data_8D9W # _entry.id 8D9W # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.373 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 8D9W pdb_00008d9w 10.2210/pdb8d9w/pdb WWPDB D_1000266289 ? ? EMDB EMD-27186 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details . _pdbx_database_related.db_id EMD-27186 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8D9W _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2022-06-11 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Hooy, R.H.' 1 ? 'Hurley, J.H.' 2 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Sci Adv' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2375-2548 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 8 _citation.language ? _citation.page_first eadd3914 _citation.page_last ? _citation.title 'Self-assembly and structure of a clathrin-independent AP-1:Arf1 tubular membrane coat.' _citation.year 2022 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1126/sciadv.add3914 _citation.pdbx_database_id_PubMed 36269825 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Hooy, R.M.' 1 0000-0001-8917-0249 primary 'Iwamoto, Y.' 2 0000-0002-6747-1590 primary 'Tudorica, D.A.' 3 0000-0003-0337-5150 primary 'Ren, X.' 4 0000-0002-4822-4316 primary 'Hurley, J.H.' 5 0000-0001-5054-5445 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8D9W _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 8D9W _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Protein Nef' 24285.244 4 ? ? ? 'Glycine 2 is myristoylated' 2 polymer man 'HLA class I histocompatibility antigen, A alpha chain' 4542.884 2 ? 'T345S, S349G, G355S, C363A' ? ? 3 polymer man 'AP-1 complex subunit beta-1' 104736.461 4 ? K359R,E476K ? ? 4 polymer man 'AP-1 complex subunit mu-1' 48606.730 4 ? ? ? ? 5 polymer man 'ADP-ribosylation factor 1' 20590.547 2 ? ? ? 'Gly2 is myristoylated' 6 polymer man 'AP-1 complex subunit gamma-1' 68194.094 2 ? ? ? ? 7 polymer man 'AP-1 complex subunit sigma-3' 18305.273 2 ? ? ? ? 8 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 2 ? ? ? ? 9 non-polymer syn "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 523.180 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 ;3'ORF,Negative factor,F-protein ; 2 'Human leukocyte antigen A,HLA-A' 3 ;Adaptor protein complex AP-1 subunit beta-1,Adaptor-related protein complex 1 subunit beta-1,Beta-1-adaptin,Beta-adaptin 1,Clathrin assembly protein complex 1 beta large chain,Golgi adaptor HA1/AP1 adaptin beta subunit ; 4 ;AP-mu chain family member mu1A,Adaptor protein complex AP-1 subunit mu-1,Adaptor-related protein complex 1 subunit mu-1,Clathrin assembly protein complex 1 mu-1 medium chain 1,Clathrin coat assembly protein AP47,Clathrin coat-associated protein AP47,Golgi adaptor HA1/AP1 adaptin mu-1 subunit,Mu-adaptin 1,Mu1A-adaptin ; 6 ;Adaptor protein complex AP-1 subunit gamma-1,Adaptor-related protein complex 1 subunit gamma-1,Clathrin assembly protein complex 1 gamma-1 large chain,Gamma-adaptin,Gamma1-adaptin,Golgi adaptor HA1/AP1 adaptin subunit gamma-1 ; 7 ;Adaptor protein complex AP-1 subunit sigma-1C,Adaptor-related protein complex 1 subunit sigma-1C,Clathrin assembly protein complex 1 sigma-1C small chain,Golgi adaptor HA1/AP1 adaptin sigma-1C subunit,Sigma 1C subunit of AP-1 clathrin,Sigma-adaptin 1C,Sigma1C-adaptin ; # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MGGKWSKSSVIGWPAVRERMRRAEPAADGVGAVSRDLEKHGAITSSNTAANNAACAWLEAQEEEEVGFPVTPQVPLRPMT YKAAVDLSHFLKEKGGLEGLIHSQRRQDILDLWIYHTQGYFPDWQNYTPGPGVRYPLTFGWCYKLVPVEPDKVEEANKGE NTSLLHPVSLHGMDDPEREVLEWRFDSRLAFHHVARELHPEYFKNCGHHHHHH ; ;MGGKWSKSSVIGWPAVRERMRRAEPAADGVGAVSRDLEKHGAITSSNTAANNAACAWLEAQEEEEVGFPVTPQVPLRPMT YKAAVDLSHFLKEKGGLEGLIHSQRRQDILDLWIYHTQGYFPDWQNYTPGPGVRYPLTFGWCYKLVPVEPDKVEEANKGE NTSLLHPVSLHGMDDPEREVLEWRFDSRLAFHHVARELHPEYFKNCGHHHHHH ; N,U,V,d ? 2 'polypeptide(L)' no no GAMGSCRKSSDRKGGSYSQAAGSDSAQSSDVSLTAAKVHHHHHH GAMGSCRKSSDRKGGSYSQAAGSDSAQSSDVSLTAAKVHHHHHH Y,j ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQ PDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQG FLDTLKDLISDSNPMVVANAVAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQYVALRNINLIVQKRPEILKHE MKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELREYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQ TKVNYVVQEAIVVIKDIFRKYPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDKSTQV QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEVVLAEKPLISEETDLIEPTLL DELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASSESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPP VSGPPLATSSVQMGAVDLLGGGLDSLMGDEPEGIGGTNFVAPPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPK AVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPLSPNQTVEISLPLSTV GSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQMFLATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSS NIFTVAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWVLAELRIQPGNPSCTDLELSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN ; ;MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQ PDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQG FLDTLKDLISDSNPMVVANAVAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQYVALRNINLIVQKRPEILKHE MKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELREYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQ TKVNYVVQEAIVVIKDIFRKYPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDKSTQV QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEVVLAEKPLISEETDLIEPTLL DELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASSESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPP VSGPPLATSSVQMGAVDLLGGGLDSLMGDEPEGIGGTNFVAPPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPK AVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPLSPNQTVEISLPLSTV GSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQMFLATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSS NIFTVAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWVLAELRIQPGNPSCTDLELSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN ; B,A,D,E ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWIKHNNLYLVATSKKNACVSLV FSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDFGYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWR SEGIKYRKNEVFLDVIEAVNLLVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQ CVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMVKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDA DSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSVKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEK SGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ ; ;MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWIKHNNLYLVATSKKNACVSLV FSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDFGYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWR SEGIKYRKNEVFLDVIEAVNLLVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQ CVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMVKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDA DSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSVKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEK SGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ ; M,X,Z,a ? 5 'polypeptide(L)' no no ;GNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHY FQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCAT SGDGLYEGLDWLSNQLRNQK ; ;GNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHY FQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCAT SGDGLYEGLDWLSNQLRNQK ; F,I ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREEDNTYRCRNVAKLLYMHMLGYPAHFGQLECLKLIASQKFT DKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQGLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAALC 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GEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLISNMSTSVTRGYALTAIMKLSTRFTCTVNRIKKVVSIYGSSIDVELQ QRAVEYNALFKKYDHMRSALLERMPVMEKVTTNGPENLYFQ ; K,O ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MIHFILLFSRQGKLRLQKWYITLPDKERKKITREIVQIILSRGHRTSSFVDWKELKLVYKRYASLYFCCAIENQDNELLT LEIVHRYVELLDKYFGNVCELDIIFNFEKAYFILDEFIIGGEIQETSKKIAVKAIEDSDMLQEVSTVSQTMGER ; ;MIHFILLFSRQGKLRLQKWYITLPDKERKKITREIVQIILSRGHRTSSFVDWKELKLVYKRYASLYFCCAIENQDNELLT LEIVHRYVELLDKYFGNVCELDIIFNFEKAYFILDEFIIGGEIQETSKKIAVKAIEDSDMLQEVSTVSQTMGER ; e,f ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 GLY n 1 3 GLY n 1 4 LYS n 1 5 TRP n 1 6 SER n 1 7 LYS n 1 8 SER n 1 9 SER n 1 10 VAL n 1 11 ILE n 1 12 GLY n 1 13 TRP n 1 14 PRO n 1 15 ALA n 1 16 VAL n 1 17 ARG n 1 18 GLU n 1 19 ARG n 1 20 MET n 1 21 ARG n 1 22 ARG n 1 23 ALA n 1 24 GLU n 1 25 PRO n 1 26 ALA n 1 27 ALA n 1 28 ASP n 1 29 GLY n 1 30 VAL n 1 31 GLY n 1 32 ALA n 1 33 VAL n 1 34 SER n 1 35 ARG n 1 36 ASP n 1 37 LEU n 1 38 GLU n 1 39 LYS n 1 40 HIS n 1 41 GLY n 1 42 ALA n 1 43 ILE n 1 44 THR n 1 45 SER n 1 46 SER n 1 47 ASN n 1 48 THR n 1 49 ALA n 1 50 ALA n 1 51 ASN n 1 52 ASN n 1 53 ALA n 1 54 ALA n 1 55 CYS n 1 56 ALA n 1 57 TRP n 1 58 LEU n 1 59 GLU n 1 60 ALA n 1 61 GLN n 1 62 GLU n 1 63 GLU n 1 64 GLU n 1 65 GLU n 1 66 VAL n 1 67 GLY n 1 68 PHE n 1 69 PRO n 1 70 VAL n 1 71 THR n 1 72 PRO n 1 73 GLN n 1 74 VAL n 1 75 PRO n 1 76 LEU n 1 77 ARG n 1 78 PRO n 1 79 MET n 1 80 THR n 1 81 TYR n 1 82 LYS n 1 83 ALA n 1 84 ALA n 1 85 VAL n 1 86 ASP n 1 87 LEU n 1 88 SER n 1 89 HIS n 1 90 PHE n 1 91 LEU n 1 92 LYS n 1 93 GLU n 1 94 LYS n 1 95 GLY n 1 96 GLY n 1 97 LEU n 1 98 GLU n 1 99 GLY n 1 100 LEU n 1 101 ILE n 1 102 HIS n 1 103 SER n 1 104 GLN n 1 105 ARG n 1 106 ARG n 1 107 GLN n 1 108 ASP n 1 109 ILE n 1 110 LEU n 1 111 ASP n 1 112 LEU n 1 113 TRP n 1 114 ILE n 1 115 TYR n 1 116 HIS n 1 117 THR n 1 118 GLN n 1 119 GLY n 1 120 TYR n 1 121 PHE n 1 122 PRO n 1 123 ASP n 1 124 TRP n 1 125 GLN n 1 126 ASN n 1 127 TYR n 1 128 THR n 1 129 PRO n 1 130 GLY n 1 131 PRO n 1 132 GLY n 1 133 VAL n 1 134 ARG n 1 135 TYR n 1 136 PRO n 1 137 LEU n 1 138 THR n 1 139 PHE n 1 140 GLY n 1 141 TRP n 1 142 CYS n 1 143 TYR n 1 144 LYS n 1 145 LEU n 1 146 VAL n 1 147 PRO n 1 148 VAL n 1 149 GLU n 1 150 PRO n 1 151 ASP n 1 152 LYS n 1 153 VAL n 1 154 GLU n 1 155 GLU n 1 156 ALA n 1 157 ASN n 1 158 LYS n 1 159 GLY n 1 160 GLU n 1 161 ASN n 1 162 THR n 1 163 SER n 1 164 LEU n 1 165 LEU n 1 166 HIS n 1 167 PRO n 1 168 VAL n 1 169 SER n 1 170 LEU n 1 171 HIS n 1 172 GLY n 1 173 MET n 1 174 ASP n 1 175 ASP n 1 176 PRO n 1 177 GLU n 1 178 ARG n 1 179 GLU n 1 180 VAL n 1 181 LEU n 1 182 GLU n 1 183 TRP n 1 184 ARG n 1 185 PHE n 1 186 ASP n 1 187 SER n 1 188 ARG n 1 189 LEU n 1 190 ALA n 1 191 PHE n 1 192 HIS n 1 193 HIS n 1 194 VAL n 1 195 ALA n 1 196 ARG n 1 197 GLU n 1 198 LEU n 1 199 HIS n 1 200 PRO n 1 201 GLU n 1 202 TYR n 1 203 PHE n 1 204 LYS n 1 205 ASN n 1 206 CYS n 1 207 GLY n 1 208 HIS n 1 209 HIS n 1 210 HIS n 1 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'Human immunodeficiency virus 1' 11676 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 44 human ? 'HLA-A, HLAA' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 'Biological sequence' 1 949 human ? 'AP1B1, ADTB1, BAM22, CLAPB2' ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample 'Biological sequence' 1 423 Mouse ? 'Ap1m1, Cltnm' ? ? ? ? ? ? 'Mus musculus' 10090 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 'Biological sequence' 1 180 human ? ARF1 ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample 'Biological sequence' 1 601 'house mouse' ? 'Ap1g1, Adtg, Clapg1' ? ? ? ? ? ? 'Mus musculus' 10090 ? ? ? ? ? ? ? ? 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP Q90VU7_9HIV1 Q90VU7 ? 1 ;MGGKWSKSSVIGWPAVRERMRRAEPAADGVGAVSRDLEKHGAITSSNTAANNAACAWLEAQEEEEVGFPVTPQVPLRPMT YKAAVDLSHFLKEKGGLEGLIHSQRRQDILDLWIYHTQGYFPDWQNYTPGPGVRYPLTFGWCYKLVPVEPDKVEEANKGE NTSLLHPVSLHGMDDPEREVLEWRFDSRLAFHHVARELHPEYFKNC ; 1 2 UNP HLAA_HUMAN P04439 ? 2 RKSSDRKGGSYTQAASSDSAQGSDVSLTACKV 334 3 UNP AP1B1_HUMAN Q10567 ? 3 ;MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQ PDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQG FLDTLKDLISDSNPMVVANAVAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQYVALRNINLIVQKRPEILKHE MKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQ TKVNYVVQEAIVVIKDIFRKYPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEVVLAEKPLISEETDLIEPTLL DELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASSESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPP VSGPPLATSSVQMGAVDLLGGGLDSLMGDEPEGIGGTNFVAPPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPK AVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPLSPNQTVEISLPLSTV GSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQMFLATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSS NIFTVAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWVLAELRIQPGNPSCTDLELSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN ; 1 4 UNP AP1M1_MOUSE P35585 ? 4 ;MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWIKHNNLYLVATSKKNACVSLV FSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDFGYPQTTDSKILQEYITQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWR SEGIKYRKNEVFLDVIEAVNLLVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQ CVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTHVKPLIWIESVIEKHSHSRIEYMVKAKSQFKRRSTANNVEIHIPVPNDA DSPKFKTTVGSVKWVPENSEIVWSVKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKIIEK SGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ ; 1 5 UNP ARF1_HUMAN P84077 ? 5 ;GNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHY FQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCAT SGDGLYEGLDWLSNQLRNQK ; 2 6 UNP AP1G1_MOUSE P22892 ? 6 ;MPAPIRLRELIRTIRTARTQAEEREMIQKECAAIRSSFREEDNTYRCRNVAKLLYMHMLGYPAHFGQLECLKLIASQKFT DKRIGYLGAMLLLDERQDVHLLMTNCIKNDLNHSTQFVQGLALCTLGCMGSSEMCRDLAGEVEKLLKTSNSYLRKKAALC AVHVIRKVPELMEMFLPATKNLLNEKNHGVLHTSVVLLTEMCERSPDMLAHFRKLVPQLVRILKNLIMSGYSPEHDVSGI SDPFLQVRILRLLRILGRNDDDSSEAMNDILAQVATNTETSKNVGNAILYETVLTIMDIKSESGLRVLAINILGRFLLNN DKNIRYVALTSLLKTVQTDHNAVQRHRSTIVDCLKDLDVSIKRRAMELSFALVNGNNIRGMMKELLYFLDSCEPEFKADC ASGIFLAAEKYAPSKRWHIDTIMRVLTTAGSYVRDDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQRLYKAILGDYSQQPLVQVAAWCI GEYGDLLVSGQCEEEEPIQVTEDEVLDILESVLISNMSTSVTRGYALTAIMKLSTRFTCTVNRIKKVVSIYGSSIDVELQ QRAVEYNALFKKYDHMRSALLERMPVMEKVTTNGP ; 1 7 UNP AP1S3_HUMAN Q96PC3 ? 7 ;MIHFILLFSRQGKLRLQKWYITLPDKERKKITREIVQIILSRGHRTSSFVDWKELKLVYKRYASLYFCCAIENQDNELLT LEIVHRYVELLDKYFGNVCELDIIFNFEKAYFILDEFIIGGEIQETSKKIAVKAIEDSDMLQEVSTVSQTMGER ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 8D9W N 1 ? 206 ? 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P35585 1 ? 423 ? 1 423 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 8D9W GLY N 207 ? UNP Q90VU7 ? ? 'expression tag' 207 1 1 8D9W HIS N 208 ? UNP Q90VU7 ? ? 'expression tag' 208 2 1 8D9W HIS N 209 ? UNP Q90VU7 ? ? 'expression tag' 209 3 1 8D9W HIS N 210 ? UNP Q90VU7 ? ? 'expression tag' 210 4 1 8D9W HIS N 211 ? UNP Q90VU7 ? ? 'expression tag' 211 5 1 8D9W HIS N 212 ? UNP Q90VU7 ? ? 'expression tag' 212 6 1 8D9W HIS N 213 ? UNP Q90VU7 ? ? 'expression tag' 213 7 2 8D9W GLY Y 1 ? UNP P04439 ? ? 'expression tag' 333 8 2 8D9W ALA Y 2 ? UNP P04439 ? ? 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PRO D 246 HIS D 250 5 ? 5 HELX_P HELX_P104 AL5 ASN L 252 ? MET L 267 ? ASN D 252 MET D 267 1 ? 16 HELX_P HELX_P105 AL6 LYS M 282 ? ASP M 298 ? LYS O 282 ASP O 298 1 ? 17 HELX_P HELX_P106 AL7 GLU M 302 ? LEU M 318 ? GLU O 302 LEU O 318 1 ? 17 HELX_P HELX_P107 AL8 ASP M 321 ? THR M 335 ? ASP O 321 THR O 335 1 ? 15 HELX_P HELX_P108 AL9 ASP M 339 ? GLN M 344 ? ASP O 339 GLN O 344 1 ? 6 HELX_P HELX_P109 AM1 HIS M 346 ? LYS M 355 ? HIS O 346 LYS O 355 1 ? 10 HELX_P HELX_P110 AM2 ASP M 358 ? LEU M 372 ? ASP O 358 LEU O 372 1 ? 15 HELX_P HELX_P111 AM3 ASN M 377 ? SER M 391 ? ASN O 377 SER O 391 1 ? 15 HELX_P HELX_P112 AM4 PHE M 396 ? ALA M 412 ? PHE O 396 ALA O 412 1 ? 17 HELX_P HELX_P113 AM5 SER M 414 ? GLY M 430 ? SER O 414 GLY O 430 1 ? 17 HELX_P HELX_P114 AM6 ASP M 436 ? SER M 448 ? ASP O 436 SER O 448 1 ? 13 HELX_P HELX_P115 AM7 HIS M 452 ? ASP M 466 ? HIS O 452 ASP O 466 1 ? 15 HELX_P HELX_P116 AM8 GLN M 469 ? VAL M 488 ? GLN O 469 VAL O 488 1 ? 20 HELX_P HELX_P117 AM9 ASP M 503 ? 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THR d 80 GLY d 95 1 ? 16 HELX_P HELX_P132 AO6 SER Q 103 ? GLY Q 119 ? SER d 103 GLY d 119 1 ? 17 HELX_P HELX_P133 AO7 SER Q 187 ? PHE Q 191 ? SER d 187 PHE d 191 5 ? 5 HELX_P HELX_P134 AO8 HIS Q 193 ? HIS Q 199 ? HIS d 193 HIS d 199 1 ? 7 HELX_P HELX_P135 AO9 HIS Q 199 ? LYS Q 204 ? HIS d 199 LYS d 204 1 ? 6 HELX_P HELX_P136 AP1 ASP R 24 ? SER R 28 ? ASP j 356 SER j 360 5 ? 5 HELX_P HELX_P137 AP2 ASN S 62 ? TYR S 76 ? ASN E 62 TYR E 76 1 ? 15 HELX_P HELX_P138 AP3 VAL S 88 ? CYS S 95 ? VAL E 88 CYS E 95 1 ? 8 HELX_P HELX_P139 AP4 ASN S 99 ? ILE S 113 ? ASN E 99 ILE E 113 1 ? 15 HELX_P HELX_P140 AP5 LEU S 122 ? LYS S 131 ? LEU E 122 LYS E 131 1 ? 10 HELX_P HELX_P141 AP6 ASP S 134 ? ASN S 152 ? ASP E 134 ASN E 152 1 ? 19 HELX_P HELX_P142 AP7 ASN S 152 ? GLY S 160 ? ASN E 152 GLY E 160 1 ? 9 HELX_P HELX_P143 AP8 GLY S 160 ? SER S 170 ? GLY E 160 SER E 170 1 ? 11 HELX_P HELX_P144 AP9 ASN S 173 ? HIS S 191 ? ASN E 173 HIS E 191 1 ? 19 HELX_P HELX_P145 AQ1 ASN S 200 ? ASN S 212 ? ASN E 200 ASN E 212 1 ? 13 HELX_P HELX_P146 AQ2 THR S 215 ? TYR S 229 ? THR E 215 TYR E 229 1 ? 15 HELX_P HELX_P147 AQ3 ASP S 233 ? THR S 245 ? ASP E 233 THR E 245 1 ? 13 HELX_P HELX_P148 AQ4 PRO S 246 ? HIS S 250 ? PRO E 246 HIS E 250 5 ? 5 HELX_P HELX_P149 AQ5 ASN S 252 ? MET S 267 ? ASN E 252 MET E 267 1 ? 16 HELX_P HELX_P150 AQ6 LEU S 274 ? LEU S 292 ? LEU E 274 LEU E 292 1 ? 19 HELX_P HELX_P151 AQ7 GLU S 295 ? GLN S 311 ? GLU E 295 GLN E 311 1 ? 17 HELX_P HELX_P152 AQ8 MET S 321 ? PHE S 325 ? MET E 321 PHE E 325 5 ? 5 HELX_P HELX_P153 AQ9 PRO S 331 ? LEU S 345 ? PRO E 331 LEU E 345 1 ? 15 HELX_P HELX_P154 AR1 CYS T 76 ? PHE T 95 ? CYS a 76 PHE a 95 1 ? 20 HELX_P HELX_P155 AR2 GLU T 99 ? ARG T 104 ? GLU a 99 ARG a 104 1 ? 6 HELX_P HELX_P156 AR3 ASN T 106 ? LEU T 117 ? ASN a 106 LEU a 117 1 ? 12 HELX_P HELX_P157 AR4 ASP T 127 ? GLN T 132 ? ASP a 127 GLN a 132 1 ? 6 HELX_P HELX_P158 AR5 PRO T 150 ? ASN T 155 ? PRO a 150 ASN a 155 1 ? 6 HELX_P HELX_P159 AR6 ASP T 216 ? GLY T 224 ? ASP a 216 GLY a 224 1 ? 9 HELX_P HELX_P160 AR7 ARG T 243 ? ARG T 251 ? ARG a 243 ARG a 251 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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I GTP 1001 I MG 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.383 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLY 130 A . ? GLY 130 N PRO 131 A ? PRO 131 N 1 -0.66 2 GLY 130 Q . ? GLY 130 d PRO 131 Q ? PRO 131 d 1 -0.64 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 9 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 6 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 6 ? AB4 ? 5 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 5 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 2 ? AB9 ? 8 ? AC1 ? 5 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 8 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 2 4 ? anti-parallel AA2 2 8 ? parallel AA2 2 9 ? parallel AA2 3 6 ? anti-parallel AA2 4 6 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA2 7 8 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? parallel AA7 3 4 ? parallel AA7 4 5 ? parallel AA7 5 6 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? parallel AB3 3 4 ? parallel AB3 4 5 ? parallel AB3 5 6 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 8 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 2 4 ? anti-parallel AB9 2 8 ? parallel AB9 3 6 ? anti-parallel AB9 4 6 ? anti-parallel AB9 5 6 ? anti-parallel AB9 7 8 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 TYR A 143 ? 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