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WWPDB D_1000010455 ? ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 1ECU _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2000-01-26 _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.SG_entry . _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Wu, J.H.' 1 'Chang, C.' 2 'Pei, J.M.' 3 'Xiao, Q.' 4 'Shi, Y.Y.' 5 # _citation.id primary _citation.title ;Solution structure of E2F binding DNA fragment GCGCGAAAC-T-GTTTCGCGC studied by Molecular Dynamics Simulation and Two Dimensional NMR experiment ; _citation.journal_abbrev 'to be published' _citation.journal_volume ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.year 2000 _citation.journal_id_ASTM ? _citation.country ? _citation.journal_id_ISSN ? _citation.journal_id_CSD 0353 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.pdbx_database_id_DOI ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Wu, J.H.' 1 ? primary 'Chang, C.' 2 ? primary 'Pei, J.M.' 3 ? primary 'Xiao, Q.' 4 ? primary 'Shi, Y.Y.' 5 ? # _cell.entry_id 1ECU _cell.length_a 1.000 _cell.length_b 1.000 _cell.length_c 1.000 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 1 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1ECU _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 # _entity.id 1 _entity.type polymer _entity.src_method syn _entity.pdbx_description ;DNA (5'-D(*GP*CP*GP*CP*GP*AP*AP*AP*CP*TP*GP*TP*TP*TP*CP*GP*CP*GP*C)-3') ; _entity.formula_weight 5821.759 _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_ec ? _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment 'FRAGMENT OF E2F BINDING DNA' _entity.details ? # _entity_poly.entity_id 1 _entity_poly.type polydeoxyribonucleotide _entity_poly.nstd_linkage no _entity_poly.nstd_monomer no _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code '(DG)(DC)(DG)(DC)(DG)(DA)(DA)(DA)(DC)(DT)(DG)(DT)(DT)(DT)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)' _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can GCGCGAAACTGTTTCGCGC _entity_poly.pdbx_strand_id A _entity_poly.pdbx_target_identifier ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DG n 1 2 DC n 1 3 DG n 1 4 DC n 1 5 DG n 1 6 DA n 1 7 DA n 1 8 DA n 1 9 DC n 1 10 DT n 1 11 DG n 1 12 DT n 1 13 DT n 1 14 DT n 1 15 DC n 1 16 DG n 1 17 DC n 1 18 DG n 1 19 DC n # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num ? _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num ? _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific ? _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id ? _pdbx_entity_src_syn.details 'The sequence is formed by adding CTG loop to ends of ds(GCGCGAAA:TTTCGCGC), which occurs naturally in humans.' # _struct_ref.id 1 _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.db_name PDB _struct_ref.db_code 1ECU _struct_ref.pdbx_db_accession 1ECU _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ? _struct_ref.pdbx_align_begin ? # _struct_ref_seq.align_id 1 _struct_ref_seq.ref_id 1 _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code 1ECU _struct_ref_seq.pdbx_strand_id A _struct_ref_seq.seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.seq_align_end 19 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_db_accession 1ECU _struct_ref_seq.db_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.db_align_end 19 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 19 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type 1 1 1 '2D NOESY' 2 1 2 '2D NOESY' # _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 300 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure ambient _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 7.0 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength '150mM NaCl' _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units K # loop_ _pdbx_nmr_sample_details.solution_id _pdbx_nmr_sample_details.contents _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system 1 '3.5mM DNA fragment; 50mM phosphate buffer, pH 7.0; 150mM NaCl; 1mM EDTA; 1mM NaN3; 90% H2O, 10% D2O' '90% H2O/10% D2O' 2 'same as 1 except in D2O' '99.96% D2O' # _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id 1 _pdbx_nmr_spectrometer.type ? _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer Bruker _pdbx_nmr_spectrometer.model DMX _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength 500 # _pdbx_nmr_refine.entry_id 1ECU _pdbx_nmr_refine.method ;Molecular Dynamics with Particle-Particle Particle-Mesh method; Iterative Relaxation Matrix Approach with generalized order parameters ; _pdbx_nmr_refine.details ;Initial structure for model 1 is A-DNA, while that for model 2 is B-DNA. First we applied 640ps free MD with 18 Na+ counterions and 2789 waters for A-DNA and 2303 waters for B-DNA. Then we applied 4 cycles of IRMA with 174 NOE restraints and 19 hydrogen bond restraints ; _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 1 # _pdbx_nmr_details.entry_id 1ECU _pdbx_nmr_details.text 'Solvent suppression was realized by WATERGATE method.' # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 1ECU _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 2 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 2 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'all calculated structures submitted' _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # loop_ _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.authors _pdbx_nmr_software.ordinal XwinNMR 1.1 collection Bruker 1 IRMA 0.1 'iterative matrix relaxation' 'Alexandre Bonvin' 2 GROMOS 96 refinement 'W.F.van Gunsteren' 3 # _exptl.entry_id 1ECU _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.crystals_number ? # _struct.entry_id 1ECU _struct.title 'SOLUTION STRUCTURE OF E2F BINDING DNA FRAGMENT GCGCGAAAC-T-GTTTCGCGC' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1ECU _struct_keywords.pdbx_keywords DNA _struct_keywords.text 'double strands, loop, DNA' # _struct_asym.id A _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.entity_id 1 _struct_asym.details ? # _struct_biol.id 1 # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? 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'DC-DG PAIR' ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _database_PDB_matrix.entry_id 1ECU _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _atom_sites.entry_id 1ECU _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C H N O P # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 DG 1 1 1 DG G A . n A 1 2 DC 2 2 2 DC C A . n A 1 3 DG 3 3 3 DG G A . n A 1 4 DC 4 4 4 DC C A . n A 1 5 DG 5 5 5 DG G A . n A 1 6 DA 6 6 6 DA A A . n A 1 7 DA 7 7 7 DA A A . n A 1 8 DA 8 8 8 DA A A . n A 1 9 DC 9 9 9 DC C A . n A 1 10 DT 10 10 10 DT T A . n A 1 11 DG 11 11 11 DG G A . n A 1 12 DT 12 12 12 DT T A . n A 1 13 DT 13 13 13 DT T A . n A 1 14 DT 14 14 14 DT T A . n A 1 15 DC 15 15 15 DC C A . n A 1 16 DG 16 16 16 DG G A . n A 1 17 DC 17 17 17 DC C A . n A 1 18 DG 18 18 18 DG G A . n A 1 19 DC 19 19 19 DC C A . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2000-02-02 2 'Structure model' 1 1 2008-04-27 3 'Structure model' 1 2 2011-07-13 4 'Structure model' 1 3 2022-02-16 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? 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N9 A DA 8 ? ? 110.70 113.80 -3.10 0.50 N 54 1 N3 A DA 8 ? ? C4 A DA 8 ? ? N9 A DA 8 ? ? 134.40 127.40 7.00 0.80 N 55 1 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 113.64 108.30 5.34 0.30 N 56 1 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.48 121.90 -5.42 0.70 N 57 1 "O4'" A DT 10 ? ? "C1'" A DT 10 ? ? N1 A DT 10 ? ? 117.06 108.30 8.76 0.30 N 58 1 N1 A DT 10 ? ? C2 A DT 10 ? ? N3 A DT 10 ? ? 120.08 114.60 5.48 0.60 N 59 1 C2 A DT 10 ? ? N3 A DT 10 ? ? C4 A DT 10 ? ? 120.57 127.20 -6.63 0.60 N 60 1 N3 A DT 10 ? ? C4 A DT 10 ? ? C5 A DT 10 ? ? 119.46 115.20 4.26 0.60 N 61 1 C5 A DT 10 ? ? C4 A DT 10 ? ? O4 A DT 10 ? ? 119.37 124.90 -5.53 0.70 N 62 1 C6 A DG 11 ? ? N1 A DG 11 ? ? C2 A DG 11 ? ? 118.64 125.10 -6.46 0.60 N 63 1 C2 A DG 11 ? ? N3 A DG 11 ? ? C4 A DG 11 ? ? 120.84 111.90 8.94 0.50 N 64 1 N3 A DG 11 ? ? C4 A DG 11 ? ? C5 A DG 11 ? ? 119.68 128.60 -8.92 0.50 N 65 1 C5 A DG 11 ? ? C6 A DG 11 ? ? N1 A DG 11 ? ? 117.64 111.50 6.14 0.50 N 66 1 C4 A DG 11 ? ? C5 A DG 11 ? ? N7 A DG 11 ? ? 107.41 110.80 -3.39 0.40 N 67 1 N3 A DG 11 ? ? C4 A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 131.80 126.00 5.80 0.60 N 68 1 N1 A DG 11 ? ? C2 A DG 11 ? ? N2 A DG 11 ? ? 123.95 116.20 7.75 0.90 N 69 1 N3 A DG 11 ? ? C2 A DG 11 ? ? N2 A DG 11 ? ? 114.32 119.90 -5.58 0.70 N 70 1 C5 A DG 11 ? ? C6 A DG 11 ? ? O6 A DG 11 ? ? 118.88 128.60 -9.72 0.60 N 71 1 "O4'" A DT 12 ? ? "C1'" A DT 12 ? ? N1 A DT 12 ? ? 112.20 108.30 3.90 0.30 N 72 1 N1 A DT 12 ? ? C2 A DT 12 ? ? N3 A DT 12 ? ? 119.82 114.60 5.22 0.60 N 73 1 C2 A DT 12 ? ? N3 A DT 12 ? ? C4 A DT 12 ? ? 120.57 127.20 -6.63 0.60 N 74 1 N3 A DT 12 ? ? C4 A DT 12 ? ? C5 A DT 12 ? ? 119.67 115.20 4.47 0.60 N 75 1 C5 A DT 12 ? ? C4 A DT 12 ? ? O4 A DT 12 ? ? 119.83 124.90 -5.07 0.70 N 76 1 "O4'" A DT 13 ? ? "C1'" A DT 13 ? ? N1 A DT 13 ? ? 112.65 108.30 4.35 0.30 N 77 1 N1 A DT 13 ? ? C2 A DT 13 ? ? N3 A DT 13 ? ? 120.15 114.60 5.55 0.60 N 78 1 C2 A DT 13 ? ? N3 A DT 13 ? ? C4 A DT 13 ? ? 120.61 127.20 -6.59 0.60 N 79 1 N3 A DT 13 ? ? C4 A DT 13 ? ? C5 A DT 13 ? ? 119.11 115.20 3.91 0.60 N 80 1 C6 A DT 13 ? ? C5 A DT 13 ? ? C7 A DT 13 ? ? 119.25 122.90 -3.65 0.60 N 81 1 N1 A DT 14 ? ? C2 A DT 14 ? ? N3 A DT 14 ? ? 120.15 114.60 5.55 0.60 N 82 1 C2 A DT 14 ? ? N3 A DT 14 ? ? C4 A DT 14 ? ? 120.25 127.20 -6.95 0.60 N 83 1 N3 A DT 14 ? ? C4 A DT 14 ? ? C5 A DT 14 ? ? 119.49 115.20 4.29 0.60 N 84 1 C5 A DT 14 ? ? C4 A DT 14 ? ? O4 A DT 14 ? ? 119.51 124.90 -5.39 0.70 N 85 1 N3 A DC 15 ? ? C4 A DC 15 ? ? C5 A DC 15 ? ? 119.36 121.90 -2.54 0.40 N 86 1 C6 A DG 16 ? ? N1 A DG 16 ? ? C2 A DG 16 ? ? 118.87 125.10 -6.23 0.60 N 87 1 C2 A DG 16 ? ? N3 A DG 16 ? ? C4 A DG 16 ? ? 121.44 111.90 9.54 0.50 N 88 1 N3 A DG 16 ? ? C4 A DG 16 ? ? C5 A DG 16 ? ? 119.92 128.60 -8.68 0.50 N 89 1 C5 A DG 16 ? ? C6 A DG 16 ? ? N1 A DG 16 ? ? 118.18 111.50 6.68 0.50 N 90 1 C4 A DG 16 ? ? C5 A DG 16 ? ? N7 A DG 16 ? ? 107.87 110.80 -2.93 0.40 N 91 1 N3 A DG 16 ? ? C4 A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 133.16 126.00 7.16 0.60 N 92 1 N1 A DG 16 ? ? C2 A DG 16 ? ? N2 A DG 16 ? ? 123.54 116.20 7.34 0.90 N 93 1 N3 A DG 16 ? ? C2 A DG 16 ? ? N2 A DG 16 ? ? 115.43 119.90 -4.47 0.70 N 94 1 C5 A DG 16 ? ? C6 A DG 16 ? ? O6 A DG 16 ? ? 118.40 128.60 -10.20 0.60 N 95 1 "O4'" A DG 18 ? ? "C1'" A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 110.39 108.30 2.09 0.30 N 96 1 C6 A DG 18 ? ? N1 A DG 18 ? ? C2 A DG 18 ? ? 119.24 125.10 -5.86 0.60 N 97 1 C2 A DG 18 ? ? N3 A DG 18 ? ? C4 A DG 18 ? ? 120.92 111.90 9.02 0.50 N 98 1 N3 A DG 18 ? ? C4 A DG 18 ? ? C5 A DG 18 ? ? 120.06 128.60 -8.54 0.50 N 99 1 C5 A DG 18 ? ? C6 A DG 18 ? ? N1 A DG 18 ? ? 117.51 111.50 6.01 0.50 N 100 1 C4 A DG 18 ? ? C5 A DG 18 ? ? N7 A DG 18 ? ? 107.34 110.80 -3.46 0.40 N 101 1 C5 A DG 18 ? ? N7 A DG 18 ? ? C8 A DG 18 ? ? 107.41 104.30 3.11 0.50 N 102 1 N3 A DG 18 ? ? C4 A DG 18 ? ? N9 A DG 18 ? ? 132.57 126.00 6.57 0.60 N 103 1 N1 A DG 18 ? ? C2 A DG 18 ? ? N2 A DG 18 ? ? 122.96 116.20 6.76 0.90 N 104 1 C5 A DG 18 ? ? C6 A DG 18 ? ? O6 A DG 18 ? ? 119.81 128.60 -8.79 0.60 N 105 1 "O4'" A DC 19 ? ? "C1'" A DC 19 ? ? N1 A DC 19 ? ? 113.50 108.30 5.20 0.30 N 106 1 N3 A DC 19 ? ? C4 A DC 19 ? ? C5 A DC 19 ? ? 119.28 121.90 -2.62 0.40 N 107 1 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.64 121.90 -4.26 0.70 N 108 2 C6 A DG 1 ? ? N1 A DG 1 ? ? C2 A DG 1 ? ? 119.26 125.10 -5.84 0.60 N 109 2 C2 A DG 1 ? ? N3 A DG 1 ? ? C4 A DG 1 ? ? 121.17 111.90 9.27 0.50 N 110 2 N3 A DG 1 ? ? C4 A DG 1 ? ? C5 A DG 1 ? ? 120.09 128.60 -8.51 0.50 N 111 2 C5 A DG 1 ? ? C6 A DG 1 ? ? N1 A DG 1 ? ? 117.67 111.50 6.17 0.50 N 112 2 C4 A DG 1 ? ? C5 A DG 1 ? ? N7 A DG 1 ? ? 107.60 110.80 -3.20 0.40 N 113 2 N3 A DG 1 ? ? C4 A DG 1 ? ? N9 A DG 1 ? ? 132.71 126.00 6.71 0.60 N 114 2 N1 A DG 1 ? ? C2 A DG 1 ? ? N2 A DG 1 ? ? 123.68 116.20 7.48 0.90 N 115 2 N3 A DG 1 ? ? C2 A DG 1 ? ? N2 A DG 1 ? ? 115.34 119.90 -4.56 0.70 N 116 2 C5 A DG 1 ? ? C6 A DG 1 ? ? O6 A DG 1 ? ? 119.17 128.60 -9.43 0.60 N 117 2 C6 A DC 2 ? ? N1 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? 117.46 120.30 -2.84 0.40 N 118 2 C6 A DG 3 ? ? N1 A DG 3 ? ? C2 A DG 3 ? ? 119.27 125.10 -5.83 0.60 N 119 2 C2 A DG 3 ? ? N3 A DG 3 ? ? C4 A DG 3 ? ? 121.18 111.90 9.28 0.50 N 120 2 N3 A DG 3 ? ? C4 A DG 3 ? ? C5 A DG 3 ? ? 120.07 128.60 -8.53 0.50 N 121 2 C5 A DG 3 ? ? C6 A DG 3 ? ? N1 A DG 3 ? ? 117.72 111.50 6.22 0.50 N 122 2 C4 A DG 3 ? ? C5 A DG 3 ? ? N7 A DG 3 ? ? 107.56 110.80 -3.24 0.40 N 123 2 N3 A DG 3 ? ? C4 A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 132.62 126.00 6.62 0.60 N 124 2 N1 A DG 3 ? ? C2 A DG 3 ? ? N2 A DG 3 ? ? 123.23 116.20 7.03 0.90 N 125 2 C5 A DG 3 ? ? C6 A DG 3 ? ? O6 A DG 3 ? ? 119.43 128.60 -9.17 0.60 N 126 2 "C3'" A DG 3 ? ? "O3'" A DG 3 ? ? P A DC 4 ? ? 129.62 119.70 9.92 1.20 Y 127 2 C6 A DC 4 ? ? N1 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? 117.60 120.30 -2.70 0.40 N 128 2 N3 A DC 4 ? ? C4 A DC 4 ? ? C5 A DC 4 ? ? 119.32 121.90 -2.58 0.40 N 129 2 N3 A DC 4 ? ? C2 A DC 4 ? ? O2 A DC 4 ? ? 117.45 121.90 -4.45 0.70 N 130 2 P A DG 5 ? ? "O5'" A DG 5 ? ? "C5'" A DG 5 ? ? 133.48 120.90 12.58 1.60 N 131 2 C6 A DG 5 ? ? N1 A DG 5 ? ? C2 A DG 5 ? ? 119.50 125.10 -5.60 0.60 N 132 2 C2 A DG 5 ? ? N3 A DG 5 ? ? C4 A DG 5 ? ? 121.24 111.90 9.34 0.50 N 133 2 N3 A DG 5 ? ? C4 A DG 5 ? ? C5 A DG 5 ? ? 120.29 128.60 -8.31 0.50 N 134 2 C5 A DG 5 ? ? C6 A DG 5 ? ? N1 A DG 5 ? ? 117.76 111.50 6.26 0.50 N 135 2 C4 A DG 5 ? ? C5 A DG 5 ? ? N7 A DG 5 ? ? 107.91 110.80 -2.89 0.40 N 136 2 N3 A DG 5 ? ? C4 A DG 5 ? ? N9 A DG 5 ? ? 132.82 126.00 6.82 0.60 N 137 2 N1 A DG 5 ? ? C2 A DG 5 ? ? N2 A DG 5 ? ? 123.10 116.20 6.90 0.90 N 138 2 C5 A DG 5 ? ? C6 A DG 5 ? ? O6 A DG 5 ? ? 119.36 128.60 -9.24 0.60 N 139 2 "C3'" A DG 5 ? ? "O3'" A DG 5 ? ? P A DA 6 ? ? 127.19 119.70 7.49 1.20 Y 140 2 N1 A DA 6 ? ? C2 A DA 6 ? ? N3 A DA 6 ? ? 123.45 129.30 -5.85 0.50 N 141 2 C2 A DA 6 ? ? N3 A DA 6 ? ? C4 A DA 6 ? ? 120.32 110.60 9.72 0.50 N 142 2 N3 A DA 6 ? ? C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? 118.02 126.80 -8.78 0.70 N 143 2 N3 A DA 6 ? ? C4 A DA 6 ? ? 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