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SER F . n F 1 588 VAL 588 588 588 VAL VAL F . n F 1 589 PRO 589 589 589 PRO PRO F . n F 1 590 PRO 590 590 590 PRO PRO F . n F 1 591 VAL 591 591 591 VAL VAL F . n F 1 592 ILE 592 592 592 ILE ILE F . n F 1 593 GLY 593 593 593 GLY GLY F . n F 1 594 SER 594 594 594 SER SER F . n F 1 595 GLN 595 595 595 GLN GLN F . n F 1 596 ILE 596 596 596 ILE ILE F . n F 1 597 VAL 597 597 597 VAL VAL F . n F 1 598 THR 598 598 598 THR THR F . n F 1 599 LYS 599 599 599 LYS LYS F . n F 1 600 LEU 600 600 600 LEU LEU F . n F 1 601 VAL 601 601 601 VAL VAL F . n F 1 602 THR 602 602 602 THR THR F . n F 1 603 GLU 603 603 603 GLU GLU F . n F 1 604 THR 604 604 604 THR THR F . n F 1 605 ALA 605 605 605 ALA ALA F . n F 1 606 LYS 606 606 606 LYS LYS F . n F 1 607 ASP 607 607 607 ASP ASP F . n F 1 608 LEU 608 608 608 LEU LEU F . n F 1 609 VAL 609 609 609 VAL VAL F . n F 1 610 GLY 610 610 610 GLY GLY F . n F 1 611 GLY 611 611 611 GLY GLY F . n F 1 612 TYR 612 612 612 TYR TYR F . n F 1 613 PHE 613 613 613 PHE PHE F . n F 1 614 ILE 614 614 614 ILE ILE F . n F 1 615 VAL 615 615 615 VAL VAL F . n F 1 616 ASP 616 616 616 ASP ASP F . n F 1 617 THR 617 617 617 THR THR F . n F 1 618 ASP 618 618 618 ASP ASP F . n F 1 619 PRO 619 619 619 PRO PRO F . n F 1 620 LYS 620 620 620 LYS LYS F . n F 1 621 SER 621 621 621 SER SER F . n F 1 622 ALA 622 622 622 ALA ALA F . n F 1 623 GLY 623 623 623 GLY GLY F . n F 1 624 ASP 624 624 624 ASP ASP F . n F 1 625 LYS 625 625 625 LYS LYS F . n F 1 626 LEU 626 626 626 LEU LEU F . n F 1 627 TYR 627 627 627 TYR TYR F . n F 1 628 ALA 628 628 628 ALA ALA F . n F 1 629 ALA 629 629 629 ALA ALA F . n F 1 630 ILE 630 630 630 ILE ILE F . n F 1 631 GLN 631 631 631 GLN GLN F . n F 1 632 GLU 632 632 632 GLU GLU F . n F 1 633 ARG 633 633 633 ARG ARG F . n F 1 634 ARG 634 634 634 ARG ARG F . n F 1 635 ALA 635 635 635 ALA ALA F . n F 1 636 GLY 636 636 636 GLY GLY F . n F 1 637 LEU 637 637 637 LEU LEU F . n F 1 638 GLY 638 638 ? ? ? F . n F 1 639 LEU 639 639 ? ? ? F . n # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 2 FE2 1 801 801 FE2 FC2 A . H 3 SF4 1 700 700 SF4 FS4 A . I 3 SF4 1 750 750 SF4 FS4 A . J 4 WCC 1 800 800 WCC WCC A . K 5 UNX 1 802 800 UNX WCC A . L 2 FE2 1 801 801 FE2 FC2 B . M 3 SF4 1 750 750 SF4 FS4 B . N 4 WCC 1 800 800 WCC WCC B . O 5 UNX 1 802 800 UNX WCC B . P 2 FE2 1 801 801 FE2 FC2 C . Q 3 SF4 1 701 700 SF4 FS4 C . R 3 SF4 1 750 750 SF4 FS4 C . S 4 WCC 1 800 800 WCC WCC C . T 5 UNX 1 802 800 UNX WCC C . U 2 FE2 1 801 801 FE2 FC2 D . V 3 SF4 1 750 750 SF4 FS4 D . W 4 WCC 1 800 800 WCC WCC D . X 5 UNX 1 802 800 UNX WCC D . Y 2 FE2 1 801 801 FE2 FC2 E . Z 3 SF4 1 702 700 SF4 FS4 E . AA 3 SF4 1 750 750 SF4 FS4 E . 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F GLU 348 OE2 # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal SOLVE phasing . ? 1 SHARP phasing . ? 2 DM 'model building' . ? 3 CNS refinement 1.0 ? 4 DENZO 'data reduction' . ? 5 SCALEPACK 'data scaling' . ? 6 DM phasing . ? 7 # _cell.entry_id 1JQK _cell.length_a 92.6 _cell.length_b 200.1 _cell.length_c 116.8 _cell.angle_alpha 90.0 _cell.angle_beta 111.5 _cell.angle_gamma 90.0 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1JQK _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 # _exptl.entry_id 1JQK _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews 2.51 _exptl_crystal.density_percent_sol 50.92 _exptl_crystal.description ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'capillary crystallization' _exptl_crystal_grow.temp 298.0 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 7.5 _exptl_crystal_grow.pdbx_details ;10% PEG 8000, 0.1 M Tris buffer, 0.4 M calcium chloride, 5% 2-methyl-2,4-pentanediol, pH 7.5, capillary crystallization, temperature 298.0K ; _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range . # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 100 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'BRANDEIS - B4' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2000-07-30 _diffrn_detector.details 'condensing mirror' # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator 'two crystal non-dispersive monochromator' _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 1.3 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'NSLS BEAMLINE X25' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site NSLS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline X25 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 1.3 # _reflns.entry_id 1JQK _reflns.observed_criterion_sigma_I -1 _reflns.observed_criterion_sigma_F -1 _reflns.d_resolution_low 100.0 _reflns.d_resolution_high 2.8 _reflns.number_obs 90759 _reflns.number_all ? _reflns.percent_possible_obs 94.0 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs ? _reflns.pdbx_Rsym_value 0.0860000 _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 8.6 _reflns.B_iso_Wilson_estimate 63.5 _reflns.pdbx_redundancy 2.5 _reflns.R_free_details ? _reflns.limit_h_max ? _reflns.limit_h_min ? _reflns.limit_k_max ? _reflns.limit_k_min ? _reflns.limit_l_max ? _reflns.limit_l_min ? _reflns.observed_criterion_F_max ? _reflns.observed_criterion_F_min ? _reflns.pdbx_diffrn_id 1 _reflns.pdbx_ordinal 1 # _reflns_shell.d_res_high 2.80 _reflns_shell.d_res_low 2.90 _reflns_shell.percent_possible_all 80.8 _reflns_shell.Rmerge_I_obs ? _reflns_shell.pdbx_Rsym_value 0.3560000 _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 1.6 _reflns_shell.pdbx_redundancy 2.1 _reflns_shell.percent_possible_obs ? _reflns_shell.number_unique_all 7792 _reflns_shell.pdbx_diffrn_id ? _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 # _refine.entry_id 1JQK _refine.ls_number_reflns_obs 74708 _refine.ls_number_reflns_all 90727 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F 2.0 _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.ls_d_res_low 100.0 _refine.ls_d_res_high 2.8 _refine.ls_percent_reflns_obs 76.9 _refine.ls_R_factor_obs 0.2590000 _refine.ls_R_factor_all 0.2760000 _refine.ls_R_factor_R_work 0.2570000 _refine.ls_R_factor_R_free 0.2870000 _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free 5.0 _refine.ls_number_reflns_R_free 3716 _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.B_iso_mean 47.6 _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.details ;bulk solvent correction, NCS restraints, maximum likelihood target, cartesian molecular dynamics. There are 3 homodimers in the asymmetric unit: chains A&B, C&D, and E&F. Molecules C&D, E&F have lower B-factors than A&B, and are the molecules that should be considered in structural analyses. No side chain density was seen for residue 348. ; _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct MAD _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'Engh & Huber' _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details Random _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_B ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.B_iso_min ? _refine.B_iso_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 26766 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 0 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 132 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 26898 _refine_hist.d_res_high 2.8 _refine_hist.d_res_low 100.0 # loop_ _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function c_bond_d 0.008 ? ? ? 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'X-RAY DIFFRACTION' ? # _database_PDB_matrix.entry_id 1JQK _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _struct.entry_id 1JQK _struct.title 'Crystal structure of carbon monoxide dehydrogenase from Rhodospirillum rubrum' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1JQK _struct_keywords.pdbx_keywords OXIDOREDUCTASE _struct_keywords.text 'Rossmann fold, OXIDOREDUCTASE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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ASP F 618 GLY F 636 1 ? 19 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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B CYS 531 SG ? ? ? 1_555 L FE2 . FE ? ? B CYS 531 B FE2 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? ? metalc29 metalc ? ? N WCC . S3 ? ? ? 1_555 L FE2 . FE ? ? B WCC 800 B FE2 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? ? metalc30 metalc ? ? N WCC . NI ? ? ? 1_555 O UNX . UNK ? ? B WCC 800 B UNX 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.887 ? ? metalc31 metalc ? ? C CYS 41 SG ? ? ? 1_555 Q SF4 . FE2 ? ? C CYS 41 C SF4 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.294 ? ? metalc32 metalc ? ? C CYS 49 SG ? ? ? 1_555 Q SF4 . FE3 ? ? C CYS 49 C SF4 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.222 ? ? metalc33 metalc ? ? C CYS 50 SG ? ? ? 1_555 R SF4 . FE2 ? ? C CYS 50 C SF4 750 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? ? metalc34 metalc ? ? C CYS 53 SG ? ? ? 1_555 R SF4 . FE3 ? ? C CYS 53 C SF4 750 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? ? metalc35 metalc ? ? C CYS 58 SG ? ? ? 1_555 R SF4 . FE1 ? ? C CYS 58 C SF4 750 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? ? metalc36 metalc ? ? C CYS 72 SG ? ? ? 1_555 R SF4 . FE4 ? ? C CYS 72 C SF4 750 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? ? metalc37 metalc ? ? C HIS 265 NE2 ? ? ? 1_555 P FE2 . FE ? ? C HIS 265 C FE2 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.930 ? ? metalc38 metalc ? ? C CYS 300 SG ? ? ? 1_555 P FE2 . FE ? ? C CYS 300 C FE2 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.908 ? ? metalc39 metalc ? ? C CYS 338 SG ? ? ? 1_555 S WCC . FE1 ? ? C CYS 338 C WCC 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? ? metalc40 metalc ? ? C CYS 451 SG ? ? ? 1_555 S WCC . FE3 ? ? C CYS 451 C WCC 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.223 ? ? metalc41 metalc ? ? C CYS 481 SG ? ? ? 1_555 S WCC . FE4 ? ? C CYS 481 C WCC 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.207 ? ? metalc42 metalc ? ? C CYS 531 SG ? ? ? 1_555 S WCC . NI ? ? C CYS 531 C WCC 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.206 ? ? metalc43 metalc ? ? C CYS 531 SG ? ? ? 1_555 P FE2 . FE ? ? C CYS 531 C FE2 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.549 ? ? metalc44 metalc ? ? Q SF4 . FE4 ? ? ? 1_555 D CYS 41 SG ? ? C SF4 701 D CYS 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? ? metalc45 metalc ? ? Q SF4 . FE1 ? ? ? 1_555 D CYS 49 SG ? ? C SF4 701 D CYS 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? ? metalc46 metalc ? ? S WCC . S3 ? ? ? 1_555 P FE2 . FE ? ? C WCC 800 C FE2 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? metalc47 metalc ? ? S WCC . NI ? ? ? 1_555 T UNX . UNK ? ? C WCC 800 C UNX 802 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.843 ? ? metalc48 metalc ? ? D CYS 50 SG ? ? ? 1_555 V SF4 . FE2 ? ? D CYS 50 D SF4 750 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.203 ? ? metalc49 metalc ? ? D CYS 53 SG ? ? ? 1_555 V SF4 . FE3 ? ? D CYS 53 D SF4 750 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? ? metalc50 metalc ? ? D CYS 58 SG ? ? ? 1_555 V SF4 . FE1 ? ? D CYS 58 D SF4 750 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? ? metalc51 metalc ? ? D CYS 72 SG ? ? ? 1_555 V SF4 . FE4 ? ? D CYS 72 D SF4 750 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.224 ? ? metalc52 metalc ? ? D HIS 265 NE2 ? ? ? 1_555 U FE2 . FE ? ? D HIS 265 D FE2 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.006 ? ? metalc53 metalc ? ? D CYS 300 SG ? ? ? 1_555 U FE2 . FE ? ? D CYS 300 D FE2 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.970 ? ? metalc54 metalc ? ? D CYS 338 SG ? ? ? 1_555 W WCC . FE1 ? ? D CYS 338 D WCC 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? ? metalc55 metalc ? ? 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? -28.89 -70.69 95 1 LYS B 506 ? ? -38.19 -30.63 96 1 LEU B 518 ? ? -83.96 -107.17 97 1 ASP B 533 ? ? -65.53 10.57 98 1 SER B 553 ? ? -65.54 2.22 99 1 MET B 565 ? ? -147.89 -40.51 100 1 VAL B 588 ? ? 74.42 90.15 101 1 PRO B 590 ? ? -58.81 65.18 102 1 GLU B 603 ? ? -139.25 -53.34 103 1 ASP B 607 ? ? -85.24 -73.74 104 1 ASP B 616 ? ? -162.52 117.75 105 1 LEU C 48 ? ? -95.69 35.24 106 1 GLU C 65 ? ? 28.19 56.29 107 1 ILE C 119 ? ? -61.41 95.81 108 1 GLU C 137 ? ? -32.09 114.97 109 1 LEU C 142 ? ? -61.05 7.59 110 1 PRO C 164 ? ? -49.23 155.59 111 1 ASN C 189 ? ? -161.69 118.57 112 1 CYS C 205 ? ? -119.01 -126.65 113 1 PRO C 243 ? ? -39.63 128.11 114 1 ASN C 249 ? ? 69.77 161.85 115 1 ASP C 279 ? ? -48.25 -70.76 116 1 LEU C 280 ? ? -64.94 18.14 117 1 GLU C 283 ? ? -38.19 -30.08 118 1 ALA C 287 ? ? -57.06 -2.09 119 1 CYS C 299 ? ? 63.93 -151.34 120 1 VAL C 311 ? ? -25.55 114.48 121 1 ASN C 316 ? ? -93.62 -143.23 122 1 TYR C 317 ? ? -65.83 -70.47 123 1 ASP C 335 ? ? -109.16 -79.55 124 1 GLN C 337 ? ? 49.03 144.36 125 1 CYS C 338 ? ? 70.11 31.38 126 1 PHE C 350 ? ? -129.54 -147.61 127 1 HIS C 360 ? ? -99.02 31.59 128 1 ASN C 361 ? ? -156.45 61.65 129 1 ALA C 376 ? ? -48.14 -72.56 130 1 ALA C 400 ? ? -174.36 92.30 131 1 PHE C 404 ? ? -37.95 110.05 132 1 LYS C 423 ? ? -69.28 23.87 133 1 VAL C 424 ? ? -144.62 -7.12 134 1 ASN C 425 ? ? 174.20 87.95 135 1 CYS C 451 ? ? -105.16 -142.83 136 1 GLN C 458 ? ? 0.30 -84.95 137 1 GLU C 503 ? ? -28.91 -71.17 138 1 LYS C 506 ? ? -38.15 -30.23 139 1 ASP C 533 ? ? -65.72 10.21 140 1 SER C 553 ? ? -65.56 1.23 141 1 MET C 565 ? ? -149.79 -40.96 142 1 VAL C 588 ? ? 74.72 88.84 143 1 PRO C 590 ? ? -59.10 65.76 144 1 GLU C 603 ? ? -139.33 -52.42 145 1 ASP C 607 ? ? -85.51 -73.58 146 1 ASP C 616 ? ? -161.31 117.77 147 1 LEU D 48 ? ? -97.79 38.02 148 1 GLU D 65 ? ? 29.55 55.76 149 1 LEU D 114 ? ? 45.60 91.47 150 1 LEU D 141 ? ? -161.32 -70.07 151 1 PRO D 164 ? ? -49.80 156.79 152 1 CYS D 205 ? ? -120.75 -128.37 153 1 PRO D 243 ? ? -39.62 130.02 154 1 ASN D 249 ? 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? -24.92 114.68 245 1 ASN F 316 ? ? -94.97 -142.61 246 1 TYR F 317 ? ? -65.24 -72.95 247 1 ASP F 335 ? ? -110.20 -78.89 248 1 GLN F 337 ? ? 48.67 143.84 249 1 PHE F 350 ? ? -128.22 -147.24 250 1 HIS F 360 ? ? -99.55 30.67 251 1 ASN F 361 ? ? -154.79 62.16 252 1 ALA F 376 ? ? -46.72 -72.90 253 1 ALA F 400 ? ? -175.77 92.22 254 1 PHE F 404 ? ? -37.13 109.79 255 1 LYS F 423 ? ? -69.13 23.98 256 1 VAL F 424 ? ? -145.26 -4.54 257 1 ASN F 425 ? ? 171.61 87.83 258 1 CYS F 451 ? ? -106.92 -144.59 259 1 GLN F 458 ? ? 0.12 -84.40 260 1 ARG F 472 ? ? -70.91 20.52 261 1 GLU F 503 ? ? -29.23 -70.51 262 1 LYS F 506 ? ? -38.94 -30.07 263 1 LEU F 518 ? ? 64.80 -31.81 264 1 ASP F 533 ? ? -65.92 9.73 265 1 SER F 553 ? ? -66.29 2.49 266 1 MET F 565 ? ? -149.53 -41.36 267 1 VAL F 588 ? ? 74.21 88.05 268 1 PRO F 590 ? ? -59.66 65.23 269 1 GLU F 603 ? ? -139.61 -53.62 270 1 ASP F 607 ? ? -84.30 -73.83 271 1 ASP F 616 ? ? -163.40 117.77 # _pdbx_validate_planes.id 1 _pdbx_validate_planes.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_planes.auth_comp_id TYR _pdbx_validate_planes.auth_asym_id E _pdbx_validate_planes.auth_seq_id 126 _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code ? _pdbx_validate_planes.label_alt_id ? _pdbx_validate_planes.rmsd 0.067 _pdbx_validate_planes.type 'SIDE CHAIN' # _pdbx_database_remark.id 600 _pdbx_database_remark.text ;HETEROGEN The ligand WCC is a Ni-Fe-S cubane. There is an unidentified ligand, UNX, bound to the Ni of the WCC. There is also a FE2 bound to the cubane. The C-cluster, as it is called, has a single iron site (FE2) and a four-metal cubane (Ni-Fe-S). ; # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET 1 ? A MET 1 2 1 Y 1 A THR 2 ? A THR 2 3 1 Y 1 A HIS 3 ? A HIS 3 4 1 Y 1 A HIS 4 ? A HIS 4 5 1 Y 1 A ASP 5 ? A ASP 5 6 1 Y 1 A CYS 6 ? A CYS 6 7 1 Y 1 A ALA 7 ? A ALA 7 8 1 Y 1 A HIS 8 ? A HIS 8 9 1 Y 1 A CYS 9 ? A CYS 9 10 1 Y 1 A SER 10 ? A SER 10 11 1 Y 1 A SER 11 ? A SER 11 12 1 Y 1 A ASP 12 ? A ASP 12 13 1 Y 1 A ALA 13 ? A ALA 13 14 1 Y 1 A CYS 14 ? A CYS 14 15 1 Y 1 A ALA 15 ? A ALA 15 16 1 Y 1 A THR 16 ? A THR 16 17 1 Y 1 A GLU 17 ? A GLU 17 18 1 Y 1 A MET 18 ? A MET 18 19 1 Y 1 A LEU 19 ? A LEU 19 20 1 Y 1 A ASN 20 ? A ASN 20 21 1 Y 1 A LEU 21 ? A LEU 21 22 1 Y 1 A ALA 22 ? A ALA 22 23 1 Y 1 A GLU 23 ? A GLU 23 24 1 Y 1 A ALA 24 ? A ALA 24 25 1 Y 1 A ASN 25 ? A ASN 25 26 1 Y 1 A SER 26 ? A SER 26 27 1 Y 1 A ILE 27 ? A ILE 27 28 1 Y 1 A GLY 638 ? A GLY 638 29 1 Y 1 A LEU 639 ? A LEU 639 30 1 Y 1 B MET 1 ? B MET 1 31 1 Y 1 B THR 2 ? B THR 2 32 1 Y 1 B HIS 3 ? B HIS 3 33 1 Y 1 B HIS 4 ? B HIS 4 34 1 Y 1 B ASP 5 ? B ASP 5 35 1 Y 1 B CYS 6 ? B CYS 6 36 1 Y 1 B ALA 7 ? B ALA 7 37 1 Y 1 B HIS 8 ? B HIS 8 38 1 Y 1 B CYS 9 ? B CYS 9 39 1 Y 1 B SER 10 ? B SER 10 40 1 Y 1 B SER 11 ? B SER 11 41 1 Y 1 B ASP 12 ? B ASP 12 42 1 Y 1 B ALA 13 ? B ALA 13 43 1 Y 1 B CYS 14 ? B CYS 14 44 1 Y 1 B ALA 15 ? B ALA 15 45 1 Y 1 B THR 16 ? 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D SER 26 114 1 Y 1 D ILE 27 ? D ILE 27 115 1 Y 1 D GLY 638 ? D GLY 638 116 1 Y 1 D LEU 639 ? D LEU 639 117 1 Y 1 E MET 1 ? E MET 1 118 1 Y 1 E THR 2 ? E THR 2 119 1 Y 1 E HIS 3 ? E HIS 3 120 1 Y 1 E HIS 4 ? E HIS 4 121 1 Y 1 E ASP 5 ? E ASP 5 122 1 Y 1 E CYS 6 ? E CYS 6 123 1 Y 1 E ALA 7 ? E ALA 7 124 1 Y 1 E HIS 8 ? E HIS 8 125 1 Y 1 E CYS 9 ? E CYS 9 126 1 Y 1 E SER 10 ? E SER 10 127 1 Y 1 E SER 11 ? E SER 11 128 1 Y 1 E ASP 12 ? E ASP 12 129 1 Y 1 E ALA 13 ? E ALA 13 130 1 Y 1 E CYS 14 ? E CYS 14 131 1 Y 1 E ALA 15 ? E ALA 15 132 1 Y 1 E THR 16 ? E THR 16 133 1 Y 1 E GLU 17 ? E GLU 17 134 1 Y 1 E MET 18 ? E MET 18 135 1 Y 1 E LEU 19 ? E LEU 19 136 1 Y 1 E ASN 20 ? E ASN 20 137 1 Y 1 E LEU 21 ? E LEU 21 138 1 Y 1 E ALA 22 ? E ALA 22 139 1 Y 1 E GLU 23 ? E GLU 23 140 1 Y 1 E ALA 24 ? E ALA 24 141 1 Y 1 E ASN 25 ? E ASN 25 142 1 Y 1 E SER 26 ? E SER 26 143 1 Y 1 E ILE 27 ? E ILE 27 144 1 Y 1 E GLY 638 ? E GLY 638 145 1 Y 1 E LEU 639 ? E LEU 639 146 1 Y 1 F MET 1 ? F MET 1 147 1 Y 1 F THR 2 ? F THR 2 148 1 Y 1 F HIS 3 ? F HIS 3 149 1 Y 1 F HIS 4 ? F HIS 4 150 1 Y 1 F ASP 5 ? F ASP 5 151 1 Y 1 F CYS 6 ? F CYS 6 152 1 Y 1 F ALA 7 ? F ALA 7 153 1 Y 1 F HIS 8 ? F HIS 8 154 1 Y 1 F CYS 9 ? F CYS 9 155 1 Y 1 F SER 10 ? F SER 10 156 1 Y 1 F SER 11 ? F SER 11 157 1 Y 1 F ASP 12 ? F ASP 12 158 1 Y 1 F ALA 13 ? F ALA 13 159 1 Y 1 F CYS 14 ? F CYS 14 160 1 Y 1 F ALA 15 ? F ALA 15 161 1 Y 1 F THR 16 ? F THR 16 162 1 Y 1 F GLU 17 ? F GLU 17 163 1 Y 1 F MET 18 ? F MET 18 164 1 Y 1 F LEU 19 ? F LEU 19 165 1 Y 1 F ASN 20 ? F ASN 20 166 1 Y 1 F LEU 21 ? F LEU 21 167 1 Y 1 F ALA 22 ? F ALA 22 168 1 Y 1 F GLU 23 ? F GLU 23 169 1 Y 1 F ALA 24 ? F ALA 24 170 1 Y 1 F ASN 25 ? F ASN 25 171 1 Y 1 F SER 26 ? F SER 26 172 1 Y 1 F ILE 27 ? F ILE 27 173 1 Y 1 F GLY 638 ? F GLY 638 174 1 Y 1 F LEU 639 ? F LEU 639 # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_ordinal ALA N N N N 1 ALA CA C N S 2 ALA C C N N 3 ALA O O N N 4 ALA CB C N N 5 ALA OXT O N N 6 ALA H H N N 7 ALA H2 H N N 8 ALA HA H N N 9 ALA HB1 H N N 10 ALA HB2 H N N 11 ALA HB3 H N N 12 ALA HXT H N N 13 ARG N N N N 14 ARG CA C N S 15 ARG C C N N 16 ARG O O N N 17 ARG CB C N N 18 ARG CG C N N 19 ARG CD C N N 20 ARG NE N N N 21 ARG CZ C N N 22 ARG NH1 N N N 23 ARG NH2 N N N 24 ARG OXT O N N 25 ARG H H N N 26 ARG H2 H N N 27 ARG HA H N N 28 ARG HB2 H N N 29 ARG HB3 H N N 30 ARG HG2 H N N 31 ARG HG3 H N N 32 ARG HD2 H N N 33 ARG HD3 H N N 34 ARG HE H N N 35 ARG HH11 H N N 36 ARG HH12 H N N 37 ARG HH21 H N N 38 ARG HH22 H N N 39 ARG HXT H N N 40 ASN N N N N 41 ASN CA C N S 42 ASN C C N N 43 ASN O O N N 44 ASN CB C N N 45 ASN CG C N N 46 ASN OD1 O N N 47 ASN ND2 N N N 48 ASN OXT O N N 49 ASN H H N N 50 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