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N3 ? ? ? 1_555 D G . N1 ? ? C C 9 F G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog31 hydrog ? ? A C . N4 ? ? ? 1_555 D G . O6 ? ? C C 9 F G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog32 hydrog ? ? A C . O2 ? ? ? 1_555 D G . N2 ? ? C C 9 F G 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog33 hydrog ? ? B A . N1 ? ? ? 1_555 D T . N3 ? ? D A 10 F T 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog34 hydrog ? ? B A . N6 ? ? ? 1_555 D T . O4 ? ? D A 10 F T 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog35 hydrog ? ? B T . N3 ? ? ? 1_555 D A . N1 ? ? D T 11 F A 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog36 hydrog ? ? B T . O4 ? ? ? 1_555 D A . N6 ? ? D T 11 F A 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog37 hydrog ? ? B A . N6 ? ? ? 1_555 D A . N1 ? ? D A 12 F A 13 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-A MISPAIR' ? ? hydrog38 hydrog ? ? B A . N1 ? ? ? 1_555 D T . N3 ? ? D A 12 F T 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog39 hydrog ? ? B A . N6 ? ? ? 1_555 D T . O4 ? ? D A 12 F T 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog40 hydrog ? ? B T . N3 ? ? ? 1_555 D A . N1 ? ? D T 13 F A 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog41 hydrog ? ? B T . O4 ? ? ? 1_555 D A . N6 ? ? D T 13 F A 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog42 hydrog ? ? B G . N1 ? ? ? 1_555 C C . N3 ? ? D G 14 E C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog43 hydrog ? ? B G . N2 ? ? ? 1_555 C C . O2 ? ? D G 14 E C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog44 hydrog ? ? B G . O6 ? ? ? 1_555 C C . N4 ? ? D G 14 E C 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog45 hydrog ? ? B T . N3 ? ? ? 1_555 C A . N1 ? ? D T 15 E A 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog46 hydrog ? ? B T . O4 ? ? ? 1_555 C A . N6 ? ? D T 15 E A 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog47 hydrog ? ? B C . N3 ? ? ? 1_555 C G . N1 ? ? D C 16 E G 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog48 hydrog ? ? B C . N4 ? ? ? 1_555 C G . O6 ? ? D C 16 E G 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog49 hydrog ? ? B C . O2 ? ? ? 1_555 C G . N2 ? ? 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WATSON-CRICK ? ? hydrog69 hydrog ? ? B T . O4 ? ? ? 1_555 C A . N6 ? ? D T 23 E A 23 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog70 hydrog ? ? B T . N3 ? ? ? 1_555 C A . N1 ? ? D T 24 E A 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog71 hydrog ? ? B T . O4 ? ? ? 1_555 C A . N6 ? ? D T 24 E A 24 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog72 hydrog ? ? B C . N3 ? ? ? 1_555 C G . N1 ? ? D C 25 E G 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog73 hydrog ? ? B C . N4 ? ? ? 1_555 C G . O6 ? ? D C 25 E G 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog74 hydrog ? ? B C . O2 ? ? ? 1_555 C G . N2 ? ? D C 25 E G 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog75 hydrog ? ? B G . N1 ? ? ? 1_555 C C . N3 ? ? D G 26 E C 26 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog76 hydrog ? ? B G . N2 ? ? ? 1_555 C C . O2 ? ? D G 26 E C 26 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog77 hydrog ? ? B G . O6 ? ? ? 1_555 C C . N4 ? ? D G 26 E C 26 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 3 ? B ? 3 ? C ? 3 ? D ? 3 ? E ? 2 ? 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N B ALA 88 ? ? 1.33 213 1 C A GLY 141 ? ? N A ARG 142 ? ? 1.33 214 1 C B GLU 58 ? ? N B MET 59 ? ? 1.33 215 1 C A LEU 195 ? ? N A ILE 196 ? ? 1.33 216 1 C A VAL 43 ? ? N A LYS 44 ? ? 1.33 217 1 C B ARG 180 ? ? N B GLU 181 ? ? 1.33 218 1 C A LYS 130 ? ? N A VAL 131 ? ? 1.33 219 1 C B VAL 108 ? ? N B ASN 109 ? ? 1.33 220 1 C A VAL 86 ? ? N A ARG 87 ? ? 1.33 221 1 C B ARG 103 ? ? N B GLN 104 ? ? 1.33 222 1 C B MET 189 ? ? N B LEU 190 ? ? 1.33 223 1 C A ALA 135 ? ? N A PHE 136 ? ? 1.33 224 1 C B PHE 69 ? ? N B ILE 70 ? ? 1.33 225 1 C A GLY 33 ? ? N A GLU 34 ? ? 1.33 226 1 C B ARG 169 ? ? N B GLN 170 ? ? 1.33 227 1 C A SER 62 ? ? N A TYR 63 ? ? 1.33 228 1 C B ARG 82 ? ? N B SER 83 ? ? 1.33 229 1 C B LYS 44 ? ? N B GLY 45 ? ? 1.33 230 1 C A GLY 45 ? ? N A SER 46 ? ? 1.33 231 1 C A ASN 194 ? ? N A LEU 195 ? ? 1.33 232 1 C B ASP 155 ? ? N B ALA 156 ? ? 1.33 233 1 C B MET 163 ? ? N B GLN 164 ? ? 1.33 234 1 C A LYS 26 ? ? N A SER 27 ? ? 1.33 235 1 C B LEU 15 ? ? N B SER 16 ? ? 1.33 236 1 C A LEU 124 ? ? N A GLN 125 ? ? 1.33 237 1 C A VAL 205 ? ? N A TYR 206 ? ? 1.33 238 1 C B ILE 165 ? ? N B LYS 166 ? ? 1.33 239 1 C B LYS 166 ? ? N B ILE 167 ? ? 1.33 240 1 C A ASP 155 ? ? N A ALA 156 ? ? 1.33 241 1 C A ILE 60 ? ? N A LEU 61 ? ? 1.33 242 1 C A GLN 170 ? ? N A GLU 171 ? ? 1.33 243 1 C B PRO 154 ? ? N B ASP 155 ? ? 1.33 244 1 C B VAL 183 ? ? N B GLY 184 ? ? 1.33 245 1 C B ILE 97 ? ? N B SER 98 ? ? 1.33 246 1 C A SER 27 ? ? N A THR 28 ? ? 1.33 247 1 C B GLN 164 ? ? N B ILE 165 ? ? 1.33 248 1 C B ASN 194 ? ? N B LEU 195 ? ? 1.33 249 1 C B VAL 176 ? ? N B GLY 177 ? ? 1.33 250 1 C A LYS 101 ? ? N A PHE 102 ? ? 1.33 251 1 C A ARG 122 ? ? N A ARG 123 ? ? 1.33 252 1 C A ARG 142 ? ? N A ILE 143 ? ? 1.33 253 1 C B CYS 18 ? ? N B HIS 19 ? ? 1.33 254 1 C B ILE 175 ? ? N B VAL 176 ? ? 1.33 255 1 C A PHE 136 ? ? N A LEU 137 ? ? 1.33 256 1 C B LEU 29 ? ? N B ILE 30 ? ? 1.33 257 1 C B ARG 122 ? ? N B ARG 123 ? ? 1.33 258 1 C A MET 114 ? ? N A ARG 115 ? ? 1.33 259 1 C A ILE 20 ? ? N A HIS 21 ? ? 1.33 260 1 C B MET 114 ? ? N B ARG 115 ? ? 1.33 261 1 C A CYS 92 ? ? N A GLU 93 ? ? 1.33 262 1 C B TYR 23 ? ? N B PRO 24 ? ? 1.33 263 1 C A THR 158 ? ? N A HIS 159 ? ? 1.33 264 1 C A TYR 23 ? ? N A PRO 24 ? ? 1.33 265 1 C B GLU 96 ? ? N B ILE 97 ? ? 1.33 266 1 C B LEU 116 ? ? N B SER 117 ? ? 1.33 267 1 C B TRP 85 ? ? N B VAL 86 ? ? 1.33 268 1 C B LEU 195 ? ? N B ILE 196 ? ? 1.33 269 1 C A LEU 11 ? ? N A GLU 12 ? ? 1.33 270 1 C B THR 127 ? ? N B SER 128 ? ? 1.33 271 1 C B LEU 124 ? ? N B GLN 125 ? ? 1.33 272 1 C B THR 10 ? ? N B LEU 11 ? ? 1.33 273 1 C B THR 90 ? ? N B ALA 91 ? ? 1.33 274 1 C A LEU 113 ? ? N A MET 114 ? ? 1.33 275 1 C B VAL 47 ? ? N B ALA 48 ? ? 1.33 276 1 C A VAL 204 ? ? N A VAL 205 ? ? 1.33 277 1 C A SER 128 ? ? N A GLU 129 ? ? 1.33 278 1 C B LYS 89 ? ? N B THR 90 ? ? 1.33 279 1 C B GLY 173 ? ? N B GLN 174 ? ? 1.33 280 1 C A ARG 185 ? ? N A ILE 186 ? ? 1.33 281 1 C B ALA 135 ? ? N B PHE 136 ? ? 1.33 282 1 C B GLU 77 ? ? N B GLU 78 ? ? 1.33 283 1 C A TYR 41 ? ? N A ILE 42 ? ? 1.33 284 1 C B LYS 101 ? ? N B PHE 102 ? ? 1.33 285 1 C A ILE 172 ? ? N A GLY 173 ? ? 1.33 286 1 C B LEU 39 ? ? N B TYR 40 ? ? 1.33 287 1 C B ALA 144 ? ? N B GLN 145 ? ? 1.33 288 1 C A THR 10 ? ? N A LEU 11 ? ? 1.33 289 1 C B GLY 33 ? ? N B GLU 34 ? ? 1.33 290 1 C B ILE 106 ? ? N B GLN 107 ? ? 1.33 291 1 C A LYS 188 ? ? N A MET 189 ? ? 1.33 292 1 C A PHE 102 ? ? N A ARG 103 ? ? 1.33 293 1 C B GLU 34 ? ? N B LYS 35 ? ? 1.33 294 1 C A GLY 71 ? ? N A GLU 72 ? ? 1.33 295 1 C B ILE 51 ? ? N B LYS 52 ? ? 1.33 296 1 C B ASP 111 ? ? N B ILE 112 ? ? 1.33 297 1 C A ILE 175 ? ? N A VAL 176 ? ? 1.33 298 1 C A GLU 34 ? ? N A LYS 35 ? ? 1.33 299 1 C B ALA 36 ? ? N B GLU 37 ? ? 1.33 300 1 C B PHE 76 ? ? N B GLU 77 ? ? 1.33 301 1 C A SER 16 ? ? N A HIS 17 ? ? 1.33 302 1 C A ILE 112 ? ? N A LEU 113 ? ? 1.33 303 1 C A ARG 180 ? ? N A GLU 181 ? ? 1.34 304 1 C B THR 38 ? ? N B LEU 39 ? ? 1.34 305 1 C B HIS 159 ? ? N B PRO 160 ? ? 1.34 306 1 C A ARG 103 ? ? N A GLN 104 ? ? 1.34 307 1 C A HIS 199 ? ? N A GLY 200 ? ? 1.34 308 1 C B TYR 99 ? ? N B LYS 100 ? ? 1.34 309 1 C A LEU 105 ? ? N A ILE 106 ? ? 1.34 310 1 C A GLY 132 ? ? N A ASN 133 ? ? 1.34 311 1 C B THR 168 ? ? N B ARG 169 ? ? 1.34 312 1 C A ARG 82 ? ? N A SER 83 ? ? 1.34 313 1 C A GLU 37 ? ? N A THR 38 ? ? 1.34 314 1 C B LEU 75 ? ? N B PHE 76 ? ? 1.34 315 1 C B GLN 80 ? ? N B GLU 81 ? ? 1.34 316 1 C A LYS 22 ? ? N A TYR 23 ? ? 1.34 317 1 C A ASN 109 ? ? N A PRO 110 ? ? 1.34 318 1 C B VAL 86 ? ? N B ARG 87 ? ? 1.34 319 1 C B MET 157 ? ? N B THR 158 ? ? 1.34 320 1 C A ASN 65 ? ? N A GLN 66 ? ? 1.34 321 1 C A LEU 75 ? ? N A PHE 76 ? ? 1.34 322 1 C B ALA 198 ? ? N B HIS 199 ? ? 1.34 323 1 C A GLU 181 ? ? N A THR 182 ? ? 1.34 324 1 C B GLU 191 ? ? N B ASP 192 ? ? 1.34 325 1 C B GLN 193 ? ? N B ASN 194 ? ? 1.34 326 1 C A MET 189 ? ? N A LEU 190 ? ? 1.34 327 1 C A LEU 137 ? ? N A ASP 138 ? ? 1.34 328 1 C A PRO 24 ? ? N A SER 25 ? ? 1.34 329 1 C A GLN 32 ? ? N A GLY 33 ? ? 1.34 330 1 C B GLU 37 ? ? N B THR 38 ? ? 1.34 331 1 C A GLY 173 ? ? N A GLN 174 ? ? 1.34 332 1 C B GLN 107 ? ? N B VAL 108 ? ? 1.34 333 1 C A GLU 54 ? ? N A GLU 55 ? ? 1.34 334 1 C A SER 179 ? ? N A ARG 180 ? ? 1.34 335 1 C A PHE 69 ? ? N A ILE 70 ? ? 1.34 336 1 C B ILE 186 ? ? N B LEU 187 ? ? 1.34 337 1 C A LYS 35 ? ? N A ALA 36 ? ? 1.34 338 1 C B GLN 170 ? ? N B GLU 171 ? ? 1.34 339 1 C A LEU 147 ? ? N A LEU 148 ? ? 1.34 340 1 C B LEU 11 ? ? N B GLU 12 ? ? 1.34 341 1 C A GLN 145 ? ? N A THR 146 ? ? 1.34 342 1 C B THR 28 ? ? N B LEU 29 ? ? 1.34 343 1 C A GLU 81 ? ? N A ARG 82 ? ? 1.34 344 1 C A ASP 192 ? ? N A GLN 193 ? ? 1.34 345 1 C A PHE 14 ? ? N A LEU 15 ? ? 1.34 346 1 C B LYS 188 ? ? N B MET 189 ? ? 1.34 347 1 C A GLU 78 ? ? N A GLY 79 ? ? 1.34 348 1 C B LEU 105 ? ? N B ILE 106 ? ? 1.34 349 1 C A ALA 144 ? ? N A GLN 145 ? ? 1.34 350 1 C A GLU 12 ? ? N A TRP 13 ? ? 1.34 351 1 C B SER 83 ? ? N B ALA 84 ? ? 1.34 352 1 C A GLU 171 ? ? N A ILE 172 ? ? 1.34 353 1 C B GLY 56 ? ? N B LYS 57 ? ? 1.34 354 1 C B LYS 152 ? ? N B GLN 153 ? ? 1.34 355 1 C B GLU 181 ? ? N B THR 182 ? ? 1.34 356 1 C B LYS 130 ? ? N B VAL 131 ? ? 1.34 357 1 C A THR 28 ? ? N A LEU 29 ? ? 1.34 358 1 C A ALA 36 ? ? N A GLU 37 ? ? 1.34 359 1 C B ILE 30 ? ? N B HIS 31 ? ? 1.34 360 1 C A VAL 108 ? ? N A ASN 109 ? ? 1.34 361 1 C A ASP 161 ? ? N A GLY 162 ? ? 1.34 362 1 C B SER 179 ? ? N B ARG 180 ? ? 1.34 363 1 C A LEU 64 ? ? N A ASN 65 ? ? 1.34 364 1 C A LYS 44 ? ? N A GLY 45 ? ? 1.34 365 1 C A ALA 151 ? ? N A LYS 152 ? ? 1.34 366 1 C B LEU 148 ? ? N B ASN 149 ? ? 1.34 367 1 C A ALA 156 ? ? N A MET 157 ? ? 1.34 368 1 C B ASP 53 ? ? N B GLU 54 ? ? 1.34 369 1 C A ASN 149 ? ? N A LEU 150 ? ? 1.34 370 1 C A LEU 187 ? ? N A LYS 188 ? ? 1.34 371 1 C A LEU 61 ? ? N A SER 62 ? ? 1.34 372 1 C B TRP 13 ? ? N B PHE 14 ? ? 1.34 373 1 C B GLY 45 ? ? 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F VAL 196 OXT # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 1BER 'double helix' 1BER 'b-form double helix' 1BER 'mismatched base pair' 1BER 'triple helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A C . 1_555 D G . 1_555 0.959 -0.396 -0.493 11.186 0.000 6.525 1 C_C-4:G-4_F C -4 ? 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