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J.Biol.Chem. 273 8145 8152 1998 JBCHA3 US 0021-9258 0071 ? 9525918 10.1074/jbc.273.14.8145 1 'Human Type I 17Beta-Hydroxysteroid Dehydrogenase: Site Directed Mutagenesis and X-Ray Crystallography Structure-Function Analysis' 'Thesis, Universite Joseph Fourier' ? ? ? 1997 ? 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P 4 HOH 13 544 544 HOH HOH D . # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal AMoRE phasing . ? 1 REFMAC refinement . ? 2 XDS 'data reduction' . ? 3 # _cell.entry_id 1FDV _cell.length_a 115.120 _cell.length_b 79.110 _cell.length_c 120.470 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 91.93 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1FDV _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 # _exptl.entry_id 1FDV _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 3.96 _exptl_crystal.density_percent_sol 69. _exptl_crystal.description ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method ? _exptl_crystal_grow.temp ? _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 6.3 _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? _exptl_crystal_grow.pdbx_details ;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 2 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM PHOSPHATE BUFFER PH 6.3, 1 MM NAD+, 100 MM NACL; THEN SOAKED IN 27 % GLYCEROL, 2.3 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM PHOSPHATE BUFFER PH 6.1, 80 MM NACL, 1 MM NAD+ ; # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 130 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type ESRF _diffrn_detector.pdbx_collection_date 1995-11 _diffrn_detector.details MIRRORS # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator MIRRORS _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol ? _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 0.9795 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'ESRF BEAMLINE BM02' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site ESRF _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline BM02 _diffrn_source.pdbx_wavelength 0.9795 _diffrn_source.pdbx_wavelength_list ? 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UNP P14061 HIS 221 'engineered mutation' 221 7 4 1FDV ARG D 301 ? UNP P14061 ALA 301 conflict 301 8 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 2 author_and_software_defined_assembly PISA dimeric 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 8070 ? 1 MORE -85 ? 1 'SSA (A^2)' 21680 ? 2 'ABSA (A^2)' 7910 ? 2 MORE -85 ? 2 'SSA (A^2)' 21760 ? # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,E,F,G,H,M,N 2 1 C,D,I,J,K,L,O,P # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_biol.id 1 2 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 GLY A 13 ? 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SER A 273 VAL A 283 1 ? 11 HELX_P HELX_P16 16 GLY B 13 ? ALA B 23 ? GLY B 13 ALA B 23 1 ? 11 HELX_P HELX_P17 17 LEU B 39 ? THR B 41 ? LEU B 39 THR B 41 5 ? 3 HELX_P HELX_P18 18 GLY B 43 ? ALA B 51 ? GLY B 43 ALA B 51 1 ? 9 HELX_P HELX_P19 19 SER B 69 ? ARG B 78 ? SER B 69 ARG B 78 1 ? 10 HELX_P HELX_P20 20 LEU B 99 ? ALA B 101 ? LEU B 99 ALA B 101 5 ? 3 HELX_P HELX_P21 21 GLU B 104 ? ASN B 114 ? GLU B 104 ASN B 114 1 ? 11 HELX_P HELX_P22 22 VAL B 116 ? ARG B 132 ? VAL B 116 ARG B 132 1 ? 17 HELX_P HELX_P23 23 VAL B 143 ? GLY B 145 ? VAL B 143 GLY B 145 5 ? 3 HELX_P HELX_P24 24 ASP B 153 ? PHE B 176 ? ASP B 153 PHE B 176 1 ? 24 HELX_P HELX_P25 25 VAL B 203 ? ARG B 206 ? VAL B 203 ARG B 206 1 ? 4 HELX_P HELX_P26 26 ILE B 209 ? ALA B 229 ? ILE B 209 ALA B 229 1 ? 21 HELX_P HELX_P27 27 PRO B 233 ? ARG B 245 ? PRO B 233 ARG B 245 1 ? 13 HELX_P HELX_P28 28 LEU B 260 ? ASP B 268 ? LEU B 260 ASP B 268 1 ? 9 HELX_P HELX_P29 29 SER B 273 ? PHE B 284 ? SER B 273 PHE B 284 1 ? 12 HELX_P HELX_P30 30 GLY C 13 ? SER C 24 ? GLY C 13 SER C 24 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 31 LEU C 39 ? THR C 41 ? LEU C 39 THR C 41 5 ? 3 HELX_P HELX_P32 32 GLY C 43 ? LEU C 52 ? GLY C 43 LEU C 52 1 ? 10 HELX_P HELX_P33 33 SER C 69 ? ARG C 78 ? SER C 69 ARG C 78 1 ? 10 HELX_P HELX_P34 34 LEU C 99 ? ALA C 101 ? LEU C 99 ALA C 101 5 ? 3 HELX_P HELX_P35 35 GLU C 104 ? VAL C 113 ? GLU C 104 VAL C 113 1 ? 10 HELX_P HELX_P36 36 VAL C 115 ? ARG C 132 ? VAL C 115 ARG C 132 1 ? 18 HELX_P HELX_P37 37 VAL C 143 ? GLY C 145 ? VAL C 143 GLY C 145 5 ? 3 HELX_P HELX_P38 38 ASP C 153 ? PHE C 176 ? ASP C 153 PHE C 176 1 ? 24 HELX_P HELX_P39 39 PRO C 200 ? ASP C 205 ? PRO C 200 ASP C 205 1 ? 6 HELX_P HELX_P40 40 ILE C 209 ? ARG C 227 ? ILE C 209 ARG C 227 1 ? 19 HELX_P HELX_P41 41 PRO C 233 ? ARG C 245 ? PRO C 233 ARG C 245 1 ? 13 HELX_P HELX_P42 42 LEU C 260 ? ASP C 268 ? LEU C 260 ASP C 268 1 ? 9 HELX_P HELX_P43 43 SER C 273 ? VAL C 283 ? SER C 273 VAL C 283 1 ? 11 HELX_P HELX_P44 44 GLY D 13 ? ALA D 23 ? GLY D 13 ALA D 23 1 ? 11 HELX_P HELX_P45 45 LEU D 39 ? THR D 41 ? LEU D 39 THR D 41 5 ? 3 HELX_P HELX_P46 46 GLY D 43 ? LEU D 52 ? GLY D 43 LEU D 52 1 ? 10 HELX_P HELX_P47 47 SER D 69 ? ARG D 78 ? SER D 69 ARG D 78 1 ? 10 HELX_P HELX_P48 48 LEU D 99 ? ALA D 101 ? LEU D 99 ALA D 101 5 ? 3 HELX_P HELX_P49 49 GLU D 104 ? ASN D 114 ? GLU D 104 ASN D 114 1 ? 11 HELX_P HELX_P50 50 VAL D 116 ? ARG D 132 ? VAL D 116 ARG D 132 1 ? 17 HELX_P HELX_P51 51 VAL D 143 ? GLY D 145 ? VAL D 143 GLY D 145 5 ? 3 HELX_P HELX_P52 52 ASP D 153 ? PHE D 176 ? ASP D 153 PHE D 176 1 ? 24 HELX_P HELX_P53 53 VAL D 203 ? ARG D 206 ? VAL D 203 ARG D 206 1 ? 4 HELX_P HELX_P54 54 ILE D 209 ? ALA D 229 ? ILE D 209 ALA D 229 1 ? 21 HELX_P HELX_P55 55 PRO D 233 ? ARG D 245 ? PRO D 233 ARG D 245 1 ? 13 HELX_P HELX_P56 56 LEU D 260 ? ASP D 268 ? LEU D 260 ASP D 268 1 ? 9 HELX_P HELX_P57 57 SER D 273 ? PHE D 284 ? SER D 273 PHE D 284 1 ? 12 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details A ? 7 ? B ? 7 ? C ? 7 ? 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O TYR D 253 N LEU D 182 ? N LEU D 182 D 2 3 O HIS D 179 ? O HIS D 179 N GLY D 135 ? N GLY D 135 D 3 4 O ARG D 136 ? O ARG D 136 N LEU D 87 ? N LEU D 87 D 4 5 O VAL D 86 ? O VAL D 86 N LEU D 6 ? N LEU D 6 D 5 6 O THR D 3 ? O THR D 3 N LYS D 31 ? N LYS D 31 D 6 7 O VAL D 32 ? O VAL D 32 N GLU D 60 ? N GLU D 60 # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details CAT Unknown ? ? ? ? 3 'CATALYTIC SITE.' 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