data_TXA # _chem_comp.id TXA _chem_comp.name threonylcarbamoyladenylate _chem_comp.type NON-POLYMER _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C15 H21 N6 O11 P" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2012-03-07 _chem_comp.pdbx_modified_date 2012-03-09 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 492.335 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code TXA _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 4E1B _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal TXA OXT OXT O 0 1 N N N 0.158 22.180 15.273 -8.741 -0.129 -0.293 OXT TXA 1 TXA CX CX C 0 1 N N N 1.381 22.380 15.056 -7.425 -0.048 -0.544 CX TXA 2 TXA OX OX O 0 1 N N N 1.747 22.879 13.980 -6.892 -0.872 -1.249 OX TXA 3 TXA CAX CAX C 0 1 N N S 2.405 21.950 16.106 -6.612 1.071 0.055 CAX TXA 4 TXA CBX CBX C 0 1 N N R 3.321 20.951 15.323 -7.163 2.415 -0.425 CBX TXA 5 TXA CGX CGX C 0 1 N N N 4.233 20.163 16.264 -6.263 3.544 0.081 CGX TXA 6 TXA OGX OGX O 0 1 N N N 2.547 19.947 14.655 -7.195 2.434 -1.853 OGX TXA 7 TXA NX NX N 0 1 N N N 1.777 21.396 17.381 -5.215 0.938 -0.366 NX TXA 8 TXA CCA CCA C 0 1 N N N 1.440 22.274 18.331 -4.378 0.135 0.321 CCA TXA 9 TXA OP2 OP2 O 0 1 N N N 0.622 21.755 19.156 -3.094 0.013 -0.066 OP2 TXA 10 TXA OCA OCA O 0 1 N N N 1.783 23.339 18.174 -4.782 -0.478 1.289 OCA TXA 11 TXA P P P 0 1 N N N 0.250 22.586 20.270 -2.158 -0.965 0.806 P TXA 12 TXA OP3 OP3 O 0 1 N N N 1.287 22.882 21.433 -1.997 -0.369 2.293 OP3 TXA 13 TXA OP1 OP1 O 0 1 N N N -0.614 23.924 19.815 -2.777 -2.307 0.877 OP1 TXA 14 TXA "O5'" "O5'" O 0 1 N N N -0.821 21.562 21.138 -0.709 -1.078 0.114 "O5'" TXA 15 TXA "C5'" "C5'" C 0 1 N N N -1.967 20.937 20.557 0.315 -1.954 0.591 "C5'" TXA 16 TXA "C4'" "C4'" C 0 1 N N R -3.158 21.876 20.522 1.558 -1.814 -0.291 "C4'" TXA 17 TXA "C3'" "C3'" C 0 1 N N S -3.871 21.943 21.873 2.633 -2.841 0.128 "C3'" TXA 18 TXA "O3'" "O3'" O 0 1 N N N -3.399 23.004 22.707 2.597 -3.982 -0.730 "O3'" TXA 19 TXA "C2'" "C2'" C 0 1 N N R -5.276 22.288 21.438 3.966 -2.078 -0.041 "C2'" TXA 20 TXA "O2'" "O2'" O 0 1 N N N -5.338 23.714 21.298 4.795 -2.727 -1.007 "O2'" TXA 21 TXA "C1'" "C1'" C 0 1 N N R -5.410 21.610 20.085 3.539 -0.681 -0.542 "C1'" TXA 22 TXA "O4'" "O4'" O 0 1 N N N -4.118 21.292 19.633 2.177 -0.526 -0.085 "O4'" TXA 23 TXA N9 N9 N 0 1 Y N N -6.148 20.370 20.217 4.394 0.355 0.043 N9 TXA 24 TXA C8 C8 C 0 1 Y N N -5.644 19.093 20.362 4.127 1.084 1.163 C8 TXA 25 TXA N7 N7 N 0 1 Y N N -6.629 18.199 20.475 5.102 1.914 1.396 N7 TXA 26 TXA C5 C5 C 0 1 Y N N -7.805 18.864 20.371 6.054 1.770 0.443 C5 TXA 27 TXA C6 C6 C 0 1 Y N N -9.237 18.479 20.423 7.294 2.378 0.185 C6 TXA 28 TXA N6 N6 N 0 1 N N N -9.608 17.156 20.514 7.782 3.371 1.017 N6 TXA 29 TXA N1 N1 N 0 1 Y N N -10.131 19.477 20.348 7.988 1.978 -0.875 N1 TXA 30 TXA C2 C2 C 0 1 Y N N -9.787 20.764 20.172 7.531 1.031 -1.674 C2 TXA 31 TXA N3 N3 N 0 1 Y N N -8.485 21.188 20.116 6.375 0.434 -1.472 N3 TXA 32 TXA C4 C4 C 0 1 Y N N -7.478 20.298 20.211 5.614 0.764 -0.434 C4 TXA 33 TXA H1 H1 H 0 1 N N N -0.348 22.463 14.520 -9.221 -0.864 -0.699 H1 TXA 34 TXA H2 H2 H 0 1 N N N 3.014 22.826 16.373 -6.670 1.021 1.142 H2 TXA 35 TXA H3 H3 H 0 1 N N N 3.934 21.515 14.605 -8.172 2.553 -0.037 H3 TXA 36 TXA H4 H4 H 0 1 N N N 4.872 20.860 16.826 -5.254 3.406 -0.307 H4 TXA 37 TXA H5 H5 H 0 1 N N N 3.619 19.581 16.967 -6.656 4.502 -0.261 H5 TXA 38 TXA H6 H6 H 0 1 N N N 4.864 19.480 15.676 -6.239 3.530 1.171 H6 TXA 39 TXA H7 H7 H 0 1 N N N 3.128 19.357 14.189 -6.329 2.317 -2.268 H7 TXA 40 TXA H8 H8 H 0 1 N N N 1.624 20.415 17.501 -4.892 1.427 -1.139 H8 TXA 41 TXA H9 H9 H 0 1 N N N 1.236 23.799 21.678 -1.597 0.511 2.323 H9 TXA 42 TXA H10 H10 H 0 1 N N N -2.229 20.050 21.152 0.568 -1.693 1.618 H10 TXA 43 TXA H11 H11 H 0 1 N N N -1.724 20.631 19.529 -0.041 -2.984 0.555 H11 TXA 44 TXA H12 H12 H 0 1 N N N -2.852 22.881 20.196 1.294 -1.947 -1.340 H12 TXA 45 TXA H13 H13 H 0 1 N N N -3.842 20.967 22.380 2.491 -3.140 1.167 H13 TXA 46 TXA H14 H14 H 0 1 N N N -3.875 22.997 23.529 3.252 -4.659 -0.512 H14 TXA 47 TXA H15 H15 H 0 1 N N N -6.020 21.903 22.150 4.485 -1.999 0.914 H15 TXA 48 TXA H16 H16 H 0 1 N N N -5.253 24.121 22.152 5.044 -3.631 -0.768 H16 TXA 49 TXA H17 H17 H 0 1 N N N -5.919 22.288 19.384 3.582 -0.638 -1.630 H17 TXA 50 TXA H18 H18 H 0 1 N N N -4.592 18.849 20.381 3.237 0.988 1.767 H18 TXA 51 TXA H19 H19 H 0 1 N N N -10.606 17.088 20.513 7.267 3.655 1.788 H19 TXA 52 TXA H20 H20 H 0 1 N N N -9.239 16.652 19.733 8.640 3.783 0.829 H20 TXA 53 TXA H21 H21 H 0 1 N N N -10.573 21.498 20.070 8.127 0.736 -2.524 H21 TXA 54 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal TXA OX CX DOUB N N 1 TXA OGX CBX SING N N 2 TXA CX OXT SING N N 3 TXA CX CAX SING N N 4 TXA CBX CAX SING N N 5 TXA CBX CGX SING N N 6 TXA CAX NX SING N N 7 TXA NX CCA SING N N 8 TXA OCA CCA DOUB N N 9 TXA CCA OP2 SING N N 10 TXA OP2 P SING N N 11 TXA "O4'" "C1'" SING N N 12 TXA "O4'" "C4'" SING N N 13 TXA OP1 P DOUB N N 14 TXA "C1'" N9 SING N N 15 TXA "C1'" "C2'" SING N N 16 TXA N3 C2 DOUB Y N 17 TXA N3 C4 SING Y N 18 TXA C2 N1 SING Y N 19 TXA C4 N9 SING Y N 20 TXA C4 C5 DOUB Y N 21 TXA N9 C8 SING Y N 22 TXA P "O5'" SING N N 23 TXA P OP3 SING N N 24 TXA N1 C6 DOUB Y N 25 TXA C8 N7 DOUB Y N 26 TXA C5 C6 SING Y N 27 TXA C5 N7 SING Y N 28 TXA C6 N6 SING N N 29 TXA "C4'" "C5'" SING N N 30 TXA "C4'" "C3'" SING N N 31 TXA "C5'" "O5'" SING N N 32 TXA "O2'" "C2'" SING N N 33 TXA "C2'" "C3'" SING N N 34 TXA "C3'" "O3'" SING N N 35 TXA OXT H1 SING N N 36 TXA CAX H2 SING N N 37 TXA CBX H3 SING N N 38 TXA CGX H4 SING N N 39 TXA CGX H5 SING N N 40 TXA CGX H6 SING N N 41 TXA OGX H7 SING N N 42 TXA NX H8 SING N N 43 TXA OP3 H9 SING N N 44 TXA "C5'" H10 SING N N 45 TXA "C5'" H11 SING N N 46 TXA "C4'" H12 SING N N 47 TXA "C3'" H13 SING N N 48 TXA "O3'" H14 SING N N 49 TXA "C2'" H15 SING N N 50 TXA "O2'" H16 SING N N 51 TXA "C1'" H17 SING N N 52 TXA C8 H18 SING N N 53 TXA N6 H19 SING N N 54 TXA N6 H20 SING N N 55 TXA C2 H21 SING N N 56 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor TXA SMILES ACDLabs 12.01 "O=C(O)C(NC(=O)OP(=O)(O)OCC3OC(n2cnc1c(ncnc12)N)C(O)C3O)C(O)C" TXA InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C15H21N6O11P/c1-5(22)7(14(25)26)20-15(27)32-33(28,29)30-2-6-9(23)10(24)13(31-6)21-4-19-8-11(16)17-3-18-12(8)21/h3-7,9-10,13,22-24H,2H2,1H3,(H,20,27)(H,25,26)(H,28,29)(H2,16,17,18)/t5-,6-,7+,9-,10-,13-/m1/s1" TXA InChIKey InChI 1.03 GHLUPQUHEIJRCU-DWVDDHQFSA-N TXA SMILES_CANONICAL CACTVS 3.370 "C[C@@H](O)[C@H](NC(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1O)n2cnc3c(N)ncnc23)C(O)=O" TXA SMILES CACTVS 3.370 "C[CH](O)[CH](NC(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]1O[CH]([CH](O)[CH]1O)n2cnc3c(N)ncnc23)C(O)=O" TXA SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.7.6 "C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)OP(=O)(O)OC[C@@H]1[C@H]([C@H]([C@@H](O1)n2cnc3c2ncnc3N)O)O)O" TXA SMILES "OpenEye OEToolkits" 1.7.6 "CC(C(C(=O)O)NC(=O)OP(=O)(O)OCC1C(C(C(O1)n2cnc3c2ncnc3N)O)O)O" # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier TXA "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "(3R,7S)-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]-3-hydroxy-7-[(1R)-1-hydroxyethyl]-5-oxo-2,4-dioxa-6-aza-3-phosphaoctan-8-oic acid 3-oxide (non-preferred name)" TXA "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.7.6 "(2S,3R)-2-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxycarbonylamino]-3-oxidanyl-butanoic acid" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site TXA "Create component" 2012-03-07 RCSB #