data_MED # _chem_comp.id MED _chem_comp.name D-METHIONINE _chem_comp.type "D-PEPTIDE LINKING" _chem_comp.pdbx_type ATOMP _chem_comp.formula "C5 H11 N O2 S" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2002-01-18 _chem_comp.pdbx_modified_date 2023-11-03 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 149.211 _chem_comp.one_letter_code M _chem_comp.three_letter_code MED _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 1KQ0 _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_backbone_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_n_terminal_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_c_terminal_atom_flag _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal MED N N N 0 1 N N N Y Y N 20.779 27.715 16.515 -1.228 1.830 0.137 N MED 1 MED CA CA C 0 1 N N R Y N N 19.604 28.469 15.985 -1.222 0.404 0.489 CA MED 2 MED C C C 0 1 N N N Y N Y 18.517 28.702 17.029 -2.505 -0.234 0.023 C MED 3 MED O O O 0 1 N N N Y N Y 18.753 29.040 18.193 -3.167 0.298 -0.836 O MED 4 MED CB CB C 0 1 N N N N N N 20.029 29.809 15.405 -0.035 -0.283 -0.189 CB MED 5 MED CG CG C 0 1 N N N N N N 20.938 30.640 16.249 1.271 0.280 0.377 CG MED 6 MED SD SD S 0 1 N N N N N N 21.032 32.191 15.335 2.679 -0.535 -0.427 SD MED 7 MED CE CE C 0 1 N N N N N N 19.498 32.908 15.736 4.110 0.251 0.363 CE MED 8 MED OXT OXT O 0 1 N Y N Y N Y 17.347 28.561 16.692 -2.912 -1.394 0.562 OXT MED 9 MED H H H 0 1 N N N Y Y N 21.429 27.546 15.774 -0.408 2.295 0.495 H MED 10 MED H2 HN2 H 0 1 N Y N Y Y N 21.223 28.252 17.233 -1.308 1.956 -0.861 H2 MED 11 MED HA HA H 0 1 N N N Y N N 19.179 27.833 15.194 -1.135 0.297 1.570 HA MED 12 MED HB2 HB1 H 0 1 N N N N N N 20.558 29.603 14.463 -0.080 -1.356 -0.001 HB2 MED 13 MED HB3 HB2 H 0 1 N N N N N N 19.103 30.394 15.302 -0.074 -0.101 -1.263 HB3 MED 14 MED HG2 HG1 H 0 1 N N N N N N 20.532 30.788 17.261 1.316 1.352 0.189 HG2 MED 15 MED HG3 HG2 H 0 1 N N N N N N 21.921 30.175 16.411 1.310 0.097 1.451 HG3 MED 16 MED HE1 HE1 H 0 1 N N N N N N 19.437 33.059 16.824 4.084 1.325 0.175 HE1 MED 17 MED HE2 HE2 H 0 1 N N N N N N 19.402 33.877 15.225 4.078 0.070 1.437 HE2 MED 18 MED HE3 HE3 H 0 1 N N N N N N 18.686 32.240 15.412 5.028 -0.168 -0.050 HE3 MED 19 MED HXT HXT H 0 1 N Y N Y N Y 16.780 28.747 17.431 -3.741 -1.765 0.230 HXT MED 20 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal MED N CA SING N N 1 MED N H SING N N 2 MED N H2 SING N N 3 MED CA C SING N N 4 MED CA CB SING N N 5 MED CA HA SING N N 6 MED C O DOUB N N 7 MED C OXT SING N N 8 MED CB CG SING N N 9 MED CB HB2 SING N N 10 MED CB HB3 SING N N 11 MED CG SD SING N N 12 MED CG HG2 SING N N 13 MED CG HG3 SING N N 14 MED SD CE SING N N 15 MED CE HE1 SING N N 16 MED CE HE2 SING N N 17 MED CE HE3 SING N N 18 MED OXT HXT SING N N 19 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor MED SMILES ACDLabs 10.04 "O=C(O)C(N)CCSC" MED SMILES_CANONICAL CACTVS 3.341 "CSCC[C@@H](N)C(O)=O" MED SMILES CACTVS 3.341 "CSCC[CH](N)C(O)=O" MED SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "CSCC[C@H](C(=O)O)N" MED SMILES "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "CSCCC(C(=O)O)N" MED InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C5H11NO2S/c1-9-3-2-4(6)5(7)8/h4H,2-3,6H2,1H3,(H,7,8)/t4-/m1/s1" MED InChIKey InChI 1.03 FFEARJCKVFRZRR-SCSAIBSYSA-N # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier MED "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 10.04 D-methionine MED "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "(2R)-2-amino-4-methylsulfanyl-butanoic acid" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site MED "Create component" 2002-01-18 RCSB MED "Modify descriptor" 2011-06-04 RCSB MED "Modify backbone" 2023-11-03 PDBE #