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'10.1002/(SICI)1521-3773(19980918)37:17<2308::AID-ANIE2308>3.' 4 'Structure at 2.8 A Resolution of F1-ATPase from Bovine Heart Mitochondria' Nature 370 621 ? 1994 NATUAS UK 0028-0836 0006 ? 8065448 10.1038/370621A0 5 'Crystallization of F1-ATPase from Bovine Heart Mitochondria' J.Mol.Biol. 229 787 ? 1993 JMOBAK UK 0022-2836 0070 ? 8433373 10.1006/JMBI.1993.1081 # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Menz, R.I.' 1 ? primary 'Walker, J.E.' 2 ? primary 'Leslie, A.G.W.' 3 ? 1 'Gibbons, C.' 4 ? 1 'Montgomery, M.G.' 5 ? 1 'Leslie, A.G.W.' 6 ? 1 'Walker, J.E.' 7 ? 2 'Stock, D.' 8 ? 2 'Leslie, A.G.W.' 9 ? 2 'Walker, J.E.' 10 ? 3 'Walker, J.E.' 11 ? 4 'Abrahams, J.P.' 12 ? 4 'Leslie, A.G.W.' 13 ? 4 'Lutter, R.' 14 ? 4 'Walker, J.E.' 15 ? 5 'Lutter, R.' 16 ? 5 'Abrahams, J.P.' 17 ? 5 'Van Raaij, M.J.' 18 ? 5 'Todd, R.J.' 19 ? 5 'Lundqvist, T.' 20 ? 5 'Buchanan, S.K.' 21 ? 5 'Leslie, A.G.' 22 ? 5 'Walker, 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"ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 427.201 6 ? ? ? ? 7 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 6 ? ? ? ? 8 non-polymer syn GLYCEROL 92.094 4 ? ? ? ? 9 non-polymer syn 'TETRAFLUOROALUMINATE ION' 102.975 2 ? ? ? ? 10 non-polymer syn 'SULFATE ION' 96.063 1 ? ? ? ? 11 water nat water 18.015 1693 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'ATP SYNTHASE ALPHA CHAIN HEART ISOFORM' 2 'ATP SYNTHASE BETA CHAIN' 3 'ATP SYNTHASE GAMMA CHAIN' 4 'ATP SYNTHASE DELTA CHAIN' 5 'ATP SYNTHASE EPSILON CHAIN' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;QKTGTAEVSSILEERILGADTSVDLEETGRVLSIGDGIARVHGLRNVQAEEMVEFSSGLKGMSLNLEPDNVGVVVFGNDK LIKEGDIVKRTGAIVDVPVGEELLGRVVDALGNAIDGKGPIGSKARRRVGLKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIG 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;ATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGVGSLALYEKADIKTPEDKKKHLIIGVSSDRGLCGA IHSSVAKQMKSEAANLAAAGKEVKIIGVGDKIRSILHRTHSDQFLVTFKEVGRRPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSI IFNRFRSVISYKTEEKPIFSLDTISSAESMSIYDDIDADVLRNYQEYSLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNAS EMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAAL ; ;ATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGVGSLALYEKADIKTPEDKKKHLIIGVSSDRGLCGA IHSSVAKQMKSEAANLAAAGKEVKIIGVGDKIRSILHRTHSDQFLVTFKEVGRRPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSI IFNRFRSVISYKTEEKPIFSLDTISSAESMSIYDDIDADVLRNYQEYSLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNAS EMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAAL ; G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;AEAAAAQAPAAGPGQMSFTFASPTQVFFNSANVRQVDVPTQTGAFGILAAHVPTLQVLRPGLVVVHAEDGTTSKYFVSSG SVTVNADSSVQLLAEEAVTLDMLDLGAAKANLEKAQSELLGAADEATRAEIQIRIEANEALVKALE ; ;AEAAAAQAPAAGPGQMSFTFASPTQVFFNSANVRQVDVPTQTGAFGILAAHVPTLQVLRPGLVVVHAEDGTTSKYFVSSG SVTVNADSSVQLLAEEAVTLDMLDLGAAKANLEKAQSELLGAADEATRAEIQIRIEANEALVKALE ; H ? 5 'polypeptide(L)' no no VAYWRQAGLSYIRYSQICAKAVRDALKTEFKANAMKTSGSTIKIVKVKKE VAYWRQAGLSYIRYSQICAKAVRDALKTEFKANAMKTSGSTIKIVKVKKE I ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 GLN n 1 2 LYS n 1 3 THR n 1 4 GLY n 1 5 THR n 1 6 ALA n 1 7 GLU n 1 8 VAL n 1 9 SER n 1 10 SER n 1 11 ILE n 1 12 LEU n 1 13 GLU n 1 14 GLU n 1 15 ARG n 1 16 ILE n 1 17 LEU n 1 18 GLY n 1 19 ALA n 1 20 ASP n 1 21 THR n 1 22 SER n 1 23 VAL n 1 24 ASP n 1 25 LEU n 1 26 GLU n 1 27 GLU n 1 28 THR n 1 29 GLY n 1 30 ARG n 1 31 VAL n 1 32 LEU n 1 33 SER n 1 34 ILE n 1 35 GLY n 1 36 ASP n 1 37 GLY n 1 38 ILE n 1 39 ALA n 1 40 ARG n 1 41 VAL n 1 42 HIS n 1 43 GLY n 1 44 LEU n 1 45 ARG n 1 46 ASN n 1 47 VAL n 1 48 GLN n 1 49 ALA n 1 50 GLU n 1 51 GLU n 1 52 MET n 1 53 VAL n 1 54 GLU n 1 55 PHE n 1 56 SER n 1 57 SER n 1 58 GLY n 1 59 LEU n 1 60 LYS n 1 61 GLY n 1 62 MET n 1 63 SER n 1 64 LEU n 1 65 ASN n 1 66 LEU n 1 67 GLU n 1 68 PRO n 1 69 ASP n 1 70 ASN n 1 71 VAL n 1 72 GLY n 1 73 VAL n 1 74 VAL n 1 75 VAL n 1 76 PHE n 1 77 GLY n 1 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189 SER n 3 190 MET n 3 191 SER n 3 192 ILE n 3 193 TYR n 3 194 ASP n 3 195 ASP n 3 196 ILE n 3 197 ASP n 3 198 ALA n 3 199 ASP n 3 200 VAL n 3 201 LEU n 3 202 ARG n 3 203 ASN n 3 204 TYR n 3 205 GLN n 3 206 GLU n 3 207 TYR n 3 208 SER n 3 209 LEU n 3 210 ALA n 3 211 ASN n 3 212 ILE n 3 213 ILE n 3 214 TYR n 3 215 TYR n 3 216 SER n 3 217 LEU n 3 218 LYS n 3 219 GLU n 3 220 SER n 3 221 THR n 3 222 THR n 3 223 SER n 3 224 GLU n 3 225 GLN n 3 226 SER n 3 227 ALA n 3 228 ARG n 3 229 MET n 3 230 THR n 3 231 ALA n 3 232 MET n 3 233 ASP n 3 234 ASN n 3 235 ALA n 3 236 SER n 3 237 LYS n 3 238 ASN n 3 239 ALA n 3 240 SER n 3 241 GLU n 3 242 MET n 3 243 ILE n 3 244 ASP n 3 245 LYS n 3 246 LEU n 3 247 THR n 3 248 LEU n 3 249 THR n 3 250 PHE n 3 251 ASN n 3 252 ARG n 3 253 THR n 3 254 ARG n 3 255 GLN n 3 256 ALA n 3 257 VAL n 3 258 ILE n 3 259 THR n 3 260 LYS n 3 261 GLU n 3 262 LEU n 3 263 ILE n 3 264 GLU n 3 265 ILE n 3 266 ILE n 3 267 SER n 3 268 GLY n 3 269 ALA n 3 270 ALA n 3 271 ALA n 3 272 LEU n 4 1 ALA n 4 2 GLU n 4 3 ALA n 4 4 ALA n 4 5 ALA n 4 6 ALA n 4 7 GLN n 4 8 ALA n 4 9 PRO n 4 10 ALA n 4 11 ALA n 4 12 GLY n 4 13 PRO n 4 14 GLY n 4 15 GLN n 4 16 MET n 4 17 SER n 4 18 PHE n 4 19 THR n 4 20 PHE n 4 21 ALA n 4 22 SER n 4 23 PRO n 4 24 THR n 4 25 GLN n 4 26 VAL n 4 27 PHE n 4 28 PHE n 4 29 ASN n 4 30 SER n 4 31 ALA n 4 32 ASN n 4 33 VAL n 4 34 ARG n 4 35 GLN n 4 36 VAL n 4 37 ASP n 4 38 VAL n 4 39 PRO n 4 40 THR n 4 41 GLN n 4 42 THR n 4 43 GLY n 4 44 ALA n 4 45 PHE n 4 46 GLY n 4 47 ILE n 4 48 LEU n 4 49 ALA n 4 50 ALA n 4 51 HIS n 4 52 VAL n 4 53 PRO n 4 54 THR n 4 55 LEU n 4 56 GLN n 4 57 VAL n 4 58 LEU n 4 59 ARG n 4 60 PRO n 4 61 GLY n 4 62 LEU n 4 63 VAL n 4 64 VAL n 4 65 VAL n 4 66 HIS n 4 67 ALA n 4 68 GLU n 4 69 ASP n 4 70 GLY n 4 71 THR n 4 72 THR n 4 73 SER n 4 74 LYS n 4 75 TYR n 4 76 PHE n 4 77 VAL n 4 78 SER n 4 79 SER n 4 80 GLY n 4 81 SER n 4 82 VAL n 4 83 THR n 4 84 VAL n 4 85 ASN n 4 86 ALA n 4 87 ASP n 4 88 SER n 4 89 SER n 4 90 VAL n 4 91 GLN n 4 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ASN n 5 34 ALA n 5 35 MET n 5 36 LYS n 5 37 THR n 5 38 SER n 5 39 GLY n 5 40 SER n 5 41 THR n 5 42 ILE n 5 43 LYS n 5 44 ILE n 5 45 VAL n 5 46 LYS n 5 47 VAL n 5 48 LYS n 5 49 LYS n 5 50 GLU n # loop_ _entity_src_nat.entity_id _entity_src_nat.pdbx_src_id _entity_src_nat.pdbx_alt_source_flag _entity_src_nat.pdbx_beg_seq_num _entity_src_nat.pdbx_end_seq_num _entity_src_nat.common_name _entity_src_nat.pdbx_organism_scientific _entity_src_nat.pdbx_ncbi_taxonomy_id _entity_src_nat.genus _entity_src_nat.species _entity_src_nat.strain _entity_src_nat.tissue _entity_src_nat.tissue_fraction _entity_src_nat.pdbx_secretion _entity_src_nat.pdbx_fragment _entity_src_nat.pdbx_variant _entity_src_nat.pdbx_cell_line _entity_src_nat.pdbx_atcc _entity_src_nat.pdbx_cellular_location _entity_src_nat.pdbx_organ _entity_src_nat.pdbx_organelle _entity_src_nat.pdbx_cell _entity_src_nat.pdbx_plasmid_name _entity_src_nat.pdbx_plasmid_details _entity_src_nat.details 1 1 sample ? ? BOVINE 'BOS TAURUS' 9913 ? ? ? MUSCLE ? ? ? ? ? ? ? HEART MITOCHONDRION ? ? ? ? 2 1 sample ? ? BOVINE 'BOS TAURUS' 9913 ? ? ? MUSCLE ? ? ? ? ? ? ? HEART MITOCHONDRION ? ? ? ? 3 1 sample ? ? BOVINE 'BOS TAURUS' 9913 ? ? ? MUSCLE ? ? ? ? ? ? ? HEART MITOCHONDRION ? ? ? ? 4 1 sample ? ? BOVINE 'BOS TAURUS' 9913 ? ? ? MUSCLE ? ? ? ? ? ? ? HEART MITOCHONDRION ? ? ? ? 5 1 sample ? ? BOVINE 'BOS TAURUS' 9913 ? ? ? MUSCLE ? ? ? ? ? ? ? HEART MITOCHONDRION ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 UNP ATP0_BOVIN 1 ? ? P19483 ? 2 UNP ATPB_BOVIN 2 ? ? P00829 ? 3 UNP ATPG_BOVIN 3 ? ? P05631 ? 4 UNP ATPD_BOVIN 4 ? ? P05630 ? 5 UNP ATPE_BOVIN 5 ? ? P05632 ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1H8E A 1 ? 510 ? P19483 44 ? 553 ? 1 510 2 1 1H8E B 1 ? 510 ? P19483 44 ? 553 ? 1 510 3 1 1H8E C 1 ? 510 ? P19483 44 ? 553 ? 1 510 4 2 1H8E D 1 ? 482 ? P00829 47 ? 528 ? -4 478 5 2 1H8E E 1 ? 482 ? P00829 47 ? 528 ? -4 478 6 2 1H8E F 1 ? 482 ? P00829 47 ? 528 ? -4 478 7 3 1H8E G 1 ? 272 ? P05631 26 ? 297 ? 1 272 8 4 1H8E H 1 ? 146 ? P05630 23 ? 168 ? 1 146 9 5 1H8E I 1 ? 50 ? P05632 1 ? 50 ? 1 50 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 1H8E GLY A 481 ? UNP P19483 SER 524 'engineered mutation' 481 1 2 1H8E GLY B 481 ? UNP P19483 SER 524 'engineered mutation' 481 2 3 1H8E GLY C 481 ? UNP P19483 SER 524 'engineered mutation' 481 3 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ADP non-polymer n "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N5 O10 P2' 427.201 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ALF non-polymer . 'TETRAFLUOROALUMINATE ION' ? 'Al F4 -1' 102.975 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 GOL non-polymer . GLYCEROL 'GLYCERIN; PROPANE-1,2,3-TRIOL' 'C3 H8 O3' 92.094 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 SO4 non-polymer . 'SULFATE ION' ? 'O4 S -2' 96.063 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 1H8E _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 2.64 _exptl_crystal.density_percent_sol 54. _exptl_crystal.description ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method ? _exptl_crystal_grow.temp ? _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 8.00 _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? _exptl_crystal_grow.pdbx_details 'CRYSTALS WERE GROWN IN THE PRESENCE OF AZIDE, A KNOWN INHIBITOR, BUT THIS HAS NOT BEEN LOCATED IN THE STRUCTURE., pH 8.00' # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100.0 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'ADSC CCD' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 1998-08-15 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 0.87 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'SRS BEAMLINE PX9.6' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site SRS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline PX9.6 _diffrn_source.pdbx_wavelength 0.87 _diffrn_source.pdbx_wavelength_list ? # _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.entry_id 1H8E _reflns.observed_criterion_sigma_I 0.000 _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.d_resolution_low 13.500 _reflns.d_resolution_high 2.000 _reflns.number_obs 209953 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 79.6 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs 0.06600 _reflns.pdbx_Rsym_value ? _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 9.1000 _reflns.B_iso_Wilson_estimate 26.7 _reflns.pdbx_redundancy 2.100 # _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 1 _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 _reflns_shell.d_res_high 2.00 _reflns_shell.d_res_low 2.14 _reflns_shell.percent_possible_all 40.6 _reflns_shell.Rmerge_I_obs 0.48000 _reflns_shell.pdbx_Rsym_value ? _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 1.700 _reflns_shell.pdbx_redundancy 1.50 # _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.entry_id 1H8E _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs 200363 _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 0.0 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 13.5 _refine.ls_d_res_high 2.00 _refine.ls_percent_reflns_obs 79.6 _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.201 _refine.ls_R_factor_R_free 0.264 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 5.0 _refine.ls_number_reflns_R_free 9590 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean 45.0 _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.details ;INITIAL REFINEMENT CARRIED OUT WITH TNT. ASP 270 IN CHAINS A, B, C AND THE PEPTIDE BOND BETWEEN ASP 256 AND ASN 257 IN CHAINS D, E, AND F HAVE BEEN MODELED IN A CIS CONFORMATION. ; _refine.pdbx_starting_model 'PDB CODE 1BMF, NATIVE BOVINE MITOCHONDRIAL F1- ATPASE' _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_overall_ESU_R 0.23 _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free 0.21 _refine.overall_SU_ML 0.15 _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B 5.8 _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 24429 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 207 _refine_hist.number_atoms_solvent 1693 _refine_hist.number_atoms_total 26329 _refine_hist.d_res_high 2.00 _refine_hist.d_res_low 13.5 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function p_bond_d 0.012 0.020 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_angle_d 0.025 0.030 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_angle_deg ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_planar_d 0.037 0.050 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_hb_or_metal_coord 0.045 0.050 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_mcbond_it 1.96 2.500 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_mcangle_it 2.75 3.500 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_scbond_it 4.71 5.000 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_scangle_it 5.94 6.000 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_plane_restr 0.023 0.03 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_chiral_restr 0.124 0.15 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_singtor_nbd 0.187 0.300 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_multtor_nbd 0.209 0.300 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_xhyhbond_nbd ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_xyhbond_nbd 0.192 0.300 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_planar_tor 3.8 7.0 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_staggered_tor 16.2 15.0 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_orthonormal_tor ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_transverse_tor 28.9 20.00 ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? p_special_tor ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? # _struct.entry_id 1H8E _struct.title '(ADP.AlF4)2(ADP.SO4) bovine F1-ATPase (all three catalytic sites occupied)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1H8E _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE _struct_keywords.text 'HYDROLASE, ATP PHOSPHORYLASE, ATP PHOSPHORYLASE (H+ TRANSPORTING), ATP SYNTHASE, F1FO ATP SYNTHASE, F1-ATPASE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? L N N 8 ? M N N 6 ? N N N 7 ? O N N 8 ? P N N 8 ? Q N N 6 ? R N N 7 ? S N N 8 ? T N N 6 ? U N N 7 ? V N N 9 ? W N N 6 ? X N N 7 ? Y N N 10 ? Z N N 6 ? AA N N 7 ? BA N N 9 ? CA N N 11 ? DA N N 11 ? EA N N 11 ? FA N N 11 ? GA N N 11 ? HA N N 11 ? IA N N 11 ? JA N N 11 ? KA N N 11 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.details ;THE F1-ATPASE MOLECULE HAS THREE COPIES OF THE NON-CATALYTICALPHA SUBUNIT AND THREE COPIES OF THE CATALYTIC BETA SUBUNIT.IN THE 1994 REFERENCE, THE BETA SUBUNITS WERE LABELED ACCORDINGTO THE BOUND NUCLEOTIDE, ASBETA(DP) (BINDS ADP),BETA(E) (NO BOUND NUCLEOTIDE) ANDBETA(TP ) (AMPPNP BOUND).THE ALPHA SUBUNITS (WHICH ALL BIND AMPPNP) CONTRIBUTE TO THECATALYTIC SITES OF THE BETA SUBUNITS, AND HAVE BEEN LABELEDACCORDINGLY . THUSALPHA(DP) CONTRIBUTES TO THE CATALYTIC SITE ON BETA(DP),ALPHA(TP) TO THE SITE ON BETA ( TP) ANDALPHA(E) TO THE SITE ON BETA(E).THE CORRESPONDENCE BETWEEN THE SUBUNIT NAMES AND THE CHAINIDENTIFIERS IS GIVEN BELOW:.CHAIN A: ALPHA(E )CHAIN B: ALPHA(TP)CHAIN C: ALPHA(DP)CHAIN D : BETA(DP)CHAIN E: BETA(E)CHAIN F: BETA(TP) CHAIN G: GAMMA SUBUNITCHAIN H: DELTA SUBUNITCHAIN I: EPSILON SUBUNIT ; # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 ASN A 78 ? ILE A 82 ? ASN A 78 ILE A 82 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 2 GLY A 100 ? LEU A 104 ? GLY A 100 LEU A 104 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 3 ILE A 150 ? VAL A 157 ? ILE A 150 VAL A 157 1 ? 8 HELX_P HELX_P4 4 GLY A 174 ? GLN A 186 ? GLY A 174 GLN A 186 1 ? 13 HELX_P HELX_P5 5 GLN A 186 ? ASP A 191 ? GLN A 186 ASP A 191 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 6 ASP A 194 ? LYS A 198 ? ASP A 194 LYS A 198 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 7 LYS A 209 ? ALA A 223 ? LYS A 209 ALA A 223 1 ? 15 HELX_P HELX_P8 8 ALA A 225 ? LYS A 227 ? ALA A 225 LYS A 227 5 ? 3 HELX_P HELX_P9 9 ALA A 239 ? ASP A 259 ? ALA A 239 ASP A 259 1 ? 21 HELX_P HELX_P10 10 ASP A 270 ? LEU A 285 ? ASP A 270 LEU A 285 1 ? 16 HELX_P HELX_P11 11 GLY A 290 ? TYR A 294 ? GLY A 290 TYR A 294 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 12 ASP A 297 ? GLU A 307 ? ASP A 297 GLU A 307 1 ? 11 HELX_P HELX_P13 13 ASN A 313 ? GLY A 317 ? ASN A 313 GLY A 317 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 14 ALA A 336 ? THR A 346 ? ALA A 336 THR A 346 1 ? 11 HELX_P HELX_P15 15 GLU A 353 ? LYS A 359 ? GLU A 353 LYS A 359 1 ? 7 HELX_P HELX_P16 16 VAL A 374 ? GLN A 379 ? VAL A 374 GLN A 379 5 ? 6 HELX_P HELX_P17 17 THR A 380 ? ALA A 401 ? THR A 380 ALA A 401 1 ? 22 HELX_P HELX_P18 18 ASP A 411 ? LYS A 429 ? ASP A 411 LYS A 429 1 ? 19 HELX_P HELX_P19 19 ALA A 437 ? ARG A 450 ? ALA A 437 ARG A 450 1 ? 14 HELX_P HELX_P20 20 GLU A 457 ? SER A 459 ? GLU A 457 SER A 459 5 ? 3 HELX_P HELX_P21 21 LYS A 460 ? HIS A 476 ? LYS A 460 HIS A 476 1 ? 17 HELX_P HELX_P22 22 HIS A 476 ? ASP A 486 ? HIS A 476 ASP A 486 1 ? 11 HELX_P HELX_P23 23 SER A 490 ? ALA A 510 ? SER A 490 ALA A 510 1 ? 21 HELX_P HELX_P24 24 ASN B 78 ? ILE B 82 ? ASN B 78 ILE B 82 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 25 GLY B 100 ? LEU B 104 ? GLY B 100 LEU B 104 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 26 ILE B 150 ? VAL B 157 ? ILE B 150 VAL B 157 1 ? 8 HELX_P HELX_P27 27 GLY B 174 ? GLN B 186 ? GLY B 174 GLN B 186 1 ? 13 HELX_P HELX_P28 28 GLN B 186 ? ASP B 191 ? GLN B 186 ASP B 191 1 ? 6 HELX_P HELX_P29 29 ASP B 194 ? LYS B 198 ? ASP B 194 LYS B 198 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 30 LYS B 209 ? ALA B 223 ? LYS B 209 ALA B 223 1 ? 15 HELX_P HELX_P31 31 ALA B 225 ? LYS B 227 ? ALA B 225 LYS B 227 5 ? 3 HELX_P HELX_P32 32 ALA B 239 ? ASP B 259 ? ALA B 239 ASP B 259 1 ? 21 HELX_P HELX_P33 33 ASP B 270 ? LEU B 285 ? ASP B 270 LEU B 285 1 ? 16 HELX_P HELX_P34 34 GLY B 290 ? TYR B 294 ? GLY B 290 TYR B 294 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 35 ASP B 297 ? ARG B 308 ? ASP B 297 ARG B 308 1 ? 12 HELX_P HELX_P36 36 ASN B 313 ? GLY B 317 ? ASN B 313 GLY B 317 5 ? 5 HELX_P HELX_P37 37 ALA B 336 ? SER B 344 ? ALA B 336 SER B 344 1 ? 9 HELX_P HELX_P38 38 GLU B 353 ? LYS B 359 ? GLU B 353 LYS B 359 1 ? 7 HELX_P HELX_P39 39 GLY B 375 ? GLN B 379 ? GLY B 375 GLN B 379 5 ? 5 HELX_P HELX_P40 40 THR B 380 ? ALA B 401 ? THR B 380 ALA B 401 1 ? 22 HELX_P HELX_P41 41 ALA B 413 ? LEU B 428 ? ALA B 413 LEU B 428 1 ? 16 HELX_P HELX_P42 42 ALA B 437 ? ARG B 450 ? ALA B 437 ARG B 450 1 ? 14 HELX_P HELX_P43 43 GLU B 457 ? SER B 459 ? GLU B 457 SER B 459 5 ? 3 HELX_P HELX_P44 44 LYS B 460 ? HIS B 476 ? LYS B 460 HIS B 476 1 ? 17 HELX_P HELX_P45 45 HIS B 476 ? GLY B 487 ? HIS B 476 GLY B 487 1 ? 12 HELX_P HELX_P46 46 SER B 490 ? PHE B 508 ? SER B 490 PHE B 508 1 ? 19 HELX_P HELX_P47 47 ASN C 78 ? ILE C 82 ? ASN C 78 ILE C 82 5 ? 5 HELX_P HELX_P48 48 GLY C 100 ? LEU C 104 ? GLY C 100 LEU C 104 5 ? 5 HELX_P HELX_P49 49 ILE C 150 ? VAL C 157 ? ILE C 150 VAL C 157 1 ? 8 HELX_P HELX_P50 50 GLY C 174 ? GLN C 186 ? GLY C 174 GLN C 186 1 ? 13 HELX_P HELX_P51 51 GLN C 186 ? ASP C 191 ? GLN C 186 ASP C 191 1 ? 6 HELX_P HELX_P52 52 LYS C 209 ? ALA C 223 ? LYS C 209 ALA C 223 1 ? 15 HELX_P HELX_P53 53 ALA C 225 ? LYS C 227 ? ALA C 225 LYS C 227 5 ? 3 HELX_P HELX_P54 54 ALA C 239 ? ASP C 259 ? ALA C 239 ASP C 259 1 ? 21 HELX_P HELX_P55 55 ASP C 270 ? LEU C 285 ? ASP C 270 LEU C 285 1 ? 16 HELX_P HELX_P56 56 GLY C 290 ? TYR C 294 ? GLY C 290 TYR C 294 5 ? 5 HELX_P HELX_P57 57 ASP C 297 ? GLU C 307 ? ASP C 297 GLU C 307 1 ? 11 HELX_P HELX_P58 58 ASN C 313 ? GLY C 317 ? ASN C 313 GLY C 317 5 ? 5 HELX_P HELX_P59 59 ALA C 336 ? SER C 344 ? ALA C 336 SER C 344 1 ? 9 HELX_P HELX_P60 60 GLU C 353 ? GLY C 360 ? GLU C 353 GLY C 360 1 ? 8 HELX_P HELX_P61 61 VAL C 374 ? GLN C 379 ? VAL C 374 GLN C 379 5 ? 6 HELX_P HELX_P62 62 THR C 380 ? GLY C 388 ? THR C 380 GLY C 388 1 ? 9 HELX_P HELX_P63 63 THR C 389 ? ALA C 404 ? THR C 389 ALA C 404 1 ? 16 HELX_P HELX_P64 64 ASP C 411 ? LYS C 429 ? ASP C 411 LYS C 429 1 ? 19 HELX_P HELX_P65 65 ALA C 437 ? ARG C 450 ? ALA C 437 ARG C 450 1 ? 14 HELX_P HELX_P66 66 GLU C 457 ? SER C 459 ? GLU C 457 SER C 459 5 ? 3 HELX_P HELX_P67 67 LYS C 460 ? HIS C 476 ? LYS C 460 HIS C 476 1 ? 17 HELX_P HELX_P68 68 HIS C 476 ? GLY C 487 ? HIS C 476 GLY C 487 1 ? 12 HELX_P HELX_P69 69 SER C 490 ? ALA C 510 ? SER C 490 ALA C 510 1 ? 21 HELX_P HELX_P70 70 GLY D 91 ? LEU D 95 ? GLY D 87 LEU D 91 5 ? 5 HELX_P HELX_P71 71 GLU D 126 ? MET D 130 ? GLU D 122 MET D 126 5 ? 5 HELX_P HELX_P72 72 ILE D 141 ? ALA D 148 ? ILE D 137 ALA D 144 1 ? 8 HELX_P HELX_P73 73 GLY D 165 ? VAL D 177 ? GLY D 161 VAL D 173 1 ? 13 HELX_P HELX_P74 74 ARG D 193 ? SER D 207 ? ARG D 189 SER D 203 1 ? 15 HELX_P HELX_P75 75 PRO D 229 ? ASP D 249 ? PRO D 225 ASP D 245 1 ? 21 HELX_P HELX_P76 76 ILE D 262 ? SER D 273 ? ILE D 258 SER D 269 1 ? 12 HELX_P HELX_P77 77 SER D 281 ? TYR D 285 ? SER D 277 TYR D 281 5 ? 5 HELX_P HELX_P78 78 THR D 288 ? GLU D 298 ? THR D 284 GLU D 294 1 ? 11 HELX_P HELX_P79 79 PRO D 317 ? ASP D 320 ? PRO D 313 ASP D 316 5 ? 4 HELX_P HELX_P80 80 ASP D 323 ? PHE D 330 ? ASP D 319 PHE D 326 1 ? 8 HELX_P HELX_P81 81 ALA D 331 ? LEU D 333 ? ALA D 327 LEU D 329 5 ? 3 HELX_P HELX_P82 82 SER D 340 ? GLU D 345 ? SER D 336 GLU D 341 1 ? 6 HELX_P HELX_P83 83 ASP D 363 ? GLY D 368 ? ASP D 359 GLY D 364 1 ? 6 HELX_P HELX_P84 84 GLY D 368 ? GLY D 396 ? GLY D 364 GLY D 392 1 ? 29 HELX_P HELX_P85 85 MET D 397 ? LEU D 400 ? MET D 393 LEU D 396 5 ? 4 HELX_P HELX_P86 86 SER D 401 ? LEU D 418 ? SER D 397 LEU D 414 1 ? 18 HELX_P HELX_P87 87 PHE D 422 ? VAL D 424 ? PHE D 418 VAL D 420 5 ? 3 HELX_P HELX_P88 88 ALA D 425 ? GLY D 430 ? ALA D 421 GLY D 426 1 ? 6 HELX_P HELX_P89 89 PRO D 437 ? GLY D 451 ? PRO D 433 GLY D 447 1 ? 15 HELX_P HELX_P90 90 PRO D 457 ? TYR D 462 ? PRO D 453 TYR D 458 5 ? 6 HELX_P HELX_P91 91 PRO D 466 ? ALA D 478 ? PRO D 462 ALA D 474 1 ? 13 HELX_P HELX_P92 92 GLY E 91 ? LEU E 95 ? GLY E 87 LEU E 91 5 ? 5 HELX_P HELX_P93 93 ILE E 141 ? ALA E 148 ? ILE E 137 ALA E 144 1 ? 8 HELX_P HELX_P94 94 GLY E 165 ? VAL E 177 ? GLY E 161 VAL E 173 1 ? 13 HELX_P HELX_P95 95 ARG E 193 ? SER E 207 ? ARG E 189 SER E 203 1 ? 15 HELX_P HELX_P96 96 PRO E 229 ? GLU E 251 ? PRO E 225 GLU E 247 1 ? 23 HELX_P HELX_P97 97 ASN E 261 ? LEU E 276 ? ASN E 257 LEU E 272 1 ? 16 HELX_P HELX_P98 98 SER E 281 ? TYR E 285 ? SER E 277 TYR E 281 5 ? 5 HELX_P HELX_P99 99 THR E 288 ? GLU E 298 ? 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GLY F 161 ALA F 174 1 ? 14 HELX_P HELX_P114 114 ARG F 193 ? GLY F 208 ? ARG F 189 GLY F 204 1 ? 16 HELX_P HELX_P115 115 PRO F 229 ? GLN F 250 ? PRO F 225 GLN F 246 1 ? 22 HELX_P HELX_P116 116 ILE F 262 ? LEU F 276 ? ILE F 258 LEU F 272 1 ? 15 HELX_P HELX_P117 117 SER F 281 ? TYR F 285 ? SER F 277 TYR F 281 5 ? 5 HELX_P HELX_P118 118 THR F 288 ? GLU F 298 ? THR F 284 GLU F 294 1 ? 11 HELX_P HELX_P119 119 PRO F 317 ? ASP F 320 ? PRO F 313 ASP F 316 5 ? 4 HELX_P HELX_P120 120 ASP F 323 ? PHE F 330 ? ASP F 319 PHE F 326 1 ? 8 HELX_P HELX_P121 121 ALA F 331 ? LEU F 333 ? ALA F 327 LEU F 329 5 ? 3 HELX_P HELX_P122 122 SER F 340 ? LEU F 346 ? SER F 336 LEU F 342 1 ? 7 HELX_P HELX_P123 123 ASP F 363 ? GLY F 368 ? ASP F 359 GLY F 364 1 ? 6 HELX_P HELX_P124 124 GLY F 368 ? ALA F 393 ? GLY F 364 ALA F 389 1 ? 26 HELX_P HELX_P125 125 SER F 401 ? LEU F 418 ? SER F 397 LEU F 414 1 ? 18 HELX_P HELX_P126 126 PHE F 422 ? VAL F 424 ? PHE F 418 VAL F 420 5 ? 3 HELX_P HELX_P127 127 ALA F 425 ? 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SER I 10 ALA I 25 1 ? 16 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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F MG 601 F HOH 2164 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.205 ? ? metalc47 metalc ? ? BA ALF . AL ? ? ? 1_555 HA HOH . O ? ? F ALF 620 F HOH 2128 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.104 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASP 269 A . ? ASP 269 A ASP 270 A ? 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HB ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA 1 2 ? anti-parallel AA 2 3 ? anti-parallel AA 3 4 ? anti-parallel AB 1 2 ? anti-parallel AC 1 2 ? parallel AC 2 3 ? parallel AC 3 4 ? parallel AC 4 5 ? parallel AC 5 6 ? parallel AC 6 7 ? parallel AD 1 2 ? parallel AD 2 3 ? parallel AD 3 4 ? parallel AD 4 5 ? parallel AD 5 6 ? anti-parallel AE 1 2 ? anti-parallel BA 1 2 ? anti-parallel BA 2 3 ? anti-parallel BA 3 4 ? anti-parallel BB 1 2 ? anti-parallel BC 1 2 ? parallel BC 2 3 ? parallel BC 3 4 ? parallel BC 4 5 ? parallel BC 5 6 ? parallel BC 6 7 ? parallel BC 7 8 ? anti-parallel BD 1 2 ? parallel BD 2 3 ? parallel BD 3 4 ? parallel BD 4 5 ? parallel BD 5 6 ? anti-parallel CA 1 2 ? anti-parallel CA 2 3 ? anti-parallel CA 3 4 ? anti-parallel CB 1 2 ? anti-parallel CC 1 2 ? parallel CC 2 3 ? parallel CC 3 4 ? parallel CC 4 5 ? parallel CC 5 6 ? parallel CC 6 7 ? parallel CC 7 8 ? anti-parallel CD 1 2 ? parallel CD 2 3 ? parallel CD 3 4 ? parallel CD 4 5 ? parallel CD 5 6 ? anti-parallel DA 1 2 ? anti-parallel DB 1 2 ? parallel DB 2 3 ? parallel DB 3 4 ? parallel DB 4 5 ? parallel DB 5 6 ? parallel DB 6 7 ? parallel DB 7 8 ? anti-parallel DC 1 2 ? anti-parallel EA 1 2 ? anti-parallel EB 1 2 ? parallel EB 2 3 ? parallel EB 3 4 ? parallel EB 4 5 ? parallel EB 5 6 ? parallel EB 6 7 ? parallel FA 1 2 ? anti-parallel FB 1 2 ? parallel FB 2 3 ? parallel FB 3 4 ? parallel FB 4 5 ? parallel FB 5 6 ? parallel FB 6 7 ? parallel FB 7 8 ? anti-parallel FC 1 2 ? anti-parallel GA 1 2 ? parallel GA 2 3 ? parallel GA 3 4 ? anti-parallel HA 1 2 ? anti-parallel HA 2 3 ? parallel HA 3 4 ? anti-parallel HA 4 5 ? anti-parallel HB 1 2 ? anti-parallel HB 2 3 ? anti-parallel HB 3 4 ? anti-parallel HB 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA 1 THR A 28 ? 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ILE A 159 GLY A 160 BA 1 THR B 28 ? GLY B 35 ? THR B 28 GLY B 35 BA 2 ILE B 87 ? ILE B 94 ? ILE B 87 ILE B 94 BA 3 GLU B 51 ? PHE B 55 ? GLU B 51 PHE B 55 BA 4 LYS B 60 ? LEU B 66 ? LYS B 60 LEU B 66 BB 1 ASP B 96 ? VAL B 99 ? ASP B 96 VAL B 99 BB 2 ALA B 125 ? ARG B 128 ? ALA B 125 ARG B 128 BC 1 VAL B 107 ? VAL B 108 ? VAL B 107 VAL B 108 BC 2 THR B 229 ? ALA B 234 ? THR B 229 ALA B 234 BC 3 TYR B 200 ? ILE B 206 ? TYR B 200 ILE B 206 BC 4 HIS B 263 ? ASP B 269 ? HIS B 263 ASP B 269 BC 5 SER B 320 ? GLU B 328 ? SER B 320 GLU B 328 BC 6 LEU B 166 ? GLY B 169 ? LEU B 166 GLY B 169 BC 7 GLY B 348 ? PHE B 351 ? GLY B 348 PHE B 351 BC 8 VAL B 371 ? SER B 372 ? VAL B 371 SER B 372 BD 1 VAL B 107 ? VAL B 108 ? VAL B 107 VAL B 108 BD 2 THR B 229 ? ALA B 234 ? THR B 229 ALA B 234 BD 3 TYR B 200 ? ILE B 206 ? TYR B 200 ILE B 206 BD 4 HIS B 263 ? ASP B 269 ? HIS B 263 ASP B 269 BD 5 SER B 320 ? GLU B 328 ? SER B 320 GLU B 328 BD 6 ALA B 310 ? LYS B 311 ? ALA B 310 LYS B 311 CA 1 THR C 28 ? GLY C 35 ? THR C 28 GLY C 35 CA 2 ILE C 87 ? ILE C 94 ? ILE C 87 ILE C 94 CA 3 GLU C 51 ? PHE C 55 ? GLU C 51 PHE C 55 CA 4 LYS C 60 ? LEU C 66 ? LYS C 60 LEU C 66 CB 1 ASP C 96 ? VAL C 99 ? ASP C 96 VAL C 99 CB 2 ALA C 125 ? ARG C 128 ? ALA C 125 ARG C 128 CC 1 VAL C 107 ? VAL C 108 ? VAL C 107 VAL C 108 CC 2 THR C 229 ? ALA C 234 ? THR C 229 ALA C 234 CC 3 TYR C 200 ? ILE C 206 ? TYR C 200 ILE C 206 CC 4 HIS C 263 ? ASP C 269 ? HIS C 263 ASP C 269 CC 5 SER C 320 ? THR C 329 ? SER C 320 THR C 329 CC 6 LEU C 166 ? ASP C 170 ? LEU C 166 ASP C 170 CC 7 GLY C 348 ? LEU C 352 ? GLY C 348 LEU C 352 CC 8 VAL C 371 ? SER C 372 ? VAL C 371 SER C 372 CD 1 VAL C 107 ? VAL C 108 ? VAL C 107 VAL C 108 CD 2 THR C 229 ? ALA C 234 ? THR C 229 ALA C 234 CD 3 TYR C 200 ? ILE C 206 ? TYR C 200 ILE C 206 CD 4 HIS C 263 ? ASP C 269 ? HIS C 263 ASP C 269 CD 5 SER C 320 ? THR C 329 ? SER C 320 THR C 329 CD 6 ALA C 310 ? LYS C 311 ? ALA C 310 LYS C 311 DA 1 ARG D 87 ? VAL D 90 ? 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E. WALKER, S. J. POWELL, O. VINAS AND M. J. RUNSWICK, BIOCHEMISTRY VOL 28, PP 4702-4708, 1989. 2) FOR THE GAMMA SUBUNIT: M. R. DYER, N. J. GAY, S. J. POWELL AND J.E. WALKER, BIOCHEMISTRY VOL 28, PP 3670-3680, 1989. DIFFERENT RESIDUE: GLY A 481, GLY B 481, GLY C 481 THIS RESIDUE WAS IDENTIFIED AS A GLY FROM THE PROTEIN SEQUENCE. IN THE CDNA SEQUENCE, THE CODON FOR THIS RESIDUE WAS AGC (SER) IN THREE CLONES WHILE IN TWO OTHERS IT WAS GGC (GLY). THE DIFFERENCE WAS THOUGHT TO BE DUE TO A MUTATION OCCURRING DURING EITHER PROPAGATION OF THE CLONES IN THE LIBRARY OR SUBCLONING INTO M13 VECTORS. THE ELECTRON DENSITY SUGGESTS A GLY IN THIS POSITION. DIFFERENT RESIDUE: ASP G 273 THIS RESIDUE IS NOT PRESENT IN THE BOVINE GAMMA SUBUNIT IN THE MATERIAL USED IN THIS STRUCTURE DETERMINATION. THERE IS NO CODON FOR AN ASP IN THE CDNA SEQUENCE, NO C-TERMINAL ASP WAS FOUND IN THE PROTEIN SEQUENCE FOR THE GAMMA SUBUNIT AS ISOLATED FROM BEEF HEART MITOCHONDRIA. ; _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest ? # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 O B GLY 37 ? ? O B HOH 2005 ? ? 2.10 2 1 F4 D ALF 620 ? ? 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NE A ARG 45 ? ? CZ A ARG 45 ? ? 134.79 123.60 11.19 1.40 N 2 1 NE A ARG 45 ? ? CZ A ARG 45 ? ? NH1 A ARG 45 ? ? 125.26 120.30 4.96 0.50 N 3 1 NE A ARG 45 ? ? CZ A ARG 45 ? ? NH2 A ARG 45 ? ? 115.17 120.30 -5.13 0.50 N 4 1 CB A ASP 170 ? ? CG A ASP 170 ? ? OD2 A ASP 170 ? ? 124.76 118.30 6.46 0.90 N 5 1 CD A ARG 188 ? ? NE A ARG 188 ? ? CZ A ARG 188 ? ? 138.74 123.60 15.14 1.40 N 6 1 NE A ARG 188 ? ? CZ A ARG 188 ? ? NH1 A ARG 188 ? ? 125.66 120.30 5.36 0.50 N 7 1 CB A ASP 270 ? ? CG A ASP 270 ? ? OD2 A ASP 270 ? ? 123.93 118.30 5.63 0.90 N 8 1 CA A TYR 300 ? ? CB A TYR 300 ? ? CG A TYR 300 ? ? 124.80 113.40 11.40 1.90 N 9 1 NE A ARG 398 ? ? CZ A ARG 398 ? ? NH1 A ARG 398 ? ? 116.74 120.30 -3.56 0.50 N 10 1 CA A GLU 439 ? ? CB A GLU 439 ? ? CG A GLU 439 ? ? 127.32 113.40 13.92 2.20 N 11 1 CA A LEU 479 ? ? CB A LEU 479 ? ? CG A LEU 479 ? ? 130.20 115.30 14.90 2.30 N 12 1 NE B ARG 40 ? ? CZ B ARG 40 ? ? NH2 B ARG 40 ? ? 117.20 120.30 -3.10 0.50 N 13 1 NE B ARG 45 ? ? CZ B ARG 45 ? ? 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