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US ? ? primary Nat.Struct.Mol.Biol. ? ? 1545-9985 ? ? ? ? ? ? 'Visualizing chaperone-mediated multistep assembly of the human 20S proteasome.' 2024 ? 10.1038/s41594-024-01268-9 38600324 ? ? ? ? ? ? ? ? ? US ? ? 1 Biorxiv ? ? 2692-8205 ? ? ? ? ? ? 'Visualizing chaperone-mediated multistep assembly of the human 20S proteasome.' 2024 ? 10.1101/2024.01.27.577538 38328185 ? ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Adolf, F.' 1 0000-0002-9812-5711 primary 'Du, J.' 2 0000-0003-1410-7020 primary 'Goodall, E.A.' 3 0000-0001-9876-5973 primary 'Walsh Jr., R.M.' 4 0000-0002-8939-8988 primary 'Rawson, S.' 5 0000-0002-2973-2630 primary 'von Gronau, S.' 6 ? primary 'Harper, J.W.' 7 0000-0002-6944-7236 primary 'Hanna, J.' 8 0000-0003-2964-1058 primary 'Schulman, B.A.' 9 0000-0002-3083-1126 1 'Adolf, F.' 10 0000-0002-9812-5711 1 'Du, J.' 11 0000-0003-1410-7020 1 'Goodall, E.A.' 12 0000-0001-9876-5973 1 'Walsh Jr., R.M.' 13 0000-0002-8939-8988 1 'Rawson, S.' 14 0000-0002-2973-2630 1 'von Gronau, S.' 15 ? 1 'Harper, J.W.' 16 0000-0002-6944-7236 1 'Hanna, J.' 17 0000-0003-2964-1058 1 'Schulman, B.A.' 18 0000-0002-3083-1126 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-2' 25927.535 1 ? ? ? ? 2 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-4' 29525.842 1 ? ? ? ? 3 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-7' 27929.891 1 ? ? ? ? 4 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-5' 26462.016 1 ? ? ? ? 5 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-1' 29621.662 1 ? ? ? ? 6 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-3' 28469.252 1 ? ? ? ? 7 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-6' 27458.498 1 ? ? ? ? 8 polymer man 'Proteasome maturation protein' 15804.993 1 ? ? ? ? 9 polymer man 'Proteasome assembly chaperone 1' 32891.887 1 ? ? ? ? 10 polymer man 'Proteasome assembly chaperone 2' 29449.080 1 ? ? ? ? 11 polymer man 'Proteasome subunit beta type-7' 35490.406 1 ? ? ? 'Where the identity of amino acids cannot be confidently assign, these are modelled as unknown (UNK)' 12 polymer man 'Proteasome subunit beta type-3' 22972.896 1 3.4.25.1 ? ? ? 13 polymer man 'Proteasome subunit beta type-2' 22890.314 1 ? ? ? ? 14 polymer man 'Proteasome subunit beta type-5' 28510.248 1 3.4.25.1 ? ? ? 15 polymer man 'Proteasome subunit beta type-1' 26522.396 1 3.4.25.1 ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'Macropain subunit C3,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C3,Proteasome component C3' 2 'Macropain subunit C9,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C9,Proteasome component C9,Proteasome subunit L' 3 'Proteasome subunit RC6-1,Proteasome subunit XAPC7' 4 'Macropain zeta chain,Multicatalytic endopeptidase complex zeta chain,Proteasome zeta chain' 6 'Macropain subunit C8,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C8,Proteasome component C8' 8 'Proteassemblin,Protein UMP1 homolog,hUMP1,Voltage-gated K channel beta subunit 4.1' 9 'PAC-1,Chromosome 21 leucine-rich protein,C21-LRP,Down syndrome critical region protein 2' 12 'Proteasome chain 13,Proteasome component C10-II,Proteasome theta chain' 14 ;Macropain epsilon chain,Multicatalytic endopeptidase complex epsilon chain,Proteasome chain 6,Proteasome epsilon chain,Proteasome subunit MB1,Proteasome subunit X ; 15 'Macropain subunit C5,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C5,Proteasome component C5,Proteasome gamma chain' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MAERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMG PDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKA TAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA ; ;MAERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMG PDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKA TAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA ; A ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGIT SDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWK ATCIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKH EEEEAKAEREKKEKEQKEKDK ; ;MSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGIT SDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWK ATCIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKH EEEEAKAEREKKEKEQKEKDK ; B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADA RIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANA IGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLTIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQSLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENE KKKQKKAS ; ;MSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADA RIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANA IGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLTIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQSLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENE KKKQKKAS ; C ? 4 'polypeptide(L)' no yes ;(ACE)MFLTRSEYDRGVNTFSPEGRLFQVEYAIEAIKLGSTAIGIQTSEGVCLAVEKRITSPLMEPSSIEKIVEIDAHIG CAMSGLIADAKTLIDKARVETQNHWFTYNETMTVESVTQAVSNLALQFGEEDADPGAMSRPFGVALLFGGVDEKGPQLFH MDPSGTFVQCDARAIGSASEGAQSSLQEVYHKSMTLKEAIKSSLIILKQVMEEKLNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELE EVIKDI ; ;XMFLTRSEYDRGVNTFSPEGRLFQVEYAIEAIKLGSTAIGIQTSEGVCLAVEKRITSPLMEPSSIEKIVEIDAHIGCAMS GLIADAKTLIDKARVETQNHWFTYNETMTVESVTQAVSNLALQFGEEDADPGAMSRPFGVALLFGGVDEKGPQLFHMDPS GTFVQCDARAIGSASEGAQSSLQEVYHKSMTLKEAIKSSLIILKQVMEEKLNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELEEVIK DI ; D ? 5 'polypeptide(L)' no yes ;(ACE)MFRNQYDNDVTVWSPQGRIHQIEYAMEAVKQGSATVGLKSKTHAVLVALKRAQSELAAHQKKILHVDNHIGISIA 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WEEMEKSRCIPEIDDSEFCIRIPGGGITKTLYDESCSKEIQMAVLLKFVSEGDNIPDALGLVEYLNEWLQILKPLSDDPT VSASRWKIPSSWRLLFGSGLPPALF ; J ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MAAVSVYAPPVGGFSFDNCRRNAVLEADFAKRGYKLPKVRKTGTTIAGVVYKDGIVLGADTRATEGMVVADKNCSKIHFI SPNIYCCGAGTAADTDMTTQLISSNLELHSLSTGRLPRVVTANRMLKQMLFRYQGYIGAALVLGGVDVTGPHLYSIYPHG STDKLPYVTMGSGSLAAMAVFEDKFRPDMEEEEAKNLVSEAIAAGIFNDLGSGSNIDLCVISKNKLDFLRPYTVPNKKGT RLGRYRCEKGTTAVLTEKITPLEIEVLEETVQTMDTSEDLYFQSVDSAWSHPQFEKGGGSGGGSGGSAWSHPQFEK (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ; ;MAAVSVYAPPVGGFSFDNCRRNAVLEADFAKRGYKLPKVRKTGTTIAGVVYKDGIVLGADTRATEGMVVADKNCSKIHFI SPNIYCCGAGTAADTDMTTQLISSNLELHSLSTGRLPRVVTANRMLKQMLFRYQGYIGAALVLGGVDVTGPHLYSIYPHG STDKLPYVTMGSGSLAAMAVFEDKFRPDMEEEEAKNLVSEAIAAGIFNDLGSGSNIDLCVISKNKLDFLRPYTVPNKKGT RLGRYRCEKGTTAVLTEKITPLEIEVLEETVQTMDTSEDLYFQSVDSAWSHPQFEKGGGSGGGSGGSAWSHPQFEKXXXX XXXXXXXXXXXX ; K ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MSIMSYNGGAVMAMKGKNCVAIAADRRFGIQAQMVTTDFQKIFPMGDRLYIGLAGLATDVQTVAQRLKFRLNLYELKEGR 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SER O 195 ALA O 211 1 ? 17 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale both ? 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