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J.Biol.Chem. 276 9985 9991 2001 JBCHA3 US 0021-9258 0071 ? 11098050 10.1074/jbc.M006548200 1 'Crystal structure of the A3 domain of human von Willebrand factor: implications for collagen binding' Structure 5 1147 1156 1997 STRUE6 UK 0969-2126 2005 ? ? 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GLN B 1006 LEU B 1018 1 ? 13 HELX_P HELX_P20 20 THR D 104 ? GLY D 109 ? THR B 1019 GLY B 1024 5 ? 6 HELX_P HELX_P21 21 VAL D 130 ? ASN D 140 ? VAL B 1045 ASN B 1055 1 ? 11 HELX_P HELX_P22 22 ASP D 154 ? ALA D 162 ? ASP B 1069 ALA B 1077 1 ? 9 HELX_P HELX_P23 23 GLY D 163 ? VAL D 170 ? GLY B 1078 VAL B 1085 5 ? 8 HELX_P HELX_P24 24 GLU D 177 ? LEU D 185 ? GLU B 1092 LEU B 1100 1 ? 9 HELX_P HELX_P25 25 PHE D 189 ? CYS D 194 ? PHE B 1104 CYS B 1109 1 ? 6 HELX_P HELX_P26 26 SER E 61 ? ILE E 64 ? SER I 61 ILE I 64 5 ? 4 HELX_P HELX_P27 27 HIS E 86 ? THR E 90 ? HIS I 86 THR I 90 5 ? 5 HELX_P HELX_P28 28 SER E 152 ? SER E 154 ? SER I 158 SER I 160 5 ? 3 HELX_P HELX_P29 29 PRO E 196 ? SER E 199 ? PRO I 202 SER I 205 5 ? 4 HELX_P HELX_P30 30 GLU F 79 ? ILE F 83 ? GLU M 79 ILE M 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P31 31 SER F 121 ? SER F 127 ? SER M 121 SER M 127 1 ? 7 HELX_P HELX_P32 32 LYS F 183 ? ARG F 188 ? LYS M 183 ARG M 188 1 ? 6 HELX_P HELX_P33 33 PRO G 25 ? ALA G 43 ? PRO C 940 ALA C 958 1 ? 19 HELX_P HELX_P34 34 GLU G 72 ? VAL G 82 ? GLU C 987 VAL C 997 1 ? 11 HELX_P HELX_P35 35 GLN G 91 ? THR G 104 ? GLN C 1006 THR C 1019 1 ? 14 HELX_P HELX_P36 36 SER G 105 ? GLY G 109 ? SER C 1020 GLY C 1024 5 ? 5 HELX_P HELX_P37 37 VAL G 130 ? ASN G 140 ? VAL C 1045 ASN C 1055 1 ? 11 HELX_P HELX_P38 38 ASP G 154 ? GLY G 163 ? ASP C 1069 GLY C 1078 1 ? 10 HELX_P HELX_P39 39 PRO G 164 ? GLY G 166 ? PRO C 1079 GLY C 1081 5 ? 3 HELX_P HELX_P40 40 ARG G 175 ? LEU G 179 ? ARG C 1090 LEU C 1094 5 ? 5 HELX_P HELX_P41 41 PRO G 180 ? LEU G 185 ? PRO C 1095 LEU C 1100 1 ? 6 HELX_P HELX_P42 42 PHE G 189 ? CYS G 194 ? PHE C 1104 CYS C 1109 1 ? 6 HELX_P HELX_P43 43 SER H 152 ? SER H 154 ? SER J 158 SER J 160 5 ? 3 HELX_P HELX_P44 44 SER H 182 ? TRP H 184 ? SER J 188 TRP J 190 5 ? 3 HELX_P HELX_P45 45 PRO H 196 ? SER H 199 ? PRO J 202 SER J 205 5 ? 4 HELX_P HELX_P46 46 GLU I 79 ? ILE I 83 ? GLU N 79 ILE N 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P47 47 SER I 121 ? THR I 126 ? SER N 121 THR N 126 1 ? 6 HELX_P HELX_P48 48 LYS I 183 ? ARG I 188 ? LYS N 183 ARG N 188 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 8 SG ? ? ? 1_555 A CYS 194 SG ? ? A CYS 923 A CYS 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 22 SG ? ? ? 1_555 B CYS 95 SG ? ? H CYS 22 H CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 136 SG ? ? ? 1_555 B CYS 191 SG ? ? H CYS 142 H CYS 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf4 disulf ? ? C CYS 23 SG ? ? ? 1_555 C CYS 88 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 134 SG ? ? ? 1_555 C CYS 194 SG ? ? L CYS 134 L CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf6 disulf ? ? D CYS 8 SG ? ? ? 1_555 D CYS 194 SG ? ? B CYS 923 B CYS 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf7 disulf ? ? E CYS 22 SG ? ? ? 1_555 E CYS 95 SG ? ? I CYS 22 I CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? ? disulf8 disulf ? ? E CYS 136 SG ? ? ? 1_555 E CYS 191 SG ? ? I CYS 142 I CYS 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf9 disulf ? ? F CYS 23 SG ? ? ? 1_555 F CYS 88 SG ? ? M CYS 23 M CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? ? disulf10 disulf ? ? F CYS 134 SG ? ? ? 1_555 F CYS 194 SG ? ? M CYS 134 M CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? ? disulf11 disulf ? ? G CYS 8 SG ? ? ? 1_555 G CYS 194 SG ? ? C CYS 923 C CYS 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf12 disulf ? ? H CYS 22 SG ? ? ? 1_555 H CYS 95 SG ? ? J CYS 22 J CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf13 disulf ? ? H CYS 136 SG ? ? ? 1_555 H CYS 191 SG ? ? J CYS 142 J CYS 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf14 disulf ? ? I CYS 23 SG ? ? ? 1_555 I CYS 88 SG ? ? N CYS 23 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? ? disulf15 disulf ? ? I CYS 134 SG ? ? ? 1_555 I CYS 194 SG ? ? N CYS 134 N CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? covale1 covale both ? A GLU 31 C ? ? ? 1_555 A MSE 32 N ? ? A GLU 946 A MSE 947 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? ? covale2 covale both ? A MSE 32 C ? ? ? 1_555 A LYS 33 N ? ? A MSE 947 A LYS 948 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale3 covale both ? A VAL 82 C ? ? ? 1_555 A MSE 83 N ? ? A VAL 997 A MSE 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale4 covale both ? A MSE 83 C ? ? ? 1_555 A GLN 84 N ? ? A MSE 998 A GLN 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale5 covale both ? A GLU 106 C ? ? ? 1_555 A MSE 107 N ? ? A GLU 1021 A MSE 1022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale6 covale both ? A MSE 107 C ? ? ? 1_555 A HIS 108 N ? ? A MSE 1022 A HIS 1023 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? ? covale7 covale both ? A THR 181 C ? ? ? 1_555 A MSE 182 N ? ? A THR 1096 A MSE 1097 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.320 ? ? covale8 covale both ? A MSE 182 C ? ? ? 1_555 A VAL 183 N ? ? A MSE 1097 A VAL 1098 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale9 covale one ? B ASN 56 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? H ASN 56 D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale10 covale both ? D GLU 31 C ? ? ? 1_555 D MSE 32 N ? ? B GLU 946 B MSE 947 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale11 covale both ? D MSE 32 C ? ? ? 1_555 D LYS 33 N ? ? B MSE 947 B LYS 948 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale12 covale both ? D VAL 82 C ? ? ? 1_555 D MSE 83 N ? ? B VAL 997 B MSE 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale13 covale both ? D MSE 83 C ? ? ? 1_555 D GLN 84 N ? ? B MSE 998 B GLN 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale14 covale both ? D GLU 106 C ? ? ? 1_555 D MSE 107 N ? ? B GLU 1021 B MSE 1022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale15 covale both ? D MSE 107 C ? ? ? 1_555 D HIS 108 N ? ? B MSE 1022 B HIS 1023 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale16 covale both ? D THR 181 C ? ? ? 1_555 D MSE 182 N ? ? B THR 1096 B MSE 1097 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? ? covale17 covale both ? D MSE 182 C ? ? ? 1_555 D VAL 183 N ? ? B MSE 1097 B VAL 1098 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale18 covale one ? E ASN 56 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? I ASN 56 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? N-Glycosylation covale19 covale both ? G GLU 31 C ? ? ? 1_555 G MSE 32 N ? ? C GLU 946 C MSE 947 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale20 covale both ? G MSE 32 C ? ? ? 1_555 G LYS 33 N ? ? C MSE 947 C LYS 948 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale21 covale both ? G VAL 82 C ? ? ? 1_555 G MSE 83 N ? ? C VAL 997 C MSE 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? ? covale22 covale both ? G MSE 83 C ? ? ? 1_555 G GLN 84 N ? ? C MSE 998 C GLN 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale23 covale both ? G GLU 106 C ? ? ? 1_555 G MSE 107 N ? ? C GLU 1021 C MSE 1022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale24 covale both ? G MSE 107 C ? ? ? 1_555 G HIS 108 N ? ? C MSE 1022 C HIS 1023 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? ? covale25 covale both ? G THR 181 C ? ? ? 1_555 G MSE 182 N ? ? C THR 1096 C MSE 1097 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale26 covale both ? G MSE 182 C ? ? ? 1_555 G VAL 183 N ? ? C MSE 1097 C VAL 1098 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.330 ? ? covale27 covale one ? H ASN 56 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? J ASN 56 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? N-Glycosylation covale28 covale both ? J NAG . O6 ? ? ? 1_555 J FUC . C1 ? ? D NAG 1 D FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? ? covale29 covale both ? K NAG . O6 ? ? ? 1_555 K FUC . C1 ? ? E NAG 1 E FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? ? covale30 covale both ? L NAG . O6 ? ? ? 1_555 L FUC . C1 ? ? F NAG 1 F FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PHE 142 B . ? PHE 148 H PRO 143 B ? 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O ? 5 ? P ? 6 ? Q ? 4 ? R ? 4 ? S ? 3 ? T ? 4 ? U ? 5 ? V ? 6 ? W ? 4 ? X ? 4 ? Y ? 6 ? Z ? 4 ? AA ? 5 ? AB ? 6 ? AC ? 4 ? AD ? 4 ? AE ? 3 ? AF ? 4 ? AG ? 5 ? AH ? 6 ? AI ? 4 ? 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P 7 HOH 64 739 739 HOH WAT A . P 7 HOH 65 740 740 HOH WAT A . P 7 HOH 66 744 744 HOH WAT A . P 7 HOH 67 750 750 HOH WAT A . P 7 HOH 68 752 752 HOH WAT A . P 7 HOH 69 755 755 HOH WAT A . P 7 HOH 70 760 760 HOH WAT A . P 7 HOH 71 761 761 HOH WAT A . P 7 HOH 72 783 783 HOH WAT A . P 7 HOH 73 787 787 HOH WAT A . P 7 HOH 74 788 788 HOH WAT A . P 7 HOH 75 789 789 HOH WAT A . P 7 HOH 76 817 817 HOH WAT A . P 7 HOH 77 834 834 HOH WAT A . P 7 HOH 78 850 850 HOH WAT A . P 7 HOH 79 853 853 HOH WAT A . P 7 HOH 80 874 874 HOH WAT A . P 7 HOH 81 876 876 HOH WAT A . P 7 HOH 82 877 877 HOH WAT A . P 7 HOH 83 883 883 HOH WAT A . P 7 HOH 84 893 893 HOH WAT A . Q 7 HOH 1 554 11 HOH WAT H . Q 7 HOH 2 555 12 HOH WAT H . Q 7 HOH 3 556 20 HOH WAT H . Q 7 HOH 4 557 28 HOH WAT H . Q 7 HOH 5 558 41 HOH WAT H . Q 7 HOH 6 559 48 HOH WAT H . Q 7 HOH 7 560 55 HOH WAT H . Q 7 HOH 8 561 100 HOH WAT H . Q 7 HOH 9 562 112 HOH WAT H . Q 7 HOH 10 563 132 HOH WAT H . Q 7 HOH 11 564 141 HOH WAT H . 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MET SELENOMETHIONINE # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 2 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 3 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 4 software_defined_assembly PISA octadecameric 18 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,J,M,N,P,Q,R 2 1 D,E,F,K,O,S,T,U 3 1 G,H,I,L,V,W,X 4 1,2 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 6450 ? 1 MORE -19 ? 1 'SSA (A^2)' 25310 ? 2 'ABSA (A^2)' 6150 ? 2 MORE -22 ? 2 'SSA (A^2)' 25650 ? 3 'ABSA (A^2)' 5960 ? 3 MORE -25 ? 3 'SSA (A^2)' 25540 ? 4 'ABSA (A^2)' 53030 ? 4 MORE -128 ? 4 'SSA (A^2)' 137100 ? # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 2 'crystal symmetry operation' 2_656 -x+1,y,-z+1 -1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 63.6095286020 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 -1.0000000000 118.2586531231 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2001-04-04 2 'Structure model' 1 1 2008-04-27 3 'Structure model' 1 2 2011-07-13 4 'Structure model' 2 0 2020-07-29 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 4 'Structure model' repository Remediation 'Carbohydrate remediation' ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Non-polymer description' 3 3 'Structure model' 'Version format compliance' 4 4 'Structure model' Advisory 5 4 'Structure model' 'Atomic model' 6 4 'Structure model' 'Data collection' 7 4 'Structure model' 'Database references' 8 4 'Structure model' 'Derived calculations' 9 4 'Structure model' 'Structure summary' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 4 'Structure model' atom_site 2 4 'Structure model' chem_comp 3 4 'Structure model' diffrn_source 4 4 'Structure model' entity 5 4 'Structure model' pdbx_branch_scheme 6 4 'Structure model' pdbx_chem_comp_identifier 7 4 'Structure model' pdbx_entity_branch 8 4 'Structure model' pdbx_entity_branch_descriptor 9 4 'Structure model' pdbx_entity_branch_link 10 4 'Structure model' pdbx_entity_branch_list 11 4 'Structure model' pdbx_entity_nonpoly 12 4 'Structure model' pdbx_nonpoly_scheme 13 4 'Structure model' pdbx_struct_assembly_gen 14 4 'Structure model' pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms 15 4 'Structure model' struct_asym 16 4 'Structure model' struct_conn 17 4 'Structure model' struct_ref_seq_dif 18 4 'Structure model' struct_site 19 4 'Structure model' struct_site_gen # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 4 'Structure model' '_atom_site.B_iso_or_equiv' 2 4 'Structure model' '_atom_site.Cartn_x' 3 4 'Structure model' '_atom_site.Cartn_y' 4 4 'Structure model' '_atom_site.Cartn_z' 5 4 'Structure model' '_atom_site.auth_asym_id' 6 4 'Structure model' '_atom_site.auth_atom_id' 7 4 'Structure model' '_atom_site.auth_comp_id' 8 4 'Structure model' '_atom_site.auth_seq_id' 9 4 'Structure model' '_atom_site.label_asym_id' 10 4 'Structure model' '_atom_site.label_atom_id' 11 4 'Structure model' '_atom_site.label_comp_id' 12 4 'Structure model' '_atom_site.label_entity_id' 13 4 'Structure model' '_atom_site.type_symbol' 14 4 'Structure model' '_chem_comp.name' 15 4 'Structure model' '_chem_comp.type' 16 4 'Structure model' '_diffrn_source.pdbx_synchrotron_site' 17 4 'Structure model' '_entity.formula_weight' 18 4 'Structure model' '_entity.pdbx_description' 19 4 'Structure model' '_entity.pdbx_number_of_molecules' 20 4 'Structure model' '_entity.type' 21 4 'Structure model' '_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list' 22 4 'Structure model' '_pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id' 23 4 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_dist_value' 24 4 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag' 25 4 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_role' 26 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id' 27 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id' 28 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id' 29 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_asym_id' 30 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_atom_id' 31 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_comp_id' 32 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr1_label_seq_id' 33 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id' 34 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id' 35 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id' 36 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_asym_id' 37 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_atom_id' 38 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_comp_id' 39 4 'Structure model' '_struct_conn.ptnr2_label_seq_id' 40 4 'Structure model' '_struct_ref_seq_dif.details' # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal DENZO 'data reduction' . ? 1 SCALEPACK 'data scaling' . ? 2 AMoRE phasing . ? 3 CNS refinement . ? 4 CNS phasing . ? 5 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 CA M CYS 134 ? ? CB M CYS 134 ? ? SG M CYS 134 ? ? 120.94 114.20 6.74 1.10 N 2 1 CA M CYS 194 ? ? CB M CYS 194 ? ? SG M CYS 194 ? ? 120.82 114.20 6.62 1.10 N # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 CYS A 923 ? ? -58.72 -8.79 2 1 LEU A 964 ? ? -119.14 -130.72 3 1 ASN A 983 ? ? 73.78 -3.83 4 1 SER A 1005 ? ? -105.95 78.50 5 1 ASP A 1066 ? ? -142.08 28.38 6 1 LEU A 1100 ? ? -48.81 -94.73 7 1 PRO H 14 ? ? -29.26 -71.91 8 1 GLN H 16 ? ? -171.21 -173.08 9 1 ALA H 91 ? ? 174.90 172.68 10 1 TYR H 99 ? ? -140.23 -61.07 11 1 MET H 102 ? ? -113.75 76.09 12 1 PHE H 148 ? ? -173.13 136.01 13 1 ALA H 203 ? ? -45.60 -19.01 14 1 SER H 205 ? ? 36.59 47.22 15 1 LYS H 207 ? ? -162.26 111.92 16 1 THR L 51 ? ? 69.55 -50.74 17 1 LEU B 964 ? ? -111.07 -128.81 18 1 ASN B 983 ? ? 71.61 -2.96 19 1 PRO B 986 ? ? -69.80 51.58 20 1 SER B 1005 ? ? -103.67 72.69 21 1 ASP B 1066 ? ? -142.43 25.90 22 1 LEU B 1100 ? ? -57.80 97.49 23 1 SER I 15 ? ? 69.72 -15.00 24 1 PRO I 41 ? ? -25.88 -73.26 25 1 ALA I 91 ? ? 178.36 174.38 26 1 TYR I 99 ? ? -138.45 -60.82 27 1 MET I 102 ? ? -104.22 74.13 28 1 PHE I 148 ? ? -172.79 137.62 29 1 SER I 162 ? ? -133.51 -37.07 30 1 ALA I 203 ? ? -49.67 -19.66 31 1 THR M 51 ? ? 70.11 -45.82 32 1 ALA M 84 ? ? -176.57 -173.00 33 1 SER C 938 ? ? -55.36 -70.97 34 1 LEU C 964 ? ? -113.20 -127.03 35 1 ASN C 983 ? ? 73.64 -10.84 36 1 ASP C 1066 ? ? -143.50 23.24 37 1 PRO C 1079 ? ? -37.98 -22.38 38 1 LEU C 1100 ? ? -75.50 -152.15 39 1 ASN C 1102 ? ? -66.21 43.88 40 1 SER J 15 ? ? 57.69 -15.53 41 1 GLN J 16 ? ? -74.99 -165.53 42 1 THR J 31 ? ? -100.75 -72.11 43 1 LEU J 48 ? ? -90.04 -61.24 44 1 ALA J 62 ? ? -84.46 41.67 45 1 LEU J 63 ? ? -157.06 -22.05 46 1 HIS J 86 ? ? -144.65 34.39 47 1 THR J 87 ? ? 60.99 -30.10 48 1 ALA J 91 ? ? 170.06 172.96 49 1 TYR J 99 ? ? -141.40 -58.22 50 1 MET J 102 ? ? -101.41 70.42 51 1 ALA J 116 ? ? -45.73 150.19 52 1 SER J 158 ? ? 56.21 14.22 53 1 PRO J 202 ? ? -38.89 -28.88 54 1 THR N 51 ? ? 67.92 -44.87 55 1 ASN N 77 ? ? 46.66 79.23 56 1 ALA N 84 ? ? -172.39 -169.31 57 1 SER N 201 ? ? -173.50 133.14 # loop_ _pdbx_validate_polymer_linkage.id _pdbx_validate_polymer_linkage.PDB_model_num _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_polymer_linkage.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_polymer_linkage.label_alt_id_1 _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_polymer_linkage.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_polymer_linkage.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_polymer_linkage.label_alt_id_2 _pdbx_validate_polymer_linkage.dist 1 1 C H VAL 129 ? ? N H SER 136 ? ? 14.07 2 1 C I VAL 129 ? ? N I SER 136 ? ? 13.60 3 1 C J VAL 129 ? ? N J SER 136 ? ? 14.08 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id 1 1 N 1 H NAG 553 ? O1 ? M NAG 1 O1 2 1 N 1 I NAG 553 ? O1 ? O NAG 1 O1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A GLY 916 ? A GLY 1 2 1 Y 1 A SER 917 ? A SER 2 3 1 Y 1 A HIS 918 ? A HIS 3 4 1 Y 1 A MSE 919 ? A MSE 4 5 1 Y 1 A ALA 920 ? A ALA 5 6 1 Y 1 A GLY 1111 ? A GLY 196 7 1 Y 1 B GLY 916 ? D GLY 1 8 1 Y 1 B SER 917 ? D SER 2 9 1 Y 1 B HIS 918 ? D HIS 3 10 1 Y 1 B MSE 919 ? D MSE 4 11 1 Y 1 B ALA 920 ? D ALA 5 12 1 Y 1 B GLY 1111 ? D GLY 196 13 1 Y 1 C GLY 916 ? G GLY 1 14 1 Y 1 C SER 917 ? G SER 2 15 1 Y 1 C HIS 918 ? G HIS 3 16 1 Y 1 C MSE 919 ? G MSE 4 17 1 Y 1 C GLY 1111 ? G GLY 196 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero J 4 NAG 1 D NAG 1 H NAG 551 n J 4 FUC 2 D FUC 2 H FUC 552 n K 4 NAG 1 E NAG 1 I NAG 551 n K 4 FUC 2 E FUC 2 I FUC 552 n L 4 NAG 1 F NAG 1 J NAG 551 n L 4 FUC 2 F FUC 2 J FUC 552 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier FUC 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 LFucpa FUC 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-L-fucopyranose FUC 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-L-Fucp FUC 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Fuc NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # _pdbx_entity_branch.entity_id 4 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 4 LFucpa1-6DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 4 'WURCS=2.0/2,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1221m-1a_1-5]/1-2/a6-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 4 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(6+1)][a-L-Fucp]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.entity_id 4 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 FUC _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O6 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO6 _pdbx_entity_branch_link.value_order sing _pdbx_entity_branch_link.details ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 4 NAG 1 n 4 FUC 2 n # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 5 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose NAG 6 'CACODYLATE ION' CAC 7 water HOH #