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WA 4 HOH 75 8114 8114 HOH HOH L . # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA hexameric 6 2 author_and_software_defined_assembly PISA hexameric 6 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,C,D,E,F,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,LA,MA,NA,OA,PA,QA 2 1 G,H,I,J,K,L,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,RA,SA,TA,UA,VA,WA # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 22680 ? 1 MORE -49 ? 1 'SSA (A^2)' 106990 ? 2 'ABSA (A^2)' 22490 ? 2 MORE -46 ? 2 'SSA (A^2)' 105970 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2003-04-08 2 'Structure model' 1 1 2008-04-28 3 'Structure model' 1 2 2011-07-13 4 'Structure model' 1 3 2020-07-29 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 4 'Structure model' repository Remediation 'Carbohydrate remediation' ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Non-polymer description' 3 3 'Structure model' 'Version format compliance' 4 4 'Structure model' Advisory 5 4 'Structure model' 'Data collection' 6 4 'Structure model' 'Database references' 7 4 'Structure model' 'Derived calculations' 8 4 'Structure model' 'Structure summary' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 4 'Structure model' chem_comp 2 4 'Structure model' entity 3 4 'Structure model' pdbx_chem_comp_identifier 4 4 'Structure model' pdbx_entity_nonpoly 5 4 'Structure model' pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms 6 4 'Structure model' struct_ref_seq_dif 7 4 'Structure model' struct_site 8 4 'Structure model' struct_site_gen # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 4 'Structure model' '_chem_comp.name' 2 4 'Structure model' '_chem_comp.type' 3 4 'Structure model' '_entity.pdbx_description' 4 4 'Structure model' '_pdbx_entity_nonpoly.name' 5 4 'Structure model' '_pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id' 6 4 'Structure model' '_struct_ref_seq_dif.details' # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal HKL-2000 'data collection' . ? 1 SCALEPACK 'data scaling' . ? 2 AMoRE phasing . ? 3 CNS refinement 1.0 ? 4 HKL-2000 'data reduction' . ? 5 # loop_ _pdbx_database_remark.id _pdbx_database_remark.text 300 ;BIOMOLECULE: 1, 2 THIS ENTRY CONTAINS THE CRYSTALLOGRAPHIC ASYMMETRIC UNIT WHICH CONSISTS OF 12 CHAIN(S). SEE REMARK 350 FOR INFORMATION ON GENERATING THE BIOLOGICAL MOLECULE(S). The authors have confirmed that human carboxylesterase 1 will form a trimer or hexamer in solution by Atomic Force Microscopy (AFM). They found the ratio of monomer:trimer:hexmer is ~ 10:44:46. 1MX1 contains a hexamer, 1MX5 contains 2 trimers. This entry contains two hexamers. The authors found that the trimer:hexmer ratio is dependent on the type and amount of ligands. ; 999 ;SEQUENCE THE AUTHOR'S SEQUENCE HAS NO GLN 362 (CALLED hCEv in: Kroetz DL, McBride OW, Gonzalez FJ.Glycosylation-dependent activity of baculovirus-expressed human liver carboxylesterases: cDNA cloning and characterization of two highly similar enzyme forms. Biochemistry 1993 Nov 2;32(43):11606-17) ; # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 O4 F NLX 6 ? ? O F HOH 7502 ? ? 2.13 2 1 OG B SER 2221 ? ? O B HOH 7002 ? ? 2.14 3 1 O2 D NLX 4 ? ? O D HOH 7001 ? ? 2.19 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 PHE A 1076 ? ? -115.02 -118.54 2 1 ALA A 1080 ? ? -106.03 45.73 3 1 ARG A 1132 ? ? -155.71 72.84 4 1 LEU A 1144 ? ? 57.76 18.55 5 1 LEU A 1155 ? ? -49.31 -73.83 6 1 SER A 1185 ? ? 179.76 70.17 7 1 ASN A 1188 ? ? 56.97 11.11 8 1 PRO A 1212 ? ? -65.08 7.27 9 1 SER A 1221 ? ? 74.08 -110.55 10 1 ALA A 1250 ? ? -57.02 -3.41 11 1 SER A 1253 ? ? -18.18 -42.63 12 1 LEU A 1318 ? ? -173.08 146.39 13 1 MET A 1326 ? ? -121.60 -53.35 14 1 ARG A 1339 ? ? -96.53 39.62 15 1 ASN A 1340 ? ? -91.53 53.76 16 1 LEU A 1358 ? ? -49.52 -76.68 17 1 LEU A 1368 ? ? -150.45 24.99 18 1 GLN A 1375 ? ? -17.30 -55.70 19 1 LYS A 1376 ? ? -51.83 -71.70 20 1 LYS A 1402 ? ? -67.89 0.36 21 1 TYR A 1451 ? ? 178.86 143.38 22 1 MET A 1459 ? ? -69.93 3.80 23 1 PRO A 1479 ? ? -57.73 -5.11 24 1 PRO A 1515 ? ? -48.81 155.69 25 1 ASN A 1521 ? ? -105.30 -157.32 26 1 LYS A 1538 ? ? 48.57 82.79 27 1 LEU A 1539 ? ? -58.98 -70.27 28 1 SER B 2022 ? ? -171.01 136.14 29 1 GLU B 2041 ? ? -46.17 109.23 30 1 ALA B 2044 ? ? -56.93 -75.59 31 1 PRO B 2059 ? ? -67.62 57.58 32 1 PHE B 2076 ? ? -116.51 -116.10 33 1 ALA B 2080 ? ? -108.24 60.77 34 1 GLN B 2089 ? ? 175.47 164.30 35 1 ASP B 2090 ? ? -50.95 109.27 36 1 SER B 2113 ? ? 175.30 142.13 37 1 LEU B 2127 ? ? -48.21 -17.14 38 1 SER B 2185 ? ? -161.65 74.09 39 1 PRO B 2212 ? ? -55.06 -8.43 40 1 SER B 2214 ? ? -145.88 57.25 41 1 SER B 2221 ? ? 56.53 -117.97 42 1 LYS B 2237 ? ? -14.62 -70.14 43 1 SER B 2253 ? ? -30.63 -36.16 44 1 MET B 2326 ? ? -124.86 -55.54 45 1 ARG B 2339 ? ? -108.94 -65.52 46 1 ASN B 2340 ? ? -59.09 88.75 47 1 PHE B 2341 ? ? -92.49 -70.97 48 1 HIS B 2342 ? ? 175.19 80.82 49 1 GLN B 2353 ? ? -116.82 62.92 50 1 TRP B 2357 ? ? -149.52 -53.53 51 1 ILE B 2359 ? ? -54.33 -73.38 52 1 SER B 2369 ? ? -95.63 42.09 53 1 GLU B 2370 ? ? -156.58 -30.12 54 1 LEU B 2373 ? ? -27.51 131.19 55 1 ALA B 2442 ? ? -176.64 142.15 56 1 SER B 2454 ? ? -67.88 6.33 57 1 PRO B 2479 ? ? -58.60 -3.69 58 1 ASN B 2521 ? ? -84.17 -148.62 59 1 ALA B 2536 ? ? -174.16 -170.58 60 1 PRO C 3059 ? ? -69.47 58.74 61 1 PHE C 3076 ? ? -124.79 -129.92 62 1 ASN C 3079 ? ? -60.61 94.14 63 1 SER C 3113 ? ? 170.97 141.89 64 1 LEU C 3127 ? ? -54.19 -0.99 65 1 PHE C 3177 ? ? -141.61 15.83 66 1 SER C 3185 ? ? -179.01 76.83 67 1 ASN C 3204 ? ? -140.76 -21.95 68 1 SER C 3214 ? ? -151.07 84.44 69 1 SER C 3221 ? ? 64.67 -123.34 70 1 SER C 3253 ? ? -15.36 -49.45 71 1 TRP C 3357 ? ? -145.04 -58.14 72 1 SER C 3369 ? ? -154.30 31.51 73 1 LEU C 3373 ? ? -167.61 110.35 74 1 ASP C 3409 ? ? -51.17 108.49 75 1 ALA C 3552 ? ? -102.75 42.18 76 1 SER D 4022 ? ? -38.86 118.74 77 1 GLU D 4041 ? ? -30.00 128.13 78 1 PHE D 4076 ? ? 69.16 -166.79 79 1 ALA D 4080 ? ? -114.32 60.04 80 1 ARG D 4132 ? ? -114.10 60.31 81 1 LEU D 4144 ? ? 55.67 6.78 82 1 ASP D 4182 ? ? -126.46 -167.93 83 1 SER D 4185 ? ? 170.60 74.97 84 1 SER D 4221 ? ? 55.28 -117.78 85 1 SER D 4253 ? ? -9.20 -57.58 86 1 ALA D 4337 ? ? -62.17 -81.78 87 1 PHE D 4341 ? ? -89.00 -76.86 88 1 TRP D 4357 ? ? -142.20 -51.44 89 1 PHE D 4426 ? ? -123.41 -59.03 90 1 ASN D 4521 ? ? -102.36 -154.34 91 1 LYS D 4538 ? ? 53.94 76.87 92 1 LYS D 4540 ? ? 44.52 29.96 93 1 ALA D 4552 ? ? -59.98 17.30 94 1 ALA E 5044 ? ? -60.16 -82.17 95 1 GLN E 5045 ? ? -41.57 103.95 96 1 PHE E 5065 ? ? 71.98 37.03 97 1 PHE E 5076 ? ? -122.24 -110.73 98 1 ALA E 5080 ? ? -108.13 71.01 99 1 LEU E 5127 ? ? -40.08 -19.70 100 1 SER E 5185 ? ? -175.19 75.41 101 1 ASN E 5204 ? ? -137.90 -39.21 102 1 SER E 5207 ? ? -65.80 0.30 103 1 SER E 5221 ? ? 61.26 -128.24 104 1 LYS E 5237 ? ? -16.82 -52.42 105 1 SER E 5253 ? ? -21.91 -42.61 106 1 TRP E 5357 ? ? -139.95 -60.25 107 1 PRO E 5367 ? ? -72.14 22.26 108 1 LEU E 5373 ? ? -174.73 130.81 109 1 THR E 5410 ? ? -59.97 -1.25 110 1 ASN E 5506 ? ? -152.42 -25.26 111 1 ASN E 5521 ? 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