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EMD-29686 'other EM volume' EMDB 'N2 neuraminidase of A/Tanzania/205/2010 H3N2 in complex with 3 FNI17 Fab molecules' EMD-29708 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 8G3Q _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2023-02-08 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Dang, H.V.' 1 0000-0002-5797-1364 'Snell, G.' 2 0000-0003-1475-659X # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Nature _citation.journal_id_ASTM NATUAS _citation.journal_id_CSD 0006 _citation.journal_id_ISSN 1476-4687 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 618 _citation.language ? _citation.page_first 590 _citation.page_last 597 _citation.title 'A pan-influenza antibody inhibiting neuraminidase via receptor mimicry.' _citation.year 2023 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41586-023-06136-y _citation.pdbx_database_id_PubMed 37258672 _citation.pdbx_database_id_patent ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Momont, C.' 1 ? primary 'Dang, H.V.' 2 ? primary 'Zatta, F.' 3 ? primary 'Hauser, K.' 4 ? primary 'Wang, C.' 5 ? primary 'di Iulio, J.' 6 ? primary 'Minola, A.' 7 ? primary 'Czudnochowski, N.' 8 ? primary 'De Marco, A.' 9 ? primary 'Branch, K.' 10 ? primary 'Donermeyer, D.' 11 ? primary 'Vyas, S.' 12 ? primary 'Chen, A.' 13 ? primary 'Ferri, E.' 14 ? primary 'Guarino, B.' 15 ? primary 'Powell, A.E.' 16 ? primary 'Spreafico, R.' 17 ? primary 'Yim, S.S.' 18 ? primary 'Balce, D.R.' 19 ? primary 'Bartha, I.' 20 ? primary 'Meury, M.' 21 ? primary 'Croll, T.I.' 22 ? primary 'Belnap, D.M.' 23 ? primary 'Schmid, M.A.' 24 ? primary 'Schaiff, W.T.' 25 ? primary 'Miller, J.L.' 26 ? primary 'Cameroni, E.' 27 ? primary 'Telenti, A.' 28 ? primary 'Virgin, H.W.' 29 ? primary 'Rosen, L.E.' 30 ? primary 'Purcell, L.A.' 31 ? primary 'Lanzavecchia, A.' 32 ? primary 'Snell, G.' 33 ? primary 'Corti, D.' 34 ? primary 'Pizzuto, M.S.' 35 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 8G3Q _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? _cell.pdbx_esd_method ? # _symmetry.entry_id 8G3Q _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man Neuraminidase 54755.047 4 ? ? ? 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_entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;METDTLLLWVLLLWVPGSTGDHHHHHHGSGLNDIFEAQKIEWHEGSIINETADDIVYRLTVIIDDRYESLKNLITLRADR LEMIINDNVSTILASGENLYFQGSAEYRNWSKPQCDITGFAPFSKDNSIRLSAGGDIWVTREPYVSCDPDKCYQFALGQG TTLNNVHSNNTVRDRTPYRTLLMNELGVPFHLGTKQVCIAWSSSSCHDGKAWLHVCITGDDKNATASFIYNGRLVDSVVS WSKEILRTQESECVCINGTCTVVMTDGSASGKADTKILFIEEGKIVHTSTLSGSAQHVEECSCYPRYPGVRCVCRDNWKG SNRPIVDINIKDHSIVSSYVCSGLVGDTPRKNDSSSSSHCLDPNNEEGGHGVKGWAFDDGNDVWMGRTINETSRLGYETF KVIEGWSNPKSKLQINRQVIVDRGNRSGYSGIFSVEGKSCINRCFYVELIRGRKEETEVLWTSNSIVVFCGTSGTYGTGS WPDGADLNLMPI ; ;METDTLLLWVLLLWVPGSTGDHHHHHHGSGLNDIFEAQKIEWHEGSIINETADDIVYRLTVIIDDRYESLKNLITLRADR LEMIINDNVSTILASGENLYFQGSAEYRNWSKPQCDITGFAPFSKDNSIRLSAGGDIWVTREPYVSCDPDKCYQFALGQG TTLNNVHSNNTVRDRTPYRTLLMNELGVPFHLGTKQVCIAWSSSSCHDGKAWLHVCITGDDKNATASFIYNGRLVDSVVS WSKEILRTQESECVCINGTCTVVMTDGSASGKADTKILFIEEGKIVHTSTLSGSAQHVEECSCYPRYPGVRCVCRDNWKG SNRPIVDINIKDHSIVSSYVCSGLVGDTPRKNDSSSSSHCLDPNNEEGGHGVKGWAFDDGNDVWMGRTINETSRLGYETF KVIEGWSNPKSKLQINRQVIVDRGNRSGYSGIFSVEGKSCINRCFYVELIRGRKEETEVLWTSNSIVVFCGTSGTYGTGS WPDGADLNLMPI ; E,G,H,F ? 2 'polypeptide(L)' no no ;EIVMTQSPATLSVSPGERATLSCRASQSVGSSLVWYQQKPGQAPRLLIYGASTRATGVPARFSGSGSGTEFTLTISSLQS EDFAVYYCQHYNNWPPWTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNS QESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; ;EIVMTQSPATLSVSPGERATLSCRASQSVGSSLVWYQQKPGQAPRLLIYGASTRATGVPARFSGSGSGTEFTLTISSLQS EDFAVYYCQHYNNWPPWTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNS QESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; B,D,L ? 3 'polypeptide(L)' no no ;QVQLVQSGAEVKRPGSSVKVSCKPSGGTFSNNVISWVRQAPGQGLEWMGGIIPTSGIANYAQKFQGRVAIIADKSTSTVY MALSSLRSEDSAVYFCARARSDYFNRDLGWEDYYFENWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDY FPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSC ; ;QVQLVQSGAEVKRPGSSVKVSCKPSGGTFSNNVISWVRQAPGQGLEWMGGIIPTSGIANYAQKFQGRVAIIADKSTSTVY 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_refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details 'PARAMETERS FOR MASK CACLULATION' _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.pdbx_R_complete ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'MAXIMUM LIKELIHOOD WITH PHASES' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R 0.164 _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.032 0.014 17005 ? r_bond_other_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.761 1.734 26166 ? r_angle_refined_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 1.451 1.658 39487 ? r_angle_other_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.057 5.000 2256 ? r_dihedral_angle_1_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 30.834 21.843 917 ? r_dihedral_angle_2_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 12.112 15.000 2876 ? r_dihedral_angle_3_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 17.422 15.000 123 ? r_dihedral_angle_4_deg ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.087 0.200 2761 ? r_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.009 0.020 21013 ? r_gen_planes_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.002 0.020 4381 ? r_gen_planes_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbd_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbd_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbtor_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_nbtor_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_xyhbond_nbd_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_xyhbond_nbd_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_metal_ion_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_vdw_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_hbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_symmetry_metal_ion_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.592 5.758 9054 ? r_mcbond_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.590 5.757 9053 ? r_mcbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 6.646 8.664 11300 ? r_mcangle_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 6.647 8.666 11301 ? r_mcangle_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 6.206 6.986 10092 ? r_scbond_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 6.206 6.986 10092 ? r_scbond_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_scangle_it ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 10.082 10.267 14867 ? r_scangle_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.789 ? 82164 ? r_long_range_B_refined ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.790 ? 82160 ? r_long_range_B_other ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_rigid_bond_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_sphericity_free ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? ? ? ? ? r_sphericity_bonded ? ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.04 ? 0.05 1 'interatomic distance' ? E 27840 ? ? 1 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.04 ? 0.05 2 'interatomic distance' ? G 27840 ? ? 1 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.05 ? 0.05 3 'interatomic distance' ? E 27732 ? ? 2 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.05 ? 0.05 4 'interatomic distance' ? H 27732 ? ? 2 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.04 ? 0.05 5 'interatomic distance' ? E 27836 ? ? 3 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.04 ? 0.05 6 'interatomic distance' ? F 27836 ? ? 3 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.04 ? 0.05 7 'interatomic distance' ? G 27796 ? ? 4 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.04 ? 0.05 8 'interatomic distance' ? H 27796 ? ? 4 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.04 ? 0.05 9 'interatomic distance' ? G 27826 ? ? 5 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.04 ? 0.05 10 'interatomic distance' ? F 27826 ? ? 5 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.04 ? 0.05 11 'interatomic distance' ? H 27776 ? ? 6 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.04 ? 0.05 12 'interatomic distance' ? F 27776 ? ? 6 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 ? ? 0.07 ? 0.05 13 'interatomic distance' ? B 6632 ? ? 7 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 ? ? 0.07 ? 0.05 14 'interatomic distance' ? 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A 8084 ? ? 12 # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_ls_shell.d_res_high 2.300 _refine_ls_shell.d_res_low 2.360 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 0 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 34456 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 100.00 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.R_factor_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.789 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_all ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_all ? _refine_ls_shell.wR_factor_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_free ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_work ? _refine_ls_shell.pdbx_R_complete ? _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.pdbx_phase_error ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_work ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_free ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free 0.000 # loop_ _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id 1 E 1 2 G 1 1 E 2 2 H 2 1 E 3 2 F 3 1 G 4 2 H 4 1 G 5 2 F 5 1 H 6 2 F 6 1 B 7 2 D 7 1 B 8 2 L 8 1 C 9 2 I 9 1 C 10 2 A 10 1 D 11 2 L 11 1 I 12 2 A 12 # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 1 0 A ALA 105 . A ILE 492 . E ALA 82 E ILE 469 0 ? 1 2 0 B ALA 105 . B ILE 492 . G ALA 82 G ILE 469 0 ? 2 1 0 A ALA 105 . A ILE 492 . E ALA 82 E ILE 469 0 ? 2 2 0 C ALA 105 . C ILE 492 . H ALA 82 H ILE 469 0 ? 3 1 0 A ALA 105 . A ILE 492 . E ALA 82 E ILE 469 0 ? 3 2 0 D ALA 105 . D ILE 492 . F ALA 82 F ILE 469 0 ? 4 1 0 B ALA 105 . B ILE 492 . G ALA 82 G ILE 469 0 ? 4 2 0 C ALA 105 . C ILE 492 . H ALA 82 H ILE 469 0 ? 5 1 0 B ALA 105 . B ILE 492 . G ALA 82 G ILE 469 0 ? 5 2 0 D ALA 105 . D ILE 492 . F ALA 82 F ILE 469 0 ? 6 1 0 C ALA 105 . C ILE 492 . H ALA 82 H ILE 469 0 ? 6 2 0 D ALA 105 . D ILE 492 . F ALA 82 F ILE 469 0 ? 7 1 0 E ILE 2 . E THR 110 . B ILE 2 B THR 110 0 ? 7 2 0 G ILE 2 . G THR 110 . D ILE 2 D THR 110 0 ? 8 1 0 E ILE 2 . E THR 110 . B ILE 2 B THR 110 0 ? 8 2 0 I ILE 2 . I THR 110 . L ILE 2 L THR 110 0 ? 9 1 0 F VAL 2 . F SER 130 . C VAL 2 C SER 130 0 ? 9 2 0 H VAL 2 . H SER 130 . I VAL 2 I SER 130 0 ? 10 1 0 F VAL 2 . F SER 130 . C VAL 2 C SER 130 0 ? 10 2 0 J VAL 2 . J SER 130 . A VAL 2 A SER 130 0 ? 11 1 0 G ILE 2 . G THR 110 . D ILE 2 D THR 110 0 ? 11 2 0 I ILE 2 . I THR 110 . L ILE 2 L THR 110 0 ? 12 1 0 H VAL 2 . H SER 130 . I VAL 2 I SER 130 0 ? 12 2 0 J VAL 2 . J SER 130 . A VAL 2 A SER 130 0 ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? 3 ? 4 ? 5 ? 6 ? 7 ? 8 ? 9 ? 10 ? 11 ? 12 ? # _struct.entry_id 8G3Q _struct.title 'N2 neuraminidase of A/Tanzania/205/2010 H3N2 in complex with 3 FNI17 Fab molecules' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 8G3Q _struct_keywords.text 'viral glycoprotein, antibody, Fab, influenza, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 2 ? 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B CYS 115 SG ? ? ? 1_555 B CYS 440 SG ? ? G CYS 92 G CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? ? disulf11 disulf ? ? B CYS 147 SG ? ? ? 1_555 B CYS 152 SG ? ? G CYS 124 G CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.059 ? ? disulf12 disulf ? ? B CYS 198 SG ? ? ? 1_555 B CYS 216 SG ? ? G CYS 175 G CYS 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.007 ? ? disulf13 disulf ? ? B CYS 206 SG ? ? ? 1_555 B CYS 253 SG ? ? G CYS 183 G CYS 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? ? disulf14 disulf ? ? B CYS 255 SG ? ? ? 1_555 B CYS 260 SG ? ? G CYS 232 G CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? ? disulf15 disulf ? ? B CYS 301 SG ? ? ? 1_555 B CYS 314 SG ? ? G CYS 278 G CYS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? ? disulf16 disulf ? ? B CYS 303 SG ? ? ? 1_555 B CYS 312 SG ? ? G CYS 280 G CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf17 disulf ? ? B CYS 341 SG ? ? ? 1_555 B CYS 360 SG ? ? G CYS 318 G CYS 337 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.085 ? ? disulf18 disulf ? ? B CYS 444 SG ? ? ? 1_555 B CYS 470 SG ? ? G CYS 421 G CYS 447 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.121 ? ? disulf19 disulf ? ? C CYS 115 SG ? ? ? 1_555 C CYS 440 SG ? ? H CYS 92 H CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf20 disulf ? ? C CYS 147 SG ? ? ? 1_555 C CYS 152 SG ? ? H CYS 124 H CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.075 ? ? disulf21 disulf ? ? C CYS 198 SG ? ? ? 1_555 C CYS 216 SG ? ? H CYS 175 H CYS 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.995 ? ? disulf22 disulf ? ? C CYS 206 SG ? ? ? 1_555 C CYS 253 SG ? ? H CYS 183 H CYS 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? ? disulf23 disulf ? ? C CYS 255 SG ? ? ? 1_555 C CYS 260 SG ? ? H CYS 232 H CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? ? disulf24 disulf ? ? C CYS 301 SG ? ? ? 1_555 C CYS 314 SG ? ? H CYS 278 H CYS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? ? disulf25 disulf ? ? C CYS 303 SG ? ? ? 1_555 C CYS 312 SG ? ? H CYS 280 H CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? ? disulf26 disulf ? ? C CYS 341 SG ? ? ? 1_555 C CYS 360 SG ? ? H CYS 318 H CYS 337 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.080 ? ? disulf27 disulf ? ? C CYS 444 SG ? ? ? 1_555 C CYS 470 SG ? ? H CYS 421 H CYS 447 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.147 ? ? disulf28 disulf ? ? D CYS 115 SG ? ? ? 1_555 D CYS 440 SG ? ? F CYS 92 F CYS 417 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? ? disulf29 disulf ? ? D CYS 147 SG ? ? ? 1_555 D CYS 152 SG ? ? F CYS 124 F CYS 129 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.067 ? ? disulf30 disulf ? ? D CYS 198 SG ? ? ? 1_555 D CYS 216 SG ? ? F CYS 175 F CYS 193 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.988 ? ? disulf31 disulf ? ? D CYS 206 SG ? ? ? 1_555 D CYS 253 SG ? ? F CYS 183 F CYS 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? ? disulf32 disulf ? ? D CYS 255 SG ? ? ? 1_555 D CYS 260 SG ? ? F CYS 232 F CYS 237 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.071 ? ? disulf33 disulf ? ? D CYS 301 SG ? ? ? 1_555 D CYS 314 SG ? ? F CYS 278 F CYS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? ? disulf34 disulf ? ? D CYS 303 SG ? ? ? 1_555 D CYS 312 SG ? ? F CYS 280 F CYS 289 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf35 disulf ? ? D CYS 341 SG ? ? ? 1_555 D CYS 360 SG ? ? F CYS 318 F CYS 337 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? ? disulf36 disulf ? ? D CYS 444 SG ? ? ? 1_555 D CYS 470 SG ? ? F CYS 421 F CYS 447 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.138 ? ? disulf37 disulf ? ? E CYS 23 SG ? ? ? 1_555 E CYS 88 SG ? ? B CYS 23 B CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.052 ? ? disulf38 disulf ? ? F CYS 22 SG ? ? ? 1_555 F CYS 96 SG ? ? C CYS 22 C CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? disulf39 disulf ? ? G CYS 23 SG ? ? ? 1_555 G CYS 88 SG ? ? D CYS 23 D CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.057 ? ? disulf40 disulf ? ? H CYS 22 SG ? ? ? 1_555 H CYS 96 SG ? ? I CYS 22 I CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? ? disulf41 disulf ? ? I CYS 23 SG ? ? ? 1_555 I CYS 88 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? ? disulf42 disulf ? ? J CYS 22 SG ? ? ? 1_555 J CYS 96 SG ? ? A CYS 22 A CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? covale1 covale one ? A ASN 109 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? E ASN 86 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 169 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? E ASN 146 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 223 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? E ASN 200 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.393 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 257 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? E ASN 234 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 352 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? E ASN 329 f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 390 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? E ASN 367 g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? B ASN 109 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? G ASN 86 q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? B ASN 169 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? G ASN 146 r NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? B ASN 223 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? G ASN 200 s NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? B ASN 257 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? G ASN 234 t NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? B ASN 352 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? G ASN 329 v NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? B ASN 390 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? G ASN 367 w NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.420 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? C ASN 109 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? H ASN 86 1 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? C ASN 169 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? H ASN 146 2 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? C ASN 223 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? H ASN 200 3 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? C ASN 257 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? H ASN 234 4 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? C ASN 352 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? H ASN 329 6 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? C ASN 390 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? H ASN 367 7 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? D ASN 109 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? F ASN 86 i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.420 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? D ASN 169 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? F ASN 146 j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? D ASN 223 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? F ASN 200 k NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.421 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? D ASN 257 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? F ASN 234 l NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? D ASN 352 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? F ASN 329 n NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? D ASN 390 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? F ASN 367 o NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale25 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale26 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K BMA . C1 ? ? a NAG 2 a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale27 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale28 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L BMA . C1 ? ? b NAG 2 b BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale29 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? c NAG 1 c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? ? covale30 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M BMA . C1 ? ? c NAG 2 c BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale31 covale both ? M BMA . O3 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? c BMA 3 c MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.420 ? ? covale32 covale both ? M BMA . O6 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? c BMA 3 c MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale33 covale both ? M MAN . O2 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? c MAN 4 c MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale34 covale both ? M MAN . O3 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? c MAN 6 c MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale35 covale both ? M MAN . O6 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? c MAN 6 c MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale36 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? d NAG 1 d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale37 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N BMA . C1 ? ? d NAG 2 d BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? ? covale38 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? f NAG 1 f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale39 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O BMA . C1 ? ? f NAG 2 f BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale40 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? g NAG 1 g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale41 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? i NAG 1 i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale42 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q BMA . C1 ? ? i NAG 2 i BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale43 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? j NAG 1 j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale44 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R BMA . C1 ? ? j NAG 2 j BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale45 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? k NAG 1 k NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? ? covale46 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S BMA . C1 ? ? k NAG 2 k BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale47 covale both ? S BMA . O3 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? k BMA 3 k MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? ? covale48 covale both ? S BMA . O6 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? k BMA 3 k MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale49 covale both ? S MAN . O2 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? k MAN 4 k MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? ? covale50 covale both ? S MAN . O3 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? k MAN 6 k MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale51 covale both ? S MAN . O6 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? k MAN 6 k MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale52 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? l NAG 1 l NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale53 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T BMA . C1 ? ? l NAG 2 l BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale54 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? n NAG 1 n NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale55 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U BMA . C1 ? ? n NAG 2 n BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale56 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? o NAG 1 o NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? ? covale57 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V BMA . C1 ? ? o NAG 2 o BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.473 ? ? covale58 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? q NAG 1 q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale59 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W BMA . C1 ? ? q NAG 2 q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? ? covale60 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? r NAG 1 r NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale61 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X BMA . C1 ? ? r NAG 2 r BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale62 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? s NAG 1 s NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? ? covale63 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y BMA . C1 ? ? s NAG 2 s BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale64 covale both ? Y BMA . O3 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? s BMA 3 s MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.420 ? ? covale65 covale both ? Y BMA . O6 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? s BMA 3 s MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale66 covale both ? Y MAN . O2 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? s MAN 4 s MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? ? covale67 covale both ? Y MAN . O3 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? s MAN 6 s MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale68 covale both ? Y MAN . O6 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? s MAN 6 s MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale69 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? t NAG 1 t NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? ? covale70 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z BMA . C1 ? ? t NAG 2 t BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? ? covale71 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? v NAG 1 v NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale72 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA BMA . C1 ? ? v NAG 2 v BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? ? covale73 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? w NAG 1 w NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? ? covale74 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA BMA . C1 ? ? w NAG 2 w BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.476 ? ? covale75 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? 1 NAG 1 1 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale76 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA BMA . C1 ? ? 1 NAG 2 1 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? ? covale77 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? 2 NAG 1 2 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale78 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA BMA . C1 ? ? 2 NAG 2 2 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale79 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? 3 NAG 1 3 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? ? covale80 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA BMA . C1 ? ? 3 NAG 2 3 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale81 covale both ? EA BMA . O3 ? ? ? 1_555 EA MAN . C1 ? ? 3 BMA 3 3 MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? ? covale82 covale both ? EA BMA . O6 ? ? ? 1_555 EA MAN . C1 ? ? 3 BMA 3 3 MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale83 covale both ? EA MAN . O2 ? ? ? 1_555 EA MAN . C1 ? ? 3 MAN 4 3 MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? ? covale84 covale both ? EA MAN . O3 ? ? ? 1_555 EA MAN . C1 ? ? 3 MAN 6 3 MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale85 covale both ? EA MAN . O6 ? ? ? 1_555 EA MAN . C1 ? ? 3 MAN 6 3 MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale86 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? 4 NAG 1 4 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? ? covale87 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA BMA . C1 ? ? 4 NAG 2 4 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.462 ? ? covale88 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? 6 NAG 1 6 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale89 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA BMA . C1 ? ? 6 NAG 2 6 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale90 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? 7 NAG 1 7 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.457 ? ? covale91 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA BMA . C1 ? ? 7 NAG 2 7 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.467 ? ? metalc1 metalc ? ? A ASP 316 O ? ? ? 1_555 IA CA . CA ? ? E ASP 293 E CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? ? metalc2 metalc ? ? A GLY 320 O ? ? ? 1_555 IA CA . CA ? ? E GLY 297 E CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? ? metalc3 metalc ? ? A ASP 347 OD2 ? ? ? 1_555 IA CA . CA ? ? E ASP 324 E CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.301 ? ? metalc4 metalc ? ? A GLY 368 O ? ? ? 1_555 IA CA . CA ? ? E GLY 345 E CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.346 ? ? metalc5 metalc ? ? A HIS 370 O ? ? ? 1_555 IA CA . CA ? ? E HIS 347 E CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.269 ? ? metalc6 metalc ? ? B ASP 316 O ? ? ? 1_555 KA CA . CA ? ? G ASP 293 G CA 2000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.251 ? ? metalc7 metalc ? ? B GLY 320 O ? ? ? 1_555 KA CA . CA ? ? G GLY 297 G CA 2000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? ? metalc8 metalc ? ? B ASP 347 OD2 ? ? ? 1_555 KA CA . CA ? ? G ASP 324 G CA 2000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? ? metalc9 metalc ? ? B GLY 368 O ? ? ? 1_555 KA CA . CA ? ? G GLY 345 G CA 2000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? ? metalc10 metalc ? ? B HIS 370 O ? ? ? 1_555 KA CA . CA ? ? G HIS 347 G CA 2000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? ? metalc11 metalc ? ? C ASP 316 O ? ? ? 1_555 LA CA . CA ? ? H ASP 293 H CA 2000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? ? metalc12 metalc ? ? C GLY 320 O ? ? ? 1_555 LA CA . CA ? ? H GLY 297 H CA 2000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.372 ? ? metalc13 metalc ? ? C ASP 347 OD2 ? ? ? 1_555 LA CA . CA ? ? H ASP 324 H CA 2000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? ? metalc14 metalc ? ? C GLY 368 O ? ? ? 1_555 LA CA . CA ? ? H GLY 345 H CA 2000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.257 ? ? metalc15 metalc ? ? C HIS 370 O ? ? ? 1_555 LA CA . CA ? ? H HIS 347 H CA 2000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? ? metalc16 metalc ? ? D ASP 316 O ? ? ? 1_555 MA CA . CA ? ? F ASP 293 F CA 2000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.266 ? ? metalc17 metalc ? ? D GLY 320 O ? ? ? 1_555 MA CA . CA ? ? F GLY 297 F CA 2000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.359 ? ? metalc18 metalc ? ? D ASP 347 OD2 ? ? ? 1_555 MA CA . CA ? ? F ASP 324 F CA 2000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? ? metalc19 metalc ? ? D GLY 368 O ? ? ? 1_555 MA CA . CA ? ? F GLY 345 F CA 2000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? ? metalc20 metalc ? ? D HIS 370 O ? ? ? 1_555 MA CA . CA ? ? F HIS 347 F CA 2000 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? metalc ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 TYR 307 A . ? TYR 284 E PRO 308 A ? PRO 285 E 1 5.51 2 THR 348 A . ? THR 325 E PRO 349 A ? PRO 326 E 1 4.12 3 ARG 453 A . ? ARG 430 E LYS 454 A ? 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AA9 ? 4 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 6 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 6 ? AD2 ? 4 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 4 ? AD5 ? 6 ? AD6 ? 4 ? AD7 ? 6 ? AD8 ? 4 ? AD9 ? 2 ? AE1 ? 4 ? AE2 ? 6 ? AE3 ? 4 ? AE4 ? 6 ? AE5 ? 4 ? 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RECONSTRUCTION ? 13 1 ? ? ? ? # _em_specimen.concentration 0.4 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.id 1 _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _pdbx_audit_support.funding_organization 'Other private' _pdbx_audit_support.country 'United States' _pdbx_audit_support.grant_number ? _pdbx_audit_support.ordinal 1 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero K 4 NAG 1 a NAG 1 a NAG 1 n K 4 NAG 2 a NAG 2 a NAG 2 n K 4 BMA 3 a BMA 3 a BMA 3 n L 4 NAG 1 b NAG 1 b NAG 1 n L 4 NAG 2 b NAG 2 b NAG 2 n L 4 BMA 3 b BMA 3 b BMA 3 n M 5 NAG 1 c NAG 1 c NAG 1 n M 5 NAG 2 c NAG 2 c NAG 2 n M 5 BMA 3 c BMA 3 c BMA 3 n M 5 MAN 4 c MAN 4 c MAN 7 n M 5 MAN 5 c MAN 5 c MAN 8 n M 5 MAN 6 c MAN 6 c MAN 4 n M 5 MAN 7 c MAN 7 c MAN 6 n M 5 MAN 8 c MAN 8 c MAN 5 n N 4 NAG 1 d NAG 1 d NAG 1 n N 4 NAG 2 d NAG 2 d NAG 2 n N 4 BMA 3 d BMA 3 d BMA 3 n O 4 NAG 1 f NAG 1 f NAG 1 n O 4 NAG 2 f NAG 2 f NAG 2 n O 4 BMA 3 f BMA 3 f BMA 3 n P 6 NAG 1 g NAG 1 g NAG 1 n P 6 NAG 2 g NAG 2 g NAG 2 n Q 4 NAG 1 i NAG 1 i NAG 1 n Q 4 NAG 2 i NAG 2 i NAG 2 n Q 4 BMA 3 i BMA 3 i BMA 3 n R 4 NAG 1 j NAG 1 j NAG 1 n R 4 NAG 2 j NAG 2 j NAG 2 n R 4 BMA 3 j BMA 3 j BMA 3 n S 5 NAG 1 k NAG 1 k NAG 1 n S 5 NAG 2 k NAG 2 k NAG 2 n S 5 BMA 3 k BMA 3 k BMA 3 n S 5 MAN 4 k MAN 4 k MAN 7 n S 5 MAN 5 k MAN 5 k MAN 8 n S 5 MAN 6 k MAN 6 k MAN 4 n S 5 MAN 7 k MAN 7 k MAN 6 n S 5 MAN 8 k MAN 8 k MAN 5 n T 4 NAG 1 l NAG 1 l NAG 1 n T 4 NAG 2 l NAG 2 l NAG 2 n T 4 BMA 3 l BMA 3 l BMA 3 n U 4 NAG 1 n NAG 1 n NAG 1 n U 4 NAG 2 n NAG 2 n NAG 2 n U 4 BMA 3 n BMA 3 n BMA 3 n V 4 NAG 1 o NAG 1 o NAG 1 n V 4 NAG 2 o NAG 2 o NAG 2 n V 4 BMA 3 o BMA 3 o BMA 3 n W 4 NAG 1 q NAG 1 q NAG 1 n W 4 NAG 2 q NAG 2 q NAG 2 n W 4 BMA 3 q BMA 3 q BMA 3 n X 4 NAG 1 r NAG 1 r NAG 1 n X 4 NAG 2 r NAG 2 r NAG 2 n X 4 BMA 3 r BMA 3 r BMA 3 n Y 5 NAG 1 s NAG 1 s NAG 1 n Y 5 NAG 2 s NAG 2 s NAG 2 n Y 5 BMA 3 s BMA 3 s BMA 3 n Y 5 MAN 4 s MAN 4 s MAN 7 n Y 5 MAN 5 s MAN 5 s MAN 8 n Y 5 MAN 6 s MAN 6 s MAN 4 n Y 5 MAN 7 s MAN 7 s MAN 6 n Y 5 MAN 8 s MAN 8 s MAN 5 n Z 4 NAG 1 t NAG 1 t NAG 1 n Z 4 NAG 2 t NAG 2 t NAG 2 n Z 4 BMA 3 t BMA 3 t BMA 3 n AA 4 NAG 1 v NAG 1 v NAG 1 n AA 4 NAG 2 v NAG 2 v NAG 2 n AA 4 BMA 3 v BMA 3 v BMA 3 n BA 4 NAG 1 w NAG 1 w NAG 1 n BA 4 NAG 2 w NAG 2 w NAG 2 n BA 4 BMA 3 w BMA 3 w BMA 3 n CA 4 NAG 1 1 NAG 1 1 NAG 1 n CA 4 NAG 2 1 NAG 2 1 NAG 2 n CA 4 BMA 3 1 BMA 3 1 BMA 3 n DA 4 NAG 1 2 NAG 1 2 NAG 1 n DA 4 NAG 2 2 NAG 2 2 NAG 2 n DA 4 BMA 3 2 BMA 3 2 BMA 3 n EA 5 NAG 1 3 NAG 1 3 NAG 1 n EA 5 NAG 2 3 NAG 2 3 NAG 2 n EA 5 BMA 3 3 BMA 3 3 BMA 3 n EA 5 MAN 4 3 MAN 4 3 MAN 7 n EA 5 MAN 5 3 MAN 5 3 MAN 8 n EA 5 MAN 6 3 MAN 6 3 MAN 4 n EA 5 MAN 7 3 MAN 7 3 MAN 6 n EA 5 MAN 8 3 MAN 8 3 MAN 5 n FA 4 NAG 1 4 NAG 1 4 NAG 1 n FA 4 NAG 2 4 NAG 2 4 NAG 2 n FA 4 BMA 3 4 BMA 3 4 BMA 3 n GA 4 NAG 1 6 NAG 1 6 NAG 1 n GA 4 NAG 2 6 NAG 2 6 NAG 2 n GA 4 BMA 3 6 BMA 3 6 BMA 3 n HA 4 NAG 1 7 NAG 1 7 NAG 1 n HA 4 NAG 2 7 NAG 2 7 NAG 2 n HA 4 BMA 3 7 BMA 3 7 BMA 3 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 4 DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 4 'WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5]/1-1-2/a4-b1_b4-c1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 4 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? 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# _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 7 _pdbx_entity_nonpoly.name 'CALCIUM ION' _pdbx_entity_nonpoly.comp_id CA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #