data_wwPDB_remediated_restraints_file_for_PDB_entry_1qp6 # This wwPDB archive file contains, for PDB entry 1qp6: # # - Sequence information from the PDB mmCIF file # - NMR restraints from the PDB MR file # # In this file, the NMR restraints share the same atom names as in the coordinate # file, and in this way can differ from the data deposited at the wwPDB. To achieve # this aim, the NMR restraints were parsed from their original format files, and # the coordinates and NMR restraints information were subsequently harmonized. # # Due to the complexity of this harmonization process, minor modifications could # have occurred to the NMR restraints information, or data could have been lost # because of parsing or conversion errors. The PDB file remains the # authoritative reference for the atomic coordinates and the originally deposited # restraints files remain the primary reference for these data. # # This file is generated as part of the wwPDB at the BioMagResBank (BMRB) in # collaboration with the PDBe (formerly MSD) group at the European # Bioinformatics Institute (EBI) and the CMBI/IMM group at the Radboud # University of Nijmegen. # # Several software packages were used to produce this file: # # - Wattos (BMRB and CMBI/IMM). # - FormatConverter and NMRStarExport (PDBe). # - CCPN framework (http://www.ccpn.ac.uk/). # # More information about this process can be found in the references below. # Please cite the original reference for this PDB entry. # # JF Doreleijers, A Nederveen, W Vranken, J Lin, AM Bonvin, R Kaptein, JL # Markley, and EL Ulrich (2005). BioMagResBank databases DOCR and FRED # containing converted and filtered sets of experimental NMR restraints and # coordinates from over 500 protein PDB structures. J. Biomol. NMR 32, 1-12. # # WF Vranken, W Boucher, TJ Stevens, RH Fogh, A Pajon, M Llinas, EL Ulrich, JL # Markley, J Ionides, ED Laue (2005). The CCPN data model for NMR spectroscopy: # development of a software pipeline. Proteins 59, 687-696. # # JF Doreleijers, WF Vranken, C Schulte, J Lin, JR Wedell, CJ Penkett, GW Vuister, # G Vriend, JL Markley, and EL Ulrich (2009). The NMR Restraints Grid at BMRB for # 5,266 Protein and Nucleic Acid PDB Entries. J Biomol. NMR 45, 389–396. save_entry_information _Entry.Sf_category entry_information _Entry.Sf_framecode entry_information _Entry.ID rr_1qp6 _Entry.Title "wwPDB remediated NMR restraints for PDB entry 1qp6" _Entry.NMR_STAR_version 3.1 _Entry.Experimental_method NMR _Entry.Experimental_method_subtype solution _Entry.Details "Contains the remediated restraint lists and coordinates for PDB entry 1qp6" save_ save_assembly _Assembly.Sf_category assembly _Assembly.Sf_framecode assembly _Assembly.Entry_ID rr_1qp6 _Assembly.ID 1 _Assembly.Name 1qp6 _Assembly.Number_of_components 2 _Assembly.Organic_ligands 0 _Assembly.Metal_ions 0 _Assembly.Non_standard_bonds no _Assembly.Paramagnetic no _Assembly.Thiol_state "not present" _Assembly.Molecular_mass 8495.7956 loop_ _Entity_assembly.ID _Entity_assembly.Entity_assembly_name _Entity_assembly.Entity_ID _Entity_assembly.Entity_label _Entity_assembly.Asym_ID _Entity_assembly.PDB_chain_ID _Entity_assembly.Experimental_data_reported _Entity_assembly.Physical_state _Entity_assembly.Conformational_isomer _Entity_assembly.Chemical_exchange_state _Entity_assembly.Magnetic_equivalence_group_code _Entity_assembly.Role _Entity_assembly.Details _Entity_assembly.Entry_ID _Entity_assembly.Assembly_ID 1 "PROTEIN ALPHA2D" 1 $PROTEIN__ALPHA2D_ A . no . . . . . . rr_1qp6 1 2 "PROTEIN ALPHA2D" 1 $PROTEIN__ALPHA2D_ B . no . . . . . . rr_1qp6 1 stop_ save_ save_PROTEIN__ALPHA2D_ _Entity.Sf_category entity _Entity.Sf_framecode PROTEIN__ALPHA2D_ _Entity.Entry_ID rr_1qp6 _Entity.ID 1 _Entity.Name PROTEIN__ALPHA2D_ _Entity.Type polymer _Entity.Polymer_type polypeptide(L) _Entity.Polymer_strand_ID "A,B" _Entity.Polymer_seq_one_letter_code ; GEVEELEKKFKELWKGPRRG EIEELHKKFHELIKG ; _Entity.Ambiguous_conformational_states no _Entity.Ambiguous_chem_comp_sites no _Entity.Nstd_monomer no _Entity.Nstd_chirality no _Entity.Nstd_linkage no _Entity.Number_of_monomers 35 _Entity.Paramagnetic no _Entity.Thiol_state "not present" _Entity.Parent_entity_ID 1 _Entity.Formula_weight 4247.8978 loop_ _Entity_comp_index.ID _Entity_comp_index.Auth_seq_ID _Entity_comp_index.Comp_ID _Entity_comp_index.Comp_label _Entity_comp_index.Entry_ID _Entity_comp_index.Entity_ID 1 . 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"MR format" 1 comment "Not applicable" "Not applicable" 0 rr_1qp6 1 1 1qp6.mr . . XPLOR/CNS 2 distance NOE simple 882 rr_1qp6 1 1 1qp6.mr . . "MR format" 3 "nomenclature mapping" "Not applicable" "Not applicable" 0 rr_1qp6 1 stop_ save_ save_CNS/XPLOR_distance_constraints_2 _Gen_dist_constraint_list.Sf_category general_distance_constraints _Gen_dist_constraint_list.Sf_framecode CNS/XPLOR_distance_constraints_2 _Gen_dist_constraint_list.Entry_ID rr_1qp6 _Gen_dist_constraint_list.ID 1 _Gen_dist_constraint_list.Constraint_type NOE _Gen_dist_constraint_list.Details "Generated by Wattos" _Gen_dist_constraint_list.Constraint_file_ID 1 _Gen_dist_constraint_list.Block_ID 2 loop_ _Gen_dist_constraint_software.Software_ID _Gen_dist_constraint_software.Software_label _Gen_dist_constraint_software.Method_ID _Gen_dist_constraint_software.Method_label _Gen_dist_constraint_software.Entry_ID _Gen_dist_constraint_software.Gen_dist_constraint_list_ID . . . . rr_1qp6 1 stop_ loop_ _Gen_dist_constraint.ID _Gen_dist_constraint.Member_ID _Gen_dist_constraint.Member_logic_code _Gen_dist_constraint.Assembly_atom_ID_1 _Gen_dist_constraint.Entity_assembly_ID_1 _Gen_dist_constraint.Entity_ID_1 _Gen_dist_constraint.Comp_index_ID_1 _Gen_dist_constraint.Seq_ID_1 _Gen_dist_constraint.Comp_ID_1 _Gen_dist_constraint.Atom_ID_1 _Gen_dist_constraint.Atom_type_1 _Gen_dist_constraint.Atom_isotope_number_1 _Gen_dist_constraint.Resonance_ID_1 _Gen_dist_constraint.Assembly_atom_ID_2 _Gen_dist_constraint.Entity_assembly_ID_2 _Gen_dist_constraint.Entity_ID_2 _Gen_dist_constraint.Comp_index_ID_2 _Gen_dist_constraint.Seq_ID_2 _Gen_dist_constraint.Comp_ID_2 _Gen_dist_constraint.Atom_ID_2 _Gen_dist_constraint.Atom_type_2 _Gen_dist_constraint.Atom_isotope_number_2 _Gen_dist_constraint.Resonance_ID_2 _Gen_dist_constraint.Intensity_val _Gen_dist_constraint.Intensity_lower_val_err _Gen_dist_constraint.Intensity_upper_val_err _Gen_dist_constraint.Distance_val _Gen_dist_constraint.Distance_lower_bound_val _Gen_dist_constraint.Distance_upper_bound_val _Gen_dist_constraint.Contribution_fractional_val _Gen_dist_constraint.Spectral_peak_ID _Gen_dist_constraint.Spectral_peak_list_ID _Gen_dist_constraint.PDB_record_ID_1 _Gen_dist_constraint.PDB_model_num_1 _Gen_dist_constraint.PDB_strand_ID_1 _Gen_dist_constraint.PDB_ins_code_1 _Gen_dist_constraint.PDB_residue_no_1 _Gen_dist_constraint.PDB_residue_name_1 _Gen_dist_constraint.PDB_atom_name_1 _Gen_dist_constraint.PDB_record_ID_2 _Gen_dist_constraint.PDB_model_num_2 _Gen_dist_constraint.PDB_strand_ID_2 _Gen_dist_constraint.PDB_ins_code_2 _Gen_dist_constraint.PDB_residue_no_2 _Gen_dist_constraint.PDB_residue_name_2 _Gen_dist_constraint.PDB_atom_name_2 _Gen_dist_constraint.Auth_entity_assembly_ID_1 _Gen_dist_constraint.Auth_asym_ID_1 _Gen_dist_constraint.Auth_chain_ID_1 _Gen_dist_constraint.Auth_seq_ID_1 _Gen_dist_constraint.Auth_comp_ID_1 _Gen_dist_constraint.Auth_atom_ID_1 _Gen_dist_constraint.Auth_alt_ID_1 _Gen_dist_constraint.Auth_atom_name_1 _Gen_dist_constraint.Auth_entity_assembly_ID_2 _Gen_dist_constraint.Auth_asym_ID_2 _Gen_dist_constraint.Auth_chain_ID_2 _Gen_dist_constraint.Auth_seq_ID_2 _Gen_dist_constraint.Auth_comp_ID_2 _Gen_dist_constraint.Auth_atom_ID_2 _Gen_dist_constraint.Auth_alt_ID_2 _Gen_dist_constraint.Auth_atom_name_2 _Gen_dist_constraint.Entry_ID _Gen_dist_constraint.Gen_dist_constraint_list_ID 1 1 . . 1 1 2 2 GLU H H . . . 1 1 3 3 VAL H H . . . . . 2.7 0.0 3.0 . . . . . A . 2 GLU H . . A . 3 VAL H . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 2 1 . . 1 1 3 3 VAL H H . . . 1 1 2 2 GLU HA H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . A . 2 GLU HA . . A . 3 VAL H . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 3 1 . . 1 1 2 2 GLU H H . . . 1 1 4 4 GLU H H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . A . 2 GLU H . . A . 4 GLU H . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 4 1 . . 1 1 3 3 VAL H H . . . 1 1 3 3 VAL HA H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . A . 3 VAL H . . A . 3 VAL HA . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 5 1 . . 1 1 3 3 VAL H H . . . 1 1 3 3 VAL HB H . . . . . 2.7 0.0 3.0 . . . . . A . 3 VAL H . . A . 3 VAL HB . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 6 1 OR . 1 1 3 3 VAL H H . . . 1 1 3 3 VAL MG1 H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . A . 3 VAL H . . A . 3 VAL MG1 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 6 2 OR . 1 1 3 3 VAL H H . . . 1 1 3 3 VAL MG2 H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . A . 3 VAL H . . 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A . 4 GLU H . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 11 1 OR . 1 1 3 3 VAL H H . . . 1 1 4 4 GLU HG2 H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . A . 3 VAL H . . A . 4 GLU HG2 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 11 2 OR . 1 1 3 3 VAL H H . . . 1 1 4 4 GLU HG3 H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . A . 3 VAL H . . A . 4 GLU HG3 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 12 1 . . 1 1 4 4 GLU H H . . . 1 1 3 3 VAL HA H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . A . 3 VAL HA . . A . 4 GLU H . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 13 1 OR . 1 1 4 4 GLU H H . . . 1 1 3 3 VAL MG1 H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . A . 3 VAL MG1 . . A . 4 GLU H . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 13 2 OR . 1 1 4 4 GLU H H . . . 1 1 3 3 VAL MG2 H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . A . 3 VAL MG2 . . A . 4 GLU H . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 14 1 . . 1 1 3 3 VAL HA H . . . 1 1 6 6 LEU H H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . A . 3 VAL HA . . 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A . 11 LYS HA . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 177 1 . . 1 1 11 11 LYS H H . . . 1 1 11 11 LYS HB3 H . . . . . 2.7 0.0 3.0 . . . . . A . 11 LYS H . . A . 11 LYS HB3 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 178 1 . . 1 1 11 11 LYS H H . . . 1 1 11 11 LYS HB2 H . . . . . 2.7 0.0 3.0 . . . . . A . 11 LYS H . . A . 11 LYS HB2 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 179 1 OR . 1 1 11 11 LYS H H . . . 1 1 11 11 LYS HG2 H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . A . 11 LYS H . . A . 11 LYS HG2 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 179 2 OR . 1 1 11 11 LYS H H . . . 1 1 11 11 LYS HG3 H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . A . 11 LYS H . . A . 11 LYS HG3 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 180 1 OR . 1 1 11 11 LYS H H . . . 1 1 11 11 LYS HD2 H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . A . 11 LYS H . . A . 11 LYS HD2 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 180 2 OR . 1 1 11 11 LYS H H . . . 1 1 11 11 LYS HD3 H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . A . 11 LYS H . . 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A . 30 HIS H . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 593 1 . . 1 1 31 31 GLU H H . . . 1 1 29 29 PHE HA H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . A . 29 PHE HA . . A . 31 GLU H . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 594 1 . . 1 1 29 29 PHE HA H . . . 1 1 32 32 LEU H H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . A . 29 PHE HA . . A . 32 LEU H . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 595 1 . . 1 1 29 29 PHE HA H . . . 1 1 32 32 LEU MD1 H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . A . 29 PHE HA . . A . 32 LEU MD1 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 596 1 . . 1 1 29 29 PHE HA H . . . 1 1 32 32 LEU MD2 H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . A . 29 PHE HA . . A . 32 LEU MD2 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 597 1 . . 1 1 29 29 PHE QE H . . . 1 1 32 32 LEU MD1 H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . A . 29 PHE QE . . A . 32 LEU MD1 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 598 1 . . 1 1 29 29 PHE QE H . . . 1 1 32 32 LEU MD2 H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . A . 29 PHE QE . . 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HD1# . . rr_1qp6 1 764 1 . . 1 1 32 32 LEU MD1 H . . . 2 1 14 14 TRP HH2 H . . . . . 4.0 0.0 6.3 . . . . . B . 14 TRP HH2 . . A . 32 LEU MD1 . A2DB . 14 . HH2 . . . A2DA . 32 . HD1# . . rr_1qp6 1 765 1 . . 1 1 14 14 TRP HE1 H . . . 2 1 33 33 ILE HA H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . A . 14 TRP HE1 . . B . 33 ILE HA . A2DA . 14 . HE1 . . . A2DB . 33 . HA . . rr_1qp6 1 766 1 . . 1 1 33 33 ILE HA H . . . 2 1 14 14 TRP HE1 H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . B . 14 TRP HE1 . . A . 33 ILE HA . A2DB . 14 . HE1 . . . A2DA . 33 . HA . . rr_1qp6 1 767 1 . . 1 1 14 14 TRP HE1 H . . . 2 1 33 33 ILE HG13 H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . A . 14 TRP HE1 . . B . 33 ILE HG13 . A2DA . 14 . HE1 . . . A2DB . 33 . HG11 . . rr_1qp6 1 768 1 . . 1 1 33 33 ILE HG13 H . . . 2 1 14 14 TRP HE1 H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . B . 14 TRP HE1 . . A . 33 ILE HG13 . A2DB . 14 . HE1 . . . A2DA . 33 . HG11 . . rr_1qp6 1 769 1 . . 1 1 14 14 TRP HE1 H . . . 2 1 33 33 ILE MG H . . . . . 4.0 0.0 6.3 . . . . . 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HA . . rr_1qp6 1 775 1 . . 1 1 14 14 TRP HZ2 H . . . 2 1 33 33 ILE HB H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . A . 14 TRP HZ2 . . B . 33 ILE HB . A2DA . 14 . HZ2 . . . A2DB . 33 . HB . . rr_1qp6 1 776 1 . . 1 1 33 33 ILE HB H . . . 2 1 14 14 TRP HZ2 H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . B . 14 TRP HZ2 . . A . 33 ILE HB . A2DB . 14 . HZ2 . . . A2DA . 33 . HB . . rr_1qp6 1 777 1 . . 1 1 14 14 TRP HH2 H . . . 2 1 33 33 ILE HA H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . A . 14 TRP HH2 . . B . 33 ILE HA . A2DA . 14 . HH2 . . . A2DB . 33 . HA . . rr_1qp6 1 778 1 . . 1 1 33 33 ILE HA H . . . 2 1 14 14 TRP HH2 H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . B . 14 TRP HH2 . . A . 33 ILE HA . A2DB . 14 . HH2 . . . A2DA . 33 . HA . . rr_1qp6 1 779 1 . . 1 1 14 14 TRP HH2 H . . . 2 1 33 33 ILE HG13 H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . A . 14 TRP HH2 . . B . 33 ILE HG13 . A2DA . 14 . HH2 . . . A2DB . 33 . HG11 . . rr_1qp6 1 780 1 . . 1 1 33 33 ILE HG13 H . . . 2 1 14 14 TRP HH2 H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . B . 14 TRP HH2 . . 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HG12 . . rr_1qp6 1 786 1 . . 1 1 33 33 ILE HG12 H . . . 2 1 14 14 TRP HZ2 H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . B . 14 TRP HZ2 . . A . 33 ILE HG12 . A2DB . 14 . HZ2 . . . A2DA . 33 . HG12 . . rr_1qp6 1 787 1 . . 1 1 14 14 TRP HE3 H . . . 2 1 33 33 ILE MD H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . A . 14 TRP HE3 . . B . 33 ILE MD . A2DA . 14 . HE3 . . . A2DB . 33 . HD1# . . rr_1qp6 1 788 1 . . 1 1 33 33 ILE MD H . . . 2 1 14 14 TRP HE3 H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . B . 14 TRP HE3 . . A . 33 ILE MD . A2DB . 14 . HE3 . . . A2DA . 33 . HD1# . . rr_1qp6 1 789 1 OR . 1 1 18 18 ARG HD2 H . . . 2 1 3 3 VAL MG2 H . . . . . 4.0 0.0 7.4 . . . . . A . 18 ARG HD2 . . B . 3 VAL MG2 . A2DA . 18 . HD2 . . . A2DB . 3 . HG# . . rr_1qp6 1 789 2 OR . 1 1 18 18 ARG HD2 H . . . 2 1 3 3 VAL MG1 H . . . . . 4.0 0.0 7.4 . . . . . A . 18 ARG HD2 . . B . 3 VAL MG1 . A2DA . 18 . HD2 . . . A2DB . 3 . HG# . . rr_1qp6 1 790 1 OR . 1 1 3 3 VAL MG2 H . . . 2 1 18 18 ARG HD2 H . . . . . 4.0 0.0 7.4 . . . . . B . 18 ARG HD2 . . A . 3 VAL MG2 . A2DB . 18 . HD2 . . . A2DA . 3 . HG# . . rr_1qp6 1 790 2 OR . 2 1 18 18 ARG HD2 H . . . 1 1 3 3 VAL MG1 H . . . . . 4.0 0.0 7.4 . . . . . B . 18 ARG HD2 . . A . 3 VAL MG1 . A2DB . 18 . HD2 . . . A2DA . 3 . HG# . . rr_1qp6 1 791 1 OR . 1 1 21 21 GLU HB2 H . . . 2 1 3 3 VAL MG2 H . . . . . 4.0 0.0 7.4 . . . . . A . 21 GLU HB2 . . B . 3 VAL MG2 . A2DA . 21 . HB2 . . . A2DB . 3 . HG# . . rr_1qp6 1 791 2 OR . 1 1 21 21 GLU HB2 H . . . 2 1 3 3 VAL MG1 H . . . . . 4.0 0.0 7.4 . . . . . A . 21 GLU HB2 . . B . 3 VAL MG1 . A2DA . 21 . HB2 . . . A2DB . 3 . HG# . . rr_1qp6 1 792 1 OR . 1 1 3 3 VAL MG2 H . . . 2 1 21 21 GLU HB2 H . . . . . 4.0 0.0 7.4 . . . . . B . 21 GLU HB2 . . A . 3 VAL MG2 . A2DB . 21 . HB2 . . . A2DA . 3 . HG# . . rr_1qp6 1 792 2 OR . 2 1 21 21 GLU HB2 H . . . 1 1 3 3 VAL MG1 H . . . . . 4.0 0.0 7.4 . . . . . B . 21 GLU HB2 . . A . 3 VAL MG1 . A2DB . 21 . HB2 . . . A2DA . 3 . 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B . 3 VAL MG1 . A2DA . 25 . HN . . . A2DB . 3 . HG# . . rr_1qp6 1 800 1 OR . 1 1 3 3 VAL MG2 H . . . 2 1 25 25 LEU H H . . . . . 4.0 0.0 8.4 . . . . . B . 25 LEU H . . A . 3 VAL MG2 . A2DB . 25 . HN . . . A2DA . 3 . HG# . . rr_1qp6 1 800 2 OR . 2 1 25 25 LEU H H . . . 1 1 3 3 VAL MG1 H . . . . . 4.0 0.0 8.4 . . . . . B . 25 LEU H . . A . 3 VAL MG1 . A2DB . 25 . HN . . . A2DA . 3 . HG# . . rr_1qp6 1 801 1 OR . 1 1 25 25 LEU MD2 H . . . 2 1 3 3 VAL MG2 H . . . . . 3.3 0.0 6.5 . . . . . A . 25 LEU MD2 . . B . 3 VAL MG2 . A2DA . 25 . HD2# . . . A2DB . 3 . HG# . . rr_1qp6 1 801 2 OR . 1 1 25 25 LEU MD2 H . . . 2 1 3 3 VAL MG1 H . . . . . 3.3 0.0 6.5 . . . . . A . 25 LEU MD2 . . B . 3 VAL MG1 . A2DA . 25 . HD2# . . . A2DB . 3 . HG# . . rr_1qp6 1 802 1 OR . 1 1 3 3 VAL MG2 H . . . 2 1 25 25 LEU MD2 H . . . . . 3.3 0.0 6.5 . . . . . B . 25 LEU MD2 . . A . 3 VAL MG2 . A2DB . 25 . HD2# . . . A2DA . 3 . 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HA . . rr_1qp6 1 847 1 . . 1 1 32 32 LEU MD2 H . . . 2 1 11 11 LYS HA H . . . . . 4.0 0.0 6.3 . . . . . A . 32 LEU MD2 . . B . 11 LYS HA . A2DA . 32 . HD2# . . . A2DB . 11 . HA . . rr_1qp6 1 848 1 . . 1 1 11 11 LYS HA H . . . 2 1 32 32 LEU MD2 H . . . . . 4.0 0.0 6.3 . . . . . B . 32 LEU MD2 . . A . 11 LYS HA . A2DB . 32 . HD2# . . . A2DA . 11 . HA . . rr_1qp6 1 849 1 . . 1 1 33 33 ILE MD H . . . 2 1 10 10 PHE QE H . . . . . 4.0 0.0 7.3 . . . . . A . 33 ILE MD . . B . 10 PHE QE . A2DA . 33 . HD1# . . . A2DB . 10 . HE# . . rr_1qp6 1 850 1 . . 1 1 10 10 PHE QE H . . . 2 1 33 33 ILE MD H . . . . . 4.0 0.0 7.3 . . . . . B . 33 ILE MD . . A . 10 PHE QE . A2DB . 33 . HD1# . . . A2DA . 10 . HE# . . rr_1qp6 1 851 1 . . 1 1 33 33 ILE MG H . . . 2 1 11 11 LYS HA H . . . . . 4.0 0.0 6.3 . . . . . A . 33 ILE MG . . B . 11 LYS HA . A2DA . 33 . HG2# . . . A2DB . 11 . HA . . rr_1qp6 1 852 1 . . 1 1 11 11 LYS HA H . . . 2 1 33 33 ILE MG H . . . . . 4.0 0.0 6.3 . . . . . B . 33 ILE MG . . 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B . 11 LYS H . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1031 1 OR . 2 1 10 10 PHE HB2 H . . . 2 1 11 11 LYS HB3 H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . B . 10 PHE HB2 . . B . 11 LYS HB3 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1031 2 OR . 2 1 11 11 LYS HB2 H . . . 2 1 10 10 PHE HB2 H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . B . 10 PHE HB2 . . B . 11 LYS HB2 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1031 3 OR . 2 1 10 10 PHE HB3 H . . . 2 1 11 11 LYS HB2 H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . B . 10 PHE HB3 . . B . 11 LYS HB2 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1031 4 OR . 2 1 10 10 PHE HB3 H . . . 2 1 11 11 LYS HB3 H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . B . 10 PHE HB3 . . B . 11 LYS HB3 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1032 1 . . 2 1 10 10 PHE QD H . . . 2 1 11 11 LYS H H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . B . 10 PHE QD . . B . 11 LYS H . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1033 1 OR . 2 1 10 10 PHE QD H . . . 2 1 11 11 LYS HD2 H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . B . 10 PHE QD . . 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B . 12 GLU H . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1037 1 . . 2 1 10 10 PHE H H . . . 2 1 13 13 LEU H H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . B . 10 PHE H . . B . 13 LEU H . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1038 1 . . 2 1 13 13 LEU MD1 H . . . 2 1 10 10 PHE H H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . B . 10 PHE H . . B . 13 LEU MD1 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1039 1 . . 2 1 13 13 LEU H H . . . 2 1 10 10 PHE HA H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . B . 10 PHE HA . . B . 13 LEU H . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1040 1 . . 2 1 13 13 LEU HB3 H . . . 2 1 10 10 PHE HA H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . B . 10 PHE HA . . B . 13 LEU HB3 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1041 1 . . 2 1 13 13 LEU MD1 H . . . 2 1 10 10 PHE HA H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . B . 10 PHE HA . . B . 13 LEU MD1 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1042 1 . . 2 1 13 13 LEU MD2 H . . . 2 1 10 10 PHE HA H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . B . 10 PHE HA . . B . 13 LEU MD2 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1043 1 . . 2 1 13 13 LEU MD1 H . . . 2 1 10 10 PHE QD H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . B . 10 PHE QD . . B . 13 LEU MD1 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1044 1 . . 2 1 14 14 TRP HE3 H . . . 2 1 10 10 PHE HA H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . B . 10 PHE HA . . B . 14 TRP HE3 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1045 1 . . 2 1 10 10 PHE QD H . . . 2 1 14 14 TRP HB3 H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . B . 10 PHE QD . . B . 14 TRP HB3 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1046 1 . . 2 1 22 22 ILE MD H . . . 2 1 10 10 PHE QD H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . B . 10 PHE QD . . B . 22 ILE MD . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1047 1 . . 2 1 10 10 PHE HZ H . . . 2 1 23 23 GLU HA H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . B . 10 PHE HZ . . B . 23 GLU HA . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1048 1 . . 2 1 10 10 PHE HZ H . . . 2 1 25 25 LEU MD2 H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . B . 10 PHE HZ . . B . 25 LEU MD2 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1049 1 . . 2 1 25 25 LEU HB3 H . . . 2 1 10 10 PHE QE H . . . . . 4.0 0.0 6.0 . . . . . B . 10 PHE QE . . B . 25 LEU HB3 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1050 1 . . 2 1 10 10 PHE HZ H . . . 2 1 26 26 HIS HB3 H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . B . 10 PHE HZ . . B . 26 HIS HB3 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1051 1 . . 2 1 10 10 PHE HZ H . . . 2 1 26 26 HIS HB2 H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . B . 10 PHE HZ . . B . 26 HIS HB2 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1052 1 . . 2 1 26 26 HIS H H . . . 2 1 10 10 PHE QE H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . B . 10 PHE QE . . B . 26 HIS H . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1053 1 . . 2 1 10 10 PHE HZ H . . . 2 1 29 29 PHE HB3 H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . B . 10 PHE HZ . . B . 29 PHE HB3 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1054 1 . . 2 1 10 10 PHE QD H . . . 2 1 29 29 PHE QE H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . B . 10 PHE QD . . B . 29 PHE QE . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1055 1 . . 2 1 11 11 LYS HA H . . . 2 1 10 10 PHE QE H . . . . . 4.0 0.0 5.0 . . . . . B . 10 PHE QE . . B . 11 LYS HA . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1056 1 . . 2 1 11 11 LYS H H . . . 2 1 11 11 LYS HA H . . . . . 2.7 0.0 3.0 . . . . . B . 11 LYS H . . B . 11 LYS HA . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1057 1 . . 2 1 11 11 LYS H H . . . 2 1 11 11 LYS HB3 H . . . . . 2.7 0.0 3.0 . . . . . B . 11 LYS H . . B . 11 LYS HB3 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1058 1 . . 2 1 11 11 LYS H H . . . 2 1 11 11 LYS HB2 H . . . . . 2.7 0.0 3.0 . . . . . B . 11 LYS H . . B . 11 LYS HB2 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1059 1 OR . 2 1 11 11 LYS H H . . . 2 1 11 11 LYS HG2 H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . B . 11 LYS H . . B . 11 LYS HG2 . . . . . . . . . . . . . . . . rr_1qp6 1 1059 2 OR . 2 1 11 11 LYS H H . . . 2 1 11 11 LYS HG3 H . . . . . 3.3 0.0 3.8 . . . . . B . 11 LYS H . . 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changed upper limit assi (resi 14 and name HZ2 ) (resi 27 and name HE# ) 4.00 4.00 1.00!MISASSIGNED ; 381 69 382 81 rr_1qp6 1 37 "residue 15 Lys , intraresidue NOEs" 385 1 385 46 rr_1qp6 1 38 "residue 15 Lys , NOEs forward in sequence" 403 1 403 51 rr_1qp6 1 39 "residue 16 Gly , intraresidue NOEs" 410 1 410 46 rr_1qp6 1 40 "residue 16 Gly , NOEs forward in sequence" 415 1 415 51 rr_1qp6 1 41 ; changed from 2.70 residue 17 Pro , intraresidue NOEs residue 17 Pro , NOEs forward in sequence ; 422 68 427 51 rr_1qp6 1 42 ; changed upper limit residue 18 Arg , intraresidue NOEs ; 434 67 436 46 rr_1qp6 1 43 "residue 18 Arg , NOEs forward in sequence" 451 1 451 51 rr_1qp6 1 44 "residue 19 Arg , intraresidue NOEs" 465 1 465 46 rr_1qp6 1 45 "residue 19 Arg , NOEs forward in sequence" 486 1 486 51 rr_1qp6 1 46 "changed from 3.30" 501 68 501 86 rr_1qp6 1 47 "residue 20 Gly , intraresidue NOEs" 504 1 504 46 rr_1qp6 1 48 "residue 20 Gly , NOEs forward in sequence" 509 1 509 51 rr_1qp6 1 49 "residue 21 Glu , intraresidue NOEs" 520 1 520 46 rr_1qp6 1 50 "residue 21 Glu , NOEs forward in sequence" 530 1 530 51 rr_1qp6 1 51 "residue 22 Ile , intraresidue NOEs" 538 1 538 46 rr_1qp6 1 52 "residue 22 Ile , NOEs forward in sequence" 556 1 556 51 rr_1qp6 1 53 "residue 23 Glu , intraresidue NOEs" 572 1 572 46 rr_1qp6 1 54 "residue 23 Glu , NOEs forward in sequence" 584 1 584 51 rr_1qp6 1 55 "changed from 3.30" 591 67 591 85 rr_1qp6 1 56 "changed fro, 4.00" 593 67 593 85 rr_1qp6 1 57 ; changed from 3.30 residue 24 Glu , intraresidue NOEs ; 596 69 598 46 rr_1qp6 1 58 "changed from 2.70" 603 68 603 86 rr_1qp6 1 59 "residue 24 Glu , NOEs forward in sequence" 609 1 609 51 rr_1qp6 1 60 "changed from 2.70" 616 67 616 85 rr_1qp6 1 61 "residue 25 Leu , intraresidue NOEs" 619 1 619 46 rr_1qp6 1 62 "residue 25 Leu , NOEs forward in sequence" 638 1 638 51 rr_1qp6 1 63 "changed from 3.30" 655 68 655 87 rr_1qp6 1 64 "residue 26 His , intraresidue NOEs" 666 1 666 46 rr_1qp6 1 65 "residue 26 His , NOEs forward in sequence" 678 1 678 51 rr_1qp6 1 66 "residue 27 Lys , intraresidue NOEs" 695 1 695 46 rr_1qp6 1 67 "residue 27 Lys , NOEs forward in sequence" 711 1 711 51 rr_1qp6 1 68 "residue 28 Lys , intraresidue NOEs" 718 1 718 46 rr_1qp6 1 69 "residue 28 Lys , NOEs forward in sequence" 737 1 737 51 rr_1qp6 1 70 "residue 29 Phe , intraresidue NOEs" 750 1 750 46 rr_1qp6 1 71 "residue 29 Phe , NOEs forward in sequence" 762 1 762 51 rr_1qp6 1 72 "residue 30 His , intraresidue NOEs" 778 1 778 46 rr_1qp6 1 73 "residue 30 His , NOEs forward in sequence" 790 1 790 51 rr_1qp6 1 74 "residue 31 Glu , intraresidue NOEs" 810 1 810 46 rr_1qp6 1 75 "residue 31 Glu , NOEs forward in sequence" 822 1 822 51 rr_1qp6 1 76 "residue 32 Leu , intraresidue NOEs" 834 1 834 46 rr_1qp6 1 77 "residue 32 Leu , NOEs forward in sequence" 856 1 856 51 rr_1qp6 1 78 "residue 33 Ile , intraresidue NOEs" 870 1 870 46 rr_1qp6 1 79 "residue 33 Ile , NOEs forward in sequence" 888 1 888 51 rr_1qp6 1 80 "residue 34 Lys , intraresidue NOEs" 898 1 898 46 rr_1qp6 1 81 ; residue 34 Lys , NOEs forward in sequence residue 35 Gly , intraresidue NOEs ; 910 1 913 46 rr_1qp6 1 82 ; residue 35 Gly , NOEs forward in sequence number of restraints as function of range ANSIG v3.3 XPLOR distance restraints file ! ***************** 89 EXPLICIT INTER NOEs for jan22 runs ************************ ! ***************** INVOLVING 19 RESIDUES ************************ Distance corrections applied. Trivial distances output. residue 1 Gly , intraresidue NOEs residue 1 Gly , NOEs forward in sequence residue 2 Glu , intraresidue NOEs residue 2 Glu , NOEs forward in sequence residue 3 Val , intraresidue NOEs residue 3 Val , NOEs forward in sequence ; 917 1 947 50 rr_1qp6 1 83 ; assi (resi 3 and name HA and segid A2DA ) (resi 25 and name HD1# and segid A2DB ) 4.00 4.00 2.30NOT REAL!!! 2/6/97 assi (resi 3 and name HA and segid A2DB ) (resi 25 and name HD1# and segid A2DA ) 4.00 4.00 2.30 ; 970 1 971 98 rr_1qp6 1 84 ; residue 4 Glu , intraresidue NOEs residue 4 Glu , NOEs forward in sequence ; 976 1 979 50 rr_1qp6 1 85 ; residue 5 Glu , intraresidue NOEs residue 5 Glu , NOEs forward in sequence residue 6 Leu , intraresidue NOEs residue 6 Leu , NOEs forward in sequence ; 984 1 993 50 rr_1qp6 1 86 ; residue 7 Glu , intraresidue NOEs residue 7 Glu , NOEs forward in sequence ; 1005 1 1008 50 rr_1qp6 1 87 ; residue 8 Lys , intraresidue NOEs residue 8 Lys , NOEs forward in sequence residue 9 Lys , intraresidue NOEs residue 9 Lys , NOEs forward in sequence ; 1016 1 1025 50 rr_1qp6 1 88 ; residue 10 Phe , intraresidue NOEs residue 10 Phe , NOEs forward in sequence ; 1036 1 1039 51 rr_1qp6 1 89 ; residue 11 Lys , intraresidue NOEs residue 11 Lys , NOEs forward in sequence ; 1059 1 1062 51 rr_1qp6 1 90 ; residue 12 Glu , intraresidue NOEs residue 12 Glu , NOEs forward in sequence residue 13 Leu , intraresidue NOEs residue 13 Leu , NOEs forward in sequence residue 14 Trp , intraresidue NOEs residue 14 Trp , NOEs forward in sequence ; 1073 1 1088 51 rr_1qp6 1 91 "changed from 3.30" 1113 98 1113 116 rr_1qp6 1 92 ; residue 15 Lys , intraresidue NOEs residue 15 Lys , NOEs forward in sequence residue 16 Gly , intraresidue NOEs residue 16 Gly , NOEs forward in sequence residue 17 Pro , intraresidue NOEs residue 17 Pro , NOEs forward in sequence residue 18 Arg , intraresidue NOEs residue 18 Arg , NOEs forward in sequence ; 1138 1 1159 51 rr_1qp6 1 93 ; residue 19 Arg , intraresidue NOEs residue 19 Arg , NOEs forward in sequence residue 20 Gly , intraresidue NOEs residue 20 Gly , NOEs forward in sequence residue 21 Glu , intraresidue NOEs residue 21 Glu , NOEs forward in sequence ; 1164 1 1179 51 rr_1qp6 1 94 ; residue 22 Ile , intraresidue NOEs residue 22 Ile , NOEs forward in sequence ; 1184 1 1187 51 rr_1qp6 1 95 ; residue 23 Glu , intraresidue NOEs residue 23 Glu , NOEs forward in sequence residue 24 Glu , intraresidue NOEs residue 24 Glu , NOEs forward in sequence residue 25 Leu , intraresidue NOEs residue 25 Leu , NOEs forward in sequence ; 1198 1 1213 51 rr_1qp6 1 96 ; residue 26 His , intraresidue NOEs residue 26 His , NOEs forward in sequence ; 1230 1 1233 51 rr_1qp6 1 97 ; residue 27 Lys , intraresidue NOEs residue 27 Lys , NOEs forward in sequence residue 28 Lys , intraresidue NOEs residue 28 Lys , NOEs forward in sequence residue 29 Phe , intraresidue NOEs residue 29 Phe , NOEs forward in sequence ; 1253 1 1268 51 rr_1qp6 1 98 ; residue 30 His , intraresidue NOEs residue 30 His , NOEs forward in sequence residue 31 Glu , intraresidue NOEs residue 31 Glu , NOEs forward in sequence residue 32 Leu , intraresidue NOEs residue 32 Leu , NOEs forward in sequence ; 1300 1 1315 51 rr_1qp6 1 99 ; residue 33 Ile , intraresidue NOEs residue 33 Ile , NOEs forward in sequence ; 1330 1 1333 51 rr_1qp6 1 100 "changed from 3.30" 1356 100 1356 118 rr_1qp6 1 101 ; residue 34 Lys , intraresidue NOEs residue 34 Lys , NOEs forward in sequence residue 35 Gly , intraresidue NOEs number of restraints as function of range ; 1383 1 1391 52 rr_1qp6 1 stop_ loop_ _Gen_dist_constraint_conv_err.ID _Gen_dist_constraint_conv_err.Gen_dist_constraint_parse_file_ID _Gen_dist_constraint_conv_err.Parse_file_constraint_ID _Gen_dist_constraint_conv_err.Conv_error_type _Gen_dist_constraint_conv_err.Conv_error_note _Gen_dist_constraint_conv_err.Entry_ID _Gen_dist_constraint_conv_err.Gen_dist_constraint_list_ID 1 2 1 1 "Not handling restraint 1, item 1, resonance(s) 'A2DA.1.HN' (nmrStar names) not linked" rr_1qp6 1 2 2 1 1 "Not handling restraint 1, item 1, resonance(s) 'A2DA.1.HN' (nmrStar names) not linked" rr_1qp6 1 3 2 1 1 "Not handling restraint 1, item 1, resonance(s) 'A2DB.1.HN' (nmrStar names) not linked" rr_1qp6 1 4 2 1 1 "Not handling restraint 1, item 1, resonance(s) 'A2DB.1.HN' (nmrStar names) not linked" rr_1qp6 1 5 2 195 1 "Not handling restraint 195, item 1, resonance(s) 'A2DA.11.HD3' (nmrStar names) not linked" rr_1qp6 1 6 2 195 1 "Not handling restraint 195, item 1, resonance(s) 'A2DB.11.HD3' (nmrStar names) not linked" rr_1qp6 1 stop_ save_ save_MR_file_comment_1 _Org_constr_file_comment.Sf_framecode MR_file_comment_1 _Org_constr_file_comment.Sf_category org_constr_file_comment _Org_constr_file_comment.Entry_ID rr_1qp6 _Org_constr_file_comment.ID 1 _Org_constr_file_comment.Constraint_file_ID 1 _Org_constr_file_comment.Block_ID 1 _Org_constr_file_comment.Details "Generated by Wattos" _Org_constr_file_comment.Comment "*HEADER DE NOVO PROTEIN 01-JUN-99 1QP6 *TITLE SOLUTION STRUCTURE OF ALPHA2D *COMPND MOL_ID: 1; *COMPND 2 MOLECULE: ALPHA2D; *COMPND 3 CHAIN: A, B; *COMPND 4 ENGINEERED: YES; *COMPND 5 BIOLOGICAL_UNIT: HOMODIMER *SOURCE MOL_ID: 1; *SOURCE 2 SYNTHETIC: YES; *SOURCE 3 OTHER_DETAILS: THE PEPTIDE WAS CHEMICALLY SYNTHESIZED. *SOURCE 4 THIS SEQUENCE WAS DESIGNED TO FOLD INTO A HELIX-TURN-HELIX *SOURCE 5 PEPTIDE THAT DIMERIZES TO FORM A FOUR-HELIX BUNDLE. *KEYWDS DE NOVO DESIGN, PROTEIN DESIGN, PROTEIN FOLDING, BISECTING *KEYWDS 2 U MOTIF, FOUR-HELIX BUNDLE, HELIX-TURN-HELIX *EXPDTA NMR, 16 STRUCTURES *AUTHOR R.B.HILL, W.F.DEGRADO *REVDAT 1 09-JUN-99 1QP6 0 ! ANSIG v3.3 XPLOR distance restraints file ! No distance corrections applied. ! Trivial distances output." save_