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'A-A MISPAIR' ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _database_PDB_matrix.entry_id 1K4A _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _atom_sites.entry_id 1K4A _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C H N O P # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 G 1 1 1 G G A . n A 1 2 G 2 2 2 G G A . n A 1 3 U 3 3 3 U U A . n A 1 4 U 4 4 4 U U A . n A 1 5 C 5 5 5 C C A . n A 1 6 A 6 6 6 A A A . n A 1 7 G 7 7 7 G G A . n A 1 8 A 8 8 8 A A A . n A 1 9 A 9 9 9 A A A . n A 1 10 G 10 10 10 G G A . n A 1 11 A 11 11 11 A A A . n A 1 12 A 12 12 12 A A A . n A 1 13 C 13 13 13 C C A . n A 1 14 C 14 14 14 C C A . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? 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? 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N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.70 106.40 -2.70 0.40 N 16 2 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.68 113.10 4.58 0.50 N 17 2 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.71 106.40 -2.69 0.40 N 18 2 N7 A A 6 ? ? C8 A A 6 ? ? N9 A A 6 ? ? 117.56 113.80 3.76 0.50 N 19 2 N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? 117.70 113.10 4.60 0.50 N 20 2 C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 103.70 106.40 -2.70 0.40 N 21 2 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.43 113.80 3.63 0.50 N 22 2 N7 A A 9 ? ? C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 117.51 113.80 3.71 0.50 N 23 2 N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 117.64 113.10 4.54 0.50 N 24 2 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.77 106.40 -2.63 0.40 N 25 2 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 117.48 113.80 3.68 0.50 N 26 2 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.56 113.80 3.76 0.50 N 27 3 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.60 113.10 4.50 0.50 N 28 3 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.79 106.40 -2.61 0.40 N 29 3 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.52 113.10 4.42 0.50 N 30 3 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.86 106.40 -2.54 0.40 N 31 3 N7 A A 6 ? ? C8 A A 6 ? ? N9 A A 6 ? ? 117.51 113.80 3.71 0.50 N 32 3 N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? 117.78 113.10 4.68 0.50 N 33 3 C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 103.67 106.40 -2.73 0.40 N 34 3 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.37 113.80 3.57 0.50 N 35 3 N7 A A 9 ? ? C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 117.51 113.80 3.71 0.50 N 36 3 N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 117.65 113.10 4.55 0.50 N 37 3 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.77 106.40 -2.63 0.40 N 38 3 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 117.54 113.80 3.74 0.50 N 39 3 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.59 113.80 3.79 0.50 N 40 4 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.59 113.10 4.49 0.50 N 41 4 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.79 106.40 -2.61 0.40 N 42 4 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.67 113.10 4.57 0.50 N 43 4 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.79 106.40 -2.61 0.40 N 44 4 N7 A A 6 ? ? C8 A A 6 ? ? N9 A A 6 ? ? 117.50 113.80 3.70 0.50 N 45 4 N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? 117.83 113.10 4.73 0.50 N 46 4 C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 103.62 106.40 -2.78 0.40 N 47 4 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.43 113.80 3.63 0.50 N 48 4 N7 A A 9 ? ? C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 117.54 113.80 3.74 0.50 N 49 4 N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 117.59 113.10 4.49 0.50 N 50 4 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.77 106.40 -2.63 0.40 N 51 4 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 117.51 113.80 3.71 0.50 N 52 4 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.57 113.80 3.77 0.50 N 53 5 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.64 113.10 4.54 0.50 N 54 5 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.76 106.40 -2.64 0.40 N 55 5 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.62 113.10 4.52 0.50 N 56 5 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.75 106.40 -2.65 0.40 N 57 5 N7 A A 6 ? ? C8 A A 6 ? ? N9 A A 6 ? ? 117.56 113.80 3.76 0.50 N 58 5 N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? 117.71 113.10 4.61 0.50 N 59 5 C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 103.79 106.40 -2.61 0.40 N 60 5 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.53 113.80 3.73 0.50 N 61 5 "O4'" A A 9 ? ? "C1'" A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 113.04 108.50 4.54 0.70 N 62 5 N7 A A 9 ? ? C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 117.56 113.80 3.76 0.50 N 63 5 C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? C4 A A 9 ? ? 103.29 105.80 -2.51 0.40 N 64 5 N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 117.76 113.10 4.66 0.50 N 65 5 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.58 106.40 -2.82 0.40 N 66 5 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 117.51 113.80 3.71 0.50 N 67 5 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.61 113.80 3.81 0.50 N 68 6 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.66 113.10 4.56 0.50 N 69 6 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.72 106.40 -2.68 0.40 N 70 6 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.68 113.10 4.58 0.50 N 71 6 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.74 106.40 -2.66 0.40 N 72 6 N7 A A 6 ? ? C8 A A 6 ? ? N9 A A 6 ? ? 117.54 113.80 3.74 0.50 N 73 6 N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? 117.70 113.10 4.60 0.50 N 74 6 C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 103.76 106.40 -2.64 0.40 N 75 6 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.55 113.80 3.75 0.50 N 76 6 "O4'" A A 9 ? ? "C1'" A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 112.88 108.50 4.38 0.70 N 77 6 N7 A A 9 ? ? C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 117.60 113.80 3.80 0.50 N 78 6 C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? C4 A A 9 ? ? 103.33 105.80 -2.47 0.40 N 79 6 N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 117.66 113.10 4.56 0.50 N 80 6 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.73 106.40 -2.67 0.40 N 81 6 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 117.57 113.80 3.77 0.50 N 82 6 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.54 113.80 3.74 0.50 N 83 7 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.52 113.10 4.42 0.50 N 84 7 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.82 106.40 -2.58 0.40 N 85 7 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.62 113.10 4.52 0.50 N 86 7 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.81 106.40 -2.59 0.40 N 87 7 N7 A A 6 ? ? C8 A A 6 ? ? N9 A A 6 ? ? 117.53 113.80 3.73 0.50 N 88 7 N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? 117.69 113.10 4.59 0.50 N 89 7 C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 103.70 106.40 -2.70 0.40 N 90 7 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.43 113.80 3.63 0.50 N 91 7 N7 A A 9 ? ? C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 117.56 113.80 3.76 0.50 N 92 7 N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 117.81 113.10 4.71 0.50 N 93 7 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.67 106.40 -2.73 0.40 N 94 7 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 117.52 113.80 3.72 0.50 N 95 7 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.51 113.80 3.71 0.50 N 96 8 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.66 113.10 4.56 0.50 N 97 8 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.74 106.40 -2.66 0.40 N 98 8 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.60 113.10 4.50 0.50 N 99 8 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.81 106.40 -2.59 0.40 N 100 8 N7 A A 6 ? ? C8 A A 6 ? ? N9 A A 6 ? ? 117.46 113.80 3.66 0.50 N 101 8 N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? 117.73 113.10 4.63 0.50 N 102 8 C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 103.74 106.40 -2.66 0.40 N 103 8 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.42 113.80 3.62 0.50 N 104 8 N7 A A 9 ? ? C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 117.53 113.80 3.73 0.50 N 105 8 N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 117.72 113.10 4.62 0.50 N 106 8 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.70 106.40 -2.70 0.40 N 107 8 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 117.41 113.80 3.61 0.50 N 108 8 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.57 113.80 3.77 0.50 N 109 9 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.63 113.10 4.53 0.50 N 110 9 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.73 106.40 -2.67 0.40 N 111 9 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? 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N9 A G 2 ? ? 117.71 113.10 4.61 0.50 N 125 10 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.75 106.40 -2.65 0.40 N 126 10 N7 A A 6 ? ? C8 A A 6 ? ? N9 A A 6 ? ? 117.45 113.80 3.65 0.50 N 127 10 N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? 117.69 113.10 4.59 0.50 N 128 10 C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 103.88 106.40 -2.52 0.40 N 129 10 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.37 113.80 3.57 0.50 N 130 10 "O4'" A A 9 ? ? "C1'" A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 112.96 108.50 4.46 0.70 N 131 10 N7 A A 9 ? ? C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 117.57 113.80 3.77 0.50 N 132 10 C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? C4 A A 9 ? ? 103.22 105.80 -2.58 0.40 N 133 10 N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 117.64 113.10 4.54 0.50 N 134 10 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.71 106.40 -2.69 0.40 N 135 10 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 117.51 113.80 3.71 0.50 N 136 10 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.52 113.80 3.72 0.50 N 137 11 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.63 113.10 4.53 0.50 N 138 11 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.73 106.40 -2.67 0.40 N 139 11 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.67 113.10 4.57 0.50 N 140 11 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.73 106.40 -2.67 0.40 N 141 11 N7 A A 6 ? ? C8 A A 6 ? ? N9 A A 6 ? ? 117.37 113.80 3.57 0.50 N 142 11 N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? 117.81 113.10 4.71 0.50 N 143 11 C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 103.66 106.40 -2.74 0.40 N 144 11 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.54 113.80 3.74 0.50 N 145 11 N7 A A 9 ? ? C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 117.50 113.80 3.70 0.50 N 146 11 N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 117.59 113.10 4.49 0.50 N 147 11 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.71 106.40 -2.69 0.40 N 148 11 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 117.52 113.80 3.72 0.50 N 149 11 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.52 113.80 3.72 0.50 N 150 12 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.60 113.10 4.50 0.50 N 151 12 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.82 106.40 -2.58 0.40 N 152 12 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.60 113.10 4.50 0.50 N 153 12 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.80 106.40 -2.60 0.40 N 154 12 N7 A A 6 ? ? C8 A A 6 ? ? N9 A A 6 ? ? 117.60 113.80 3.80 0.50 N 155 12 N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? 117.72 113.10 4.62 0.50 N 156 12 C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 103.79 106.40 -2.61 0.40 N 157 12 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.42 113.80 3.62 0.50 N 158 12 N7 A A 9 ? ? C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 117.50 113.80 3.70 0.50 N 159 12 N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 117.60 113.10 4.50 0.50 N 160 12 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.75 106.40 -2.65 0.40 N 161 12 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 117.54 113.80 3.74 0.50 N 162 12 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.46 113.80 3.66 0.50 N 163 13 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.62 113.10 4.52 0.50 N 164 13 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.75 106.40 -2.65 0.40 N 165 13 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.60 113.10 4.50 0.50 N 166 13 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.76 106.40 -2.64 0.40 N 167 13 N7 A A 6 ? ? C8 A A 6 ? ? N9 A A 6 ? ? 117.56 113.80 3.76 0.50 N 168 13 N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? 117.68 113.10 4.58 0.50 N 169 13 C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 103.76 106.40 -2.64 0.40 N 170 13 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.44 113.80 3.64 0.50 N 171 13 N7 A A 9 ? ? C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 117.64 113.80 3.84 0.50 N 172 13 N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 117.60 113.10 4.50 0.50 N 173 13 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.82 106.40 -2.58 0.40 N 174 13 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 117.49 113.80 3.69 0.50 N 175 13 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.52 113.80 3.72 0.50 N 176 14 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.59 113.10 4.49 0.50 N 177 14 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.80 106.40 -2.60 0.40 N 178 14 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.61 113.10 4.51 0.50 N 179 14 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.73 106.40 -2.67 0.40 N 180 14 N7 A A 6 ? ? C8 A A 6 ? ? N9 A A 6 ? ? 117.45 113.80 3.65 0.50 N 181 14 N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? 117.72 113.10 4.62 0.50 N 182 14 C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 103.87 106.40 -2.53 0.40 N 183 14 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.38 113.80 3.58 0.50 N 184 14 N7 A A 9 ? ? C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 117.58 113.80 3.78 0.50 N 185 14 C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? C4 A A 9 ? ? 103.40 105.80 -2.40 0.40 N 186 14 N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 117.70 113.10 4.60 0.50 N 187 14 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.69 106.40 -2.71 0.40 N 188 14 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 117.48 113.80 3.68 0.50 N 189 14 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.58 113.80 3.78 0.50 N 190 15 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.65 113.10 4.55 0.50 N 191 15 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.70 106.40 -2.70 0.40 N 192 15 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.70 113.10 4.60 0.50 N 193 15 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.78 106.40 -2.62 0.40 N 194 15 N7 A A 6 ? ? C8 A A 6 ? ? N9 A A 6 ? ? 117.55 113.80 3.75 0.50 N 195 15 N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? 117.76 113.10 4.66 0.50 N 196 15 C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 103.85 106.40 -2.55 0.40 N 197 15 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.35 113.80 3.55 0.50 N 198 15 N7 A A 9 ? ? C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 117.49 113.80 3.69 0.50 N 199 15 N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 117.72 113.10 4.62 0.50 N 200 15 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.77 106.40 -2.63 0.40 N 201 15 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 117.54 113.80 3.74 0.50 N 202 15 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.59 113.80 3.79 0.50 N 203 16 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.61 113.10 4.51 0.50 N 204 16 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.76 106.40 -2.64 0.40 N 205 16 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.65 113.10 4.55 0.50 N 206 16 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.76 106.40 -2.64 0.40 N 207 16 N7 A A 6 ? ? C8 A A 6 ? ? N9 A A 6 ? ? 117.43 113.80 3.63 0.50 N 208 16 N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? 117.79 113.10 4.69 0.50 N 209 16 C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 103.71 106.40 -2.69 0.40 N 210 16 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.44 113.80 3.64 0.50 N 211 16 N7 A A 9 ? ? C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 117.49 113.80 3.69 0.50 N 212 16 N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 117.59 113.10 4.49 0.50 N 213 16 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.74 106.40 -2.66 0.40 N 214 16 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 117.49 113.80 3.69 0.50 N 215 16 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.44 113.80 3.64 0.50 N 216 17 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.63 113.10 4.53 0.50 N 217 17 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.69 106.40 -2.71 0.40 N 218 17 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.56 113.10 4.46 0.50 N 219 17 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.83 106.40 -2.57 0.40 N 220 17 N7 A A 6 ? ? C8 A A 6 ? ? N9 A A 6 ? ? 117.60 113.80 3.80 0.50 N 221 17 N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? 117.74 113.10 4.64 0.50 N 222 17 C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 103.75 106.40 -2.65 0.40 N 223 17 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.61 113.80 3.81 0.50 N 224 17 "O4'" A A 9 ? ? "C1'" A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 112.90 108.50 4.40 0.70 N 225 17 N7 A A 9 ? ? C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 117.57 113.80 3.77 0.50 N 226 17 N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 117.71 113.10 4.61 0.50 N 227 17 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.66 106.40 -2.74 0.40 N 228 17 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? 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N9 A G 10 ? ? 117.67 113.10 4.57 0.50 N 242 18 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.61 106.40 -2.79 0.40 N 243 18 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 117.47 113.80 3.67 0.50 N 244 18 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.50 113.80 3.70 0.50 N 245 19 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.62 113.10 4.52 0.50 N 246 19 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.79 106.40 -2.61 0.40 N 247 19 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.55 113.10 4.45 0.50 N 248 19 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.80 106.40 -2.60 0.40 N 249 19 N7 A A 6 ? ? C8 A A 6 ? ? N9 A A 6 ? ? 117.52 113.80 3.72 0.50 N 250 19 N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? 117.59 113.10 4.49 0.50 N 251 19 C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 103.88 106.40 -2.52 0.40 N 252 19 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.50 113.80 3.70 0.50 N 253 19 "O4'" A A 9 ? ? "C1'" A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 112.83 108.50 4.33 0.70 N 254 19 N7 A A 9 ? ? C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 117.54 113.80 3.74 0.50 N 255 19 C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? C4 A A 9 ? ? 103.38 105.80 -2.42 0.40 N 256 19 N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 117.66 113.10 4.56 0.50 N 257 19 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.70 106.40 -2.70 0.40 N 258 19 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 117.42 113.80 3.62 0.50 N 259 19 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.44 113.80 3.64 0.50 N 260 20 N7 A G 1 ? ? C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? 117.62 113.10 4.52 0.50 N 261 20 C8 A G 1 ? ? N9 A G 1 ? ? C4 A G 1 ? ? 103.75 106.40 -2.65 0.40 N 262 20 N7 A G 2 ? ? C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? 117.65 113.10 4.55 0.50 N 263 20 C8 A G 2 ? ? N9 A G 2 ? ? C4 A G 2 ? ? 103.73 106.40 -2.67 0.40 N 264 20 N7 A A 6 ? ? C8 A A 6 ? ? N9 A A 6 ? ? 117.57 113.80 3.77 0.50 N 265 20 N7 A G 7 ? ? C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? 117.78 113.10 4.68 0.50 N 266 20 C8 A G 7 ? ? N9 A G 7 ? ? C4 A G 7 ? ? 103.77 106.40 -2.63 0.40 N 267 20 N7 A A 8 ? ? C8 A A 8 ? ? N9 A A 8 ? ? 117.52 113.80 3.72 0.50 N 268 20 "O4'" A A 9 ? ? "C1'" A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 113.24 108.50 4.74 0.70 N 269 20 N7 A A 9 ? ? C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? 117.61 113.80 3.81 0.50 N 270 20 C8 A A 9 ? ? N9 A A 9 ? ? C4 A A 9 ? ? 103.25 105.80 -2.55 0.40 N 271 20 N7 A G 10 ? ? C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? 117.66 113.10 4.56 0.50 N 272 20 C8 A G 10 ? ? N9 A G 10 ? ? C4 A G 10 ? ? 103.72 106.40 -2.68 0.40 N 273 20 N7 A A 11 ? ? C8 A A 11 ? ? N9 A A 11 ? ? 117.46 113.80 3.66 0.50 N 274 20 N7 A A 12 ? ? C8 A A 12 ? ? N9 A A 12 ? ? 117.49 113.80 3.69 0.50 N # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 1K4A 'a-form double helix' 1K4A 'hairpin loop' 1K4A 'mismatched base pair' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 1 1_555 A C 14 1_555 -0.324 0.181 -0.083 -1.845 -2.286 -1.220 1 A_G1:C14_A A 1 ? A 14 ? 19 1 1 A G 2 1_555 A C 13 1_555 -1.207 -0.258 -0.201 -3.228 -0.848 -2.624 2 A_G2:C13_A A 2 ? A 13 ? 19 1 1 A U 3 1_555 A A 12 1_555 -0.703 0.238 -0.142 0.723 1.997 -5.912 3 A_U3:A12_A A 3 ? A 12 ? 20 1 1 A U 4 1_555 A A 11 1_555 -0.868 0.219 -0.071 -0.971 1.997 -2.011 4 A_U4:A11_A A 4 ? A 11 ? 20 1 1 A C 5 1_555 A G 10 1_555 -0.304 0.227 -0.128 2.420 2.326 0.590 5 A_C5:G10_A A 5 ? A 10 ? 19 1 1 A A 6 1_555 A A 9 1_555 6.017 -4.715 1.032 -4.783 -7.230 -14.350 6 A_A6:A9_A A 6 ? A 9 ? ? 6 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A G 1 1_555 A C 14 1_555 A G 2 1_555 A C 13 1_555 -0.992 -1.202 3.987 -2.545 1.859 30.221 -2.749 1.269 3.976 3.553 4.865 30.381 1 AA_G1G2:C13C14_AA A 1 ? A 14 ? A 2 ? A 13 ? 1 A G 2 1_555 A C 13 1_555 A U 3 1_555 A A 12 1_555 -0.146 -1.369 3.592 -2.093 14.142 32.586 -4.355 -0.073 2.783 23.826 3.527 35.506 2 AA_G2U3:A12C13_AA A 2 ? A 13 ? A 3 ? A 12 ? 1 A U 3 1_555 A A 12 1_555 A U 4 1_555 A A 11 1_555 1.135 -1.582 3.894 -0.273 5.024 30.739 -4.052 -2.174 3.586 9.398 0.511 31.139 3 AA_U3U4:A11A12_AA A 3 ? A 12 ? A 4 ? A 11 ? 1 A U 4 1_555 A A 11 1_555 A C 5 1_555 A G 10 1_555 -0.147 -1.978 3.201 0.623 15.902 26.181 -6.328 0.379 1.736 31.657 -1.240 30.566 4 AA_U4C5:G10A11_AA A 4 ? A 11 ? A 5 ? A 10 ? 1 A C 5 1_555 A G 10 1_555 A A 6 1_555 A A 9 1_555 -0.636 -0.829 3.439 -4.078 18.694 55.343 -1.861 0.432 3.075 19.489 4.251 58.309 5 AA_C5A6:A9G10_AA A 5 ? A 10 ? A 6 ? A 9 ? #