data_LLE
#

_chem_comp.id                                   LLE
_chem_comp.name                                 "(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-~{N}-[3-oxidanylidene-3-[2-[(1~{R},4~{Z},6~{Z},8~{Z})-1,5,7,9-tetrakis(oxidanyl)-3,11-bis(oxidanylidene)dodeca-4,6,8-trienyl]sulfanylethylamino]propyl]-4-[tris(oxidanyl)-$l^{5}-phosphanyl]oxy-butanamide"
_chem_comp.type                                 NON-POLYMER
_chem_comp.pdbx_type                            HETAIN
_chem_comp.formula                              "C23 H39 N2 O13 P S"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id              ?
_chem_comp.pdbx_synonyms                        ?
_chem_comp.pdbx_formal_charge                   0
_chem_comp.pdbx_initial_date                    2019-08-22
_chem_comp.pdbx_modified_date                   2020-05-22
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                  N
_chem_comp.pdbx_release_status                  REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by                     ?
_chem_comp.pdbx_replaces                        ?
_chem_comp.formula_weight                       614.600
_chem_comp.one_letter_code                      ?
_chem_comp.three_letter_code                    LLE
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details       ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag  Y
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details       Corina
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag  N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code       6SMP
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list               ?
_chem_comp.pdbx_processing_site                 PDBE
#   #
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
LLE  C4   C1   C  0  1  N  N  N  14.698  -17.697  18.633   14.040  -0.683   0.273  C4   LLE   1  
LLE  C5   C2   C  0  1  N  N  N  15.639  -17.338  17.553   12.692  -0.204  -0.201  C5   LLE   2  
LLE  C6   C3   C  0  1  N  N  N  16.780  -17.960  17.510   11.602  -0.395   0.565  C6   LLE   3  
LLE  C7   C4   C  0  1  N  N  N  17.678  -17.600  16.432   10.311  -0.336  -0.013  C7   LLE   4  
LLE  C8   C5   C  0  1  N  N  N  18.900  -17.901  16.666    9.202  -0.167   0.792  C8   LLE   5  
LLE  C10  C6   C  0  1  N  N  N  22.855  -20.011  16.067    4.429   0.915   1.337  C10  LLE   6  
LLE  C13  C7   C  0  1  N  N  N  14.220  -15.610  20.004   15.610  -2.753   0.025  C13  LLE   7  
LLE  C28  C8   C  0  1  N  N  N  19.238  -29.836   9.883   -9.811  -0.560  -0.407  C28  LLE   8  
LLE  O25  O1   O  0  1  N  N  N  19.534  -32.681   8.623   -8.669  -3.248   0.789  O25  LLE   9  
LLE  P24  P1   P  0  1  N  N  N  18.300  -32.064   9.091  -10.342  -2.996   0.479  P24  LLE  10  
LLE  O26  O2   O  0  1  N  N  N  17.613  -33.039   9.919  -10.546  -2.386   2.074  O26  LLE  11  
LLE  O27  O3   O  0  1  N  N  N  18.436  -30.937  10.131   -9.943  -1.926  -0.807  O27  LLE  12  
LLE  C29  C9   C  0  1  N  N  N  20.127  -29.581  11.067   -9.457   0.296  -1.624  C29  LLE  13  
LLE  C30  C10  C  0  1  N  N  N  19.490  -28.518  11.914   -8.135  -0.189  -2.221  C30  LLE  14  
LLE  C31  C11  C  0  1  N  N  N  20.369  -30.805  11.911  -10.565   0.176  -2.672  C31  LLE  15  
LLE  C32  C12  C  0  1  N  N  R  21.383  -29.082  10.439   -9.317   1.758  -1.195  C32  LLE  16  
LLE  O33  O4   O  0  1  N  N  N  20.987  -27.870   9.839  -10.526   2.189  -0.569  O33  LLE  17  
LLE  C34  C13  C  0  1  N  N  N  22.508  -28.901  11.390   -8.173   1.889  -0.223  C34  LLE  18  
LLE  O35  O5   O  0  1  N  N  N  22.891  -29.838  12.027   -8.395   2.110   0.949  O35  LLE  19  
LLE  N36  N1   N  0  1  N  N  N  23.074  -27.718  11.441   -6.903   1.762  -0.655  N36  LLE  20  
LLE  C37  C14  C  0  1  N  N  N  24.190  -27.423  12.302   -5.797   1.775   0.306  C37  LLE  21  
LLE  C38  C15  C  0  1  N  N  N  24.130  -26.015  12.872   -4.471   1.614  -0.440  C38  LLE  22  
LLE  C39  C16  C  0  1  N  N  N  25.397  -25.708  13.612   -3.333   1.628   0.548  C39  LLE  23  
LLE  O40  O6   O  0  1  N  N  N  26.037  -26.610  14.082   -3.561   1.754   1.733  O40  LLE  24  
LLE  N41  N2   N  0  1  N  N  N  25.758  -24.440  13.715   -2.063   1.500   0.116  N41  LLE  25  
LLE  C42  C17  C  0  1  N  N  N  26.116  -23.810  14.973   -0.958   1.514   1.077  C42  LLE  26  
LLE  C12  C18  C  0  1  N  N  N  25.027  -23.154  15.821    0.368   1.353   0.331  C12  LLE  27  
LLE  S44  S1   S  0  1  N  N  N  24.242  -21.888  14.904    1.738   1.370   1.520  S44  LLE  28  
LLE  C11  C19  C  0  1  N  N  R  24.164  -20.182  15.407    3.199   1.171   0.464  C11  LLE  29  
LLE  O19  O7   O  0  1  N  N  N  24.301  -19.398  14.211    3.398   2.360  -0.303  O19  LLE  30  
LLE  C3   C20  C  0  1  N  N  N  22.100  -18.872  15.508    5.618   0.628   0.458  C3   LLE  31  
LLE  O23  O8   O  0  1  N  N  N  22.471  -18.198  14.588    5.494   0.628  -0.753  O23  LLE  32  
LLE  C2   C21  C  0  1  N  N  N  20.863  -18.695  16.138    6.854   0.364   1.028  C2   LLE  33  
LLE  C9   C22  C  0  1  N  N  N  20.058  -17.748  15.833    7.953   0.099   0.216  C9   LLE  34  
LLE  O20  O9   O  0  1  N  N  N  20.328  -16.851  14.925    7.815   0.099  -1.131  O20  LLE  35  
LLE  O21  O10  O  0  1  N  N  N  17.271  -16.994  15.342   10.165  -0.447  -1.353  O21  LLE  36  
LLE  O22  O11  O  0  1  N  N  N  15.348  -16.421  16.654   12.578   0.415  -1.395  O22  LLE  37  
LLE  C43  C23  C  0  1  N  N  N  13.894  -16.472  18.837   14.318  -2.049  -0.299  C43  LLE  38  
LLE  O24  O12  O  0  1  N  N  N  13.037  -16.226  18.027   13.505  -2.579  -1.019  O24  LLE  39  
LLE  H1   H1   H  0  1  N  N  N  14.057  -18.538  18.329   14.810   0.014  -0.058  H1   LLE  40  
LLE  H2   H2   H  0  1  N  N  N  15.242  -17.964  19.551   14.043  -0.738   1.362  H2   LLE  41  
LLE  H3   H3   H  0  1  N  N  N  17.045  -18.708  18.242   11.713  -0.592   1.622  H3   LLE  42  
LLE  H4   H4   H  0  1  N  N  N  19.088  -18.336  17.637    9.297  -0.240   1.865  H4   LLE  43  
LLE  H5   H5   H  0  1  N  N  N  22.265  -20.930  15.930    4.631   1.796   1.946  H5   LLE  44  
LLE  H6   H6   H  0  1  N  N  N  23.018  -19.836  17.141    4.242   0.060   1.987  H6   LLE  45  
LLE  H7   H7   H  0  1  N  N  N  13.562  -14.729  20.005   15.683  -2.900   1.103  H7   LLE  46  
LLE  H8   H8   H  0  1  N  N  N  14.071  -16.179  20.933   15.632  -3.721  -0.475  H8   LLE  47  
LLE  H9   H9   H  0  1  N  N  N  15.269  -15.285  19.938   16.450  -2.148  -0.317  H9   LLE  48  
LLE  H10  H10  H  0  1  N  N  N  19.858  -30.028   8.995  -10.753  -0.214   0.019  H10  LLE  49  
LLE  H11  H11  H  0  1  N  N  N  18.604  -28.955   9.705   -9.022  -0.474   0.340  H11  LLE  50  
LLE  H12  H12  H  0  1  N  N  N  20.009  -32.066   8.076   -8.182  -3.618   0.041  H12  LLE  51  
LLE  H13  H13  H  0  1  N  N  N  16.801  -32.666  10.241  -11.452  -2.117   2.279  H13  LLE  52  
LLE  H14  H14  H  0  1  N  N  N  20.126  -28.315  12.788   -8.266  -1.191  -2.629  H14  LLE  53  
LLE  H15  H15  H  0  1  N  N  N  19.376  -27.598  11.323   -7.825   0.489  -3.017  H15  LLE  54  
LLE  H16  H16  H  0  1  N  N  N  18.501  -28.862  12.252   -7.371  -0.210  -1.444  H16  LLE  55  
LLE  H17  H17  H  0  1  N  N  N  21.025  -30.545  12.755  -11.487   0.601  -2.276  H17  LLE  56  
LLE  H18  H18  H  0  1  N  N  N  19.409  -31.181  12.295  -10.273   0.716  -3.573  H18  LLE  57  
LLE  H19  H19  H  0  1  N  N  N  20.850  -31.583  11.299  -10.723  -0.875  -2.914  H19  LLE  58  
LLE  H20  H20  H  0  1  N  N  N  21.692  -29.796   9.661   -9.121   2.377  -2.072  H20  LLE  59  
LLE  H21  H21  H  0  1  N  N  N  21.733  -27.472   9.407  -10.763   1.682   0.220  H21  LLE  60  
LLE  H22  H22  H  0  1  N  N  N  22.715  -26.990  10.857   -6.721   1.661  -1.603  H22  LLE  61  
LLE  H23  H23  H  0  1  N  N  N  24.192  -28.141  13.135   -5.797   2.722   0.846  H23  LLE  62  
LLE  H24  H24  H  0  1  N  N  N  25.120  -27.530  11.724   -5.919   0.953   1.012  H24  LLE  63  
LLE  H25  H25  H  0  1  N  N  N  24.004  -25.294  12.051   -4.471   0.668  -0.981  H25  LLE  64  
LLE  H26  H26  H  0  1  N  N  N  23.277  -25.937  13.562   -4.349   2.436  -1.146  H26  LLE  65  
LLE  H27  H27  H  0  1  N  N  N  25.786  -23.886  12.883   -1.881   1.399  -0.832  H27  LLE  66  
LLE  H28  H28  H  0  1  N  N  N  26.585  -24.585  15.597   -0.958   2.460   1.617  H28  LLE  67  
LLE  H29  H29  H  0  1  N  N  N  26.855  -23.029  14.741   -1.079   0.692   1.782  H29  LLE  68  
LLE  H30  H30  H  0  1  N  N  N  25.480  -22.722  16.726    0.368   0.407  -0.210  H30  LLE  69  
LLE  H31  H31  H  0  1  N  N  N  24.283  -23.911  16.109    0.490   2.175  -0.375  H31  LLE  70  
LLE  H32  H32  H  0  1  N  N  N  24.992  -20.006  16.110    3.049   0.326  -0.208  H32  LLE  71  
LLE  H33  H33  H  0  1  N  N  N  23.585  -18.776  14.156    3.538   3.153   0.231  H33  LLE  72  
LLE  H34  H34  H  0  1  N  N  N  20.575  -19.388  16.915    6.964   0.365   2.103  H34  LLE  73  
LLE  H35  H35  H  0  1  N  N  N  21.167  -17.047  14.525    8.649   0.001  -1.611  H35  LLE  74  
LLE  H36  H36  H  0  1  N  N  N  16.330  -16.871  15.380   10.985  -0.651  -1.823  H36  LLE  75  
LLE  H37  H37  H  0  1  N  N  N  14.484  -16.067  16.830   11.700   0.783  -1.564  H37  LLE  76  
LLE  O1   O13  O  0  1  N  Y  N  17.424  -31.679   7.871  -10.537  -4.677   0.169  O1   LLE  77  
LLE  H39  H39  H  0  1  N  N  N  16.618  -31.276   8.173  -10.761  -5.198   0.953  H39  LLE  78  
LLE  H38  H38  H  0  1  N  N  N       ?        ?       ?  -11.772  -2.781   0.214  H38  LLE  79  
#   #
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
LLE  O25  P24  SING  N  N   1  
LLE  P24  O26  SING  N  N   2  
LLE  P24  O27  SING  N  N   3  
LLE  O33  C32  SING  N  N   4  
LLE  C28  O27  SING  N  N   5  
LLE  C28  C29  SING  N  N   6  
LLE  C32  C29  SING  N  N   7  
LLE  C32  C34  SING  N  N   8  
LLE  C29  C31  SING  N  N   9  
LLE  C29  C30  SING  N  N  10  
LLE  C34  N36  SING  N  N  11  
LLE  C34  O35  DOUB  N  N  12  
LLE  N36  C37  SING  N  N  13  
LLE  C37  C38  SING  N  N  14  
LLE  C38  C39  SING  N  N  15  
LLE  C39  N41  SING  N  N  16  
LLE  C39  O40  DOUB  N  N  17  
LLE  N41  C42  SING  N  N  18  
LLE  O19  C11  SING  N  N  19  
LLE  O23  C3   DOUB  N  N  20  
LLE  S44  C11  SING  N  N  21  
LLE  S44  C12  SING  N  N  22  
LLE  O20  C9   SING  N  N  23  
LLE  C42  C12  SING  N  N  24  
LLE  O21  C7   SING  N  N  25  
LLE  C11  C10  SING  N  N  26  
LLE  C3   C10  SING  N  N  27  
LLE  C3   C2   SING  N  N  28  
LLE  C9   C2   DOUB  N  Z  29  
LLE  C9   C8   SING  N  N  30  
LLE  C7   C8   DOUB  N  Z  31  
LLE  C7   C6   SING  N  N  32  
LLE  O22  C5   SING  N  N  33  
LLE  C6   C5   DOUB  N  Z  34  
LLE  C5   C4   SING  N  N  35  
LLE  O24  C43  DOUB  N  N  36  
LLE  C4   C43  SING  N  N  37  
LLE  C43  C13  SING  N  N  38  
LLE  C4   H1   SING  N  N  39  
LLE  C4   H2   SING  N  N  40  
LLE  C6   H3   SING  N  N  41  
LLE  C8   H4   SING  N  N  42  
LLE  C10  H5   SING  N  N  43  
LLE  C10  H6   SING  N  N  44  
LLE  C13  H7   SING  N  N  45  
LLE  C13  H8   SING  N  N  46  
LLE  C13  H9   SING  N  N  47  
LLE  C28  H10  SING  N  N  48  
LLE  C28  H11  SING  N  N  49  
LLE  O25  H12  SING  N  N  50  
LLE  O26  H13  SING  N  N  51  
LLE  C30  H14  SING  N  N  52  
LLE  C30  H15  SING  N  N  53  
LLE  C30  H16  SING  N  N  54  
LLE  C31  H17  SING  N  N  55  
LLE  C31  H18  SING  N  N  56  
LLE  C31  H19  SING  N  N  57  
LLE  C32  H20  SING  N  N  58  
LLE  O33  H21  SING  N  N  59  
LLE  N36  H22  SING  N  N  60  
LLE  C37  H23  SING  N  N  61  
LLE  C37  H24  SING  N  N  62  
LLE  C38  H25  SING  N  N  63  
LLE  C38  H26  SING  N  N  64  
LLE  N41  H27  SING  N  N  65  
LLE  C42  H28  SING  N  N  66  
LLE  C42  H29  SING  N  N  67  
LLE  C12  H30  SING  N  N  68  
LLE  C12  H31  SING  N  N  69  
LLE  C11  H32  SING  N  N  70  
LLE  O19  H33  SING  N  N  71  
LLE  C2   H34  SING  N  N  72  
LLE  O20  H35  SING  N  N  73  
LLE  O21  H36  SING  N  N  74  
LLE  O22  H37  SING  N  N  75  
LLE  P24  O1   SING  N  N  76  
LLE  O1   H39  SING  N  N  77  
LLE  P24  H38  SING  N  N  78  
#   #
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
LLE  InChI             InChI                 1.03   "InChI=1S/C23H39N2O13PS/c1-14(26)8-15(27)9-16(28)10-17(29)11-18(30)12-20(32)40-7-6-24-19(31)4-5-25-22(34)21(33)23(2,3)13-38-39(35,36)37/h9-11,20-21,27-29,32-33,35-37,39H,4-8,12-13H2,1-3H3,(H,24,31)(H,25,34)/b15-9-,16-10-,17-11-/t20-,21+/m1/s1"  
LLE  InChIKey          InChI                 1.03   FQZZDEAQTCCCMT-XOXVVNQZSA-N  
LLE  SMILES_CANONICAL  CACTVS                3.385  "CC(=O)C/C(O)=C/C(O)=C/C(O)=C/C(=O)C[C@H](O)SCCNC(=O)CCNC(=O)[C@H](O)C(C)(C)CO[PH](O)(O)O"  
LLE  SMILES            CACTVS                3.385  "CC(=O)CC(O)=CC(O)=CC(O)=CC(=O)C[CH](O)SCCNC(=O)CCNC(=O)[CH](O)C(C)(C)CO[PH](O)(O)O"  
LLE  SMILES_CANONICAL  "OpenEye OEToolkits"  2.0.7  "CC(=O)C/C(=C/C(=C/C(=C/C(=O)C[C@H](O)SCCNC(=O)CCNC(=O)[C@@H](C(C)(C)COP(O)(O)O)O)/O)/O)/O"  
LLE  SMILES            "OpenEye OEToolkits"  2.0.7  "CC(=O)CC(=CC(=CC(=CC(=O)CC(O)SCCNC(=O)CCNC(=O)C(C(C)(C)COP(O)(O)O)O)O)O)O"  
#
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id          LLE
_pdbx_chem_comp_identifier.type             "SYSTEMATIC NAME"
_pdbx_chem_comp_identifier.program          "OpenEye OEToolkits"
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version  2.0.7
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier       "(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-~{N}-[3-oxidanylidene-3-[2-[(1~{R},4~{Z},6~{Z},8~{Z})-1,5,7,9-tetrakis(oxidanyl)-3,11-bis(oxidanylidene)dodeca-4,6,8-trienyl]sulfanylethylamino]propyl]-4-[tris(oxidanyl)-$l^{5}-phosphanyl]oxy-butanamide"
#   #
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
LLE  "Create component"  2019-08-22  PDBE  
LLE  "Initial release"   2020-05-27  RCSB  
##
