data_NGA
#

_chem_comp.id                                   NGA
_chem_comp.name                                 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose
_chem_comp.type                                 "D-saccharide, beta linking"
_chem_comp.pdbx_type                            ATOMS
_chem_comp.formula                              "C8 H15 N O6"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id              ?
_chem_comp.pdbx_synonyms                        
;N-acetyl-beta-D-galactosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactose; 2-acetamido-2-deoxy-D-galactose;
2-acetamido-2-deoxy-galactose; N-ACETYL-D-GALACTOSAMINE
;

_chem_comp.pdbx_formal_charge                   0
_chem_comp.pdbx_initial_date                    1999-07-08
_chem_comp.pdbx_modified_date                   2020-07-17
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                  N
_chem_comp.pdbx_release_status                  REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by                     ?
_chem_comp.pdbx_replaces                        ?
_chem_comp.formula_weight                       221.208
_chem_comp.one_letter_code                      ?
_chem_comp.three_letter_code                    NGA
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details       ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag  N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details       Corina
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag  N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code       3CHB
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list               ?
_chem_comp.pdbx_processing_site                 RCSB
#   #
loop_
_pdbx_chem_comp_synonyms.ordinal
_pdbx_chem_comp_synonyms.comp_id
_pdbx_chem_comp_synonyms.name
_pdbx_chem_comp_synonyms.provenance
_pdbx_chem_comp_synonyms.type
1  NGA  N-acetyl-beta-D-galactosamine         PDB  ?  
2  NGA  2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactose  PDB  ?  
3  NGA  2-acetamido-2-deoxy-D-galactose       PDB  ?  
4  NGA  2-acetamido-2-deoxy-galactose         PDB  ?  
5  NGA  N-ACETYL-D-GALACTOSAMINE              PDB  ?  
#   #
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
NGA  C1   C1   C  0  1  N  N  R  -12.079  20.898  -1.919   0.071   1.072  -0.412  C1   NGA   1  
NGA  C2   C2   C  0  1  N  N  R  -11.844  19.742  -0.936   0.740  -0.250  -0.029  C2   NGA   2  
NGA  C3   C3   C  0  1  N  N  R  -10.967  20.217   0.174  -0.079  -1.412  -0.601  C3   NGA   3  
NGA  C4   C4   C  0  1  N  N  R   -9.669  20.856  -0.340  -1.516  -1.316  -0.080  C4   NGA   4  
NGA  C5   C5   C  0  1  N  N  R  -10.072  21.968  -1.280  -2.098   0.048  -0.461  C5   NGA   5  
NGA  C6   C6   C  0  1  N  N  N   -8.975  22.914  -1.693  -3.512   0.176   0.108  C6   NGA   6  
NGA  C7   C7   C  0  1  N  N  N  -13.368  17.886  -0.720   3.116   0.273   0.101  C7   NGA   7  
NGA  C8   C8   C  0  1  N  N  N  -14.811  17.468  -0.421   4.512   0.232  -0.465  C8   NGA   8  
NGA  N2   N2   N  0  1  N  N  N  -13.146  19.205  -0.610   2.097  -0.290  -0.578  N2   NGA   9  
NGA  O1   O1   O  0  1  N  Y  N  -12.834  20.294  -2.960   0.797   2.158   0.166  O1   NGA  10  
NGA  O3   O3   O  0  1  N  N  N  -10.588  19.109   0.990   0.498  -2.652  -0.187  O3   NGA  11  
NGA  O4   O4   O  0  1  N  N  N   -8.909  19.857  -0.976  -1.519  -1.456   1.342  O4   NGA  12  
NGA  O5   O5   O  0  1  N  N  N  -10.831  21.434  -2.362  -1.273   1.084   0.076  O5   NGA  13  
NGA  O6   O6   O  0  1  N  N  N   -9.573  24.131  -2.078  -4.099   1.398  -0.345  O6   NGA  14  
NGA  O7   O7   O  0  1  N  N  N  -12.407  17.166  -1.066   2.909   0.812   1.168  O7   NGA  15  
NGA  H1   H1   H  0  1  N  N  N  -12.610  21.759  -1.487   0.064   1.175  -1.497  H1   NGA  16  
NGA  H2   H2   H  0  1  N  N  N  -11.276  18.889  -1.337   0.783  -0.336   1.057  H2   NGA  17  
NGA  H3   H3   H  0  1  N  N  N  -11.545  20.967   0.734  -0.081  -1.355  -1.689  H3   NGA  18  
NGA  H4   H4   H  0  1  N  N  N   -9.048  21.280   0.463  -2.119  -2.106  -0.526  H4   NGA  19  
NGA  H5   H5   H  0  1  N  N  N  -10.720  22.644  -0.704  -2.133   0.138  -1.547  H5   NGA  20  
NGA  H61  H61  H  0  1  N  N  N   -8.287  23.083  -0.851  -4.118  -0.664  -0.231  H61  NGA  21  
NGA  H62  H62  H  0  1  N  N  N   -8.410  22.489  -2.536  -3.468   0.176   1.196  H62  NGA  22  
NGA  H81  H81  H  0  1  N  N  N  -14.914  16.381  -0.555   4.528   0.738  -1.430  H81  NGA  23  
NGA  H82  H82  H  0  1  N  N  N  -15.062  17.735   0.616   5.196   0.734   0.220  H82  NGA  24  
NGA  H83  H83  H  0  1  N  N  N  -15.493  17.988  -1.109   4.822  -0.805  -0.593  H83  NGA  25  
NGA  HN2  HN2  H  0  1  N  N  N  -13.878  19.814  -0.304   2.262  -0.721  -1.432  HN2  NGA  26  
NGA  HO1  HO1  H  0  1  N  Y  N  -13.031  20.942  -3.626   0.429   3.030  -0.036  HO1  NGA  27  
NGA  HO3  HO3  H  0  1  N  Y  N  -10.030  19.412   1.697   0.029  -3.433  -0.514  HO3  NGA  28  
NGA  HO4  HO4  H  0  1  N  Y  N   -8.100  20.233  -1.302  -2.398  -1.404   1.740  HO4  NGA  29  
NGA  HO6  HO6  H  0  1  N  Y  N   -8.899  24.746  -2.343  -4.998   1.546  -0.022  HO6  NGA  30  
#   #
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
NGA  C1  C2   SING  N  N   1  
NGA  C1  O1   SING  N  N   2  
NGA  C1  O5   SING  N  N   3  
NGA  C1  H1   SING  N  N   4  
NGA  C2  C3   SING  N  N   5  
NGA  C2  N2   SING  N  N   6  
NGA  C2  H2   SING  N  N   7  
NGA  C3  C4   SING  N  N   8  
NGA  C3  O3   SING  N  N   9  
NGA  C3  H3   SING  N  N  10  
NGA  C4  C5   SING  N  N  11  
NGA  C4  O4   SING  N  N  12  
NGA  C4  H4   SING  N  N  13  
NGA  C5  C6   SING  N  N  14  
NGA  C5  O5   SING  N  N  15  
NGA  C5  H5   SING  N  N  16  
NGA  C6  O6   SING  N  N  17  
NGA  C6  H61  SING  N  N  18  
NGA  C6  H62  SING  N  N  19  
NGA  C7  C8   SING  N  N  20  
NGA  C7  N2   SING  N  N  21  
NGA  C7  O7   DOUB  N  N  22  
NGA  C8  H81  SING  N  N  23  
NGA  C8  H82  SING  N  N  24  
NGA  C8  H83  SING  N  N  25  
NGA  N2  HN2  SING  N  N  26  
NGA  O1  HO1  SING  N  N  27  
NGA  O3  HO3  SING  N  N  28  
NGA  O4  HO4  SING  N  N  29  
NGA  O6  HO6  SING  N  N  30  
#   #
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
NGA  SMILES            ACDLabs               10.04  "O=C(NC1C(O)C(O)C(OC1O)CO)C"  
NGA  SMILES_CANONICAL  CACTVS                3.352  "CC(=O)N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O"  
NGA  SMILES            CACTVS                3.352  "CC(=O)N[CH]1[CH](O)O[CH](CO)[CH](O)[CH]1O"  
NGA  SMILES_CANONICAL  "OpenEye OEToolkits"  1.7.0  "CC(=O)N[C@@H]1[C@H]([C@H]([C@H](O[C@H]1O)CO)O)O"  
NGA  SMILES            "OpenEye OEToolkits"  1.7.0  "CC(=O)NC1C(C(C(OC1O)CO)O)O"  
NGA  InChI             InChI                 1.03   "InChI=1S/C8H15NO6/c1-3(11)9-5-7(13)6(12)4(2-10)15-8(5)14/h4-8,10,12-14H,2H2,1H3,(H,9,11)/t4-,5-,6+,7-,8-/m1/s1"  
NGA  InChIKey          InChI                 1.03   OVRNDRQMDRJTHS-JAJWTYFOSA-N  
#   #
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
NGA  "SYSTEMATIC NAME"                      ACDLabs               10.04  "2-(acetylamino)-2-deoxy-beta-D-galactopyranose"  
NGA  "SYSTEMATIC NAME"                      "OpenEye OEToolkits"  1.6.1  "N-[(2R,3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-3-yl]ethanamide"  
NGA  "CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL"  GMML                  1.0    DGalpNAcb  
NGA  "COMMON NAME"                          GMML                  1.0    N-acetyl-b-D-galactopyranosamine  
NGA  "IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL"            PDB-CARE              1.0    b-D-GalpNAc  
NGA  "SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL"             GMML                  1.0    GalNAc  
#   #
loop_
_pdbx_chem_comp_feature.comp_id
_pdbx_chem_comp_feature.type
_pdbx_chem_comp_feature.value
_pdbx_chem_comp_feature.source
_pdbx_chem_comp_feature.support
NGA  "CARBOHYDRATE ISOMER"                  D         PDB  ?  
NGA  "CARBOHYDRATE RING"                    pyranose  PDB  ?  
NGA  "CARBOHYDRATE ANOMER"                  beta      PDB  ?  
NGA  "CARBOHYDRATE PRIMARY CARBONYL GROUP"  aldose    PDB  ?  
#   #
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
NGA  "Create component"    1999-07-08  RCSB  
NGA  "Modify descriptor"   2011-06-04  RCSB  
NGA  "Other modification"  2019-08-12  RCSB  
NGA  "Other modification"  2019-12-19  RCSB  
NGA  "Other modification"  2020-07-03  RCSB  
NGA  "Modify name"         2020-07-17  RCSB  
NGA  "Modify synonyms"     2020-07-17  RCSB  
##
