data_1HVU # _entry.id 1HVU # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.375 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 1HVU pdb_00001hvu 10.2210/pdb1hvu/pdb RCSB PRV022 ? ? WWPDB D_1000174058 ? ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 1HVU _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 1998-06-30 _pdbx_database_status.deposit_site ? _pdbx_database_status.process_site NDB _pdbx_database_status.SG_entry . _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Jaeger, J.' 1 'Restle, T.' 2 'Steitz, T.A.' 3 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.journal_id_ASTM _citation.country _citation.journal_id_ISSN _citation.journal_id_CSD _citation.book_publisher _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The structure of HIV-1 reverse transcriptase complexed with an RNA pseudoknot inhibitor.' 'EMBO J.' 17 4535 4542 1998 EMJODG UK 0261-4189 0897 ? 9687519 10.1093/emboj/17.15.4535 1 'Comparison of Three Different Crystal Forms Shows HIV-1 Reverse Transcriptase Displays an Internal Swivel Motion' Structure 2 869 ? 1994 STRUE6 UK 0969-2126 2005 ? ? ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Jaeger, J.' 1 ? primary 'Restle, T.' 2 ? primary 'Steitz, T.A.' 3 ? 1 'Jaeger, J.' 4 ? 1 'Smerdon, S.J.' 5 ? 1 'Wang, J.' 6 ? 1 'Boisvert, D.C.' 7 ? 1 'Steitz, T.A.' 8 ? # _cell.entry_id 1HVU _cell.length_a 166.700 _cell.length_b 169.200 _cell.length_c 331.400 _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_beta 104.50 _cell.angle_gamma 90.00 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1HVU _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting monoclinic _symmetry.Int_Tables_number 5 # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer syn 'RNA (33 NUCLEOTIDE RNA PSEUDOKNOT)' 9638.777 4 ? ? ? ? 2 polymer man 'PROTEIN (HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE)' 63834.125 4 2.7.7.49 ? ? ;THE HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IS A HETERODIMER CONSISTING OF TWO SUBUNITS: P66 (CHAIN A) AND P51 (DESIGNATED CHAIN B) IN THIS CRYSTAL FORM THERE ARE FOUR REVERSE TRANSCRIPTASE MOLECULES PLUS FOUR RNA MOLECULES PER ASYMMETRIC UNIT. THE COORDINATES FOR ONE COMPLEX ARE CONTAINED IN THIS ENTRY. THE NON-CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY TRANSFORMATIONS GIVEN BELOW ARE BASED ON THE BEST SUPERPOSITION OF THIS MOLECULE ON THE OTHER THREE HETERODIMER COMPLEXES. ; 3 polymer man 'PROTEIN (HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE)' 49532.961 4 2.7.7.49 ? ? ;THE HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IS A HETERODIMER CONSISTING OF TWO SUBUNITS: P66 (CHAIN A) AND P51 (DESIGNATED CHAIN B) IN THIS CRYSTAL FORM THERE ARE FOUR REVERSE TRANSCRIPTASE MOLECULES PLUS FOUR RNA MOLECULES PER ASYMMETRIC UNIT. THE COORDINATES FOR ONE COMPLEX ARE CONTAINED IN THIS ENTRY. THE NON-CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY TRANSFORMATIONS GIVEN BELOW ARE BASED ON THE BEST SUPERPOSITION OF THIS MOLECULE ON THE OTHER THREE HETERODIMER COMPLEXES. ; # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 polyribonucleotide no no AGAUUCCGUUUUCAGUCGGGAAAAACUGAA AGAUUCCGUUUUCAGUCGGGAAAAACUGAA C,F,I,L ? 2 'polypeptide(L)' no no ;PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALVEICTEMEKEGKISKIGPENPYNTPVFAIKKKDSTKWRKLVDFREL NKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKKKSVTVLDVGDAYFSVPLDEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIF QSSMTKILEPFKKQNPDIVIYQYMDDLYVGSDLEIGQHRTKIEELRQHLLRWGLTTPDKKHQKEPPFLWMGYELHPDKWT VQPIVLPEKDSWTVNDIQKLVGKLNWASQIYPGIKVRQLCKLLRGTKALTEVIPLTEEAELELAENREILKEPVHGVYYD PSKDLIAEIQKQGQGQWTYQIYQEPFKNLKTGKYARMRGAHTNDVKQLTEAVQKITTESIVIWGKTPKFKLPIQKETWET WWTEYWQATWIPEWEFVNTPPLVKLWYQLEKEPIVGAETFYVDGAANRETKLGKAGYVTNKGRQKVVPLTNTTNQKTELQ AIYLALQDSGLEVNIVTDSQYALGIIQAQPDKSESELVNQIIEQLIKKEKVYLAWVPAHKGIGGNEQVDKLVSA ; ;PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALVEICTEMEKEGKISKIGPENPYNTPVFAIKKKDSTKWRKLVDFREL NKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKKKSVTVLDVGDAYFSVPLDEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIF QSSMTKILEPFKKQNPDIVIYQYMDDLYVGSDLEIGQHRTKIEELRQHLLRWGLTTPDKKHQKEPPFLWMGYELHPDKWT VQPIVLPEKDSWTVNDIQKLVGKLNWASQIYPGIKVRQLCKLLRGTKALTEVIPLTEEAELELAENREILKEPVHGVYYD PSKDLIAEIQKQGQGQWTYQIYQEPFKNLKTGKYARMRGAHTNDVKQLTEAVQKITTESIVIWGKTPKFKLPIQKETWET WWTEYWQATWIPEWEFVNTPPLVKLWYQLEKEPIVGAETFYVDGAANRETKLGKAGYVTNKGRQKVVPLTNTTNQKTELQ AIYLALQDSGLEVNIVTDSQYALGIIQAQPDKSESELVNQIIEQLIKKEKVYLAWVPAHKGIGGNEQVDKLVSA ; A,D,G,J ? 3 'polypeptide(L)' no no ;IETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALVEICTEMEKEGKISKIGPENPYNTPVFAIKKKDSTKWRKLVDFRELNKRT QDFWEVQLGIPHPAGLKKKKSVTVLDVGDAYFSVPLDEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIFQSSM TKILEPFKKQNPDIVIYQYMDDLYVGSDLEIGQHRTKIEELRQHLLRWGLTTPDKKHQKEPPFLWMGYELHPDKWTVQPI 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'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 1HVU _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 3.8 _exptl_crystal.density_percent_sol 72 _exptl_crystal.description ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP' _exptl_crystal_grow.temp 277 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 7.0 _exptl_crystal_grow.pdbx_details 'pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K' _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range ? # loop_ _exptl_crystal_grow_comp.crystal_id _exptl_crystal_grow_comp.id _exptl_crystal_grow_comp.sol_id _exptl_crystal_grow_comp.name _exptl_crystal_grow_comp.volume _exptl_crystal_grow_comp.conc _exptl_crystal_grow_comp.details 1 1 1 BIS-TRIS-PROPANE ? ? ? 1 2 1 HEXA-B-D-GLYCOPYRANOSIDE ? ? ? 1 3 1 '(NH4)2SO4' ? ? ? 1 4 1 GLYCEROL ? ? ? 1 5 1 NAN3 ? ? ? 1 6 1 DIOXANE ? ? ? 1 7 2 'SODIUM CITRATE' ? ? ? 1 8 2 'MAGNESIUM ACETATE' ? ? ? 1 9 2 IOXANE ? ? ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type CUSTOM-MADE _diffrn_detector.pdbx_collection_date 1995-03-15 _diffrn_detector.details MIRROR # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator 'SI(111)' _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 0.9200 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'CHESS BEAMLINE A1' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site CHESS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline A1 _diffrn_source.pdbx_wavelength 0.9200 _diffrn_source.pdbx_wavelength_list ? # _reflns.entry_id 1HVU _reflns.observed_criterion_sigma_I 1.1 _reflns.observed_criterion_sigma_F ? _reflns.d_resolution_low 30.0 _reflns.d_resolution_high 4.75 _reflns.number_obs 32343 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 81 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs ? _reflns.pdbx_Rsym_value 0.0640000 _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI ? _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 1.9 _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 # _refine.entry_id 1HVU _refine.ls_number_reflns_obs 32343 _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 1.1 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low 30.0 _refine.ls_d_res_high 4.75 _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs 0.3400000 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.3400000 _refine.ls_R_factor_R_free 0.4130000 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 5.5 _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.B_iso_mean 55.0 _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method 'FREE R' _refine.details ;RIGID BODY REFINEMENT ONLY DUE TO LIMITED RESOLUTION. THE FOLLOWING RESIDUES ARE NOT VISIBLE IN THE ELECTRON DENSITY MAPS, THEREFORE THEY ARE NOT INCLUDED IN THE COORDINATE LIST. CHAIN B: 212 - 234, 428 - 440. ; _refine.pdbx_starting_model '3HVT AND 1HMV' _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_B ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 18864 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 2552 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 0 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 21416 _refine_hist.d_res_high 4.75 _refine_hist.d_res_low 30.0 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function x_bond_d 0.011 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_bond_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_bond_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_deg 1.8 ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_deg_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_angle_deg_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_dihedral_angle_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_dihedral_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_dihedral_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_improper_angle_d ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_improper_angle_d_na ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_improper_angle_d_prot ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_mcbond_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_mcangle_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_scbond_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? x_scangle_it ? ? ? ? 'X-RAY DIFFRACTION' ? # loop_ _struct_ncs_oper.id _struct_ncs_oper.code _struct_ncs_oper.details _struct_ncs_oper.matrix[1][1] _struct_ncs_oper.matrix[1][2] _struct_ncs_oper.matrix[1][3] _struct_ncs_oper.matrix[2][1] _struct_ncs_oper.matrix[2][2] _struct_ncs_oper.matrix[2][3] _struct_ncs_oper.matrix[3][1] _struct_ncs_oper.matrix[3][2] _struct_ncs_oper.matrix[3][3] _struct_ncs_oper.vector[1] _struct_ncs_oper.vector[2] _struct_ncs_oper.vector[3] 1 given ? -0.999974 -0.000410 0.007119 0.000339 -0.999950 -0.009924 0.007123 -0.009921 0.999925 250.60800 83.54400 -0.26600 2 given ? -0.999170 -0.018436 -0.036317 -0.016739 0.998778 -0.046499 0.037130 -0.045853 -0.998257 213.72800 47.95800 157.81500 3 given ? 0.999501 0.019618 -0.024731 0.018563 -0.998936 -0.042204 -0.025532 0.041724 -0.998802 44.99700 44.28200 162.60800 # _struct.entry_id 1HVU _struct.title 'HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEXED WITH A 33-BASE NUCLEOTIDE RNA PSEUDOKNOT' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1HVU _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSFERASE/RNA _struct_keywords.text 'COMPLEX (NUCLEOTIDYLTRANSFERASE-RNA), HYDROLASE, ASPARTYL PROTEASE, ENDONUCLEASE, TRANSFERASE-RNA complex' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 2 ? F N N 3 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 2 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 3 ? # loop_ _struct_biol.id _struct_biol.details _struct_biol.pdbx_parent_biol_id 1 ;THE HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IS A HETERODIMER CONSISTING OF TWO SUBUNITS: P66 (CHAIN A) AND P51 (DESIGNATED CHAIN B) IN THIS CRYSTAL FORM THERE ARE FOUR REVERSE TRANSCRIPTASE MOLECULES PLUS FOUR RNA MOLECULES PER ASYMMETRIC UNIT. THE COORDINATES FOR ONE COMPLEX ARE CONTAINED IN THIS ENTRY. THE NON-CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY TRANSFORMATIONS GIVEN BELOW ARE BASED ON THE BEST SUPERPOSITION OF THIS MOLECULE ON THE OTHER THREE HETERODIMER COMPLEXES. THE TRANSFORMATIONS MATRICES IN THE MTRIX RECORDS BELOW DESCRIBE NON-CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY AMONG THE FOUR HETERODIMERS OF REVERSE TRANSCRIPTASE FOUND IN THE ASYMMETRIC UNIT. APPLYING THE APPROPRIATE MTRIX TRANSFORMATION TO THE RESIDUES LISTED FIRST WILL YIELD COORDINATES FOR THE OTHER THREE MOLECULES PRESENT IN THE ASYMMETRIC UNIT. ; ? 2 ? ? 3 ? ? 4 ? ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 GLU E 28 ? GLU E 44 ? GLU A 28 GLU A 44 1 ? 17 HELX_P HELX_P2 2 ARG E 78 ? ARG E 83 ? ARG A 78 ARG A 83 1 ? 6 HELX_P HELX_P3 3 PRO E 97 ? GLY E 99 ? PRO A 97 GLY A 99 5 ? 3 HELX_P HELX_P4 4 ALA E 114 ? SER E 117 ? ALA A 114 SER A 117 1 ? 4 HELX_P HELX_P5 5 GLU E 122 ? THR E 128 ? GLU A 122 THR A 128 1 ? 7 HELX_P HELX_P6 6 SER E 156 ? GLN E 174 ? SER A 156 GLN A 174 1 ? 19 HELX_P HELX_P7 7 ILE E 195 ? TRP E 212 ? ILE A 195 TRP A 212 1 ? 18 HELX_P HELX_P8 8 VAL E 254 ? GLN E 269 ? VAL A 254 GLN A 269 1 ? 16 HELX_P HELX_P9 9 ARG E 277 ? LEU E 283 ? ARG A 277 LEU A 283 1 ? 7 HELX_P HELX_P10 10 GLU E 297 ? LYS E 311 ? GLU A 297 LYS A 311 1 ? 15 HELX_P HELX_P11 11 ASP E 364 ? ILE E 382 ? ASP A 364 ILE A 382 1 ? 19 HELX_P HELX_P12 12 LYS E 395 ? THR E 403 ? LYS A 395 THR A 403 1 ? 9 HELX_P HELX_P13 13 ASN E 474 ? GLN E 487 ? ASN A 474 GLN A 487 1 ? 14 HELX_P HELX_P14 14 GLN E 500 ? ALA E 508 ? GLN A 500 ALA A 508 1 ? 9 HELX_P HELX_P15 15 GLU E 516 ? LYS E 527 ? GLU A 516 LYS A 527 1 ? 12 HELX_P HELX_P16 16 ASN E 545 ? VAL E 552 ? ASN A 545 VAL A 552 1 ? 8 HELX_P HELX_P17 17 GLU F 24 ? LYS F 39 ? GLU B 28 LYS B 43 1 ? 16 HELX_P HELX_P18 18 ARG F 74 ? LYS F 78 ? ARG B 78 LYS B 82 1 ? 5 HELX_P HELX_P19 19 GLY F 95 ? LYS F 98 ? GLY B 99 LYS B 102 1 ? 4 HELX_P HELX_P20 20 VAL F 107 ? PHE F 112 ? VAL B 111 PHE B 116 5 ? 6 HELX_P HELX_P21 21 GLU F 118 ? THR F 124 ? GLU B 122 THR B 128 1 ? 7 HELX_P HELX_P22 22 ILE F 131 ? ASN F 133 ? ILE B 135 ASN B 137 5 ? 3 HELX_P HELX_P23 23 LYS F 150 ? ASN F 171 ? LYS B 154 ASN B 175 1 ? 22 HELX_P HELX_P24 24 ILE F 191 ? LEU F 206 ? ILE B 195 LEU B 210 1 ? 16 HELX_P HELX_P25 25 PRO F 232 ? LYS F 234 ? PRO B 236 LYS B 238 5 ? 3 HELX_P HELX_P26 26 VAL F 250 ? GLN F 265 ? VAL B 254 GLN B 269 1 ? 16 HELX_P HELX_P27 27 GLN F 274 ? LEU F 279 ? GLN B 278 LEU B 283 1 ? 6 HELX_P HELX_P28 28 GLU F 293 ? LYS F 307 ? GLU B 297 LYS B 311 1 ? 15 HELX_P HELX_P29 29 ASP F 360 ? VAL F 377 ? ASP B 364 VAL B 381 1 ? 18 HELX_P HELX_P30 30 LYS F 391 ? TYR F 401 ? LYS B 395 TYR B 405 1 ? 11 HELX_P HELX_P31 31 PRO F 417 ? LEU F 421 ? PRO B 421 LEU B 425 5 ? 5 HELX_P HELX_P32 32 GLU G 28 ? GLU G 44 ? GLU D 28 GLU D 44 1 ? 17 HELX_P HELX_P33 33 ARG G 78 ? ARG G 83 ? ARG D 78 ARG D 83 1 ? 6 HELX_P HELX_P34 34 PRO G 97 ? GLY G 99 ? PRO D 97 GLY D 99 5 ? 3 HELX_P HELX_P35 35 ALA G 114 ? SER G 117 ? ALA D 114 SER D 117 1 ? 4 HELX_P HELX_P36 36 GLU G 122 ? THR G 128 ? GLU D 122 THR D 128 1 ? 7 HELX_P HELX_P37 37 SER G 156 ? GLN G 174 ? SER D 156 GLN D 174 1 ? 19 HELX_P HELX_P38 38 ILE G 195 ? TRP G 212 ? ILE D 195 TRP D 212 1 ? 18 HELX_P HELX_P39 39 VAL G 254 ? GLN G 269 ? VAL D 254 GLN D 269 1 ? 16 HELX_P HELX_P40 40 ARG G 277 ? LEU G 283 ? ARG D 277 LEU D 283 1 ? 7 HELX_P HELX_P41 41 GLU G 297 ? LYS G 311 ? GLU D 297 LYS D 311 1 ? 15 HELX_P HELX_P42 42 ASP G 364 ? ILE G 382 ? ASP D 364 ILE D 382 1 ? 19 HELX_P HELX_P43 43 LYS G 395 ? THR G 403 ? LYS D 395 THR D 403 1 ? 9 HELX_P HELX_P44 44 ASN G 474 ? GLN G 487 ? ASN D 474 GLN D 487 1 ? 14 HELX_P HELX_P45 45 GLN G 500 ? ALA G 508 ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog57 hydrog ? ? C U 5 O2 ? ? ? 1_555 C G 20 N2 ? ? I U 8 I G 23 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-G MISPAIR' ? ? ? hydrog58 hydrog ? ? C C 6 N3 ? ? ? 1_555 C G 19 N1 ? ? I C 9 I G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog59 hydrog ? ? C C 6 N4 ? ? ? 1_555 C G 19 O6 ? ? I C 9 I G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog60 hydrog ? ? C C 6 O2 ? ? ? 1_555 C G 19 N2 ? ? I C 9 I G 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog61 hydrog ? ? C C 7 N3 ? ? ? 1_555 C G 18 N1 ? ? I C 10 I G 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog62 hydrog ? ? C C 7 N4 ? ? ? 1_555 C G 18 O6 ? ? I C 10 I G 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog63 hydrog ? ? C C 7 O2 ? ? ? 1_555 C G 18 N2 ? ? I C 10 I G 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog64 hydrog ? ? C G 8 N1 ? ? ? 1_555 C C 17 N3 ? ? I G 11 I C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog65 hydrog ? ? C G 8 N2 ? ? ? 1_555 C C 17 O2 ? ? I G 11 I C 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog66 hydrog ? ? 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? -79.18 29.77 116 1 PRO D 140 ? ? -114.00 -75.00 117 1 SER D 156 ? ? -14.97 -69.70 118 1 TYR D 183 ? ? -162.61 94.21 119 1 MET D 184 ? ? 70.49 -147.57 120 1 SER D 191 ? ? -171.88 136.55 121 1 ILE D 195 ? ? -38.64 -26.28 122 1 PRO D 217 ? ? -48.31 155.18 123 1 LYS D 219 ? ? -68.92 71.19 124 1 LYS D 220 ? ? -109.18 -107.92 125 1 GLN D 222 ? ? -7.90 -28.14 126 1 LYS D 223 ? ? -133.37 -72.79 127 1 GLU D 224 ? ? -33.86 120.03 128 1 LEU D 228 ? ? -102.90 78.46 129 1 GLU D 248 ? ? -154.75 83.95 130 1 ILE D 270 ? ? -136.89 -56.94 131 1 ILE D 274 ? ? -158.51 -14.89 132 1 LYS D 275 ? ? -34.32 103.46 133 1 VAL D 276 ? ? -78.54 47.08 134 1 THR D 296 ? ? -64.79 -165.47 135 1 HIS D 315 ? ? 178.19 166.43 136 1 PRO D 321 ? ? -76.13 28.44 137 1 SER D 322 ? ? -142.47 -7.16 138 1 GLN D 332 ? ? -72.22 35.00 139 1 PRO D 345 ? ? -0.25 -71.31 140 1 LYS D 347 ? ? -111.76 77.90 141 1 LEU D 349 ? ? -90.30 -64.25 142 1 MET D 357 ? ? -173.16 82.16 143 1 THR D 362 ? ? -118.64 -168.59 144 1 GLU D 399 ? ? -38.73 -39.93 145 1 TRP D 410 ? ? -174.86 139.29 146 1 PRO D 412 ? ? -79.75 -97.42 147 1 ASN D 418 ? ? -68.15 91.92 148 1 PRO D 420 ? ? -59.26 -75.16 149 1 ASP D 443 ? ? 176.73 148.91 150 1 GLN D 464 ? ? -161.49 92.04 151 1 ASN D 471 ? ? 46.76 74.41 152 1 HIS D 539 ? ? 66.28 -7.39 153 1 SER G 48 ? ? -174.70 144.43 154 1 PRO G 52 ? ? -66.13 13.83 155 1 ASN G 54 ? ? -34.16 100.81 156 1 ALA G 62 ? ? 136.62 124.04 157 1 LYS G 66 ? ? 73.28 54.29 158 1 ASP G 67 ? ? 174.97 91.34 159 1 SER G 68 ? ? 66.40 -150.49 160 1 THR G 69 ? ? -88.44 41.79 161 1 GLN G 85 ? ? -46.14 95.71 162 1 VAL G 90 ? ? -93.73 58.62 163 1 ALA G 114 ? ? -32.51 -37.75 164 1 PHE G 116 ? ? -47.39 -14.02 165 1 ASP G 123 ? ? -61.95 11.15 166 1 SER G 134 ? ? 35.24 -31.46 167 1 ILE G 135 ? ? -57.04 69.89 168 1 ASN G 136 ? ? 31.64 -75.22 169 1 ASN G 137 ? ? -147.05 -42.82 170 1 GLU G 138 ? ? -79.09 29.72 171 1 PRO G 140 ? ? -114.01 -75.01 172 1 SER G 156 ? ? -14.87 -69.74 173 1 TYR G 183 ? ? -162.65 94.14 174 1 MET G 184 ? ? 70.52 -147.56 175 1 SER G 191 ? ? -171.83 136.57 176 1 ILE G 195 ? ? -38.54 -26.37 177 1 PRO G 217 ? ? -48.38 155.24 178 1 LYS G 219 ? ? -68.96 71.21 179 1 LYS G 220 ? ? -109.25 -107.90 180 1 GLN G 222 ? ? -7.91 -28.09 181 1 LYS G 223 ? ? -133.39 -72.79 182 1 GLU G 224 ? ? -33.84 120.07 183 1 LEU G 228 ? ? -102.94 78.54 184 1 GLU G 248 ? ? -154.75 83.89 185 1 ILE G 270 ? ? -136.85 -56.97 186 1 ILE G 274 ? ? -158.48 -14.92 187 1 LYS G 275 ? ? -34.34 103.48 188 1 VAL G 276 ? ? -78.57 47.09 189 1 THR G 296 ? ? -64.82 -165.47 190 1 HIS G 315 ? ? 178.25 166.46 191 1 PRO G 321 ? ? -76.17 28.45 192 1 SER G 322 ? ? -142.50 -7.18 193 1 GLN G 332 ? ? -72.26 35.06 194 1 PRO G 345 ? ? -0.24 -71.33 195 1 LYS G 347 ? ? -111.81 77.91 196 1 LEU G 349 ? ? -90.28 -64.33 197 1 MET G 357 ? ? -173.16 82.23 198 1 THR G 362 ? ? -118.67 -168.60 199 1 TRP G 410 ? ? -174.88 139.21 200 1 PRO G 412 ? ? -79.73 -97.46 201 1 ASN G 418 ? ? -68.15 91.89 202 1 PRO G 420 ? ? -59.21 -75.24 203 1 ASP G 443 ? ? 176.76 148.89 204 1 GLN G 464 ? ? -161.50 92.12 205 1 ASN G 471 ? ? 46.81 74.36 206 1 HIS G 539 ? ? 66.34 -7.43 207 1 SER J 48 ? ? -174.67 144.47 208 1 PRO J 52 ? ? -66.17 13.92 209 1 ASN J 54 ? ? -34.14 100.85 210 1 ALA J 62 ? ? 136.60 124.03 211 1 LYS J 66 ? ? 73.32 54.29 212 1 ASP J 67 ? ? 174.98 91.41 213 1 SER J 68 ? ? 66.40 -150.49 214 1 THR J 69 ? ? -88.43 41.75 215 1 GLN J 85 ? ? -46.09 95.74 216 1 VAL J 90 ? ? -93.80 58.72 217 1 ALA J 114 ? ? -32.51 -37.77 218 1 PHE J 116 ? ? -47.37 -14.06 219 1 ASP J 123 ? ? -61.93 11.14 220 1 SER J 134 ? ? 35.20 -31.48 221 1 ILE J 135 ? ? -57.01 69.90 222 1 ASN J 136 ? ? 31.68 -75.25 223 1 ASN J 137 ? ? -147.06 -42.82 224 1 GLU J 138 ? ? -79.14 29.70 225 1 PRO J 140 ? ? -113.99 -75.04 226 1 SER J 156 ? ? -14.89 -69.80 227 1 TYR J 183 ? ? -162.61 94.11 228 1 MET J 184 ? ? 70.58 -147.57 229 1 SER J 191 ? ? -171.81 136.53 230 1 ILE J 195 ? ? -38.61 -26.31 231 1 PRO J 217 ? ? -48.33 155.18 232 1 LYS J 219 ? ? -69.00 71.24 233 1 LYS J 220 ? ? -109.27 -107.92 234 1 GLN J 222 ? ? -7.97 -28.05 235 1 LYS J 223 ? ? -133.39 -72.74 236 1 GLU J 224 ? ? -33.96 120.12 237 1 LEU J 228 ? ? -102.90 78.52 238 1 GLU J 248 ? ? -154.73 83.92 239 1 ILE J 270 ? ? -136.80 -57.00 240 1 ILE J 274 ? ? -158.49 -14.82 241 1 LYS J 275 ? ? -34.38 103.50 242 1 VAL J 276 ? ? -78.51 47.00 243 1 THR J 296 ? ? -64.76 -165.44 244 1 HIS J 315 ? ? 178.25 166.44 245 1 PRO J 321 ? ? -76.23 28.45 246 1 SER J 322 ? ? -142.47 -7.16 247 1 GLN J 332 ? ? -72.29 35.03 248 1 PRO J 345 ? ? -0.18 -71.37 249 1 LYS J 347 ? ? -111.87 77.88 250 1 LEU J 349 ? ? -90.30 -64.29 251 1 MET J 357 ? ? -173.22 82.16 252 1 THR J 362 ? ? -118.67 -168.59 253 1 TRP J 410 ? ? -174.89 139.18 254 1 PRO J 412 ? ? -79.64 -97.49 255 1 ASN J 418 ? ? -68.14 91.91 256 1 PRO J 420 ? ? -59.21 -75.23 257 1 ASP J 443 ? ? 176.77 148.95 258 1 GLN J 464 ? ? -161.46 92.03 259 1 ASN J 471 ? ? 46.69 74.36 260 1 HIS J 539 ? ? 66.25 -7.38 261 1 LYS E 20 ? ? -143.42 55.40 262 1 GLU E 28 ? ? -44.50 -14.05 263 1 ILE E 47 ? ? -122.74 -167.17 264 1 SER E 48 ? ? -175.44 138.45 265 1 PRO E 55 ? ? -47.27 -8.79 266 1 ASN E 57 ? ? -173.92 137.32 267 1 LYS E 66 ? ? 45.98 -112.67 268 1 SER E 68 ? ? 61.13 81.37 269 1 THR E 69 ? ? -95.71 -64.36 270 1 PHE E 77 ? ? -55.96 -1.34 271 1 TRP E 88 ? ? -163.14 -33.23 272 1 GLN E 91 ? ? -49.20 109.16 273 1 ILE E 94 ? ? -30.40 -136.68 274 1 ALA E 98 ? ? 77.86 -17.63 275 1 PHE E 116 ? ? -67.34 13.25 276 1 ASP E 123 ? ? -66.73 30.94 277 1 PHE E 124 ? ? -142.32 -18.90 278 1 ASN E 136 ? ? 61.09 -2.43 279 1 SER E 156 ? ? -38.27 -72.06 280 1 GLU E 169 ? ? -25.44 -51.30 281 1 PRO E 176 ? ? -43.67 -5.18 282 1 MET E 184 ? ? 54.38 -110.78 283 1 ASP E 237 ? ? -54.03 -8.93 284 1 ASP E 250 ? ? -153.93 -37.25 285 1 SER E 251 ? ? -80.07 44.11 286 1 TRP E 252 ? ? -67.28 98.09 287 1 LYS E 259 ? ? -51.82 -71.77 288 1 ARG E 277 ? ? -167.12 -56.87 289 1 THR E 286 ? ? -170.20 38.66 290 1 PRO E 313 ? ? -36.74 129.13 291 1 HIS E 315 ? ? -64.87 90.72 292 1 PRO E 321 ? ? -47.68 -18.09 293 1 GLN E 334 ? ? -84.15 34.12 294 1 PHE E 346 ? ? 83.19 2.75 295 1 LYS E 347 ? ? -115.41 67.83 296 1 MET E 357 ? ? -64.78 92.16 297 1 HIS E 361 ? ? -76.58 43.62 298 1 THR E 362 ? ? -83.08 33.56 299 1 ILE E 382 ? ? -100.05 -80.65 300 1 PRO E 420 ? ? -81.64 -158.05 301 1 PRO E 421 ? ? -69.05 22.91 302 1 TRP E 426 ? ? -175.47 97.61 303 1 LYS H 20 ? ? -143.43 55.45 304 1 GLU H 28 ? ? -44.34 -14.15 305 1 ILE H 47 ? ? -122.76 -167.16 306 1 SER H 48 ? ? -175.43 138.45 307 1 PRO H 55 ? ? -47.16 -8.87 308 1 ASN H 57 ? ? -173.92 137.31 309 1 LYS H 66 ? ? 45.97 -112.61 310 1 SER H 68 ? ? 61.23 81.39 311 1 THR H 69 ? ? -95.70 -64.36 312 1 PHE H 77 ? ? -55.87 -1.44 313 1 TRP H 88 ? ? -163.07 -33.25 314 1 GLN H 91 ? ? -49.17 109.16 315 1 ILE H 94 ? ? -30.32 -136.66 316 1 ALA H 98 ? ? 77.94 -17.67 317 1 PHE H 116 ? ? -67.35 13.22 318 1 ASP H 123 ? ? -66.77 30.96 319 1 PHE H 124 ? ? -142.34 -18.87 320 1 ASN H 136 ? ? 61.12 -2.54 321 1 SER H 156 ? ? -38.29 -72.05 322 1 GLU H 169 ? ? -25.44 -51.30 323 1 PRO H 176 ? ? -43.67 -5.17 324 1 MET H 184 ? ? 54.41 -110.81 325 1 ASP H 237 ? ? -53.99 -8.96 326 1 ASP H 250 ? 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