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'X-RAY DIFFRACTION' ? x_bond_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_bond_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_deg ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_deg_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_deg_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_dihedral_angle_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_dihedral_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_dihedral_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_improper_angle_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_improper_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_improper_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_mcbond_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_mcangle_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_scbond_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_scangle_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.details _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] 1 given ? 0.145430 0.676290 -0.722140 -0.634110 -0.496560 -0.592740 -0.759450 0.544110 0.356620 13.75691 121.46453 15.26016 2 given ? 0.143240 -0.630960 -0.762470 0.676630 -0.499810 0.540710 -0.722260 -0.593360 0.355340 86.88766 43.31865 76.52478 3 given ? -0.999980 0.002660 -0.006510 0.002040 0.995560 0.094090 0.006730 0.094070 -0.995540 -40.40277 -14.51652 185.40674 4 given ? -0.143250 -0.678630 0.720380 -0.701300 -0.443990 -0.557720 0.698320 -0.585100 -0.412320 -54.40217 107.98046 181.39107 5 given ? -0.137790 0.633720 0.761190 0.605710 -0.554150 0.570990 0.783670 0.539740 -0.307490 -127.61971 35.81133 113.78906 # _struct.entry_id 1BVP _struct.title 'THE CRYSTAL STRUCTURE OF BLUETONGUE VIRUS VP7' _struct.pdbx_descriptor 'BLUETONGUE VIRUS 10 (USA) VP7 (BTV-10 (USA) VP7)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1BVP _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.text 'VIRUS, VP7, TRIMER, Viral protein' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? # loop_ _struct_biol.id _struct_biol.details _struct_biol.pdbx_parent_biol_id 1 ;VP7 FORMS A TRIMER IN CRYSTAL, SOLUTION, AND IN THE VIRUS. MTRIX THE TRANSFORMATIONS PRESENTED ON MTRIX RECORDS BELOW DESCRIBE NON-CRYSTALLOGRAPHIC RELATIONSHIPS AMONG THE VARIOUS DOMAINS IN THIS ENTRY. APPLYING THE APPROPRIATE MTRIX TRANSFORMATION TO THE RESIDUES LISTED FIRST WILL YIELD APPROXIMATE COORDINATES FOR THE RESIDUES LISTED SECOND. APPLIED TO TRANSFORMED TO MTRIX RESIDUES RESIDUES RMSD M1 1 1 .. N 349 2 1 .. N 349 0.0005 M2 1 1 .. N 349 3 1 .. N 349 0.0005 M3 1 1 .. N 349 4 1 .. N 349 0.0005 M4 1 1 .. N 349 5 1 .. N 349 0.0005 M5 1 1 .. N 349 6 1 .. N 349 0.0005 ; ? 2 ? ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ASP A 2 ? THR A 17 ? ASP 1 2 THR 1 17 1 ? 16 HELX_P HELX_P2 2 ALA A 27 ? THR A 44 ? ALA 1 27 THR 1 44 1 ? 18 HELX_P HELX_P3 3 LEU A 55 ? ALA A 73 ? LEU 1 55 ALA 1 73 1 ? 19 HELX_P HELX_P4 4 MET A 88 ? LEU A 94 ? MET 1 88 LEU 1 94 5 ? 7 HELX_P HELX_P5 5 THR A 103 ? THR A 116 ? THR 1 103 THR 1 116 1 ? 14 HELX_P HELX_P6 6 GLN A 172 ? ILE A 174 ? GLN 1 172 ILE 1 174 5 ? 3 HELX_P HELX_P7 7 LEU A 263 ? TYR A 271 ? LEU 1 263 TYR 1 271 1 ? 9 HELX_P HELX_P8 8 HIS A 276 ? ARG A 288 ? HIS 1 276 ARG 1 288 1 ? 13 HELX_P HELX_P9 9 ARG A 304 ? LEU A 323 ? ARG 1 304 LEU 1 323 1 ? 20 HELX_P HELX_P10 10 ARG A 341 ? ALA A 347 ? ARG 1 341 ALA 1 347 1 ? 7 HELX_P HELX_P11 11 ASP B 2 ? THR B 17 ? ASP 2 2 THR 2 17 1 ? 16 HELX_P HELX_P12 12 ALA B 27 ? THR B 44 ? ALA 2 27 THR 2 44 1 ? 18 HELX_P HELX_P13 13 LEU B 55 ? ALA B 73 ? LEU 2 55 ALA 2 73 1 ? 19 HELX_P HELX_P14 14 MET B 88 ? LEU B 94 ? MET 2 88 LEU 2 94 5 ? 7 HELX_P HELX_P15 15 THR B 103 ? THR B 116 ? THR 2 103 THR 2 116 1 ? 14 HELX_P HELX_P16 16 GLN B 172 ? ILE B 174 ? GLN 2 172 ILE 2 174 5 ? 3 HELX_P HELX_P17 17 LEU B 263 ? TYR B 271 ? LEU 2 263 TYR 2 271 1 ? 9 HELX_P HELX_P18 18 HIS B 276 ? ARG B 288 ? HIS 2 276 ARG 2 288 1 ? 13 HELX_P HELX_P19 19 ARG B 304 ? LEU B 323 ? ARG 2 304 LEU 2 323 1 ? 20 HELX_P HELX_P20 20 ARG B 341 ? ALA B 347 ? ARG 2 341 ALA 2 347 1 ? 7 HELX_P HELX_P21 21 ASP C 2 ? THR C 17 ? ASP 3 2 THR 3 17 1 ? 16 HELX_P HELX_P22 22 ALA C 27 ? THR C 44 ? ALA 3 27 THR 3 44 1 ? 18 HELX_P HELX_P23 23 LEU C 55 ? ALA C 73 ? LEU 3 55 ALA 3 73 1 ? 19 HELX_P HELX_P24 24 MET C 88 ? LEU C 94 ? MET 3 88 LEU 3 94 5 ? 7 HELX_P HELX_P25 25 THR C 103 ? THR C 116 ? THR 3 103 THR 3 116 1 ? 14 HELX_P HELX_P26 26 GLN C 172 ? ILE C 174 ? GLN 3 172 ILE 3 174 5 ? 3 HELX_P HELX_P27 27 LEU C 263 ? TYR C 271 ? LEU 3 263 TYR 3 271 1 ? 9 HELX_P HELX_P28 28 HIS C 276 ? ARG C 288 ? HIS 3 276 ARG 3 288 1 ? 13 HELX_P HELX_P29 29 ARG C 304 ? LEU C 323 ? ARG 3 304 LEU 3 323 1 ? 20 HELX_P HELX_P30 30 ARG C 341 ? ALA C 347 ? ARG 3 341 ALA 3 347 1 ? 7 HELX_P HELX_P31 31 ASP D 2 ? THR D 17 ? ASP 4 2 THR 4 17 1 ? 16 HELX_P HELX_P32 32 ALA D 27 ? THR D 44 ? ALA 4 27 THR 4 44 1 ? 18 HELX_P HELX_P33 33 LEU D 55 ? ALA D 73 ? LEU 4 55 ALA 4 73 1 ? 19 HELX_P HELX_P34 34 MET D 88 ? LEU D 94 ? MET 4 88 LEU 4 94 5 ? 7 HELX_P HELX_P35 35 THR D 103 ? THR D 116 ? THR 4 103 THR 4 116 1 ? 14 HELX_P HELX_P36 36 GLN D 172 ? ILE D 174 ? GLN 4 172 ILE 4 174 5 ? 3 HELX_P HELX_P37 37 LEU D 263 ? TYR D 271 ? LEU 4 263 TYR 4 271 1 ? 9 HELX_P HELX_P38 38 HIS D 276 ? ARG D 288 ? HIS 4 276 ARG 4 288 1 ? 13 HELX_P HELX_P39 39 ARG D 304 ? LEU D 323 ? ARG 4 304 LEU 4 323 1 ? 20 HELX_P HELX_P40 40 ARG D 341 ? ALA D 347 ? ARG 4 341 ALA 4 347 1 ? 7 HELX_P HELX_P41 41 ASP E 2 ? THR E 17 ? ASP 5 2 THR 5 17 1 ? 16 HELX_P HELX_P42 42 ALA E 27 ? THR E 44 ? ALA 5 27 THR 5 44 1 ? 18 HELX_P HELX_P43 43 LEU E 55 ? ALA E 73 ? LEU 5 55 ALA 5 73 1 ? 19 HELX_P HELX_P44 44 MET E 88 ? LEU E 94 ? MET 5 88 LEU 5 94 5 ? 7 HELX_P HELX_P45 45 THR E 103 ? THR E 116 ? THR 5 103 THR 5 116 1 ? 14 HELX_P HELX_P46 46 GLN E 172 ? ILE E 174 ? GLN 5 172 ILE 5 174 5 ? 3 HELX_P HELX_P47 47 LEU E 263 ? TYR E 271 ? LEU 5 263 TYR 5 271 1 ? 9 HELX_P HELX_P48 48 HIS E 276 ? ARG E 288 ? HIS 5 276 ARG 5 288 1 ? 13 HELX_P HELX_P49 49 ARG E 304 ? LEU E 323 ? ARG 5 304 LEU 5 323 1 ? 20 HELX_P HELX_P50 50 ARG E 341 ? ALA E 347 ? ARG 5 341 ALA 5 347 1 ? 7 HELX_P HELX_P51 51 ASP F 2 ? THR F 17 ? ASP 6 2 THR 6 17 1 ? 16 HELX_P HELX_P52 52 ALA F 27 ? THR F 44 ? ALA 6 27 THR 6 44 1 ? 18 HELX_P HELX_P53 53 LEU F 55 ? ALA F 73 ? LEU 6 55 ALA 6 73 1 ? 19 HELX_P HELX_P54 54 MET F 88 ? LEU F 94 ? MET 6 88 LEU 6 94 5 ? 7 HELX_P HELX_P55 55 THR F 103 ? THR F 116 ? THR 6 103 THR 6 116 1 ? 14 HELX_P HELX_P56 56 GLN F 172 ? ILE F 174 ? GLN 6 172 ILE 6 174 5 ? 3 HELX_P HELX_P57 57 LEU F 263 ? TYR F 271 ? LEU 6 263 TYR 6 271 1 ? 9 HELX_P HELX_P58 58 HIS F 276 ? ARG F 288 ? HIS 6 276 ARG 6 288 1 ? 13 HELX_P HELX_P59 59 ARG F 304 ? LEU F 323 ? ARG 6 304 LEU 6 323 1 ? 20 HELX_P HELX_P60 60 ARG F 341 ? ALA F 347 ? ARG 6 341 ALA 6 347 1 ? 7 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLY 337 A . ? GLY 337 1 PRO 338 A ? PRO 338 1 1 0.35 2 GLY 337 B . ? GLY 337 2 PRO 338 B ? PRO 338 2 1 0.38 3 GLY 337 C . ? GLY 337 3 PRO 338 C ? PRO 338 3 1 0.35 4 GLY 337 D . ? GLY 337 4 PRO 338 D ? PRO 338 4 1 0.34 5 GLY 337 E . ? GLY 337 5 PRO 338 E ? PRO 338 5 1 0.37 6 GLY 337 F . ? GLY 337 6 PRO 338 F ? PRO 338 6 1 0.37 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 5 ? B ? 4 ? C ? 3 ? D ? 5 ? E ? 4 ? F ? 3 ? G ? 5 ? H ? 4 ? I ? 3 ? J ? 5 ? K ? 4 ? L ? 3 ? M ? 5 ? N ? 4 ? O ? 3 ? P ? 5 ? Q ? 4 ? R ? 3 ? S ? 2 ? T ? 2 ? U ? 2 ? V ? 2 ? W ? 2 ? X ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? anti-parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? anti-parallel A 4 5 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel C 2 3 ? parallel D 1 2 ? anti-parallel D 2 3 ? anti-parallel D 3 4 ? anti-parallel D 4 5 ? anti-parallel E 1 2 ? anti-parallel E 2 3 ? anti-parallel E 3 4 ? anti-parallel F 1 2 ? anti-parallel F 2 3 ? parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? anti-parallel G 3 4 ? anti-parallel G 4 5 ? anti-parallel H 1 2 ? anti-parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel I 2 3 ? parallel J 1 2 ? anti-parallel J 2 3 ? anti-parallel J 3 4 ? anti-parallel J 4 5 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel K 2 3 ? anti-parallel K 3 4 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel L 2 3 ? parallel M 1 2 ? anti-parallel M 2 3 ? anti-parallel M 3 4 ? anti-parallel M 4 5 ? anti-parallel N 1 2 ? anti-parallel N 2 3 ? anti-parallel N 3 4 ? anti-parallel O 1 2 ? anti-parallel O 2 3 ? parallel P 1 2 ? anti-parallel P 2 3 ? anti-parallel P 3 4 ? anti-parallel P 4 5 ? anti-parallel Q 1 2 ? anti-parallel Q 2 3 ? anti-parallel Q 3 4 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel R 2 3 ? parallel S 1 2 ? anti-parallel T 1 2 ? anti-parallel U 1 2 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel W 1 2 ? anti-parallel X 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 ILE A 223 ? 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n F 1 275 ASP 275 275 275 ASP ASP 6 . n F 1 276 HIS 276 276 276 HIS HIS 6 . n F 1 277 THR 277 277 277 THR THR 6 . n F 1 278 TRP 278 278 278 TRP TRP 6 . n F 1 279 HIS 279 279 279 HIS HIS 6 . n F 1 280 GLY 280 280 280 GLY GLY 6 . n F 1 281 LEU 281 281 281 LEU LEU 6 . n F 1 282 ARG 282 282 282 ARG ARG 6 . n F 1 283 THR 283 283 283 THR THR 6 . n F 1 284 ALA 284 284 284 ALA ALA 6 . n F 1 285 ILE 285 285 285 ILE ILE 6 . n F 1 286 LEU 286 286 286 LEU LEU 6 . n F 1 287 ASN 287 287 287 ASN ASN 6 . n F 1 288 ARG 288 288 288 ARG ARG 6 . n F 1 289 THR 289 289 289 THR THR 6 . n F 1 290 THR 290 290 290 THR THR 6 . n F 1 291 LEU 291 291 291 LEU LEU 6 . n F 1 292 PRO 292 292 292 PRO PRO 6 . n F 1 293 ASN 293 293 293 ASN ASN 6 . n F 1 294 MET 294 294 294 MET MET 6 . n F 1 295 LEU 295 295 295 LEU LEU 6 . n F 1 296 PRO 296 296 296 PRO PRO 6 . n F 1 297 PRO 297 297 297 PRO PRO 6 . n F 1 298 ILE 298 298 298 ILE ILE 6 . n F 1 299 PHE 299 299 299 PHE PHE 6 . n F 1 300 PRO 300 300 300 PRO PRO 6 . n F 1 301 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_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 2 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 3 software_defined_assembly PISA hexameric 6 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C 2 1 D,E,F 3 1 A,B,C 3 2 D,E,F # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 15610 ? 1 MORE -56 ? 1 'SSA (A^2)' 36620 ? 2 'ABSA (A^2)' 15590 ? 2 MORE -56 ? 2 'SSA (A^2)' 36630 ? 3 'ABSA (A^2)' 34790 ? 3 MORE -140 ? 3 'SSA (A^2)' 69660 ? # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 2 'crystal symmetry operation' 1_456 x-1,y,z+1 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -113.0193397053 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 126.4220805528 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 1995-06-03 2 'Structure model' 1 1 2008-03-24 3 'Structure model' 1 2 2011-07-13 # 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