 5 ? 6 HELX_P HELX_P24 AC6 GLY A 510 ? GLY A 536 ? GLY B 510 GLY B 536 1 ? 27 HELX_P HELX_P25 AC7 SER A 560 ? LEU A 574 ? SER B 560 LEU B 574 1 ? 15 HELX_P HELX_P26 AC8 SER A 586 ? GLU A 589 ? SER B 586 GLU B 589 5 ? 4 HELX_P HELX_P27 AC9 THR A 590 ? THR A 605 ? THR B 590 THR B 605 1 ? 16 HELX_P HELX_P28 AD1 ARG A 608 ? ALA A 617 ? ARG B 608 ALA B 617 1 ? 10 HELX_P HELX_P29 AD2 ASN A 624 ? ASP A 634 ? ASN B 624 ASP B 634 1 ? 11 HELX_P HELX_P30 AD3 ASP A 634 ? ARG A 655 ? ASP B 634 ARG B 655 1 ? 22 HELX_P HELX_P31 AD4 GLY A 656 ? ASN A 669 ? GLY B 656 ASN B 669 1 ? 14 HELX_P HELX_P32 AD5 ASN A 669 ? THR A 677 ? ASN B 669 THR B 677 1 ? 9 HELX_P HELX_P33 AD6 GLY A 679 ? GLN A 700 ? GLY B 679 GLN B 700 1 ? 22 HELX_P HELX_P34 AD7 SER A 703 ? GLU A 717 ? 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ASP B 1044 CYS B 1050 1 ? 7 HELX_P HELX_P49 AF4 ASP A 1089 ? TYR A 1093 ? ASP B 1089 TYR B 1093 5 ? 5 HELX_P HELX_P50 AF5 THR A 1094 ? ARG A 1106 ? THR B 1094 ARG B 1106 1 ? 13 HELX_P HELX_P51 AF6 ARG A 1106 ? ILE A 1126 ? ARG B 1106 ILE B 1126 1 ? 21 HELX_P HELX_P52 AF7 ASP A 1130 ? HIS A 1134 ? ASP B 1130 HIS B 1134 1 ? 5 HELX_P HELX_P53 AF8 ASN A 1161 ? GLY A 1174 ? ASN B 1161 GLY B 1174 1 ? 14 HELX_P HELX_P54 AF9 ARG B 9 ? GLU B 24 ? ARG C 9 GLU C 24 1 ? 16 HELX_P HELX_P55 AG1 SER B 39 ? GLY B 55 ? SER C 39 GLY C 55 1 ? 17 HELX_P HELX_P56 AG2 LEU B 64 ? LEU B 77 ? LEU C 64 LEU C 77 1 ? 14 HELX_P HELX_P57 AG3 ASN B 87 ? LEU B 103 ? ASN C 87 LEU C 103 1 ? 17 HELX_P HELX_P58 AG4 GLU B 104 ? ASP B 107 ? GLU C 104 ASP C 107 5 ? 4 HELX_P HELX_P59 AG5 PHE B 108 ? THR B 116 ? PHE C 108 THR C 116 1 ? 9 HELX_P HELX_P60 AG6 LYS B 121 ? ARG B 142 ? LYS C 121 ARG C 142 1 ? 22 HELX_P HELX_P61 AG7 ARG B 142 ? GLY B 152 ? ARG C 142 GLY C 152 1 ? 11 HELX_P HELX_P62 AG8 ALA B 161 ? LEU B 179 ? 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