data_M7G
# 
_chem_comp.id                                    M7G 
_chem_comp.name                                  "7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C11 H19 N5 O11 P2" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     1999-07-08 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2011-06-04 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         MDG 
_chem_comp.formula_weight                        459.243 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     M7G 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        1EJ1 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
M7G PA     PA   P 0 1 N N S 4.418  11.773 14.326 -0.169 -0.023 -3.365 PA     M7G 1  
M7G O1A    O1A  O 0 1 N N N 4.950  11.847 12.934 0.825  0.994  -2.959 O1A    M7G 2  
M7G O2A    O2A  O 0 1 N N N 4.818  10.458 14.881 -1.316 0.671  -4.255 O2A    M7G 3  
M7G O3A    O3A  O 0 1 N N N 5.080  12.946 15.243 0.559  -1.171 -4.228 O3A    M7G 4  
M7G "O5'"  O5*  O 0 1 N N N 2.779  11.869 14.344 -0.831 -0.679 -2.052 "O5'"  M7G 5  
M7G PB     PB   P 0 1 N N N 4.651  14.509 15.233 1.195  -0.449 -5.518 PB     M7G 6  
M7G O1B    O1B  O 0 1 N N N 4.732  15.083 13.864 2.169  0.575  -5.080 O1B    M7G 7  
M7G O2B    O2B  O 0 1 N N N 5.611  15.230 16.108 1.944  -1.544 -6.431 O2B    M7G 8  
M7G O3B    O3B  O 0 1 N N N 3.265  14.672 15.747 0.025  0.253  -6.373 O3B    M7G 9  
M7G "C5'"  C5*  C 0 1 N N N 2.039  12.541 13.352 -1.459 0.383  -1.331 "C5'"  M7G 10 
M7G "C4'"  C4*  C 0 1 N N R 0.814  11.828 12.892 -2.112 -0.174 -0.065 "C4'"  M7G 11 
M7G "O4'"  O4*  O 0 1 N N N 1.216  10.800 11.925 -1.114 -0.764 0.796  "O4'"  M7G 12 
M7G "C3'"  C3*  C 0 1 N N S 0.143  10.948 13.900 -2.730 0.967  0.771  "C3'"  M7G 13 
M7G "O3'"  O3*  O 0 1 N N N -0.626 11.721 14.854 -4.134 1.066  0.522  "O3'"  M7G 14 
M7G "C2'"  C2*  C 0 1 N N R -0.812 10.162 12.968 -2.466 0.546  2.236  "C2'"  M7G 15 
M7G "O2'"  O2*  O 0 1 N N N -1.840 11.016 12.387 -3.700 0.374  2.937  "O2'"  M7G 16 
M7G "C1'"  C1*  C 0 1 N N R 0.231  9.736  11.939 -1.717 -0.798 2.108  "C1'"  M7G 17 
M7G N9     N9   N 0 1 N N N 1.103  8.581  12.346 -0.684 -0.906 3.141  N9     M7G 18 
M7G C8     C8   C 0 1 N N N 2.255  8.468  13.018 -0.584 -1.961 4.157  C8     M7G 19 
M7G N7     N7   N 0 1 N N N 2.546  7.200  13.107 0.607  -1.633 4.951  N7     M7G 20 
M7G CM7    CM7  C 0 1 N N N 3.715  6.625  13.762 1.133  -2.387 6.091  CM7    M7G 21 
M7G C5     C5   C 0 1 N N N 1.539  6.346  12.451 1.143  -0.446 4.407  C5     M7G 22 
M7G C6     C6   C 0 1 N N N 1.359  5.107  12.262 2.268  0.310  4.766  C6     M7G 23 
M7G O6     O6   O 0 1 N N N 2.153  4.183  12.691 2.970  -0.028 5.707  O6     M7G 24 
M7G N1     N1   N 0 1 N N N 0.186  4.886  11.550 2.562  1.418  4.055  N1     M7G 25 
M7G C2     C2   C 0 1 N N N -0.681 5.853  11.090 1.772  1.784  3.008  C2     M7G 26 
M7G N2     N2   N 0 1 N N N -1.753 5.491  10.421 2.086  2.913  2.295  N2     M7G 27 
M7G N3     N3   N 0 1 N N N -0.476 7.133  11.294 0.714  1.083  2.668  N3     M7G 28 
M7G C4     C4   C 0 1 N N N 0.663  7.369  12.000 0.372  -0.031 3.333  C4     M7G 29 
M7G HOA2   2HOA H 0 0 N N N 4.479  10.410 15.767 -1.942 -0.025 -4.498 HOA2   M7G 30 
M7G HOB2   2HOB H 0 0 N N N 5.359  16.146 16.102 2.310  -1.071 -7.191 HOB2   M7G 31 
M7G HOB3   3HOB H 0 0 N N N 3.013  15.588 15.741 -0.585 -0.447 -6.638 HOB3   M7G 32 
M7G "H5'1" 1H5* H 0 0 N N N 1.780  13.570 13.694 -2.220 0.848  -1.958 "H5'1" M7G 33 
M7G "H5'2" 2H5* H 0 0 N N N 2.692  12.784 12.482 -0.710 1.127  -1.057 "H5'2" M7G 34 
M7G "H4'"  H4*  H 0 1 N N N 0.149  12.659 12.560 -2.873 -0.909 -0.324 "H4'"  M7G 35 
M7G "H3'"  H3*  H 0 1 N N N 0.841  10.334 14.516 -2.236 1.914  0.550  "H3'"  M7G 36 
M7G "HO3'" *HO3 H 0 0 N N N -1.051 11.162 15.493 -4.464 1.792  1.069  "HO3'" M7G 37 
M7G "H2'"  H2*  H 0 1 N N N -1.407 9.346  13.440 -1.841 1.284  2.739  "H2'"  M7G 38 
M7G "HO2'" *HO2 H 0 0 N N N -2.425 10.533 11.815 -4.147 1.232  2.930  "HO2'" M7G 39 
M7G "H1'"  H1*  H 0 1 N N N -0.339 9.493  11.012 -2.416 -1.631 2.183  "H1'"  M7G 40 
M7G H81    1H8  H 0 1 N N N 3.078  9.069  12.566 -0.462 -2.933 3.679  H81    M7G 41 
M7G H82    2H8  H 0 1 N N N 2.227  8.975  14.010 -1.471 -1.960 4.790  H82    M7G 42 
M7G HM71   1HM7 H 0 0 N N N 3.963  5.540  13.838 2.027  -1.895 6.472  HM71   M7G 43 
M7G HM72   2HM7 H 0 0 N N N 4.603  7.118  13.303 0.379  -2.429 6.878  HM72   M7G 44 
M7G HM73   3HM7 H 0 0 N N N 3.714  7.019  14.805 1.383  -3.399 5.773  HM73   M7G 45 
M7G HN1    HN1  H 0 1 N N N -0.063 3.918  11.344 3.336  1.954  4.289  HN1    M7G 46 
M7G HN21   1HN2 H 0 0 N N N -2.394 6.206  10.080 1.531  3.185  1.548  HN21   M7G 47 
M7G HN22   2HN2 H 0 0 N N N -2.278 4.822  10.983 2.862  3.441  2.539  HN22   M7G 48 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
M7G PA    O1A    DOUB N N 1  
M7G PA    O2A    SING N N 2  
M7G PA    O3A    SING N N 3  
M7G PA    "O5'"  SING N N 4  
M7G O2A   HOA2   SING N N 5  
M7G O3A   PB     SING N N 6  
M7G "O5'" "C5'"  SING N N 7  
M7G PB    O1B    DOUB N N 8  
M7G PB    O2B    SING N N 9  
M7G PB    O3B    SING N N 10 
M7G O2B   HOB2   SING N N 11 
M7G O3B   HOB3   SING N N 12 
M7G "C5'" "C4'"  SING N N 13 
M7G "C5'" "H5'1" SING N N 14 
M7G "C5'" "H5'2" SING N N 15 
M7G "C4'" "O4'"  SING N N 16 
M7G "C4'" "C3'"  SING N N 17 
M7G "C4'" "H4'"  SING N N 18 
M7G "O4'" "C1'"  SING N N 19 
M7G "C3'" "O3'"  SING N N 20 
M7G "C3'" "C2'"  SING N N 21 
M7G "C3'" "H3'"  SING N N 22 
M7G "O3'" "HO3'" SING N N 23 
M7G "C2'" "O2'"  SING N N 24 
M7G "C2'" "C1'"  SING N N 25 
M7G "C2'" "H2'"  SING N N 26 
M7G "O2'" "HO2'" SING N N 27 
M7G "C1'" N9     SING N N 28 
M7G "C1'" "H1'"  SING N N 29 
M7G N9    C8     SING N N 30 
M7G N9    C4     SING N N 31 
M7G C8    N7     SING N N 32 
M7G C8    H81    SING N N 33 
M7G C8    H82    SING N N 34 
M7G N7    CM7    SING N N 35 
M7G N7    C5     SING N N 36 
M7G CM7   HM71   SING N N 37 
M7G CM7   HM72   SING N N 38 
M7G CM7   HM73   SING N N 39 
M7G C5    C6     SING N N 40 
M7G C5    C4     DOUB N N 41 
M7G C6    O6     DOUB N N 42 
M7G C6    N1     SING N N 43 
M7G N1    C2     SING N N 44 
M7G N1    HN1    SING N N 45 
M7G C2    N2     SING N N 46 
M7G C2    N3     DOUB N N 47 
M7G N2    HN21   SING N N 48 
M7G N2    HN22   SING N N 49 
M7G N3    C4     SING N N 50 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
M7G SMILES           ACDLabs              10.04 "O=P(O)(O)OP(=O)(O)OCC3OC(N1C=2N=C(N)NC(=O)C=2N(C1)C)C(O)C3O"                                                                                                                                         
M7G SMILES_CANONICAL CACTVS               3.341 "CN1CN([C@@H]2O[C@H](CO[P@@](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]2O)C3=C1C(=O)NC(=N3)N"                                                                                                                  
M7G SMILES           CACTVS               3.341 "CN1CN([CH]2O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH]2O)C3=C1C(=O)NC(=N3)N"                                                                                                                          
M7G SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "CN1CN(C2=C1C(=O)NC(=N2)N)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO[P@](=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O"                                                                                                                   
M7G SMILES           "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "CN1CN(C2=C1C(=O)NC(=N2)N)C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O"                                                                                                                                        
M7G InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/C11H19N5O11P2/c1-15-3-16(8-5(15)9(19)14-11(12)13-8)10-7(18)6(17)4(26-10)2-25-29(23,24)27-28(20,21)22/h4,6-7,10,17-18H,2-3H2,1H3,(H,23,24)(H2,20,21,22)(H3,12,13,14,19)/t4-,6-,7-,10-/m1/s1" 
M7G InChIKey         InChI                1.03  QQODJOAVWUWVHJ-KQYNXXCUSA-N                                                                                                                                                                           
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
M7G "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              10.04 
;7-methylguanosine 5'-(trihydrogen diphosphate)
;
M7G "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-7-methyl-6-oxo-1,8-dihydropurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
M7G "Create component"  1999-07-08 RCSB 
M7G "Modify descriptor" 2011-06-04 RCSB 
# 
