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KRADGSTIRFDRNAAVIINNQGEPRGTRVFGPVARELRDRRFMKIVSLAPEV ; I ? 12 'polypeptide(L)' no no ;HDLKPTPGSRKDRKRVGRGPGGTDKTAGRGHKGQKSRSGAGKGAFFEGGRSRLIARLPKRGFNNVGTTYEVVKLSQLQDL EDTTFDRDTLEAYRLVRRKNRPVKLLASGEISRAVTVHVDAASAAAIKAVEAAGGRVVLPE ; ;HDLKPTPGSRKDRKRVGRGPGGTDKTAGRGHKGQKSRSGAGKGAFFEGGRSRLIARLPKRGFNNVGTTYEVVKLSQLQDL EDTTFDRDTLEAYRLVRRKNRPVKLLASGEISRAVTVHVDAASAAAIKAVEAAGGRVVLPE ; J ? 13 'polypeptide(L)' no no ;TKFRKQFRGRMTGDAKGGDYVAFGDYGLIAMEPAWIKSNQIEACRIVMSRHFRRGGKIYIRIFPDKPVTKKPAETRMGKG KGAVEYWVSVVKPGRVMFEVAGVTEEQAKEAFRLAGHKLPIQTK ; ;TKFRKQFRGRMTGDAKGGDYVAFGDYGLIAMEPAWIKSNQIEACRIVMSRHFRRGGKIYIRIFPDKPVTKKPAETRMGKG KGAVEYWVSVVKPGRVMFEVAGVTEEQAKEAFRLAGHKLPIQTK ; K ? 14 'polypeptide(L)' no no ;HGKAGRKLNRNSSARVALARAQATALLREGRIQTTLTKAKELRPFVEQLITTAKGGDLHSRRLVAQDIHDKDVVRKVMDE VAPKYAERPGGYTRILRVGTRRGDGVTMALIELV ; ;HGKAGRKLNRNSSARVALARAQATALLREGRIQTTLTKAKELRPFVEQLITTAKGGDLHSRRLVAQDIHDKDVVRKVMDE VAPKYAERPGGYTRILRVGTRRGDGVTMALIELV ; L ? 15 'polypeptide(L)' no no ;ATTIRRKLRTRRKVRTTTAASGRLRLSVYRSSKHIYAQIIDDSRGQTLAAASSAALKSGNKTDTAAAVGKALAAAAAEKG IKQVVFDRGSYKYHGRVKALADAAREGGLDF ; ;ATTIRRKLRTRRKVRTTTAASGRLRLSVYRSSKHIYAQIIDDSRGQTLAAASSAALKSGNKTDTAAAVGKALAAAAAEKG IKQVVFDRGSYKYHGRVKALADAAREGGLDF ; M ? 16 'polypeptide(L)' no no ;QTHIKINRGELLRGIEQDHTRQLPDFRPGDTVRVDTKVREGNRTRSQAFEGVVIAINGSGSRKSFTVRKISFGEGVERVF PFASPLVNQVTIVERGKVRRAKLYYLRELRGKAARIKSDRSRVMK ; ;QTHIKINRGELLRGIEQDHTRQLPDFRPGDTVRVDTKVREGNRTRSQAFEGVVIAINGSGSRKSFTVRKISFGEGVERVF PFASPLVNQVTIVERGKVRRAKLYYLRELRGKAARIKSDRSRVMK ; N ? 17 'polypeptide(L)' no no ;PRAKTGIVRRRRHKKVLKRAKGFWGSRSKQYRNAFQTLLNAATYEYRDRRNKKRDFRRLWIQRINAGARLHGMNYSTFIN GLKRANIDLNRKVLADIAAREPEAFKALVDASRNARQ ; ;PRAKTGIVRRRRHKKVLKRAKGFWGSRSKQYRNAFQTLLNAATYEYRDRRNKKRDFRRLWIQRINAGARLHGMNYSTFIN GLKRANIDLNRKVLADIAAREPEAFKALVDASRNARQ ; O ? 18 'polypeptide(L)' no no ;MFAIIQTGGKQYRVSEGDVIRVESLQGEAGDKVELKALFVGGEQTVFGEDAGKYTVQAEVVEHGRGKKIYIRKYKSGVQY RRRTGHRQNFTAIKILGIQG ; ;MFAIIQTGGKQYRVSEGDVIRVESLQGEAGDKVELKALFVGGEQTVFGEDAGKYTVQAEVVEHGRGKKIYIRKYKSGVQY RRRTGHRQNFTAIKILGIQG ; P ? 19 'polypeptide(L)' no no ;EQTFRNKKQRKQQVKLRKPGFAVAKYVRMSPRKVRLVVDVIRGKSVQDAEDLLRFIPRSASEPVAKVLNSAKANALHNDE MLEDRLFVKEAYVDAGPTLKRLIPRARGSANIIKKRTSHITIIVAEKGNK ; ;EQTFRNKKQRKQQVKLRKPGFAVAKYVRMSPRKVRLVVDVIRGKSVQDAEDLLRFIPRSASEPVAKVLNSAKANALHNDE MLEDRLFVKEAYVDAGPTLKRLIPRARGSANIIKKRTSHITIIVAEKGNK ; Q ? 20 'polypeptide(L)' no no ;SHYDILQAPVISEKAYSAMERGVYSFWVSPKATKTEIKDAIQQAFGVRVIGISTMNVPGKRKRVGRFIGQRNDRKKAIVR LAEGQSIEALAGQ ; ;SHYDILQAPVISEKAYSAMERGVYSFWVSPKATKTEIKDAIQQAFGVRVIGISTMNVPGKRKRVGRFIGQRNDRKKAIVR LAEGQSIEALAGQ ; R ? 21 'polypeptide(L)' no no ;PRPSAGSHHNDKLHFKKGDTVIVLSGKHKGQTGKVLLALPRDQKVVVEGVNVITKNVKPSMTNPQGGQEQRELALHASKV ALVDPETGKATRVRKQIVDGKKVRVAVASGKTI ; ;PRPSAGSHHNDKLHFKKGDTVIVLSGKHKGQTGKVLLALPRDQKVVVEGVNVITKNVKPSMTNPQGGQEQRELALHASKV ALVDPETGKATRVRKQIVDGKKVRVAVASGKTI ; S ? 22 'polypeptide(L)' no no ;MELTAKPRTPKQKLDESMIAAVAYNKENNVSFALDRKAFDRAFRQQSTTGLFDITVEGGETFPALVKAVQMDKRKRAPIH VDFYMVTYGEPVEVSVPVHTTGRSQGEVQGGLVDIVVHNLQIVAPGPRRIPQELVVDVTKMNIGDHITAGDIKLPEGCTL AADPELTVVSVLP ; ;MELTAKPRTPKQKLDESMIAAVAYNKENNVSFALDRKAFDRAFRQQSTTGLFDITVEGGETFPALVKAVQMDKRKRAPIH VDFYMVTYGEPVEVSVPVHTTGRSQGEVQGGLVDIVVHNLQIVAPGPRRIPQELVVDVTKMNIGDHITAGDIKLPEGCTL AADPELTVVSVLP ; T ? 23 'polypeptide(L)' no no ;AHKKGVGSSKNGRDSNPKYLGVKKFGGEVVKAGNILVRQRGTKFKAGQGVGMGRDHTLFALSDGKVVFINKGKGARFISI EAAQTE ; ;AHKKGVGSSKNGRDSNPKYLGVKKFGGEVVKAGNILVRQRGTKFKAGQGVGMGRDHTLFALSDGKVVFINKGKGARFISI EAAQTE ; U ? 24 'polypeptide(L)' no no '(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)' XXXXXXXXXXXXXXXX V ? 25 'polypeptide(L)' no no KPSEMRNLQATDFAKEIDARKKELMELRFQAAAGQLAQPHRVRQLRREVAQLNTVKAELARKGEQ KPSEMRNLQATDFAKEIDARKKELMELRFQAAAGQLAQPHRVRQLRREVAQLNTVKAELARKGEQ W ? 26 'polypeptide(L)' no no MKIKLVRSVIGRPGNQVKTVQALGLRKIGDSREVSDTPAVRGMVKTVKHLLEVQE MKIKLVRSVIGRPGNQVKTVQALGLRKIGDSREVSDTPAVRGMVKTVKHLLEVQE X ? 27 'polypeptide(L)' no no MQKDLHPKAVPCKIIYQGQVVMETMSTRPEIHVDVWSGVHPFWTGEERFLDTEGRVDKFNKRFGDSYRRGSKK MQKDLHPKAVPCKIIYQGQVVMETMSTRPEIHVDVWSGVHPFWTGEERFLDTEGRVDKFNKRFGDSYRRGSKK Y ? 28 'polypeptide(L)' no no AKHPVPKKKTSKSKRDMRRSHHALTAPNLTECPQCHGKKLSHHICPNCGYYDGRQVLA AKHPVPKKKTSKSKRDMRRSHHALTAPNLTECPQCHGKKLSHHICPNCGYYDGRQVLA Z ? 29 'polypeptide(L)' no no AKDGPRIIVKMESSAGTGFYYTTTKNRRNTQAKLELKKYDPVAKKHVVFREKK AKDGPRIIVKMESSAGTGFYYTTTKNRRNTQAKLELKKYDPVAKKHVVFREKK 1 ? 30 'polypeptide(L)' no no MKRTYQPNNRKRAKTHGFRARMKTKSGRNILARRRAKGRHQLTVSD MKRTYQPNNRKRAKTHGFRARMKTKSGRNILARRRAKGRHQLTVSD 2 ? 31 'polypeptide(L)' no no PKMKTHKMAKRRIKITGTGKVMAFKSGKRHQNTGKSGDEIRGKGKGFVLAKAEWARMKLMLPR PKMKTHKMAKRRIKITGTGKVMAFKSGKRHQNTGKSGDEIRGKGKGFVLAKAEWARMKLMLPR 3 ? 32 'polypeptide(L)' no no KVRSSVKKMCDNCKVVRRHGRVLVICSNVKHKQRQ KVRSSVKKMCDNCKVVRRHGRVLVICSNVKHKQRQ 4 ? 33 'polypeptide(L)' no yes ;MLADKESLIEALKLALSTEYNVKRNFTQSVEIILTFKGID(MSE)KKGDLKLREIVPLPKQPSKAKRVLVVPSSEQLEYA KKASPKVVITREELQKLQGQKRPVKKLARQNEWFLINQES(MSE)ALAGRILGPALGPRGKFPTPLPNTADISEYINRFK RSVLVKTKDQPQVQVFIGTED(MSE)KPEDLAENAIAVLNAIENKAKVETNLRNIYVKTT(MSE)GKAVKVKR ; ;MLADKESLIEALKLALSTEYNVKRNFTQSVEIILTFKGIDMKKGDLKLREIVPLPKQPSKAKRVLVVPSSEQLEYAKKAS PKVVITREELQKLQGQKRPVKKLARQNEWFLINQESMALAGRILGPALGPRGKFPTPLPNTADISEYINRFKRSVLVKTK DQPQVQVFIGTEDMKPEDLAENAIAVLNAIENKAKVETNLRNIYVKTTMGKAVKVKR ; 5 ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 G n 1 2 G n 1 3 U n 1 4 C n 1 5 A n 1 6 A n 1 7 G n 1 8 A n 1 9 U n 1 10 A n 1 11 G n 1 12 U n 1 13 A n 1 14 A n 1 15 G n 1 16 G n 1 17 G n 1 18 U n 1 19 C n 1 20 C n 1 21 A n 1 22 C n 1 23 G n 1 24 G n 1 25 U n 1 26 G n 1 27 G n 1 28 A n 1 29 U n 1 30 G n 1 31 C n 1 32 C n 1 33 C n 1 34 U n 1 35 G n 1 36 G n 1 37 C n 1 38 G n 1 39 C n 1 40 U n 1 41 G n 1 42 G n 1 43 A n 1 44 G n 1 45 C n 1 46 C n 1 47 G n 1 48 A n 1 49 U n 1 50 G n 1 51 A n 1 52 A n 1 53 G n 1 54 G n 1 55 A n 1 56 C n 1 57 G n 1 58 C n 1 59 G n 1 60 A n 1 61 U n 1 62 U n 1 63 A n 1 64 C n 1 65 C n 1 66 U n 1 67 G n 1 68 C n 1 69 G n 1 70 A n 1 71 A n 1 72 A n 1 73 A n 1 74 G n 1 75 C n 1 76 C n 1 77 C n 1 78 C n 1 79 G n 1 80 A n 1 81 C n 1 82 G n 1 83 A n 1 84 G n 1 85 C n 1 86 U n 1 87 G n 1 88 G n 1 89 A n 1 90 G n 1 91 A n 1 92 U n 1 93 A n 1 94 C n 1 95 G n 1 96 C n 1 97 U n 1 98 U n 1 99 U n 1 100 G n 1 101 A n 1 102 C n 1 103 U n 1 104 C n 1 105 G n 1 106 G n 1 107 G n 1 108 G n 1 109 A n 1 110 U n 1 111 G n 1 112 U n 1 113 C n 1 114 C n 1 115 G n 1 116 A n 1 117 A n 1 118 U n 1 119 G n 1 120 G n 1 121 G n 1 122 G n 1 123 A n 1 124 A n 1 125 A n 1 126 C n 1 127 C n 1 128 C n 1 129 A n 1 130 C n 1 131 C n 1 132 U n 1 133 C n 1 134 G n 1 135 U n 1 136 A n 1 137 A n 1 138 G n 1 139 A n 1 140 G n 1 141 G n 1 142 U n 1 143 A n 1 144 U n 1 145 C n 1 146 C n 1 147 G n 1 148 C n 1 149 A n 1 150 A n 1 151 G n 1 152 G n 1 153 A n 1 154 U n 1 155 G n 1 156 G n 1 157 G n 1 158 A n 1 159 A n 1 160 C n 1 161 U n 1 162 C n 1 163 A n 1 164 G n 1 165 G n 1 166 G n 1 167 A n 1 168 A n 1 169 C n 1 170 U n 1 171 G n 1 172 A n 1 173 A n 1 174 A n 1 175 C n 1 176 A n 1 177 U n 1 178 C n 1 179 U n 1 180 C n 1 181 A n 1 182 G n 1 183 U n 1 184 A n 1 185 C n 1 186 C n 1 187 U n 1 188 G n 1 189 A n 1 190 A n 1 191 G n 1 192 G n 1 193 A n 1 194 G n 1 195 A n 1 196 A n 1 197 G n 1 198 A n 1 199 A n 1 200 A n 1 201 G n 1 202 A n 1 203 G n 1 204 A n 1 205 A n 1 206 U n 1 207 U n 1 208 C n 1 209 G n 1 210 A n 1 211 U n 1 212 U n 1 213 C n 1 214 C n 1 215 G n 1 216 U n 1 217 U n 1 218 A n 1 219 G n 1 220 U n 1 221 A n 1 222 G n 1 223 C n 1 224 G n 1 225 G n 1 226 C n 1 227 G n 1 228 A n 1 229 G n 1 230 C n 1 231 G n 1 232 A n 1 233 A n 1 234 C n 1 235 C n 1 236 C n 1 237 G n 1 238 G n 1 239 A n 1 240 U n 1 241 C n 1 242 A n 1 243 G n 1 244 C n 1 245 C n 1 246 C n 1 247 A n 1 248 A n 1 249 A n 1 250 C n 1 251 C n 1 252 G n 1 253 A n 1 254 A n 1 255 A n 1 256 C n 1 257 G n 1 258 C n 1 259 U n 1 260 U n 1 261 G n 1 262 C n 1 263 G n 1 264 U n 1 265 U n 1 266 U n 1 267 C n 1 268 G n 1 269 G n 1 270 G n 1 271 G n 1 272 U n 1 273 U n 1 274 G n 1 275 U n 1 276 A n 1 277 G n 1 278 G n 1 279 A n 1 280 C n 1 281 C n 1 282 A n 1 283 G n 1 284 U n 1 285 U n 1 286 U n 1 287 U n 1 288 U n 1 289 A n 1 290 A n 1 291 G n 1 292 A n 1 293 U n 1 294 U n 1 295 C n 1 296 A n 1 297 A n 1 298 C n 1 299 C n 1 300 C n 1 301 C n 1 302 U n 1 303 C n 1 304 A n 1 305 A n 1 306 G n 1 307 C n 1 308 C n 1 309 G n 1 310 A n 1 311 A n 1 312 G n 1 313 U n 1 314 G n 1 315 G n 1 316 C n 1 317 U n 1 318 G n 1 319 G n 1 320 A n 1 321 A n 1 322 A n 1 323 G n 1 324 C n 1 325 U n 1 326 A n 1 327 C n 1 328 A n 1 329 C n 1 330 C n 1 331 U n 1 332 C n 1 333 A n 1 334 G n 1 335 A n 1 336 A n 1 337 G n 1 338 G n 1 339 U n 1 340 G n 1 341 A n 1 342 G n 1 343 A n 1 344 G n 1 345 U n 1 346 C n 1 347 C n 1 348 U n 1 349 G n 1 350 U n 1 351 A n 1 352 G n 1 353 G n 1 354 C n 1 355 G n 1 356 A n 1 357 A n 1 358 C n 1 359 G n 1 360 A n 1 361 G n 1 362 C n 1 363 G n 1 364 G n 1 365 U n 1 366 U n 1 367 G n 1 368 A n 1 369 C n 1 370 U n 1 371 G n 1 372 U n 1 373 A n 1 374 C n 1 375 U n 1 376 G n 1 377 G n 1 378 C n 1 379 A n 1 380 C n 1 381 C n 1 382 U n 1 383 G n 1 384 A n 1 385 G n 1 386 U n 1 387 A n 1 388 G n 1 389 G n 1 390 U n 1 391 C n 1 392 G n 1 393 U n 1 394 U n 1 395 G n 1 396 U n 1 397 U n 1 398 C n 1 399 G n 1 400 U n 1 401 G n 1 402 A n 1 403 A n 1 404 A n 1 405 C n 1 406 G n 1 407 A n 1 408 U n 1 409 G n 1 410 A n 1 411 C n 1 412 U n 1 413 G n 1 414 A n 1 415 A n 1 416 U n 1 417 C n 1 418 C n 1 419 G n 1 420 C n 1 421 G n 1 422 C n 1 423 G n 1 424 G n 1 425 A n 1 426 C n 1 427 C n 1 428 A n 1 429 C n 1 430 C n 1 431 G n 1 432 C n 1 433 G n 1 434 C n 1 435 A n 1 436 A n 1 437 G n 1 438 G n 1 439 C n 1 440 U n 1 441 A n 1 442 A n 1 443 A n 1 444 U n 1 445 A n 1 446 C n 1 447 U n 1 448 C n 1 449 C n 1 450 C n 1 451 A n 1 452 G n 1 453 U n 1 454 G 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'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 10 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 11 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 12 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 13 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 14 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 15 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 16 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 17 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 18 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 19 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 20 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 21 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 22 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 23 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 24 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 25 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 26 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 27 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 28 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 29 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 30 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 31 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 32 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 33 1 sample ? ? ? 'Escherichia coli' 562 Escherichia ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 1 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 2 2 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 3 3 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 4 4 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 5 5 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 6 6 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 7 7 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 8 8 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 9 9 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 10 10 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 11 11 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 12 12 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 13 13 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 14 14 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 15 15 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 16 16 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 17 17 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 18 18 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 19 19 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 20 20 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 21 21 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 22 22 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 23 23 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 24 24 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 25 25 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 26 26 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 27 27 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 28 28 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 29 29 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 30 30 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 31 31 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 32 32 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? 33 33 PDB 1PNU 1PNU ? ? ? # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 1PNU 0 1 ? 2887 ? 1PNU 1 ? 2880 ? 1 2880 2 2 1PNU 9 1 ? 118 ? 1PNU 4 ? 121 ? 4 121 3 3 1PNU A 1 ? 270 ? 1PNU 4 ? 273 ? 4 273 4 4 1PNU B 1 ? 205 ? 1PNU 1 ? 205 ? 1 205 5 5 1PNU C 1 ? 197 ? 1PNU 2 ? 198 ? 2 198 6 6 1PNU D 1 ? 178 ? 1PNU 2 ? 179 ? 2 179 7 7 1PNU E 1 ? 177 ? 1PNU 5 ? 181 ? 5 181 8 8 1PNU F 1 ? 52 ? 1PNU 1 ? 52 ? 1 52 9 9 1PNU G 1 ? 143 ? 1PNU 1 ? 143 ? 1 143 10 10 1PNU H 1 ? 143 ? 1PNU 29 ? 171 ? 29 171 11 11 1PNU I 1 ? 132 ? 1PNU 2 ? 133 ? 2 133 12 12 1PNU J 1 ? 141 ? 1PNU 4 ? 144 ? 4 144 13 13 1PNU K 1 ? 124 ? 1PNU 8 ? 131 ? 8 131 14 14 1PNU L 1 ? 114 ? 1PNU 3 ? 116 ? 3 116 15 15 1PNU M 1 ? 111 ? 1PNU 4 ? 114 ? 4 114 16 16 1PNU N 1 ? 125 ? 1PNU 2 ? 126 ? 2 126 17 17 1PNU O 1 ? 117 ? 1PNU 2 ? 118 ? 2 118 18 18 1PNU P 1 ? 100 ? 1PNU 1 ? 100 ? 1 100 19 19 1PNU Q 1 ? 130 ? 1PNU 5 ? 134 ? 5 134 20 20 1PNU R 1 ? 93 ? 1PNU 2 ? 94 ? 2 94 21 21 1PNU S 1 ? 113 ? 1PNU 2 ? 114 ? 2 114 22 22 1PNU T 1 ? 173 ? 1PNU 1 ? 173 ? 1 173 23 23 1PNU U 1 ? 86 ? 1PNU 2 ? 87 ? 2 87 24 24 1PNU V 1 ? 16 ? 1PNU 1 ? 16 ? 1 16 25 25 1PNU W 1 ? 65 ? 1PNU 2 ? 66 ? 2 66 26 26 1PNU X 1 ? 55 ? 1PNU 1 ? 55 ? 1 55 27 27 1PNU Y 1 ? 73 ? 1PNU 1 ? 73 ? 1 73 28 28 1PNU Z 1 ? 58 ? 1PNU 2 ? 59 ? 2 59 29 29 1PNU 1 1 ? 53 ? 1PNU 2 ? 54 ? 2 54 30 30 1PNU 2 1 ? 46 ? 1PNU 1 ? 46 ? 1 46 31 31 1PNU 3 1 ? 63 ? 1PNU 2 ? 64 ? 2 64 32 32 1PNU 4 1 ? 35 ? 1PNU 2 ? 36 ? 2 36 33 33 1PNU 5 1 ? 217 ? 1PNU 1 ? 217 ? 1 217 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 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'C5 H11 N O2 S' 149.211 MSE 'L-peptide linking' n SELENOMETHIONINE ? 'C5 H11 N O2 Se' 196.106 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 UNK 'L-peptide linking' . UNKNOWN ? 'C4 H9 N O2' 103.120 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.entry_id 1PNU _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' _exptl.crystals_number 1 # _exptl_crystal.id 1 _exptl_crystal.density_meas ? _exptl_crystal.density_Matthews ? _exptl_crystal.density_percent_sol ? _exptl_crystal.description ? # _exptl_crystal_grow.crystal_id 1 _exptl_crystal_grow.method 'VAPOR DIFFUSION' _exptl_crystal_grow.temp 277 _exptl_crystal_grow.temp_details ? _exptl_crystal_grow.pH 6.5 _exptl_crystal_grow.pdbx_details 'MPD, ethanol, magnesium chloride, ammonium chloride, spermine, spermidine, MES , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K' _exptl_crystal_grow.pdbx_pH_range . # loop_ _exptl_crystal_grow_comp.crystal_id _exptl_crystal_grow_comp.id _exptl_crystal_grow_comp.sol_id _exptl_crystal_grow_comp.name _exptl_crystal_grow_comp.volume _exptl_crystal_grow_comp.conc _exptl_crystal_grow_comp.details 1 1 1 MPD ? ? ? 1 2 1 ethanol ? ? ? 1 3 1 'magnesium chloride' ? ? ? 1 4 1 'ammonium chloride' ? ? ? 1 5 1 spermine ? ? ? 1 6 1 spermidine ? ? ? 1 7 1 MES ? ? ? 1 8 1 H2O ? ? ? 1 9 2 MPD ? ? ? 1 10 2 'magnesium chloride' ? ? ? 1 11 2 'ammonium chloride' ? ? ? 1 12 2 H2O ? ? ? # _diffrn.id 1 _diffrn.ambient_temp 110 _diffrn.ambient_temp_details ? _diffrn.crystal_id 1 # _diffrn_detector.diffrn_id 1 _diffrn_detector.detector CCD _diffrn_detector.type 'ADSC QUANTUM 315' _diffrn_detector.pdbx_collection_date 2002-08-31 _diffrn_detector.details ? # _diffrn_radiation.diffrn_id 1 _diffrn_radiation.wavelength_id 1 _diffrn_radiation.pdbx_monochromatic_or_laue_m_l M _diffrn_radiation.monochromator 'Si 111' _diffrn_radiation.pdbx_diffrn_protocol 'SINGLE WAVELENGTH' _diffrn_radiation.pdbx_scattering_type x-ray # _diffrn_radiation_wavelength.id 1 _diffrn_radiation_wavelength.wavelength 1.1 _diffrn_radiation_wavelength.wt 1.0 # _diffrn_source.diffrn_id 1 _diffrn_source.source SYNCHROTRON _diffrn_source.type 'ALS BEAMLINE 8.3.1' _diffrn_source.pdbx_synchrotron_site ALS _diffrn_source.pdbx_synchrotron_beamline 8.3.1 _diffrn_source.pdbx_wavelength ? _diffrn_source.pdbx_wavelength_list 1.1 # _reflns.entry_id 1PNU _reflns.observed_criterion_sigma_F 0 _reflns.observed_criterion_sigma_I -3 _reflns.d_resolution_high 8.7 _reflns.d_resolution_low 175 _reflns.number_all 37559 _reflns.number_obs 36338 _reflns.percent_possible_obs 98.5 _reflns.pdbx_Rmerge_I_obs ? _reflns.pdbx_Rsym_value 0.15 _reflns.pdbx_netI_over_sigmaI 9. _reflns.B_iso_Wilson_estimate ? _reflns.pdbx_redundancy 5.2 _reflns.R_free_details ? _reflns.pdbx_ordinal 1 _reflns.pdbx_diffrn_id 1 # _reflns_shell.d_res_high 8.7 _reflns_shell.d_res_low 8.9 _reflns_shell.percent_possible_all 99.2 _reflns_shell.Rmerge_I_obs ? _reflns_shell.pdbx_Rsym_value 0.635 _reflns_shell.meanI_over_sigI_obs 2.5 _reflns_shell.pdbx_redundancy 5.2 _reflns_shell.percent_possible_obs ? _reflns_shell.number_unique_all ? _reflns_shell.pdbx_ordinal 1 _reflns_shell.pdbx_diffrn_id 1 # _refine.entry_id 1PNU _refine.ls_d_res_high 8.7 _refine.ls_d_res_low 70 _refine.pdbx_ls_sigma_F 0 _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.ls_number_reflns_all 37559 _refine.ls_number_reflns_obs 36338 _refine.ls_number_reflns_R_free 1781 _refine.ls_percent_reflns_obs 98.5 _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_work 0.394 _refine.ls_R_factor_R_free 0.415 _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct 'MOLECULAR REPLACEMENT' _refine.pdbx_starting_model 'PDB ENTRIES 1J5E, 1LNR' _refine.pdbx_ls_cross_valid_method THROUGHOUT _refine.pdbx_R_Free_selection_details RANDOM _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values NA _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model GROUPED _refine.B_iso_mean 648.8 _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.details ;89 RIGID BODIES REFINEMENT, GROUPED B-FACTOR REFINEMENT. There are many long O3'-P distances in this entry. Coordinates used for solving and refining this structure comes from PDB entry, 1LNR, where the sequence represents that of Deinococcus radiodurans. ; _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine.pdbx_diffrn_id 1 _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # _refine_hist.pdbx_refine_id 'X-RAY DIFFRACTION' _refine_hist.cycle_id LAST _refine_hist.pdbx_number_atoms_protein 3605 _refine_hist.pdbx_number_atoms_nucleic_acid 63155 _refine_hist.pdbx_number_atoms_ligand 0 _refine_hist.number_atoms_solvent 0 _refine_hist.number_atoms_total 66760 _refine_hist.d_res_high 8.7 _refine_hist.d_res_low 70 # _struct.entry_id 1PNU _struct.title ;Crystal Structure of a Streptomycin Dependent Ribosome from Escherichia Coli, 50S Subunit of 70S Ribosome. THIS FILE, 1PNU, CONTAINS ONLY MOLECULES OF THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 30S SUBUNIT, MRNA, P-SITE TRNA, AND A-SITE TRNA ARE IN THE PDB FILE 1PNS. ; _struct.pdbx_descriptor '50S RIBOSOMAL SUBUNIT' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_CASP_flag ? _struct.pdbx_model_type_details ? # _struct_keywords.entry_id 1PNU _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME _struct_keywords.text '50S Ribosomal Subunit, PROTEIN-PROTEIN COMPLEX, RNA-RNA COMPLEX, PROTEIN-RNA COMPLEX, RIBOSOME' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? U N N 21 ? V N N 22 ? W N N 23 ? X N N 24 ? Y N N 25 ? Z N N 26 ? AA N N 27 ? BA N N 28 ? CA N N 29 ? DA N N 30 ? EA N N 31 ? FA N N 32 ? GA N N 33 ? # _struct_biol.id 1 _struct_biol.pdbx_parent_biol_id ? _struct_biol.details ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order hydrog1 hydrog ? ? A G 1 N1 ? ? ? 1_555 A C 2883 N3 ? ? 0 G 1 0 C 2876 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog2 hydrog ? ? A G 1 N2 ? ? ? 1_555 A C 2883 O2 ? ? 0 G 1 0 C 2876 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3 hydrog ? ? A G 1 O6 ? ? ? 1_555 A C 2883 N4 ? ? 0 G 1 0 C 2876 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog4 hydrog ? ? A G 2 N1 ? ? ? 1_555 A C 2882 N3 ? ? 0 G 2 0 C 2875 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog5 hydrog ? ? A G 2 N2 ? ? ? 1_555 A C 2882 O2 ? ? 0 G 2 0 C 2875 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog6 hydrog ? ? A G 2 O6 ? ? ? 1_555 A C 2882 N4 ? ? 0 G 2 0 C 2875 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog7 hydrog ? ? A U 3 N3 ? ? ? 1_555 A A 2881 N1 ? ? 0 U 3 0 A 2874 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog8 hydrog ? ? A U 3 O4 ? ? ? 1_555 A A 2881 N6 ? ? 0 U 3 0 A 2874 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog9 hydrog ? ? A C 4 N3 ? ? ? 1_555 A G 2880 N1 ? ? 0 C 4 0 G 2873 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog10 hydrog ? ? A C 4 N4 ? ? ? 1_555 A G 2880 O6 ? ? 0 C 4 0 G 2873 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog11 hydrog ? ? A C 4 O2 ? ? ? 1_555 A G 2880 N2 ? ? 0 C 4 0 G 2873 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog12 hydrog ? ? A A 5 N1 ? ? ? 1_555 A U 2879 N3 ? ? 0 A 5 0 U 2872 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog13 hydrog ? ? A A 5 N6 ? ? ? 1_555 A U 2879 O4 ? ? 0 A 5 0 U 2872 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog14 hydrog ? ? A A 6 N1 ? ? ? 1_555 A U 2878 N3 ? ? 0 A 6 0 U 2871 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog15 hydrog ? ? A A 6 N6 ? ? ? 1_555 A U 2878 O4 ? ? 0 A 6 0 U 2871 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog16 hydrog ? ? A G 7 N1 ? ? ? 1_555 A C 2877 N3 ? ? 0 G 7 0 C 2870 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog17 hydrog ? ? A G 7 N2 ? ? ? 1_555 A C 2877 O2 ? ? 0 G 7 0 C 2870 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog18 hydrog ? ? A G 7 O6 ? ? ? 1_555 A C 2877 N4 ? ? 0 G 7 0 C 2870 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog19 hydrog ? ? A A 8 N1 ? ? ? 1_555 A U 2876 N3 ? ? 0 A 8 0 U 2869 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog20 hydrog ? ? A A 8 N6 ? ? ? 1_555 A U 2876 O4 ? ? 0 A 8 0 U 2869 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog21 hydrog ? ? A U 9 O2 ? ? ? 1_555 A A 2615 N6 ? ? 0 U 9 0 A 2608 1_555 ? ? ? ? ? ? 'U-A PAIR' ? ? hydrog22 hydrog ? ? A A 13 N3 ? ? ? 1_555 A A 536 N6 ? ? 0 A 13 0 A 536 1_555 ? ? ? ? ? ? 'A-A MISPAIR' ? ? hydrog23 hydrog ? ? A G 16 N1 ? ? ? 1_555 A U 534 O2 ? ? 0 G 16 0 U 534 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-U MISPAIR' ? ? hydrog24 hydrog ? ? A G 17 N1 ? ? ? 1_555 A C 533 N3 ? ? 0 G 17 0 C 533 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog25 hydrog ? ? A G 17 N2 ? ? ? 1_555 A C 533 O2 ? ? 0 G 17 0 C 533 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog26 hydrog ? ? A G 17 O6 ? ? ? 1_555 A C 533 N4 ? ? 0 G 17 0 C 533 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog27 hydrog ? ? A U 18 N3 ? ? ? 1_555 A A 532 N1 ? ? 0 U 18 0 A 532 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog28 hydrog ? ? A U 18 O4 ? ? ? 1_555 A A 532 N6 ? ? 0 U 18 0 A 532 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog29 hydrog ? ? A C 19 N3 ? ? ? 1_555 A G 531 N1 ? ? 0 C 19 0 G 531 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog30 hydrog ? ? A C 19 N4 ? ? ? 1_555 A G 531 O6 ? ? 0 C 19 0 G 531 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog31 hydrog ? ? A C 19 O2 ? ? ? 1_555 A G 531 N2 ? ? 0 C 19 0 G 531 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog32 hydrog ? ? A C 20 N3 ? ? ? 1_555 A G 530 N1 ? ? 0 C 20 0 G 530 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog33 hydrog ? ? A C 20 N4 ? ? ? 1_555 A G 530 O6 ? ? 0 C 20 0 G 530 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog34 hydrog ? ? A C 20 O2 ? ? ? 1_555 A G 530 N2 ? ? 0 C 20 0 G 530 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog35 hydrog ? ? A A 21 N1 ? ? ? 1_555 A U 529 N3 ? ? 0 A 21 0 U 529 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog36 hydrog ? ? A A 21 N6 ? ? ? 1_555 A U 529 O4 ? ? 0 A 21 0 U 529 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog37 hydrog ? ? 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112 ILE 112 112 112 ILE ILE 5 . n GA 33 113 ASN 113 113 113 ASN ASN 5 . n GA 33 114 GLN 114 114 114 GLN GLN 5 . n GA 33 115 GLU 115 115 115 GLU GLU 5 . n GA 33 116 SER 116 116 116 SER SER 5 . n GA 33 117 MSE 117 117 117 MSE MSE 5 . n GA 33 118 ALA 118 118 118 ALA ALA 5 . n GA 33 119 LEU 119 119 119 LEU LEU 5 . n GA 33 120 ALA 120 120 120 ALA ALA 5 . n GA 33 121 GLY 121 121 121 GLY GLY 5 . n GA 33 122 ARG 122 122 122 ARG ARG 5 . n GA 33 123 ILE 123 123 123 ILE ILE 5 . n GA 33 124 LEU 124 124 124 LEU LEU 5 . n GA 33 125 GLY 125 125 125 GLY GLY 5 . n GA 33 126 PRO 126 126 126 PRO PRO 5 . n GA 33 127 ALA 127 127 127 ALA ALA 5 . n GA 33 128 LEU 128 128 128 LEU LEU 5 . n GA 33 129 GLY 129 129 129 GLY GLY 5 . n GA 33 130 PRO 130 130 130 PRO PRO 5 . n GA 33 131 ARG 131 131 131 ARG ARG 5 . n GA 33 132 GLY 132 132 132 GLY GLY 5 . n GA 33 133 LYS 133 133 133 LYS LYS 5 . n GA 33 134 PHE 134 134 134 PHE PHE 5 . n GA 33 135 PRO 135 135 135 PRO PRO 5 . n GA 33 136 THR 136 136 136 THR THR 5 . n GA 33 137 PRO 137 137 137 PRO PRO 5 . n GA 33 138 LEU 138 138 138 LEU LEU 5 . n GA 33 139 PRO 139 139 139 PRO PRO 5 . n GA 33 140 ASN 140 140 140 ASN ASN 5 . n GA 33 141 THR 141 141 141 THR THR 5 . n GA 33 142 ALA 142 142 142 ALA ALA 5 . n GA 33 143 ASP 143 143 143 ASP ASP 5 . n GA 33 144 ILE 144 144 144 ILE ILE 5 . n GA 33 145 SER 145 145 145 SER SER 5 . n GA 33 146 GLU 146 146 146 GLU GLU 5 . n GA 33 147 TYR 147 147 147 TYR TYR 5 . n GA 33 148 ILE 148 148 148 ILE ILE 5 . n GA 33 149 ASN 149 149 149 ASN ASN 5 . n GA 33 150 ARG 150 150 150 ARG ARG 5 . n GA 33 151 PHE 151 151 151 PHE PHE 5 . n GA 33 152 LYS 152 152 152 LYS LYS 5 . n GA 33 153 ARG 153 153 153 ARG ARG 5 . n GA 33 154 SER 154 154 154 SER SER 5 . n GA 33 155 VAL 155 155 155 VAL VAL 5 . n GA 33 156 LEU 156 156 156 LEU LEU 5 . n GA 33 157 VAL 157 157 157 VAL VAL 5 . n GA 33 158 LYS 158 158 158 LYS LYS 5 . n GA 33 159 THR 159 159 159 THR THR 5 . n GA 33 160 LYS 160 160 160 LYS LYS 5 . n GA 33 161 ASP 161 161 161 ASP ASP 5 . n GA 33 162 GLN 162 162 162 GLN GLN 5 . n GA 33 163 PRO 163 163 163 PRO PRO 5 . n GA 33 164 GLN 164 164 164 GLN GLN 5 . n GA 33 165 VAL 165 165 165 VAL VAL 5 . n GA 33 166 GLN 166 166 166 GLN GLN 5 . n GA 33 167 VAL 167 167 167 VAL VAL 5 . n GA 33 168 PHE 168 168 168 PHE PHE 5 . n GA 33 169 ILE 169 169 169 ILE ILE 5 . n GA 33 170 GLY 170 170 170 GLY GLY 5 . n GA 33 171 THR 171 171 171 THR THR 5 . n GA 33 172 GLU 172 172 172 GLU GLU 5 . n GA 33 173 ASP 173 173 173 ASP ASP 5 . n GA 33 174 MSE 174 174 174 MSE MSE 5 . n GA 33 175 LYS 175 175 175 LYS LYS 5 . n GA 33 176 PRO 176 176 176 PRO PRO 5 . n GA 33 177 GLU 177 177 177 GLU GLU 5 . n GA 33 178 ASP 178 178 178 ASP ASP 5 . n GA 33 179 LEU 179 179 179 LEU LEU 5 . n GA 33 180 ALA 180 180 180 ALA ALA 5 . n GA 33 181 GLU 181 181 181 GLU GLU 5 . n GA 33 182 ASN 182 182 182 ASN ASN 5 . n GA 33 183 ALA 183 183 183 ALA ALA 5 . n GA 33 184 ILE 184 184 184 ILE ILE 5 . n GA 33 185 ALA 185 185 185 ALA ALA 5 . n GA 33 186 VAL 186 186 186 VAL VAL 5 . n GA 33 187 LEU 187 187 187 LEU LEU 5 . n GA 33 188 ASN 188 188 188 ASN ASN 5 . n GA 33 189 ALA 189 189 189 ALA ALA 5 . n GA 33 190 ILE 190 190 190 ILE ILE 5 . n GA 33 191 GLU 191 191 191 GLU GLU 5 . n GA 33 192 ASN 192 192 192 ASN ASN 5 . n GA 33 193 LYS 193 193 193 LYS LYS 5 . n GA 33 194 ALA 194 194 194 ALA ALA 5 . n GA 33 195 LYS 195 195 195 LYS LYS 5 . n GA 33 196 VAL 196 196 196 VAL VAL 5 . n GA 33 197 GLU 197 197 197 GLU GLU 5 . n GA 33 198 THR 198 198 198 THR THR 5 . n GA 33 199 ASN 199 199 199 ASN ASN 5 . n GA 33 200 LEU 200 200 200 LEU LEU 5 . n GA 33 201 ARG 201 201 201 ARG ARG 5 . n GA 33 202 ASN 202 202 202 ASN ASN 5 . n GA 33 203 ILE 203 203 203 ILE ILE 5 . n GA 33 204 TYR 204 204 204 TYR TYR 5 . n GA 33 205 VAL 205 205 205 VAL VAL 5 . n GA 33 206 LYS 206 206 206 LYS LYS 5 . n GA 33 207 THR 207 207 207 THR THR 5 . n GA 33 208 THR 208 208 208 THR THR 5 . n GA 33 209 MSE 209 209 209 MSE MSE 5 . n GA 33 210 GLY 210 210 210 GLY GLY 5 . n GA 33 211 LYS 211 211 211 LYS LYS 5 . n GA 33 212 ALA 212 212 212 ALA ALA 5 . n GA 33 213 VAL 213 213 213 VAL VAL 5 . n GA 33 214 LYS 214 214 214 LYS LYS 5 . n GA 33 215 VAL 215 215 215 VAL VAL 5 . n GA 33 216 LYS 216 216 216 LYS LYS 5 . n GA 33 217 ARG 217 217 217 ARG ARG 5 . n # loop_ _pdbx_struct_mod_residue.id _pdbx_struct_mod_residue.label_asym_id _pdbx_struct_mod_residue.label_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.label_seq_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_asym_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.auth_seq_id _pdbx_struct_mod_residue.PDB_ins_code _pdbx_struct_mod_residue.parent_comp_id _pdbx_struct_mod_residue.details 1 GA MSE 41 5 MSE 41 ? MET SELENOMETHIONINE 2 GA MSE 117 5 MSE 117 ? MET SELENOMETHIONINE 3 GA MSE 174 5 MSE 174 ? MET SELENOMETHIONINE 4 GA MSE 209 5 MSE 209 ? MET SELENOMETHIONINE # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 33-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 33 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2003-07-15 2 'Structure model' 1 1 2008-04-29 3 'Structure model' 1 2 2011-07-13 4 'Structure model' 1 3 2014-12-10 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? 2 4 'Structure model' repository Obsolete ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Version format compliance' 2 3 'Structure model' 'Version format compliance' 3 4 'Structure model' Other # loop_ _software.name _software.classification _software.version _software.citation_id _software.pdbx_ordinal DENZO 'data collection' . ? 1 SCALEPACK 'data reduction' . ? 2 CNS 'model building' . ? 3 CNS refinement . ? 4 DENZO 'data reduction' . ? 5 SCALEPACK 'data scaling' . ? 6 CNS phasing . ? 7 # loop_ _pdbx_database_remark.id _pdbx_database_remark.text 400 ;COMPOUND PDB ENTRIES 1PNS AND 1PNU REPRESENT ONE CRYSTAL STRUCTURE OF THE E. COLI 70S RIBOSOME. THIS FILE, 1PNU, CONTAINS ONLY MOLECULES OF THE 50S RIBOSOMAL SUBUNIT. THE 30S SUBUNIT, MRNA, P-SITE TRNA, AND A-SITE TRNA ARE IN THE PDB FILE 1PNS. ; 999 ;SEQUENCE The protein structures contain CA atoms only THE RESIDUES IN CHAIN V ARE LISTED AS UNK BECAUSE THE RESIDUE IDENTITY HAS NOT BEEN ASSIGNED. THE SEQUENCE FOR CHAIN V IS MSRECYLTGK KNLVVNSVIR RGKARADGGV GRKTTGITKRVQ RANLHKKAIR ENGQVKTVWL SANALRTLSK GPYKGIELI. ONLY 16 RESIDUES OF CHAIN V ARE PRESENT IN THE FILE. 23S rRNA in this entry was obtained from E. Coli (dbref: GB|147581|J01695) and was modelled using pdb entry 1LNR which was obtained from DEINOCOCCUS RADIODURANS (dbref: GB|1580504|NC_001263). The sequence in this entry has insertion compared to GB|1580504 and cannot match to GB|147581. The 50S subunit is derived mainly from 1LNR, the Deinococcus radiodurans 50 subunit, with modifications to the rRNA to make it match E. coli insertions and deletions. The sequence of this subunit represent that of pdb entry, 1LNR. As a result, no dbref was provided. ; # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 OP1 0 U 3109 ? ? P 0 C 3150 ? ? 0.46 2 1 "C3'" 0 G 1912 ? ? "O5'" 0 G 1913 ? ? 0.59 3 1 "O4'" 0 A 3875 ? ? CA 5 LYS 43 ? ? 0.60 4 1 "C1'" 0 G 1912 ? ? OP2 0 G 1913 ? ? 0.62 5 1 N4 0 C 3111 ? ? "C5'" 0 G 3148 ? ? 0.62 6 1 C4 0 U 3118 ? ? 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