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_pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.content_type PDB 1D8D ;Co-Crystal Structure Of Rat Protein Farnesyltransferase Complexed With A K-Ras4B Peptide Substrate and Fpp Analog At 2.0A Resolution ; unspecified PDB 1FPP 'Protein Farnesyltransferase Complex With Farnesyl Diphosphate' unspecified PDB 1QBQ ;Structure Of Rat Farnesyl Protein Transferase Complexed With A Cvim Peptide and -Hydroxyfarnesylphosphonic Acid ; unspecified PDB 1FT1 'Crystal Structure Of Protein Farnesyltransferase At 2.25 Angstroms Resolution' unspecified PDB 1KZO ;Protein Farnesyltransferase Complexed With Farnesylated K-Ras4B Peptide Product and Farnesyl Diphosphate Substrate Bound Simultaneously ; unspecified PDB 1KZP 'Protein Farnesyltransferase Complexed With A Farnesylated K-Ras4B Peptide Product' unspecified PDB 1DCE 'Crystal Structure Of Rab Geranylgeranyltransferase From Rat Brain' unspecified PDB 1N4P 'Geranylgeranyltransferase 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_citation_author.identifier_ORCID primary 'Taylor, J.S.' 1 ? primary 'Reid, T.S.' 2 ? primary 'Terry, K.L.' 3 ? primary 'Casey, P.J.' 4 ? primary 'Beese, L.S.' 5 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha' 44098.145 6 2.5.1.58,2.5.1.59 ? ? ? 2 polymer man 'Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta' 42466.176 6 2.5.1.59 ? ? ? 3 polymer syn 'Fusion protein consisting of transforming protein p21b and Ras related protein Rap-2b' 1280.685 6 ? ? ? ? 4 non-polymer syn '2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID' 195.237 6 ? ? ? ? 5 non-polymer syn 'ZINC ION' 65.409 6 ? ? ? ? 6 non-polymer syn 'SULFATE ION' 96.063 6 ? ? ? ? 7 non-polymer syn 'CHLORIDE ION' 35.453 7 ? ? ? ? 8 non-polymer syn 'GERAN-8-YL GERAN' 274.484 6 ? ? ? ? 9 water nat 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NB N N 9 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP FNTA_RAT Q04631 ? 1 ;MAATEGVGESAPGGEPGQPEQPPPPPPPPPAQQPQEEEMAAEAGEAAASPMDDGFLSLDSPTYVLYRDRAEWADIDPVPQ NDGPSPVVQIIYSEKFRDVYDYFRAVLQRDERSERAFKLTRDAIELNAANYTVWHFRRVLLRSLQKDLQEEMNYIIAIIE EQPKNYQVWHHRRVLVEWLKDPSQELEFIADILNQDAKNYHAWQHRQWVIQEFRLWDNELQYVDQLLKEDVRNNSVWNQR HFVISNTTGYSDRAVLEREVQYTLEMIKLVPHNESAWNYLKGILQDRGLSRYPNLLNQLLDLQPSHSSPYLIAFLVDIYE DMLENQCDNKEDILNKALELCEILAKEKDTIRKEYWRYIGRSLQSKHSRESDIPASV ; 1 2 UNP PGTB1_RAT P53610 ? 2 ;MAATEDDRLAGSGEGERLDFLRDRHVRFFQRCLQVLPERYSSLETSRLTIAFFALSGLDMLDSLDVVNKDDIIEWIYSLQ VLPTEDRSNLDRCGFRGSSYLGIPFNPSKNPGTAHPYDSGHIAMTYTGLSCLIILGDDLSRVDKEACLAGLRALQLEDGS FCAVPEGSENDMRFVYCASCICYMLNNWSGMDMKKAISYIRRSMSYDNGLAQGAGLESHGGSTFCGIASLCLMGKLEEVF SEKELNRIKRWCIMRQQNGYHGRPNKPVDTCYSFWVGATLKLLKIFQYTNFEKNRNYILSTQDRLVGGFAKWPDSHPDAL HAYFGICGLSLMEESGICKVHPALNVSTRTSERLRDLHQSWKTKDSKQCSDNVHISS ; 1 3 PDB 1N4R 1N4R ? 3 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1N4R A 1 ? 377 ? Q04631 1 ? 377 ? 1 377 2 2 1N4R B 1 ? 377 ? P53610 1 ? 377 ? 1 377 3 1 1N4R C 1 ? 377 ? Q04631 1 ? 377 ? 1 377 4 2 1N4R D 1 ? 377 ? P53610 1 ? 377 ? 1 377 5 1 1N4R E 1 ? 377 ? Q04631 1 ? 377 ? 1 377 6 2 1N4R F 1 ? 377 ? P53610 1 ? 377 ? 1 377 7 1 1N4R G 1 ? 377 ? Q04631 1 ? 377 ? 1 377 8 2 1N4R H 1 ? 377 ? P53610 1 ? 377 ? 1 377 9 1 1N4R I 1 ? 377 ? Q04631 1 ? 377 ? 1 377 10 2 1N4R J 1 ? 377 ? P53610 1 ? 377 ? 1 377 11 1 1N4R K 1 ? 377 ? Q04631 1 ? 377 ? 1 377 12 2 1N4R L 1 ? 377 ? P53610 1 ? 377 ? 1 377 13 3 1N4R M 1 ? 11 ? 1N4R 101 ? 111 ? 101 111 14 3 1N4R N 1 ? 11 ? 1N4R 201 ? 211 ? 201 211 15 3 1N4R O 1 ? 11 ? 1N4R 301 ? 311 ? 301 311 16 3 1N4R P 1 ? 11 ? 1N4R 401 ? 411 ? 401 411 17 3 1N4R Q 1 ? 11 ? 1N4R 501 ? 511 ? 501 511 18 3 1N4R R 1 ? 11 ? 1N4R 601 ? 611 ? 601 611 # loop_ _pdbx_struct_assembly.id _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 2 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 3 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 4 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 5 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 6 author_and_software_defined_assembly PISA trimeric 3 7 software_defined_assembly PQS dimeric 2 8 software_defined_assembly PQS dimeric 2 9 software_defined_assembly PQS dimeric 2 10 software_defined_assembly PQS dimeric 2 11 software_defined_assembly PQS dimeric 2 12 software_defined_assembly PQS dimeric 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 8700 ? 1 MORE -71 ? 1 'SSA (A^2)' 25490 ? 2 'ABSA (A^2)' 9030 ? 2 MORE -95 ? 2 'SSA (A^2)' 25750 ? 3 'ABSA (A^2)' 8920 ? 3 MORE -82 ? 3 'SSA (A^2)' 25710 ? 4 'ABSA (A^2)' 9050 ? 4 MORE -93 ? 4 'SSA (A^2)' 25640 ? 5 'ABSA (A^2)' 8970 ? 5 MORE -86 ? 5 'SSA (A^2)' 26030 ? 6 'ABSA (A^2)' 9020 ? 6 MORE -82 ? 6 'SSA (A^2)' 26260 ? # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list 1 1 A,B,M,S,T,U,RA,XA,YA,JB 2 1 C,D,N,V,W,X,Y,Z,SA,ZA,AB,KB 3 1 E,F,O,AA,BA,CA,DA,TA,BB,CB,LB 4 1 G,H,P,EA,FA,GA,HA,IA,UA,DB,EB 5 1 I,J,Q,JA,KA,LA,MA,VA,FB,GB,MB 6 1 K,L,R,NA,OA,PA,QA,WA,HB,IB,NB 7 1 A,B,S,T,U,XA,YA 8 1 C,D,V,W,X,Y,Z,ZA,AB 9 1 E,F,AA,BA,CA,DA,BB,CB 10 1 G,H,EA,FA,GA,HA,IA,DB,EB 11 1 I,J,JA,KA,LA,MA,FB,GB 12 1 K,L,NA,OA,PA,QA,HB,IB # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 1 LEU A 65 ? ALA A 73 ? LEU A 65 ALA A 73 5 ? 9 HELX_P HELX_P2 2 SER A 93 ? ARG A 109 ? SER A 93 ARG A 109 1 ? 17 HELX_P HELX_P3 3 SER A 113 ? ASN A 127 ? SER A 113 ASN A 127 1 ? 15 HELX_P HELX_P4 4 ASN A 130 ? LEU A 144 ? ASN A 130 LEU A 144 1 ? 15 HELX_P HELX_P5 5 ASP A 147 ? GLN A 162 ? ASP A 147 GLN A 162 1 ? 16 HELX_P HELX_P6 6 ASN A 165 ? LYS A 180 ? ASN A 165 LYS A 180 1 ? 16 HELX_P HELX_P7 7 GLN A 184 ? ASP A 196 ? GLN A 184 ASP A 196 1 ? 13 HELX_P HELX_P8 8 ASN A 199 ? PHE A 213 ? ASN A 199 PHE A 213 1 ? 15 HELX_P HELX_P9 9 ASN A 218 ? ASP A 230 ? ASN A 218 ASP A 230 1 ? 13 HELX_P HELX_P10 10 ASN A 233 ? ASN A 246 ? ASN A 233 ASN A 246 1 ? 14 HELX_P HELX_P11 11 ASP A 252 ? VAL A 270 ? ASP A 252 VAL A 270 1 ? 19 HELX_P HELX_P12 12 ASN A 273 ? ASP A 286 ? ASN A 273 ASP A 286 1 ? 14 HELX_P HELX_P13 13 GLY A 288 ? ARG A 291 ? GLY A 288 ARG A 291 5 ? 4 HELX_P HELX_P14 14 TYR A 292 ? GLN A 303 ? TYR A 292 GLN A 303 1 ? 12 HELX_P HELX_P15 15 SER A 308 ? ASN A 325 ? SER A 308 ASN A 325 1 ? 18 HELX_P HELX_P16 16 ASN A 329 ? GLU A 347 ? ASN A 329 GLU A 347 1 ? 19 HELX_P HELX_P17 17 ASP A 349 ? ILE A 351 ? ASP A 349 ILE A 351 5 ? 3 HELX_P HELX_P18 18 ARG A 352 ? SER A 365 ? ARG A 352 SER A 365 1 ? 14 HELX_P HELX_P19 19 LEU B 21 ? GLN B 34 ? LEU B 21 GLN B 34 1 ? 14 HELX_P HELX_P20 20 PRO B 37 ? THR B 45 ? PRO B 37 THR B 45 5 ? 9 HELX_P HELX_P21 21 SER B 46 ? LEU B 61 ? SER B 46 LEU B 61 1 ? 16 HELX_P HELX_P22 22 ASP B 62 ? ASP B 62 ? ASP B 62 ASP B 62 5 ? 1 HELX_P HELX_P23 23 SER B 63 ? VAL B 67 ? SER B 63 VAL B 67 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 24 ASN B 68 ? SER B 78 ? ASN B 68 SER B 78 1 ? 11 HELX_P HELX_P25 25 ASN B 89 ? CYS B 93 ? ASN B 89 CYS B 93 5 ? 5 HELX_P HELX_P26 26 HIS B 121 ? LEU B 135 ? HIS B 121 LEU B 135 1 ? 15 HELX_P HELX_P27 27 ASP B 143 ? GLN B 155 ? ASP B 143 GLN B 155 1 ? 13 HELX_P HELX_P28 28 ASP B 171 ? LEU B 185 ? ASP B 171 LEU B 185 1 ? 15 HELX_P HELX_P29 29 ASN B 187 ? MET B 191 ? ASN B 187 MET B 191 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 30 ASP B 192 ? SER B 203 ? ASP B 192 SER B 203 1 ? 12 HELX_P HELX_P31 31 HIS B 219 ? GLY B 234 ? HIS B 219 GLY B 234 1 ? 16 HELX_P HELX_P32 32 LYS B 235 ? PHE B 240 ? LYS B 235 PHE B 240 1 ? 6 HELX_P HELX_P33 33 SER B 241 ? MET B 254 ? SER B 241 MET B 254 1 ? 14 HELX_P HELX_P34 34 CYS B 271 ? LEU B 283 ? CYS B 271 LEU B 283 1 ? 13 HELX_P HELX_P35 35 ILE B 285 ? THR B 289 ? ILE B 285 THR B 289 5 ? 5 HELX_P HELX_P36 36 ASN B 290 ? THR B 301 ? ASN B 290 THR B 301 1 ? 12 HELX_P HELX_P37 37 ASP B 318 ? MET B 332 ? ASP B 318 MET B 332 1 ? 15 HELX_P HELX_P38 38 THR B 348 ? LYS B 362 ? THR B 348 LYS B 362 1 ? 15 HELX_P HELX_P39 39 LEU C 65 ? ALA C 73 ? LEU C 65 ALA C 73 5 ? 9 HELX_P HELX_P40 40 SER C 93 ? ARG C 109 ? SER C 93 ARG C 109 1 ? 17 HELX_P HELX_P41 41 SER C 113 ? ASN C 127 ? SER C 113 ASN C 127 1 ? 15 HELX_P HELX_P42 42 ASN C 130 ? LEU C 144 ? ASN C 130 LEU C 144 1 ? 15 HELX_P HELX_P43 43 ASP C 147 ? GLN C 162 ? ASP C 147 GLN C 162 1 ? 16 HELX_P HELX_P44 44 ASN C 165 ? LYS C 180 ? ASN C 165 LYS C 180 1 ? 16 HELX_P HELX_P45 45 GLN C 184 ? ASP C 196 ? GLN C 184 ASP C 196 1 ? 13 HELX_P HELX_P46 46 ASN C 199 ? PHE C 213 ? ASN C 199 PHE C 213 1 ? 15 HELX_P HELX_P47 47 ASN C 218 ? ASP C 230 ? ASN C 218 ASP C 230 1 ? 13 HELX_P HELX_P48 48 ASN C 233 ? ASN C 246 ? ASN C 233 ASN C 246 1 ? 14 HELX_P HELX_P49 49 ASP C 252 ? VAL C 270 ? ASP C 252 VAL C 270 1 ? 19 HELX_P HELX_P50 50 ASN C 273 ? ASP C 286 ? ASN C 273 ASP C 286 1 ? 14 HELX_P HELX_P51 51 GLY C 288 ? ARG C 291 ? GLY C 288 ARG C 291 5 ? 4 HELX_P HELX_P52 52 TYR C 292 ? SER C 307 ? TYR C 292 SER C 307 1 ? 16 HELX_P HELX_P53 53 SER C 308 ? ASN C 325 ? SER C 308 ASN C 325 1 ? 18 HELX_P HELX_P54 54 ASN C 329 ? GLU C 347 ? ASN C 329 GLU C 347 1 ? 19 HELX_P HELX_P55 55 ASP C 349 ? ILE C 351 ? ASP C 349 ILE C 351 5 ? 3 HELX_P HELX_P56 56 ARG C 352 ? SER C 365 ? ARG C 352 SER C 365 1 ? 14 HELX_P HELX_P57 57 LEU D 21 ? GLN D 34 ? LEU D 21 GLN D 34 1 ? 14 HELX_P HELX_P58 58 PRO D 37 ? THR D 45 ? PRO D 37 THR D 45 5 ? 9 HELX_P HELX_P59 59 SER D 46 ? LEU D 61 ? SER D 46 LEU D 61 1 ? 16 HELX_P HELX_P60 60 SER D 63 ? VAL D 67 ? SER D 63 VAL D 67 5 ? 5 HELX_P HELX_P61 61 ASN D 68 ? SER D 78 ? ASN D 68 SER D 78 1 ? 11 HELX_P HELX_P62 62 ASN D 89 ? CYS D 93 ? ASN D 89 CYS D 93 5 ? 5 HELX_P HELX_P63 63 HIS D 121 ? GLY D 136 ? HIS D 121 GLY D 136 1 ? 16 HELX_P HELX_P64 64 ASP D 143 ? GLN D 155 ? ASP D 143 GLN D 155 1 ? 13 HELX_P HELX_P65 65 ASP D 171 ? LEU D 185 ? ASP D 171 LEU D 185 1 ? 15 HELX_P HELX_P66 66 ASN D 187 ? MET D 191 ? ASN D 187 MET D 191 5 ? 5 HELX_P HELX_P67 67 ASP D 192 ? SER D 203 ? ASP D 192 SER D 203 1 ? 12 HELX_P HELX_P68 68 HIS D 219 ? GLY D 234 ? HIS D 219 GLY D 234 1 ? 16 HELX_P HELX_P69 69 LYS D 235 ? PHE D 240 ? LYS D 235 PHE D 240 1 ? 6 HELX_P HELX_P70 70 SER D 241 ? MET D 254 ? SER D 241 MET D 254 1 ? 14 HELX_P HELX_P71 71 CYS D 271 ? LEU D 283 ? CYS D 271 LEU D 283 1 ? 13 HELX_P HELX_P72 72 ILE D 285 ? THR D 289 ? ILE D 285 THR D 289 5 ? 5 HELX_P HELX_P73 73 ASN D 290 ? THR D 301 ? ASN D 290 THR D 301 1 ? 12 HELX_P HELX_P74 74 ASP D 318 ? GLU D 333 ? ASP D 318 GLU D 333 1 ? 16 HELX_P HELX_P75 75 THR D 348 ? LYS D 362 ? THR D 348 LYS D 362 1 ? 15 HELX_P HELX_P76 76 LEU E 65 ? ALA E 73 ? LEU E 65 ALA E 73 5 ? 9 HELX_P HELX_P77 77 SER E 93 ? ARG E 109 ? SER E 93 ARG E 109 1 ? 17 HELX_P HELX_P78 78 SER E 113 ? ASN E 127 ? SER E 113 ASN E 127 1 ? 15 HELX_P HELX_P79 79 ASN E 130 ? LEU E 144 ? ASN E 130 LEU E 144 1 ? 15 HELX_P HELX_P80 80 ASP E 147 ? GLN E 162 ? ASP E 147 GLN E 162 1 ? 16 HELX_P HELX_P81 81 ASN E 165 ? LYS E 180 ? ASN E 165 LYS E 180 1 ? 16 HELX_P HELX_P82 82 GLN E 184 ? ASP E 196 ? GLN E 184 ASP E 196 1 ? 13 HELX_P HELX_P83 83 ASN E 199 ? PHE E 213 ? ASN E 199 PHE E 213 1 ? 15 HELX_P HELX_P84 84 ASN E 218 ? ASP E 230 ? ASN E 218 ASP E 230 1 ? 13 HELX_P HELX_P85 85 ASN E 233 ? ASN E 246 ? 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