data_1ONM # _entry.id 1ONM # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.355 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code _database_2.pdbx_database_accession _database_2.pdbx_DOI PDB 1ONM pdb_00001onm 10.2210/pdb1onm/pdb RCSB RCSB018476 ? ? WWPDB D_1000018476 ? ? # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.entry_id 1ONM _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2003-02-28 _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_mr REL _pdbx_database_status.SG_entry . _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Sanchez, A.M.' 1 'Volk, D.E.' 2 'Gorenstein, D.G.' 3 'Lloyd, R.S.' 4 # _citation.id primary _citation.title 'Initiation of repair of A/G mismatches is modulated by sequence context' _citation.journal_abbrev 'DNA REPAIR' _citation.journal_volume 2 _citation.page_first 863 _citation.page_last 878 _citation.year 2003 _citation.journal_id_ASTM ? _citation.country NE _citation.journal_id_ISSN 1568-7864 _citation.journal_id_CSD ? _citation.book_publisher ? _citation.pdbx_database_id_PubMed 12893083 _citation.pdbx_database_id_DOI '10.1016/S1568-7864(03)00067-3' # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Sanchez, A.M.' 1 ? primary 'Volk, D.E.' 2 ? primary 'Gorenstein, D.G.' 3 ? primary 'Lloyd, R.S.' 4 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer syn "5'-D(*GP*CP*TP*TP*CP*AP*GP*TP*CP*GP*T)-3'" 3340.183 1 ? ? ? ? 2 polymer syn "5'-D(*AP*CP*GP*AP*CP*GP*GP*AP*AP*GP*C)-3'" 3392.238 1 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 polydeoxyribonucleotide no no '(DG)(DC)(DT)(DT)(DC)(DA)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)' GCTTCAGTCGT A ? 2 polydeoxyribonucleotide no no '(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DG)(DG)(DA)(DA)(DG)(DC)' ACGACGGAAGC B ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DG n 1 2 DC n 1 3 DT n 1 4 DT n 1 5 DC n 1 6 DA n 1 7 DG n 1 8 DT n 1 9 DC n 1 10 DG n 1 11 DT n 2 1 DA n 2 2 DC n 2 3 DG n 2 4 DA n 2 5 DC n 2 6 DG n 2 7 DG n 2 8 DA n 2 9 DA n 2 10 DG n 2 11 DC n # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 1 PDB 1ONM 1ONM ? ? ? 2 2 PDB 1ONM 1ONM ? ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1ONM A 1 ? 11 ? 1ONM 1 ? 11 ? 1 11 2 2 1ONM B 1 ? 11 ? 1ONM 12 ? 22 ? 12 22 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.type 1 1 2 '2D NOESY' 2 2 1 '2D NOESY' # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units 1 283 ambient 6.8 '25 mM Phosphate,50 mM NaCl' ? K 2 288 ambient 6.8 '25 mM Phosphate,50 mM NaCl' ? K # loop_ _pdbx_nmr_sample_details.solution_id _pdbx_nmr_sample_details.contents _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system 1 '1 mM DNA duplex; 25 mM phosphate, 50 mM NaCl, 1 mM EDTA;' '90% H2O/10% D2O' 2 '1 mM DNA duplex; 25 mM phosphate, 50 mM NaCl, 1 mM EDTA;' '99.96% D2O' # loop_ _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id _pdbx_nmr_spectrometer.type _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer _pdbx_nmr_spectrometer.model _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength 1 ? Varian UNITYPLUS 600 2 ? Varian UNITYPLUS 750 # _pdbx_nmr_refine.entry_id 1ONM _pdbx_nmr_refine.method 'Total Relaxation Matrix and Molecular Dynamics were used.' _pdbx_nmr_refine.details '624 total restraints were used: 500 derived from 2D NOE data and 124 dihedral angle restraints.' _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 1 # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 1ONM _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'all calculated structures submitted' _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.entry_id 1ONM _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'all equally representative' # loop_ _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.authors _pdbx_nmr_software.ordinal VNMR 6.1 processing 'Varian, Inc.' 1 MORASS 2.51 'iterative matrix relaxation' 'Gorenstein, D.G. et al.' 2 Amber 5 refinement 'Case, D.A. et al.' 3 # _exptl.entry_id 1ONM _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.crystals_number ? # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews ? _exptl_crystal.density_percent_sol ? _exptl_crystal.description ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp ? _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator ? _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type ? # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength . _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _struct.entry_id 1ONM _struct.title 'Solution Structure of a DNA duplex containing A:G mismatch. d(GCTTCAGTCGT):d(ACGACGGAAGC)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1ONM _struct_keywords.pdbx_keywords DNA _struct_keywords.text 'A/G mismatch, A:G mismatch, A/G mispair, A:G mispair, DNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? # _struct_biol.id 1 # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? A DG 1 N1 ? ? ? 1_555 B DC 11 N3 ? ? A DG 1 B DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DG 1 N2 ? ? ? 1_555 B DC 11 O2 ? ? A DG 1 B DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DG 1 O6 ? ? ? 1_555 B DC 11 N4 ? ? A DG 1 B DC 22 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DC 2 N3 ? ? ? 1_555 B DG 10 N1 ? ? A DC 2 B DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DC 2 N4 ? ? ? 1_555 B DG 10 O6 ? ? A DC 2 B DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DC 2 O2 ? ? ? 1_555 B DG 10 N2 ? ? A DC 2 B DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DT 3 N3 ? ? ? 1_555 B DA 9 N1 ? ? A DT 3 B DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DT 3 O4 ? ? ? 1_555 B DA 9 N6 ? ? A DT 3 B DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DT 4 N3 ? ? ? 1_555 B DA 8 N1 ? ? A DT 4 B DA 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DT 4 O4 ? ? ? 1_555 B DA 8 N6 ? ? A DT 4 B DA 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DC 5 N3 ? ? ? 1_555 B DG 7 N1 ? ? A DC 5 B DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DC 5 N4 ? ? ? 1_555 B DG 7 O6 ? ? A DC 5 B DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DC 5 O2 ? ? ? 1_555 B DG 7 N2 ? ? A DC 5 B DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DA 6 N1 ? ? ? 1_555 B DG 6 N1 ? ? A DA 6 B DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DA 6 N6 ? ? ? 1_555 B DG 6 O6 ? ? A DA 6 B DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DG 7 N1 ? ? ? 1_555 B DC 5 N3 ? ? A DG 7 B DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DG 7 N2 ? ? ? 1_555 B DC 5 O2 ? ? A DG 7 B DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DG 7 O6 ? ? ? 1_555 B DC 5 N4 ? ? A DG 7 B DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DT 8 N3 ? ? ? 1_555 B DA 4 N1 ? ? A DT 8 B DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DT 8 O4 ? ? ? 1_555 B DA 4 N6 ? ? A DT 8 B DA 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DC 9 N3 ? ? ? 1_555 B DG 3 N1 ? ? A DC 9 B DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DC 9 N4 ? ? ? 1_555 B DG 3 O6 ? ? A DC 9 B DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A DC 9 O2 ? ? ? 1_555 B DG 3 N2 ? ? A DC 9 B DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DG 10 N1 ? ? ? 1_555 B DC 2 N3 ? ? A DG 10 B DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DG 10 N2 ? ? ? 1_555 B DC 2 O2 ? ? A DG 10 B DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A DG 10 O6 ? ? ? 1_555 B DC 2 N4 ? ? A DG 10 B DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A DT 11 N3 ? ? ? 1_555 B DA 1 N1 ? ? A DT 11 B DA 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A DT 11 O4 ? ? ? 1_555 B DA 1 N6 ? ? A DT 11 B DA 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _database_PDB_matrix.entry_id 1ONM _database_PDB_matrix.origx[1][1] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[1][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][2] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx[2][3] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][1] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][2] 0.000000 _database_PDB_matrix.origx[3][3] 1.000000 _database_PDB_matrix.origx_vector[1] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[2] 0.00000 _database_PDB_matrix.origx_vector[3] 0.00000 # _atom_sites.entry_id 1ONM _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C H N O P # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 DG 1 1 1 DG G A . n A 1 2 DC 2 2 2 DC C A . n A 1 3 DT 3 3 3 DT T A . n A 1 4 DT 4 4 4 DT T A . n A 1 5 DC 5 5 5 DC C A . n A 1 6 DA 6 6 6 DA A A . n A 1 7 DG 7 7 7 DG G A . n A 1 8 DT 8 8 8 DT T A . n A 1 9 DC 9 9 9 DC C A . n A 1 10 DG 10 10 10 DG G A . n A 1 11 DT 11 11 11 DT T A . n B 2 1 DA 1 12 12 DA A B . n B 2 2 DC 2 13 13 DC C B . n B 2 3 DG 3 14 14 DG G B . n B 2 4 DA 4 15 15 DA A B . n B 2 5 DC 5 16 16 DC C B . n B 2 6 DG 6 17 17 DG G B . n B 2 7 DG 7 18 18 DG G B . n B 2 8 DA 8 19 19 DA A B . n B 2 9 DA 9 20 20 DA A B . n B 2 10 DG 10 21 21 DG G B . n B 2 11 DC 11 22 22 DC C B . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2003-11-04 2 'Structure model' 1 1 2008-04-29 3 'Structure model' 1 2 2011-07-13 4 'Structure model' 1 3 2022-02-23 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Version format compliance' 3 4 'Structure model' 'Data collection' 4 4 'Structure model' 'Database references' 5 4 'Structure model' 'Derived calculations' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 4 'Structure model' database_2 2 4 'Structure model' pdbx_nmr_software 3 4 'Structure model' pdbx_struct_assembly 4 4 'Structure model' pdbx_struct_oper_list # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_DOI' 2 4 'Structure model' '_database_2.pdbx_database_accession' 3 4 'Structure model' '_pdbx_nmr_software.name' # loop_ _pdbx_validate_rmsd_bond.id _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_target_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.linker_flag 1 1 "C5'" B DA 20 ? ? "C4'" B DA 20 ? ? 1.555 1.512 0.043 0.007 N 2 2 "C5'" A DG 7 ? ? "C4'" A DG 7 ? ? 1.554 1.512 0.042 0.007 N 3 2 "C5'" B DA 19 ? ? "C4'" B DA 19 ? ? 1.555 1.512 0.043 0.007 N 4 5 "C5'" B DA 20 ? ? "C4'" B DA 20 ? ? 1.556 1.512 0.044 0.007 N 5 6 "C5'" A DC 2 ? ? "C4'" A DC 2 ? ? 1.555 1.512 0.043 0.007 N 6 7 "C5'" B DC 13 ? ? "C4'" B DC 13 ? ? 1.555 1.512 0.043 0.007 N 7 7 "C5'" B DG 18 ? ? "C4'" B DG 18 ? ? 1.558 1.512 0.046 0.007 N 8 8 "C5'" A DC 5 ? ? "C4'" A DC 5 ? ? 1.555 1.512 0.043 0.007 N 9 8 "C5'" A DG 10 ? ? "C4'" A DG 10 ? ? 1.554 1.512 0.042 0.007 N 10 9 "C5'" B DG 17 ? ? "C4'" B DG 17 ? ? 1.559 1.512 0.047 0.007 N 11 10 "C5'" A DC 2 ? ? "C4'" A DC 2 ? ? 1.556 1.512 0.044 0.007 N # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 "O4'" A DG 1 ? ? "C1'" A DG 1 ? ? N9 A DG 1 ? ? 111.05 108.30 2.75 0.30 N 2 1 "O4'" A DC 2 ? ? "C1'" A DC 2 ? ? N1 A DC 2 ? ? 110.51 108.30 2.21 0.30 N 3 1 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 116.97 121.90 -4.93 0.70 N 4 1 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 116.43 121.90 -5.47 0.70 N 5 1 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 112.99 117.00 -4.01 0.50 N 6 1 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 7 1 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.01 118.60 -5.59 0.60 N 8 1 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.70 108.30 4.40 0.30 N 9 1 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 118.23 122.90 -4.67 0.60 N 10 1 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 111.44 108.30 3.14 0.30 N 11 1 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.34 121.90 -5.56 0.70 N 12 1 N1 A DG 10 ? ? C6 A DG 10 ? ? O6 A DG 10 ? ? 116.16 119.90 -3.74 0.60 N 13 1 "O4'" A DT 11 ? ? "C1'" A DT 11 ? ? "C2'" A DT 11 ? ? 110.65 106.80 3.85 0.50 N 14 1 C4 B DA 12 ? ? C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? 113.45 117.00 -3.55 0.50 N 15 1 C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N1 B DA 12 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 16 1 N1 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N6 B DA 12 ? ? 114.43 118.60 -4.17 0.60 N 17 1 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 117.07 121.90 -4.83 0.70 N 18 1 C4 B DA 15 ? ? C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? 113.68 117.00 -3.32 0.50 N 19 1 C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N1 B DA 15 ? ? 120.81 117.70 3.11 0.50 N 20 1 N1 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N6 B DA 15 ? ? 114.50 118.60 -4.10 0.60 N 21 1 N3 B DC 16 ? ? C4 B DC 16 ? ? C5 B DC 16 ? ? 124.35 121.90 2.45 0.40 N 22 1 N3 B DC 16 ? ? C2 B DC 16 ? ? O2 B DC 16 ? ? 117.42 121.90 -4.48 0.70 N 23 1 "C4'" B DG 18 ? ? "C3'" B DG 18 ? ? "C2'" B DG 18 ? ? 97.95 102.20 -4.25 0.70 N 24 1 "O4'" B DA 19 ? ? "C1'" B DA 19 ? ? N9 B DA 19 ? ? 111.81 108.30 3.51 0.30 N 25 1 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 113.51 117.00 -3.49 0.50 N 26 1 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 121.33 117.70 3.63 0.50 N 27 1 N1 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N6 B DA 19 ? ? 114.72 118.60 -3.88 0.60 N 28 1 C4 B DA 20 ? ? C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? 113.51 117.00 -3.49 0.50 N 29 1 C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N1 B DA 20 ? ? 120.86 117.70 3.16 0.50 N 30 1 N1 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N6 B DA 20 ? ? 114.37 118.60 -4.23 0.60 N 31 1 "O4'" B DC 22 ? ? "C1'" B DC 22 ? ? N1 B DC 22 ? ? 110.25 108.30 1.95 0.30 N 32 1 N3 B DC 22 ? ? C4 B DC 22 ? ? C5 B DC 22 ? ? 124.72 121.90 2.82 0.40 N 33 1 N3 B DC 22 ? ? C2 B DC 22 ? ? O2 B DC 22 ? ? 117.09 121.90 -4.81 0.70 N 34 2 N1 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 122.72 118.90 3.82 0.60 N 35 2 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 117.08 121.90 -4.82 0.70 N 36 2 "O4'" A DT 3 ? ? "C1'" A DT 3 ? ? N1 A DT 3 ? ? 110.20 108.30 1.90 0.30 N 37 2 N3 A DT 4 ? ? C2 A DT 4 ? ? O2 A DT 4 ? ? 118.69 122.30 -3.61 0.60 N 38 2 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 110.21 108.30 1.91 0.30 N 39 2 N3 A DC 5 ? ? C4 A DC 5 ? ? C5 A DC 5 ? ? 124.54 121.90 2.64 0.40 N 40 2 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 116.47 121.90 -5.43 0.70 N 41 2 N3 A DC 5 ? ? C4 A DC 5 ? ? N4 A DC 5 ? ? 112.70 118.00 -5.30 0.70 N 42 2 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 112.53 117.00 -4.47 0.50 N 43 2 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.65 117.70 3.95 0.50 N 44 2 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 112.58 118.60 -6.02 0.60 N 45 2 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 116.09 119.90 -3.81 0.60 N 46 2 "O4'" A DT 8 ? ? "C4'" A DT 8 ? ? "C3'" A DT 8 ? ? 110.37 106.00 4.37 0.60 N 47 2 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 110.77 108.30 2.47 0.30 N 48 2 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 118.19 122.90 -4.71 0.60 N 49 2 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 117.41 121.90 -4.49 0.70 N 50 2 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 111.65 108.30 3.35 0.30 N 51 2 C4 A DT 11 ? ? C5 A DT 11 ? ? C7 A DT 11 ? ? 122.77 119.00 3.77 0.60 N 52 2 C6 A DT 11 ? ? C5 A DT 11 ? ? C7 A DT 11 ? ? 117.71 122.90 -5.19 0.60 N 53 2 "O4'" B DA 12 ? ? "C1'" B DA 12 ? ? "C2'" B DA 12 ? ? 109.84 106.80 3.04 0.50 N 54 2 "O4'" B DA 12 ? ? "C1'" B DA 12 ? ? N9 B DA 12 ? ? 110.57 108.30 2.27 0.30 N 55 2 C4 B DA 12 ? ? C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? 112.77 117.00 -4.23 0.50 N 56 2 C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N1 B DA 12 ? ? 122.06 117.70 4.36 0.50 N 57 2 N1 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N6 B DA 12 ? ? 112.16 118.60 -6.44 0.60 N 58 2 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.73 121.90 -5.17 0.70 N 59 2 "O4'" B DA 15 ? ? "C1'" B DA 15 ? ? N9 B DA 15 ? ? 110.93 108.30 2.63 0.30 N 60 2 C4 B DA 15 ? ? C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? 112.74 117.00 -4.26 0.50 N 61 2 C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N1 B DA 15 ? ? 122.11 117.70 4.41 0.50 N 62 2 N1 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N6 B DA 15 ? ? 112.04 118.60 -6.56 0.60 N 63 2 N3 B DC 16 ? ? C2 B DC 16 ? ? O2 B DC 16 ? ? 117.69 121.90 -4.21 0.70 N 64 2 "O4'" B DG 17 ? ? "C1'" B DG 17 ? ? N9 B DG 17 ? ? 110.22 108.30 1.92 0.30 N 65 2 N1 B DG 18 ? ? C6 B DG 18 ? ? O6 B DG 18 ? ? 116.19 119.90 -3.71 0.60 N 66 2 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 113.17 117.00 -3.83 0.50 N 67 2 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 121.74 117.70 4.04 0.50 N 68 2 N1 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N6 B DA 19 ? ? 112.50 118.60 -6.10 0.60 N 69 2 C4 B DA 20 ? ? C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? 112.19 117.00 -4.81 0.50 N 70 2 C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N1 B DA 20 ? ? 121.79 117.70 4.09 0.50 N 71 2 N1 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N6 B DA 20 ? ? 112.48 118.60 -6.12 0.60 N 72 2 "O4'" B DG 21 ? ? "C1'" B DG 21 ? ? N9 B DG 21 ? ? 110.86 108.30 2.56 0.30 N 73 2 N3 B DG 21 ? ? C2 B DG 21 ? ? N2 B DG 21 ? ? 114.92 119.90 -4.98 0.70 N 74 2 N3 B DC 22 ? ? C2 B DC 22 ? ? O2 B DC 22 ? ? 116.52 121.90 -5.38 0.70 N 75 3 "O4'" A DT 4 ? ? "C1'" A DT 4 ? ? N1 A DT 4 ? ? 111.05 108.30 2.75 0.30 N 76 3 N3 A DT 4 ? ? C2 A DT 4 ? ? O2 A DT 4 ? ? 118.49 122.30 -3.81 0.60 N 77 3 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 112.88 108.30 4.58 0.30 N 78 3 C6 A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? 117.82 120.30 -2.48 0.40 N 79 3 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 116.12 121.90 -5.78 0.70 N 80 3 "O4'" A DA 6 ? ? "C1'" A DA 6 ? ? N9 A DA 6 ? ? 111.00 108.30 2.70 0.30 N 81 3 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 112.02 117.00 -4.98 0.50 N 82 3 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.11 117.70 3.41 0.50 N 83 3 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 112.88 118.60 -5.72 0.60 N 84 3 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.10 108.30 2.80 0.30 N 85 3 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 110.54 108.30 2.24 0.30 N 86 3 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 117.63 121.90 -4.27 0.70 N 87 3 C4 B DA 12 ? ? C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? 113.85 117.00 -3.15 0.50 N 88 3 C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N1 B DA 12 ? ? 121.45 117.70 3.75 0.50 N 89 3 N1 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N6 B DA 12 ? ? 114.78 118.60 -3.82 0.60 N 90 3 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 111.64 108.30 3.34 0.30 N 91 3 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 117.14 121.90 -4.76 0.70 N 92 3 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 111.20 108.30 2.90 0.30 N 93 3 C4 B DA 15 ? ? C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? 113.10 117.00 -3.90 0.50 N 94 3 C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N1 B DA 15 ? ? 121.76 117.70 4.06 0.50 N 95 3 N1 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N6 B DA 15 ? ? 114.82 118.60 -3.78 0.60 N 96 3 N3 B DC 16 ? ? C4 B DC 16 ? ? C5 B DC 16 ? ? 124.75 121.90 2.85 0.40 N 97 3 N1 B DC 16 ? ? C2 B DC 16 ? ? O2 B DC 16 ? ? 122.65 118.90 3.75 0.60 N 98 3 N3 B DC 16 ? ? C2 B DC 16 ? ? O2 B DC 16 ? ? 117.26 121.90 -4.64 0.70 N 99 3 "O4'" B DG 18 ? ? "C1'" B DG 18 ? ? N9 B DG 18 ? ? 110.44 108.30 2.14 0.30 N 100 3 "O4'" B DA 19 ? ? "C1'" B DA 19 ? ? N9 B DA 19 ? ? 110.80 108.30 2.50 0.30 N 101 3 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 113.67 117.00 -3.33 0.50 N 102 3 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 121.47 117.70 3.77 0.50 N 103 3 N1 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N6 B DA 19 ? ? 113.95 118.60 -4.65 0.60 N 104 3 C4 B DA 20 ? ? C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? 112.88 117.00 -4.12 0.50 N 105 3 C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N1 B DA 20 ? ? 120.99 117.70 3.29 0.50 N 106 3 N1 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N6 B DA 20 ? ? 113.39 118.60 -5.21 0.60 N 107 3 "O4'" B DG 21 ? ? "C1'" B DG 21 ? ? N9 B DG 21 ? ? 110.99 108.30 2.69 0.30 N 108 3 N3 B DG 21 ? ? C2 B DG 21 ? ? N2 B DG 21 ? ? 114.66 119.90 -5.24 0.70 N 109 3 N3 B DC 22 ? ? C2 B DC 22 ? ? O2 B DC 22 ? ? 117.34 121.90 -4.56 0.70 N 110 4 N3 A DG 1 ? ? C2 A DG 1 ? ? N2 A DG 1 ? ? 115.48 119.90 -4.42 0.70 N 111 4 "O4'" A DT 3 ? ? "C1'" A DT 3 ? ? N1 A DT 3 ? ? 111.98 108.30 3.68 0.30 N 112 4 C6 A DT 4 ? ? C5 A DT 4 ? ? C7 A DT 4 ? ? 118.95 122.90 -3.95 0.60 N 113 4 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.42 121.90 -4.48 0.70 N 114 4 "O4'" A DA 6 ? ? "C1'" A DA 6 ? ? "C2'" A DA 6 ? ? 110.72 106.80 3.92 0.50 N 115 4 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 112.64 117.00 -4.36 0.50 N 116 4 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.68 117.70 3.98 0.50 N 117 4 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 113.65 118.60 -4.95 0.60 N 118 4 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.23 108.30 2.93 0.30 N 119 4 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 116.26 119.90 -3.64 0.60 N 120 4 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 110.12 108.30 1.82 0.30 N 121 4 "C3'" A DC 9 ? ? "O3'" A DC 9 ? ? P A DG 10 ? ? 127.24 119.70 7.54 1.20 Y 122 4 "O4'" A DT 11 ? ? "C1'" A DT 11 ? ? N1 A DT 11 ? ? 111.24 108.30 2.94 0.30 N 123 4 C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N1 B DA 12 ? ? 121.14 117.70 3.44 0.50 N 124 4 N1 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N6 B DA 12 ? ? 112.53 118.60 -6.07 0.60 N 125 4 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 111.24 108.30 2.94 0.30 N 126 4 N1 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 122.51 118.90 3.61 0.60 N 127 4 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.45 121.90 -5.45 0.70 N 128 4 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 111.80 108.30 3.50 0.30 N 129 4 "O4'" B DA 15 ? ? "C1'" B DA 15 ? ? N9 B DA 15 ? ? 110.67 108.30 2.37 0.30 N 130 4 C4 B DA 15 ? ? C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? 113.61 117.00 -3.39 0.50 N 131 4 C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N1 B DA 15 ? ? 122.25 117.70 4.55 0.50 N 132 4 N1 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N6 B DA 15 ? ? 114.58 118.60 -4.02 0.60 N 133 4 "O4'" B DC 16 ? ? "C1'" B DC 16 ? ? N1 B DC 16 ? ? 111.41 108.30 3.11 0.30 N 134 4 N3 B DC 16 ? ? C2 B DC 16 ? ? O2 B DC 16 ? ? 116.63 121.90 -5.27 0.70 N 135 4 "O4'" B DG 17 ? ? "C1'" B DG 17 ? ? N9 B DG 17 ? ? 111.59 108.30 3.29 0.30 N 136 4 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 112.77 117.00 -4.23 0.50 N 137 4 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 121.68 117.70 3.98 0.50 N 138 4 N1 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N6 B DA 19 ? ? 111.13 118.60 -7.47 0.60 N 139 4 "O4'" B DA 20 ? ? "C1'" B DA 20 ? ? N9 B DA 20 ? ? 111.52 108.30 3.22 0.30 N 140 4 C4 B DA 20 ? ? C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? 112.88 117.00 -4.12 0.50 N 141 4 C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N1 B DA 20 ? ? 121.48 117.70 3.78 0.50 N 142 4 N1 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N6 B DA 20 ? ? 113.11 118.60 -5.49 0.60 N 143 4 N3 B DG 21 ? ? C2 B DG 21 ? ? N2 B DG 21 ? ? 115.58 119.90 -4.32 0.70 N 144 4 "O4'" B DC 22 ? ? "C1'" B DC 22 ? ? N1 B DC 22 ? ? 111.94 108.30 3.64 0.30 N 145 4 N3 B DC 22 ? ? C2 B DC 22 ? ? O2 B DC 22 ? ? 116.63 121.90 -5.27 0.70 N 146 5 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 117.68 121.90 -4.22 0.70 N 147 5 "O4'" A DT 3 ? ? "C1'" A DT 3 ? ? N1 A DT 3 ? ? 112.09 108.30 3.79 0.30 N 148 5 N3 A DT 3 ? ? C2 A DT 3 ? ? O2 A DT 3 ? ? 118.65 122.30 -3.65 0.60 N 149 5 C6 A DT 3 ? ? C5 A DT 3 ? ? C7 A DT 3 ? ? 118.94 122.90 -3.96 0.60 N 150 5 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.33 121.90 -4.57 0.70 N 151 5 "O4'" A DA 6 ? ? "C1'" A DA 6 ? ? "C2'" A DA 6 ? ? 110.09 106.80 3.29 0.50 N 152 5 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 112.97 117.00 -4.03 0.50 N 153 5 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 120.82 117.70 3.12 0.50 N 154 5 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 114.58 118.60 -4.02 0.60 N 155 5 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.87 108.30 4.57 0.30 N 156 5 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 110.90 108.30 2.60 0.30 N 157 5 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.58 121.90 -5.32 0.70 N 158 5 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? "C2'" A DG 10 ? ? 110.19 106.80 3.39 0.50 N 159 5 "O4'" A DT 11 ? ? "C1'" A DT 11 ? ? N1 A DT 11 ? ? 111.14 108.30 2.84 0.30 N 160 5 C4 B DA 12 ? ? C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? 113.74 117.00 -3.26 0.50 N 161 5 C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N1 B DA 12 ? ? 120.91 117.70 3.21 0.50 N 162 5 N1 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N6 B DA 12 ? ? 114.33 118.60 -4.27 0.60 N 163 5 N3 B DC 13 ? ? C4 B DC 13 ? ? C5 B DC 13 ? ? 124.45 121.90 2.55 0.40 N 164 5 N1 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 122.72 118.90 3.82 0.60 N 165 5 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.64 121.90 -5.26 0.70 N 166 5 "C3'" B DG 14 ? ? "O3'" B DG 14 ? ? P B DA 15 ? ? 126.99 119.70 7.29 1.20 Y 167 5 "O4'" B DA 15 ? ? "C1'" B DA 15 ? ? N9 B DA 15 ? ? 111.29 108.30 2.99 0.30 N 168 5 C4 B DA 15 ? ? C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? 113.52 117.00 -3.48 0.50 N 169 5 C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N1 B DA 15 ? ? 121.21 117.70 3.51 0.50 N 170 5 N1 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N6 B DA 15 ? ? 111.02 118.60 -7.58 0.60 N 171 5 "O4'" B DC 16 ? ? "C1'" B DC 16 ? ? N1 B DC 16 ? ? 111.01 108.30 2.71 0.30 N 172 5 N3 B DC 16 ? ? C2 B DC 16 ? ? O2 B DC 16 ? ? 116.98 121.90 -4.92 0.70 N 173 5 "O4'" B DA 19 ? ? "C1'" B DA 19 ? ? N9 B DA 19 ? ? 112.20 108.30 3.90 0.30 N 174 5 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 112.41 117.00 -4.59 0.50 N 175 5 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 121.46 117.70 3.76 0.50 N 176 5 N1 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N6 B DA 19 ? ? 112.03 118.60 -6.57 0.60 N 177 5 C4 B DA 20 ? ? C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? 113.49 117.00 -3.51 0.50 N 178 5 C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N1 B DA 20 ? ? 121.08 117.70 3.38 0.50 N 179 5 N1 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N6 B DA 20 ? ? 112.56 118.60 -6.04 0.60 N 180 5 "O4'" B DG 21 ? ? "C1'" B DG 21 ? ? N9 B DG 21 ? ? 111.58 108.30 3.28 0.30 N 181 5 N3 B DG 21 ? ? C2 B DG 21 ? ? N2 B DG 21 ? ? 111.55 119.90 -8.35 0.70 N 182 5 "O4'" B DC 22 ? ? "C1'" B DC 22 ? ? N1 B DC 22 ? ? 111.38 108.30 3.08 0.30 N 183 5 N3 B DC 22 ? ? C2 B DC 22 ? ? O2 B DC 22 ? ? 117.05 121.90 -4.85 0.70 N 184 6 "C3'" A DG 1 ? ? "O3'" A DG 1 ? ? P A DC 2 ? ? 127.48 119.70 7.78 1.20 Y 185 6 "O4'" A DT 3 ? ? "C1'" A DT 3 ? ? N1 A DT 3 ? ? 115.03 108.30 6.73 0.30 N 186 6 N3 A DT 3 ? ? C2 A DT 3 ? ? O2 A DT 3 ? ? 118.53 122.30 -3.77 0.60 N 187 6 C6 A DT 4 ? ? C5 A DT 4 ? ? C7 A DT 4 ? ? 118.17 122.90 -4.73 0.60 N 188 6 N3 A DC 5 ? ? C4 A DC 5 ? ? C5 A DC 5 ? ? 124.48 121.90 2.58 0.40 N 189 6 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.35 121.90 -4.55 0.70 N 190 6 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.02 117.00 -3.98 0.50 N 191 6 "C3'" A DA 6 ? ? "O3'" A DA 6 ? ? P A DG 7 ? ? 127.20 119.70 7.50 1.20 Y 192 6 N3 A DT 8 ? ? C2 A DT 8 ? ? O2 A DT 8 ? ? 118.16 122.30 -4.14 0.60 N 193 6 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.87 121.90 -5.03 0.70 N 194 6 N3 A DG 10 ? ? C2 A DG 10 ? ? N2 A DG 10 ? ? 114.47 119.90 -5.43 0.70 N 195 6 C6 A DT 11 ? ? C5 A DT 11 ? ? C7 A DT 11 ? ? 118.35 122.90 -4.55 0.60 N 196 6 "O4'" B DA 12 ? ? "C1'" B DA 12 ? ? "C2'" B DA 12 ? ? 109.82 106.80 3.02 0.50 N 197 6 C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N1 B DA 12 ? ? 120.84 117.70 3.14 0.50 N 198 6 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 117.22 121.90 -4.68 0.70 N 199 6 N3 B DG 14 ? ? C2 B DG 14 ? ? N2 B DG 14 ? ? 114.06 119.90 -5.84 0.70 N 200 6 C4 B DA 15 ? ? C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? 113.10 117.00 -3.90 0.50 N 201 6 C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N1 B DA 15 ? ? 121.51 117.70 3.81 0.50 N 202 6 N1 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N6 B DA 15 ? ? 111.95 118.60 -6.65 0.60 N 203 6 N1 B DC 16 ? ? C2 B DC 16 ? ? O2 B DC 16 ? ? 123.23 118.90 4.33 0.60 N 204 6 N3 B DC 16 ? ? C2 B DC 16 ? ? O2 B DC 16 ? ? 116.44 121.90 -5.46 0.70 N 205 6 "C4'" B DG 18 ? ? "C3'" B DG 18 ? ? "C2'" B DG 18 ? ? 97.94 102.20 -4.26 0.70 N 206 6 "O4'" B DG 18 ? ? "C1'" B DG 18 ? ? N9 B DG 18 ? ? 111.12 108.30 2.82 0.30 N 207 6 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 112.71 117.00 -4.29 0.50 N 208 6 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 121.22 117.70 3.52 0.50 N 209 6 N1 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N6 B DA 19 ? ? 110.88 118.60 -7.72 0.60 N 210 6 C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N1 B DA 20 ? ? 121.47 117.70 3.77 0.50 N 211 6 N1 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N6 B DA 20 ? ? 113.46 118.60 -5.14 0.60 N 212 6 N3 B DG 21 ? ? C2 B DG 21 ? ? N2 B DG 21 ? ? 113.98 119.90 -5.92 0.70 N 213 6 N3 B DC 22 ? ? C2 B DC 22 ? ? O2 B DC 22 ? ? 117.61 121.90 -4.29 0.70 N 214 7 "O4'" A DC 2 ? ? "C1'" A DC 2 ? ? N1 A DC 2 ? ? 110.12 108.30 1.82 0.30 N 215 7 N3 A DC 2 ? ? C4 A DC 2 ? ? C5 A DC 2 ? ? 124.36 121.90 2.46 0.40 N 216 7 "O4'" A DT 3 ? ? "C1'" A DT 3 ? ? N1 A DT 3 ? ? 110.93 108.30 2.63 0.30 N 217 7 "O4'" A DT 4 ? ? "C1'" A DT 4 ? ? N1 A DT 4 ? ? 110.88 108.30 2.58 0.30 N 218 7 N3 A DT 4 ? ? C2 A DT 4 ? ? O2 A DT 4 ? ? 118.68 122.30 -3.62 0.60 N 219 7 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.12 121.90 -4.78 0.70 N 220 7 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 112.85 117.00 -4.15 0.50 N 221 7 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 120.74 117.70 3.04 0.50 N 222 7 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 111.94 118.60 -6.66 0.60 N 223 7 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.37 108.30 4.07 0.30 N 224 7 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 111.40 108.30 3.10 0.30 N 225 7 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 112.25 108.30 3.95 0.30 N 226 7 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 116.97 121.90 -4.93 0.70 N 227 7 "O4'" A DT 11 ? ? "C1'" A DT 11 ? ? N1 A DT 11 ? ? 111.46 108.30 3.16 0.30 N 228 7 C6 A DT 11 ? ? C5 A DT 11 ? ? C7 A DT 11 ? ? 118.74 122.90 -4.16 0.60 N 229 7 C4 B DA 12 ? ? C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? 113.44 117.00 -3.56 0.50 N 230 7 C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N1 B DA 12 ? ? 121.72 117.70 4.02 0.50 N 231 7 N1 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N6 B DA 12 ? ? 114.04 118.60 -4.56 0.60 N 232 7 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.27 121.90 -5.63 0.70 N 233 7 N3 B DG 14 ? ? C2 B DG 14 ? ? N2 B DG 14 ? ? 113.63 119.90 -6.27 0.70 N 234 7 C4 B DA 15 ? ? C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? 112.70 117.00 -4.30 0.50 N 235 7 C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N1 B DA 15 ? ? 121.03 117.70 3.33 0.50 N 236 7 N1 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N6 B DA 15 ? ? 112.41 118.60 -6.19 0.60 N 237 7 N3 B DC 16 ? ? C2 B DC 16 ? ? O2 B DC 16 ? ? 116.59 121.90 -5.31 0.70 N 238 7 N3 B DG 17 ? ? C2 B DG 17 ? ? N2 B DG 17 ? ? 113.75 119.90 -6.15 0.70 N 239 7 "O4'" B DA 19 ? ? "C1'" B DA 19 ? ? N9 B DA 19 ? ? 110.37 108.30 2.07 0.30 N 240 7 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 113.62 117.00 -3.38 0.50 N 241 7 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 121.18 117.70 3.48 0.50 N 242 7 C4 B DA 20 ? ? C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? 113.71 117.00 -3.29 0.50 N 243 7 C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N1 B DA 20 ? ? 121.03 117.70 3.33 0.50 N 244 7 N1 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N6 B DA 20 ? ? 112.37 118.60 -6.23 0.60 N 245 7 "O4'" B DG 21 ? ? "C1'" B DG 21 ? ? N9 B DG 21 ? ? 111.33 108.30 3.03 0.30 N 246 7 N3 B DC 22 ? ? C2 B DC 22 ? ? O2 B DC 22 ? ? 116.29 121.90 -5.61 0.70 N 247 8 "O4'" A DG 1 ? ? "C1'" A DG 1 ? ? N9 A DG 1 ? ? 111.15 108.30 2.85 0.30 N 248 8 "O4'" A DT 3 ? ? "C1'" A DT 3 ? ? N1 A DT 3 ? ? 110.68 108.30 2.38 0.30 N 249 8 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 110.45 108.30 2.15 0.30 N 250 8 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.49 121.90 -4.41 0.70 N 251 8 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 112.06 117.00 -4.94 0.50 N 252 8 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 122.43 117.70 4.73 0.50 N 253 8 C6 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? N7 A DA 6 ? ? 136.77 132.30 4.47 0.70 N 254 8 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 111.54 118.60 -7.06 0.60 N 255 8 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.41 108.30 3.11 0.30 N 256 8 N1 A DG 7 ? ? C6 A DG 7 ? ? O6 A DG 7 ? ? 116.01 119.90 -3.89 0.60 N 257 8 "O4'" A DT 8 ? ? "C1'" A DT 8 ? ? N1 A DT 8 ? ? 110.26 108.30 1.96 0.30 N 258 8 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 117.63 121.90 -4.27 0.70 N 259 8 N3 A DG 10 ? ? C2 A DG 10 ? ? N2 A DG 10 ? ? 114.38 119.90 -5.52 0.70 N 260 8 "O4'" B DA 12 ? ? "C1'" B DA 12 ? ? N9 B DA 12 ? ? 110.96 108.30 2.66 0.30 N 261 8 C4 B DA 12 ? ? C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? 112.79 117.00 -4.21 0.50 N 262 8 C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N1 B DA 12 ? ? 122.13 117.70 4.43 0.50 N 263 8 N1 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N6 B DA 12 ? ? 113.07 118.60 -5.53 0.60 N 264 8 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 111.02 108.30 2.72 0.30 N 265 8 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.69 121.90 -5.21 0.70 N 266 8 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? "C2'" B DG 14 ? ? 110.43 106.80 3.63 0.50 N 267 8 C4 B DA 15 ? ? C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? 112.93 117.00 -4.07 0.50 N 268 8 C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N1 B DA 15 ? ? 121.49 117.70 3.79 0.50 N 269 8 N1 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N6 B DA 15 ? ? 111.65 118.60 -6.95 0.60 N 270 8 N3 B DC 16 ? ? C2 B DC 16 ? ? O2 B DC 16 ? ? 116.76 121.90 -5.14 0.70 N 271 8 "O4'" B DA 19 ? ? "C1'" B DA 19 ? ? N9 B DA 19 ? ? 110.60 108.30 2.30 0.30 N 272 8 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 121.77 117.70 4.07 0.50 N 273 8 N1 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N6 B DA 19 ? ? 114.70 118.60 -3.90 0.60 N 274 8 "O4'" B DA 20 ? ? "C1'" B DA 20 ? ? "C2'" B DA 20 ? ? 110.00 106.80 3.20 0.50 N 275 8 C4 B DA 20 ? ? C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? 113.12 117.00 -3.88 0.50 N 276 8 C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N1 B DA 20 ? ? 121.19 117.70 3.49 0.50 N 277 8 N1 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N6 B DA 20 ? ? 112.86 118.60 -5.74 0.60 N 278 8 "O4'" B DG 21 ? ? "C1'" B DG 21 ? ? N9 B DG 21 ? ? 110.19 108.30 1.89 0.30 N 279 9 "O4'" A DC 2 ? ? "C1'" A DC 2 ? ? N1 A DC 2 ? ? 111.93 108.30 3.63 0.30 N 280 9 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 117.47 121.90 -4.43 0.70 N 281 9 "O4'" A DT 3 ? ? "C1'" A DT 3 ? ? N1 A DT 3 ? ? 111.01 108.30 2.71 0.30 N 282 9 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.19 121.90 -4.71 0.70 N 283 9 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.34 117.00 -3.66 0.50 N 284 9 C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N1 A DA 6 ? ? 121.12 117.70 3.42 0.50 N 285 9 N1 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? N6 A DA 6 ? ? 114.91 118.60 -3.69 0.60 N 286 9 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.90 108.30 2.60 0.30 N 287 9 C6 A DT 8 ? ? C5 A DT 8 ? ? C7 A DT 8 ? ? 118.43 122.90 -4.47 0.60 N 288 9 N1 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 122.77 118.90 3.87 0.60 N 289 9 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 115.87 121.90 -6.03 0.70 N 290 9 C4 B DA 12 ? ? C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? 113.45 117.00 -3.55 0.50 N 291 9 C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N1 B DA 12 ? ? 121.38 117.70 3.68 0.50 N 292 9 N1 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N6 B DA 12 ? ? 114.86 118.60 -3.74 0.60 N 293 9 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 110.81 108.30 2.51 0.30 N 294 9 N1 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 122.75 118.90 3.85 0.60 N 295 9 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.46 121.90 -5.44 0.70 N 296 9 C5 B DC 13 ? ? C4 B DC 13 ? ? N4 B DC 13 ? ? 115.68 120.20 -4.52 0.70 N 297 9 "O4'" B DA 15 ? ? "C1'" B DA 15 ? ? N9 B DA 15 ? ? 111.31 108.30 3.01 0.30 N 298 9 C4 B DA 15 ? ? C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? 113.19 117.00 -3.81 0.50 N 299 9 C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N1 B DA 15 ? ? 121.69 117.70 3.99 0.50 N 300 9 N1 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N6 B DA 15 ? ? 114.78 118.60 -3.82 0.60 N 301 9 "O4'" B DC 16 ? ? "C1'" B DC 16 ? ? N1 B DC 16 ? ? 110.17 108.30 1.87 0.30 N 302 9 N3 B DC 16 ? ? C2 B DC 16 ? ? O2 B DC 16 ? ? 117.09 121.90 -4.81 0.70 N 303 9 N1 B DG 17 ? ? C6 B DG 17 ? ? O6 B DG 17 ? ? 115.91 119.90 -3.99 0.60 N 304 9 "O4'" B DG 18 ? ? "C1'" B DG 18 ? ? N9 B DG 18 ? ? 110.74 108.30 2.44 0.30 N 305 9 "O4'" B DA 19 ? ? "C1'" B DA 19 ? ? N9 B DA 19 ? ? 111.79 108.30 3.49 0.30 N 306 9 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 112.73 117.00 -4.27 0.50 N 307 9 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 122.33 117.70 4.63 0.50 N 308 9 N1 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N6 B DA 19 ? ? 112.01 118.60 -6.59 0.60 N 309 9 "O4'" B DA 20 ? ? "C1'" B DA 20 ? ? N9 B DA 20 ? ? 110.73 108.30 2.43 0.30 N 310 9 C4 B DA 20 ? ? C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? 113.43 117.00 -3.57 0.50 N 311 9 C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N1 B DA 20 ? ? 121.48 117.70 3.78 0.50 N 312 9 N1 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N6 B DA 20 ? ? 112.55 118.60 -6.05 0.60 N 313 9 "O4'" B DC 22 ? ? "C1'" B DC 22 ? ? N1 B DC 22 ? ? 110.28 108.30 1.98 0.30 N 314 9 N3 B DC 22 ? ? C2 B DC 22 ? ? O2 B DC 22 ? ? 116.82 121.90 -5.08 0.70 N 315 10 N3 A DG 1 ? ? C2 A DG 1 ? ? N2 A DG 1 ? ? 113.93 119.90 -5.97 0.70 N 316 10 N3 A DC 2 ? ? C4 A DC 2 ? ? C5 A DC 2 ? ? 124.53 121.90 2.63 0.40 N 317 10 N1 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 123.17 118.90 4.27 0.60 N 318 10 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 116.51 121.90 -5.39 0.70 N 319 10 N3 A DC 2 ? ? C4 A DC 2 ? ? N4 A DC 2 ? ? 112.30 118.00 -5.70 0.70 N 320 10 C6 A DT 4 ? ? C5 A DT 4 ? ? C7 A DT 4 ? ? 118.68 122.90 -4.22 0.60 N 321 10 "O4'" A DC 5 ? ? "C1'" A DC 5 ? ? N1 A DC 5 ? ? 110.79 108.30 2.49 0.30 N 322 10 N3 A DC 5 ? ? C2 A DC 5 ? ? O2 A DC 5 ? ? 117.14 121.90 -4.76 0.70 N 323 10 "O4'" A DA 6 ? ? "C1'" A DA 6 ? ? N9 A DA 6 ? ? 112.97 108.30 4.67 0.30 N 324 10 C4 A DA 6 ? ? C5 A DA 6 ? ? C6 A DA 6 ? ? 113.77 117.00 -3.23 0.50 N 325 10 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.47 108.30 3.17 0.30 N 326 10 N3 A DG 7 ? ? C2 A DG 7 ? ? N2 A DG 7 ? ? 115.63 119.90 -4.27 0.70 N 327 10 "O4'" A DC 9 ? ? "C1'" A DC 9 ? ? N1 A DC 9 ? ? 110.47 108.30 2.17 0.30 N 328 10 N3 A DC 9 ? ? C2 A DC 9 ? ? O2 A DC 9 ? ? 117.68 121.90 -4.22 0.70 N 329 10 "O4'" A DG 10 ? ? "C1'" A DG 10 ? ? N9 A DG 10 ? ? 111.00 108.30 2.70 0.30 N 330 10 N3 A DG 10 ? ? C2 A DG 10 ? ? N2 A DG 10 ? ? 115.62 119.90 -4.28 0.70 N 331 10 "O4'" A DT 11 ? ? "C1'" A DT 11 ? ? N1 A DT 11 ? ? 112.38 108.30 4.08 0.30 N 332 10 C6 A DT 11 ? ? C5 A DT 11 ? ? C7 A DT 11 ? ? 118.94 122.90 -3.96 0.60 N 333 10 C4 B DA 12 ? ? C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? 113.26 117.00 -3.74 0.50 N 334 10 C5 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N1 B DA 12 ? ? 121.18 117.70 3.48 0.50 N 335 10 N1 B DA 12 ? ? C6 B DA 12 ? ? N6 B DA 12 ? ? 112.80 118.60 -5.80 0.60 N 336 10 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.94 121.90 -4.96 0.70 N 337 10 N3 B DG 14 ? ? C2 B DG 14 ? ? N2 B DG 14 ? ? 115.49 119.90 -4.41 0.70 N 338 10 "O4'" B DA 15 ? ? "C1'" B DA 15 ? ? N9 B DA 15 ? ? 111.14 108.30 2.84 0.30 N 339 10 C4 B DA 15 ? ? C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? 113.59 117.00 -3.41 0.50 N 340 10 C5 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N1 B DA 15 ? ? 121.68 117.70 3.98 0.50 N 341 10 N1 B DA 15 ? ? C6 B DA 15 ? ? N6 B DA 15 ? ? 114.40 118.60 -4.20 0.60 N 342 10 N3 B DC 16 ? ? C2 B DC 16 ? ? O2 B DC 16 ? ? 116.78 121.90 -5.12 0.70 N 343 10 "O4'" B DA 19 ? ? "C1'" B DA 19 ? ? N9 B DA 19 ? ? 111.18 108.30 2.88 0.30 N 344 10 C4 B DA 19 ? ? C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? 113.26 117.00 -3.74 0.50 N 345 10 C5 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N1 B DA 19 ? ? 121.47 117.70 3.77 0.50 N 346 10 N1 B DA 19 ? ? C6 B DA 19 ? ? N6 B DA 19 ? ? 114.09 118.60 -4.51 0.60 N 347 10 C4 B DA 20 ? ? C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? 113.18 117.00 -3.82 0.50 N 348 10 C5 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N1 B DA 20 ? ? 121.38 117.70 3.68 0.50 N 349 10 N1 B DA 20 ? ? C6 B DA 20 ? ? N6 B DA 20 ? ? 111.79 118.60 -6.81 0.60 N 350 10 "O4'" B DG 21 ? ? "C1'" B DG 21 ? ? N9 B DG 21 ? ? 112.72 108.30 4.42 0.30 N 351 10 N9 B DG 21 ? ? C4 B DG 21 ? ? C5 B DG 21 ? ? 107.87 105.40 2.47 0.40 N 352 10 N3 B DG 21 ? ? C2 B DG 21 ? ? N2 B DG 21 ? ? 114.96 119.90 -4.94 0.70 N # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 DC A 2 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 2 1 DT A 4 ? ? 0.081 'SIDE CHAIN' 3 1 DG A 7 ? ? 0.063 'SIDE CHAIN' 4 1 DA B 12 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 5 1 DG B 14 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 6 2 DA A 6 ? ? 0.055 'SIDE CHAIN' 7 2 DT A 11 ? ? 0.082 'SIDE CHAIN' 8 2 DA B 12 ? ? 0.087 'SIDE CHAIN' 9 2 DC B 13 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 10 2 DG B 17 ? ? 0.121 'SIDE CHAIN' 11 3 DG A 1 ? ? 0.095 'SIDE CHAIN' 12 3 DC A 9 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 13 3 DT A 11 ? ? 0.067 'SIDE CHAIN' 14 3 DG B 14 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 15 3 DC B 22 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 16 4 DG A 1 ? ? 0.097 'SIDE CHAIN' 17 4 DC A 5 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 18 4 DT A 8 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 19 4 DA B 12 ? ? 0.096 'SIDE CHAIN' 20 4 DG B 14 ? ? 0.055 'SIDE CHAIN' 21 4 DG B 21 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 22 5 DT A 4 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 23 5 DG B 14 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 24 5 DG B 17 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 25 5 DG B 21 ? ? 0.067 'SIDE CHAIN' 26 5 DC B 22 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 27 6 DC A 5 ? ? 0.085 'SIDE CHAIN' 28 6 DG A 10 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 29 6 DC B 13 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 30 6 DG B 14 ? ? 0.105 'SIDE CHAIN' 31 6 DC B 22 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 32 7 DG A 1 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 33 7 DG A 7 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 34 7 DG A 10 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 35 7 DA B 12 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 36 7 DG B 17 ? ? 0.085 'SIDE CHAIN' 37 8 DG A 1 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 38 8 DC B 16 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 39 8 DG B 18 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 40 9 DC A 2 ? ? 0.085 'SIDE CHAIN' 41 9 DT A 4 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 42 9 DG A 7 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 43 9 DC B 22 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 44 10 DG A 1 ? ? 0.091 'SIDE CHAIN' 45 10 DT A 11 ? ? 0.091 'SIDE CHAIN' 46 10 DG B 14 ? ? 0.120 'SIDE CHAIN' 47 10 DG B 17 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 48 10 DG B 21 ? ? 0.067 'SIDE CHAIN' # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 1ONM 'double helix' 1ONM 'b-form double helix' 1ONM 'mismatched base pair' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DG 1 1_555 B DC 11 1_555 -0.287 -0.319 0.869 4.226 -14.834 -4.584 1 A_DG1:DC22_B A 1 ? B 22 ? 19 1 1 A DC 2 1_555 B DG 10 1_555 0.010 -0.093 0.521 -10.724 -6.920 -2.894 2 A_DC2:DG21_B A 2 ? B 21 ? 19 1 1 A DT 3 1_555 B DA 9 1_555 -0.332 -0.029 0.143 -5.441 -9.220 -0.770 3 A_DT3:DA20_B A 3 ? B 20 ? 20 1 1 A DT 4 1_555 B DA 8 1_555 -0.225 -0.064 0.291 -1.566 -14.112 -1.382 4 A_DT4:DA19_B A 4 ? B 19 ? 20 1 1 A DC 5 1_555 B DG 7 1_555 -0.555 -0.056 -0.049 -4.227 -6.647 -4.400 5 A_DC5:DG18_B A 5 ? B 18 ? 19 1 1 A DA 6 1_555 B DG 6 1_555 -0.323 1.552 -0.243 -2.108 -5.035 -8.926 6 A_DA6:DG17_B A 6 ? B 17 ? 8 1 1 A DG 7 1_555 B DC 5 1_555 0.594 -0.003 0.912 7.400 -1.111 -3.817 7 A_DG7:DC16_B A 7 ? B 16 ? 19 1 1 A DT 8 1_555 B DA 4 1_555 0.210 0.016 0.231 3.506 -9.876 -3.751 8 A_DT8:DA15_B A 8 ? B 15 ? 20 1 1 A DC 9 1_555 B DG 3 1_555 -0.751 0.258 0.001 -0.910 -7.607 0.719 9 A_DC9:DG14_B A 9 ? B 14 ? 19 1 1 A DG 10 1_555 B DC 2 1_555 0.293 0.004 0.282 0.219 -2.940 -5.176 10 A_DG10:DC13_B A 10 ? B 13 ? 19 1 1 A DT 11 1_555 B DA 1 1_555 -0.535 0.230 1.132 -11.832 -7.377 -15.508 11 A_DT11:DA12_B A 11 ? B 12 ? 20 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A DG 1 1_555 B DC 11 1_555 A DC 2 1_555 B DG 10 1_555 0.226 -0.377 3.693 3.248 -7.552 38.458 0.466 0.106 3.705 -11.307 -4.863 39.295 1 AA_DG1DC2:DG21DC22_BB A 1 ? B 22 ? A 2 ? B 21 ? 1 A DC 2 1_555 B DG 10 1_555 A DT 3 1_555 B DA 9 1_555 0.376 -0.414 2.944 4.964 0.082 35.469 -0.684 0.037 2.967 0.134 -8.099 35.804 2 AA_DC2DT3:DA20DG21_BB A 2 ? B 21 ? A 3 ? B 20 ? 1 A DT 3 1_555 B DA 9 1_555 A DT 4 1_555 B DA 8 1_555 0.015 -0.100 3.227 -1.004 -1.295 39.780 0.001 -0.137 3.227 -1.902 1.475 39.812 3 AA_DT3DT4:DA19DA20_BB A 3 ? B 20 ? A 4 ? B 19 ? 1 A DT 4 1_555 B DA 8 1_555 A DC 5 1_555 B DG 7 1_555 -0.173 0.180 3.201 2.657 -3.852 41.203 0.654 0.521 3.156 -5.453 -3.761 41.457 4 AA_DT4DC5:DG18DA19_BB A 4 ? B 19 ? A 5 ? B 18 ? 1 A DC 5 1_555 B DG 7 1_555 A DA 6 1_555 B DG 6 1_555 0.029 0.743 3.478 6.115 3.123 33.304 0.734 1.002 3.482 5.379 -10.530 33.985 5 AA_DC5DA6:DG17DG18_BB A 5 ? B 18 ? A 6 ? B 17 ? 1 A DA 6 1_555 B DG 6 1_555 A DG 7 1_555 B DC 5 1_555 0.924 0.352 3.012 -8.031 -4.130 38.585 0.950 -2.201 2.723 -6.149 11.955 39.588 6 AA_DA6DG7:DC16DG17_BB A 6 ? B 17 ? A 7 ? B 16 ? 1 A DG 7 1_555 B DC 5 1_555 A DT 8 1_555 B DA 4 1_555 0.394 -0.500 3.483 6.038 4.430 35.601 -1.460 0.265 3.417 7.148 -9.743 36.355 7 AA_DG7DT8:DA15DC16_BB A 7 ? B 16 ? A 8 ? B 15 ? 1 A DT 8 1_555 B DA 4 1_555 A DC 9 1_555 B DG 3 1_555 0.280 -0.317 3.337 1.359 -0.651 33.754 -0.438 -0.257 3.351 -1.121 -2.339 33.787 8 AA_DT8DC9:DG14DA15_BB A 8 ? B 15 ? A 9 ? B 14 ? 1 A DC 9 1_555 B DG 3 1_555 A DG 10 1_555 B DC 2 1_555 -0.490 0.125 3.042 -4.442 4.230 42.312 -0.226 0.254 3.074 5.824 6.115 42.734 9 AA_DC9DG10:DC13DG14_BB A 9 ? B 14 ? A 10 ? B 13 ? 1 A DG 10 1_555 B DC 2 1_555 A DT 11 1_555 B DA 1 1_555 -0.761 -0.598 3.597 -5.970 -10.278 32.494 0.822 0.219 3.690 -17.647 10.252 34.545 10 AA_DG10DT11:DA12DC13_BB A 10 ? B 13 ? A 11 ? B 12 ? #