data_VUM # _chem_comp.id VUM _chem_comp.name "5-[(4-{trans-4-hydroxy-4-[3-(trifluoromethyl)phenyl]cyclohexyl}piperazin-1-yl)methyl]pyridin-2(1H)-one" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C23 H28 F3 N3 O2" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2020-09-16 _chem_comp.pdbx_modified_date 2020-12-04 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 435.483 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code VUM _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 7K4D _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal VUM C01 C1 C 0 1 N N N 100.712 132.962 98.782 -7.799 1.170 -0.731 C01 VUM 1 VUM N01 N1 N 0 1 N N N 100.551 133.755 99.910 -6.879 0.480 -1.431 N01 VUM 2 VUM O01 O1 O 0 1 N N N 100.812 133.554 97.527 -8.739 1.693 -1.308 O01 VUM 3 VUM C02 C2 C 0 1 N N N 100.785 131.497 98.892 -7.682 1.282 0.665 C02 VUM 4 VUM N02 N2 N 0 1 N N N 100.402 131.845 103.651 -3.434 0.289 1.391 N02 VUM 5 VUM O02 O2 O 0 1 N N N 100.794 126.021 108.472 2.890 -2.069 -1.257 O02 VUM 6 VUM C03 C3 C 0 1 N N N 100.693 130.900 100.139 -6.629 0.688 1.297 C03 VUM 7 VUM N03 N3 N 0 1 N N N 100.572 130.570 106.135 -1.176 -1.036 0.271 N03 VUM 8 VUM C04 C4 C 0 1 N N N 100.451 133.130 101.196 -5.831 -0.113 -0.804 C04 VUM 9 VUM C05 C5 C 0 1 N N N 100.526 131.707 101.312 -5.688 -0.023 0.539 C05 VUM 10 VUM C06 C6 C 0 1 N N N 100.433 130.996 102.659 -4.518 -0.687 1.219 C06 VUM 11 VUM C07 C7 C 0 1 N N N 99.255 131.774 104.308 -2.374 -0.249 2.256 C07 VUM 12 VUM C08 C8 C 0 1 N N N 99.277 130.775 105.475 -1.721 -1.452 1.571 C08 VUM 13 VUM C09 C9 C 0 1 N N N 101.529 131.623 105.824 -2.236 -0.498 -0.594 C09 VUM 14 VUM C10 C10 C 0 1 N N N 101.551 131.976 104.327 -2.888 0.705 0.091 C10 VUM 15 VUM C11 C11 C 0 1 N N N 101.233 129.310 105.787 -0.474 -2.147 -0.385 C11 VUM 16 VUM C12 C12 C 0 1 N N N 102.335 129.032 106.814 0.079 -1.676 -1.732 C12 VUM 17 VUM C13 C13 C 0 1 N N N 102.177 127.801 107.708 1.054 -0.519 -1.507 C13 VUM 18 VUM C14 C14 C 0 1 N N N 100.754 127.357 108.050 2.207 -0.989 -0.619 C14 VUM 19 VUM C15 C15 C 0 1 Y N N 100.195 128.171 109.200 3.167 0.152 -0.397 C15 VUM 20 VUM C16 C16 C 0 1 Y N N 99.664 129.366 109.053 2.704 1.454 -0.388 C16 VUM 21 VUM C17 C17 C 0 1 Y N N 99.122 130.110 110.260 3.585 2.500 -0.185 C17 VUM 22 VUM C18 C18 C 0 1 Y N N 99.173 129.539 111.439 4.929 2.243 0.009 C18 VUM 23 VUM C19 C19 C 0 1 Y N N 99.775 128.147 111.565 5.392 0.941 0.002 C19 VUM 24 VUM C20 C20 C 0 1 N N N 99.867 127.438 112.890 6.858 0.661 0.213 C20 VUM 25 VUM C21 C21 C 0 1 Y N N 100.250 127.509 110.545 4.511 -0.105 -0.197 C21 VUM 26 VUM C22 C22 C 0 1 N N N 99.765 127.478 106.901 1.655 -1.459 0.728 C22 VUM 27 VUM C23 C23 C 0 1 N N N 100.282 128.118 105.611 0.680 -2.617 0.503 C23 VUM 28 VUM F01 F1 F 0 1 N N N 99.201 128.135 113.854 7.373 -0.002 -0.906 F01 VUM 29 VUM F02 F2 F 0 1 N N N 101.189 127.343 113.162 7.542 1.869 0.395 F02 VUM 30 VUM F03 F3 F 0 1 N N N 99.354 126.187 112.745 7.021 -0.141 1.347 F03 VUM 31 VUM H1 H1 H 0 1 N N N 100.505 134.750 99.826 -6.965 0.406 -2.394 H1 VUM 32 VUM H2 H2 H 0 1 N N N 100.909 130.891 98.007 -8.417 1.834 1.232 H2 VUM 33 VUM H4 H4 H 0 1 N N N 101.409 125.934 109.190 3.635 -2.418 -0.749 H4 VUM 34 VUM H5 H5 H 0 1 N N N 100.747 129.825 100.227 -6.522 0.764 2.369 H5 VUM 35 VUM H7 H7 H 0 1 N N N 100.319 133.736 102.080 -5.103 -0.662 -1.383 H7 VUM 36 VUM H8 H8 H 0 1 N N N 99.515 130.390 102.680 -4.166 -1.518 0.607 H8 VUM 37 VUM H9 H9 H 0 1 N N N 101.308 130.341 102.778 -4.829 -1.060 2.194 H9 VUM 38 VUM H10 H10 H 0 1 N N N 99.021 132.772 104.708 -1.623 0.521 2.432 H10 VUM 39 VUM H11 H11 H 0 1 N N N 98.468 131.468 103.603 -2.805 -0.561 3.207 H11 VUM 40 VUM H12 H12 H 0 1 N N N 98.567 131.133 106.235 -2.467 -2.232 1.419 H12 VUM 41 VUM H13 H13 H 0 1 N N N 98.941 129.802 105.089 -0.916 -1.834 2.198 H13 VUM 42 VUM H14 H14 H 0 1 N N N 102.533 131.286 106.122 -1.805 -0.186 -1.545 H14 VUM 43 VUM H15 H15 H 0 1 N N N 101.260 132.524 106.395 -2.987 -1.268 -0.770 H15 VUM 44 VUM H16 H16 H 0 1 N N N 102.295 131.325 103.844 -3.694 1.087 -0.536 H16 VUM 45 VUM H17 H17 H 0 1 N N N 101.869 133.025 104.239 -2.143 1.486 0.243 H17 VUM 46 VUM H18 H18 H 0 1 N N N 101.734 129.458 104.819 -1.168 -2.971 -0.545 H18 VUM 47 VUM H19 H19 H 0 1 N N N 103.279 128.918 106.261 0.600 -2.501 -2.219 H19 VUM 48 VUM H20 H20 H 0 1 N N N 102.400 129.911 107.473 -0.743 -1.342 -2.365 H20 VUM 49 VUM H21 H21 H 0 1 N N N 102.672 126.960 107.201 1.447 -0.184 -2.467 H21 VUM 50 VUM H22 H22 H 0 1 N N N 102.693 128.013 108.656 0.533 0.306 -1.020 H22 VUM 51 VUM H23 H23 H 0 1 N N N 99.614 129.818 108.073 1.653 1.654 -0.540 H23 VUM 52 VUM H24 H24 H 0 1 N N N 98.700 131.098 110.149 3.223 3.517 -0.179 H24 VUM 53 VUM H25 H25 H 0 1 N N N 98.792 130.050 112.311 5.617 3.060 0.168 H25 VUM 54 VUM H26 H26 H 0 1 N N N 100.676 126.523 110.659 4.873 -1.123 -0.200 H26 VUM 55 VUM H27 H27 H 0 1 N N N 98.916 128.081 107.255 2.477 -1.794 1.361 H27 VUM 56 VUM H28 H28 H 0 1 N N N 99.417 126.464 106.653 1.134 -0.635 1.215 H28 VUM 57 VUM H29 H29 H 0 1 N N N 99.412 128.464 105.034 0.286 -2.952 1.463 H29 VUM 58 VUM H30 H30 H 0 1 N N N 100.815 127.343 105.041 1.201 -3.441 0.017 H30 VUM 59 # # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal VUM O01 C01 DOUB N N 1 VUM C01 C02 SING N N 2 VUM C01 N01 SING N N 3 VUM C02 C03 DOUB N N 4 VUM N01 C04 SING N N 5 VUM C03 C05 SING N N 6 VUM C04 C05 DOUB N N 7 VUM C05 C06 SING N N 8 VUM C06 N02 SING N N 9 VUM N02 C07 SING N N 10 VUM N02 C10 SING N N 11 VUM C07 C08 SING N N 12 VUM C10 C09 SING N N 13 VUM C08 N03 SING N N 14 VUM C23 C11 SING N N 15 VUM C23 C22 SING N N 16 VUM C11 N03 SING N N 17 VUM C11 C12 SING N N 18 VUM C09 N03 SING N N 19 VUM C12 C13 SING N N 20 VUM C22 C14 SING N N 21 VUM C13 C14 SING N N 22 VUM C14 O02 SING N N 23 VUM C14 C15 SING N N 24 VUM C16 C15 DOUB Y N 25 VUM C16 C17 SING Y N 26 VUM C15 C21 SING Y N 27 VUM C17 C18 DOUB Y N 28 VUM C21 C19 DOUB Y N 29 VUM C18 C19 SING Y N 30 VUM C19 C20 SING N N 31 VUM F03 C20 SING N N 32 VUM C20 F02 SING N N 33 VUM C20 F01 SING N N 34 VUM N01 H1 SING N N 35 VUM C02 H2 SING N N 36 VUM O02 H4 SING N N 37 VUM C03 H5 SING N N 38 VUM C04 H7 SING N N 39 VUM C06 H8 SING N N 40 VUM C06 H9 SING N N 41 VUM C07 H10 SING N N 42 VUM C07 H11 SING N N 43 VUM C08 H12 SING N N 44 VUM C08 H13 SING N N 45 VUM C09 H14 SING N N 46 VUM C09 H15 SING N N 47 VUM C10 H16 SING N N 48 VUM C10 H17 SING N N 49 VUM C11 H18 SING N N 50 VUM C12 H19 SING N N 51 VUM C12 H20 SING N N 52 VUM C13 H21 SING N N 53 VUM C13 H22 SING N N 54 VUM C16 H23 SING N N 55 VUM C17 H24 SING N N 56 VUM C18 H25 SING N N 57 VUM C21 H26 SING N N 58 VUM C22 H27 SING N N 59 VUM C22 H28 SING N N 60 VUM C23 H29 SING N N 61 VUM C23 H30 SING N N 62 # # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor VUM SMILES ACDLabs 12.01 "C1(C=CC(=CN1)CN2CCN(CC2)C4CCC(O)(c3cc(ccc3)C(F)(F)F)CC4)=O" VUM InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C23H28F3N3O2/c24-23(25,26)19-3-1-2-18(14-19)22(31)8-6-20(7-9-22)29-12-10-28(11-13-29)16-17-4-5-21(30)27-15-17/h1-5,14-15,20,31H,6-13,16H2,(H,27,30)/t20-,22-" VUM InChIKey InChI 1.03 HGNRFWCPFKHVCH-AQYVVDRMSA-N VUM SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "O[C@]1(CC[C@@H](CC1)N2CCN(CC2)CC3=CNC(=O)C=C3)c4cccc(c4)C(F)(F)F" VUM SMILES CACTVS 3.385 "O[C]1(CC[CH](CC1)N2CCN(CC2)CC3=CNC(=O)C=C3)c4cccc(c4)C(F)(F)F" VUM SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "c1cc(cc(c1)C(F)(F)F)C2(CCC(CC2)N3CCN(CC3)CC4=CNC(=O)C=C4)O" VUM SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "c1cc(cc(c1)C(F)(F)F)C2(CCC(CC2)N3CCN(CC3)CC4=CNC(=O)C=C4)O" # # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier VUM "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "5-[(4-{trans-4-hydroxy-4-[3-(trifluoromethyl)phenyl]cyclohexyl}piperazin-1-yl)methyl]pyridin-2(1H)-one" VUM "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "5-[[4-[4-oxidanyl-4-[3-(trifluoromethyl)phenyl]cyclohexyl]piperazin-1-yl]methyl]-1~{H}-pyridin-2-one" # # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site VUM "Create component" 2020-09-16 RCSB VUM "Initial release" 2020-12-09 RCSB ##