data_6GR # _chem_comp.id 6GR _chem_comp.name "2-(alpha-L-altropyranosyloxy)benzoic acid" _chem_comp.type L-saccharide _chem_comp.pdbx_type ATOMS _chem_comp.formula "C13 H16 O8" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id Z6H _chem_comp.pdbx_synonyms "2-(alpha-L-altrosyloxy)benzoic acid; 2-(L-altrosyloxy)benzoic acid; 2-(altrosyloxy)benzoic acid" _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2016-04-07 _chem_comp.pdbx_modified_date 2020-07-17 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 300.261 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code 6GR _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 5J6I _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # # loop_ _pdbx_chem_comp_synonyms.ordinal _pdbx_chem_comp_synonyms.comp_id _pdbx_chem_comp_synonyms.name _pdbx_chem_comp_synonyms.provenance _pdbx_chem_comp_synonyms.type 1 6GR "2-(alpha-L-altrosyloxy)benzoic acid" PDB ? 2 6GR "2-(L-altrosyloxy)benzoic acid" PDB ? 3 6GR "2-(altrosyloxy)benzoic acid" PDB ? # # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal 6GR C3 C3 C 0 1 N N S 50.216 74.057 37.770 2.347 1.452 -0.247 C3 6GR 1 6GR C2 C2 C 0 1 N N R 49.099 73.943 36.840 1.870 0.950 -1.614 C2 6GR 2 6GR C4 C4 C 0 1 N N R 51.433 74.768 37.244 2.835 0.261 0.582 C4 6GR 3 6GR C5 C5 C 0 1 N N S 51.329 75.084 35.792 1.705 -0.764 0.704 C5 6GR 4 6GR C6 C6 C 0 1 N N N 52.542 75.677 35.182 2.204 -1.984 1.481 C6 6GR 5 6GR C1 C1 C 0 1 N N S 48.942 75.080 35.825 0.776 -0.102 -1.409 C1 6GR 6 6GR OAA OAA O 0 1 N N N 49.030 75.675 30.350 -1.601 2.332 0.395 OAA 6GR 7 6GR CAN CAN C 0 1 N N N 49.038 75.304 31.559 -2.586 1.634 0.538 CAN 6GR 8 6GR OAC OAC O 0 1 N N N 49.717 74.346 31.902 -3.680 2.131 1.148 OAC 6GR 9 6GR CAP CAP C 0 1 Y N N 48.183 76.089 32.554 -2.583 0.245 0.046 CAP 6GR 10 6GR CAJ CAJ C 0 1 Y N N 47.535 77.208 32.026 -3.714 -0.559 0.204 CAJ 6GR 11 6GR CAH CAH C 0 1 Y N N 46.711 78.017 32.838 -3.705 -1.857 -0.259 CAH 6GR 12 6GR CAG CAG C 0 1 Y N N 46.543 77.700 34.167 -2.578 -2.369 -0.881 CAG 6GR 13 6GR CAI CAI C 0 1 Y N N 47.190 76.576 34.715 -1.453 -1.586 -1.044 CAI 6GR 14 6GR CAO CAO C 0 1 Y N N 48.010 75.763 33.924 -1.446 -0.275 -0.589 CAO 6GR 15 6GR O1 O1 O 0 1 N N N 48.609 74.659 34.596 -0.343 0.497 -0.753 O1 6GR 16 6GR O5 O5 O 0 1 N N N 50.158 75.886 35.570 1.288 -1.168 -0.601 O5 6GR 17 6GR O6 O6 O 0 1 N N N 53.263 74.870 34.383 1.119 -2.889 1.696 O6 6GR 18 6GR O4 O4 O 0 1 N N N 52.615 74.036 37.517 3.215 0.710 1.885 O4 6GR 19 6GR O3 O3 O 0 1 N N N 50.546 72.742 38.244 1.264 2.094 0.430 O3 6GR 20 6GR O2 O2 O 0 1 N N N 47.917 73.748 37.679 2.969 0.366 -2.317 O2 6GR 21 6GR H3 H1 H 0 1 N N N 49.861 74.639 38.633 3.163 2.161 -0.384 H3 6GR 22 6GR H2 H2 H 0 1 N N N 49.246 73.021 36.259 1.472 1.785 -2.190 H2 6GR 23 6GR H4 H3 H 0 1 N N N 51.498 75.727 37.778 3.693 -0.198 0.091 H4 6GR 24 6GR H5 H4 H 0 1 N N N 51.162 74.125 35.279 0.863 -0.317 1.232 H5 6GR 25 6GR H61 H5 H 0 1 N N N 53.198 76.013 35.999 2.986 -2.484 0.910 H61 6GR 26 6GR H62 H6 H 0 1 N N N 52.226 76.545 34.585 2.605 -1.663 2.443 H62 6GR 27 6GR H1 H7 H 0 1 N N N 48.164 75.756 36.210 0.464 -0.494 -2.377 H1 6GR 28 6GR H8 H8 H 0 1 N N N 50.174 73.995 31.147 -3.635 3.047 1.454 H8 6GR 29 6GR H9 H9 H 0 1 N N N 47.666 77.457 30.983 -4.595 -0.164 0.688 H9 6GR 30 6GR H10 H10 H 0 1 N N N 46.215 78.880 32.419 -4.580 -2.477 -0.137 H10 6GR 31 6GR H11 H11 H 0 1 N N N 45.913 78.316 34.792 -2.579 -3.388 -1.240 H11 6GR 32 6GR H12 H12 H 0 1 N N N 47.052 76.338 35.759 -0.578 -1.993 -1.529 H12 6GR 33 6GR HO6 H13 H 0 1 N Y N 54.014 75.345 34.046 1.363 -3.687 2.183 HO6 6GR 34 6GR HO4 H14 H 0 1 N Y N 52.662 73.845 38.446 3.925 1.367 1.883 HO4 6GR 35 6GR HO3 H15 H 0 1 N Y N 51.273 72.798 38.852 0.903 2.858 -0.042 HO3 6GR 36 6GR HO2 H16 H 0 1 N Y N 48.073 73.033 38.285 2.739 0.025 -3.193 HO2 6GR 37 # # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal 6GR OAA CAN DOUB N N 1 6GR CAN OAC SING N N 2 6GR CAN CAP SING N N 3 6GR CAJ CAP DOUB Y N 4 6GR CAJ CAH SING Y N 5 6GR CAP CAO SING Y N 6 6GR CAH CAG DOUB Y N 7 6GR CAO O1 SING N N 8 6GR CAO CAI DOUB Y N 9 6GR CAG CAI SING Y N 10 6GR O6 C6 SING N N 11 6GR O1 C1 SING N N 12 6GR C6 C5 SING N N 13 6GR O5 C5 SING N N 14 6GR O5 C1 SING N N 15 6GR C5 C4 SING N N 16 6GR C1 C2 SING N N 17 6GR C2 O2 SING N N 18 6GR C2 C3 SING N N 19 6GR C4 O4 SING N N 20 6GR C4 C3 SING N N 21 6GR C3 O3 SING N N 22 6GR C3 H3 SING N N 23 6GR C2 H2 SING N N 24 6GR C4 H4 SING N N 25 6GR C5 H5 SING N N 26 6GR C6 H61 SING N N 27 6GR C6 H62 SING N N 28 6GR C1 H1 SING N N 29 6GR OAC H8 SING N N 30 6GR CAJ H9 SING N N 31 6GR CAH H10 SING N N 32 6GR CAG H11 SING N N 33 6GR CAI H12 SING N N 34 6GR O6 HO6 SING N N 35 6GR O4 HO4 SING N N 36 6GR O3 HO3 SING N N 37 6GR O2 HO2 SING N N 38 # # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 6GR SMILES ACDLabs 12.01 "C2(O)C(O)C(Oc1c(C(=O)O)cccc1)OC(C2O)CO" 6GR InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C13H16O8/c14-5-8-9(15)10(16)11(17)13(21-8)20-7-4-2-1-3-6(7)12(18)19/h1-4,8-11,13-17H,5H2,(H,18,19)/t8-,9-,10-,11+,13+/m0/s1" 6GR InChIKey InChI 1.03 TZPBMNKOLMSJPF-HKLXJQGRSA-N 6GR SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "OC[C@@H]1O[C@@H](Oc2ccccc2C(O)=O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O" 6GR SMILES CACTVS 3.385 "OC[CH]1O[CH](Oc2ccccc2C(O)=O)[CH](O)[CH](O)[CH]1O" 6GR SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.7.6 "c1ccc(c(c1)C(=O)O)O[C@H]2[C@@H]([C@H]([C@H]([C@@H](O2)CO)O)O)O" 6GR SMILES "OpenEye OEToolkits" 1.7.6 "c1ccc(c(c1)C(=O)O)OC2C(C(C(C(O2)CO)O)O)O" # # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier 6GR "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "2-(alpha-L-altropyranosyloxy)benzoic acid" 6GR "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.7.6 "2-[(2S,3R,4S,5R,6S)-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxybenzoic acid" # _pdbx_chem_comp_related.comp_id 6GR _pdbx_chem_comp_related.related_comp_id Z6H _pdbx_chem_comp_related.relationship_type "Carbohydrate core" _pdbx_chem_comp_related.details ? # # loop_ _pdbx_chem_comp_atom_related.ordinal _pdbx_chem_comp_atom_related.comp_id _pdbx_chem_comp_atom_related.atom_id _pdbx_chem_comp_atom_related.related_comp_id _pdbx_chem_comp_atom_related.related_atom_id _pdbx_chem_comp_atom_related.related_type 1 6GR C1 Z6H C1 "Carbohydrate core" 2 6GR C2 Z6H C2 "Carbohydrate core" 3 6GR C3 Z6H C3 "Carbohydrate core" 4 6GR C4 Z6H C4 "Carbohydrate core" 5 6GR C5 Z6H C5 "Carbohydrate core" 6 6GR C6 Z6H C6 "Carbohydrate core" 7 6GR O1 Z6H O1 "Carbohydrate core" 8 6GR O2 Z6H O2 "Carbohydrate core" 9 6GR O3 Z6H O3 "Carbohydrate core" 10 6GR O4 Z6H O4 "Carbohydrate core" 11 6GR O5 Z6H O5 "Carbohydrate core" 12 6GR O6 Z6H O6 "Carbohydrate core" 13 6GR H3 Z6H H3 "Carbohydrate core" 14 6GR HO6 Z6H HO6 "Carbohydrate core" 15 6GR HO4 Z6H HO4 "Carbohydrate core" 16 6GR HO3 Z6H HO3 "Carbohydrate core" 17 6GR HO2 Z6H HO2 "Carbohydrate core" 18 6GR H2 Z6H H2 "Carbohydrate core" 19 6GR H4 Z6H H4 "Carbohydrate core" 20 6GR H5 Z6H H5 "Carbohydrate core" 21 6GR H61 Z6H H61 "Carbohydrate core" 22 6GR H62 Z6H H62 "Carbohydrate core" 23 6GR H1 Z6H H1 "Carbohydrate core" # # loop_ _pdbx_chem_comp_feature.comp_id _pdbx_chem_comp_feature.type _pdbx_chem_comp_feature.value _pdbx_chem_comp_feature.source _pdbx_chem_comp_feature.support 6GR "CARBOHYDRATE ISOMER" L PDB ? 6GR "CARBOHYDRATE RING" pyranose PDB ? 6GR "CARBOHYDRATE ANOMER" alpha PDB ? 6GR "CARBOHYDRATE PRIMARY CARBONYL GROUP" aldose PDB ? # # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site 6GR "Create component" 2016-04-07 RCSB 6GR "Initial release" 2019-10-09 RCSB 6GR "Other modification" 2020-07-03 RCSB 6GR "Modify parent residue" 2020-07-17 RCSB 6GR "Modify synonyms" 2020-07-17 RCSB 6GR "Modify internal type" 2020-07-17 RCSB 6GR "Modify linking type" 2020-07-17 RCSB 6GR "Modify atom id" 2020-07-17 RCSB 6GR "Modify component atom id" 2020-07-17 RCSB 6GR "Modify leaving atom flag" 2020-07-17 RCSB ##