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_refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_Zscore _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0026 ? 95730 ? f_bond_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.6954 ? 129625 ? f_angle_d ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0421 ? 14640 ? f_chiral_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0091 ? 16805 ? f_plane_restr ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 11.0012 ? 35685 ? f_dihedral_angle_d ? ? ? # loop_ _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ordinal _refine_ls_restr_ncs.pdbx_refine_id _refine_ls_restr_ncs.dom_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_ens_id _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_position _refine_ls_restr_ncs.weight_position _refine_ls_restr_ncs.rms_dev_B_iso _refine_ls_restr_ncs.weight_B_iso _refine_ls_restr_ncs.pdbx_type _refine_ls_restr_ncs.pdbx_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_auth_asym_id _refine_ls_restr_ncs.pdbx_number _refine_ls_restr_ncs.pdbx_rms _refine_ls_restr_ncs.pdbx_weight _refine_ls_restr_ncs.ncs_model_details 1 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_1 8.43777692923e-13 ? ? ? 'NCS constraints' L G ? ? ? ? 2 'ELECTRON MICROSCOPY' d_3 ens_1 6.23964382572e-13 ? ? ? 'NCS constraints' L G ? ? ? ? 3 'ELECTRON MICROSCOPY' d_4 ens_1 1.3878772693e-12 ? ? ? 'NCS constraints' L G ? ? ? ? 4 'ELECTRON MICROSCOPY' d_5 ens_1 1.952757076e-11 ? ? ? 'NCS constraints' L G ? ? ? ? 5 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_2 7.26816449477e-10 ? ? ? 'NCS constraints' A Ar ? ? ? ? 6 'ELECTRON MICROSCOPY' d_3 ens_2 1.67034439234e-12 ? ? ? 'NCS constraints' A Ar ? ? ? ? 7 'ELECTRON MICROSCOPY' d_4 ens_2 2.42807291864e-12 ? ? ? 'NCS constraints' A Ar ? ? ? ? 8 'ELECTRON MICROSCOPY' d_5 ens_2 1.47628559241e-11 ? ? ? 'NCS constraints' A Ar ? ? ? ? 9 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_3 2.50515190986e-10 ? ? ? 'NCS constraints' EA T ? ? ? ? 10 'ELECTRON MICROSCOPY' d_3 ens_3 8.32151416452e-13 ? ? ? 'NCS constraints' EA T ? ? ? ? 11 'ELECTRON MICROSCOPY' d_4 ens_3 2.29501061924e-12 ? ? ? 'NCS constraints' EA T ? ? ? ? 12 'ELECTRON MICROSCOPY' d_5 ens_3 9.8628048296e-11 ? ? ? 'NCS constraints' EA T ? ? ? ? 13 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_4 8.32549501705e-13 ? ? ? 'NCS constraints' O I ? ? ? ? 14 'ELECTRON MICROSCOPY' d_3 ens_4 3.47984219814e-13 ? ? ? 'NCS constraints' O I ? ? ? ? 15 'ELECTRON MICROSCOPY' d_4 ens_4 9.87254706628e-13 ? ? ? 'NCS constraints' O I ? ? ? ? 16 'ELECTRON MICROSCOPY' d_5 ens_4 9.49933196849e-13 ? ? ? 'NCS constraints' O I ? ? ? ? 17 'ELECTRON MICROSCOPY' d_6 ens_4 7.77152095324e-11 ? ? ? 'NCS constraints' O I ? ? ? ? 18 'ELECTRON MICROSCOPY' d_7 ens_4 3.87144594966e-11 ? ? ? 'NCS constraints' O I ? ? ? ? 19 'ELECTRON MICROSCOPY' d_8 ens_4 7.30296204049e-13 ? ? ? 'NCS constraints' O I ? ? ? ? 20 'ELECTRON MICROSCOPY' d_9 ens_4 5.67682735677e-13 ? ? ? 'NCS constraints' O I ? ? ? ? 21 'ELECTRON MICROSCOPY' d_10 ens_4 1.42658773174e-11 ? ? ? 'NCS constraints' O I ? ? ? ? 22 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_5 3.30305420191e-12 ? ? ? 'NCS constraints' N Ck ? ? ? ? 23 'ELECTRON MICROSCOPY' d_3 ens_5 6.17689464787e-13 ? ? ? 'NCS constraints' N Ck ? ? ? ? 24 'ELECTRON MICROSCOPY' d_4 ens_5 2.54249590154e-12 ? ? ? 'NCS constraints' N Ck ? ? ? ? 25 'ELECTRON MICROSCOPY' d_5 ens_5 3.13771864489e-10 ? ? ? 'NCS constraints' N Ck ? ? ? ? 26 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_6 1.04037488756e-12 ? ? ? 'NCS constraints' Z Q ? ? ? ? 27 'ELECTRON MICROSCOPY' d_3 ens_6 6.32262674985e-12 ? ? ? 'NCS constraints' Z Q ? ? ? ? 28 'ELECTRON MICROSCOPY' d_4 ens_6 1.66998698388e-11 ? ? ? 'NCS constraints' Z Q ? ? ? ? 29 'ELECTRON MICROSCOPY' d_5 ens_6 1.18792509486e-11 ? ? ? 'NCS constraints' Z Q ? ? ? ? 30 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_7 2.19610094246e-10 ? ? ? 'NCS constraints' SA i ? ? ? ? 31 'ELECTRON MICROSCOPY' d_3 ens_7 1.62636121311e-12 ? ? ? 'NCS constraints' SA i ? ? ? ? 32 'ELECTRON MICROSCOPY' d_4 ens_7 1.15292319111e-11 ? ? ? 'NCS constraints' SA i ? ? ? ? 33 'ELECTRON MICROSCOPY' d_5 ens_7 2.08108413312e-11 ? ? ? 'NCS constraints' SA i ? ? ? ? 34 'ELECTRON MICROSCOPY' d_2 ens_8 3.7073494836e-12 ? ? ? 'NCS constraints' CA c ? ? ? ? 35 'ELECTRON MICROSCOPY' d_3 ens_8 1.85907782258e-10 ? ? ? 'NCS constraints' CA c ? ? ? ? 36 'ELECTRON MICROSCOPY' d_4 ens_8 1.31932309308e-11 ? ? ? 'NCS constraints' CA c ? ? ? ? 37 'ELECTRON MICROSCOPY' d_5 ens_8 1.77312298716e-12 ? ? ? 'NCS constraints' CA c ? ? ? ? # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] _struct_ncs_oper.details 1 given -0.810275013079 0.586049788672 0.000219948610607 -0.586038173814 -0.810261207257 0.0060029031507 0.00369621594965 0.00473510414685 0.999981958225 411.415076039 802.626540748 -3.67539552061 ? 2 given 0.311103042706 -0.950376097916 -0.000411495359984 0.950370249489 0.311102600434 -0.00340013095871 0.0033594204695 0.000666718138923 0.999994134873 550.842535958 -86.615754087 -1.58165293113 ? 3 given -0.804842475186 -0.593480073348 0.00316111945818 0.593480775864 -0.80484775499 -0.000812384236189 0.00302635375525 0.00122222228918 0.999994673664 805.143010098 406.794034248 -1.75402326502 ? 4 given 0.306921570403 0.951730804419 -0.00276143844991 -0.951726478514 0.306929732428 0.00329385003948 0.00398242611225 0.00161718046478 0.999990762462 -85.6691761131 551.384731054 -2.30868699998 ? 5 given 0.309017180073 -0.951056455422 -3.19394526307e-05 0.951056228549 0.309017082785 0.000701914780057 -0.000657690746252 -0.000247279941345 0.999999753148 551.745408525 -87.817141934 0.304074903806 ? 6 given -0.809016528117 -0.587785466123 -0.000709258730432 0.587784872153 -0.809016782687 0.000888481327954 -0.00109603862768 0.000301904527048 0.999999353776 805.711198793 409.858553527 0.267060989661 ? 7 given -0.808242532617 0.588848383112 0.00126102162792 -0.58884058952 -0.808240062904 0.00384198533194 0.00328155505053 0.00236271523618 0.999991824453 409.281495174 803.554902352 -1.86284736634 ? 8 given 0.310831592142 0.95045731116 -0.00382374016238 -0.950461278686 0.310839120608 0.00154881159032 0.00266064732914 0.00315289739155 0.999991490061 -86.0231613697 550.209079058 -1.87798325704 ? 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G GLN 142 . D VAL 130 D GLN 142 ? ? ens_4 d_3 1 F MET 1 . F GLN 142 . C MET 1 C GLN 142 ? ? ens_4 d_4 1 P MET 1 . P ARG 111 . J MET 1 J ARG 111 ? ? ens_4 d_4 2 P VAL 130 . P GLN 142 . J VAL 130 J GLN 142 ? ? ens_4 d_5 1 X MET 1 . X GLN 142 . O MET 1 O GLN 142 ? ? ens_4 d_6 1 Y MET 1 . Y ARG 111 . P MET 1 P ARG 111 ? ? ens_4 d_6 2 Y VAL 130 . Y GLN 142 . P VAL 130 P GLN 142 ? ? ens_4 d_7 1 GA MET 1 . GA GLN 142 . U MET 1 U GLN 142 ? ? ens_4 d_8 1 HA MET 1 . HA ARG 111 . V MET 1 V ARG 111 ? ? ens_4 d_8 2 HA VAL 130 . HA GLN 142 . V VAL 130 V GLN 142 ? ? ens_4 d_9 1 PA MET 1 . PA GLN 142 . f MET 1 f GLN 142 ? ? ens_4 d_10 1 QA MET 1 . QA ARG 111 . g MET 1 g ARG 111 ? ? ens_4 d_10 2 QA VAL 130 . QA GLN 142 . g VAL 130 g GLN 142 ? ? ens_5 d_1 1 N LYS 134 . N ALA 934 . Ck LYS 134 Ck ALA 934 ? ? ens_5 d_2 1 E LYS 134 . E ALA 934 . Cj LYS 134 Cj ALA 934 ? ? ens_5 d_3 1 W LYS 134 . W ALA 934 . Cl LYS 134 Cl ALA 934 ? ? ens_5 d_4 1 FA LYS 134 . FA ALA 934 . Cm LYS 134 Cm ALA 934 ? ? ens_5 d_5 1 OA LYS 134 . OA ALA 934 . Cn LYS 134 Cn ALA 934 ? ? ens_6 d_1 1 Z MET 1 . Z LEU 206 . Q MET 1 Q LEU 206 ? ? ens_6 d_2 1 Q MET 1 . Q LEU 206 . K MET 1 K LEU 206 ? ? ens_6 d_3 1 RA MET 1 . RA LEU 206 . h MET 1 h LEU 206 ? ? ens_6 d_4 1 IA MET 1 . IA LEU 206 . W MET 1 W LEU 206 ? ? ens_6 d_5 1 H MET 1 . H LEU 206 . E MET 1 E LEU 206 ? ? ens_7 d_1 1 SA ALA 3 . SA LYS 174 . i ALA 3 i LYS 174 ? ? ens_7 d_2 1 I ALA 3 . I LYS 174 . F ALA 3 F LYS 174 ? ? ens_7 d_3 1 R ALA 3 . R LYS 174 . L ALA 3 L LYS 174 ? ? ens_7 d_4 1 JA ALA 3 . JA LYS 174 . X ALA 3 X LYS 174 ? ? ens_7 d_5 1 AA ALA 3 . AA LYS 174 . R ALA 3 R LYS 174 ? ? ens_8 d_1 1 CA ALA 33 . CA LYS 280 . c ALA 33 c LYS 280 ? ? ens_8 d_2 1 B ALA 33 . B LYS 280 . Z ALA 33 Z LYS 280 ? ? ens_8 d_3 1 T ALA 33 . T LYS 280 . b ALA 33 b LYS 280 ? ? ens_8 d_4 1 K ALA 33 . K LYS 280 . a ALA 33 a LYS 280 ? ? ens_8 d_5 1 LA ALA 33 . LA LYS 280 . d ALA 33 d LYS 280 ? ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details ens_1 ? ens_2 ? ens_3 ? ens_4 ? ens_5 ? ens_6 ? ens_7 ? ens_8 ? # loop_ _struct_ncs_ens_gen.ens_id _struct_ncs_ens_gen.dom_id_1 _struct_ncs_ens_gen.dom_id_2 _struct_ncs_ens_gen.oper_id ens_1 d_2 d_1 1 ens_1 d_3 d_1 2 ens_1 d_4 d_1 3 ens_1 d_5 d_1 4 ens_2 d_2 d_1 5 ens_2 d_3 d_1 6 ens_2 d_4 d_1 7 ens_2 d_5 d_1 8 ens_3 d_2 d_1 9 ens_3 d_3 d_1 10 ens_3 d_4 d_1 11 ens_3 d_5 d_1 12 ens_4 d_2 d_1 13 ens_4 d_3 d_1 14 ens_4 d_4 d_1 15 ens_4 d_5 d_1 16 ens_4 d_6 d_1 17 ens_4 d_7 d_1 18 ens_4 d_8 d_1 19 ens_4 d_9 d_1 20 ens_4 d_10 d_1 21 ens_5 d_2 d_1 22 ens_5 d_3 d_1 23 ens_5 d_4 d_1 24 ens_5 d_5 d_1 25 ens_6 d_2 d_1 26 ens_6 d_3 d_1 27 ens_6 d_4 d_1 28 ens_6 d_5 d_1 29 ens_7 d_2 d_1 30 ens_7 d_3 d_1 31 ens_7 d_4 d_1 32 ens_7 d_5 d_1 33 ens_8 d_2 d_1 34 ens_8 d_3 d_1 35 ens_8 d_4 d_1 36 ens_8 d_5 d_1 37 # _struct.entry_id 11FG _struct.title 'Penton Vertex Complex of Bacteriophage Goslar' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 11FG _struct_keywords.text 'PVC, Penton-Vertex, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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ASN Y 117 ASN Y 135 1 ? 19 HELX_P HELX_P450 BX9 ASP MA 156 ? TYR MA 174 ? ASP Y 156 TYR Y 174 1 ? 19 HELX_P HELX_P451 BY1 ARG MA 178 ? ILE MA 186 ? ARG Y 178 ILE Y 186 1 ? 9 HELX_P HELX_P452 BY2 ILE MA 190 ? ILE MA 195 ? ILE Y 190 ILE Y 195 1 ? 6 HELX_P HELX_P453 BY3 ARG MA 201 ? ALA MA 212 ? ARG Y 201 ALA Y 212 1 ? 12 HELX_P HELX_P454 BY4 LYS NA 4 ? LYS NA 16 ? LYS e 4 LYS e 16 1 ? 13 HELX_P HELX_P455 BY5 ASP NA 17 ? ASN NA 32 ? ASP e 17 ASN e 32 1 ? 16 HELX_P HELX_P456 BY6 ALA NA 34 ? LEU NA 47 ? ALA e 34 LEU e 47 1 ? 14 HELX_P HELX_P457 BY7 SER NA 53 ? GLY NA 74 ? SER e 53 GLY e 74 1 ? 22 HELX_P HELX_P458 BY8 THR NA 79 ? ASN NA 97 ? THR e 79 ASN e 97 1 ? 19 HELX_P HELX_P459 BY9 LYS OA 135 ? HIS OA 161 ? LYS Cn 135 HIS Cn 161 1 ? 27 HELX_P HELX_P460 BZ1 THR OA 165 ? GLY OA 184 ? THR Cn 165 GLY Cn 184 1 ? 20 HELX_P HELX_P461 BZ2 ASP OA 186 ? MET OA 198 ? ASP Cn 186 MET Cn 198 1 ? 13 HELX_P HELX_P462 BZ3 THR OA 199 ? ALA OA 208 ? 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ASN f 2 VAL f 14 1 ? 13 HELX_P HELX_P489 CC3 PRO PA 18 ? MET PA 38 ? PRO f 18 MET f 38 1 ? 21 HELX_P HELX_P490 CC4 THR PA 48 ? HIS PA 57 ? THR f 48 HIS f 57 1 ? 10 HELX_P HELX_P491 CC5 HIS PA 57 ? LEU PA 72 ? HIS f 57 LEU f 72 1 ? 16 HELX_P HELX_P492 CC6 GLY PA 75 ? GLU PA 96 ? GLY f 75 GLU f 96 1 ? 22 HELX_P HELX_P493 CC7 ALA PA 99 ? ARG PA 111 ? ALA f 99 ARG f 111 1 ? 13 HELX_P HELX_P494 CC8 GLN PA 132 ? ALA PA 140 ? GLN f 132 ALA f 140 1 ? 9 HELX_P HELX_P495 CC9 ASN QA 2 ? VAL QA 14 ? ASN g 2 VAL g 14 1 ? 13 HELX_P HELX_P496 CD1 PRO QA 18 ? MET QA 38 ? PRO g 18 MET g 38 1 ? 21 HELX_P HELX_P497 CD2 THR QA 48 ? HIS QA 57 ? THR g 48 HIS g 57 1 ? 10 HELX_P HELX_P498 CD3 HIS QA 57 ? LEU QA 72 ? HIS g 57 LEU g 72 1 ? 16 HELX_P HELX_P499 CD4 GLY QA 75 ? GLU QA 96 ? GLY g 75 GLU g 96 1 ? 22 HELX_P HELX_P500 CD5 ALA QA 99 ? GLU QA 114 ? ALA g 99 GLU g 114 1 ? 16 HELX_P HELX_P501 CD6 GLY QA 117 ? GLY QA 124 ? GLY g 117 GLY g 124 1 ? 8 HELX_P HELX_P502 CD7 GLN QA 132 ? ALA QA 140 ? 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