data_PLG
#

_chem_comp.id                                   PLG
_chem_comp.name                                 N-GLYCINE-[3-HYDROXY-2-METHYL-5-PHOSPHONOOXYMETHYL-PYRIDIN-4-YL-METHANE]
_chem_comp.type                                 NON-POLYMER
_chem_comp.pdbx_type                            HETAIN
_chem_comp.formula                              "C10 H15 N2 O7 P"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id              ?
_chem_comp.pdbx_synonyms                        N-PYRIDOXYL-GLYCINE-5-MONOPHOSPHATE
_chem_comp.pdbx_formal_charge                   0
_chem_comp.pdbx_initial_date                    1999-12-01
_chem_comp.pdbx_modified_date                   2021-03-01
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                  N
_chem_comp.pdbx_release_status                  REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by                     ?
_chem_comp.pdbx_replaces                        ?
_chem_comp.formula_weight                       306.209
_chem_comp.one_letter_code                      ?
_chem_comp.three_letter_code                    PLG
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details       ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag  N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details       ?
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag  N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code       1DFO
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list               ?
_chem_comp.pdbx_processing_site                 RCSB
#   #
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
PLG  N1    N1    N  0  1  Y  N  N   5.284  48.979  54.972   3.469   0.637  -0.120  N1    PLG   1  
PLG  C2    C2    C  0  1  Y  N  N   4.525  48.093  54.298   3.389   0.278  -1.386  C2    PLG   2  
PLG  C2A   C2A   C  0  1  N  N  N   3.654  48.639  53.222   4.569   0.494  -2.299  C2A   PLG   3  
PLG  C3    C3    C  0  1  Y  N  N   4.643  46.720  54.695   2.228  -0.290  -1.888  C3    PLG   4  
PLG  O3    O3    O  0  1  N  N  N   3.918  45.822  54.064   2.150  -0.658  -3.194  O3    PLG   5  
PLG  C4    C4    C  0  1  Y  N  N   5.534  46.376  55.774   1.148  -0.488  -1.033  C4    PLG   6  
PLG  C4A   C4A   C  0  1  N  N  N   5.633  44.973  56.156  -0.129  -1.109  -1.535  C4A   PLG   7  
PLG  C5    C5    C  0  1  Y  N  N   6.286  47.351  56.452   1.275  -0.096   0.289  C5    PLG   8  
PLG  C6    C6    C  0  1  Y  N  N   6.144  48.689  56.004   2.463   0.468   0.714  C6    PLG   9  
PLG  C5A   C5A   C  0  1  N  N  N   7.214  47.211  57.611   0.132  -0.284   1.253  C5A   PLG  10  
PLG  OP4   OP4   O  0  1  N  N  N   8.361  46.396  57.460   0.513   0.196   2.543  OP4   PLG  11  
PLG  P     P     P  0  1  N  N  N   9.166  45.624  58.545  -0.747  -0.034   3.517  P     PLG  12  
PLG  OP1   OP1   O  0  1  N  N  N   9.170  46.560  59.713  -1.072  -1.476   3.569  OP1   PLG  13  
PLG  OP2   OP2   O  0  1  N  N  N   8.380  44.298  58.776  -0.385   0.488   4.996  OP2   PLG  14  
PLG  OP3   OP3   O  0  1  N  N  N  10.552  45.256  58.088  -2.015   0.782   2.954  OP3   PLG  15  
PLG  C     C     C  0  1  N  N  N   3.592  41.932  55.423  -3.216   0.308  -3.014  C     PLG  16  
PLG  O     O     O  0  1  N  N  N   2.887  42.571  54.615  -2.921   1.479  -2.993  O     PLG  17  
PLG  OXT   OXT   O  0  1  N  N  N   3.413  40.724  55.675  -4.407  -0.075  -3.500  OXT   PLG  18  
PLG  CA    CA    C  0  1  N  N  N   4.723  42.657  56.118  -2.246  -0.722  -2.496  CA    PLG  19  
PLG  N     N     N  0  1  N  N  N   4.635  44.083  55.890  -1.026  -0.054  -2.024  N     PLG  20  
PLG  H2A1  1H2A  H  0  0  N  N  N   3.025  47.905  52.664   5.211  -0.386  -2.277  H2A1  PLG  21  
PLG  H2A2  2H2A  H  0  0  N  N  N   3.006  49.444  53.638   4.215   0.661  -3.316  H2A2  PLG  22  
PLG  H2A3  3H2A  H  0  0  N  N  N   4.272  49.224  52.502   5.133   1.364  -1.963  H2A3  PLG  23  
PLG  HO3   HO3   H  0  1  N  N  N   3.996  44.912  54.327   1.808   0.104  -3.680  HO3   PLG  24  
PLG  H4A1  1H4A  H  0  0  N  N  N   6.576  44.567  55.721   0.096  -1.799  -2.348  H4A1  PLG  25  
PLG  H4A2  2H4A  H  0  0  N  N  N   5.843  44.931  57.250  -0.614  -1.650  -0.723  H4A2  PLG  26  
PLG  H6    H6    H  0  1  N  N  N   6.710  49.515  56.464   2.568   0.776   1.744  H6    PLG  27  
PLG  H5A1  1H5A  H  0  0  N  N  N   7.531  48.225  57.946  -0.735   0.271   0.899  H5A1  PLG  28  
PLG  H5A2  2H5A  H  0  0  N  N  N   6.636  46.863  58.498  -0.116  -1.343   1.319  H5A2  PLG  29  
PLG  HOP2  2HOP  H  0  0  N  N  N   8.871  43.826  59.438  -1.165   0.332   5.546  HOP2  PLG  30  
PLG  HOP3  3HOP  H  0  0  N  N  N  11.043  44.784  58.750  -1.762   1.715   2.936  HOP3  PLG  31  
PLG  HXT   HXT   H  0  1  N  N  N   3.949  40.237  56.289  -5.029   0.586  -3.833  HXT   PLG  32  
PLG  HA2   HA2   H  0  1  N  N  N   4.762  42.414  57.205  -1.993  -1.418  -3.296  HA2   PLG  33  
PLG  HA1   HA1   H  0  1  N  N  N   5.718  42.251  55.819  -2.704  -1.269  -1.671  HA1   PLG  34  
PLG  H     H     H  0  1  N  N  N   4.377  44.210  54.911  -1.290   0.497  -1.221  H     PLG  35  
#   #
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
PLG  N1   C2    DOUB  Y  N   1  
PLG  N1   C6    SING  Y  N   2  
PLG  C2   C2A   SING  N  N   3  
PLG  C2   C3    SING  Y  N   4  
PLG  C2A  H2A1  SING  N  N   5  
PLG  C2A  H2A2  SING  N  N   6  
PLG  C2A  H2A3  SING  N  N   7  
PLG  C3   O3    SING  N  N   8  
PLG  C3   C4    DOUB  Y  N   9  
PLG  O3   HO3   SING  N  N  10  
PLG  C4   C4A   SING  N  N  11  
PLG  C4   C5    SING  Y  N  12  
PLG  C4A  N     SING  N  N  13  
PLG  C4A  H4A1  SING  N  N  14  
PLG  C4A  H4A2  SING  N  N  15  
PLG  C5   C6    DOUB  Y  N  16  
PLG  C5   C5A   SING  N  N  17  
PLG  C6   H6    SING  N  N  18  
PLG  C5A  OP4   SING  N  N  19  
PLG  C5A  H5A1  SING  N  N  20  
PLG  C5A  H5A2  SING  N  N  21  
PLG  OP4  P     SING  N  N  22  
PLG  P    OP1   DOUB  N  N  23  
PLG  P    OP2   SING  N  N  24  
PLG  P    OP3   SING  N  N  25  
PLG  OP2  HOP2  SING  N  N  26  
PLG  OP3  HOP3  SING  N  N  27  
PLG  C    O     DOUB  N  N  28  
PLG  C    OXT   SING  N  N  29  
PLG  C    CA    SING  N  N  30  
PLG  OXT  HXT   SING  N  N  31  
PLG  CA   N     SING  N  N  32  
PLG  CA   HA2   SING  N  N  33  
PLG  CA   HA1   SING  N  N  34  
PLG  N    H     SING  N  N  35  
#   #
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
PLG  SMILES            ACDLabs               10.04  "O=P(O)(O)OCc1cnc(c(O)c1CNCC(=O)O)C"  
PLG  SMILES_CANONICAL  CACTVS                3.341  "Cc1ncc(CO[P](O)(O)=O)c(CNCC(O)=O)c1O"  
PLG  SMILES            CACTVS                3.341  "Cc1ncc(CO[P](O)(O)=O)c(CNCC(O)=O)c1O"  
PLG  SMILES_CANONICAL  "OpenEye OEToolkits"  1.5.0  "Cc1c(c(c(cn1)COP(=O)(O)O)CNCC(=O)O)O"  
PLG  SMILES            "OpenEye OEToolkits"  1.5.0  "Cc1c(c(c(cn1)COP(=O)(O)O)CNCC(=O)O)O"  
PLG  InChI             InChI                 1.03   "InChI=1S/C10H15N2O7P/c1-6-10(15)8(3-11-4-9(13)14)7(2-12-6)5-19-20(16,17)18/h2,11,15H,3-5H2,1H3,(H,13,14)(H2,16,17,18)"  
PLG  InChIKey          InChI                 1.03   FEVQWBMNLWUBTF-UHFFFAOYSA-N  
#   #
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
PLG  "SYSTEMATIC NAME"  ACDLabs               10.04  "N-({3-hydroxy-2-methyl-5-[(phosphonooxy)methyl]pyridin-4-yl}methyl)glycine"  
PLG  "SYSTEMATIC NAME"  "OpenEye OEToolkits"  1.5.0  "2-[[3-hydroxy-2-methyl-5-(phosphonooxymethyl)pyridin-4-yl]methylamino]ethanoic acid"  
#   #
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
PLG  "Create component"   1999-12-01  RCSB  
PLG  "Modify descriptor"  2011-06-04  RCSB  
PLG  "Modify synonyms"    2021-03-01  PDBE  
#
_pdbx_chem_comp_synonyms.ordinal     1
_pdbx_chem_comp_synonyms.comp_id     PLG
_pdbx_chem_comp_synonyms.name        N-PYRIDOXYL-GLYCINE-5-MONOPHOSPHATE
_pdbx_chem_comp_synonyms.provenance  ?
_pdbx_chem_comp_synonyms.type        ?
##
