data_1N8C # _entry.id 1N8C # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.355 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 1N8C pdb_00001n8c 10.2210/pdb1n8c/pdb RCSB RCSB017645 ? ? WWPDB D_1000017645 ? ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 1N8C _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2002-11-20 _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_mr REL _pdbx_database_status.SG_entry . _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Volk, D.E.' 1 'Thiviyanathan, V.' 2 'Rice, J.S.' 3 'Luxon, B.A.' 4 'Shah, J.H.' 5 'Yagi, H.' 6 'Sayer, J.M.' 7 'Yeh, H.J.C.' 8 'Jerina, D.M.' 9 'Gorenstein, D.G.' 10 # _citation.id primary _citation.title ;Solution Structure of a Cis-Opened (10R)-N6-Deoxyadenosine Adduct of (9S,10R)-(9,10)-Epoxy-7,8,9,10-tetrahydrobenzo[a]pyrene in a DNA Duplex ; _citation.journal_abbrev Biochemistry _citation.journal_volume 42 _citation.page_first 1410 _citation.page_last 1420 _citation.year 2003 _citation.journal_id_ASTM BICHAW _citation.country US _citation.journal_id_ISSN 0006-2960 _citation.journal_id_CSD 0033 _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 12578353 _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1021/bi026745u # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Volk, D.E.' 1 ? primary 'Thiviyanathan, V.' 2 ? primary 'Rice, J.S.' 3 ? primary 'Luxon, B.A.' 4 ? primary 'Shah, J.H.' 5 ? primary 'Yagi, H.' 6 ? primary 'Sayer, J.M.' 7 ? primary 'Yeh, H.J.C.' 8 ? primary 'Jerina, D.M.' 9 ? primary 'Gorenstein, D.G.' 10 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer syn "5'-D(*CP*GP*GP*TP*CP*AP*CP*GP*AP*GP*G)-3'" 3399.223 1 ? ? ? ? 2 polymer syn "5'-D(*CP*CP*TP*CP*GP*TP*GP*AP*CP*CP*G)-3'" 3310.161 1 ? ? ? ? 3 non-polymer syn '(9S,10R)-9-HYDROXY-7,8,9,10-TETRAHYDROBENZO[A]PYRENE' 272.340 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 polydeoxyribonucleotide no no '(DC)(DG)(DG)(DT)(DC)(DA)(DC)(DG)(DA)(DG)(DG)' CGGTCACGAGG A ? 2 polydeoxyribonucleotide no no '(DC)(DC)(DT)(DC)(DG)(DT)(DG)(DA)(DC)(DC)(DG)' CCTCGTGACCG B ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DC n 1 2 DG n 1 3 DG n 1 4 DT n 1 5 DC n 1 6 DA n 1 7 DC n 1 8 DG n 1 9 DA n 1 10 DG n 1 11 DG n 2 1 DC n 2 2 DC n 2 3 DT n 2 4 DC n 2 5 DG n 2 6 DT n 2 7 DG n 2 8 DA n 2 9 DC n 2 10 DC n 2 11 DG n # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 1 PDB 1N8C 1N8C ? ? ? 2 2 PDB 1N8C 1N8C ? ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1N8C A 1 ? 11 ? 1N8C 1 ? 11 ? 1 11 2 2 1N8C B 1 ? 11 ? 1N8C 12 ? 22 ? 12 22 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 TBC non-polymer . '(9S,10R)-9-HYDROXY-7,8,9,10-TETRAHYDROBENZO[A]PYRENE' ? 'C20 H16 O' 272.340 # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.type 1 2 2 '2D NOESY' 2 1 1 '2D NOESY' 3 2 2 '2D TOCSY' 4 2 2 '2D ROESY' 5 2 2 Exchange-Only # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units 1 278 ambient 6.7 '100 mM' ? K 2 288 ambient 6.7 '100 mM' ? K # loop_ _pdbx_nmr_sample_details.solution_id _pdbx_nmr_sample_details.contents _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system 1 '1 mM Duplex: 20 mM sodium phosphate (pH 6.7); 56 mM NaCl; 50 uM sodium azide' '90% H2O/10% D2O' 2 '1 mM Duplex: 20 mM sodium phosphate (pH 6.7); 56 mM NaCl; 50 uM sodium azide' '99.96% D2O' # loop_ _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id _pdbx_nmr_spectrometer.type _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer _pdbx_nmr_spectrometer.model _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength 1 ? Varian UNITYPLUS 750 2 ? Varian UNITYPLUS 600 # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 1N8C _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 11 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 11 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria '10 structures and their minimized average were deposited' _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.entry_id 1N8C _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'minimized average structure' # loop_ _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.authors _pdbx_nmr_software.ordinal VNMR 6.1 collection ? 1 VNMR 6.1 'data analysis' ? 2 MORASS 2.51 'iterative matrix relaxation' 'D.G.Gorenstein, et al. UTMB' 3 Amber '5.0, 6.0, and 7.0' refinement PEARLMAN,CASE,CALDWELL,ROSS,CHEATHAM,FERGUSON,SEIBEL,SINGH,WEINER,KOLLMAN 4 # _exptl.entry_id 1N8C _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.crystals_number ? # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews ? _exptl_crystal.density_percent_sol ? _exptl_crystal.description ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp ? _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type ? # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength . _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _struct.entry_id 1N8C _struct.title ;Solution Structure of a Cis-Opened (10R)-N6-Deoxyadenosine Adduct of (9S,10R)-(9,10)-Epoxy-7,8,9,10-tetrahydrobenzo[a]pyrene in a DNA Duplex ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details 'minimized average' # _struct_keywords.entry_id 1N8C _struct_keywords.pdbx_keywords DNA _struct_keywords.text 'Benzo[a]pyrene, 7, 8, 9, 10-Tetrahydrobenzo[a]pyrene, DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? # _struct_biol.id 1 # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role covale1 covale none ? A DA 6 N6 ? ? ? 1_555 C TBC . C10 ? ? A DA 6 A TBC 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.378 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A DC 1 N3 ? ? ? 1_555 B DG 11 N1 ? ? A DC 1 B DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DC 1 N4 ? ? ? 1_555 B DG 11 O6 ? ? A DC 1 B DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DC 1 O2 ? ? ? 1_555 B DG 11 N2 ? ? A DC 1 B DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DG 2 N1 ? ? ? 1_555 B DC 10 N3 ? ? A DG 2 B DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DG 2 N2 ? ? ? 1_555 B DC 10 O2 ? ? A DG 2 B DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DG 2 O6 ? ? ? 1_555 B DC 10 N4 ? ? A DG 2 B DC 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DG 3 N1 ? ? ? 1_555 B DC 9 N3 ? ? A DG 3 B DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DG 3 N2 ? ? ? 1_555 B DC 9 O2 ? ? A DG 3 B DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DG 3 O6 ? ? ? 1_555 B DC 9 N4 ? ? A DG 3 B DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DT 4 N3 ? ? ? 1_555 B DA 8 N1 ? ? A DT 4 B DA 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DT 4 O4 ? ? ? 1_555 B DA 8 N6 ? ? A DT 4 B DA 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DC 5 N3 ? ? ? 1_555 B DG 7 N1 ? ? A DC 5 B DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DC 5 N4 ? ? ? 1_555 B DG 7 O6 ? ? A DC 5 B DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DC 5 O2 ? ? ? 1_555 B DG 7 N2 ? ? A DC 5 B DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DA 6 N1 ? ? ? 1_555 B DT 6 N3 ? ? A DA 6 B DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DA 6 N6 ? ? ? 1_555 B DT 6 O4 ? ? A DA 6 B DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DC 7 N3 ? ? ? 1_555 B DG 5 N1 ? ? A DC 7 B DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DC 7 N4 ? ? ? 1_555 B DG 5 O6 ? ? A DC 7 B DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DC 7 O2 ? ? ? 1_555 B DG 5 N2 ? ? A DC 7 B DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DG 8 N1 ? ? ? 1_555 B DC 4 N3 ? ? A DG 8 B DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DG 8 N2 ? ? ? 1_555 B DC 4 O2 ? ? A DG 8 B DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DG 8 O6 ? ? ? 1_555 B DC 4 N4 ? ? A DG 8 B DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A DA 9 N1 ? ? ? 1_555 B DT 3 N3 ? ? A DA 9 B DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DA 9 N6 ? ? ? 1_555 B DT 3 O4 ? ? A DA 9 B DT 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DG 10 N1 ? ? ? 1_555 B DC 2 N3 ? ? A DG 10 B DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A DG 10 N2 ? ? ? 1_555 B DC 2 O2 ? ? A DG 10 B DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A DG 10 O6 ? ? ? 1_555 B DC 2 N4 ? ? A DG 10 B DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A DG 11 N1 ? ? ? 1_555 B DC 1 N3 ? ? A DG 11 B DC 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? A DG 11 N2 ? ? ? 1_555 B DC 1 O2 ? ? A DG 11 B DC 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? A DG 11 O6 ? ? ? 1_555 B DC 1 N4 ? ? A DG 11 B DC 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? hydrog ? ? # _struct_site.id AC1 _struct_site.pdbx_evidence_code Software _struct_site.pdbx_auth_asym_id A _struct_site.pdbx_auth_comp_id TBC _struct_site.pdbx_auth_seq_id 23 _struct_site.pdbx_auth_ins_code ? _struct_site.pdbx_num_residues 5 _struct_site.details 'BINDING SITE FOR RESIDUE TBC A 23' # loop_ _struct_site_gen.id _struct_site_gen.site_id _struct_site_gen.pdbx_num_res _struct_site_gen.label_comp_id _struct_site_gen.label_asym_id _struct_site_gen.label_seq_id _struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code _struct_site_gen.auth_comp_id _struct_site_gen.auth_asym_id _struct_site_gen.auth_seq_id _struct_site_gen.label_atom_id _struct_site_gen.label_alt_id _struct_site_gen.symmetry _struct_site_gen.details 1 AC1 5 DC A 5 ? DC A 5 . ? 1_555 ? 2 AC1 5 DA A 6 ? DA A 6 . ? 1_555 ? 3 AC1 5 DC A 7 ? DC A 7 . ? 1_555 ? 4 AC1 5 DT B 6 ? DT B 17 . ? 1_555 ? 5 AC1 5 DG B 7 ? DG B 18 . ? 1_555 ? # _database_PDB_matrix.entry_id 1N8C _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _atom_sites.entry_id 1N8C _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C H N O P # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 DC 1 1 1 DC C A . n A 1 2 DG 2 2 2 DG G A . n A 1 3 DG 3 3 3 DG G A . n A 1 4 DT 4 4 4 DT T A . n A 1 5 DC 5 5 5 DC C A . n A 1 6 DA 6 6 6 DA +A A . n A 1 7 DC 7 7 7 DC C A . n A 1 8 DG 8 8 8 DG G A . n A 1 9 DA 9 9 9 DA A A . n A 1 10 DG 10 10 10 DG G A . n A 1 11 DG 11 11 11 DG G A . n B 2 1 DC 1 12 12 DC C B . n B 2 2 DC 2 13 13 DC C B . n B 2 3 DT 3 14 14 DT T B . n B 2 4 DC 4 15 15 DC C B . n B 2 5 DG 5 16 16 DG G B . n B 2 6 DT 6 17 17 DT T B . n B 2 7 DG 7 18 18 DG G B . n B 2 8 DA 8 19 19 DA A B . n B 2 9 DC 9 20 20 DC C B . n B 2 10 DC 10 21 21 DC C B . n B 2 11 DG 11 22 22 DG G B . n # _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id C _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id 3 _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id TBC _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num 1 _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num 23 _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num 23 _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id TBC _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id THB _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id A _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code . # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2003-02-14 2 'Structure model' 1 1 2008-04-28 3 'Structure model' 1 2 2011-07-13 4 'Structure model' 1 3 2022-02-23 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Version format compliance' 3 4 'Structure model' 'Data collection' 4 4 'Structure model' 'Database references' 5 4 'Structure model' 'Derived calculations' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 4 'Structure model' database_2 2 4 'Structure model' pdbx_nmr_software 3 4 'Structure model' pdbx_struct_assembly 4 4 'Structure model' pdbx_struct_oper_list 5 4 'Structure model' struct_conn 6 4 'Structure model' struct_site # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 2 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 3 4 'Structure model' '_pdbx_nmr_software.name' 4 4 'Structure model' '_struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag' 5 4 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_asym_id' 6 4 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_comp_id' 7 4 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_seq_id' # _pdbx_validate_rmsd_bond.id 1 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_model_num 2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_1 "C5'" _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_1 A _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_1 DC _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_1 1 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_1 ? _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_1 ? _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_2 "C4'" _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_2 A _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_2 DC _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_2 1 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_2 ? _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_2 ? _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_value 1.560 _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_target_value 1.512 _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_deviation 0.048 _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_standard_deviation 0.007 _pdbx_validate_rmsd_bond.linker_flag N # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 "O4'" A DC 1 ? ? "C4'" A DC 1 ? ? "C3'" A DC 1 ? ? 109.92 106.00 3.92 0.60 N 2 1 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.52 121.90 -4.38 0.70 N 3 1 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.51 108.30 2.21 0.30 N 4 1 "O4'" A DT 4 ? ? "C4'" A DT 4 ? ? "C3'" A DT 4 ? ? 109.61 106.00 3.61 0.60 N 5 1 "C3'" A DC 5 ? ? "O3'" A DC 5 ? ? P A DA 6 ? ? 126.90 119.70 7.20 1.20 Y 6 1 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 112.59 118.60 -6.01 0.60 N 7 1 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.17 117.00 -3.83 0.50 N 8 1 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.41 117.70 3.71 0.50 N 9 1 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 114.30 118.60 -4.30 0.60 N 10 1 "O4'" B DC 12 ? ? "C4'" B DC 12 ? ? "C3'" B DC 12 ? ? 109.66 106.00 3.66 0.60 N 11 1 "O4'" B DC 12 ? ? "C1'" B DC 12 ? ? N1 B DC 12 ? ? 110.18 108.30 1.88 0.30 N 12 1 "O4'" B DT 17 ? ? "C1'" B DT 17 ? ? N1 B DT 17 ? ? 110.16 108.30 1.86 0.30 N 13 1 C6 B DT 17 ? ? C5 B DT 17 ? ? C7 B DT 17 ? ? 118.85 122.90 -4.05 0.60 N 14 1 N3 B DG 18 ? ? C2 B DG 18 ? ? N2 B DG 18 ? ? 115.27 119.90 -4.63 0.70 N 15 1 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 113.43 117.00 -3.57 0.50 N 16 1 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 120.86 117.70 3.16 0.50 N 17 1 N1 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N6 B DA 19 ? ? 114.09 118.60 -4.51 0.60 N 18 1 "O4'" B DC 20 ? ? "C1'" B DC 20 ? ? N1 B DC 20 ? ? 111.11 108.30 2.81 0.30 N 19 1 "O4'" B DC 21 ? ? "C1'" B DC 21 ? ? N1 B DC 21 ? ? 110.51 108.30 2.21 0.30 N 20 1 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 111.80 108.30 3.50 0.30 N 21 2 "C3'" A DC 1 ? ? "C2'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? 109.81 102.50 7.31 1.20 N 22 2 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 111.71 108.30 3.41 0.30 N 23 2 N1 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 123.02 118.90 4.12 0.60 N 24 2 "O4'" A DG 2 ? ? "C4'" A DG 2 ? ? "C3'" A DG 2 ? ? 109.99 106.00 3.99 0.60 N 25 2 N3 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? N2 A DG 2 ? ? 114.78 119.90 -5.12 0.70 N 26 2 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 111.16 108.30 2.86 0.30 N 27 2 N3 A DG 3 ? ? C4 A DG 3 ? ? C5 A DG 3 ? ? 125.21 128.60 -3.39 0.50 N 28 2 "C3'" A DG 3 ? ? "O3'" A DG 3 ? ? P A DT 4 ? ? 127.95 119.70 8.25 1.20 Y 29 2 "O4'" A DT 4 ? ? "C4'" A DT 4 ? ? "C3'" A DT 4 ? ? 110.13 106.00 4.13 0.60 N 30 2 "O4'" A DT 4 ? ? "C1'" A DT 4 ? ? N1 A DT 4 ? ? 111.17 108.30 2.87 0.30 N 31 2 C6 A DT 4 ? ? N1 A DT 4 ? ? C2 A DT 4 ? ? 118.24 121.30 -3.06 0.50 N 32 2 C5 A DT 4 ? ? C4 A DT 4 ? ? O4 A DT 4 ? ? 129.22 124.90 4.32 0.70 N 33 2 N1 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 122.69 118.90 3.79 0.60 N 34 2 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.65 121.90 -4.25 0.70 N 35 2 "O4'" A DA 6 ? ? "C4'" A DA 6 ? ? "C3'" A DA 6 ? ? 100.32 104.50 -4.18 0.40 N 36 2 "O4'" A DA 6 ? ? "C1'" A DA 6 ? ? N9 A DA 6 ? ? 115.23 108.30 6.93 0.30 N 37 2 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 114.39 118.60 -4.21 0.60 N 38 2 N3 A DC 7 ? ? C4 A DC 7 ? ? N4 A DC 7 ? ? 112.13 118.00 -5.87 0.70 N 39 2 C5 A DC 7 ? ? C4 A DC 7 ? ? N4 A DC 7 ? ? 125.22 120.20 5.02 0.70 N 40 2 "O4'" A DA 9 ? ? "C4'" A DA 9 ? ? "C3'" A DA 9 ? ? 110.52 106.00 4.52 0.60 N 41 2 "O4'" A DA 9 ? ? "C1'" A DA 9 ? ? N9 A DA 9 ? ? 103.33 108.00 -4.67 0.70 N 42 2 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 111.96 118.60 -6.64 0.60 N 43 2 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 103.10 108.00 -4.90 0.70 N 44 2 "C3'" B DC 13 ? ? "C2'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? 97.36 102.40 -5.04 0.80 N 45 2 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.76 121.90 -5.14 0.70 N 46 2 "C3'" B DT 14 ? ? "O3'" B DT 14 ? ? P B DC 15 ? ? 126.96 119.70 7.26 1.20 Y 47 2 "O4'" B DC 15 ? ? "C1'" B DC 15 ? ? N1 B DC 15 ? ? 110.72 108.30 2.42 0.30 N 48 2 N3 B DC 15 ? ? C4 B DC 15 ? ? C5 B DC 15 ? ? 125.15 121.90 3.25 0.40 N 49 2 C4 B DC 15 ? ? C5 B DC 15 ? ? C6 B DC 15 ? ? 113.90 117.40 -3.50 0.50 N 50 2 "O4'" B DG 16 ? ? "C1'" B DG 16 ? ? "C2'" B DG 16 ? ? 110.93 106.80 4.13 0.50 N 51 2 C4 B DG 16 ? ? C5 B DG 16 ? ? N7 B DG 16 ? ? 108.31 110.80 -2.49 0.40 N 52 2 C6 B DG 16 ? ? C5 B DG 16 ? ? N7 B DG 16 ? ? 135.64 130.40 5.24 0.60 N 53 2 N1 B DG 16 ? ? C6 B DG 16 ? ? O6 B DG 16 ? ? 114.52 119.90 -5.38 0.60 N 54 2 "O4'" B DT 17 ? ? "C1'" B DT 17 ? ? N1 B DT 17 ? ? 113.91 108.30 5.61 0.30 N 55 2 N1 B DT 17 ? ? C2 B DT 17 ? ? N3 B DT 17 ? ? 118.41 114.60 3.81 0.60 N 56 2 C5 B DT 17 ? ? C6 B DT 17 ? ? N1 B DT 17 ? ? 119.23 123.70 -4.47 0.60 N 57 2 N3 B DT 17 ? ? C2 B DT 17 ? ? O2 B DT 17 ? ? 118.49 122.30 -3.81 0.60 N 58 2 C6 B DT 17 ? ? C5 B DT 17 ? ? C7 B DT 17 ? ? 116.44 122.90 -6.46 0.60 N 59 2 "O4'" B DG 18 ? ? "C1'" B DG 18 ? ? N9 B DG 18 ? ? 111.17 108.30 2.87 0.30 N 60 2 N1 B DG 18 ? ? C2 B DG 18 ? ? N2 B DG 18 ? ? 124.00 116.20 7.80 0.90 N 61 2 N3 B DG 18 ? ? C2 B DG 18 ? ? N2 B DG 18 ? ? 111.70 119.90 -8.20 0.70 N 62 2 N1 B DG 18 ? ? C6 B DG 18 ? ? O6 B DG 18 ? ? 114.32 119.90 -5.58 0.60 N 63 2 "C5'" B DA 19 ? ? "C4'" B DA 19 ? ? "O4'" B DA 19 ? ? 117.91 109.80 8.11 1.10 N 64 2 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 113.37 117.00 -3.63 0.50 N 65 2 "O4'" B DC 20 ? ? "C1'" B DC 20 ? ? N1 B DC 20 ? ? 116.38 108.30 8.08 0.30 N 66 2 "O4'" B DC 21 ? ? "C4'" B DC 21 ? ? "C3'" B DC 21 ? ? 110.72 106.00 4.72 0.60 N 67 2 "O4'" B DC 21 ? ? "C1'" B DC 21 ? ? N1 B DC 21 ? ? 114.16 108.30 5.86 0.30 N 68 2 N1 B DC 21 ? ? C2 B DC 21 ? ? O2 B DC 21 ? ? 123.16 118.90 4.26 0.60 N 69 2 N3 B DC 21 ? ? C2 B DC 21 ? ? O2 B DC 21 ? ? 116.01 121.90 -5.89 0.70 N 70 2 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 112.75 108.30 4.45 0.30 N 71 2 N7 B DG 22 ? ? C8 B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 117.15 113.10 4.05 0.50 N 72 2 C8 B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? C4 B DG 22 ? ? 102.69 106.40 -3.71 0.40 N 73 2 N3 B DG 22 ? ? C2 B DG 22 ? ? N2 B DG 22 ? ? 114.70 119.90 -5.20 0.70 N 74 3 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.45 121.90 -4.45 0.70 N 75 3 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.67 108.30 2.37 0.30 N 76 3 "O4'" A DT 4 ? ? "C4'" A DT 4 ? ? "C3'" A DT 4 ? ? 109.99 106.00 3.99 0.60 N 77 3 "O4'" A DT 4 ? ? "C1'" A DT 4 ? ? N1 A DT 4 ? ? 110.15 108.30 1.85 0.30 N 78 3 "C3'" A DC 5 ? ? "O3'" A DC 5 ? ? P A DA 6 ? ? 128.37 119.70 8.67 1.20 Y 79 3 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 112.90 118.60 -5.70 0.60 N 80 3 N1 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 122.58 118.90 3.68 0.60 N 81 3 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 117.41 121.90 -4.49 0.70 N 82 3 N3 A DC 7 ? ? C4 A DC 7 ? ? N4 A DC 7 ? ? 113.18 118.00 -4.82 0.70 N 83 3 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 110.27 108.30 1.97 0.30 N 84 3 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.78 117.00 -3.22 0.50 N 85 3 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 86 3 "O4'" B DC 12 ? ? "C1'" B DC 12 ? ? N1 B DC 12 ? ? 110.52 108.30 2.22 0.30 N 87 3 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 113.35 117.00 -3.65 0.50 N 88 3 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 120.91 117.70 3.21 0.50 N 89 3 N1 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N6 B DA 19 ? ? 114.87 118.60 -3.73 0.60 N 90 3 "O4'" B DC 20 ? ? "C1'" B DC 20 ? ? N1 B DC 20 ? ? 112.78 108.30 4.48 0.30 N 91 3 "O4'" B DC 21 ? ? "C1'" B DC 21 ? ? N1 B DC 21 ? ? 110.72 108.30 2.42 0.30 N 92 3 N3 B DC 21 ? ? C2 B DC 21 ? ? O2 B DC 21 ? ? 117.35 121.90 -4.55 0.70 N 93 3 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 112.32 108.30 4.02 0.30 N 94 4 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.16 108.30 1.86 0.30 N 95 4 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.51 121.90 -4.39 0.70 N 96 4 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.33 108.30 2.03 0.30 N 97 4 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 110.88 108.30 2.58 0.30 N 98 4 "O4'" A DT 4 ? ? "C4'" A DT 4 ? ? "C3'" A DT 4 ? ? 110.43 106.00 4.43 0.60 N 99 4 "O4'" A DT 4 ? ? "C1'" A DT 4 ? ? N1 A DT 4 ? ? 110.29 108.30 1.99 0.30 N 100 4 C6 A DT 4 ? ? C5 A DT 4 ? ? C7 A DT 4 ? ? 119.13 122.90 -3.77 0.60 N 101 4 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.65 118.60 -4.95 0.60 N 102 4 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.57 117.00 -3.43 0.50 N 103 4 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.09 117.70 3.39 0.50 N 104 4 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.73 118.60 -4.87 0.60 N 105 4 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 110.72 108.30 2.42 0.30 N 106 4 C6 B DT 14 ? ? C5 B DT 14 ? ? C7 B DT 14 ? ? 118.00 122.90 -4.90 0.60 N 107 4 N3 B DG 16 ? ? C2 B DG 16 ? ? N2 B DG 16 ? ? 115.46 119.90 -4.44 0.70 N 108 4 "O4'" B DT 17 ? ? "C1'" B DT 17 ? ? N1 B DT 17 ? ? 111.00 108.30 2.70 0.30 N 109 4 C6 B DT 17 ? ? C5 B DT 17 ? ? C7 B DT 17 ? ? 119.07 122.90 -3.83 0.60 N 110 4 "O4'" B DG 18 ? ? "C1'" B DG 18 ? ? N9 B DG 18 ? ? 110.35 108.30 2.05 0.30 N 111 4 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 113.87 117.00 -3.13 0.50 N 112 4 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 120.87 117.70 3.17 0.50 N 113 4 N1 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N6 B DA 19 ? ? 114.10 118.60 -4.50 0.60 N 114 4 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 112.40 108.30 4.10 0.30 N 115 5 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.23 121.90 -4.67 0.70 N 116 5 "O4'" A DG 2 ? ? "C4'" A DG 2 ? ? "C3'" A DG 2 ? ? 109.72 106.00 3.72 0.60 N 117 5 N3 A DG 2 ? ? C2 A DG 2 ? ? N2 A DG 2 ? ? 113.05 119.90 -6.85 0.70 N 118 5 "O4'" A DG 3 ? ? "C4'" A DG 3 ? ? "C3'" A DG 3 ? ? 109.63 106.00 3.63 0.60 N 119 5 "O4'" A DT 4 ? ? "C4'" A DT 4 ? ? "C3'" A DT 4 ? ? 110.03 106.00 4.03 0.60 N 120 5 "O4'" A DC 5 ? ? "C4'" A DC 5 ? ? "C3'" A DC 5 ? ? 101.07 104.50 -3.43 0.40 N 121 5 "C3'" A DC 5 ? ? "O3'" A DC 5 ? ? P A DA 6 ? ? 127.89 119.70 8.19 1.20 Y 122 5 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.30 118.60 -5.30 0.60 N 123 5 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 112.69 117.00 -4.31 0.50 N 124 5 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.98 117.70 4.28 0.50 N 125 5 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 114.05 118.60 -4.55 0.60 N 126 5 "O4'" B DC 13 ? ? "C4'" B DC 13 ? ? "C3'" B DC 13 ? ? 110.02 106.00 4.02 0.60 N 127 5 "O4'" B DT 17 ? ? "C1'" B DT 17 ? ? N1 B DT 17 ? ? 111.11 108.30 2.81 0.30 N 128 5 N3 B DG 18 ? ? C2 B DG 18 ? ? N2 B DG 18 ? ? 115.59 119.90 -4.31 0.70 N 129 5 "O4'" B DA 19 ? ? "C4'" B DA 19 ? ? "C3'" B DA 19 ? ? 109.98 106.00 3.98 0.60 N 130 5 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 112.88 117.00 -4.12 0.50 N 131 5 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 121.05 117.70 3.35 0.50 N 132 5 N1 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N6 B DA 19 ? ? 113.30 118.60 -5.30 0.60 N 133 5 "O4'" B DC 20 ? ? "C1'" B DC 20 ? ? N1 B DC 20 ? ? 110.60 108.30 2.30 0.30 N 134 5 N3 B DC 21 ? ? C4 B DC 21 ? ? N4 B DC 21 ? ? 112.74 118.00 -5.26 0.70 N 135 5 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 113.12 108.30 4.82 0.30 N 136 6 "O4'" A DC 1 ? ? "C4'" A DC 1 ? ? "C3'" A DC 1 ? ? 109.74 106.00 3.74 0.60 N 137 6 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.24 121.90 -4.66 0.70 N 138 6 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 111.24 108.30 2.94 0.30 N 139 6 "C3'" A DC 5 ? ? "O3'" A DC 5 ? ? P A DA 6 ? ? 128.97 119.70 9.27 1.20 Y 140 6 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 112.95 118.60 -5.65 0.60 N 141 6 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.41 117.00 -3.59 0.50 N 142 6 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.65 117.70 3.95 0.50 N 143 6 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.70 118.60 -4.90 0.60 N 144 6 "O4'" B DC 12 ? ? "C1'" B DC 12 ? ? N1 B DC 12 ? ? 110.14 108.30 1.84 0.30 N 145 6 C6 B DT 14 ? ? C5 B DT 14 ? ? C7 B DT 14 ? ? 118.73 122.90 -4.17 0.60 N 146 6 "O4'" B DT 17 ? ? "C1'" B DT 17 ? ? N1 B DT 17 ? ? 111.21 108.30 2.91 0.30 N 147 6 C6 B DT 17 ? ? C5 B DT 17 ? ? C7 B DT 17 ? ? 119.13 122.90 -3.77 0.60 N 148 6 N3 B DG 18 ? ? C2 B DG 18 ? ? N2 B DG 18 ? ? 115.41 119.90 -4.49 0.70 N 149 6 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 113.35 117.00 -3.65 0.50 N 150 6 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 120.83 117.70 3.13 0.50 N 151 6 N1 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N6 B DA 19 ? ? 114.00 118.60 -4.60 0.60 N 152 6 "O4'" B DC 20 ? ? "C1'" B DC 20 ? ? N1 B DC 20 ? ? 111.19 108.30 2.89 0.30 N 153 6 N3 B DC 20 ? ? C2 B DC 20 ? ? O2 B DC 20 ? ? 117.62 121.90 -4.28 0.70 N 154 6 "O4'" B DC 21 ? ? "C1'" B DC 21 ? ? N1 B DC 21 ? ? 110.49 108.30 2.19 0.30 N 155 6 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.69 108.30 2.39 0.30 N 156 7 "O4'" A DC 1 ? ? "C4'" A DC 1 ? ? "C3'" A DC 1 ? ? 110.54 106.00 4.54 0.60 N 157 7 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.12 108.30 1.82 0.30 N 158 7 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.26 121.90 -4.64 0.70 N 159 7 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 111.36 108.30 3.06 0.30 N 160 7 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 111.16 108.30 2.86 0.30 N 161 7 "O4'" A DT 4 ? ? "C1'" A DT 4 ? ? N1 A DT 4 ? ? 112.24 108.30 3.94 0.30 N 162 7 C6 A DT 4 ? ? C5 A DT 4 ? ? C7 A DT 4 ? ? 119.05 122.90 -3.85 0.60 N 163 7 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 112.95 118.60 -5.65 0.60 N 164 7 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.25 117.00 -3.75 0.50 N 165 7 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.18 117.70 3.48 0.50 N 166 7 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 114.44 118.60 -4.16 0.60 N 167 7 "O4'" B DC 15 ? ? "C4'" B DC 15 ? ? "C3'" B DC 15 ? ? 109.63 106.00 3.63 0.60 N 168 7 "O4'" B DG 16 ? ? "C4'" B DG 16 ? ? "C3'" B DG 16 ? ? 109.61 106.00 3.61 0.60 N 169 7 C6 B DT 17 ? ? C5 B DT 17 ? ? C7 B DT 17 ? ? 118.64 122.90 -4.26 0.60 N 170 7 N3 B DG 18 ? ? C2 B DG 18 ? ? N2 B DG 18 ? ? 115.51 119.90 -4.39 0.70 N 171 7 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 113.52 117.00 -3.48 0.50 N 172 7 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 121.37 117.70 3.67 0.50 N 173 7 "O4'" B DC 20 ? ? "C1'" B DC 20 ? ? N1 B DC 20 ? ? 112.63 108.30 4.33 0.30 N 174 7 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.90 108.30 2.60 0.30 N 175 8 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 112.09 118.60 -6.51 0.60 N 176 8 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 117.40 121.90 -4.50 0.70 N 177 8 N3 A DC 7 ? ? C4 A DC 7 ? ? N4 A DC 7 ? ? 113.53 118.00 -4.47 0.70 N 178 8 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 111.34 108.30 3.04 0.30 N 179 8 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.34 117.00 -3.66 0.50 N 180 8 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.35 117.70 3.65 0.50 N 181 8 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.85 118.60 -4.75 0.60 N 182 8 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 110.20 108.30 1.90 0.30 N 183 8 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 111.00 108.30 2.70 0.30 N 184 8 "O4'" B DC 12 ? ? "C4'" B DC 12 ? ? "C3'" B DC 12 ? ? 109.84 106.00 3.84 0.60 N 185 8 "O4'" B DC 15 ? ? "C4'" B DC 15 ? ? "C3'" B DC 15 ? ? 109.78 106.00 3.78 0.60 N 186 8 N3 B DC 15 ? ? C2 B DC 15 ? ? O2 B DC 15 ? ? 117.69 121.90 -4.21 0.70 N 187 8 "O4'" B DT 17 ? ? "C1'" B DT 17 ? ? N1 B DT 17 ? ? 112.12 108.30 3.82 0.30 N 188 8 C6 B DT 17 ? ? C5 B DT 17 ? ? C7 B DT 17 ? ? 118.80 122.90 -4.10 0.60 N 189 8 "O4'" B DG 18 ? ? "C1'" B DG 18 ? ? N9 B DG 18 ? ? 110.17 108.30 1.87 0.30 N 190 8 N3 B DG 18 ? ? C2 B DG 18 ? ? N2 B DG 18 ? ? 115.61 119.90 -4.29 0.70 N 191 8 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 113.41 117.00 -3.59 0.50 N 192 8 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 120.72 117.70 3.02 0.50 N 193 8 N1 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N6 B DA 19 ? ? 113.76 118.60 -4.84 0.60 N 194 8 "O4'" B DC 20 ? ? "C1'" B DC 20 ? ? N1 B DC 20 ? ? 110.14 108.30 1.84 0.30 N 195 8 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.39 108.30 2.09 0.30 N 196 9 "O4'" A DC 1 ? ? "C4'" A DC 1 ? ? "C3'" A DC 1 ? ? 109.75 106.00 3.75 0.60 N 197 9 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 111.77 108.30 3.47 0.30 N 198 9 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.39 121.90 -4.51 0.70 N 199 9 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.88 108.30 2.58 0.30 N 200 9 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.28 118.60 -5.32 0.60 N 201 9 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 117.47 121.90 -4.43 0.70 N 202 9 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.23 117.00 -3.77 0.50 N 203 9 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.58 117.70 3.88 0.50 N 204 9 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.50 118.60 -5.10 0.60 N 205 9 "O4'" B DC 12 ? ? "C1'" B DC 12 ? ? N1 B DC 12 ? ? 111.37 108.30 3.07 0.30 N 206 9 C6 B DT 14 ? ? C5 B DT 14 ? ? C7 B DT 14 ? ? 118.99 122.90 -3.91 0.60 N 207 9 "O4'" B DC 15 ? ? "C4'" B DC 15 ? ? "C3'" B DC 15 ? ? 109.74 106.00 3.74 0.60 N 208 9 N3 B DG 18 ? ? C2 B DG 18 ? ? N2 B DG 18 ? ? 114.59 119.90 -5.31 0.70 N 209 9 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 121.13 117.70 3.43 0.50 N 210 9 N1 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N6 B DA 19 ? ? 114.58 118.60 -4.02 0.60 N 211 9 "O4'" B DC 20 ? ? "C1'" B DC 20 ? ? N1 B DC 20 ? ? 112.40 108.30 4.10 0.30 N 212 9 "O4'" B DC 21 ? ? "C1'" B DC 21 ? ? N1 B DC 21 ? ? 110.14 108.30 1.84 0.30 N 213 9 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 112.83 108.30 4.53 0.30 N 214 10 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.87 108.30 4.57 0.30 N 215 10 "O4'" A DT 4 ? ? "C4'" A DT 4 ? ? "C3'" A DT 4 ? ? 110.18 106.00 4.18 0.60 N 216 10 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.26 118.60 -5.34 0.60 N 217 10 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 117.01 121.90 -4.89 0.70 N 218 10 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.31 117.00 -3.69 0.50 N 219 10 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.24 117.70 3.54 0.50 N 220 10 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 110.43 108.30 2.13 0.30 N 221 10 "O4'" B DC 12 ? ? "C4'" B DC 12 ? ? "C3'" B DC 12 ? ? 110.05 106.00 4.05 0.60 N 222 10 "O4'" B DC 12 ? ? "C1'" B DC 12 ? ? N1 B DC 12 ? ? 111.72 108.30 3.42 0.30 N 223 10 "O4'" B DC 15 ? ? "C1'" B DC 15 ? ? N1 B DC 15 ? ? 111.09 108.30 2.79 0.30 N 224 10 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 113.49 117.00 -3.51 0.50 N 225 10 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 121.06 117.70 3.36 0.50 N 226 10 "O4'" B DC 20 ? ? "C1'" B DC 20 ? ? N1 B DC 20 ? ? 111.96 108.30 3.66 0.30 N 227 10 N3 B DC 20 ? ? C2 B DC 20 ? ? O2 B DC 20 ? ? 117.67 121.90 -4.23 0.70 N 228 10 "O4'" B DC 21 ? ? "C1'" B DC 21 ? ? N1 B DC 21 ? ? 110.61 108.30 2.31 0.30 N 229 10 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 110.95 108.30 2.65 0.30 N 230 11 "O4'" A DC 1 ? ? "C4'" A DC 1 ? ? "C3'" A DC 1 ? ? 110.06 106.00 4.06 0.60 N 231 11 "O4'" A DC 1 ? ? "C1'" A DC 1 ? ? N1 A DC 1 ? ? 110.27 108.30 1.97 0.30 N 232 11 N3 A DC 1 ? ? C2 A DC 1 ? ? O2 A DC 1 ? ? 117.21 121.90 -4.69 0.70 N 233 11 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.66 108.30 2.36 0.30 N 234 11 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 110.14 108.30 1.84 0.30 N 235 11 "O4'" A DT 4 ? ? "C4'" A DT 4 ? ? "C3'" A DT 4 ? ? 109.65 106.00 3.65 0.60 N 236 11 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 112.79 118.60 -5.81 0.60 N 237 11 N3 A DC 7 ? ? C2 A DC 7 ? ? O2 A DC 7 ? ? 117.51 121.90 -4.39 0.70 N 238 11 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.28 117.00 -3.72 0.50 N 239 11 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.56 117.70 3.86 0.50 N 240 11 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 114.22 118.60 -4.38 0.60 N 241 11 "O4'" A DG 11 ? ? "C1'" A DG 11 ? ? N9 A DG 11 ? ? 110.61 108.30 2.31 0.30 N 242 11 "O4'" B DC 12 ? ? "C1'" B DC 12 ? ? N1 B DC 12 ? ? 110.54 108.30 2.24 0.30 N 243 11 "O4'" B DT 17 ? ? "C1'" B DT 17 ? ? N1 B DT 17 ? ? 110.57 108.30 2.27 0.30 N 244 11 C6 B DT 17 ? ? C5 B DT 17 ? ? C7 B DT 17 ? ? 119.25 122.90 -3.65 0.60 N 245 11 N3 B DG 18 ? ? C2 B DG 18 ? ? N2 B DG 18 ? ? 115.70 119.90 -4.20 0.70 N 246 11 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 113.47 117.00 -3.53 0.50 N 247 11 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 121.06 117.70 3.36 0.50 N 248 11 N1 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N6 B DA 19 ? ? 114.30 118.60 -4.30 0.60 N 249 11 "O4'" B DC 20 ? ? "C1'" B DC 20 ? ? N1 B DC 20 ? ? 111.30 108.30 3.00 0.30 N 250 11 "O4'" B DC 21 ? ? "C1'" B DC 21 ? ? N1 B DC 21 ? ? 110.56 108.30 2.26 0.30 N 251 11 "O4'" B DG 22 ? ? "C1'" B DG 22 ? ? N9 B DG 22 ? ? 111.56 108.30 3.26 0.30 N # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 DG A 8 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 2 1 DG B 18 ? ? 0.113 'SIDE CHAIN' 3 2 DG A 3 ? ? 0.099 'SIDE CHAIN' 4 2 DT A 4 ? ? 0.102 'SIDE CHAIN' 5 2 DC A 5 ? ? 0.119 'SIDE CHAIN' 6 2 DA A 6 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 7 2 DG A 8 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 8 2 DG A 10 ? ? 0.095 'SIDE CHAIN' 9 2 DG A 11 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 10 2 DT B 14 ? ? 0.099 'SIDE CHAIN' 11 2 DG B 18 ? ? 0.181 'SIDE CHAIN' 12 3 DC A 1 ? ? 0.075 'SIDE CHAIN' 13 3 DC A 5 ? ? 0.095 'SIDE CHAIN' 14 3 DG A 8 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 15 3 DG B 18 ? ? 0.082 'SIDE CHAIN' 16 3 DA B 19 ? ? 0.093 'SIDE CHAIN' 17 3 DG B 22 ? ? 0.115 'SIDE CHAIN' 18 4 DT A 4 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 19 4 DG A 8 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 20 4 DG A 11 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 21 4 DC B 12 ? ? 0.084 'SIDE CHAIN' 22 4 DG B 18 ? ? 0.091 'SIDE CHAIN' 23 4 DG B 22 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 24 5 DG A 2 ? ? 0.053 'SIDE CHAIN' 25 5 DG A 3 ? ? 0.067 'SIDE CHAIN' 26 5 DT A 4 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 27 5 DA A 6 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 28 5 DG A 8 ? ? 0.087 'SIDE CHAIN' 29 5 DG A 11 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 30 5 DC B 15 ? ? 0.085 'SIDE CHAIN' 31 5 DG B 18 ? ? 0.133 'SIDE CHAIN' 32 5 DG B 22 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 33 6 DT A 4 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 34 6 DG A 8 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 35 6 DA A 9 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 36 6 DC B 15 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 37 6 DG B 18 ? ? 0.129 'SIDE CHAIN' 38 6 DC B 21 ? ? 0.112 'SIDE CHAIN' 39 7 DG B 18 ? ? 0.125 'SIDE CHAIN' 40 8 DT A 4 ? ? 0.098 'SIDE CHAIN' 41 8 DG A 8 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 42 8 DA A 9 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 43 8 DG B 18 ? ? 0.140 'SIDE CHAIN' 44 8 DG B 22 ? ? 0.056 'SIDE CHAIN' 45 9 DG A 2 ? ? 0.063 'SIDE CHAIN' 46 9 DC A 5 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 47 9 DC A 7 ? ? 0.103 'SIDE CHAIN' 48 9 DA A 9 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 49 9 DG A 11 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 50 9 DG B 18 ? ? 0.127 'SIDE CHAIN' 51 10 DC A 7 ? ? 0.090 'SIDE CHAIN' 52 10 DG A 8 ? ? 0.086 'SIDE CHAIN' 53 10 DA A 9 ? ? 0.054 'SIDE CHAIN' 54 10 DG A 11 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 55 10 DC B 15 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 56 10 DG B 16 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 57 10 DG B 18 ? ? 0.107 'SIDE CHAIN' 58 10 DC B 20 ? ? 0.062 'SIDE CHAIN' 59 10 DC B 21 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 60 11 DG B 18 ? ? 0.105 'SIDE CHAIN' 61 11 DC B 21 ? ? 0.078 'SIDE CHAIN' # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 1N8C 'double helix' 1N8C 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DC 1 1_555 B DG 11 1_555 0.218 -0.136 -0.206 -0.907 -3.293 -0.892 1 A_DC1:DG22_B A 1 ? B 22 ? 19 1 1 A DG 2 1_555 B DC 10 1_555 -0.591 -0.171 0.503 20.688 4.039 1.801 2 A_DG2:DC21_B A 2 ? B 21 ? 19 1 1 A DG 3 1_555 B DC 9 1_555 -0.185 -0.125 0.267 6.215 -5.011 -2.803 3 A_DG3:DC20_B A 3 ? B 20 ? 19 1 1 A DT 4 1_555 B DA 8 1_555 -0.482 -0.049 0.013 9.493 -11.816 0.114 4 A_DT4:DA19_B A 4 ? B 19 ? 20 1 1 A DC 5 1_555 B DG 7 1_555 0.555 -0.226 -0.134 6.822 -19.063 4.113 5 A_DC5:DG18_B A 5 ? B 18 ? 19 1 1 A DA 6 1_555 B DT 6 1_555 -0.402 -0.040 -0.104 -18.057 33.634 8.208 6 A_DA6:DT17_B A 6 ? B 17 ? 20 1 1 A DC 7 1_555 B DG 5 1_555 0.487 -0.191 0.118 -4.480 22.018 2.674 7 A_DC7:DG16_B A 7 ? B 16 ? 19 1 1 A DG 8 1_555 B DC 4 1_555 -0.339 -0.158 0.290 12.892 -12.503 -0.457 8 A_DG8:DC15_B A 8 ? B 15 ? 19 1 1 A DA 9 1_555 B DT 3 1_555 0.158 -0.092 0.196 4.299 -11.411 -1.255 9 A_DA9:DT14_B A 9 ? B 14 ? 20 1 1 A DG 10 1_555 B DC 2 1_555 -0.260 -0.203 0.191 -5.976 -13.808 -2.379 10 A_DG10:DC13_B A 10 ? B 13 ? 19 1 1 A DG 11 1_555 B DC 1 1_555 -0.321 -0.191 0.152 -12.723 -19.025 -1.973 11 A_DG11:DC12_B A 11 ? B 12 ? 19 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A DC 1 1_555 B DG 11 1_555 A DG 2 1_555 B DC 10 1_555 0.101 1.309 3.018 -6.837 9.293 21.258 0.159 -2.427 3.130 23.125 17.013 24.156 1 AA_DC1DG2:DC21DG22_BB A 1 ? B 22 ? A 2 ? B 21 ? 1 A DG 2 1_555 B DC 10 1_555 A DG 3 1_555 B DC 9 1_555 0.211 -1.246 3.707 1.143 -1.435 37.553 -1.720 -0.158 3.755 -2.228 -1.775 37.597 2 AA_DG2DG3:DC20DC21_BB A 2 ? B 21 ? A 3 ? B 20 ? 1 A DG 3 1_555 B DC 9 1_555 A DT 4 1_555 B DA 8 1_555 -0.234 -0.725 3.233 3.341 -3.516 32.715 -0.682 0.974 3.252 -6.199 -5.891 33.063 3 AA_DG3DT4:DA19DC20_BB A 3 ? B 20 ? A 4 ? B 19 ? 1 A DT 4 1_555 B DA 8 1_555 A DC 5 1_555 B DG 7 1_555 0.674 -0.117 3.243 4.806 2.354 39.381 -0.447 -0.432 3.287 3.474 -7.091 39.729 4 AA_DT4DC5:DG18DA19_BB A 4 ? B 19 ? A 5 ? B 18 ? 1 A DC 5 1_555 B DG 7 1_555 A DA 6 1_555 B DT 6 1_555 -1.595 2.140 6.690 -19.907 10.275 12.496 -2.467 -10.532 5.374 28.073 54.390 25.613 5 AA_DC5DA6:DT17DG18_BB A 5 ? B 18 ? A 6 ? B 17 ? 1 A DA 6 1_555 B DT 6 1_555 A DC 7 1_555 B DG 5 1_555 -0.693 -0.680 3.250 1.330 7.869 16.283 -6.363 2.911 2.579 25.855 -4.371 18.122 6 AA_DA6DC7:DG16DT17_BB A 6 ? B 17 ? A 7 ? B 16 ? 1 A DC 7 1_555 B DG 5 1_555 A DG 8 1_555 B DC 4 1_555 -0.892 0.857 3.089 -1.878 -6.158 34.390 2.290 1.222 2.939 -10.303 3.143 34.969 7 AA_DC7DG8:DC15DG16_BB A 7 ? B 16 ? A 8 ? B 15 ? 1 A DG 8 1_555 B DC 4 1_555 A DA 9 1_555 B DT 3 1_555 0.126 -0.145 3.444 -0.398 2.527 40.086 -0.513 -0.230 3.427 3.682 0.580 40.164 8 AA_DG8DA9:DT14DC15_BB A 8 ? B 15 ? A 9 ? B 14 ? 1 A DA 9 1_555 B DT 3 1_555 A DG 10 1_555 B DC 2 1_555 -0.136 -0.719 3.474 -1.842 2.467 34.697 -1.598 -0.068 3.419 4.127 3.082 34.829 9 AA_DA9DG10:DC13DT14_BB A 9 ? B 14 ? A 10 ? B 13 ? 1 A DG 10 1_555 B DC 2 1_555 A DG 11 1_555 B DC 1 1_555 0.088 -0.529 3.466 -0.522 5.337 36.693 -1.581 -0.211 3.357 8.423 0.824 37.069 10 AA_DG10DG11:DC12DC13_BB A 10 ? B 13 ? A 11 ? B 12 ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 3 _pdbx_entity_nonpoly.name '(9S,10R)-9-HYDROXY-7,8,9,10-TETRAHYDROBENZO[A]PYRENE' _pdbx_entity_nonpoly.comp_id TBC #