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_refine.pdbx_ls_cross_valid_method NONE _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_Zscore _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0014 ? 47496 ? f_bond_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.3796 ? 64513 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0372 ? 7342 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0033 ? 8349 ? f_plane_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 10.2167 ? 17422 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details 1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_1 1.86222829554e-13 ? ? ? 'NCS constraints' D D ? ? ? ? 2 'ELECTRON MICROSCOPY' d_3 ens_1 3.43075777309e-13 ? ? ? 'NCS constraints' D D ? ? ? ? 3 'ELECTRON MICROSCOPY' d_4 ens_1 2.52287026291e-11 ? ? ? 'NCS constraints' D D ? ? ? ? 4 'ELECTRON MICROSCOPY' d_5 ens_1 2.29685874448e-13 ? ? ? 'NCS constraints' D D ? ? ? ? 5 'ELECTRON MICROSCOPY' d_6 ens_1 1.52558751127e-13 ? ? ? 'NCS constraints' D D ? ? ? ? 6 'ELECTRON MICROSCOPY' d_7 ens_1 5.74432907055e-12 ? ? ? 'NCS constraints' D D ? ? ? ? 7 'ELECTRON MICROSCOPY' d_8 ens_1 2.13473025616e-12 ? ? ? 'NCS constraints' D D ? ? ? ? 8 'ELECTRON MICROSCOPY' d_9 ens_1 2.94399577075e-11 ? ? ? 'NCS constraints' D D ? ? ? ? 9 'ELECTRON MICROSCOPY' d_10 ens_1 2.34005090414e-13 ? ? ? 'NCS constraints' D D ? ? ? ? 10 'ELECTRON MICROSCOPY' d_11 ens_1 1.97834550481e-13 ? ? ? 'NCS constraints' D D ? ? ? ? 11 'ELECTRON MICROSCOPY' d_12 ens_1 1.99394132862e-13 ? ? ? 'NCS constraints' D D ? ? ? ? # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] _struct_ncs_oper.details 1 given 0.497790319957 0.867296167896 0.00146782491302 -0.867211798847 0.497764249016 -0.0132078894071 -0.0121857826343 0.0053018444107 0.999911694675 -66.6623348431 251.67905601 0.82472458499 ? 2 given 0.851210076445 0.507809571603 0.132555063074 -0.509480164267 0.860159853714 -0.0235581891712 -0.125981617614 -0.0474812073041 0.990895638792 -86.4868976308 121.941414405 38.618375945 ? 3 given -0.00411253818035 0.997901686003 0.0646166549883 -0.995604657566 0.00196003484258 -0.0936350580499 -0.0935652331922 -0.0647177204139 0.99350750566 -9.67365221706 378.251494886 33.0216470121 ? 4 given 0.862033794721 -0.506562644659 0.0170887037006 0.502866796056 0.85899069311 0.0962287616759 -0.0634249334429 -0.0743591029101 0.995212540934 114.673696339 -82.6855793073 28.4277618377 ? 5 given 0.496500924403 -0.867918241355 -0.0143093811993 0.867565651576 0.495621642243 0.0410977851607 -0.0285774784108 -0.032819415947 0.999052658104 251.530579366 -73.5503647139 11.8194885903 ? 6 given -0.0166523891572 -0.998101900379 -0.0592899181521 0.992360542645 -0.0237481462074 0.12106435872 -0.122242592152 -0.0568209645363 0.990872406848 377.541769462 -14.8695238822 38.3555855347 ? 7 given -0.492619375858 -0.869981710985 0.0214003056263 0.869920849164 -0.491616031395 0.0393877374903 -0.023745877931 0.0380197347018 0.998994811325 425.457715404 105.772561499 -1.85106215719 ? 8 given -0.862074028909 -0.500016523164 -0.0825339035972 0.501465717339 -0.865169946626 0.00361908669154 -0.0732154561146 -0.038268002527 0.996581686049 442.938567925 247.322385809 24.2633163853 ? 9 given -0.999886467261 -0.00371479220467 0.0146031814086 0.00362851855516 -0.999975834603 -0.00592992946596 0.0146248569726 -0.00587626831012 0.9998757838 362.065128107 363.431033416 -2.35314012989 ? 10 given -0.86092061573 0.50775463433 -0.0316373944451 -0.503439441568 -0.859255910456 -0.0907083734868 -0.0732422151788 -0.062165196562 0.99537483706 250.936068179 445.163639912 28.502720428 ? 11 given -0.495675139449 0.868439241234 0.0109288799954 -0.868418474049 -0.495404121755 -0.0205939330375 -0.0124703673852 -0.0196987419189 0.999728187811 112.302625929 433.570913568 5.75578548161 ? # loop_ _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details ens_1 d_1 ;(chain "D" and resid 260 through 270) ; ens_1 d_2 ;(chain "B" and resid 260 through 270) ; ens_1 d_3 ;(chain "C" and resid 260 through 270) ; ens_1 d_4 ;(chain "A" and resid 260 through 270) ; ens_1 d_5 ;(chain "E" and resid 260 through 270) ; ens_1 d_6 ;(chain "F" and resid 260 through 270) ; ens_1 d_7 ;(chain "G" and resid 260 through 270) ; ens_1 d_8 ;(chain "H" and resid 260 through 270) ; ens_1 d_9 ;(chain "I" and resid 260 through 270) ; ens_1 d_10 ;(chain "J" and resid 260 through 270) ; ens_1 d_11 ;(chain "K" and resid 260 through 270) ; ens_1 d_12 ;(chain "L" and resid 260 through 270) ; # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details ens_1 d_1 1 D GLY 260 . D ALA 270 . D GLY 260 D ALA 270 ? ? ens_1 d_2 1 B GLY 260 . B ALA 270 . B GLY 260 B ALA 270 ? ? ens_1 d_3 1 C GLY 260 . C ALA 270 . C GLY 260 C ALA 270 ? ? ens_1 d_4 1 A GLY 260 . A ALA 270 . A GLY 260 A ALA 270 ? ? ens_1 d_5 1 E GLY 260 . E ALA 270 . E GLY 260 E ALA 270 ? ? ens_1 d_6 1 F GLY 260 . F ALA 270 . F GLY 260 F ALA 270 ? ? ens_1 d_7 1 G GLY 260 . G ALA 270 . G GLY 260 G ALA 270 ? ? ens_1 d_8 1 H GLY 260 . H ALA 270 . H GLY 260 H ALA 270 ? ? ens_1 d_9 1 I GLY 260 . I ALA 270 . I GLY 260 I ALA 270 ? ? ens_1 d_10 1 J GLY 260 . J ALA 270 . J GLY 260 J ALA 270 ? ? ens_1 d_11 1 K GLY 260 . K ALA 270 . K GLY 260 K ALA 270 ? ? ens_1 d_12 1 L GLY 260 . L ALA 270 . L GLY 260 L ALA 270 ? ? # _struct_ncs_ens.id ens_1 _struct_ncs_ens.details ? # loop_ _struct_ncs_ens_gen.ens_id _struct_ncs_ens_gen.dom_id_1 _struct_ncs_ens_gen.dom_id_2 _struct_ncs_ens_gen.oper_id ens_1 d_2 d_1 1 ens_1 d_3 d_1 2 ens_1 d_4 d_1 3 ens_1 d_5 d_1 4 ens_1 d_6 d_1 5 ens_1 d_7 d_1 6 ens_1 d_8 d_1 7 ens_1 d_9 d_1 8 ens_1 d_10 d_1 9 ens_1 d_11 d_1 10 ens_1 d_12 d_1 11 # _struct.entry_id 11CQ _struct.title 'KpSwz in complex with bacteriophage Bas14 Portal' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 11CQ _struct_keywords.text 'Bacteriophage, phage, portal protein, bacterial immunity, TIR, DUF4062, NADase, HYDROLASE' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? K N N 1 ? L N N 1 ? M N N 2 ? N N N 2 ? O N N 2 ? P N N 2 ? Q N N 2 ? R N N 2 ? S N N 2 ? T N N 2 ? U N N 2 ? V N N 2 ? W N N 2 ? X N N 2 ? Y N N 2 ? Z N N 3 ? AA N N 3 ? BA N N 3 ? CA N N 3 ? DA N N 3 ? EA N N 3 ? FA N N 3 ? GA N N 3 ? HA N N 3 ? IA N N 3 ? JA N N 3 ? KA N N 3 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0AAE7VZF8_9CAUD A0AAE7VZF8 ? 1 ;MTVNVDNQHPLYARIAPEWKMIRDCVAGERAVKACGPLYLPHPASGDNTDPKARARYKAYKQRAVFMNATARTLNALLGV AFAKPVSLDLSGAMADLIDDVDGSGMPLPQLLRGAMSEVLQSGRAGFMVDYDRQAHFDELGNVVPQTAAEMASHRPLIRL YTAEQIINWRQTHGVDTLIVLKETDEISTEDPDDFANHEVTIWTELRMINGAAHARRWYYNADTSEVQMDLPRGFTRTDL VPLVDAAGNALTQLPFCWCGAVDNNATPDAAPLADIASINIKHYNAEADVAEIAHIVGQPTLVATGLTQSWADKNLKGGI ALGATKGVILGQNMDAKLIQAEERNLSVTLCERRELQMAKLGAALVEKGTAPKTATEAAYDAQTDNSILSLIAGNVEKAF NRALQIVQLFTGDTADQRVTLNKFYTEITVDAQLMTAMMSGVQTGTVRLADFIKWMMAQGVIDDSQTVEQVEDELRNQNP LPQMSPDAVESTEEDPDKVADDGENN ; 1 2 PDB 11CQ 11CQ ? 2 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 11CQ A 1 ? 506 ? 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