data_TAE # _chem_comp.id TAE _chem_comp.name "N1-[(E)-4-DIHYDROXYPHOSPHONYL-BUT-2-ENYL]-THYMINE" _chem_comp.type NON-POLYMER _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C9 H14 N2 O8 P2" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2010-11-08 _chem_comp.pdbx_modified_date 2011-12-02 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 340.164 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code TAE _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 2XX3 _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site EBI # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal TAE N1 N1 N 0 1 N N N -25.804 9.633 18.030 -3.459 -0.804 0.369 N1 TAE 1 TAE C2 C2 C 0 1 N N N -26.160 10.259 19.232 -4.331 -0.999 -0.637 C2 TAE 2 TAE O2 O2 O 0 1 N N N -27.313 10.176 19.648 -4.396 -2.089 -1.171 O2 TAE 3 TAE N3 N3 N 0 1 N N N -25.199 10.978 19.946 -5.133 -0.005 -1.060 N3 TAE 4 TAE C4 C4 C 0 1 N N N -23.887 11.069 19.469 -5.075 1.210 -0.477 C4 TAE 5 TAE O4 O4 O 0 1 N N N -23.045 11.701 20.102 -5.800 2.111 -0.859 O4 TAE 6 TAE C5 C5 C 0 1 N N N -23.535 10.446 18.282 -4.161 1.429 0.582 C5 TAE 7 TAE C6 C6 C 0 1 N N N -24.487 9.729 17.563 -3.368 0.414 0.986 C6 TAE 8 TAE PA PA P 0 1 N N N -27.551 4.298 15.714 2.117 -0.395 0.366 PA TAE 9 TAE PB PB P 0 1 N N N -26.853 4.915 12.979 4.847 0.498 -0.365 PB TAE 10 TAE "C1'" "C1'" C 0 1 N N N -26.787 8.859 17.261 -2.603 -1.907 0.811 "C1'" TAE 11 TAE O1A O1A O 0 1 N N N -28.718 5.176 15.496 2.321 -0.419 1.832 O1A TAE 12 TAE O1B O1B O 0 1 N N N -27.711 6.229 13.333 6.092 -0.294 -1.009 O1B TAE 13 TAE "C2'" "C2'" C 0 1 N N N -26.570 7.512 17.463 -1.317 -1.891 0.026 "C2'" TAE 14 TAE O2A O2A O 0 1 N N N -27.723 2.997 16.399 1.349 0.959 -0.047 O2A TAE 15 TAE O2B O2B O 0 1 N N N -25.493 5.302 12.546 4.551 1.825 -1.228 O2B TAE 16 TAE "C3'" "C3'" C 0 1 N N N -26.536 6.648 16.389 -0.167 -1.852 0.653 "C3'" TAE 17 TAE O3A O3A O 0 1 N N N -26.796 4.058 14.323 3.546 -0.449 -0.375 O3A TAE 18 TAE O3B O3B O 0 1 N N N -27.734 4.168 11.850 5.171 0.878 1.028 O3B TAE 19 TAE "C4'" "C4'" C 0 1 N N N -26.317 5.292 16.604 1.119 -1.837 -0.132 "C4'" TAE 20 TAE C5M C5M C 0 1 N N N -22.109 10.543 17.757 -4.076 2.777 1.250 C5M TAE 21 TAE HN3 HN3 H 0 1 N N N -25.450 11.430 20.802 -5.756 -0.162 -1.787 HN3 TAE 22 TAE H6 H6 H 0 1 N N N -24.208 9.244 16.639 -2.666 0.562 1.793 H6 TAE 23 TAE "H1'" "H1'" H 0 1 N N N -27.802 9.121 17.594 -2.382 -1.793 1.873 "H1'" TAE 24 TAE "H1'A" "H1'A" H 0 0 N N N -26.681 9.091 16.191 -3.117 -2.854 0.647 "H1'A" TAE 25 TAE HO1B HO1B H 0 0 N N N -27.880 6.255 14.267 6.912 0.218 -1.036 HO1B TAE 26 TAE "H2'" "H2'" H 0 1 N N N -26.426 7.133 18.464 -1.343 -1.912 -1.053 "H2'" TAE 27 TAE HO2A HO2A H 0 0 N N N -27.760 2.301 15.753 1.182 1.042 -0.995 HO2A TAE 28 TAE HO2B HO2B H 0 0 N N N -25.473 5.385 11.600 4.332 1.652 -2.154 HO2B TAE 29 TAE "H3'" "H3'" H 0 1 N N N -26.679 7.023 15.386 -0.141 -1.832 1.732 "H3'" TAE 30 TAE "H4'" "H4'" H 0 1 N N N -26.393 5.081 17.681 0.894 -1.772 -1.197 "H4'" TAE 31 TAE "H4'A" "H4'A" H 0 0 N N N -25.315 5.030 16.234 1.677 -2.751 0.066 "H4'A" TAE 32 TAE H5M H5M H 0 1 N N N -22.123 10.566 16.657 -4.789 3.459 0.786 H5M TAE 33 TAE H5MA H5MA H 0 0 N N N -21.640 11.463 18.137 -4.308 2.674 2.309 H5MA TAE 34 TAE H5MB H5MB H 0 0 N N N -21.533 9.670 18.097 -3.067 3.175 1.136 H5MB TAE 35 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal TAE "C1'" N1 SING N N 1 TAE C6 N1 SING N N 2 TAE N1 C2 SING N N 3 TAE C2 O2 DOUB N N 4 TAE C2 N3 SING N N 5 TAE C4 N3 SING N N 6 TAE N3 HN3 SING N N 7 TAE C5 C4 SING N N 8 TAE C4 O4 DOUB N N 9 TAE C6 C5 DOUB N N 10 TAE C5M C5 SING N N 11 TAE C6 H6 SING N N 12 TAE O3A PA SING N N 13 TAE O1A PA DOUB N N 14 TAE PA O2A SING N N 15 TAE PA "C4'" SING N N 16 TAE O3B PB DOUB N N 17 TAE O2B PB SING N N 18 TAE PB O1B SING N N 19 TAE PB O3A SING N N 20 TAE "C1'" "C2'" SING N N 21 TAE "C1'" "H1'" SING N N 22 TAE "C1'" "H1'A" SING N N 23 TAE O1B HO1B SING N N 24 TAE "C3'" "C2'" DOUB N E 25 TAE "C2'" "H2'" SING N N 26 TAE O2A HO2A SING N N 27 TAE O2B HO2B SING N N 28 TAE "C3'" "C4'" SING N N 29 TAE "C3'" "H3'" SING N N 30 TAE "C4'" "H4'" SING N N 31 TAE "C4'" "H4'A" SING N N 32 TAE C5M H5M SING N N 33 TAE C5M H5MA SING N N 34 TAE C5M H5MB SING N N 35 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor TAE SMILES_CANONICAL CACTVS 3.352 "CC1=CN(C/C=C/C[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)C(=O)NC1=O" TAE SMILES CACTVS 3.352 "CC1=CN(CC=CC[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)C(=O)NC1=O" TAE SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.6.1 "CC1=CN(C(=O)NC1=O)C\C=C\C[P@](=O)(O)OP(=O)(O)O" TAE SMILES "OpenEye OEToolkits" 1.6.1 "CC1=CN(C(=O)NC1=O)CC=CCP(=O)(O)OP(=O)(O)O" TAE InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C9H14N2O8P2/c1-7-6-11(9(13)10-8(7)12)4-2-3-5-20(14,15)19-21(16,17)18/h2-3,6H,4-5H2,1H3,(H,14,15)(H,10,12,13)(H2,16,17,18)/b3-2+" TAE InChIKey InChI 1.03 XCVLZXXLVNRCHX-NSCUHMNNSA-N # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier TAE "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.6.1 "[(E)-4-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)but-2-enyl]-phosphonooxy-phosphinic acid" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site TAE "Create component" 2010-11-08 EBI TAE "Modify descriptor" 2011-06-04 RCSB TAE "Modify model coordinates code" 2011-11-07 EBI #