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'Deinococcus radiodurans' 1299 Deinococcus ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 2 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num ? _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num ? _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific ? _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id ? _pdbx_entity_src_syn.details 'The terminal C of ASM was coupled via a phosphodiester bond to the 5 OH of the N6-dimethyl moiety of puromycin' # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_db_isoform 1 1 GB AE002087 6460405 4635 ;GGUCAAGAUAGUAAGGGUCCACGGUGGAUGCCCUGGCGCUGGAGCCGAUGAAGGACGCGAUUACCUGCGAAAAGCCCCGA CGAGCUGGAGAUACGCUUUGACUCGGGGAUGUCCGAAUGGGGAAACCCACCUCGUAAGAGGUAUCCGCAAGGAUGGGAAC UCAGGGAACUGAAACAUCUCAGUACCUGAAGGAGAAGAAAGAGAAUUCGAUUCCGUUAGUAGCGGCGAGCGAACCCGGAU CAGCCCAAACCGAAACGCUUGCGUUUCGGGGUUGUAGGACCAGUUUUUAAGAUUCAACCCCUCAAGCCGAAGUGGCUGGA AAGCUACACCUCAGAAGGUGAGAGUCCUGUAGGCGAACGAGCGGUUGACUGUACUGGCACCUGAGUAGGUCGUUGUUCGU GAAACGAUGACUGAAUCCGCGCGGACCACCGCGCAAGGCUAAAUACUCCCAGUGACCGAUAGCGCAUAGUACCGUGAGGG AAAGGUGAAAAGAACCCCGGGAGGGGAGUGAAAGAGAACCUGAAACCGUGGACUUACAAGCAGUCAUGGCACCUUAUGCG UGUUAUGGCGUGCCUAUUGAAGCAUGAGCCGGCGACUUAGACCUGACGUGCGAGCUUAAGUUGAAAAACGGAGGCGGAGC GAAAGCGAGUCCGAAUAGGGCGGCAUUAGUACGUCGGGCUAGACUCGAAACCAGGUGAGCUAAGCAUGACCAGGUUGAAA CCCCCGUGACAGGGGGCGGAGGACCGAACCGGUGCCUGCUGAAACAGUCUCGGAUGAGUUGUGUUUAGGAGUGAAAAGCU AACCGAACCUGGAGAUAGCUAGUUCUCCCCGAAAUGUAUUGAGGUACAGCCUCGGAUGUUGACCAUGUCCUGUAGAGCAC UCACAAGGCUAGGGGGCCUACCAGCUUACCAAACCUUAUGAAACUCCGAAGGGGCACGCGUUUAGUCCGGGAGUGAGGCU GCGAGAGCUAACUUCCGUAGCCGAGAGGGAAACAACCCAGACCAUCAGCUAAGGUCCCUAAAUGAUCGCUCAGUGGUUAA GGAUGUGUCGUCGCAUAGACAGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCCUUCAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUC GAGUGACGAUGCGCCGAAAAUGAUCGGGGCUCAAGUGAUCUACCGAAGCUAUGGAUUCAACUCGCGAAGCGAGUUGUCUG GUAGGGGAGCGUUCAGUCCGCGGAGAAGCCAUACCGGAAGGAGUGGUGGAGCCGACUGAAGUGCGGAUGCCGGCAUGAGU AACGAUAAAAGAAGUGAGAAUCUUCUUCGCCGUAAGGACAAGGGUUCCUGGGGAAGGGUCGUCCGCCCAGGGAAAGUCGG GACCUAAGGUGAGGCCGAACGGCGCAGCCGAUGGACAGCAGGUCAAGAUUCCUGCACCGAUCAUGUGGAGUGAUGGAGGG ACGCAUUACGCUAUCCAAUGCCAAGCUAUGGCUAUGCUGGUUGGUACGCUCAAGGGCGAUCGGGUCAGAAAAUCUACCGG UCACAUGCCUCAGACGUAUCGGGAGCUUCCUCGGAAGCGAAGUUGGAAACGCGACGGUGCCAAGAAAAGCUUCUAAACGU UGAAACAUGAUUGCCCGUACCGCAAACCGACACAGGUGUCCGAGUGUCAAUGCACUAAGGCGCGCGAGAGAACCCUCGUU AAGGAACUUUGCAAUCUCACCCCGUAACUUCGGAAGAAGGGGUCCCCACGCUUCGCGUGGGGCGCAGUGAAUAGGCCCAG GCGACUGUUUACCAAAAUCACAGCACUCUGCCAACACGAACAGUGGACGUAUAGGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAA GGUCAAGUGGAGCGGUGCAAGCUGCGAAAUGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAA AUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAAGGCGUAACGAUCUGGGCGCUGUCUCAACGAGGGACUCGGUGAAAUU GAAUUGGCUGUAAAGAUGCGGCCUACCCGUAGCAGGACGAAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUAUAGUCUGGCAUUGGGAU UCGGGUUUCUCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGCGAAACUGGCCUUUUGGGGUCGGUGGAGGCAACGGUGAAAUACCAC CCUGAGAAACUUGGAUUUCUAACCUGAAAAAUCACUUUCGGGGACCGUGCUUGGCGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCGCC UCCCAAAAUGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUCACCUCAAGACGGUUGGAAAUCGUCUGUAGAGCGCAAAGGUAGAAGGUGG CUUGACUGCGAGACUGACACGUCGAGCAGGGAGGAAACUCGGGCUUAGUGAACCGGUGGUACCGUGUGGAAGGGCCAUCG AUCAACGGAUAAAAGUUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCGAGAGUCCAUAUCGGCGGGGAGGUUUGGCACCUC GAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGAAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUG GGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCUCUAUCCGCUACGGGCGCAGGAGAAUUGAGGGGAGUUGCUCCUAGUACGAG AGGACCGGAGUGAACGGACCGCUGGUCUCCCUGCUGUCGUACCAACGGCACAUGCAGGGUAGCUAUGUCCGGAACGGAUA ACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCAGCCCCAAGAUGAGUUCUCCCACUGUUUAUCAGGUAAGACUCCCGGAAGACC ACCGGGUUAAGAGGCCAGGCGUGCACGCAUAGCAAUGUGUUCAGCGGACUGGUGCUCAUCAGUCGAGGUCUUGACCACUC ; ? 2 3 UNP RL16_DEIRA Q9RXJ5 2 ;MLLPKRTKFRKQFRGRMTGDAKGGDYVAFGDYGLIAMEPAWIKSNQIEACRIVMSRHFRRGGKIYIRIFPDKPVTKKPAE TRMGKGKGAVEYWVSVVKPGRVMFEVAGVTEEQAKEAFRLAGHKLPIQTKMVKREVYDEAQ ; ? 3 4 UNP RL25_DEIRA Q9RX88 17 ;MELTAKPRTPKQKLDESMIAAVAYNKENNVSFALDRKAFDRAFRQQSTTGLFDITVEGGETFPALVKAVQMDKRKRAPIH VDFYMVTYGEPVEVSVPVHTTGRSQGEVQGGLVDIVVHNLQIVAPGPRRIPQELVVDVTKMNIGDHITAGDIKLPEGCTL AADPELTVVSVLPPRLTAEELEAEVQAAQVAGLVAAGELSEEAAEAVLEGDASLEEVKAEASEDNAGTDSEDNSDAQ ; ? 4 2 PDB 1NJM 1NJM ? ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1NJM 0 1 ? 2880 ? 6460405 4635 ? 1756 ? 1 2880 2 2 1NJM K 1 ? 141 ? 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WATSON-CRICK ? ? ? hydrog197 hydrog ? ? A C 160 N4 ? ? ? 1_555 A G 191 O6 ? ? 0 C 160 0 G 191 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog198 hydrog ? ? A C 160 O2 ? ? ? 1_555 A G 191 N2 ? ? 0 C 160 0 G 191 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog199 hydrog ? ? A U 161 N3 ? ? ? 1_555 A A 189 N1 ? ? 0 U 161 0 A 189 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog200 hydrog ? ? A U 161 O4 ? ? ? 1_555 A A 189 N6 ? ? 0 U 161 0 A 189 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog201 hydrog ? ? A C 162 N3 ? ? ? 1_555 A G 188 N1 ? ? 0 C 162 0 G 188 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog202 hydrog ? ? A C 162 N4 ? ? ? 1_555 A G 188 O6 ? ? 0 C 162 0 G 188 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog203 hydrog ? ? A C 162 O2 ? ? ? 1_555 A G 188 N2 ? ? 0 C 162 0 G 188 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog204 hydrog ? ? A A 163 N1 ? ? ? 1_555 A U 187 N3 ? ? 0 A 163 0 U 187 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog205 hydrog ? ? 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'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog214 hydrog ? ? A A 167 N7 ? ? ? 1_555 A U 183 N3 ? ? 0 A 167 0 U 183 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED HOOGSTEEN' ? ? ? hydrog215 hydrog ? ? A A 168 N7 ? ? ? 1_555 A A 181 N6 ? ? 0 A 168 0 A 181 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-A MISPAIR' ? ? ? hydrog216 hydrog ? ? A A 168 N3 ? ? ? 1_555 A G 812 N2 ? ? 0 A 168 0 G 812 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-G MISPAIR' ? ? ? hydrog217 hydrog ? ? A C 169 N4 ? ? ? 1_555 A C 180 O2 ? ? 0 C 169 0 C 180 1_555 ? ? ? ? ? ? 'C-C MISPAIR' ? ? ? hydrog218 hydrog ? ? A U 170 N3 ? ? ? 1_555 A C 180 O2 ? ? 0 U 170 0 C 180 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-C MISPAIR' ? ? ? hydrog219 hydrog ? ? A G 171 N1 ? ? ? 1_555 A C 178 N3 ? ? 0 G 171 0 C 178 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog220 hydrog ? ? A G 171 N2 ? ? ? 1_555 A C 178 O2 ? ? 0 G 171 0 C 178 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog221 hydrog ? ? A G 171 O6 ? ? ? 1_555 A C 178 N4 ? ? 0 G 171 0 C 178 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog222 hydrog ? ? 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