data_EUS # _chem_comp.id EUS _chem_comp.name "N-[(1R,2S,3S,4R,5S)-5-amino-4-{[(2S,3R)-3-amino-6-(aminomethyl)-3,4-dihydro-2H-pyran-2-yl]oxy}-2-{[3-deoxy-4-C-methyl-3-(methylamino)-beta-L-arabinopyranosyl]oxy}-3-hydroxycyclohexyl]methanesulfonamide" _chem_comp.type saccharide _chem_comp.pdbx_type ATOMS _chem_comp.formula "C20 H39 N5 O9 S" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2018-02-01 _chem_comp.pdbx_modified_date 2018-07-20 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 525.617 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code EUS _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 6CAS _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal EUS C6 C1 C 0 1 N N N 107.861 396.281 27.920 -1.970 5.109 0.669 C6 EUS 1 EUS O1 O1 O 0 1 N N N 109.197 396.888 30.171 -3.836 4.122 -0.963 O1 EUS 2 EUS C11 C2 C 0 1 N N S 113.633 390.612 32.541 3.685 -0.657 0.487 C11 EUS 3 EUS C12 C3 C 0 1 N N R 110.472 393.810 29.822 -0.877 2.031 0.208 C12 EUS 4 EUS C13 C4 C 0 1 N N R 111.407 392.608 26.901 -1.946 -1.149 -1.256 C13 EUS 5 EUS C21 C5 C 0 1 N N R 113.421 389.354 33.330 4.561 -1.484 1.439 C21 EUS 6 EUS C22 C6 C 0 1 N N N 111.093 394.451 31.051 0.416 2.844 0.131 C22 EUS 7 EUS C23 C7 C 0 1 N N R 110.389 392.346 25.822 -3.364 -1.726 -1.242 C23 EUS 8 EUS C31 C8 C 0 1 N N N 112.961 389.781 34.710 5.506 -2.344 0.592 C31 EUS 9 EUS C32 C9 C 0 1 N N S 111.333 393.388 32.106 1.495 2.168 0.979 C32 EUS 10 EUS C33 C10 C 0 1 N N R 110.066 390.866 25.846 -3.624 -2.391 0.112 C33 EUS 11 EUS C41 C11 C 0 1 N N N 113.900 390.648 35.272 6.131 -1.494 -0.480 C41 EUS 12 EUS C42 C12 C 0 1 N N R 112.273 392.321 31.571 1.749 0.755 0.450 C42 EUS 13 EUS C43 C13 C 0 1 N N R 111.343 390.109 25.529 -2.557 -3.464 0.354 C43 EUS 14 EUS C51 C14 C 0 1 N N N 114.740 391.425 34.476 5.640 -0.336 -0.834 C51 EUS 15 EUS C52 C15 C 0 1 N N S 111.675 391.703 30.306 0.455 -0.058 0.527 C52 EUS 16 EUS C53 C16 C 0 1 N N N 112.388 390.461 26.585 -1.171 -2.821 0.279 C53 EUS 17 EUS C61 C17 C 0 1 N N N 115.694 392.272 35.041 6.336 0.433 -1.927 C61 EUS 18 EUS C62 C18 C 0 1 N N S 111.437 392.776 29.260 -0.624 0.618 -0.321 C62 EUS 19 EUS C83 C19 C 0 1 N N N 111.078 388.601 25.563 -2.760 -4.084 1.738 C83 EUS 20 EUS C93 C20 C 0 1 N N N 107.713 390.351 25.619 -5.993 -2.034 0.462 C93 EUS 21 EUS N12 N1 N 0 1 N N N 110.111 394.827 28.817 -1.911 2.678 -0.604 N12 EUS 22 EUS N21 N2 N 0 1 N N N 112.428 388.481 32.685 5.344 -0.586 2.298 N21 EUS 23 EUS N32 N3 N 0 1 N N N 111.868 393.989 33.337 2.737 2.949 0.905 N32 EUS 24 EUS N33 N4 N 0 1 N N N 108.990 390.524 24.905 -4.955 -3.012 0.108 N33 EUS 25 EUS N61 N5 N 0 1 N N N 115.246 393.672 35.040 5.447 0.544 -3.091 N61 EUS 26 EUS O11 O2 O 0 1 N N N 112.395 391.328 32.585 2.757 0.123 1.242 O11 EUS 27 EUS O2 O3 O 0 1 N N N 107.888 394.754 30.149 -3.500 2.992 1.212 O2 EUS 28 EUS O23 O4 O 0 1 N N N 109.218 393.101 26.115 -4.310 -0.674 -1.446 O23 EUS 29 EUS O43 O5 O 0 1 N N N 111.807 390.480 24.220 -2.668 -4.481 -0.645 O43 EUS 30 EUS O51 O6 O 0 1 N N N 114.726 391.374 33.111 4.539 0.207 -0.269 O51 EUS 31 EUS O52 O7 O 0 1 N N N 112.539 390.694 29.755 0.692 -1.378 0.033 O52 EUS 32 EUS O53 O8 O 0 1 N N N 112.619 391.884 26.628 -1.006 -2.193 -0.994 O53 EUS 33 EUS O62 O9 O 0 1 N N N 110.842 392.159 28.130 -1.832 -0.142 -0.249 O62 EUS 34 EUS S S1 S 0 1 N N N 108.779 395.683 29.323 -2.988 3.719 0.103 S EUS 35 EUS H1 H1 H 0 1 N N N 106.983 396.845 28.269 -1.467 5.563 -0.186 H1 EUS 36 EUS H2 H2 H 0 1 N N N 108.503 396.939 27.315 -2.605 5.852 1.152 H2 EUS 37 EUS H3 H3 H 0 1 N N N 107.530 395.429 27.308 -1.226 4.750 1.379 H3 EUS 38 EUS H4 H4 H 0 1 N N N 113.873 390.344 31.501 3.145 -1.321 -0.187 H4 EUS 39 EUS H5 H5 H 0 1 N N N 109.557 393.286 30.136 -1.211 1.976 1.245 H5 EUS 40 EUS H6 H6 H 0 1 N N N 111.614 393.687 26.948 -1.741 -0.711 -2.233 H6 EUS 41 EUS H7 H7 H 0 1 N N N 114.378 388.819 33.422 3.931 -2.126 2.054 H7 EUS 42 EUS H8 H8 H 0 1 N N N 112.050 394.919 30.777 0.750 2.899 -0.905 H8 EUS 43 EUS H9 H9 H 0 1 N N N 110.411 395.217 31.450 0.236 3.851 0.508 H9 EUS 44 EUS H10 H10 H 0 1 N N N 110.803 392.621 24.841 -3.464 -2.465 -2.037 H10 EUS 45 EUS H11 H11 H 0 1 N N N 111.991 390.294 34.630 6.287 -2.760 1.229 H11 EUS 46 EUS H12 H12 H 0 1 N N N 112.854 388.893 35.351 4.943 -3.156 0.131 H12 EUS 47 EUS H13 H13 H 0 1 N N N 110.369 392.910 32.336 1.162 2.113 2.016 H13 EUS 48 EUS H14 H14 H 0 1 N N N 109.749 390.597 26.864 -3.573 -1.643 0.903 H14 EUS 49 EUS H15 H15 H 0 1 N N N 113.977 390.718 36.347 7.020 -1.855 -0.977 H15 EUS 50 EUS H16 H16 H 0 1 N N N 113.249 392.770 31.336 2.082 0.810 -0.586 H16 EUS 51 EUS H17 H17 H 0 1 N N N 110.706 391.252 30.568 0.122 -0.113 1.564 H17 EUS 52 EUS H18 H18 H 0 1 N N N 112.032 390.124 27.570 -1.073 -2.074 1.067 H18 EUS 53 EUS H19 H19 H 0 1 N N N 113.331 389.950 26.342 -0.406 -3.587 0.408 H19 EUS 54 EUS H20 H20 H 0 1 N N N 115.880 391.958 36.079 6.588 1.430 -1.566 H20 EUS 55 EUS H21 H21 H 0 1 N N N 116.626 392.196 34.462 7.248 -0.091 -2.215 H21 EUS 56 EUS H22 H22 H 0 1 N N N 112.389 393.259 28.997 -0.290 0.673 -1.357 H22 EUS 57 EUS H23 H23 H 0 1 N N N 110.723 388.313 26.563 -3.749 -4.537 1.793 H23 EUS 58 EUS H24 H24 H 0 1 N N N 110.313 388.346 24.815 -2.000 -4.847 1.909 H24 EUS 59 EUS H25 H25 H 0 1 N N N 112.008 388.060 25.335 -2.673 -3.308 2.499 H25 EUS 60 EUS H26 H26 H 0 1 N N N 106.921 390.096 24.899 -5.985 -1.218 -0.261 H26 EUS 61 EUS H27 H27 H 0 1 N N N 107.812 389.541 26.357 -6.969 -2.519 0.452 H27 EUS 62 EUS H28 H28 H 0 1 N N N 107.452 391.287 26.135 -5.794 -1.638 1.458 H28 EUS 63 EUS H29 H29 H 0 1 N N N 109.904 394.375 27.949 -1.963 2.498 -1.555 H29 EUS 64 EUS H30 H30 H 0 1 N N N 112.307 387.652 33.231 5.927 -1.111 2.933 H30 EUS 65 EUS H31 H31 H 0 1 N N N 111.555 388.964 32.615 5.895 0.054 1.746 H31 EUS 66 EUS H33 H33 H 0 1 N N N 112.019 393.274 34.019 2.596 3.887 1.249 H33 EUS 67 EUS H34 H34 H 0 1 N N N 112.734 394.446 33.135 3.484 2.489 1.405 H34 EUS 68 EUS H36 H36 H 0 1 N N N 109.222 389.672 24.436 -4.985 -3.809 0.726 H36 EUS 69 EUS H38 H38 H 0 1 N N N 115.952 394.249 35.451 4.568 0.968 -2.835 H38 EUS 70 EUS H39 H39 H 0 1 N N N 115.080 393.968 34.099 5.891 1.055 -3.838 H39 EUS 71 EUS H41 H41 H 0 1 N N N 109.426 394.028 26.099 -4.204 -0.207 -2.287 H41 EUS 72 EUS H42 H42 H 0 1 N N N 111.972 391.415 24.195 -2.021 -5.193 -0.554 H42 EUS 73 EUS H43 H43 H 0 1 N N N 112.692 390.018 30.405 1.313 -1.892 0.567 H43 EUS 74 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal EUS O43 C43 SING N N 1 EUS N33 C93 SING N N 2 EUS N33 C33 SING N N 3 EUS C43 C83 SING N N 4 EUS C43 C33 SING N N 5 EUS C43 C53 SING N N 6 EUS C23 C33 SING N N 7 EUS C23 O23 SING N N 8 EUS C23 C13 SING N N 9 EUS C53 O53 SING N N 10 EUS O53 C13 SING N N 11 EUS C13 O62 SING N N 12 EUS C6 S SING N N 13 EUS O62 C62 SING N N 14 EUS N12 S SING N N 15 EUS N12 C12 SING N N 16 EUS C62 C12 SING N N 17 EUS C62 C52 SING N N 18 EUS S O2 DOUB N N 19 EUS S O1 DOUB N N 20 EUS O52 C52 SING N N 21 EUS C12 C22 SING N N 22 EUS C52 C42 SING N N 23 EUS C22 C32 SING N N 24 EUS C42 C32 SING N N 25 EUS C42 O11 SING N N 26 EUS C32 N32 SING N N 27 EUS C11 O11 SING N N 28 EUS C11 O51 SING N N 29 EUS C11 C21 SING N N 30 EUS N21 C21 SING N N 31 EUS O51 C51 SING N N 32 EUS C21 C31 SING N N 33 EUS C51 C61 SING N N 34 EUS C51 C41 DOUB N N 35 EUS C31 C41 SING N N 36 EUS N61 C61 SING N N 37 EUS C6 H1 SING N N 38 EUS C6 H2 SING N N 39 EUS C6 H3 SING N N 40 EUS C11 H4 SING N N 41 EUS C12 H5 SING N N 42 EUS C13 H6 SING N N 43 EUS C21 H7 SING N N 44 EUS C22 H8 SING N N 45 EUS C22 H9 SING N N 46 EUS C23 H10 SING N N 47 EUS C31 H11 SING N N 48 EUS C31 H12 SING N N 49 EUS C32 H13 SING N N 50 EUS C33 H14 SING N N 51 EUS C41 H15 SING N N 52 EUS C42 H16 SING N N 53 EUS C52 H17 SING N N 54 EUS C53 H18 SING N N 55 EUS C53 H19 SING N N 56 EUS C61 H20 SING N N 57 EUS C61 H21 SING N N 58 EUS C62 H22 SING N N 59 EUS C83 H23 SING N N 60 EUS C83 H24 SING N N 61 EUS C83 H25 SING N N 62 EUS C93 H26 SING N N 63 EUS C93 H27 SING N N 64 EUS C93 H28 SING N N 65 EUS N12 H29 SING N N 66 EUS N21 H30 SING N N 67 EUS N21 H31 SING N N 68 EUS N32 H33 SING N N 69 EUS N32 H34 SING N N 70 EUS N33 H36 SING N N 71 EUS N61 H38 SING N N 72 EUS N61 H39 SING N N 73 EUS O23 H41 SING N N 74 EUS O43 H42 SING N N 75 EUS O52 H43 SING N N 76 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor EUS SMILES ACDLabs 12.01 "CS(=O)(NC2CC(N)C(OC1OC(=CCC1N)CN)C(C2OC3C(C(C(C)(CO3)O)NC)O)O)=O" EUS InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C20H39N5O9S/c1-20(28)8-31-19(14(27)17(20)24-2)34-16-12(25-35(3,29)30)6-11(23)15(13(16)26)33-18-10(22)5-4-9(7-21)32-18/h4,10-19,24-28H,5-8,21-23H2,1-3H3/t10-,11+,12-,13+,14-,15-,16+,17-,18-,19-,20+/m1/s1" EUS InChIKey InChI 1.03 YMZLOLIFCOUGLA-CPIRLDNISA-N EUS SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "CN[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](OC[C@]1(C)O)O[C@@H]2[C@@H](O)[C@H](O[C@H]3OC(=CC[C@H]3N)CN)[C@@H](N)C[C@H]2N[S](C)(=O)=O" EUS SMILES CACTVS 3.385 "CN[CH]1[CH](O)[CH](OC[C]1(C)O)O[CH]2[CH](O)[CH](O[CH]3OC(=CC[CH]3N)CN)[CH](N)C[CH]2N[S](C)(=O)=O" EUS SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "C[C@@]1(CO[C@@H]([C@@H]([C@H]1NC)O)O[C@H]2[C@@H](C[C@@H]([C@H]([C@@H]2O)O[C@@H]3[C@@H](CC=C(O3)CN)N)N)NS(=O)(=O)C)O" EUS SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "CC1(COC(C(C1NC)O)OC2C(CC(C(C2O)OC3C(CC=C(O3)CN)N)N)NS(=O)(=O)C)O" # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier EUS "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "N-[(1R,2S,3S,4R,5S)-5-amino-4-{[(2S,3R)-3-amino-6-(aminomethyl)-3,4-dihydro-2H-pyran-2-yl]oxy}-2-{[3-deoxy-4-C-methyl-3-(methylamino)-beta-L-arabinopyranosyl]oxy}-3-hydroxycyclohexyl]methanesulfonamide" EUS "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "~{N}-[(1~{R},2~{S},3~{S},4~{R},5~{S})-4-[[(2~{S},3~{R})-6-(aminomethyl)-3-azanyl-3,4-dihydro-2~{H}-pyran-2-yl]oxy]-5-azanyl-2-[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-methyl-4-(methylamino)-3,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3-oxidanyl-cyclohexyl]methanesulfonamide" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site EUS "Create component" 2018-02-01 RCSB EUS "Initial release" 2018-07-25 RCSB #